BGIOSGA003152

From RiceWiki
Revision as of 18:22, 20 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

BGIOSGA003152

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA003152, complete gene.

LocusTag

OsI_01190

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA003152-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA003152-PA

Length

7563

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:9088253..9095815

Sequence Coding Region

9088253..9088598,9088857..9088954,9089896..9090015,9090253..9090342,9090429..9090544
,9090626..9090725,9091513..9091584,9091659..9091706,9091976..9092095
,9092200..9092305,9093278..9093441,9094107..9094241,9094468..9094598
,9095567..9095629,9095719..9095815

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:9088253..9095815 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:9088253..9095815 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGGACTCCATCGAGCTCGCGCGCCGCCTCTGCCTCCAGCCTCCGGCGCGGAGGACGGGAACGGGAAGGTGCAGGCCGCGGGGCCGCCTCGGAGCTCCCTCCCTCCGCGTCCCGCGCCCTCCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTGGTCGTCGCTCCGGTGCCGCGCGCTCGACTCCACCAGGCCGGTCGCGGTGGAGGGGGGCCTGGGAGACGAGGAGGACGAGGATGAGGAGGGGGAGTCGTACTTCGCCTTGACCTCGTCGAGGCTCTCGCGGGTGGACTACCTAGGGGAGAGCACCAAGGGGGATTTGAACGTGCGGAGGGAGCATCTCGACGCGTTTGGTGGGAATGGCAAGTCGACATTGCATGGCCCTATAGAGGAGATAGCTTGGCAAGAAGCGAGAGAAGCTGAATCGTTGCTCCGTGAGTTGGGAATTGCAGATCCTTTTTCCGTAAGACACTCTCCTCGTGGAATATTTTGCACCAGGACACTAAATCTTCGATCCATCAGTGTCATTGGCTATGATATGGACTATACATTGATTCACTACAATGTGATGGCTTGGGAAGGGCGTGCTTATGATTATGGTATGGCCAATCTGAAGGGCATGGGTTTCCCTGTAGATGACCTTGAATTTGATCCTGACCTGGTCATCAGGGGTCTAATTATGGATAAAGACAAAGGGAATTTGGTCAAAGCTGATCGTTTTGGTTACATTAAAAGGGCCATGCATGGCACCCAGATGCTTTCTACTAGTGCTGTGAGTGAAATATATGGAAGAGAATTGGTGGATCTACGGAAAGAAAGTAGATGGGAGTTCCTTAATACCCTTTTCTCTGTGTCAGAAGCTGTTATGTTCATGCAGATGGTCGACAAGTTGGATCAGGGGTTGGTGCCAGCTGAACTTGGGCCACTGGATTACAAAGGACTGTACAATGCTGTTTCCAAGGCACTTTTTCGAGCGCATGTAGAAGGTCAACTCAAGGCTGGAAAAAGGTTGCTTCTTATTACAAACTCAGATTACCACTATACGAACAAAATGATGAATCATGCATTCAATCGCTTCCTTCCTAATGATATGGCATGGAGAGATCTGTTTGAAATGGTTATAGTCTCTGCAAGGAAGCCAGAGTTTTTCCAAATCTCTCATCCGTTATACGAGGTTGTAACAAATGATGGATTAATGCGTCCCTGTTTTAAAGCTAATTCAGGTGGATTGTACTCTGGTGGCAGTGCTCAGATGGTTGAGAAGTCACTAGACATCCATGGAGATGAAATATTATATGTGGGGGATCATATTTACACAGATGTAAGCCAGTCTAAAGTTCATTTACGATGGAGGACAGCACTAATCTGCAGAGAACTAGAAGACGAGTTTGATGCACTAATTCGAAGCCATGTTCAGAAAGAACAGCTTATCACACTTATACAACAAAAGGAAGTCGTGGGAGATCTTTTTAACCAGCTTCGGCTGGCTCTGCAGAGACGAACAAATTCACGCCCAGCACAGACGCTTGCTGCTACTTGTATGGATGATCAGGAGCTTACAGAAAGTATGCAAAAGTTGCTCATTGTTATGCAGAGATTAGATGAAAAAATTGCACCAATGCTAGAATCAGATGGAGAGCTGTTCAATAAAAGATGGGGTTGGCTATCACGTACGGGCCTATGGGATAAGAGTCATCTGACGAGGCAAATTGAAAAATATGCTGATATATACACATCAAGGGTTTCAAATTTTCTACATTATACTCCATTCATGTATTTCCAATCACAAGAACAGGTAATTGCAAAACTCTAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MADSIELARRLCLQPPARRTGTGRCRPRGRLGAPSLRVPRPPLSLSLSLWSSLRCRALDSTRPVAVEGGLGDEEDEDEEGESYFALTSSRLSRVDYLGESTKGDLNVRREHLDAFGGNGKSTLHGPIEEIAWQEAREAESLLRELGIADPFSVRHSPRGIFCTRTLNLRSISVIGYDMDYTLIHYNVMAWEGRAYDYGMANLKGMGFPVDDLEFDPDLVIRGLIMDKDKGNLVKADRFGYIKRAMHGTQMLSTSAVSEIYGRELVDLRKESRWEFLNTLFSVSEAVMFMQMVDKLDQGLVPAELGPLDYKGLYNAVSKALFRAHVEGQLKAGKRLLLITNSDYHYTNKMMNHAFNRFLPNDMAWRDLFEMVIVSARKPEFFQISHPLYEVVTNDGLMRPCFKANSGGLYSGGSAQMVEKSLDIHGDEILYVGDHIYTDVSQSKVHLRWRTALICRELEDEFDALIRSHVQKEQLITLIQQKEVVGDLFNQLRLALQRRTNSRPAQTLAATCMDDQELTESMQKLLIVMQRLDEKIAPMLESDGELFNKRWGWLSRTGLWDKSHLTRQIEKYADIYTSRVSNFLHYTPFMYFQSQEQVIAKL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..346#605..702#1644..1763#2001..2090#2177..2292#2374..2473#3261..3332#3407..3454#3724..3843#3948..4053#5026..5189#5855..5989#6216..6346#7315..7377#7467..7563#ATGGCGGACTCCATCGAGCTCGCGCGCCGCCTCTGCCTCCAGCCTCCGGCGCGGAGGACGGGAACGGGAAGGTGCAGGCCGCGGGGCCGCCTCGGAGCTCCCTCCCTCCGCGTCCCGCGCCCTCCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTGGTCGTCGCTCCGGTGCCGCGCGCTCGACTCCACCAGGCCGGTCGCGGTGGAGGGGGGCCTGGGAGACGAGGAGGACGAGGATGAGGAGGGGGAGTCGTACTTCGCCTTGACCTCGTCGAGGCTCTCGCGGGTGGACTACCTAGGGGAGAGCACCAAGGGGGATTTGAACGTGCGGAGGGAGCATCTCGACGCGTTTGGTGAGCTACTGGTTTCTTCCAACCTCCACACAAAATAAATTTGAGCTGTTTACTTGCAATCCCCTGTTCAGAGGAGATGTTGTGTTTGTTAACCCGTAGTTGTTAATGATTCGATTTATGTTAGACACTTAGACTAAACAAGCAAATTAGCAGTACTACGATGTCACTAAATTACAGCATCAGGCATCCTCATATGTAGCACCATCAAAACCATGCCAGAGTCTTTGCTATAATTAATCCGAAATGCTTGCATTCTAGGTGGGAATGGCAAGTCGACATTGCATGGCCCTATAGAGGAGATAGCTTGGCAAGAAGCGAGAGAAGCTGAATCGTTGCTCCGTGAGTTGGGAATTGCAGTAATATTCTACTCTATTAGCATTATTTTTCCTCCTTGTTGATGTTTGGTAATTGGTATGCTTTCTTCCATTTCTATTCATATTCTGTTAAATATATTCGGTAGGGCACCTATTGTTGCTGTGAGCCTGTGACTGAAGTAACTTAAAACTTGGCATTCAATTTGCTTCCGGCATGATGATCATCATCTCAAATCACTAGCATGGAAATAGAACTTTCATGACTGTGTTCATCAAATTGTTGTAACTTGTAACACTCATGTTGCACTGAGAAAGTCAATTACCAAGACGAAGTTAACTTTGAAGAATGGTATAAAGGTGATAATACTGTAATATTGTTCACTTCTGTTCTTGGAAAACAATTTACAATTGAATAGCAGAATATGTAGAAGTCTTCGTCTATTGTAGAAAAGCTTAATAAAATTTATTTTTCTTTCCAAAGTGAAAAAATCACTAATTTCGCTTGAAAATGTTTTACGATTGTTTTGAAAATACATGGAGTTTTCTATAAAAATCCAGAAAAAGGCATGCCTTTGTAGCAACATGAACTCCAAATCCCAATGTTTAGTGATATCCAACAGTTCACATGAATCATGGCAAAAGCCAAACAATTAGGGTGAAAAGAGATCCAAGAAAATTCTGAACACTTGATGGCATGTTTTGTTAAAGTCTACCCAACATTTCAGCATGAACTCTTGAAAAGGCTCCAAGAGTTCAGTGTTTAGCCATTCACTCTGAATTTCTGTATAGCGGATATCAGAATATAGTTTGCAATTATCTTTTTACTGCTAAACGTTTCCTTCTTTAACTCCAATGATTTGTTATTCCTTTGTCTATCGATGTATCTTGATTGACTATCGCGATGTATCTTGATTGATTATCTTCTTGATGAAGAAACTAGCTTTATGATGATACAATATTAATGAATGGTTGTTAACACGCAGGATCCTTTTTCCGTAAGACACTCTCCTCGTGGAATATTTTGCACCAGGACACTAAATCTTCGATCCATCAGTGTCATTGGCTATGATATGGACTATACATTGATTCACTACAATGTGATGGTACTTCACTATCTATATCATCAAATTGTCTACGAATCATTCTAAAGTAGATGATTACATATGTACAAAATTTTACATATTTGTTGGACTGATATGACATGATACTAGCTGATAATTTAGGTATGGCCTCCTGATTCTCACATCAGACATAAAAAAACAACATGAGTGCTTTGTGTCCTTCCATATGGTCCTTGTGGTAAATTGCAGAAAAACCAAATTGTTGTTACATCTATGCAGGCTTGGGAAGGGCGTGCTTATGATTATGGTATGGCCAATCTGAAGGGCATGGGTTTCCCTGTAGATGACCTTGAATTTGATCCTGACCTGGTACTGTACTGTAGTATTGGGTACTCCATAATTCATAATATCTCAAGGCACATGCATAACCCCTAATGATACCATTACTCTCACAGGTCATCAGGGGTCTAATTATGGATAAAGACAAAGGGAATTTGGTCAAAGCTGATCGTTTTGGTTACATTAAAAGGGCCATGCATGGCACCCAGATGCTTTCTACTAGTGCTGTGAGGTATTGTTAAGACATTTTGTCAGCTTTACTGTGGTCCTGAGCTGAGAGAAGATAATAAATCTTATTCATGTCCATGAACAGTGAAATATATGGAAGAGAATTGGTGGATCTACGGAAAGAAAGTAGATGGGAGTTCCTTAATACCCTTTTCTCTGTGTCAGAAGCTGTTATGTTCATGCAGGTCAATTACCTGTCTCTCTATCTAATAGTGTTCATTTCATGCTTGTGCTGGGTGGCGACCTAGTCTACGGATTGATAGTCACTAATATCTATGTTTCGTGATGGGGGTTAGTTGTCCTTTTATTGGCTGTGTGCATTTTATGCAGAGGCCGGGGTTGGGCTCAGTTGGAATGTATCATCTTGGTGTATTTGACAGAGTCTTAATAAAGCTTTCATTATCTAAAAAATTTCATGCTTGTGCTATGATACTTGACATCTCATCATCCATCAATCCAGAACCATCGTTCACATGTGTGTACAAGAGTAGTTTCAGTGTTAGTAAAACACTTGATAGGAATTGCAGTCATGGGATGACAAATTCAGATAAAAATCACGCTCAGTTCTGGCCTGGTTAGAGTTCTCTTTGCTAGGTTTTTAATGTTCTTGTCTTTTTCATTCATGAATAATGCTCCTTTGTCTCTGAGTGCTTGGAGTTTGGACGTTTTACATACATTATGTAATACACATATGGTTTGCAAAAAAGTGTCCTGTGTGATTACAGAGACCAGGTTGTGATCTAAGAAATCCAGCAAACGTACTCTCATATCACAAAGGACAGTATCTACTCCTAATACATATAATTTGACATGATCAGTCCTGTTTGATTCATTGATAATATTTTTGCACTTTTAATTGAAAATTCAGTGTGGTTAGACTGTCTGACATTTACATTTTATAGTGTGCTACCTTGAATGTCTATTGAAGTTTGAATTGATCCATATTTATATGGGCGTGGGTCTTCTGTTCAGATGGTCGACAAGTTGGATCAGGGGTTGGTGCCAGCTGAACTTGGGCCACTGGATTACAAAGGACTGTACAATGTAATTAGCCTTGCTACCTCTTTTACCGTTGTGCACGTTTGTTGTTGTAAAATTTTAAGGCTTTTCTTTTTTAGGCTGTTTCCAAGGCACTTTTTCGAGCGCATGTAGAAGGTCAACTCAAGGTAATGTCTGGTTGTCATTACTCATTAGATATGACAATACTCTATATGATCAATATTGGTCTAAAAAATTCTTTAGCTGGTTGAAATGTAGAGTGAGATAATGGCTGAGCCGGAACGATTGTAGAGCCTGATCCTGAACTGCCTTTAGCTCTTCTGGATCAAAAGGAGGTTAACACACAATTACCTTACAAGTTCATGATCCATTAATAATATTAGAACTTTTGTACTTCTCTGCATTACTTTGCTGATTTCCCCTTTCAACTCATCAGGCTGGAAAAAGGTTGCTTCTTATTACAAACTCAGATTACCACTATACGAACAAAATGATGAATCATGCATTCAATCGCTTCCTTCCTAATGATATGGCATGGAGAGATCTGTTTGAAATGGTGAGTAATCAAGTTGCTGGTTCTAGATTGAACTGTTTGTCATTCGTTGCTTGCCTGCCATGCTGAAAACTTTACTAAGATCACTTGATTTATTCTTACTGTAGGTTATAGTCTCTGCAAGGAAGCCAGAGTTTTTCCAAATCTCTCATCCGTTATACGAGGTTGTAACAAATGATGGATTAATGCGTCCCTGTTTTAAAGCTAATTCAGGTGTAAATCTTGATTTTTTTCTTCTATGGCCAAATTTCTCTAGAGTCTCTTTGCTTTGTTTCTTTTGTTGATTTCTAAAACGATCAATTTCAAGTTTCAACCAGCAAATACACACTTTATGGCATGTTTGGTAGAACTCCAACTCCTAAATTTAACTCCCAAGAGCTGGGTCTGAAGTGGAGTTGTGGAGCAGTCTGAACCCAGCTCCACCTCTCTTGTTCATTTTGTGAGAACACTCCAGCCAGCTCCCCTCTCATTTTGGGTGGAGCTGAAACTGTTTGGCTGGGCTCTAGCTCCATGAGAGGTGGAGATGGAGCTGGACCTCTGCCAAACAGGCCCATAGTTTCATTTAAACTCTAGGCAGGGTAAAACGATAAAAACGGTAGATGGAAATGAAACATAAGGTGTAAAAACAGCAATACAAGTTCATTCATGCTATGAGAGGAACAGGACACTGATTTGCATATCAGTTATCTACAGCTCTAGCTTATGACTTTCTGTGAGCTGAAAGCACATCTAACCTCTGTTAGACAATAATCCGAAGTGATCAGATTTTCTGTAGTTCTGTAGGTGGATCTTATGTGCCATATGCCCACAACACAAGTAGGTTTCTTTGTGAAATTGCATAAGAGATCAAGAGGCATGTGCATATGCTCGCTTGAGTGTTGTTATTTTATGGCATTATAACATAAGGTGGAACAAGAGCAAGTGCATCACACAGCGAAGAAAACACTGTTCAGTCTTCTGTATCTAAGATGATTTCTTCTCCCTATGCCATTGTTCATCAATAATTGAGATACCTCCTTTCTCTGCTACCTCTCCGACTTAGGTTGTATTTTTGTTATATATCTTGAAACCATAAAATATTGTTTCATTTCTAAGCATGTGTTTCTGATGCACTAGCAGCTAGCTTGAAAGAAAACATTCTTTTCTGCAACTGACTTGTGAACCTTTTCTTAATTGGGTATTTAGGTGGATTGTACTCTGGTGGCAGTGCTCAGATGGTTGAGAAGTCACTAGACATCCATGGAGATGAAATATTATATGTGGGGGATCATATTTACACAGATGTAAGCCAGTCTAAAGTTCATTTACGATGGAGGACAGCACTAATCTGCAGAGAACTAGAAGACGAGGTCAGTGTACTCTTTCTCATGCATTTACCTTCAGCACAGGATGAGAACTGTCAGCTGAGGGGCTTTACCATAAGAAAATATTGATAACACTAAATTTATGCACACTGGCGATCTATATATATGAGTATATGACTTAGCACTAAAATTTAGTTTTCCAGCTATATGTCTGTGAGGTTGAAAGTCTTTTCTGATACCCTTTTTAATTACATAACTGATCTTTCCCCTGTTCTTTATTTGATTTCTTATACTTTCTTGAGGAAAACATATTTTGAATCACGGATTGTCCTCAAATTATAAGTCTTTGGTCTTTACGCATGTCCTATTGTCTCGCTTAGGTCCATGACTTTTAGTTTTGGCCTATTAAATACCTAAACTTACACAAGGGTGCCACTTATCGGAGTTCTCTGTTGGTGAAATATTGAAGTGACAAAACAATGCCATGGAGGATCTCAAGTCCTGGAATATATGATCCCATTATGTAGCTGATGCCTTTACCCTTTAGACCATTAACTGGCTTATCTGCAATATTTGTGTATATATTGATTCTGAATTCGTTTGAAGACTAACTGGTAAGGGCAGCATTTAGTTTCTATGCATGCTCTAGTTGCTGATAGAGGCATGCTATCATGTCCTGTGACCATTTTGTTCTCTCCTGTTTTCTGCAGTTTGATGCACTAATTCGAAGCCATGTTCAGAAAGAACAGCTTATCACACTTATACAACAAAAGGAAGTCGTGGGAGATCTTTTTAACCAGCTTCGGCTGGCTCTGCAGAGACGAACAAATTCACGCCCAGCACAGGTATTAATGTCTTAAATTGGAACAATGAAGCTTTTGTTAGCTTTAACATGTCTCAATTTTCTCTCTTGAGAAACATGAGATTCTGCCCTATACATTATGTTGGTAACAGTATAATTTCAGCTGTTCTAATCTATCATGTAGTAACTATCTTAATCTTAAGCCAAAAATAAAGATAGTTTGGTGATTTAGTTTATTTTCTACTGAAGTATCAATTTTTCTTTTCCAGACGCTTGCTGCTACTTGTATGGATGATCAGGAGCTTACAGAAAGTATGCAAAAGTTGCTCATTGTTATGCAGAGATTAGATGAAAAAATTGCACCAATGCTAGAATCAGATGGAGAGCTGTTCAATAAAAGGTAAAGCAGGCATGCAGTCATTGCGTAATTCCTCATGTCTTTGAATGCAAGAAACATCTGAAATTCGTCGCTTCTAGATCTGTTGCCCTATGTATTTTTGCAGAAAAATCATATTTTAAAGGCCATGTTTCAGACCTCTCATTCAGAAAGGTTTGTGAATCTTAAAGAAAAAAGCAGTTACTAATGATAATGGGTATTCTTGTATCAGTAATAATAGGCTGGCCTATTATGAAATGACTCTTAGGGTGCAATGAGGTGTGAAAAGTTAAATATAAGACCGTGCTAAGATAGATTGCTCGAGAACCCACTTTTTTCTTGCTGATGCTTTGCTTCCCTTCTATGATATACTGTCGTTACTTCACTCCAATTCCATCCATTGGACACAGTGGATATGGGAATCCAATCAAATAAGTAACAGTTAGTTGCAGTTGTAATTCTTTTTCGTAGTTGCATTTGTAATTTGATGATTGAGAGTTGAGAATATCAACAGGGTTAACTTGCAATTAGCTTCTCATATCTTCCTCTTTTTCATTAAAGAATATCTTCAATCTGAGGAAATGAGGAGTATGCTAGGACCAACCCTTAGTGCTAGGACCATAGCCTTTTAATCTATGATTGGATGGTTAGATTTGATTTTATGCAATGAGGTTGGGTTTGGCCAATCACATTTAATCATGCTTTCATGGGGTTGTGGTTTTGAACCATACTGAAACAAACTTGTGGAATCCAGACACCATAATTTATCCTTATTTGCCCCTAATCATTAGTAACTACTTTTGGTCTAACGTTCATTAACACCTTTTAGAAGAGCGGTTACGACGCGAGGCCCTTTGCATTTATATGTTTTGTTGCTTCCGAATCCCAGTGAATCTTTGATATTTGCTTTTTGTTTATAATGCCTATGCCAGAACTACAGAATTATAATACCTTTGTAAGCTAAGCAAGCATTTTTTTTTTTGCCTGTTAAGATGGGGTTGGCTATCACGTACGGGCCTATGGGATAAGAGTCATCTGACGAGGCAAATTGAAAAGTGAGTGGTTATGGTTTTGCAGTGGTGAATATTATTTTATGAGCCCAAATTTTATCTGTGTAAATGCAATTATTTTGTCCTCGGTGCAGATATGCTGATATATACACATCAAGGGTTTCAAATTTTCTACATTATACTCCATTCATGTATTTCCAATCACAAGAACAGGTAATTGCAAAACTCTAG</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA003152