BGIOSGA003662
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA003662 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA003662, complete gene. |
| LocusTag |
OJ1005_B10.13 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA003662-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA003662-PA |
| Length |
11865 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:20895506..20907370 |
| Sequence Coding Region |
20895506..20895774,20904322..20905124,20905653..20906188,20906377..20906445,20906933..20907370 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:20895506..20907370 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:20895506..20907370 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGAGGCAGCCGGGACGAGGGCTTCACAGCAGCAGGAGGAAGCAGCTGGGATTGAGAACGGAGGAGGCAAGGACCAGCTGCCAGAAGATACAAGTAAGTTAAACATAACAGTCCTCTGGCTTGCAATCTACTTTAGGTTGATGGACAGCTTCGGGAAGCTGGCACTTGCCTGGGCCACCGTTGTGCTGCTAGGTGGATTCTCCACCCTGATAAAGCCCAAGGACTTTTGGTTCGTCACCATCATCGTGGTCATGCAAATAACAAGGTTTTTCAACACTTCCAAACCCGAGGACCAATTCTTCATTGGCCTTCCTGAAGCAATCATCAAGGCTGACAGAATTGCTGTACTTGGGCGCGGAAGCTGGCGGAGGTATAGAAGCGACGAAGAGAAGCCTGACGACTACACAAAAATATTTTTGGAGTTGTTTTCGGCCTTCATCAATGGTCGCTCCTGCTTGGCGGTCCTATATCAGACCACCCTTGGATATGCACAGCTGGCTGCAGTGATCGGTACCATGGTTATCAGTTCGTTGCGCCTGAAAAGGCAAGATTATGTCGATCCAATCTATCAACAAAACGATGACCATAAGAACATCAGATGGTCCCTGAACATCTTCTATGGATTGGCGCTCTCCCAGTGCATTGTCTATTTCCTGGTTTCGATCTTGGCAAACCCGTTGAAACGGATGCTACGAGTTGGCCTCACATATAAGCTGGGATTTTGGGGTGTGCTATCTCTTGCTCGCTATGTTGAGGAATGTCTTCTGAAATGCGTCAGTGGTGATCTTCGTGGTGCGGTCAGCATGGATTTGGTTAGCTTTTCAAACGAGCTGCTAAGTTCCGACTCAATAGAGAACCAGCTTATAGGATTTCGTATTGTCGACCACCTTCTCAGAAGCAAAATGTACAAACAGAGGGTGCTGAAGAAGATTCGAGTTTCCATTGGCACAATTCAGATGGCAGTCCACATGCTGAGCTTGAAGATAGACATGGATACAGACACAAGAGGGCATGCTGCACGCGTATTGCTGGAGCTCGCGCCTGACCTCCAGGTGGAGAGCTTTCCTGGCCTTGCTCAAGCTGGTGAAGCTGGGGAGGAGCTTCGGCGCCAAGTGTCTGGAAATTTGCACATCATGGAAGTCATCAAAAAGTTGCTAACTGACCATACTGAAAGCCAACAAGCTGATCTGCTTGTTCAAGTAACAGGAATCCTTGCATTCTTAGCAGCGGATGATACTGCAAGAAAGGAGATCAGAAACTCTCGCCTAATTGTTCGGATGCTCATCTCTTTCCTCGCAGGAGAAATGAATGTTGTTCAAGATCCCATCCCTAGAAAGATGATGGAAACTTTAGCAACTGAAGCGTTAGTTTTGCTTACTACTCATTTTAAAGAAAAGATTGTGCTCAGTACTGTGAGCGAAAGCAATGTTCAGGCCATACTGGCAGAAACAATGGTGGAAGACATGGAAAATATTGTTCATGTACTCTCTGATGAGTCTGCAGATCATAGGATAGGAGTAGGGAAACTCCTGCAGAATCTTAGGGCCTACCAAGGAGCAGAATACACTGAGTTGTTCAAGATAATTGATAAAGCACTGCCAAAGGTACTAGAGACGATCGACCTAGCAGAGTCAAAAATTGAGTCAGATTCTTCTGATGATCATTCTTCACATGCGCAAGAGCTAATAGATTCTGCAGAGGGCAAAGGCAAACTACTGGAGTCCTTTATTGGGCTCACCGTGCAAATTTGCACCAACGGGGATGAAATGGTTTTCACCGATGCACTCAGGAGTGCCAATATTACAGTTGACGAGTTCGTGCTGAAGCTTAAGATGATATTAACTGTGTACAAGTCTCCAACTGCTGATTTTCCAGGGGTAAGAAGGGTTGTAATTCAGCAAATGAATTGGATGATGGAAAAGAACCCGGCGTATATTGTGGTGTTTAAGAAGCACGAAATGGACATCATACTTAAAGAAACAGCAGAGACGGCAACAAAGATTGAAAATTTTTTGTTGTTCCATTCGGGTGTTGGTGCTTTTGAGCATGAAGAGTCCATTTCTAGTATTGTGAGCAAGTCACTGGGACTGATTACAGGTAGTTTTGCTTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAEAAGTRASQQQEEAAGIENGGGKDQLPEDTSKLNITVLWLAIYFRLMDSFGKLALAWATVVLLGGFSTLIKPKDFWFVTIIVVMQITRFFNTSKPEDQFFIGLPEAIIKADRIAVLGRGSWRRYRSDEEKPDDYTKIFLELFSAFINGRSCLAVLYQTTLGYAQLAAVIGTMVISSLRLKRQDYVDPIYQQNDDHKNIRWSLNIFYGLALSQCIVYFLVSILANPLKRMLRVGLTYKLGFWGVLSLARYVEECLLKCVSGDLRGAVSMDLVSFSNELLSSDSIENQLIGFRIVDHLLRSKMYKQRVLKKIRVSIGTIQMAVHMLSLKIDMDTDTRGHAARVLLELAPDLQVESFPGLAQAGEAGEELRRQVSGNLHIMEVIKKLLTDHTESQQADLLVQVTGILAFLAADDTARKEIRNSRLIVRMLISFLAGEMNVVQDPIPRKMMETLATEALVLLTTHFKEKIVLSTVSESNVQAILAETMVEDMENIVHVLSDESADHRIGVGKLLQNLRAYQGAEYTELFKIIDKALPKVLETIDLAESKIESDSSDDHSSHAQELIDSAEGKGKLLESFIGLTVQICTNGDEMVFTDALRSANITVDEFVLKLKMILTVYKSPTADFPGVRRVVIQQMNWMMEKNPAYIVVFKKHEMDIILKETAETATKIENFLLFHSGVGAFEHEESISSIVSKSLGLITGSFA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..269#8817..9619#10148..10683#10872..10940#11428..11865#ATGGCGGAGGCAGCCGGGACGAGGGCTTCACAGCAGCAGGAGGAAGCAGCTGGGATTGAGAACGGAGGAGGCAAGGACCAGCTGCCAGAAGATACAAGTAAGTTAAACATAACAGTCCTCTGGCTTGCAATCTACTTTAGGTTGATGGACAGCTTCGGGAAGCTGGCACTTGCCTGGGCCACCGTTGTGCTGCTAGGTGGATTCTCCACCCTGATAAAGCCCAAGGACTTTTGGTTCGTCACCATCATCGTGGTCATGCAAATAACAAGGTGCGTATCAATACGACATCCCTATGTATATAAAGTAGAAGTTAACTAAACTGCTAATTAGTTTCCGTTTCCACCATCAATTGATACATAGGAAAAGTGCTGGCTTGTTCTTGGGCACTCGATCACAAGAGAAAAATTGGGCGTCCCATGGCTACAGGCAGTGCCCCTCTTTCACTGTGAATAGCCTGCACACGCCAGCCCCTCTCTCTCTCCTATGCATGCATGCATGTATGTGTATCGCTCTAACGAGTTTCAAATATTTTCCCTTAAATTAGTTATTATCTCACATATGATCCAATTACACCCGTATTTATTAAATTACTAGAAAAAATATCCATGCGTTGCAACGGGAAAATACCTTAAATCATGTTAAATATTAGATCCGTACTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAATAACTAATTACATAGATTGCATGTAAATTGCGAGATGAATCTTTTAAGCCTAATTACGCTTGATTGATAATATGGTGTTATAGTAAACATCTGCTAATGACGGATTAATTAGGCTTAATAAGTTCGTCTCGCGGTTTACAGGTGGATTCTGTTATTTGTTTCGTTATTAGACTGCATTTCTCTACTATTATAAAAATTAAAGATGTTTTTGCTGTATTTTGGTACGTCATCCGTGTTTGAGTCGGTTTTTAAGTTCGTTCGCTTTTAGAAATATAGATCCGCGTTTGGCTTGGATTTTAAGCTTATTTTCTTTTGGAAATACAAAAGGAGTCGTAGAAGGAATATCTTTAAAAAAACATGCATGCTAACTTGAGGTAAAATACGGACTTCTAATTGCAGCTTATGATTTTCTAAAAAGAATATCAAAGCGGATTACCACAGTGAATTTTACCCTACTTAAACTGTATAACAACAATAAAACTAAAATAGCATTTACCGTTACAACGCACGGGCATTTTTCTAGTAATACTTGAAATGTGCGTATGTATATATGATATGACACGTCAAAACTTTACACCCCTAATCTAACCACAGCCTAAATCAAACCAGCCCAAAACTTCCGTTTTCTTTTTTTTATTTCTTTTAGTTTTTCTTATGGCCAGATCGCTCCACGCCTCCTGAAACTAATATTTGAATGTTTAGTTCACGCTAAAATGAAAGTTTGAAAGTTTAGTTGAAATTGAAATGATGTGACGAAAAAGTTGAAAGTTTGTGTGTGTAAGAAAATTTTGATGTGATAGAAAAGTTGAAAGTTTAAAGAAAAAATTTGGAAGAATTTGAGTGCTCGATCCAGCGATCTAACGGGGTAGGAAAACTGATGCACGCTCAATGCACAGATGATTTGACACGGCGATGAAAAAAAGAAAACATAAACAATTAATTAGTGCGCAGGTTACTCCTAATCGGATACATATGCGACGTACGAAAATTTTCGACAAAAACATAAACTTTTATAATAGTAGATATAATAATTAGAAAAAATACCCGTGCGTTGTAACAGGTGAAGGCTATTTTAATTTTATTATTGTTATATGGTTTAGTTAAGGTGAAAATCATGAGCTACAATTAGGAGTATGATCATCTCAAGTTAACATGTGAGTTTTTATTAAAAAATATTTCTTATACAATTTCTTCTGTATTTTCGAAAGCGAACGAATTTAAAACCCGACTCAAATACGGATATGTATTTCCAAAAGCCCCCCCACTTAAAAACCGACTCGTACACGGATAACATATCAAAATACCGATAAAAACATCTTTTAACTTTTATAATAATAGAGATAGAGATAGATCTATCTATAAATGTGTCATCCTAAAACGGAGGCAAACTTTAGACCATACGATACAAAAAATTATTACGATGGTCGGCAGGCCCATCCAACATCCACAAAGATCGTGGGATGGGCTGGTTGGAATTTCAACTATTGGACGAATTTCCATCGCACCACTCGACCACAAAACTAGGTACGTAGAGAACATGCATCCTCCGACTTACAAAATTAGATCAATTTACATCCCTTCGAAGTTTGCACGATGTTTTTGTTCTGATATGGTGCATATGTGGCCACGGTTCGACTTGTCGTCGCCTTGATCCTTTTCACTCAAATGAATTTTACAATAATAATCATTAGGTGGGACCCACATGTCCGAAATCCTTTCTCCACCCCTCCCTTGCCAACCAACAGTCCACCACGCCACATGCATCCTCTAGGATTGAAGACACCGAGGTCGTGAGAAAGAGCGCGGGTGTGGTAGCGGCTGAGGACGATGGTGGCGACGACACCACCGTTAGGAGAGGGATGGATGCACGTCCGTCGTCGACAAGATGCAGTCAGTGTGAGCAGAGGAGGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATAGATAACTTATTATGGTTAATAAATATGTGATTCTTTCATGAGAATATTTATGTTATGTGTTGCTATTTCTAAAGGATCCCTGATCAAATATCATATGTGGAACAAATATGTTTAGATGATCAACACATGTATTAATTGATGATCATGTCTCATGGATCATGGTATAGAGATACTAAATTAATAATGTGGACATATGTTGGTGAACATGTTGTTGGATAGACCCAACATGAGACACTGCAAGAGCCATATGTGTTGTGTCATCAGTGATCTCATTTAGTGTTGGTGTTGAATTCTTAGATCTGAGATTATCATGGTTCTCAACATGTGTAGTAGCTTACTTAGGGACTGCTAAACACTACTCCGTAATTGGGTAGTTATAAAAGTAGTTTTCGGGTATGCTATGAAACATGTAGTGGGATATGAATAATCAAGATGGGATTTGACCGTCCTATGGAGAGATATCTCTGGGCCCCTCGATGTTGTAAATTATGGAAGTGCATGGCCATGCCAAAGGTGATTGAGGAGTCAATCACAAGTTATATAATCTATTAACAGGTTCGAGTGAATGATTGAGCTATTAGAGGATGGCACATATCTAGCCTTGAGCTTAATCGATATCGTGAGGCAAAGGGGTTTATACAAGTATACACTAGAGGTTCAGTCGATATGATTTTTATGTATGCCCGGTGGGTCAATACATTCTAATAGGGGCCGCTATTGACACGTGGATCGAAAAAGGGTTTTCGGGTTACAGCCGAGTATACATGAACCTACAGGGTCGCACGCTTAATGGCCCGAAAATAAGGGGATTGGATGGATATCCAATATAAGCTTAATTCGGATAGGATCCAAATAGAAGTCCTATGGGCCTTGGAGGCCCGAGTGATGGATGCTATATATTTGTGAGGGGTGTGACCGGCGGAGGTATTGCATCACGTGAGAAACCCTAGCCGTCACTTCCCTCCCCGAGCAAAACCCTAGCCGCGCGCGGGTGCTAGCATATCTGCGCGTGGCGTTCTGTCCCTATACATGTGGATACCGGTAGAGGCACCGCTAGTTTGCGGTGCTGATCGGTGTGGGAGTACGGCGAGGAGAACGCACGAGGAGGAGAAGGTCGAGCCGGTGCGATCGACTACTTCCTCTACATCGACGCGCGCTACTTCGCGAGAGTTCCTTCGACTTCTCAGCGTCTTCTTCCGCTGCACAGCGCGTCGAGTGGTAACAATCTATGATCTAATACTTGCATGGTTCCTGGTTTACGCGATAGAAAATTTTGATTTATGCTATCGTAGCCTACGCGTATCCTAACAGTGGGGCCCACTGTGCGCGGTAGAGCGTGGAGGACACCGCCGCGCGCCGTAGCCCATCCCTTCTGTCGTCGTCGCCTACACCCACTGTTGCCATCGCCGCCGCCGTCACCTACACCCACTGTTGCCATCGCCGCCGCCGTCACCTACACCCGCCGCTGCCGCTGTCGCTGTCGGGAGGGAGGAGAGGAGAAGAGTGAGGCCGCGCAGAAAGGAGAGGAAAAAGAGGAGAGGAGAGAAGAGAAAGAGATAGAGAGGAGAGGAGAGAAAGAGGAGAAAATTTAAAGTGAGTAAGAGGGAAAAGAGGGAGGGGTATTTTTGCGTGTGGACCTTTTAATAGGTCCGCTTGTGAAAATAGGCTCATTTTTGTGCATGGTCCATTTAAGATGTGCGCACGCAAAAATCAATTTTTCTGTGCGGTCCTCTTAAGGAGCCGCACACGAAAATAGAGGATAATTTTCACATACGCAGCCAGTTATAATCCGTTTACAATTTAAATGGGTCCCTGTACATGAAAATCGTTTTTTAGTAGTGAGTACTTCCTATGGTCTGGTAATACATGTTTTTTTATTACAGTATATATAGATATCAATAAATATATGATTTTGTTGTAGCACTTTTTGAGACCAATATACATATATATGTTTACTATATTTGAAAAACAAATATTTCAGATGTTATTTATAGTTAAAGTTTTTAAAGTTTTATAATAGTCTTATCCAAAACAATAAGTATTATTATTAAAAAAATAATAAGTATTATGAGAAAGTAACTTGAAAACTCTCTTAACCTGGCTCGGCAGAAATATCCCGAGGAAAACGAGGTGCAGCCCACAAAACCATAGCGAAGCAATAGCAGCCCGATAGGCCATTCGGCCTGATTCGGCCACAACCTGACAGCCCACAAGGCCCACAACAGCTGAGCTCAATGTCTCAATAATA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