BGIOSGA003138
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA003138 |
|---|---|
| Description |
Isocitrate dehydrogenase |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA003138, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0049B20.19 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA003138-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA003138-PA |
| Length |
4891 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:8889341..8894231 |
| Sequence Coding Region |
8889341..8889389,8889667..8889741,8890230..8890273,8890468..8890577,8890796..8890833 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:8889341..8894231 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:8889341..8894231 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGTTCGAGAAGATCGTCGTGGCCAACCCCGTCGTCGAGATGGACGAGTTCAACACATTTGATGTGCTGAAAGCTGCTCTACTTGGCCTTTCTGAAATTCTAGGTGTTACAAGGAATAGTGGTGATGAGATGACTCGAGTTATTTGGAAATGGATCAAAGATAAGCTTATATTCCCTTTCTTGGACTTGGACATAAAATACTATGACTTAGGTCTACCTAATCGTGACGCTACTGGGGACAAAGTTACAATAGAGAGTGCAGAAGCGACCCTAAAGTATAATGTAGCCATCAAATGTGCAACTATAACTCCAGATGAAGGACGCGTGAAAGAGTTTAATTTAAGTGCAATGTGGAAGAGTCCAAATGGGACAATAAGGAACATTTTGAATGGAACTGTTTTCCGAGAACCAATCATCTGCAAGAATATTCCTCGGCTTGTACCTGGGTGGATAAAGCCCATATGCATTGGACGACATGCATTTGGTGATCAATACCGAGCAACAGATACAGTTATTAAAGGTCCTGGGAAGTTGAAGTTAGTATTTGATGGCAGAGAGGAACAAATAGAGTTGGATGTGTTCAACTTTACTGGTGCTGGTGGAGTAGCCTTGTCTATGTATAATACTGACGAGTCTATTTGGGCATTCGCTGAAGCTTCCATGAACATGGCTTACCAGAAAAGATGGCCACTTTATCTTAGCACCAAAAACACGATCCTCAAAAAATACGATGGAAGGTTTAAAGATATATTTCAGGAGAACTATGAAACAAAATGGAGAGCCAAGTTTGATGATGCAGGAATATGGTACGAACATCGGCTGATTGATGATATGGTGGCCTATGCCCTTAAGAGTGAAGGTGGCTATGTTTGGGCTTGCAAGAACTATGATGGAGATGTGCAGAGCGATCTAATTGCTCAAGGTTTTGGATCGCTAGGTCTAATGACATCAGTTCTGGTGTGCCCTGATGGTAGAACCATTGAAGCTGAAGCTGCTCATGGTACAGTCACACGCCATTACAGAGTTCACCAAAAAGGAGGCGAAACTAGTACAAATAGCATTGCTTCAATATTTGCTTGGACAACCGGACTAGGACATAGGGCAAAGCTCGATGACAATAAAAGACTGTTAGATTTTGTACAAAAACTTGAAGCTGCTTGTGTGGGAACAGTGGAATCTGGAAAGATGACAAAGGATCTAGCTCTTCTTGTACATGGGCCAAATGTTAGCCGAGATAAGTATCTTAACACTGTTGAGTTCATCGATGCTGTTGCTGAGGATTTAAGAACAAGATTGTCAGTAACATCCAAGTTATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAFEKIVVANPVVEMDEFNTFDVLKAALLGLSEILGVTRNSGDEMTRVIWKWIKDKLIFPFLDLDIKYYDLGLPNRDATGDKVTIESAEATLKYNVAIKCATITPDEGRVKEFNLSAMWKSPNGTIRNILNGTVFREPIICKNIPRLVPGWIKPICIGRHAFGDQYRATDTVIKGPGKLKLVFDGREEQIELDVFNFTGAGGVALSMYNTDESIWAFAEASMNMAYQKRWPLYLSTKNTILKKYDGRFKDIFQENYETKWRAKFDDAGIWYEHRLIDDMVAYALKSEGGYVWACKNYDGDVQSDLIAQGFGSLGLMTSVLVCPDGRTIEAEAAHGTVTRHYRVHQKGGETSTNSIASIFAWTTGLGHRAKLDDNKRLLDFVQKLEAACVGTVESGKMTKDLALLVHGPNVSRDKYLNTVEFIDAVAEDLRTRLSVTSKL