BGIOSGA005211
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA005211 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA005211, complete gene. |
| LocusTag |
OJ1294_F06.24 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA005211-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA005211-PA |
| Length |
10435 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:46271897..46282331 |
| Sequence Coding Region |
46271897..46272454,46272529..46273051,46273833..46274078,46274951..46275039,46275355..46275565 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:46271897..46282331 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:46271897..46282331 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGAAGCGGAAGCAGAAGCCCGCCGCCGCCGACGCCGCCGCCGAAGTCGACGCCGACGAGCCCTCCCAAGCCCCGCTCCCTCTCGAGGCCTTCTCGGGTGACGTCTGCGCCGCCCTCACCGCGCGCTACGGCCGCTCCACCGCCCCGCAGCACCGCCACCTCCTCGCCTCCGCCGCCGCCATACGCTCCATTCTCGTCGACGACGGCCTCCCCGTGACGCCAGCATCCTACCTCCCCGCCGCCATCTCGGCCCTCCAAGCCGCCGGCTCGGCTGACCCCGCCGCCGCTTCCGCCCTTGCCTCCCTCCTCGTCATCCTCCTGCCCAATATCCCCTCGTCCCCATCGTCTCTCCCGCCAGCGTCCGCCTCCGAATCTGCCTCAGCGCTCGCCGTCTTCCTCTCCTCGCCCGATGCATCCCAGCTACCCACCGGCACCGTGCGCTCGGTGGTCAAGTCCCTTGGCCATTTGGCTTTCCATGTCGACGCTGCAGCCGATTGGGGCTCTGTGGCCTCTCCTCTGGAGGCTCTCCTTGCTGCTTCCGTCGACCAGCGGGCCAAGGTTCGAAGGTGTGCACAGGAGAGTGTGGAGAAGCTATTTGCGCACTTGAAACAATGTGTTTGTGGGAAGAAAGTTAGTAATGCTGCAATTGGCATGTTTGATAAGCACATTGCATCTGTGAAAAATCATGTCAATTTGAATTCAGATGCTTCTGAGGGTAAGGAGATGGAGGCTGCAAATATGCTAAGTGCAATGGTTGTTGTAGTTCCATACCTATCAAAGAAGGCAATGAAGACTGTGTTTTCAGAAGTTTATCAGCTGTTAACCCCTTGTTTTAGTCCACTTACAAGGCATGTCTTGAAGCTTATGGAGACCTTGTTGGACCATCTGAAGGCTGAGAATGTTGAGTCAGACTTGGTGAATCTTATCCCATTGTTGTTGGCATACCTGAATTATGATGAAAAGAAGCCTGATGATACCATTGTCGCAGCATTGAAGCTGATGAAAAATTGCTTGGCGAAACTAGTTGGTCGACCAAATTTGTGGATGGAGGTTCTTCCATCTGCATTTGAGGCAGTTTCAGGATACCTGATTCTGGACAGAAAATGTTCTGAAGATATAGCAGGACTGCTACAAGACTGTATTGATTCTCATATTGACCGGAATATTATTTTGACTGGATCACAGTTATGCGATCGTGATTATGAGAGCTTAAGTGATGCGGCTGCTGTTAAATCAATCTGTTCATCGATTAATAACATGCTTTGCGCATGTGCTTCTCCTCCCAATAGTATCTTAACAACGGCCTTGGTTTTGTTTCTGAAACTTGGGGAGAGTTCGTATGCCTTTATGAAAAATATAATACTTACATTGTCACAAATCGCTGCGAAAACAGACAAAGAATCAGAGCGGAAGAATGTTGAAGAGTGCATTGGGGCAGCTGTCATTGCTTTGGGGCCAGATAAAATCCTTTCACTAATTCCAATAGGTTTTGATGAGGACCGGCTAACATGCTCAAATACTTGGCTTCTGCCCATTTTAGATAAGTATATCTATGGGGCCTCACCACAACAATTCCTAGAGCGCATTGTACCTCTAGCAGAATCTGTACAACAAGCTTCTAACATGGCCAAGTCAGCACGGAAATGTGAAGACTTGAAATCATGTTCCAATCAGCTGTGGAATTTGCTTCCTGCCTTCTGCCGCTACCCAGTTGATATATGTCAGAATTTCGGTTCTCTATCCAAGTTGCTACTAGAGATGTTGAAATGTGACAAGTATCTGTACAAATCCGCTGTTAAAGCCCTGCAGCAACTTGTAGATGGAACTAGAAGATTAAGTAGCAGTGAGCAAAACAGAGAAATATATGTGGAGCTTTCTACTTTGTTCTCCTCGAAAATTATTAACTTAAGCTGCCCAAGCTTTGAGAGGTGCTCTAAAAAAGATGCTCGTAAGAACATGAAAGTTCTGGCATCACATTCTGTGTATCTTCTTTCTACTGTCACAGATTATTTTCTAGATTCTTCACCAGAGAAGCGTTCTCATTTGAAGGATGCATTGAGATGTTTGGCTCAACTTTCTGGTAGCACGAACATTTGCAACCTTTTCCTTTCACTGGTTAAAAGATTTGGTTTAGAAGATACTCAGTCAGAGCAAGAGAATATTGAATGCCAAACTAATGAGGTAGACAAGAAGGATGAAGAGGGTACTGATGTAGATGAGGAGAAAAATAAAAAGAGGTCTCTTGTAATGGAACTTATTTCGACATTCGCTGAAGCTGCTGACGAGGATCTGCTTGATTTGCTTTTTGGATTTGTCAAATCTTCTTTACTGAACAACAAGCAACCTTGTGAGGGCAAAGCTCTATTTGCTCTAAGCATAATTTTGAAGGAACACAATGAATATTCTTTGGCTCGGTTGGATGAAATAATGATGCTTCTTCATGGAATAAAGGCAGACTTGGATAATGAAGTTTTAGAAGGCCAATTATTATGCTACCAGTATTTGTTGGTTCACATGATTAAGGCTAATGAAGAGAACACGAGCAAGAAGGCGTTCCTGATTCTAAACGAGTTAATAGTCGCGTTGAAGTCCAAGAAGGAAAGTAGAAGATTGGCATATGATGTACTCCTGGCTATTAGTAATAGCTTGAGAAGCTCTGAGTCAAACAGTGAAGATTCAGATCTTCAACGACTATTCACAATGGTGATGGGATATCTTTCAAGTCCAGCTCCACACATAGTGAGTGGGGCAATAGCTGCACTATCGCTGCTTATATACAATGATGCTAACTTTTGCTTGGAAGTTCCAAATCTGATACCATCAGTTTTAGTTTTGCTGAAGCATAAAGCTATTGAAGTAATCAAGGCATCTTTGGGCTTTGTAAAGGTGTTGGTAACATCATTGCATTCAGAAAAACTGTTGGAATTGCAAGCAGATATCATGAGCGGCATATTACCATGGTCGTCTGTTACAAAACACCATTTCAAAGGAAAGGTTGTGTTAATAATGGAAATACTGATTAGGAAATGTGGCTTTGATGCTATCGACTTAGTTACACCTGAAAAGTACAAGGCTTTTGTTAGAAGCGTTGAAGAGGGCCGCAAGGGAAATCATAATCCAGCAGATGGCGCAGAGTCTGAGGCACAACAACCTACGCAACACGCTGCTAAGAGAAGAAAACGGTCTGATTCTGATGTTGGAACTGGACAAGAGGGAACACACACTCGGGCGCCATCGAGGAGTTTGCCAGCTGGAAAGAAGGAATTCTTCGTTAAAGGGGCCAGGAATGCTCGCTCTCCTGGTGTGAAAAGCCAACGAAGCAAACCATCAGGCCGCAATGGTGATAGAACTAATTTCAAATCCAAATCTGAACCATGGCCAGGAAATGGCCAAAATACCAAGGGCGACAAACCTCAAGGTTTCAACAAAAGAAACAGAACTGGTAAGTTCGACAAGACACAAAATCGTGGGGGTAAAGCATCTGATCGCTCTTCTAGATTCAAGAAGCCTAGAACTGCAGCAACAACATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MKRKQKPAAADAAAEVDADEPSQAPLPLEAFSGDVCAALTARYGRSTAPQHRHLLASAAAIRSILVDDGLPVTPASYLPAAISALQAAGSADPAAASALASLLVILLPNIPSSPSSLPPASASESASALAVFLSSPDASQLPTGTVRSVVKSLGHLAFHVDAAADWGSVASPLEALLAASVDQRAKVRRCAQESVEKLFAHLKQCVCGKKVSNAAIGMFDKHIASVKNHVNLNSDASEGKEMEAANMLSAMVVVVPYLSKKAMKTVFSEVYQLLTPCFSPLTRHVLKLMETLLDHLKAENVESDLVNLIPLLLAYLNYDEKKPDDTIVAALKLMKNCLAKLVGRPNLWMEVLPSAFEAVSGYLILDRKCSEDIAGLLQDCIDSHIDRNIILTGSQLCDRDYESLSDAAAVKSICSSINNMLCACASPPNSILTTALVLFLKLGESSYAFMKNIILTLSQIAAKTDKESERKNVEECIGAAVIALGPDKILSLIPIGFDEDRLTCSNTWLLPILDKYIYGASPQQFLERIVPLAESVQQASNMAKSARKCEDLKSCSNQLWNLLPAFCRYPVDICQNFGSLSKLLLEMLKCDKYLYKSAVKALQQLVDGTRRLSSSEQNREIYVELSTLFSSKIINLSCPSFERCSKKDARKNMKVLASHSVYLLSTVTDYFLDSSPEKRSHLKDALRCLAQLSGSTNICNLFLSLVKRFGLEDTQSEQENIECQTNEVDKKDEEGTDVDEEKNKKRSLVMELISTFAEAADEDLLDLLFGFVKSSLLNNKQPCEGKALFALSIILKEHNEYSLARLDEIMMLLHGIKADLDNEVLEGQLLCYQYLLVHMIKANEENTSKKAFLILNELIVALKSKKESRRLAYDVLLAISNSLRSSESNSEDSDLQRLFTMVMGYLSSPAPHIVSGAIAALSLLIYNDANFCLEVPNLIPSVLVLLKHKAIEVIKASLGFVKVLVTSLHSEKLLELQADIMSGILPWSSVTKHHFKGKVVLIMEILIRKCGFDAIDLVTPEKYKAFVRSVEEGRKGNHNPADGAESEAQQPTQHAAKRRKRSDSDVGTGQEGTHTRAPSRSLPAGKKEFFVKGARNARSPGVKSQRSKPSGRNGDRTNFKSKSEPWPGNGQNTKGDKPQGFNKRNRTGKFDKTQNRGGKASDRSSRFKKPRTAATT</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..558#633..1155#1937..2182#3055..3143#3459..3669#3743..3924#4051..4290#5169..5356#5708..5801#5885..5941#6030..6164#6938..7003#7223..7336#8326..8487#8570..8698#8800..8901#9906..9982#10078..10435#ATGAAGCGGAAGCAGAAGCCCGCCGCCGCCGACGCCGCCGCCGAAGTCGACGCCGACGAGCCCTCCCAAGCCCCGCTCCCTCTCGAGGCCTTCTCGGGTGACGTCTGCGCCGCCCTCACCGCGCGCTACGGCCGCTCCACCGCCCCGCAGCACCGCCACCTCCTCGCCTCCGCCGCCGCCATACGCTCCATTCTCGTCGACGACGGCCTCCCCGTGACGCCAGCATCCTACCTCCCCGCCGCCATCTCGGCCCTCCAAGCCGCCGGCTCGGCTGACCCCGCCGCCGCTTCCGCCCTTGCCTCCCTCCTCGTCATCCTCCTGCCCAATATCCCCTCGTCCCCATCGTCTCTCCCGCCAGCGTCCGCCTCCGAATCTGCCTCAGCGCTCGCCGTCTTCCTCTCCTCGCCCGATGCATCCCAGCTACCCACCGGCACCGTGCGCTCGGTGGTCAAGTCCCTTGGCCATTTGGCTTTCCATGTCGACGCTGCAGCCGATTGGGGCTCTGTGGCCTCTCCTCTGGAGGCTCTCCTTGCTGCTTCCGTCGACCAGCGGGCCAAGGTGAGGACGCTAAGAGCTTTTGCCACACATACTTGAGGACCATGCTCATGTGGTTGTCACTCTTTGCTTGGTAGGTTCGAAGGTGTGCACAGGAGAGTGTGGAGAAGCTATTTGCGCACTTGAAACAATGTGTTTGTGGGAAGAAAGTTAGTAATGCTGCAATTGGCATGTTTGATAAGCACATTGCATCTGTGAAAAATCATGTCAATTTGAATTCAGATGCTTCTGAGGGTAAGGAGATGGAGGCTGCAAATATGCTAAGTGCAATGGTTGTTGTAGTTCCATACCTATCAAAGAAGGCAATGAAGACTGTGTTTTCAGAAGTTTATCAGCTGTTAACCCCTTGTTTTAGTCCACTTACAAGGCATGTCTTGAAGCTTATGGAGACCTTGTTGGACCATCTGAAGGCTGAGAATGTTGAGTCAGACTTGGTGAATCTTATCCCATTGTTGTTGGCATACCTGAATTATGATGAAAAGAAGCCTGATGATACCATTGTCGCAGCATTGAAGCTGATGAAAAATTGCTTGGCGAAACTAGTTGGTCGACCAAATTTGTGGATGGAGGTTCTTCCATCTGCATTTGAGGCAGTTTCAGGTCTGTGCATCTACAGTTTCACCTGTCAACATTTCAATATGATAATGCTTCTTTTACGAGTTTTCAGTTGACATACTTGTGTTTGAGTTATTATGGTTATCATTGATGGGGCACGTTGAACCTATGGTCCTCAAACATGTTTCCTCCAGTTCCATTTTGCACTGGTGCATCTGAGGGGGAAAAAACTTATCTCTTTGCTCTTTCTTGACAACGACAGTTAACTAACTTTGAGTTACCACATGCTAATGTTGTATGCTGCCTTTCTTCTAATGAATACTTATGTTTATCAGATAAGAGTTGGTATTCCTGCGGATCAACCCATTTTGGTGGATTTAGTTCACTGCTATTGTTCTGATAAGTGTATTTAGACATTGTCTTGTCTATATATCATATATGGTTGGAACCAATAGGTCAACATGCATTGAGCTACATCACCCGCCAAAACAAGAGGCATTGGATCATCTTCATGCTTAATCACAACCATCCATTCCGTAGTTACTCTCTCTCATTAATTAGCATATATCTCAATATTCATTGAGTCACTTAGTGTAGTTATTTCTATAAAAAGTCATGGCCTCATCCTTTTATTAACACCCTTGGATGGTGCTTTTACAATTCAAATCAGTCCATAATATTTTGTGTGTGTGTGTATTGAAATTTTGCAACTGCATTGCACAGAACAATATCCTGCTGCAATGTGTGGGGTGTCATCTAGTTCATTATATGTATTGTAATGGATAACAGTCCCAGAGCTAACTTGGTAAAATTTTGAAATGGGCAGGATACCTGATTCTGGACAGAAAATGTTCTGAAGATATAGCAGGACTGCTACAAGACTGTATTGATTCTCATATTGACCGGAATATTATTTTGACTGGATCACAGTTATGCGATCGTGATTATGAGAGCTTAAGTGATGCGGCTGCTGTTAAATCAATCTGTTCATCGATTAATAACATGCTTTGCGCATGTGCTTCTCCTCCCAATAGTATCTTAACAACGGCCTTGGTTTTGTTTCTGAAACTTGGTATGGCTTCAATAATTTCAGTAAAGTATCTTTTGCCTATAACTGTACCAGTGTATATAATAACCATTCGAGAATATGTAGAAGACTAGAACTGTAGAAGTAATAACCTTCTCTGTAAAGAACAATTTGTTATACATGAAACAGTAGGTACCTCTAATTTTTACTTCCTCCGTTTCATATTATAAGTCTTTCTAGCATTGCTCACATTCATATAGATGTTAATGAATCTAGACACATATATATATGTGTGTCTAGATTCATTAACATCTATATGAATATGGGCAATGCTAGAAAGTCTTATAATATGAAACAGAGGGAGTATATACATATTCTCTATAATCTATACATGAAACACTAGATACCATTTATTCTATCTCATGTGAATTCCAGCATGCACCATTTCGTAAAATATGTATGTTGATTATAAATAATCACATCTTGCACCACAAAAAACTAAAAAAAAATTGTTTACCGCTCCCTTTGTTCCAAAATATAAGCACTCGTAGCATTTGAAATTTTACCAAAATATAAGCACTCCTAGAATATTACTTGTCCCATCAACCACTCATTCAATTTTCTTCCCATATTACCCCCAAACATACCTCATTTAATAAGGGGCATGGTCTTTCCTACTCAAACCTTAATCTTTGCTAAAACACCTAGAAATGCTTATATCTTGAAATGGAGGGAGTATTTACTAGTGCAAGTACCTACAAAGCTAATTTAGACATGAAATATTGACACACTCTCCCAGTACCTTTTGACTTTCTATATTGTCATACATTGGTCGACTTTTTTGATGTATGATATTGCCTGCTTTTTATGATTCATTTGCTTAATTAACTCATCTATATTGTTTGGTTCTTCTCCAGGGGAGAGTTCGTATGCCTTTATGAAAAATATAATACTTACATTGTCACAAATCGCTGCGAAAACAGACAAAGAATCAGAGCGGAAGAATGTAAGTTTATTTCTTGATTGTTCTCACATCAAAGATAGAGCATCTATTTGCTTCTTTGTGTGTACTGCGTACATATACCATGTACATGAGCATTGAAACTATTTCATGGCAATGCTTATGTTTCAGTTCCTCCCATGGGAGAATCCAGACCTCAGAAACTTTCACTCCAAATAGGAAGCTAGAGCCATAATGCCTGTGAAAGTTTAAGTACAGAATAAAAACGAGAAGTTTATAAGATTATTGTAGTCATATCATAACTGAAAAAGGCTTGAGCATTGAATTATTGAAATTTCATTTAACTTGTCGTGTTTTCAGGTTGAAGAGTGCATTGGGGCAGCTGTCATTGCTTTGGGGCCAGATAAAATCCTTTCACTAATTCCAATAGGTTTTGATGAGGACCGGCTAACATGCTCAAATACTTGGCTTCTGCCCATTTTAGATAAGTATATCTATGGGGCCTCACCACAACAATTCCTAGAGCGCATTGTACCTCTAGCAGAATCTGTACAACAAGCTTCTAACATGGGTAGGTAAAGCCAATTCATTAGGTCTTAAATACATACGCAACATGATTTCCTAACCTTCTGCTTTAACTTCAGCCAAGTCAGCACGGAAATGTGAAGACTTGAAATCATGTTCCAATCAGCTGTGGAATTTGCTTCCTGCCTTCTGCCGCTACCCAGTTGATATATGTCAGAATTTCGGTTCTCTATCCAAGTTGCTACTAGAGATGTTGAAATGTGACAAGTATCTGTACAAATCCGCTGTTAAAGCCCTGCAGGTGCAGTTTTCATTTACAGATATACTGCATTTTTCTTATCTTATCTATACTCATTTTCTTTCTGGAATTTCGAACTACAAGGCTGCTCCATGTCTTCTCTCAGACAACATGTTTTATTTTTCTCAGCAACTTGTAGATGGAACTAGAAGATTAAGTAGCAGTGAGCAAAACAGAGAAATATATGTGGAGCTTTCTACTTTGTTCTCCTCGAAAATTATTAACTTAAGCTGCCCAAGCTTTGAGAGGTGCTCTAAAAAAGATGCTCGTAAGAACATGAAAGTTCTGGCATCACATTCTGTGTATCTTCTTTCTACTGTCACAGATTATTTTCTAGATTCTTCACCAGAGAAGCGTTCTCATTTGAAGGTGTGTCACTTAATATTTCTAATTATTATCAGTTGATGAGCATGTTAGATGTCTTCAAACCAATTAAGTCTAAAAAACCCCTACTTAAATCAGTCACGGACGGACTCACATATTGAAACATTACTGTATTTTCTATTATTTGGCATTTGAAGTTTGATTGATCTATGCACATTAGAGTACCACTGATTTAAATGAGGTTTTGTGTCACAAACTTGAGAAAGGCTTAACGCCGCTTGATGCAGCCCAATATTGACTGCTGCAGGCTGTGCCCTACACAATTAAAGAGAGATTATATTAGTAGAACATGGTTATTTTGTTGTGTTTGTACTTTTTTACTATCATTTAACCATGTTTGGTTGATATAGATAAAACCAATAAAGGTGTATCAGGGATGAGTTATATAAGTAAATTTTATAAATGCACTTTTGCATATTATTATCAATACATAAGAAAAGGAACCACAACCTTATTTCTTCTCAGCAAGGCGCACTCAAATGACTA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