BGIOSGA003339
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA003339 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA003339, complete gene. |
| LocusTag |
B1146F03.33 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA003339-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA003339-PA |
| Length |
8243 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:12285408..12293650 |
| Sequence Coding Region |
12285408..12285526,12286869..12286986,12287661..12287757,12288409..12288515,12289000..12289122 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:12285408..12293650 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:12285408..12293650 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGCGACGGTGGAGGAGCAGATGGTGGTCAAGGCCATCCGGGAGGAGTGCCCATGGGAGTCGCTCCCCAAGCGCCTCCAGTCCACGCTCCACACCAAGGAGGAATGGCACCGCAGGATTGTGGATTACTGCATCCGAAAACGATTACAATGGAATACTTGTTTTGCTCGTAGAGTGTGCAGGGAAGGGGAGTACTATGAGGAAATGATGAAATACCTCCGGAGGAATCTTGCATTATACCCGTATCATCTTGCAGACTATATCTGCCGAGTTTCGAGGATCTCACCATTTAGATATTATTGTGACATCTTGTTTGAAGCTATGAAGAATGAGCAACCATATGACAGTATTCCAAACTTCACTGCTGCTGATGCCTTGAGGCTTACTGGCGTTGGAAGAAATGAGTTCATTGATATTATGAACAAATGCAGATCAAAGAAACTAATGTGGAAGCTGAATAAGTCAATTGCAAAAGAATTATTGCCTACACAGCCTGTTGACTTCCCAATCGATCCTTGGTGGGGAGTTTGTCTTGTGAACTTCACTATAGAAGAGTTTAAGAAACTTTCAGAGGAAGAGACTGCAACAATAGACAAAATATGCAAAGAAGAAGCCAATTCCTATGTTCTATTTGACCCAAAGGTCATAGATGGCCTTTATAAAAGAGGTTTGGTGTATTTTGATGTGCCTGTTTACCCTGACGACCGCTTTAAAGTTTCCAGGCTCGAAGGTTTTGTTTCTAACAAGGATCAATCATATGAAGACCCAATCGAAGAGCTACTTTATGCTGTATTTGTTGTGTCAAGTGCCAATGCTACTGTAGCTGAATTGGCTGCAACTCTACTAGCTGACCTTTATCAGCTGCAAGCAGCTGCGTCGTTTGCTTGTCGACTGGGCTGGGCTGTAAAACTTATGGATGCTGACTCTGTACTTGAAGATGCACCCACTTTTCCCAGTAACATTCTGAGTGATGATGAAGAAGGTTCAAATGCAAGCATCAATTCAGAAAAGTCTGGCCAACAGTTGCTCAGTGTTGATGCTGGACCAAGGAAAATATCTGGAACTGCCCATGTAGCGTTGGTTGTGGATGCGAATGTTACTTCGTACTTGATGATGGGCTCATTGTCACCAGGTTTAAAATCTCATGCTGTCACACTATACGAAGCTGGAAAATTAGGTGATTCTTGCATTGCAGAACTATGCAGTGATCTGGCTAGTTTGGAAGGGAAGAAGTTTGAGGGTGTGCTTGAGGAGTTTGCTAATCATGCATTCAGTCTTCGATGCTTCCTGGAGTGTTTACAATCTGGTGGAGTTTCTACCAATGTGAATATTGATAAAGCTGGTGAAGCAAAGCTTACAACAAGCTCCTTGCAAGATAATGTTACTGCCCATTTGACCAAGATAAACATTGAGGACACTGATGAAATGCCCCAGCAGAAGCACTCTGGTTTAAATAGTAGTGATGGGAAAATGTTGACTTCATCAGCGACTTTATTGGAAAGTGGAGAAGGCATGGAGGGAAATGATGTTGAGGGTAGTGGCACCACTGAACTAGATGGCTCAACTGACATCAATGTGGTTAAGACTAAAAGGAAGTACAGAGTTGATATCCTCCGATGTGAGAGCTTAGCTTCACTTCCACCAGCAACACTGGAACGGTTGTTTCTCCGGGACTATGACATCATTGTGTCTATGGTTCCTCTTCCTTCTTCATCAGTTCTTCCTGGTTCGTCAGGCCCAATTCATTTTGGTCCACCCTCATACTCTTCCATGACACCTTGGATGAAGCTGGTTTTGTATACAGCAGGGGATTGTGGACCATTATCTGCTGTTTTCATGAAAGGACAACGCATTAGATTGCTTCCTAAACCTTTAGCCGGTTGTGAGAAGGCACTGATATGGTCTTGGGATAGCTCTGTGGTAGGTGGGCTAGGAGGGAAGTTTGAAGGGAACTTAGTCAAGGGCAACCTGTTGTTGCATTGCTTGAACTCAATGCTTAAACAATCAGCTGTTATGGTGCAACCACTTAGTGTAAATGATCTTAATGCATCAGGAAACCTTGTCACAGTGGATATCCCTTTGCCCCTGAAGAGTGATGATCAGTCAATTGCATCTGTGATAGCTCAAACTAATTTGCCACAAGAACAGGTCTTAAATTTGGCCTCTGTATTAAAAGACCTGTCCAGTAAATTTGAGTTGAGTACACTTGGCTACCTTCGGTTATTAAGACTTCATAGGCTTACTGAATCGGATGAATCACACCTAGAAAATGGAAGTTACCAGTGGGTGCCTTTGAGCTTGGAGTTTGGAATCCCCTTGTTCAGTCCAAAATTATGTGAGCGGATTTGCGAAAGGGTGGTCGAATCCTGTATACTTCAAAAAGAGGATCTCGCTGAACATTATGATGTGATGCAAACTGTAAGGCGGCGGCTAAGAGAACTTTGCAGTGAATATCAGGCAACTGGTCCAGTTGCTAAGTTGTTCAACAAGCGAGGAAGCTCAAAGGATTTGCCCCGTGTTTTAATCAACACCATCAGTGGCAGATGGAATCCAGTTAATGATCCTTCAGCACCAAGTGAACATGAGAGGCTGAAACTTGCTGGACGGCAGAGATGCCGAACAGAAGTCGTGGGATTTGATGGGACCTTTATCAGGTCATATGCACTTCCTCCTGAGCACGATGAGGCTGGCACCAAATCTTTATCTGAAGAACAATCATCAGCTCACGATGGAAAACCAGACACAGAAGATGCAGATAGCAAGGATGTACTCTTACCAGGTGTAAACCTCATATTTGATGGAGCTGAATTGCATCCATTCGACATCAGTGCTTGCCTTCAAGCACGTCAACCTCTCTGGCTCATAGCTGAGGCGTCAGCTGCTTCATCGACCATGATATAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAATVEEQMVVKAIREECPWESLPKRLQSTLHTKEEWHRRIVDYCIRKRLQWNTCFARRVCREGEYYEEMMKYLRRNLALYPYHLADYICRVSRISPFRYYCDILFEAMKNEQPYDSIPNFTAADALRLTGVGRNEFIDIMNKCRSKKLMWKLNKSIAKELLPTQPVDFPIDPWWGVCLVNFTIEEFKKLSEEETATIDKICKEEANSYVLFDPKVIDGLYKRGLVYFDVPVYPDDRFKVSRLEGFVSNKDQSYEDPIEELLYAVFVVSSANATVAELAATLLADLYQLQAAASFACRLGWAVKLMDADSVLEDAPTFPSNILSDDEEGSNASINSEKSGQQLLSVDAGPRKISGTAHVALVVDANVTSYLMMGSLSPGLKSHAVTLYEAGKLGDSCIAELCSDLASLEGKKFEGVLEEFANHAFSLRCFLECLQSGGVSTNVNIDKAGEAKLTTSSLQDNVTAHLTKINIEDTDEMPQQKHSGLNSSDGKMLTSSATLLESGEGMEGNDVEGSGTTELDGSTDINVVKTKRKYRVDILRCESLASLPPATLERLFLRDYDIIVSMVPLPSSSVLPGSSGPIHFGPPSYSSMTPWMKLVLYTAGDCGPLSAVFMKGQRIRLLPKPLAGCEKALIWSWDSSVVGGLGGKFEGNLVKGNLLLHCLNSMLKQSAVMVQPLSVNDLNASGNLVTVDIPLPLKSDDQSIASVIAQTNLPQEQVLNLASVLKDLSSKFELSTLGYLRLLRLHRLTESDESHLENGSYQWVPLSLEFGIPLFSPKLCERICERVVESCILQKEDLAEHYDVMQTVRRRLRELCSEYQATGPVAKLFNKRGSSKDLPRVLINTISGRWNPVNDPSAPSEHERLKLAGRQRCRTEVVGFDGTFIRSYALPPEHDEAGTKSLSEEQSSAHDGKPDTEDADSKDVLLPGVNLIFDGAELHPFDISACLQARQPLWLIAEASAASSTMI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..119#1462..1579#2254..2350#3002..3108#3593..3715#3883..4036#4410..4470#4576..4931#6363..7884#7997..8243#ATGGCGGCGACGGTGGAGGAGCAGATGGTGGTCAAGGCCATCCGGGAGGAGTGCCCATGGGAGTCGCTCCCCAAGCGCCTCCAGTCCACGCTCCACACCAAGGAGGAATGGCACCGCAGGTTTACTTGCCTCGCCTCTACTCTCTTCCATGGATTTTTGATCCTGCTGCTTGCTTCGACGCAGCTTGTGGTAGTTTACTACTAGTCGGCCTCCGAGATCTAGGGAGATATACACCAGTAGAGGCAATGCCGTTTGGAGTTCTTGCCTCAGACTGATTAAAGCTCGTTGCACCAGCTGGAAGCTCTTGCCTAGATCTCGCCCATTTGCTAGCCGCATTTGGGCAGGAGCACTCACTTCGGAGATGCTTGTGTTGATCTCAATTGTGGTGGGGGACTAGACAATCGCTGGGTTGTCCTATAGGATAGCCGGATAGATGGATCCCTGTGCACCTGTAGTTACTTCTAGACAACACTTATGAAGCTTTTGCATTCGTAAATAGTACTTGATAGGTAGTGGGGATTGAAGAATTCCAAGCTTCAATTGATTCTGAGTGAGGTCAGGAACTCCGAGATCTAGAAAGCACGTGATATCCAGTTTTTAGAAATGAGCAGCGCATTGGATTTGATTGGTCTTTCACCCTGTATGATCTTCTGCTTAGTTATCACTACGACGCTTGCTAGTATACTGGATGTTGGTGATGATTATACTGATTGGAATTTATCGTGTTCATCTTATTTAGCATGCAAATAACAATTCTTCATGGGTTAAAGCACATGATATCCATTGAAAGGATGCAGGAAAGTCCGTTAATAACCTGAATTGATGGCAATCATTAGTGAAATGTTTGTCCCTTTCAAAGTTACCTCCTTGAAAATGTGCTGAGAATAGACAGTCTCAAATGCCAATTCTATAGATCATGTATCGCAAGGTGATAAAAGAGAAAACCTTGCACTTCCCAGTCCCTATAGGTCTATCGAAAGAGCTGAATTATTTTTGTCATGTCTGCGAAAACAATTCACATAACTGATGATGATCACTATAAGGGGAGTTACAAACGTAGGGGATTTACAATTAATCATCACAACTCATTTCCACTTGGCTTACACCGAAGTACATTTGGAGTTGCAATGTGACTTTGTAGAAACTAAGTAGAAAGGAATCTAATCGTGTAAATCAACAAACATACTTCCATCACCATCGATGGCATTCAGATCACATAAATAAAAGAAATTAATGGCTCAATGAAGGGAGAAAATTACATTTGTATATCAGCAAAAAAATCCTTTTGAGCTAATGTACACACATACATCCTGGTGCATTCCTTATAAAGGCCTTCTTGGATGACTGTGTTCAAGTACTTAGGTGTATTAAACTATGAAAGTATGAATTGCTTTCCTATTACTTTTGTTGATGTAGAGTAAAATTTACTGGCCTAATCTCCAGTTAATAATTTGATGGCAGGATTGTGGATTACTGCATCCGAAAACGATTACAATGGAATACTTGTTTTGCTCGTAGAGTGTGCAGGGAAGGGGAGTACTATGAGGAAATGATGAAATACCTCCGGAGGAATCTTGCAGTATGTTCCTGAATACTACCTCTTGCATGGTACCATTTTGAGATAATCCATGAAATGCCATTGACAAGCATCTAAGTCCCAGAAATGCCATCGACAAGTGTGAGTTCCAAGAAATGCCATCGTACAAGCGATTTTGTCCCAAAAATACCATCGCCGCTAGGGTTCCGTCCATTCCGCGCCGTTAAATACACTGTTGCATCCTATAGAACTTAACGACGTGGAATGGACGGAACCCTAACGGCGATGGTATTTTTGGGACAAAATCGTTTGTACGATGGCATTTCTTGGAACTCACACTTGTCGATGGCATTTCTGGGACTTGGACGCTTGTCAATGGCATTTTATGGATTATCTCTATAATTTTAGGTTAGCATATTCAGCAATTATGCAAAAGTATGGTTGTACCTCTTGGGGCCATGATTCATTCTTCTATTGATAATCACCCCCTAGCTAGCATTATTATATCCGTGTTTTGATAGTCGAGATACTTTGCTTGACCATATCTGTTATTTTTTCTATGGAGGGTTCTCTAATTATTTCTGCAAGCTTCTGTAGCTGTTCTATTGACGTGCTAAATTAGTATAGAAGAAAAGCAATGGTCTTGTATATTTGAAGAGTTTGTGCAAAAGTTCTGATGATCCTCACCTGATACACAATATCACAACGTTTTGCAGTTATACCCGTATCATCTTGCAGACTATATCTGCCGAGTTTCGAGGATCTCACCATTTAGATATTATTGTGACATCTTGTTTGAAGCTATGAAGAATGGTAATCTCTTGTTAATAGAAATAGTTTCTTTCATGTCATTTATGTATTTGTTTAGCATCCTCGTATAAAGATCACATTTAATTGGTTAATTATTTTATGTCTTATTTGACATATAATAACAATAAAAAAGGTATTACATTGGTTTCTATTTTATGTTACTACAACATCGGGCAATTCCTGGCCTAAGGGGGTTTTCTTTTAGTTGCAGAACAGGGCAATGTATTGATAGACAATTCTTCCATCTAGTTTTACTATTAAGTTCTATGGGTACCTCAGGGTGTACAGAGTCCCTGTGCAGGCAACTATTATGTACAAAGTTGCATAATTGTTTTTTGTTTCATCCTATTTTGTGATAGTTTTGTGTAATCTATGTCGTTTTTAGTTGAATACCTCTGTAACAGCATGGAAACAATATAAATAAGCTTTTATTTTTGCCAAATTACAAGAAATGTGATTTTACTCTTTTAGGTTTGTTCAGCATAGCTCTTAGAATTAGCCTTTATCTTCAACTGATTATTTCTGATGGCAATAATTTAGTAATCACTTTGAAACATGGAGGTGACTATCATAAATGAGTATACTTCCACCTGCTTTATTCATCGATGTTGTTCCTGTTTATAGTTCTGACATGTTTTGGTTATGTTATTGCAGAGCAACCATATGACAGTATTCCAAACTTCACTGCTGCTGATGCCTTGAGGCTTACTGGCGTTGGAAGAAATGAGTTCATTGATATTATGAACAAATGCAGATCAAAGGTAGTATCCATTCTCATGGCTTTTTGCACATTACCACCTGCTCTTACCTTGAAAACCGTAAATTGTTTTCAAATAGTTCACTGTTTGACTTCTGGAGTAATCTGCTACACACTGAAACAATATTGGACAATTTGGAAGCTCGCAAGAAATAATAAAAACATTGGAATAATGGATATTACCTAGAACATATCTCAACTAAGCAGTAACTGAATCCTAAACCATTAAGCTTACTATTGTTTAGATGCACTTCTGCAGTGTCAGGCTGAATTTGAGTTATGAAATATAACGATTCTGTGTAAACAATGATGTGCAATTGTGCTAACTAGTTAGTCCAGTTCATGAGAAAAGTCATGAATGCACTACCAGGTTACCTTTTCTTTTTTTCAGTATGAATCTAGAGTGGTTTTTCATGATGTAGTAGTACTATTTTGTAGCAAGATCGATTACCCTAGCAAATAATACTATTTCTTGCTGAATTCTTCAGAAACTAATGTGGAAGCTGAATAAGTCAATTGCAAAAGAATTATTGCCTACACAGCCTGTTGACTTCCCAATCGATCCTTGGTGGGGAGTTTGTCTTGTGAACTTCACTATAGAAGAGTTTAAGGTCAGGTTTGCCCCACTCTCTATATGCTGTACATATCACAATATGTATATCAATGCGGTGAAACTGCTTTTGTTAGCTTGGAAGATAAACGAATTTCTCGAGTTTTTGTTTCTATATGAAGCTATTATTTCTTGATGAAATCTTTACATCTCATTGGTTGATTGTAGAAACTTTCAGAGGAAGAGACTGCAACAATAGACAAAATATGCAAAGAAGAAGCCAATTCCTATGTTCTATTTGACCCAAAGGTCATAGATGGCCTTTATAAAAGAGGTTTGGTGTATTTTGATGTGCCTGTTTACCCTGACGACCGCTTTAAAGGTATTGACCGTTTTAAATGATCTTTTCTAGTGAAAATCCAGTAAAATTAAGCTAATTGGTTGGCACTATTTTCTTTTGTATTGTATCTAGATTCTATACTCATGAGTTTACCTTGTTTAATACTTTAATGTCAACAAGTATGATATGAGTATACTCTTGTCTTGTAACTACTGACTGCCAAGGAATGTTTGAGACACTCCTTATTTCGTCATCTTATAATGAGCTTCCTATGTAAGAATAACTTATAAACTGTGCATGTAGTTTTATTCCTTCTTTTACTATAGTAAGCATGTGTTTTTCTGTTTTCAACTAGGAAAACTTGTATTTATGTTACTTCTCTAGTTTTAAAAGATGTTATATTGTTCTGTTTCAGTTTCCAGGCTCGAAGGTTTTGTTTCTAACAAGGATCAATCATATGAAGACCCAATCGAAGAGTATGTACTAGTAGTGCTTTCAGTTGATATTCAAATCAATTTTACTTGTAATTTTGTGCTGCCATCAAAGTGAGTACTGCTTACCTTTTTTTTCTTTTATTTCAGGCTACTTTATGCTGTATTTGTTGTGTCAAGTGCCAATGCTACTGTAGCTGAATTGGCTGCAACTCTACTAGCTGACCTTTATCAGCTGCAAGCAGCTGCGTCGTTTGCTTGTCGACTGGGCTGGGCTGTAAAACTTATGGATGCTGACTCTGTACTTGAAGATGCACCCACTTTTCCCAGTAACATTCTGAGTGATGATGAAGAAGGTTCAAATGCAAGCATCAATTCAGAAAAGTCTGGCCAACAGTTGCTCAGTGTTGATGCTGGACCAAGGAAAATATCTGGAACTGCCCATGTAGCGTTGG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