BGIOSGA004780
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA004780 |
|---|---|
| Description |
Mitochondrial Rho GTPase |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA004780, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_04400 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA004780-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA004780-PA |
| Length |
6232 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:39691270..39697501 |
| Sequence Coding Region |
39691270..39691472,39691573..39691705,39691797..39691943,39692834..39693010,39693131..39693379 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:39691270..39697501 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:39691270..39697501 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGCTCGCGAATCTGGCGGGCAAGCAGAGCTTGCGAGTCGTCGTCATCGGCGACCCTGGCACCGGCAAGTCCAGCCTCGTCGTGTCCGCCGCCACCGAGCGGTTCCCCGGCGACGTCCCCCGCGTACTGCCCCCCACCCGCCTCCCCGTCGACTACTTCGCCGACCGCATCCCCATCACCATCGTCGACACCTCCTCCAGCCCAGAGCAGAGGTCGAAGCTGATCGCCGAGTGCCAGTCGGCGGATGTGGTGGTGCTCACCTACGCCTGTGACCAACCTGCGACGCTGGAGCGGCTCAGCTCATTCTGGTTCCCCGAACTCCGGCGCCTCCAGTTGGAGGCACCGGTGATTGTCGTGGGATGTAAGCTGGACCTGAGGGGTGAGGAGCAGGGAACTCTTGATGCCGTGATGGCACCCATCATGGTTGCATTCCGAGAGATCGAGACCTGCATTGAGTGCTCTGCGCTTCGCCAGATCCTGGTTTATGAGGTCTTCTATTATGCACAGAAAGCAGTGCTTTACCCAACAGCTCCTCTATTTTATCAGGAGGCACAGATGCTAAAGTTACGCTGTATGAGGGCTTTGAAGCGTATATTTATTCTATGTGACCATGACAGGGATGGAGCTTTTAGTGATGTGGAGCTCAATGATTTTCAGGTCATATGCTTCAATGCTCCTCTCCAACCTAATGAAATCATAGGCGTGAAGAGAACCATCCAAGAGAAATTGACTGAAGGTGTAAATGAAAATGGCCTTACCTTGACTGGGTTTCTTTTCCTTCATACCCTTATTATTGGGAACGGAAAGCTGGAAACTACTTGGACCGTGTTGAGGAAGTTTGGCTATGATAATGAACTCAAGCTTAGAGATGACCTCATTCCAGCAATTAAACGAGCTCCTGATCAAACCTTGGAATTGACAAGTCAAGTCATTGATTTCTTGAGAGGGATCTTCAACATGTTTGACACAGACAATGATGGAGCTTTGCAACCTGCTGAAATCAATGATCTTTTTTCAACCGCACCTGAAAATCCGTGGTCTTCTCATCTGTACGAGAACTGTGCTGAAAATAATGTCTTGGGTGGGTTGTCGTTTGAAGGGTTCATCTCCAAGTGGACTCTTATGACACTTATACACCCGTCAAATAGTTTTGCCAACCTTATATATGTTGGCTATCCCGGCGATTTTGATTCGGCATTTACCACCACGAGGAAAAGGCGAGTAGACCGTAAAAAGAAGCAGACTCAGAGAAATGTGTTCCAGCAACCTTCCGATGCTCCTCCTGTCAATGGTGAACAATTTGCAGCAAATACTGTTGAACTGCCTGATGGGACTAGAAAGACACTTGTGATGCGAGAAATTTCTGAAGGTGATGTTGGACCATTACTATCAGATAAGGAATCTTTGGCACCCTGTGATGTAGCAGTAATTGTTTATGATAGTGGTGATGAAGTTTCTTGGCAAAGAGCAAGAGAATTGCTTGTACAAGTGGCCACACGGGGAAAAAACACTGGCTATGAAGTTCCTTGTCTGATAGTTGCTGCTAAGGATGACCTCGACCAATCTCCGTTGGCTCTGCAGGACTCAACTAGAGTGAGCCATGACATGGGAATCGAAACACCAATTCCTATTAGTGTAAGGTTGAGGGATTTGAACAATATTTTCTGCCGGATAGTCCATGCGGCGCAGCAGCCTCATTTGAGCATCCCAGAGACTGAAGCTGGGAAAACACACAGGCAATACCGTCAACTTCTGAACCGTTCCCTCACGGTTGTCTCAGTAGGAGCGGCTGTTGCAGTTGTGGGCGTAGCTGCTTACCGGGTTTACGCAGCTAGGAAGAACGCGTCATCTTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MALANLAGKQSLRVVVIGDPGTGKSSLVVSAATERFPGDVPRVLPPTRLPVDYFADRIPITIVDTSSSPEQRSKLIAECQSADVVVLTYACDQPATLERLSSFWFPELRRLQLEAPVIVVGCKLDLRGEEQGTLDAVMAPIMVAFREIETCIECSALRQILVYEVFYYAQKAVLYPTAPLFYQEAQMLKLRCMRALKRIFILCDHDRDGAFSDVELNDFQVICFNAPLQPNEIIGVKRTIQEKLTEGVNENGLTLTGFLFLHTLIIGNGKLETTWTVLRKFGYDNELKLRDDLIPAIKRAPDQTLELTSQVIDFLRGIFNMFDTDNDGALQPAEINDLFSTAPENPWSSHLYENCAENNVLGGLSFEGFISKWTLMTLIHPSNSFANLIYVGYPGDFDSAFTTTRKRRVDRKKKQTQRNVFQQPSDAPPVNGEQFAANTVELPDGTRKTLVMREISEGDVGPLLSDKESLAPCDVAVIVYDSGDEVSWQRARELLVQVATRGKNTGYEVPCLIVAAKDDLDQSPLALQDSTRVSHDMGIETPIPISVRLRDLNNIFCRIVHAAQQPHLSIPETEAGKTHRQYRQLLNRSLTVVSVGAAVAVVGVAAYRVYAARKNASS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..203#304..436#528..674#1565..1741#1862..2110#2554..2622#2757..2812#3032..3113#3652..3800#3955..4021#4310..4422#5230..5380#5743..5929#6159..6232#ATGGCGCTCGCGAATCTGGCGGGCAAGCAGAGCTTGCGAGTCGTCGTCATCGGCGACCCTGGCACCGGCAAGTCCAGCCTCGTCGTGTCCGCCGCCACCGAGCGGTTCCCCGGCGACGTCCCCCGCGTACTGCCCCCCACCCGCCTCCCCGTCGACTACTTCGCCGACCGCATCCCCATCACCATCGTCGACACCTCCTCCAGGTCCTCCACTGCCCCTCACGCTAGATTTGCGGGTGTATTTTTTTTTTGTTGGGGGATTTGTGGATTTTGATTCGTTGACAATTCTGAATTGCTGATTCAGCCCAGAGCAGAGGTCGAAGCTGATCGCCGAGTGCCAGTCGGCGGATGTGGTGGTGCTCACCTACGCCTGTGACCAACCTGCGACGCTGGAGCGGCTCAGCTCATTCTGGTTCCCCGAACTCCGGCGCCTCCAGGTGAGGCTCTGCACTCACTGCCGGAATTGATTGGTAATTTTGTGGGTTAATTTTGTCCGCTGTGGCTCATGTTTTGTTCTGCTTGGCTCAGTTGGAGGCACCGGTGATTGTCGTGGGATGTAAGCTGGACCTGAGGGGTGAGGAGCAGGGAACTCTTGATGCCGTGATGGCACCCATCATGGTTGCATTCCGAGAGATCGAGACCTGCATTGAGTGCTCTGCGCTTCGCCAGATCCTGGTTAATATGTCTGCAGTCATAATTTTGTGTTGATAGGTTTCTCTGAGATAGGGATGCTTGGCACATTGCTGCACATAATTAAGTTAATAGCTACAACACTAGCTAGATCATAATTTTATTGTATTCTAGGCATGAACTTGTTGTACTTTTACTGTGCAATACTTTTATTATGTACTGTGTTTATTAGCTAACCAGTAGCACCAAGTTGGACAGACTAGAGTAATATTACCAATAATAATTAGAGCAGTTTTAAAAATTATGAAATATACAAGAAAGTATTACACGATATTCTGAATACACAGGGACATTCTCTCTGAATTTGGGTTTCTTTCTCAGAAAAACCCAGGCAACTCTATTATTCTTTGTTTATATAAATAAAAGTCGTATTATGTTTTGGGCCATAATTTATTTTACAATATAATATTGACATCTAGGGAATTAGCATTCATGTGAAAGTACTTTGCAATAGAAATGCAATGGTATCATCTTGTATGGCAGTAAACATAGTAACATACTATATTTGTTAAGTCAATAGTTATAAATTTTGAATTTTCCAAATTCATGTGTGACTTGTAGTTATCAATGGAGGGAGTACATGATAATTCTGTCTGATGCTGTTAGGCTTGAGTCCATGGCCTTTCTCATCCATGACTGGCTGTTGTAGCGAGTCCAGAACGCTGCGCGCGCTATGGCGTGTTTCCCTCACCTGCCTAGTCTCCCGATACTTGTTTCCACAAATCGGTTGATGAAATTTGGCAGGTGTTGGACTGTTTGTATCAGTTGTACAATGAATTAGTTAATTATCGCATGAATTATTTGAACCATCAGATGCATTAAAAGTCCAGACATTGTGCTAGTCTCTAGCTAACTATAATTGCGTATGTTTGCAGGTTTATGAGGTCTTCTATTATGCACAGAAAGCAGTGCTTTACCCAACAGCTCCTCTATTTTATCAGGAGGCACAGATGCTAAAGTTACGCTGTATGAGGGCTTTGAAGCGTATATTTATTCTATGTGACCATGACAGGGATGGAGCTTTTAGTGATGTGGAGCTCAATGATTTTCAGGTTTGTAGCCACTAAAGCTGCCTTGGTTTCTTTGATTAGTGTAAGGCAAACTAATGCTTGCACTATCATTCTATTAATACTTCTGGTGATGTTAAGAATCTCCTTTTGGCTGCTTTACAGGTCATATGCTTCAATGCTCCTCTCCAACCTAATGAAATCATAGGCGTGAAGAGAACCATCCAAGAGAAATTGACTGAAGGTGTAAATGAAAATGGCCTTACCTTGACTGGGTTTCTTTTCCTTCATACCCTTATTATTGGGAACGGAAAGCTGGAAACTACTTGGACCGTGTTGAGGAAGTTTGGCTATGATAATGAACTCAAGCTTAGAGATGACCTCATTCCAGCAATTAAACGAGCTCCTGATCAAGTAATGTTGCCCTTTTGTTGCTTCCAGCTATCCTGTGTACTATCTGTATAAACTAGAGTAATTGTACATGTGCATGATCTTAACACTGATAGTTAATTGTTTTAGATTCTATAAATTGAGTTGCTCTGAATTCAGATTTTAGAGGTGAATTTATGAGAATTTAGGGTAATTGATCGTTTGTTATGCTTTTTATTTACAGTTTATATATACACCCTTTGGTATTTTCATCACTAACATTACTACTGTGGTAAAATATCCGCACTCTTAAGAACTCCTAAACTGCTCTAGAAAATGTGCTTGTAATTTGTTAGTCATTCAATTTGATGCGAATCTATGGTGTTAGCTTCACTAAGCATCTTCATGTTTGATATTTATCATACTTCTGGTTTATTATATATTTTGCTGATAATTAATTTAAAGTCAAATCATTTTTTTTGTTCCAGACCTTGGAATTGACAAGTCAAGTCATTGATTTCTTGAGAGGGATCTTCAACATGTTTGACACAGACAATGTAAGTTCTATGCACTGATGTGATTGTTATTCTCCTGAATCGTATTCAACTCTTTGTTGTACTGAGCATTTTTTGTAATAAAAACTGTCATTTTACATTGATAATTTGAAAATGCCTTTTGGTATAATATCCAGGATGGAGCTTTGCAACCTGCTGAAATCAATGATCTTTTTTCAACCGCACCTGAAAAGTAAGAAGCTGATAGAATGCCCTTTCATGTTTAATAACTTGATACTTTCATTGTAACAAAAAGTTAGGTTACCAAAATTGTTAAATATTTCTTGTATTAATTTCTCTATTGGACTTGATGTAATGAAGATTCTTTGCATTGGAAGGGTGTGAAGAATTACTATTTAATAATCTGTCTGTTGATATTTCCTGTATCAATACTCTTCTATTGGAATTTCAGTCCGTGGTCTTCTCATCTGTACGAGAACTGTGCTGAAAATAATGTCTTGGGTGGGTTGTCGTTTGAAGGGTTCATCTCCAAGGTATTTTCTCAAACTTTGCATGATAAGAGTTGACACAACAATTGACAACCCTGTATTTTTTTGTTGATGGATTGACCTTTTAGCAAATTATTATTTGTTGATTGGTTTCAAAACAAGAAAGAGAAGCCCTTTCTCTATTCAGAACCACACGCATTGTATTTATTGGTGTGGCTGTCCTGTAGCACTGTGCAAGATTCTTTCATGACTCTAGGAAACCCCATATTGTTGTTCTTTTAATCTCTATATTCATTGATCTGTGCATTCTGAGCATCAAAACTAGGTATGGAATAGATTGCTTACAGTGCATGTAAAGTATTAAGCAAATTAATCTGGGAGCAATCATATCTTGTATAAGGAGCACGCAGTGTTTAATATGAACTATATAATTTGTCTTGACAAACCTGTGGGGGTGTTGTTAGGCAGAAAATTGATCTTTGATTTCTTGAATTTTATTGTTGCTTTAATCTTGCGTTTGGAAAATACTGAATTTCCTTATTGGTCTGTTTTCTTTTATTGACTAATTATTCTGTAATTGCAGTGGACTCTTATGACACTTATACACCCGTCAAATAGTTTTGCCAACCTTATATATGTTGGCTATCCCGGCGATTTTGATTCGGCATTTACCACCACGAGGAAAAGGCGAGTAGACCGTAAAAAGAAGCAGACTCAGAGAAATGTGTTCCAGTGTTATGTTTTTGGTCCCAGACATGCCGGAAAGACTGCATTGCTACAATCATTCCTTAAAAGATATCACTCCATAGTATTTTATATCATGAACTTTGTTTGCCATGGTTATTTCTTCTGATATTCTCACTTTCACTCTTGGTCCTTGCAATAGGCAACCTTCCGATGCTCCTCCTGTCAATGGTGAACAATTTGCAGCAAATACTGTTGAACTGCCTGATGTAAGTATTCGAAATTCTTGATTTATTTTGCTCACACCATATGCAACCATTTTGATAGTTTTATTTTGAACAGTGCAACATTTACTCATGTATTCGTAAGTATTCTACAGTCTGAGATGACAGATACTCTTTAAACAATCCATATTCTTGTTTATTAAAAAATAAGTAACTAGCAACATATTTATATGAAACCATAATTGATCTGCATCTTAACACTTGATAATGTGTGTCACAAACAAGTTAGTTTCTAACTGTTTGGTCTGATTCAATAATTTTCTTCCACTGAAGGGGACTAGAAAGACACTTGTGATGCGAGAAATTTCTGAAGGTGATGTTGGACCATTACTATCAGATAAGGAATCTTTGGCACCCTGTGATGTAGCAGTAATTGTTTATGATAGGTATGCTATCCACTGAATTATCCCCCTCTTTATTCATGGCCATAAGTTTTGTCAGTTGCATTTTTCTTTCATGGTCACTGAATTCTTCCTTTTTATTCATGACAAAAATCCTCAGTACACAGTTTTCAGTAGCAGCACTCCTTTCCCATTAGCTATAGCAGTATGATTTGTTTATAAAGCTGGCATACTATGAGAGAACTTTATTTTTGCTTTAGATGAAATCAATTTTGTTGTTGTGATGCATTTGTATTAACCCCAGTGACAAAAACAGAAACCAACTGCCAACAAAAAGAGAAATTTCAGTCCCCCAAAAAATAAAAAACAGAAATTTCTCTTGTTTTAGAGACACGTCAACATCTTGTGGTAGCTATCAAGGGATCTAAACAAACTAGCAGTAACTGGAGGTCCACAGTTTGGTAGGACTGGCAAATAACATATGCTGATGGTAATCTAAATATAGACTTGAAACCAACAGCTAACTGCCTGGGAACTGGTATGGGATGTTCATCTCCACAAGGAATATGAATTAGCAGTACACCACTTAAATAGAATAACCGACTACACGATACTGTCAATTGGCTCGTTGAAGTGACTGACTTTAATCCTTTATCCTGTCAATTGGTTTAAATATTCGTTGTTCTATGCGAGCCCTCCTGCTGACAGTTCACAGATTCAGGATTGAACCAATGTAGTAATTCAGAAGTTCGACACATAAATATTGTTTATTCAGATGTACCTCTCTCTATATTATCTATTCAGTTGTACCTAATTTTCTGCACACAAAATGTGATGCTGTTGAAATGGCAGTGGTGATGAAGTTTCTTGGCAAAGAGCAAGAGAATTGCTTGTACAAGTGGCCACACGGGGAAAAAACACTGGCTATGAAGTTCCTTGTCTGATAGTTGCTGCTAAGGATGACCTCGACCAATCTCCGTTGGCTCTGCAGGACTCAACTAGAGTAAGCTTCAATACAATATTGATTCATTTTTAAACTGTTATATTTTATTTACCTCTGAGAATCATTTGTCCTTTTTGGCACAGTTGGTTGGTTGAACTGGAATTAGATATTTGAATGAATCAGTCCCCCCACCCTTTTTTTTTCTTTTGCTTTTGCTAATTGGAGACCACCATGCCAGTGGTTGTTTCTGCTGCCTCATGGAAAAACTCTTGATCAAACTGTGTCGTTCCAAGTCAACATTCATACAAATGGACTGATTTGTCAATATTGTCTACTATTGCCACCAGTTTTCTTTATGTCTGATCTCTACAGCTATGGATTATTTTCAGTTGTTTTAATTCAATAAAATCATGTACTTGTAGGTGAGCCATGACATGGGAATCGAAACACCAATTCCTATTAGTGTAAGGTTGAGGGATTTGAACAATATTTTCTGCCGGATAGTCCATGCGGCGCAGCAGCCTCATTTGAGCATCCCAGAGACTGAAGCTGGGAAAACACACAGGCAATACCGTCAACTTCTGAACCGTTCCCTCACGGTTGTCTCAGGTAAGTTAGTGTCAAGCTTCTGCCTCTAAAGTGTGTTTCTGTATTTGCCTTTATGCTCTGGCACAAATCGATCATGCCAATTACTACAGAATAGTAAGAGCACAGGTTTAGTAAGACAATAAAATCTAAAAGTAATAGTTATTTATGATTTTGAGTTGAAACTGAATAGTGGTTTTATCTTAAGTTGGTTGAGTTCTAACACAACTGATGGTGTGCCAATAATTTGCAGTAGGAGCGGCTGTTGCAGTTGTGGGCGTAGCTGCTTACCGGGTTTACGCAGCTAGGAAGAACGCGTCATCTTGA</dnaseqindica> 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