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..49#327..401#890..933#1128..1237#1456..1493#1605..1682#1794..1847#1920..2021#3172..3257#3363..3466#3549..3617#3703..3818#3913..3947#4130..4272#4598..4720#4798..4891#ATGGCGTTCGAGAAGATCGTCGTGGCCAACCCCGTCGTCGAGATGGACGGTGAGAACCCCCACCTCCCCTCTCCTTCCCCCCCGCTTCCGATCGGAACTCGCTCGTGATTAGCCTCGCTATCTCCGCTAATATCTACGGGGGGAGCCTTTGCCTCTTGTCTGGTGCCGTGATTGCTTTGGTTCTGCTATACCAATGGTGGTGGGATGGATTAGGCTGCTCTATGTACTGGATCTAAAAATTGTAGGTGTTTGGAGGAAGAAGGGGAGTCGTCCTGAGTAGAACGTGCGGCTGAAATTAGCTAAATGGTCCTGTTTTGTGGGAACAGAGTTCAACACATTTGATGTGCTGAAAGCTGCTCTACTTGGCCTTTCTGAAATTCTAGGTGTTACAAGGAATAGTGGTAGTCATCCTTAGGCGTAGAAAGTGTGCTGAAATTAGTTAAATAGCCATCTTCTTGGGAGGACAAAATGTTCAACCTTAGATGCGCGGAATAGTCGGTTTTAAAGGGTAAATCTAAAATAACTGTTTTAGTGCATTGTCATTGGTAAAAAAGAAAAGATTATTCATGTGAAGAATATAGTAAAAAAATAAAGAATAAAATTGAACCCACAGCATCGCTTAGTTCCAAGTTCCAAGGTGAACTGTATCAGTAAACACATATGCCAATTTCAGAACTTATCGTCTACAATGTTCAAGTGGGCTGAAAAGTTTTTCTGTTGACAGTCTTTCTGCTTCATTGAAGTTCTGTGCTGAAAAGTTCCATCATCGAACTTAAGTAACTTTAAATTGCATATTTAGAAAGTATACCATACTTTTGGCTAGCCCAATCATCCTTTGCTTACCTCAGATTGTAGTGGTTATATATGACTGTATGTGCTTTTTACTTAGGTGATGAGATGACTCGAGTTATTTGGAAATGGATCAAAGATAAGGTCAGGTTCTTGTAACAATATATGTTTTTTATTCTTGATTTTGATGATTGTTTGTCTAGCATTGTACTCTGCAGCTCCTTTTTTTTTCACGTTACATGTTCATTTTTTTTACTTTGTTATGCTTTTGGTGCTGCTTCATCCCTTAATGCTGGCATCGTTAAGAATTATGTTGGATATCTGTTTTGATCATGCAGCTTATATTCCCTTTCTTGGACTTGGACATAAAATACTATGACTTAGGTCTACCTAATCGTGACGCTACTGGGGACAAAGTTACAATAGAGAGTGCAGAAGCGACCCTAAAGTAAGCCTGTAAGCCTCAGTTGTTTGACGTCACAGTTCTGGTCCATTATTTCTTCTATTACTTTTTTCCATCTAAGTTATGCTTTTGTTATATAATTGGTGCTTTAAGCTGAACCTGTTTACCCTGTAGTCTCAGTTAGAATACATAATGTTTACCTTTTGTGATTTCTATTATAACGTTTACATTAGGTTGCTTCAGTATTCTATTTTTTTTTTCAGGTATAATGTAGCCATCAAATGTGCAACTATAACTCCAGGTGATGTTCAGCAGAATTGAGCTCATTGACAGATGAGCATGATGTGTTAACAAGTAGTTTTGGACACTCAATTTAAATTTGATTTTGGCCGCACTATTCATGAGCCTACAGATGAAGGACGCGTGAAAGAGTTTAATTTAAGTGCAATGTGGAAGAGTCCAAATGGGACAATAAGGAACATTTTGAATGGTAAACCTTTAATTGGTCACATGTCTATATGGTTCTATTTTGAACTTTCATCAAGTGCAGCTGTTGCTGTTCTCTTATACTTACTTCAGCAGAACTAATTGACTCCTGCAGGAACTGTTTTCCGAGAACCAATCATCTGCAAGAATATTCCTCGGCTTGTACCTGGTACGAAGTCTGTATCAAAAATACCGATAGTAGAATTCATTGGTAGTTACACTATTTTTTTTATGCTTCCAGGGTGGATAAAGCCCATATGCATTGGACGACATGCATTTGGTGATCAATACCGAGCAACAGATACAGTTATTAAAGGTCCTGGGAAGTTGAAGTTAGTATTTGGTATGTCTCAATAAAGCTAATGTCATGATAGTGGCTGCAGATCTGAACTTGTAGCAGCCAGGATTAAATTAATATTTAGCTTTGTCTCCCTAGTGTTTATCCTACTAGGAATGACAAGGACTTCTACCTTTTCTTTTCATATGGGCATCATTGGCTTTGGCTATAGAAAAGCTGTTCTAAAAATTTGGGGCTTAATTATTTGTATAGTCATCATATGCCACCATATTGGCAAATAGACTTGGTAATCATTCTTGTCAGTTTATTTACTTCAGAACCTATTAAATGGTTAATAGCCTGATATATGTTAATGCTGAGCAGCGAACAGAATATGTTTTTTTTTTATGGCAGATCAATATATTGACCCGGCTTTAGAAAAAAGCCCAAGAACAAAAACAGAGTCTTATACAAGACCTGGAAAATAAAAGAAACACAAAGAGATAGCTGGGGAACAACCAGTTTTTCAGAGACAAAAGGAACGTACTCCCAACCTAACCACACCCTTACAGAAAAAACTGAAACTCAGACTAAAGTAGCTATTCTATAGCTATGCAGGTAGCACATGAGGCCTGACTTGATTCAGCTTTATCCTGATTGCTTCACACCATCCTCCCAGCAGCTCCTGGTCTTCCTCCTTTAGCAAAATGCGCCACTTCTGTATGAAAGACAGCGATTTATAAACCACATAAAGGGGAGACTTGACAAGAATATTTTCAAACACCCAGTCGTTTCTAATGATCCAAATAGCCCAACAAACCCCCCCAATTAAAGAGATCCAAGGTTTAAACTTTTTCCTATCTTTGAGCAGACTCATACACTCCCATAGATTATTAGGTAAAGAAACCAGATTCAAAGCATCCCTAATAACACACCAACCAAAAACAGCTAAGGGACATTTAAACAAGATATGATTAGTAGTTTCAGTTTTGCCACAGAGCTTGCAATATTGACCAATTTAAACAGAATATGTTTCTGTCAGTAAGAAGAGCTTTTATATATGTAAACATACTTCACTGATTTGTGGTGTCATCACATCAATATCCAAGCATCAGGGAATAAGCTTAGTCAGTTTACTAAAATTGCTAACTATAAATAACCTTTGTGTCAATGTATCCACTCATCCTACACTATCTTCTCCTCAAAACTGGTATAGATGGCAGAGAGGAACAAATAGAGTTGGATGTGTTCAACTTTACTGGTGCTGGTGGAGTAGCCTTGTCTATGTATAATACTGACGAGGTTTGTTTATGATACCCTTTATCAGGGTAGCTTAATTTTGATACTCTGTATTTTTAAACAGGGTTTTAAACTTGACAACCTCTATTTTATGTTTGTTGCAAATAGTCTATTTGGGCATTCGCTGAAGCTTCCATGAACATGGCTTACCAGAAAAGATGGCCACTTTATCTTAGCACCAAAAACACGATCCTCAAAAAATACGATGGAAGGTCAATAGTCAATCGTTGTATGCTATTTGTTTCTTTTAATAGACATGTATGTCCATATTGAAATATTACTTTTATATATCAGGTTTAAAGATATATTTCAGGAGAACTATGAAACAAAATGGAGAGCCAAGTTTGATGATGCAGGAATATGGTACAGCTATCTTCTATCTACCTTACTGTAGGAACATGGAGCCTTATTTTCCTCCTTTATGTCCTAATCATTTCTGCTGTGGCAGGTACGAACATCGGCTGATTGATGATATGGTGGCCTATGCCCTTAAGAGTGAAGGTGGCTATGTTTGGGCTTGCAAGAACTATGATGGAGATGTGCAGAGCGATCTAATTGCTCAAGGTTTTTGCTTATTATATGTGTATACTCTCTTCTGACCTTTTATTTGGAGAAAAATGAAGTCTTTGCTAAGAGCAGGATGATTTTACTTGTACAGGTTTTGGATCGCTAGGTCTAATGACATCAGTTCTGGTGAGTGTTCTCCCTGCTGAACTCTTATCTGTTTATCTGAAAGTTCAAATGTAGAACAATTGTTAATGCTATCTAGAACAATTGTAGATTCCAATATGCTGATGGTGTAACCTCTATTTAAAAAATATGTTCTGATTAGATTAATCTTCTGAATTTAACAAATAAGTTCTGCATTGCCTTAGGTGTGCCCTGATGGTAGAACCATTGAAGCTGAAGCTGCTCATGGTACAGTCACACGCCATTACAGAGTTCACCAAAAAGGAGGCGAAACTAGTACAAATAGCATTGCTTCAATATTTGCTTGGACAACCGGACTAGGACATAGGTATAAGCTTGAATTAAACCATAGTAACTAAGATCTATGAGCTTGCTTTTCACTTAATTAGTTTGGCTCTAAATGATGAAATCTATATGCTCAGTTTTCCCATCATGGTTAATGCTATTCTATTGTAGTACATCATCTTTTAGTCCTTTTGTTAGTGCTCAGAGCAGAAAATTTTGTCATCTAAAAGTTAGGGAGAGTTTCTGTTCTTAAAGAAATTTATTCTGCTCCTTATATTTCCTGCTTTTTGTTGTAAATATTAAGTATGCTACATAAATAATTAAGAGTTGTAAGTCTTGTGACTTGACTGTTGAACACACCACAACAGGGCAAAGCTCGATGACAATAAAAGACTGTTAGATTTTGTACAAAAACTTGAAGCTGCTTGTGTGGGAACAGTGGAATCTGGAAAGATGACAAAGGATCTAGCTCTTCTTGTACATGGGCCAAAGTAATTCCTACTTCTCTTATTTATTCTGTAGTAATAATAGACAAGACCTTTTAATTGATTCTGTTGGAATTGTACAGTGTTAGCCGAGATAAGTATCTTAACACTGTTGAGTTCATCGATGCTGTTGCTGAGGATTTAAGAACAAGATTGTCAGTAACATCCAAGTTATGA</dnaseqindica> 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