BGIOSGA004989
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA004989 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA004989, complete gene. |
| LocusTag |
P0035F12.5 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA004989-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA004989-PA |
| Length |
7111 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:42820486..42827596 |
| Sequence Coding Region |
42820486..42820776,42821483..42821621,42821997..42822111,42822303..42822403,42822759..42822880 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:42820486..42827596 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:42820486..42827596 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCCGGCGGCGTGCTGGCCACGGTGCGGTGGGCGACGGCGTGCGCGGCGGTGCTGAACGCGGCCGCGGCGTCCACCGGGGGGGCGGTGGCGGCGCTCGCCCTCCGCGGCGGCGGGGGATGCGGAGGGGCGCTCGGCCCGGCCGCCGCAGCCGCGTCCGCGGCGTCGGCGGCGAGGCTCGTCGCGTCGGCGGTGGCCGGGTTCGCGCAGGGCGCCGCCGCGGCCGCCATTGCCGCGGGGGCCATCGGGGCGCACGTCGACAGCGACCGCGACCTCCGCCACCTCTCGCGGCTGCGGTACAAGAGATGGCTTTGGTGGACAAGGTTTGGGGTGGTCATTACTGTGCTGCAGTTTGTTTTAGCACTTTGTTTGTTGTGTATTATAGTGAAGGATTTCTCTGCTGGGAGATCTTCAAAACAGTGCTTGTCAGGACATGACCAAGACAACAGTAACTGGAAGCACACTCTGTTAATAAGTTTTATCGTCATCATGTGGGTGGCAACTATAGTTCAATGTTCTACTGGTTCTGATGTATTAAGGTGGAGGAGTGTATTAGAAGAAGATGATATATGTGTTGTGGCAAAATTATTGGGTGATCTTATGGCTTATCGCGCATCTGGAACTGGCCACCTTGAGCTTATAGCAGGGTTTTCATTGTTGCAGAAATTTAAGTCATCCGCAGTTGTTTCAAAAGAACAAGCAGAGGCTCCTCAGGATCTCATTAAAGAGGCTGTTCTCTTTCATCCATTTGCTGAAGCTGCCTATACAGGACCACTTCTTGATTTTGGAAGGAATCCTTTTATGTTTCCATGTGTTTGGCTCAATCGGCAGGGTGTTATGACACCATGGACCCGTGCTAGGCGACCAGTTCTTGAAGGCGATAATTGGTGGCGAGGGCATGCAGCTGCTTTCCTAAAATATGTCAGTGTACCCCCGGAAGTTCTTATAAAAGGCCGTGTTAGCCAGGCAAGACGTGAGGCTGCCTATTTTGTTGTTGTCCTGCACGATTTGAAAACGTTAGTCATTGCCATCCGCGGAACTGAGACTCCTGAAGATGTTATAACTGATGGCTTGTGTAGGGAATGCTCTCTTACGGTGGATGACTTGGATGGGCTGATCAATTCTGATCAGTTACCCCTACAAGTTAAGGATGCTGTCATCTCATCCTTTCCACACCATGGACATGCTGGAATGGTTGAATCAGCTCGAGAACTGTACGCTAAGCTTGAAGGGCTGCCCATCCATCAAGATAAACCAGATGCAGTGCCAGCTGGATTCTTATCTTCTTTGCTCGGGGCTGGATGTGAGTGCCATGGATACAATATTGAAATCGTTGGGCATTCTTTAGGAGGTTCTGTAGCTGCACTTCTTGGTATCAGACTGTATGGACGCTTTCCAAAATTACATGTATATGCATATGGAGCAGCACCATGTGTGGACTATGTGATCGCAGAAGCATGTTCACAGTTTGTTACCAGTATTGTCCACAATGATGAATTTTCTGCCCGGTTATCCATGAATTCAATAATTAGATTACGTGCTGCTGCTGTGAGAGCTCTCTCAAAGGATGCTTTGCCGAATTCCGCCAAAGTTGGAAAACTAGTTGCTGGGATCGTGAGGACGAAGGGATACAATCGAAATGTTGCAGATCATCGTCAGTCTACTGGTGCTCTTCAGATAGTCAATGAGGCAAAGCTAAGAAATGATCAAATCCACGGAAATAATCTAATGCACACAATTAGAGGTGGTGTATTCCTCCTTGGTAAAGCGATATCTTGCTTGGTAAATACTCCAAAATATCGAGTGAGCTCCACAGCAGCAATCAACTATGAGTTGGGGAGCAGATCTAGAATGAATATTCTTGCTGATAGAGGGAACTGCATGGCTGCTTCCTGCAGTGTTCTGGATGTTCCTCATTTTGGAGAACCTAGTAATGCATGCGGAAATGGGAAGTCTTCTGAAGATGATCTGAATGAATGTAGCAGGGAATACAGGCTACCTCATTCAAATGATGGCACGAAACTCTCGATTGATCCTAATGATCTGCGTACAATAAGTTTGCCTGAAGGACAATCACCGGAGGTGTATCTGCCTGGTCTCGTTATTCATCTTGTTCCAGTAAAGAATCATACCTCTCCATTTCAGAAGACACCTGTGACTCGACACAAGAGTCGCAAGAACAAGAGTTACAAAGCATTTATAGCCAATCGACAAGATTTTATGGACCTTGTTGTTACACCTCGTATGTTCCTTGATCATCTTCCATGGAGGTGCCACTATGCCATGCAAAGGGTTATAGAAACTCGGAAAAGGGCATGCTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAGGVLATVRWATACAAVLNAAAASTGGAVAALALRGGGGCGGALGPAAAAASAASAARLVASAVAGFAQGAAAAAIAAGAIGAHVDSDRDLRHLSRLRYKRWLWWTRFGVVITVLQFVLALCLLCIIVKDFSAGRSSKQCLSGHDQDNSNWKHTLLISFIVIMWVATIVQCSTGSDVLRWRSVLEEDDICVVAKLLGDLMAYRASGTGHLELIAGFSLLQKFKSSAVVSKEQAEAPQDLIKEAVLFHPFAEAAYTGPLLDFGRNPFMFPCVWLNRQGVMTPWTRARRPVLEGDNWWRGHAAAFLKYVSVPPEVLIKGRVSQARREAAYFVVVLHDLKTLVIAIRGTETPEDVITDGLCRECSLTVDDLDGLINSDQLPLQVKDAVISSFPHHGHAGMVESARELYAKLEGLPIHQDKPDAVPAGFLSSLLGAGCECHGYNIEIVGHSLGGSVAALLGIRLYGRFPKLHVYAYGAAPCVDYVIAEACSQFVTSIVHNDEFSARLSMNSIIRLRAAAVRALSKDALPNSAKVGKLVAGIVRTKGYNRNVADHRQSTGALQIVNEAKLRNDQIHGNNLMHTIRGGVFLLGKAISCLVNTPKYRVSSTAAINYELGSRSRMNILADRGNCMAASCSVLDVPHFGEPSNACGNGKSSEDDLNECSREYRLPHSNDGTKLSIDPNDLRTISLPEGQSPEVYLPGLVIHLVPVKNHTSPFQKTPVTRHKSRKNKSYKAFIANRQDFMDLVVTPRMFLDHLPWRCHYAMQRVIETRKRAC</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..291#998..1136#1512..1626#1818..1918#2274..2395#2471..2562#3874..3979#4063..4217#4490..4617#4937..5067#5759..5856#5959..6750#7060..7111#ATGGCCGGCGGCGTGCTGGCCACGGTGCGGTGGGCGACGGCGTGCGCGGCGGTGCTGAACGCGGCCGCGGCGTCCACCGGGGGGGCGGTGGCGGCGCTCGCCCTCCGCGGCGGCGGGGGATGCGGAGGGGCGCTCGGCCCGGCCGCCGCAGCCGCGTCCGCGGCGTCGGCGGCGAGGCTCGTCGCGTCGGCGGTGGCCGGGTTCGCGCAGGGCGCCGCCGCGGCCGCCATTGCCGCGGGGGCCATCGGGGCGCACGTCGACAGCGACCGCGACCTCCGCCACCTCTCGCGGGTAAGCTCCACCGGCCGAACGCCAATGCGATTCGTGTTCAATTCTAATATGCGAGAGATTCGATAGTTTCGAAAACGGGAGGGGAGGGCAACGTCAAAACTTTGCTGCCAAACGGTGCTCAGAAGAGCAAATTTGTGTGTTTTGTTGTGCGATGATGCTTGAATTGTTCAATCAATTGCGGCAATCTTTAACATTTGCTTCAAGCTGCCGTGTGCTGCGATTGTTAGGCCAAGCTGCCTCTGTAGGTTGCAGCCTTGCAGCATCTGGTTAGCTCAGTCTTTGAAGGCCGAGTTTAGTTCCAAACTTTTTCTTCAAACTTCCAACTTTTCCATCACATCAAAACTTTCCTACACACACAAACTTCCAACTTTTCCGTCACATCGTTCTAATTTTAACCAAATTTCTAATTTTGGCATGAACTAAACACACCCGAAATGTAGTGTGACAACTTGACAAGTCACCATGAGAGTAGGATACCCTGAATTAATTGACTTGAATTTGTTTTTCGTAAATATCATGTTACCAAAATCTGAAATCGTTTTTAACTTCACCGATATTCAGCAAAATGGCATCTATTCTTATAGGTGAGAGTTTTATTAGTGTTATTTTTTTACTGTTGCTTTGCAGTGCTGATACTGCATTTTTAGATGCTTACTGGTATTAATGTCTGAACCTTGAGGTTACTCCCTGTTCTGTTTGTTGGCAGCTGCGGTACAAGAGATGGCTTTGGTGGACAAGGTTTGGGGTGGTCATTACTGTGCTGCAGTTTGTTTTAGCACTTTGTTTGTTGTGTATTATAGTGAAGGATTTCTCTGCTGGGAGATCTTCAAAACAGTGCTTGTCAGGTACTTGCATTGTGCTATATACAGATTCAGACTGTTTTTTTTTTCAAAAAAAATGGGCTGTTAAGATGTTGTTAGGATCAAAATACATTTATGCTCTTAAACCCTTGGAATTCTATGCAAAGCAGCATTTTTCTGCACTAAATTTACTTATTTAAAATCAAATATATGTGGGATTTCGCCACCCTACATGGATTTTAGTATGTAACATACTTTATCCTGTCTTCATGCTTAAATTATCTATAGTATCATATAGTAACACGAACTGATATATAGTACAGCATAACAAGGAAGGCCTTCATCTCCATTCGTTTGTTAGATGTATGGATTCCTTTGTTGCAATTAGATCACTGATTCATGTTACTTGGCTTTTATCAGGACATGACCAAGACAACAGTAACTGGAAGCACACTCTGTTAATAAGTTTTATCGTCATCATGTGGGTGGCAACTATAGTTCAATGTTCTACTGGTTCTGATGTATTAAGGTGGAGGTCATTCTATGCTTCCCATGATATTGCGTGGAGGGCACACTATAGAGAGGTGTTTGATCATGGTATCCGAGAAGTTTTATGCTGTCTAGGGCGGGTTAAGTATTCGTATGTTTCTCTCTGGAACTATTTGGTATATCCTACCTCTATTGCTATTTGAAAAGTTTGAGCAACTTTGTTATTCACATTGCTAGGAGTGTATTAGAAGAAGATGATATATGTGTTGTGGCAAAATTATTGGGTGATCTTATGGCTTATCGCGCATCTGGAACTGGCCACCTTGAGCTTATAGCAGGTTGGTTTCTGTATACCCTGTGATTTGAAGTTCAGCTCTGCTCTCTTTAATCTTGGTGCATATCTGAGATATATCATTCCCTTCAAATGGACAAAAACACATATCACCCTTTATTCGTGCAATTAAGGTGAAGCTTCTTTAGGCTGGTAGTCAGCTAAAAAATTTCAACATGTTATTGTCATTATTATGTTTCTGATGCTCTGCTATATTGTGAAATTTTAGAATACATATCTGTGGACATTTATTATAGGTTTCGACTGCTAGAAGGGAGAAAAAAGAACATTTTGATGATTTTTCAGGTCCCATGGTACTGTTATTCAGCAATATTATATGATCTCAAATTATTTTTCTTCAGGGTTTTCATTGTTGCAGAAATTTAAGTCATCCGCAGTTGTTTCAAAAGAACAAGCAGAGGCTCCTCAGGATCTCATTAAAGAGGCTGTTCTCTTTCATCCATTTGCTGAAGCTGCCTATACAGTTATTCCCTGACTCATTTACTTGGTCTGTCATTTTCAGTCTTGCCAGTACATTTTTTACATGTTCTCCTTGCAGGGACCACTTCTTGATTTTGGAAGGAATCCTTTTATGTTTCCATGTGTTTGGCTCAATCGGCAGGGTGTTATGACACCATGGACCCGTGCTAGGTAAATATGTGGTGCTTTGTTACATGCTTTTGCAAAACATAATTAGATTATGTTGTGAAAACTTTGTAATGCTCATTTCTGCTAATGGATTTTTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGGGGGCTATGCTCTTCTAGTCGCACAAAAAAAAAGAGATTATGCTGCACATGTTTTGTCAGTGTTGCTTTTATCTTTAGCACTTGGATAATTTGTGCTTGCTTACTTTGATGTCCGTTCAATCTTTATACGAAAATAAGAAGACATATTTTAGAACTTGACTAGTGTTATTTGGTAGCATGGCACAGAGACAGCTCATATAAATATTGCAACAGAACCCTTCAAATTATTTGCATAATTTAATTTGATAAATTTGGTCTCTTCTACAAGCACAGTCACTTAAAACATGACATTGCAGCTTCCCTTGGGGTCAAAATTAAAATGAAAGGGAAAAAGAACGAATAATTAAATCCCCTTTCAAAACTACTAATTTATGTTCCAGATTTATATTATTTCCTAATTGTATTTCTATATGGTCTCTATACTCTAATTCTAATATTCCTTATTTTTAATTCCGAATTTCAGTTATTTCCTAATTGTATTTCTATATGGACTCTATACTCTACTTCTAATATTCCTTATTTTTAATTCCGAATTTCAGTTATTTCCTAAGTGTATTTCTATATGGACTCTAGTCTCCTCTTCTAATATTCCTTTTTTTTTTAATTTCGAATTTCAGCTATTTCTAAATTGTATTCCTATATTGACTTTAAGCTTTTCTTCCCATGTTTTTTCTTAATCTCGAATTTTAGTTATTTGTAAATTGTATTTTTATACGGATTCTAAACTCTACTTTTGATTTTATTATGTTTATTCCAAATTATAGTTAGTTTTAAATTCCTATATAGACTCTATACTCTACTTCTAATATTCATTATTTTTTAATTCTGAATTTCTATTTTTTTCTTAATTGTATTTCTATATGGACTATACTCTACTTCTAATATTCCTTATTTTTAATTCCGAATTTCTATTATTTCCTAATTGTATTTCTATATGGACTCTATACTCTACTTCTAATATTCCTTATTTTTAATTCCGAATTTAAGTTATTTCCTAATTGGATTTCTATATGGACTCTAGTCTCCTCTTCTAATATTCCTTATTTTTTAATTCCGAATTTCAGCTCTTTCTAAATTTTGCATCAGAGCCAATTGGTGCTCCAGATTATGTTTAGTTTTTATGTGATGTCTGTCTTTGTCTGTTGTGTCTTTGCTGCATGGTATATAGTCACGCTTATGGAACTTTAGTTTGACAGGCGACCAGTTCTTGAAGGCGATAATTGGTGGCGAGGGCATGCAGCTGCTTTCCTAAAATATGTCAGTGTACCCCCGGAAGTTCTTATAAAAGGCCGTGTTAGCCAGGTTAATCAGCAGTCTACCTCACCTTCTATTTACAATTTTGTTATGGCGTGTGACGAACCTAAGGTTTTATATTCTGTATGTAGGCAAGACGTGAGGCTGCCTATTTTGTTGTTGTCCTGCACGATTTGAAAACGTTAGTCATTGCCATCCGCGGAACTGAGACTCCTGAAGATGTTATAACTGATGGCTTGTGTAGGGAATGCTCTCTTACGGTGGATGACTTGGATGGGCTGATCAAGTAACTTTACTTTTTCTACATTTCCCTTACTTACACTAAAACTTATCTAGAGTAAGCTGCTGGTTATTTTATGAATAAATAAGGCTTATCCTTAGCCAGCTGCTTGTGCATGAAACGAACTATCTGGAACTCCCCACTGCCAATAGTCTCATGGTCCGCCATGATTAAATTTGGGAAATACTCTTCTTCGTTATGGTCCATATGGTCAATCTGAATTAAATGTGAATTAGGACTCATTTTTTTTCTTGATAAAATGATCTGTTGCATTGCAGTTCTGATCAGTTACCCCTACAAGTTAAGGATGCTGTCATCTCATCCTTTCCACACCATGGACATGCTGGAATGGTTGAATCAGCTCGAGAACTGTACGCTAAGCTTGAAGGGCTGCCCATCCATCAAGGTTAGCATGGAAATCTAATGTAACTTTATATTTTATATTTGATGTGGAACTTAAATACATGGATATTTTGATCAGATGACAGTCACACATTCCTAACAATCATATTTTATAGATATAAAAATACCAAAATACCCGTCAGTAATATCTTAAGCATGACAAGTTGGTAAGTATAGAATAGATTCTTCTCTATGTACAAACAAGAACCCTTCAGTTTTTTGGACTGAACGAGTG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