BGIOSGA004416
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA004416 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA004416, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_03657 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA004416-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA004416-PA |
| Length |
7189 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:33947372..33954560 |
| Sequence Coding Region |
33947372..33947617,33948078..33948389,33949032..33949094,33949190..33949243,33950237..33950308 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:33947372..33954560 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:33947372..33954560 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCCACCGCACCGGCGGCGTCCGCCGCCGCGAAGGCGACCATCTCCGTCGAGTACGCCAAGTCCGGTCGGTCCTCCTGCAAAGTATGCAGCGAGGGCATCGCCAAGGGCGCGCTCCGCCTGGGCGCCTCCGCCCGCGACCCCCGCGGCTTCGACAGCACCAAGTGGTACCACGTCGCTTGCTTCCCCTCCTCGTCGCACCCGATTGACCCCGTCGAGAAGATCAAGGGGTTCGACTCCATCAAGACGTGTAAGAGAGACCATACTGCAGTAGGGACAACTGAAGAGTCAAGCCCAAAGAAAGTAAAAGCCAGCCTATCGTCACCTGCTGCAGGAGTGGCAGAAAATGCTAGTATCTCAGTTGAGTATGCCAAGTCTGGCCGCTCCACCTGCAAGGGTTGCAGTGAAAGTATTGCGGCAGGTGCCCTCCGTCTTGGCGCCTCTATTCGCGACCCCCGTGGTTTTGACAGTACAAAATGGTACCATATTGCCTGCTTCCCTTCATCAACTTACCCAGCATTCCCTGTGGAGAACCTTAAGGGGTTTGATTCTATCGAGAATTGTAAGAGAGATGGCAATGTGACTGATCAATTGAATGAACAAAATCTGAAGAAGGAAGTGGTTCACAGCATGGAAGACTCTAAGGGAACTGGAAATAATATTGAAGGTGTTAAGATGCTGGCAGGGGACAAAAGAGCTGGTCCAGTGATACCCTTTTCGGTTTCTGATATAAAGAAAAATTACAAGGATGCTACCCTTCCAGCGCATTGGAAGGTTTTCAATACAGTTATATTTCGTGAGCAGGATGATGGCCTTCAGTCTTCAGCTAAGATTGCTGCATTTGATTTTGATGGATGCCTCGCCAAAACCTCAGTGAGGATTGTTGGTGCGGACAAGTGGTCTTTACTGTATGAATCGATTCCAGAAAAGCTACAAATCCTGTACAATGATGGCTATAAATTGGTCATATTCACCAATGAGTCGAACATTGAACGATGGAACAAAAAGCGGCAGCAAGCTGTTGACTCCAAAATTGGGCGTCTTGACAAGTTCATTGAACGTGTAAAAGTCCCTATTCAGGTTTTCATAGCATGTGGTTTAGGGAAAGGAAAAACCTTTCCAGATGATCCATTTAGAAAACCAAACACTGGAATGTGGTGGTTGATGACAGAGCATTTCAATTCGGGAGTTACAGTTGACATGGACAAATCTTTCTATGTTGGTGATGCCGCTGGGAGAGAGAATGATCATAGTGATGCAGATAAAGAATTCGCTAAGATGAATAGCTCGGGCTTGGCTTATCTGAGGTCTGAGAGTTGGTATGAGCTTGGGATACTTGATCAATTTGAGCTTGAGTTGAGCTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSTAPAASAAAKATISVEYAKSGRSSCKVCSEGIAKGALRLGASARDPRGFDSTKWYHVACFPSSSHPIDPVEKIKGFDSIKTCKRDHTAVGTTEESSPKKVKASLSSPAAGVAENASISVEYAKSGRSTCKGCSESIAAGALRLGASIRDPRGFDSTKWYHIACFPSSTYPAFPVENLKGFDSIENCKRDGNVTDQLNEQNLKKEVVHSMEDSKGTGNNIEGVKMLAGDKRAGPVIPFSVSDIKKNYKDATLPAHWKVFNTVIFREQDDGLQSSAKIAAFDFDGCLAKTSVRIVGADKWSLLYESIPEKLQILYNDGYKLVIFTNESNIERWNKKRQQAVDSKIGRLDKFIERVKVPIQVFIACGLGKGKTFPDDPFRKPNTGMWWLMTEHFNSGVTVDMDKSFYVGDAAGRENDHSDADKEFAKMNSSGLAYLRSESWYELGILDQFELELS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..246#707..1018#1661..1723#1819..1872#2866..2937#3043..3099#3494..3570#4362..4443#4929..5045#5432..5559#6444..6513#7103..7189#ATGTCCACCGCACCGGCGGCGTCCGCCGCCGCGAAGGCGACCATCTCCGTCGAGTACGCCAAGTCCGGTCGGTCCTCCTGCAAAGTATGCAGCGAGGGCATCGCCAAGGGCGCGCTCCGCCTGGGCGCCTCCGCCCGCGACCCCCGCGGCTTCGACAGCACCAAGTGGTACCACGTCGCTTGCTTCCCCTCCTCGTCGCACCCGATTGACCCCGTCGAGAAGATCAAGGGGTTCGACTCCATCAAGGTTTGGGCTCTGAGTCGGTTTACATTTGCTTCCCGCGGGTGCTAATATGTGGATTTGGGGGGAGTGCAGGAGGAGGATCGCGAGGAGGTGCGTGAGCTAAACAAGGTAATTTGTTCCTTACCTGTTGAAACAGCTTATCAGTTAGATGGCGAAATCTGCTTCTGGTCGATATTTATGACTACCAGATGGATGGCTATAATGCTAGTGGAATGTAGATTGCCAAATGATATTGTTCAATTTTTGTAATGGTACATTTGAGTAATGTTCAGTATACTCGATAAACTTATGGTGAAAATTAATTTAAGTAATCTGGATTGTTGTCCAAAATGCTACATTTGGAGTTATTTTGGATTAGCAAGCCGTATACATATTTTGGATTAGTAAACCAAATGATATATTTACAAAAGTTTGGATACAACTTTGTTATTTCTCTTTAATATCCCAAACTATTAATTTTCAGACGTGTAAGAGAGACCATACTGCAGTAGGGACAACTGAAGAGTCAAGCCCAAAGAAAGTAAAAGCCAGCCTATCGTCACCTGCTGCAGGAGTGGCAGAAAATGCTAGTATCTCAGTTGAGTATGCCAAGTCTGGCCGCTCCACCTGCAAGGGTTGCAGTGAAAGTATTGCGGCAGGTGCCCTCCGTCTTGGCGCCTCTATTCGCGACCCCCGTGGTTTTGACAGTACAAAATGGTACCATATTGCCTGCTTCCCTTCATCAACTTACCCAGCATTCCCTGTGGAGAACCTTAAGGGGTTTGATTCTATCGAGGTTTGGCCTTCGATTTTTTTTTCAGCTGTTTTATACTTGTATTTCTTCTCTTTGGAAACTAACTGTGGTTTTGGAGGGTGGGCGCAGAATCAAGACCGTGATAAGTTGCGGGAGTTGGAGGTAACAATTTGCTCACTCATACAACTAGTTTAAATTAAGCGGCAATATGAATTCCTAGAAATTTTCTTCTCATCCGTTCGTAGCTTTTGTAAATTAGGAAAAGAGGTCGCTAATTCGTTTCTGAACAAAGGAAGCTACAAGCTTTTTTTATGTTGTTTGTGAAAGTGTTCTATTAAATGTTACTGTTGCTTAACTGCTTTCTAACAAGTTTTCAGTTGGTGGAACTTTGAAACTCCCTCTGGGTTGACAATACTTGTCTTTTTGGACAAGGTTATTGTCAAACTTTTAAAATTTTGGCTATAAATAATATCTAAAATATTTGTCTTAAAAATAAGGAGGCCATATATGTAGATTAGTCTTAAAAAGTACTTCAATAAAATAATATACTTACTAATATTTTTATATATATTGTAATAAAAGAGAGTGGTCAAAGTTGTTTTTTGGAGACTGTCCTTTCCCAAAACGGCAAGTATTATCGACCCGGAGGAAATACTTACTTTGATCCACCATATTCATTTGCAGAATTGTAAGAGAGATGGCAATGTGACTGATCAATTGAATGAACAAAATCTGAAGAAGGAAGTGGTTAGCTTTTGATTAGACATGAGCCTACAGTTCACTCCAGCATCAAGTTCAACTTTGCGATGACATACACACTTTTATATCCTTGATCCTTCTAGGTTCACAGCATGGAAGACTCTAAGGGAACTGGAAATAATATTGAAGGTGTTAAGGTGATGAAATCATGTATTCTTTCAGTTTTGGGAGCCATACCTAAACCCTTATAATGTCTGTAGAGATGGCACATTTCTAGTTCTTTGTTTCCCTGAAAGTTTTGCTTACTGACATTTAATTGTTGTTGTTGTTTGAATAGTCTGTTTATAAGGCAGATGTATCATTATTTATTATTTGTTAGCATCCAACTTGCATTTTCATCATGTTAATGCTGGCAGTCATGGCTTTGATATGTTGAATGCCGATCCTTTTACCTTGAGAGTTCTTTCAATGATTGACTGTAACAATTGTCTCTATAGTTTATACATTTGCCATTCATTTCCCCAACCTGTAGATCTCTACTCTCTATATCATGGCCTCATGGGCATTGAGCCGAGAGACTGAGGCCCATGGATCCAACATCTGACTGGTAAACAGCACGGCGTGTACTGTAGCAATGTGTAAGGAGATAATAATAAACTAGAATTAGTTAGTTACTTAAGTTTAAGGGTCAAGTCATACCATCCATCTATACAAGGATGGGAATATTTCTCTATTGATTTAAGCAATGAAGAAGAATTAGCCTAAGCTAAACAAAGGGAAAAATACTTTCCACTGCCCACCCACACACAATGTTTATCATCCCAGTCTAAGTCCTTTCCTCATTTCTAGTAGTCGATGCTGCTACAAAATTCCTAAAATAAAAGGAAAAATACTTTCCACTGCCCTAAACAATGGGCGGGAAGCAAGACGGCAAACATATCCTCTAAATTGATCATCCTCAAATCAGCTATTCCTGGGCCTCTGGCAGTGTTTACCCATAATGATCTTGATTCATGACACCCTACTACTCTTCTGTGAGTGGTAAGTGGGAAACATGAAAGGAGAGAGAAGACAAAATATCTGTAGCTAAGAATGTTATTTAACCATAACACAACCCCTTAATGTCTTGCTTGATTTCAAAGCTGAACATGCATGATTATTTATAGGACTTGTATTGTTTTCCCTATCAGATGCTGGCAGGGGACAAAAGAGCTGGTCCAGTGATACCCTTTTCGGTTTCTGATATAAAGAAAAATTACAAGGTATTCTTATACCATTGTTCTTAGCAAGTCACTCTGATTCCTATGTTTATCATTTTATTATACTCAAATGCTACATCTGCATTTTCCTGTCATGTGTGAATGCAGGATGCTACCCTTCCAGCGCATTGGAAGGTTTTCAATACAGTTATATTTCGTGAGCAGGTGTGTTAAGCAAAATTTATAAAAGAAAGGAGCAGTTCTTGAGCCTCATTTTCTAATTATTATATGAATTAAACCATGCATTTTTTCCTTCAAGGAATGCATCTTTCAGAAGACTAGCTATACCCGTGCTTTGCTACGGATAAATATAAATTATACACATGCTATTATTGTTTGGAACAAATCAATTCTGAGGTTTTTAAGAACAATTCTACCCTGTAGACATGTTTGCATAATATACCCATGCAGAAGGACTATTTTATAATATTAAAGTACATGAAAGAATTAGTTGGTAAAAGATATACAATAGAGTTGGTGGGTGGCAGATTCACTGCCACCACCATTGCCTTTTTTTAATATGAAGTATAGATGGATAACTTGCAATTCTAATGTTCAGGATGATGGCCTTCAGTCTTCAGCTAAGATTGCTGCATTTGATTTTGATGGATGCCTCGCCAAAACCTCAGTGAGGATGTATGTATACATACACTTTTTTTTTTGCGGAAATATGTTATTTATATTGTTATAAGAGTAGTCTGCATGCTTCTTTGTGTGCTATATCTATTTTTCATAACTTTTTGTTGTAAGGGGCACTTGGGCAATTAAGAAACAAAATGAGCAGACTGTTCAGAACCACATGGAGTGAACATACTTGTCCTATGCTTTGGCCAGTTGCAGGGGAACACACTGCATATGCAACTAATGAGTAGACTATCTCATCAAACACCTGCTTGAACACCCTAGAAAGGCACATTTAATTTGACTTACTAAATAGTACTATATGCTTTTGAGTTACTATGCTGTAGCTGTATGGATAAGATGGTATTTGGTTAGATTTTATGAATTGATCGAGCAGTTTCATGTTAGGGCTTTCTGATATTATGTGATCTATTTGTTAGTTTTGTCTTAGTTCTTCTATAGCTGTAAAGAAGCATGACATAAGTAGTCCAACCCACATTAAAGTAATCTTACCATTTTTTATGGCCAACAATCGAGTTTTTTTTTTTTCTTTACAAGCAAAGGTATCAATTAGCATTTCCAAGGAAGTATTCACTACATGCGAGTCCTGAAAAGTGCTATGCTGGACCTTTTGATGAACTTGAGCATAACGATTGCCAGATTTAGAGATAACTTATGGGATAGTATTTTCCCAGAATATTGACTTGTTACACATGAGTTCATGATTCACGATATTACCTCTTTATATATGCTGTTGCTTTTTTTTAAGAATGCAATCGTTAAGTTCCAACTTACTTCAAGTGCAGTGTTGGTGCGGACAAGTGGTCTTTACTGTATGAATCGATTCCAGAAAAGCTACAAATCCTGTACAATGATGGCTATAAATTGGTTAGTTGCTTTTTAGTCTTTACAAGTTCTTTTGGGCCTATAACTGTAGTTCCATAACGTCTCTCTGTACGTTGCATCGAATTAAGTATGCACATAGAATGTTCTTAAGAACCTCGGAAAAGTTATAGCATACTCTCTCTGGTCACAAGTACTTGTCGTTTTGAACATGCCTTCTCTCTCTGAAATTTTGTGTACCGATATATTTTTAAGTATGTAGATTGGATACATCAAAACCATTTGTATAATTAGGCCTCGAAAAGTGCTACCATAAAAACGTAGCTCTGTTGGGTTTTACGAATATACTCCAATACAATAAGTGGTCAAAGTTGTATTTTGGAGACCGTGTTGTCCAAAACGACAATTATATGTGACTAGAGGGAGTAACTAATCACTTAACTTAATTAGTTAATTATTGC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