BGIOSGA003490
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA003490 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA003490, complete gene. |
| LocusTag |
B1157F09.10 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA003490-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA003490-PA |
| Length |
7464 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:15856003..15863466 |
| Sequence Coding Region |
15856003..15856009,15857569..15859538,15859853..15859960,15860060..15860230,15860765..15861007 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:15856003..15863466 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:15856003..15863466 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGAGGGTGGTCGGCCCAGGGACACTTCGGTCGTCGTCGTCGTGTTAGATACGAGCGAAGTGTACATTGTGGCTAGTTTGTCAACAAGGAAGGATACTCAGGTAATCTACGTCGACCCAACCACGGGTTACCTGCACTACCTGGGGAAGCACGGCGAGGACCTTTTTGATTCGGAGGCAGCAGCATTGAACTATATCACTAATGGATCAAAGATTCTGTGCAAGAGTACTACGTACTCTAAAGCTGTACTAGGTTATGCGATATTAGGGAGTTACGCATTGCTTCTGGTTGCGACGCAGCTGAGTGCGACAGTACCAACCCTACCTGGAGGTGGGTGTATATATACAGTGGCAGAGAGTCAATGGATAAAGATCCAACTGCAAAACCCACAAGCCCAAGGTAATGGAGAATCGAAGAATATCAAGGAATTGGCTGAACTTGACATTGATGGGAAGTACTACTTCTGTGAAACAAGGGATATTACCAGGCCGTTTCCGAGCCGTATGACTCTTCGGGAACCAGATGAAGAATTTGTGTGGAACAGATGGTTAGCAAAGCCTTTTATGGATATTGGGTTGCTAGGCCATTGTGTTGTTCTATTGCAGGGTTTTGCCGAGTGCCGGAGTTTTGGAGGTACAGGACAGCAAGGTGGGAGAGTTGCCCTCCTTGCACGACGTAGTCGGTTGCATCCTGGGACCCGCTATTTGGCCCGTGGCATAAATGCTTGTTCAGGCACAGGTAATGAGGTGGAGTGTGAGCAGCTTGTATGGGCTCCTCGGAAGGATGGTCAAGGGCAATCTATTCCCTTTAGCTCTTATATTTGGCGCCGTGGAACTATACCAATATGGTGGGGTGCCGAGATAAAAAATGCTGTTTCAGTAGAGGCTGAAATTTATGTTGCTGATGATCCTTTCAATGGGAGCTTACAATACTACCAACGGCTGGGTAGAAGATATGGAAATAAATCATTGGAAGTCAATGCAACTAGTCAAAAGAAACCTGGAGTGGTTCCCATTGTGTGCGTTAACTTGCTGAGATATGGTGATGGAAAACCTGAGACAGTTCTTGTTGATTCTTTCAAAAGTTCTCTAGAGTACCTGAGGTCTACTAAAAAGCTTGGGAAAACCTGGATTCAGTTGATAAATTATGACTGGCATGCCACTGTGAAGTTAAAAGGGCAACAACAGACAGTTGAGGGCCTTTGGAGACACCTTAAAGCACCTACAATGGCAATTGGCTTCAGTGAAGGAAAATACTATAATGTAAAGCAGCAGCTTAAGGAATGTAAAGGATCAGTTATCTTCAATGATGACATCAATGGTGGGTTTTGCATGGAATCTATACAAAACGGGGTGGTGCGCTTCAATTGTGCAGACTCTCTTGATCGAACCAATGCTGCAAGCTACTTTGGGGCACTTCAAGTTTTTGTCGAACAGTGTAGTCGATTGAGTATATCCCTTGATGTTGATGCAATGTTTGGGTTATCATCAAGCAGGTATCCTGAATATAATGGCAGAAACCCTCGTACTTTGCCCCCTGGATGGGAGGAGCGCTTTGATTCTGTAACAGGAAAATCATTCTATATTGATCATAATACACGCACTACAACGTGGGAGCATCCATGTCAGGAGGCTCCCCAAAAGCCCTGGAAGAGATTTGATATGACATTTGATCAGTTCAAAGGCTCGACGATGCTTGCTCCAGTGAATCACCTTGCTGAACTTTTTCTTCTGGCTGGTGATATCCATGCTACATTGTACACTGGCTCAAAAGCTATGCACAGTGAAATTCTGAACATATTCAAGGAAGAGACTGGAAAATTTAGTAAATTCTCAGCTGCTCAGAATGTCAAGATTACGCTGCAAAGAAGGTTCCAGAATTATATTAATGATAGTTCTCGTCAAAAACAGTTTGAGATGTTCCTTGGATTGAGGCTGTTTAAGCATCTCCCATCCATCCCTATTTCTCCTCTCAAAGTACTTTCGAGGCCATCTGGATGCATGTTAAAACCAGTTCCTAGTATCACCCCAGTGGCTGATGGTGGTTCTAGTCTTCTCAGCTTCAAAAAGAAGGATCTGACTTGGGTATGTCAGCAAGGTGCTGATTATGTTGAACTTTTTATATACCTTGGAGAACCTTGTCAAGTTTGTCAGCTTCTTCTTACTGTCTCTCATGGTGTTGATGATTCTTCATATCCAGCAACTATTGATGTTAGAGTTGGCTCCAGCGTAGATACCCTTAAGCTTGTTCTTGAGGGTGCTTGCATTCCACAATGCTCCAATGGGACGAATTTGTTGATCCCACTTACTGGAAGAATTGATCCAGAGGACTTAGCTGTGACAGGTAAAAGTGCTCGTCCAAATATTCAAGAGAGCACTTACCTTCCTTTGCTGTATGACTTTGAAGAGCTGGAAGGAGAATTAAACTTTTTAAATAGAGTTGTTGCATTATCTTTTCATCCATCGGCCAGGGCAAGAACACCAATTACTCTTGGTGAGATTGAAGTGCTTGGGGTTTCTCTTCCATGGGTGGATATGTTAACAGATAGCAGACGTGGCCCTGATTTTGTAGAGCTTCTACATGAAAAGTTGTCTAGTATTCCTGGCAATGTTGGTTCAAAGGAATTTGCAAATTCTTCAAATTCTTTCTTGCCTCAAAATGGTATTGTTGGTAGTGAAAGAGCCTCTTCTACTAAAAGCTCTTCATCAGTTCTACAAGGCAGTTCAGGAAATTTTGTGGACTTTCTCACTGGTGATTTTGACATGCTGAATCAATCAGATGCAACTGAAAATACATCTTTTGTTAATGTGGAACAAACGAACTCATTTGATGATGACTTTGATGTTAACCCTTTCGCCACTGCATCAGAAACACCTTCTGTTAAAGTGAATAGCCAGGTTGAAGAATTTGACAGTGCACACATTTATCTTAAGTTTTTTGAATCATTTTCTGGAAATATCAAGGGTAAGGGTCTTAACTTCGAGCAAATGATGAAGCTTGAAATAAAGCGTCTTTGTCTTGATCTTTCTGCTGCCGAAAGAGACCGGGCGTTATTATCGATCGGTGTTATTCCTGCCACAGTAGACCCAAACCGCTCGGTTGATTATTCTTACCTGTTGAAGTTGTCTAGCCTTGCTGATTATCTGGCATTGCTGGGCCATACTGTCCATGAGGATCGTGTCAATGCTTCAATAGGGCTCGAAAATATCAATGGTCATGCTATAGACTTTTGGAATATTTGTGAAAATGATGAGTCGTGCACAGGTGATGTATGTGATGTCCGTGCTTTGTCTTCATCACACGCTTCTGCCACTAGTGAGAACTCATCAATATTTGTAGAGTGTTCCCAGTGTGGAAGGACAGCATGCAAAGCATGTTGTGCTGGGAAAGGAGCCTTTCTTTTGCTTAATAACACTTACAGAGATCTGAAGATATATGGTGGGAGTCAAGGTGGTGGCTATTCAGCTCTTGCAGATAATTTTGTGTGCAAATCATGCTGCAGTGAGGTGATCAAACATGCATTATATGTGGATTATGTGAGGGTTCTTCGCAGCCTGCGAAAAAAAGGTCGTACCGAGCAAGCAGTACTGAAAGCTGTGAATCAGGCCTGCGGACTTGAATTCAGTAGGATATCCGATTTCACAAAAAGTGTTCAATATGGTCAAAAGCAATTGAAGCAGCTCCTTGATGGTGAAGAATCCCTTGCAGAATTTCCATATGCAAGCTTTTTACAAACGGTAGAAACTTCTGATGACTCAGAACCACTGTTGTCATTACTGGCACCATTTGGTATTGGAGAGCAAAAGTCTTATTGGAAAGCTCCACTGGATAACACATCTGTGGAGTTCTCAATTGTTCTTGGTGGTCTATCTGATGTTTCAGGAGCTGCAATAATTGTTGGTTCCTGTGGATACTCAACATCTGACTGCCCAATTGTTCCGAGGGTGCCTTTGTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEGGRPRDTSVVVVVLDTSEVYIVASLSTRKDTQVIYVDPTTGYLHYLGKHGEDLFDSEAAALNYITNGSKILCKSTTYSKAVLGYAILGSYALLLVATQLSATVPTLPGGGCIYTVAESQWIKIQLQNPQAQGNGESKNIKELAELDIDGKYYFCETRDITRPFPSRMTLREPDEEFVWNRWLAKPFMDIGLLGHCVVLLQGFAECRSFGGTGQQGGRVALLARRSRLHPGTRYLARGINACSGTGNEVECEQLVWAPRKDGQGQSIPFSSYIWRRGTIPIWWGAEIKNAVSVEAEIYVADDPFNGSLQYYQRLGRRYGNKSLEVNATSQKKPGVVPIVCVNLLRYGDGKPETVLVDSFKSSLEYLRSTKKLGKTWIQLINYDWHATVKLKGQQQTVEGLWRHLKAPTMAIGFSEGKYYNVKQQLKECKGSVIFNDDINGGFCMESIQNGVVRFNCADSLDRTNAASYFGALQVFVEQCSRLSISLDVDAMFGLSSSRYPEYNGRNPRTLPPGWEERFDSVTGKSFYIDHNTRTTTWEHPCQEAPQKPWKRFDMTFDQFKGSTMLAPVNHLAELFLLAGDIHATLYTGSKAMHSEILNIFKEETGKFSKFSAAQNVKITLQRRFQNYINDSSRQKQFEMFLGLRLFKHLPSIPISPLKVLSRPSGCMLKPVPSITPVADGGSSLLSFKKKDLTWVCQQGADYVELFIYLGEPCQVCQLLLTVSHGVDDSSYPATIDVRVGSSVDTLKLVLEGACIPQCSNGTNLLIPLTGRIDPEDLAVTGKSARPNIQESTYLPLLYDFEELEGELNFLNRVVALSFHPSARARTPITLGEIEVLGVSLPWVDMLTDSRRGPDFVELLHEKLSSIPGNVGSKEFANSSNSFLPQNGIVGSERASSTKSSSSVLQGSSGNFVDFLTGDFDMLNQSDATENTSFVNVEQTNSFDDDFDVNPFATASETPSVKVNSQVEEFDSAHIYLKFFESFSGNIKGKGLNFEQMMKLEIKRLCLDLSAAERDRALLSIGVIPATVDPNRSVDYSYLLKLSSLADYLALLGHTVHEDRVNASIGLENINGHAIDFWNICENDESCTGDVCDVRALSSSHASATSENSSIFVECSQCGRTACKACCAGKGAFLLLNNTYRDLKIYGGSQGGGYSALADNFVCKSCCSEVIKHALYVDYVRVLRSLRKKGRTEQAVLKAVNQACGLEFSRISDFTKSVQYGQKQLKQLLDGEESLAEFPYASFLQTVETSDDSEPLLSLLAPFGIGEQKSYWKAPLDNTSVEFSIVLGGLSDVSGAAIIVGSCGYSTSDCPIVPRVPL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..7#1567..3536#3851..3958#4058..4228#4763..5005#5122..5586#6063..6836#7094..7291#7444..7464#ATGGAGGGTATTTGTCGCGTTAGTAATCACATCTCTCCCAAATTTCTAACTATTTCTCGGGAACTAATTCAAGGTCTTATTCGTCTGTTTGCGCCACACTCTCTCATTCAGATTAAGCCACAAATTTGTTCTGAATTTCACCACATATTTGCTACATGCAGTAAAGCCAACTTGGAAAATGAAGGTTGGTGTTGGGCACTTGTGCCCACCACGAGGCAAGGATGTCCTTACTGTTGTTGCTATAGATGGCTTCACAATTAGCGCTCTTTTATTGTCCCTCGTTTTCTGAAAGGTCAGGGCCTCAGGGGATCAGACCTTCTCCACTTGGGATTAAGGGTAATGATCATTTCGATTCCAGATTTTGCATGGGGGCAGAGAGATTTTTGCAAAGTCGTTACTTATCTCCCCCTAATTTTGTGGCAATGGGCCCATATATCATATATTGTTCCTATACTAATGTTTATTTCCCCCGCCAAATAATTGTCAACCCAGCTTTGTCGCAATCTCAGTTTGAACAGTCATGCAGACTATTGCTGGTCGATCATATGGAGAACACAATTCCAGTTAATGAACCAAAACATGTATTTAGATATAACTTTTGACAGTCATACTTGTGTAAAAGGTTTTAGGTTTCAAACATACCCTTTTCAGAGTCTTCAGACTACACTCAGTCTTTGGTTTGTTAACAATTTTCCATTTTGAACTTCAATTTGTAAACTTCATGGCACAAGTGTGTGCTAAAATCTCAAAATACTTCATTGGCCCAGTAGACTTACATTTTTTTTCCGAGATTTCTAAGCCTGCAATGTTTTTTGAAGCCTAAACCTGCAACCATGAAATGCAAGGCATCATATATGGTGATTATGGTGAATTCATTAGTAAGAAGGTTTTTTCCTTTTTGTTGAAATTAGTTTTGATTTGGTGATATTCTAAAAAGCATGCAGTACAGGAGTCGGTGGCTTAACTTCACCTTCCTGCATGCAAGTTCGAACTAGCCAGTTAACCACTGAGGCTTCAGTTAATTTATATTATATTGATAGGGTTGAACAGTTGTGCCATTACATAATTGTCCTATGTTTTCCTGCTTTGTGAATTTCCAAGTTGAAAAATGTTGCTTTCCATGGTAAATAAGTTTTTGAGAAGGATAAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCCGCTCTCCGCTCTTCGTTTCGTGCAGAGCGGATCGGCAGCGACTGGGCTTGATCCGAGATCGCGCGCGCAGTCGGTTAATTAGTTAGGCTCCGCTTATTATAGTTTGCTGCACCTAATTGGATCAAACTGTAATACCATACTACATCGTACTGGTTGCTTCCTGTTTGTGCGTAGCAATTAGTGCTGCTATTAATGAATGAATGAATCGATCATGGCTGGCTGCTAGCTGCGCGATGGTATTTTTGTGCAGATTCGACGGGCATACAATTTTGCTGCTGTTCTACCTCCTTGACCAATCACATATTCGCCTCCTTCCATTTATTTACAAAGTGCTTTGGATGATTGCCTTGTCTCCATTTCAGGTGGTCGGCCCAGGGACACTTCGGTCGTCGTCGTCGTGTTAGATACGAGCGAAGTGTACATTGTGGCTAGTTTGTCAACAAGGAAGGATACTCAGGTAATCTACGTCGACCCAACCACGGGTTACCTGCACTACCTGGGGAAGCACGGCGAGGACCTTTTTGATTCGGAGGCAGCAGCATTGAACTATATCACTAATGGATCAAAGATTCTGTGCAAGAGTACTACGTACTCTAAAGCTGTACTAGGTTATGCGATATTAGGGAGTTACGCATTGCTTCTGGTTGCGACGCAGCTGAGTGCGACAGTACCAACCCTACCTGGAGGTGGGTGTATATATACAGTGGCAGAGAGTCAATGGATAAAGATCCAACTGCAAAACCCACAAGCCCAAGGTAATGGAGAATCGAAGAATATCAAGGAATTGGCTGAACTTGACATTGATGGGAAGTACTACTTCTGTGAAACAAGGGATATTACCAGGCCGTTTCCGAGCCGTATGACTCTTCGGGAACCAGATGAAGAATTTGTGTGGAACAGATGGTTAGCAAAGCCTTTTATGGATATTGGGTTGCTAGGCCATTGTGTTGTTCTATTGCAGGGTTTTGCCGAGTGCCGGAGTTTTGGAGGTACAGGACAGCAAGGTGGGAGAGTTGCCCTCCTTGCACGACGTAGTCGGTTGCATCCTGGGACCCGCTATTTGGCCCGTGGCATAAATGCTTGTTCAGGCACAGGTAATGAGGTGGAGTGTGAGCAGCTTGTATGGGCTCCTCGGAAGGATGGTCAAGGGCAATCTATTCCCTTTAGCTCTTATATTTGGCGCCGTGGAACTATACCAATATGGTGGGGTGCCGAGATAAAAAATGCTGTTTCAGTAGAGGCTGAAATTTATGTTGCTGATGATCCTTTCAATGGGAGCTTACAATACTACCAACGGCTGGGTAGAAGATATGGAAATAAATCATTGGAAGTCAATGCAACTAGTCAAAAGAAACCTGGAGTGGTTCCCATTGTGTGCGTTAACTTGCTGAGATATGGTGATGGAAAACCTGAGACAGTTCTTGTTGATTCTTTCAAAAGTTCTCTAGAGTACCTGAGGTCTACTAAAAAGCTTGGGAAAACCTGGATTCAGTTGATAAATTATGACTGGCATGCCACTGTGAAGTTAAAAGGGCAACAACAGACAGTTGAGGGCCTTTGGAGACACCTTAAAGCACCTACAATGGCAATTGGCTTCAGTGAAGGAAAATACTATAATGTAAAGCAGCAGCTTAAGGAATGTAAAGGATCAGTTATCTTCAATGATGACATCAATGGTGGGTTTTGCATGGAATCTATACAAAACGGGGTGGTGCGCTTCAATTGTGCAGACTCTCTTGATCGAACCAATGCTGCAAGCTACTTTGGGGCACTTCAAGTTTTTGTCGAACAGTGTAGTCGATTGAGTATATCCCTTGATGTTGATGCAATGTTTGGGTTATCATCAAGCAGGTATCCTGAATATAATGGCAGAAACCCTCGTACTTTGCCCCCTGGATGGGAGGAGCGCTTTGATTCTGTAACAGGAAAATCATTCTATATTGATCATAATACACGCACTACAACGTGGGAGCATCCATGTCAGGAGGCTCCCCAAAAGCCCTGGAAGAGATTTGATATGACATTTGATCAGTTCAAAGGCTCGACGATGCTTGCTCCAGTGAATCACCTTGCTGAACTTTTTCTTCTGGCTGGTGATATCCATGCTACATTGTACACTGGCTCAAAAGCTATGCACAGTGAAATTCTGAACATATTCAAGGAAGAGACTGGAAAATTTAGTAAATTCTCAGCTGCTCAGAATGTCAAGATTACGCTGCAAAGAAGGTTCCAGAATTATATTAATGATAGTTCTCGTCAAAAACAGTTTGAGATGTTCCTTGGATTGAGGCTGTTTAAGCATCTCCCATCCATCCCTATTTCTCCTCTCAAAGTTGGTAAACTTGCTCCCTGTCAATACCTTTCTTGCAAACTTTACCAGTAAACTTGATTTTAATTTTCAATATTGCAGTACTGCAACTTCTTTATGCCAAACAGTTTTCATCGCAAAGATGTAAAAAATTCCTGAGTTTTAGCTGATGTTAAATTTACATGTAACTAAAATCCAATCCTACAAACTTCTATAATCATCTCTCAATGCATCTGCTTCAACAAATTACATGTGTAAGATTGATATTTTATCTTCTTGTAGCTAATTTTGGTTTTAAACAATTTTTGGTTGAATCATGCCTGATTTTCATAATTCAGGTACTTTCGAGGCCATCTGGATGCATGTTAAAACCAGTTCCTAGTATCACCCCAGTGGCTGATGGTGGTTCTAGTCTTCTCAGCTTCAAAAAGAAGGATCTGACTTGGGTATTCTGCTTTGGATAGTTATTGTCCAGTATTATTTCTTGATATATGACTATTGTGTTATTGTTTTACCTGTGTCTCACTAAACTTTTACTCCTGCAGGTATGTCAGCAAGGTGCTGATTATGTTGAACTTTTTATATACCTTGGAGAACCTTGTCAAGTTTGTCAGCTTCTTCTTACTGTCTCTCATGGTGTTGATGATTCTTCATATCCAGCAACTATTGATGTTAGAGTTGGCTCCAGCGTAGATACCCTTAAGCTTGTTCTTGAGGTCTTTTTCATCATCCTATCTCACTGTTTATTATTAATCTCCTTTTTTGTTAATAGTTTTTAACTCGTTTGTTTCATCAAGTTCCTTTGACATATCAAGTTGGCTCACTCGCTGTCAAAAGTCAAAACTGGAAAAACACAATAAATAGCCCTTTCTAGTTTTGTGCCTCTTCAAATGTGTCCTGTAATTTTGATATCTGGCCAAAATGCTATGTTGCTGCTATGAGCACATTACTATCATGGTTGAAAACCAATGTCGAAGTGCATGCTCCTTAACTTCGTTGTGCTAGGCTTGAAACAAAGCTCAGCCCTTGGTTCAGCCTTGATTTTGGCTAAGTTATTATATCCTATCATATATTATTCAACTACTATACTTTTGGCAATGTGTAGTAACTGCTTGTTTTTAGTATTTTGGCTCTTTTCTATTTTTGTATCTTGACTTAGATGATTTCACTTGTGCTCTGCATGCCTTTGTTCTTTTACACTCCTTATTTGGCTAGTAGTTATATAGTTAACTGCAAGATTATTTGTTCAGGGTGCTTGCATTCCACAATGCTCCAATGGGACGAATTTGTTGATCCCACTTACTGGAAGAATTGATCCAGAGGACTTAGCTGTGACAGGTAAAAGTGCTCGTCCAAATATTCAAGAGAGCACTTACCTTCC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|
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