BGIOSGA003478
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA003478 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA003478, complete gene. |
| LocusTag |
P0463A02.27 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA003478-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA003478-PA |
| Length |
13958 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:15555052..15569009 |
| Sequence Coding Region |
15555052..15555135,15555260..15555605,15555706..15555830,15556173..15556254,15556702..15556934 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:15555052..15569009 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:15555052..15569009 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCGGCGAGGCTGCGGGTGGAGGAGCTCCGCGCCGAGCTGCAGCGCCGCGGCCTCAACGCCTCCGGCAACAAGCCAGTGCTCGTGCGGAGGCTGGACGCCGCCATCCGGAAAGAGGAGGAGGAGGAGGCTGCGGTGTCCGCAGCAGCGAAGGAAGAAGCAGATGCAGGTGGCGTGGTGGACGGCGAAGGGAATGGCGAGGACAAGAGGAAGAGGAAAAGACGCGGTGATGGAGAGGATGTGGATAACAGTGAATCGGACGCGGCGAAGCTGGAGGGGATGAGCTATCGTGAGCTCCAGGCACTGGCCAAGTCGAGGGGACTCGCAGCAAATGGGAGCAAGAAGGAGGTTATTGAGAGGCTGCTCTGCGCCCCTTCTGATACGGATGGTGGAGTTCAGGACAAGAAGAAAATCGCAAAAGGTTTTGCTGATGGTGACGACAGAGTTGAGGAGTGTAGAAAGGAGAAGATTGTTACAGCCACAAGGAAAGGTGCTGCGGTGTTGGACCAGCACATCCCTGACCATATAAAAATGACCTATCATGTCTTGCAAGTGGGTGATGAGATCTATGATGCCACCATGAACCAGACTAATGTTGGAGACAACAATAATAAGTTCTATATCATCCAAGCCTTAGAATCTGATGCTGGAGGAAGCTTCATGGTTTACAATAGATGGGGGAGGGTAGGGGCACGGGGTCAAGACAAGCTACATGGTCCCTTTTCATCACGAGAACAAGCAATATATGAATTTGAGGGAAAGTTCCATAGCAAAACCAATAACCATTGGTCAGATCGCAAGAGCTTTGAATGCTATGCAAGGAAATACACCTGGCTTGAGATGGACTATGGTGAAGCAGACAGGGAAACAAACAAGAAAGTCAGTCCCAGCACTGATCAGATAAAAGAAACGAAACTTGAAACTCGAATTGCAAGTTTCATATCCCTCATCTGCAACATAAGCATGATGAAGCAGCAAATGGTGGAAATAGGTTACAATGCTGATAAACTTCCTCTTGGAAAGCTAAGTAAATCCACAATATTTAAGGGTTATGATGTTTTAAAGAGGATTTCCAATGTTATTTCGAGGGCAGACAGGAGACAGCTTGAACAATTGACTGGGGAATTCTACACTGTGATCCCTCATGACTTCGGTTTTAAGAAAATGCGTGAATTTATTATTGACACTCCTCAGAAGCTAAAAGCTAAGCTGGAAATGGTTGAAGCCCTTGGTGAGATTGAGATTGCAACCAAGCTTCTGGAGGATGATTCAACCGACCAGGATGATCCATTGTATGCTCGATACAAGCAACTTAGCTGTGACTTTACACCTTTGGAAGTTGGTTCTGAAGAATACTCTATGATAAAAACATATTTGGCAAATACCCATGGAAAAACGCACACAAGCTATACTGTTGACGTAGTGCAAATATTTAAGGTGTCAAGGCATGGTGAAATGGAACGGTTTCAGAAATTTGCTACTGCAGGCAATAGGATGCTTTTATGGCATGGTTCTCGGTTGACTAACTGGGCCGGCATTCTGTCTCAAGGTTTGCGAATTGCTCCTCCTGAAGCACCTGTTACTGGCTACATGTTTGGGAAAGGAGTATACTTTGCTGATATGTTTTCCAAGAGTGCAAATTATTGCTATGCTTCAGAAGCCTGCAGGTCCGGTGTGCTGCTTCTATGTGAGGTTGCACTCGGTGAGATGAATGAGCTACTAAATGCAGATTATGATGCCAATAACCTGCCAAAGGGAAAGCTAAGCACGAAAGGAGTTGGCCAAACAGAACCGAACACAGCAGAGTCGAAGATCACGGATGATGGTGTGGTTGTTCCACTTGGAAAACCTAAGGCAGAGCCTTCAAAAAGGGGTAGCTTGCTGTACAATGAGTTCATAGTTTATAACGTAGATCAGATAAGGATGCGGTACGTTCTCCATTCCCGATTAGCAATTGCCATTGCTCTTCGCTTCAAAATGATCTTATCCTTGCACAATAACACCTTCTTCCAGCAACTTCAAGACGAGGGCGACCTTGAAGAATCCATGGGGATGCCTAGGCCAGTTGGGACTGATTGGGTTAGTCACGTCGTCAATCGGAGAAACAGGAAGAAGCCAGTTGGGACTGATTGGGTTAGTCACGTTGTCAATCGGAGAAATAGGAAGAAGCATAGAGGTTCCACGGAGTCTGCCGTTAAATCTGAGGAGCAAAAATTGCTCAACCCGAACGGCGACGAAGCCACAAGCGGCAATAGCCTCGTGGGCGGCGTGACCGTGGGAGGCAGGAGCCACTTGAGTGGCGCAGCCGCGGGCGAAGGAGACCCCGTGAGCAGTGCGGCTGTAGGAGGCGACGACCACACGGGTTGCGGCACCACAGTCGATGGAGACCCCATAGGCGGCGCGGCTGCGAGAGGCGGCGAAGACCTCGCGAGAGGCGACGGCGTGGCCGTGGTCGACGCAAATGCAGATCTCGATGCTGCGGAGTGCAGCCCGGCGACGCGCCTGGCGTCGTGCGTGCGTGCATCGGAGTGCCTGACCTCGCGCAGCTCTCCACCGCCATCGCCGCCGGGGAGGACCTGTGCCCGTTCGTGCGGCGCGCGTTCGCGTGCGGGCGCCCCGAGCCGCTGCTCGCCTCGCTCCGGGCGTGCGGCGCGGGACCGGGAGGCCGAGATCGAGGAGCTCTGCCGCGCCCACTTCCACGACTTCATCCGCGCCGTCGACGACCTCCGCTCCCTCCTCGCCGACGCCGACGCGCTCAAGGGCTCCCTCTCGGCCTCCCACGCCGCGCTCCTCTCCTCCGCCGCCCCGCTTCTCGCCTCGCTCGAGTCCTTCCTCGCCGCGCGCGGGCTCGCCGGGAACCTCTCCTCCGCGCTCGCATCCTCCCGACGCTGCGTCCGCCTCCTGGCGCTCGCCAACCGCGCCAACGCGCACCTGCAGGGCGGCAACCACAACCTGTACCTCGCCCTGCGCGCCGTCGATGCCATTGACCGCGACCTCGCCTCCGGCCCCGAGCCGCTGCCGCTCCCCACCCTCCGCCGCATGTTGCTCAGCCTCGTCCCCGCGGTGCGCGCCCACGCCGAGCGCGAGATCTCCAGGGAGTTCTCCGATTGGATGGTTAGCATCCGCGCCGCGTCGCGGCACCTTGGCCAGGTAGCCATTGGCCGCTCAGCTGCCGCCAGGCAGCGCCAGGAGGAGCTCCGATCCAAGCACCGCCCGCTTGAGGAGTGCATAACGCTGGACGACGATGGCGTCGGCGACCTTGATGACTTCGCAGCTGCCGCCGCAACAGCAGACGTTGCAGATGGTGCCGCTGCAGCATCATTCGACCTCACGCCACTCTACCGCGCGATGCATATACACCATACCCTGGCACTTGGCGAGCGGTTCAAGAAGTATTACCTGGAGAACAGGAAGCTTCAGCTGACATCGGACTTCGATGTGATTGCAGCAACACCGTTCCTCGAGTCTCACCAGGTGTTCTTCTCGCAGATTGCTGGTTTCTTCATTGTCGAGGACCGCGTGTTTCGGACAGGGGGTGGGCTCACGTCCCGGCCTGATGTAGATGCATTGTGGGATTCTGCTGTTGCAAAGATGGTCTCTGTAATGGAGGACAACTTCTCTCGCATGCAGACAGCAAATCACCTGCTTCTGATAACTGATTATGCTGCTTTACTTTCTGCCACGATGAGGCGGTATGGTTATCCAGTTGGGATGCTGCTCGATGTGCTGGCTAGGCACCGGGACAAGTACCATGACTTGCTACTTGCTGATTGCCGTAGGCAGGTGGTAGAGGCACTGGCTGCAGATAAGTTTGATCAGATGCTGATGAGGAAAGAGTATGAATACTCAATGAACGTGCTTGCATTTGGGATCCAAAGCTCGGATATCACCCCAGCGTTCCCGTATGTTGCTCCATTCTCATGCACCGTGCCAGATATTTGCCGCATAGTTCGGTCATTCATTGAGGATTCTGTAAGCTTCATGGCACATGGGGGTGGTGGGGACACTTATGCAGCCGTGAAGAAGTACCTTGGTCGGATTCTCTCGGAGGTGGTTGATGCATCGATACAAAAGCTCGTGGATTCTGGTGGTGGTCTGAGTGTGTCCCAGGCAATGCAAGTTGCTGCAAATATGTCTGTTATGGAGCGTGCGTGTGAGTTTTTCACAGGCCATGCAGCGCAACTGTGTGGTGTGCCACTTCGTGCAGTGGAGCGTGGGCGGCGTGACTTCCCACTTCGCAAGTCCCGTGATGCTGCAGAGGCACTTTTACTACGGCTTCTACGTTCCAAGGTTGATGAGTTCATGGGGCAATCTGATGGTGTCACTTGGATGGCTGATGATCCACCAGCTGGTGGAAATGAGTATGCAAACGAGGTCATTATCTATCTCGAGACACTCACTTCAACTGCACAGCAGATCCTCCCTCTTCCAGTGCTCCGCCGTGTGCTTGTGGCAGTGCTTGCCCACATCTCTGAGAGGATTGTCGGGCTCTTCTTGAATGACTCAGTCAAGCGGTTTAATGCTAGTGCAGTCACCGGAATTGATACCGATCTCAAAATGTTCGAGGCGTTTGGGGAGAGCATGTCCAGTTTGTTTGTGGACTCTGATCAAGAGTCTGCAGCAAATGAAATGAAGGCTGCACTTGTGGAGGCGAGACAGCTAGTGAATCTTCTTATGAGCAACAGCCCAGAGAATTTCCTTAATCCAGTGATCCGTGAGAAGAGCTATAACAAGCTTGATTACAAAAAGGTGGCAGCCATATCAGAGAAGTTTCGGGATTCCTCAGAGAGCTATTTCTCAACATTTGGAACTAGGGGTGCTAGGCAAAATCCGAAGAAGAAATCTCTTGATACTCTCATCAAAAGGCTCAGAGAAGCCAGCTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSARLRVEELRAELQRRGLNASGNKPVLVRRLDAAIRKEEEEEAAVSAAAKEEADAGGVVDGEGNGEDKRKRKRRGDGEDVDNSESDAAKLEGMSYRELQALAKSRGLAANGSKKEVIERLLCAPSDTDGGVQDKKKIAKGFADGDDRVEECRKEKIVTATRKGAAVLDQHIPDHIKMTYHVLQVGDEIYDATMNQTNVGDNNNKFYIIQALESDAGGSFMVYNRWGRVGARGQDKLHGPFSSREQAIYEFEGKFHSKTNNHWSDRKSFECYARKYTWLEMDYGEADRETNKKVSPSTDQIKETKLETRIASFISLICNISMMKQQMVEIGYNADKLPLGKLSKSTIFKGYDVLKRISNVISRADRRQLEQLTGEFYTVIPHDFGFKKMREFIIDTPQKLKAKLEMVEALGEIEIATKLLEDDSTDQDDPLYARYKQLSCDFTPLEVGSEEYSMIKTYLANTHGKTHTSYTVDVVQIFKVSRHGEMERFQKFATAGNRMLLWHGSRLTNWAGILSQGLRIAPPEAPVTGYMFGKGVYFADMFSKSANYCYASEACRSGVLLLCEVALGEMNELLNADYDANNLPKGKLSTKGVGQTEPNTAESKITDDGVVVPLGKPKAEPSKRGSLLYNEFIVYNVDQIRMRYVLHSRLAIAIALRFKMILSLHNNTFFQQLQDEGDLEESMGMPRPVGTDWVSHVVNRRNRKKPVGTDWVSHVVNRRNRKKHRGSTESAVKSEEQKLLNPNGDEATSGNSLVGGVTVGGRSHLSGAAAGEGDPVSSAAVGGDDHTGCGTTVDGDPIGGAAARGGEDLARGDGVAVVDANADLDAAECSPATRLASCVRASECLTSRSSPPPSPPGRTCARSCGARSRAGAPSRCSPRSGRAARDREAEIEELCRAHFHDFIRAVDDLRSLLADADALKGSLSASHAALLSSAAPLLASLESFLAARGLAGNLSSALASSRRCVRLLALANRANAHLQGGNHNLYLALRAVDAIDRDLASGPEPLPLPTLRRMLLSLVPAVRAHAEREISREFSDWMVSIRAASRHLGQVAIGRSAAARQRQEELRSKHRPLEECITLDDDGVGDLDDFAAAAATADVADGAAAASFDLTPLYRAMHIHHTLALGERFKKYYLENRKLQLTSDFDVIAATPFLESHQVFFSQIAGFFIVEDRVFRTGGGLTSRPDVDALWDSAVAKMVSVMEDNFSRMQTANHLLLITDYAALLSATMRRYGYPVGMLLDVLARHRDKYHDLLLADCRRQVVEALAADKFDQMLMRKEYEYSMNVLAFGIQSSDITPAFPYVAPFSCTVPDICRIVRSFIEDSVSFMAHGGGGDTYAAVKKYLGRILSEVVDASIQKLVDSGGGLSVSQAMQVAANMSVMERACEFFTGHAAQLCGVPLRAVERGRRDFPLRKSRDAAEALLLRLLRSKVDEFMGQSDGVTWMADDPPAGGNEYANEVIIYLETLTSTAQQILPLPVLRRVLVAVLAHISERIVGLFLNDSVKRFNASAVTGIDTDLKMFEAFGESMSSLFVDSDQESAANEMKAALVEARQLVNLLMSNSPENFLNPVIREKSYNKLDYKKVAAISEKFRDSSESYFSTFGTRGARQNPKKKSLDTLIKRLREAS</aaseq> |
| Gene Sequence |
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