BGIOSGA005325

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA005325

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA005325, complete gene.

LocusTag

P0452F04.20

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA005325-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA005325-PA

Length

9105

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:37680070..37689174

Sequence Coding Region

37689110..37689174,37688759..37688822,37688503..37688639,37688162..37688248,37687878..37687953
,37687672..37687746,37687504..37687573,37687335..37687412,37687190..37687250
,37687023..37687101,37686241..37686331,37685927..37685987,37685754..37685824
,37685517..37685590,37685054..37685191,37684822..37684926,37684170..37684294
,37683997..37684093,37683776..37683850,37683593..37683648,37681931..37681973
,37681090..37681614,37680723..37680989,37680070..37680603

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:37680070..37689174 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:37680070..37689174 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGAGCGGGTGCTCAAATCCGCCAGGGAGTCGGGCTCCCTCAACCTCTCCAATCGATCCCTCAGGGAGGTACCCAAGGAGGTGTACAACAACTTGGACACGGGGGCTCAGGATGAGAAATGGTGGGAGGGAGTTGACCTTCAGAAGCTCATATTGGCTCATAACAACCTTGAGGTGTTGCGTGAAGACCTCAGAAATTTGTCTTCGCTCGTTGTATTAAACATTAGTCACAACAATATTTCTTCCCTCCCCGCAGCTATTGGAGACCTTCCTTTGCTAAAATCATTGGATGTATCTTCTAATCAAATAAACGCTTTGCCCGAAGAGATTGGTTTTGCGACCGCTTTAGTCAAGGTTGACTGCTCAAATAATTGCCTTACAGATCTCCCAGTTAGTCTTGCCAGATGCCTGGAGTTGTCAGAACTCAATGCGTCAAACAACACTATATCCGTACTGCCAGATGAACTTGCTGGCTGTTCCAAGTTATTCAGATTGAATCTAGAGGGTAACAAGCTCGTGACGCTATCAGACAAGATGTTTATGTCATGGACAATGCTTACAGAGATGAATGCTGCAAAGAATCTACTGACAGCCATCCCGGATGGTATTGGTGCACTGTCAAAGCTAATTCGTCTGGACCTGCATCAGAACAAAATAACCCTGATTCCTCCTTCCATAAAAGATTGCTCTTCTCTAGCAGAGTTTTATATGGGAAATAACTTGTTGACATCCATACCAGAGGATATTGGCATGCTATCGAACTTGGGAATACTTGATCTACACTCTAACCAGCTAAAGGAGTATCCTGTCGGGGCTTGTAGACTCAAGCTCTCTTTCCTTGATCTATCAAACAACTCATTATCTGGTCTGCCTGCTGAACTAGGTACTATGACAACCCTAAGAAAGCTTCTGCTTACTGGTAATCCTATGAGGACACTTCGGAGTTCCTTGGTTTCTGGACCAACAACAGCATTATTAAAGTATCTGCGCAGTCGGCTTTCATCTGATGAAGGAGCATCAGGATCTGGAAGCACTCCAACAAAAGATGATCAAATTGCTGCAGCAAGAAGATTGTCTTTATCTTCTAAGGAACTGGACTTGAGTGGTCTTGGTGTGACCAGTGTACCACCTGCAGCTTGGGAGACAAATGATGTGATGAAACTAGATCTTTCTAAGAATTCAATAGAAGATCTGCCAAACGAGTTGTCATTATGCTCGTCACTTCAATCTTTGATTTTGTCTAACAACAAAATTAAAAGGTGGCCTGGCACCGTATTCTCCTCCCTTGCCAGCCTTTCTTTGTTAAAGCTAGACAACAATCCTTTGGCAGAGATATTGGCTACTGATCTTGAGGCCCTGTCTAAACTTGAAGTACTAGATTTAAGTGGCAGTGCTTCTTCTCTACCTGAACCCTCTGCGGTTTCGAAATTACCTCACCTAAAGGAACTCTACCTAAGACGAATGAAACTCCATGGATTTCCTGATAGTTTATTGGGCTTAAAACTGCTGCGAATTCTTGATCTGAGTCAGAATTATCTTACATCTGTGCCAGAGGGTATCAAAGATTTAACTTCTTTGATTGAGCTTGATCTGTCGGACAACAATATAACAACACTCCCACCTGAGCTGGGTTTGCTTGAGCCTAACCTGCAAGTCTTGAAACTTGATGGAAATCCCCTCAGGAGGGTAATCGACGTTAAGTGTTGGTATCTTAACGCCAATGGACTTACACCAAGTTTAGTCCCTGGAAAGGACAGGCTGAGCGATTTGCCGGATGATGTCGTGCTCAACATCTTGGAGAGGCTGGACACCTCTGACGCCATGAAAACCTGCATCCTCTCCAAGAACATGAGGGCCACCCTCCCCGACATGCTGTCCCGGATCGCCGTCGACGTCGCCGCCTTCTCGCGGCCAAACCACCGCCGCTTCACCCTGCGCGAGGTGGTCCGGACGAACGGCGCCGTGGCCGACCTGACGGCCGCCGTCCTCGAATTCCGGCGGCCGGAGATCCCCGTCCACCACCTCGCCCTCCGCTTCTACCTCAGGTACTACGACTGCATCTCCATCGCCGGCACGGTGGCCCGCGCCATGGCCGCCCGGAAGCTCGCCGCCGGCGCCGCCGTCGAGTTCTCGATCCTGACGGAGAAGCGCTGCGGACGACCTCGTCTACTTCGCCGGCCAGTTCCACACCTTGTTCACCGCCTACCCGGCCGTCTTCGCCGGCCTCACCCGCCTCCAGCTGGAGAACCTCTGGTAGAGCACAATCATCTCGTTGAGCATGAGATATCACACGGCAATTTCGAGACGATCGAGCTCGTCCATGTACCCAAGCTCCAGACGATGAAATGTCAGGGCTGGATCTCTTATCGGGATCCACTGTTTTTTGGTTACACTCCATTGCTCCAAAGCTTGAGCCTCGTCTACACCGGCATGAGCTGGAAGAACAGTATCCGATTAAGTCACTTCCTTTCTAATGCCCCCTCACTGCATCAACTTAATCTCAATTTCCAGAGCGAAAAGATTTGGGTTGAGCCAGAAGGCTGGAAGAGGCTAGCCCCAGTGCTGGGCGAGCTACGACATGTCACTCTCGTCGACCTCCCTGAAGGCTGCGACATCGCTTGGACAATGTTCATCGTGGAAGCCGCACCGAGGCTGGAGAGTCTCTCCATCAGAGTGTGGGATCACTGCTGCAAGATGGAGAGGGACGAGACGACACGGCAGGAGAACGGCTACTGCGACAAATCGAACGTCGAATGGCAGCCATCGGTGGCTAACCTCGAGCACCGTAATCTGGCCAAGCTCACCATCGTCGGTTTCCAACCCGATGAACACTTCGTGGGATTCATCAGGCGCGTGATGGAATCCGCGGTTAATCTGGAGGAGATATCACTGTATGACAGGGTGGTGGGTAGGTGCTGTTCTTATTTGGATCCTAAGACTAAGAGCAAGGTTGTTCCGTCGAGATATCCGAGGACCATGAAGGAGCAGGTGTTGCTCAGGAAGGAGATGACCAAGGGGATGGATTTGTCTCATGTAATTCACTTCAGGTCTTAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MERVLKSARESGSLNLSNRSLREVPKEVYNNLDTGAQDEKWWEGVDLQKLILAHNNLEVLREDLRNLSSLVVLNISHNNISSLPAAIGDLPLLKSLDVSSNQINALPEEIGFATALVKVDCSNNCLTDLPVSLARCLELSELNASNNTISVLPDELAGCSKLFRLNLEGNKLVTLSDKMFMSWTMLTEMNAAKNLLTAIPDGIGALSKLIRLDLHQNKITLIPPSIKDCSSLAEFYMGNNLLTSIPEDIGMLSNLGILDLHSNQLKEYPVGACRLKLSFLDLSNNSLSGLPAELGTMTTLRKLLLTGNPMRTLRSSLVSGPTTALLKYLRSRLSSDEGASGSGSTPTKDDQIAAARRLSLSSKELDLSGLGVTSVPPAAWETNDVMKLDLSKNSIEDLPNELSLCSSLQSLILSNNKIKRWPGTVFSSLASLSLLKLDNNPLAEILATDLEALSKLEVLDLSGSASSLPEPSAVSKLPHLKELYLRRMKLHGFPDSLLGLKLLRILDLSQNYLTSVPEGIKDLTSLIELDLSDNNITTLPPELGLLEPNLQVLKLDGNPLRRVIDVKCWYLNANGLTPSLVPGKDRLSDLPDDVVLNILERLDTSDAMKTCILSKNMRATLPDMLSRIAVDVAAFSRPNHRRFTLREVVRTNGAVADLTAAVLEFRRPEIPVHHLALRFYLRYYDCISIAGTVARAMAARKLAAGAAVEFSILTEKRCGRPRLLRRPVPHLVHRLPGRLRRPHPPPAGEPLVEHNHLVEHEISHGNFETIELVHVPKLQTMKCQGWISYRDPLFFGYTPLLQSLSLVYTGMSWKNSIRLSHFLSNAPSLHQLNLNFQSEKIWVEPEGWKRLAPVLGELRHVTLVDLPEGCDIAWTMFIVEAAPRLESLSIRVWDHCCKMERDETTRQENGYCDKSNVEWQPSVANLEHRNLAKLTIVGFQPDEHFVGFIRRVMESAVNLEEISLYDRVVGRCCSYLDPKTKSKVVPSRYPRTMKEQVLLRKEMTKGMDLSHVIHFRS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..65#353..416#536..672#927..1013#1222..1297#1429..1503#1602..1671#1763..1840#1925..1985#2074..2152#2844..2934#3188..3248#3351..3421#3585..3658#3984..4121#4249..4353#4881..5005#5082..5178#5325..5399#5527..5582#7202..7244#7561..8085#8186..8452#8572..9105#ATGGAGCGGGTGCTCAAATCCGCCAGGGAGTCGGGCTCCCTCAACCTCTCCAATCGATCCCTCAGGTGCATTGTCTCTCTCTGCTCGCTCGGTTGGATCGCCATCGGCGACATGGACGATGATCTCTCCTAGTCTGTAGCCGCCGCCCACTGCTCGGACGCGACGCAATCCAATCCCTTCCCGCCATGACGCCTTCACCTGCTTCTCACATCAGTTTACTGCATTGCATTGTCTGATTATGGCCGGTGTACTAGGGGACCATGGGTTAATCGATTCCAGCGCGCGCACACACAGCTTCGCTCTTCTTGTTCTTGATGTCTCGCTGACGCCACACCTCTGCCTGTTCTGCCAGGGAGGTACCCAAGGAGGTGTACAACAACTTGGACACGGGGGCTCAGGATGAGAAATGGTGGGAGGTAAATCGATTCGCCCCCTTCCTGTATGACTATTTCCCTACATGCTGCATAAACAAGGGATATCAAGCAACGCCAATCAAATTTGTTTCTGTTTCTGTTTTTTTCCTTTTGTAATTCAGGGAGTTGACCTTCAGAAGCTCATATTGGCTCATAACAACCTTGAGGTGTTGCGTGAAGACCTCAGAAATTTGTCTTCGCTCGTTGTATTAAACATTAGTCACAACAATATTTCTTCCCTCCCCGCAGCTATTGGAGAGTATGTACTGGACTATCCTTATTTACTACTCCCTCCGGTCATGGAAACATATCGTTTGTGGACATGTTTGAAGTCACTGCCTTCAAAACCAGTTTCATAATATTATCATTCTATCAAGATTTTCAACTGTTTTTCGATAGAGATTACTGGTCAAGTTTGCAGGCATGGTTTTTGTGACAGGAGGGAGTAATTTCCGTTGTTAACCGTGGACCACTAATATCATCTGAACTTTTTTATGGCTCTTTTCCATGCAGCCTTCCTTTGCTAAAATCATTGGATGTATCTTCTAATCAAATAAACGCTTTGCCCGAAGAGATTGGTTTTGCGACCGCTTTAGTCAAGTATGTCTTCTATGTCCCTTTTCTAATTGATTTCATTAATGTACTGTTAAAACAAGCTCAAAATTTGGCTATTCATATTTCTAAAACCATCTGTCACATATTTTAGATGTTATGATGTTGACAATTAGTATGACGCCTAAATACAAGAAGCAATGTTTGAGACTATGTATGATTATATTCATGTAAGTTGATGCATTGTTGTTGCCAGGGTTGACTGCTCAAATAATTGCCTTACAGATCTCCCAGTTAGTCTTGCCAGATGCCTGGAGTTGTCAGAACTCAATGTAAGCCACCATCGATGTATTCCTTATTTTCTCCATAAGGTTTCTTTGTTTGATGAAGATATATACAGCTCATCTTTATAGCTTCCCTCTTCATCCTCTGTCCTAAATATAATGTAATGCCCTACCTGTAGGCGTCAAACAACACTATATCCGTACTGCCAGATGAACTTGCTGGCTGTTCCAAGTTATTCAGATTGAATCTAGAGGTATATACTCCTTATAGAGAATGCCAAAGCTGGATTTATCATATTTTCGTGCTGCATTTCTTTTGTTCTTGAAAACTCCAATTACTGCAAAATGTCAGGGTAACAAGCTCGTGACGCTATCAGACAAGATGTTTATGTCATGGACAATGCTTACAGAGATGAATGCTGGTATGCCACACAGCCACAGTACCAAAAATAATGTCGAACCTATGTGATATCCTTGAGTTTCTACCTGAGATTAACATTCAAACCTGTACAGCAAAGAATCTACTGACAGCCATCCCGGATGGTATTGGTGCACTGTCAAAGCTAATTCGTCTGGACCTGCATCAGAACAGTTAGTCTACCATACTATCGCATATGCTAGCTCTTTATTATTCATTTTTATCTGTATTGATGGCTTTCTACTTTTGTTATGTAGAAATAACCCTGATTCCTCCTTCCATAAAAGATTGCTCTTCTCTAGCAGAGTTTTATATGGGGTTGGTTATCTATTTTGGACAAACTTCTTTACCATGCTCTTATTTTTAAACAGCACAAGTTCACTCTATTTGTACTTTTATGTTCCAGAAATAACTTGTTGACATCCATACCAGAGGATATTGGCATGCTATCGAACTTGGGAATACTTGATCTACACTCTAACCAGGTCTTACTCCATTTATTTTCACAGATACTGCCAATTTAATAGTCTATTATTCCCCTGACTCTTGTTATTCTGCACCATTTTAAAATCTGAAGATACTGGGAGAAAGGCTCTTGATTTGATTTCTTTGTTGCTGGGACATCAAATCTGTAGCTGTGTGGCTCAAAATTTTAGTACATCATTTGTTTATTCTAACATGAGGCTTTTTTGCTTATGACTATCTTGGGATGGTTTTTGAGAAAAAAGGATCATCTCGGGATGGCTAGGATACACTCCAGTCCAGAAAATTTCATGAATGTTTCGCTCCCTTAACATTTTCCCACTTCCCAAATCCCAAGAGCTTCATTAATAGTGTATGTAAACTGCATGTGATTTACCATAGTCACTCCCACCATCTATAGGCTTGTCTAATCCTGTCTGTTTTGTTAGAGGGCTGGCGCTATGATATATTTTGAGTTCTTATTAACTCAGTTACTTACATGTTCGGAAGGAATGGTGGAACAGTGTTGTTCAGAATATTTGATGTAAATATTGATCCCCAAAATCACTTTATTAGACAACAACAAACTTCTCATGTTGTAACATTGAGCTTAACTTCTGCAACCAATCCTGCTAGAATTAACAGAACATTACAGAAGAAATAAGTTCATTTCTGTTTTTTTTATTATTTTCTGATAATATGTCACTTTTCCAGCTAAAGGAGTATCCTGTCGGGGCTTGTAGACTCAAGCTCTCTTTCCTTGATCTATCAAACAACTCATTATCTGGTCTGCCTGCTGAACTAGGTTGGTTTTTCTGCTGTGCAATGCTCCTCTCGATGATGCCACTTTTGTTATTTTCCTATTTGGTTAGCTGAAATTTTATGATATGAAATGATTGCATGCATCTCTATGTGTTGGATAGATCATAGGGCTGATTCTTTTTTTCCATGGGGTATCTGCTTTGAAAACTTAGCATGCTCTATGCAAGTGTGCTACTATCTTAATGAACTTTCGAAACTATGGACACTCACATATGCTTCGGCATGCTATATTCAAGGTACTATGACAACCCTAAGAAAGCTTCTGCTTACTGGTAATCCTATGAGGACACTTCGGAGGTATGATGCCCATGCCATTGTCCTAGTTTTTCACAAAGAGGTTGTCAGGATTCTAAACAGAACTGCCAACATAATAATACAGTGTTCCATTTTGGTTACCAGTTCCTTGGTTTCTGGACCAACAACAGCATTATTAAAGTATCTGCGCAGTCGGCTTTCATCTGATGAAGGAGGTAACCAAAAACACAAAATCAATATCCATGCATTTTATTGTTCATAATGATGTATTTGTAGTGCACATTATCTGCTTCAAGCTTTGCCACGTCTTCTGTTTTTTTTCTGATTTGAGAACCATTATCCATGATCACTCGAAAGCTCAACATATTTCCTGTGCAGCATCAGGATCTGGAAGCACTCCAACAAAAGATGATCAAATTGCTGCAGCAAGAAGATTGTCTTTATCTTCTAAGGTACTTTAATTATTTCGACAGCATATTTGTATATCATAAGATAGATCTCTTTTTATGTCTTTTTTAAAAGGAGCTAATTCACCCACATGTGGTATTTGCCATTCATGGATTGTCTCATTCATGCCAAAAGAGTAACTGATTTGTGTGTTTCTATCTGCCATGTTTCCTGTATTTTTACAAAAACTTGTCGACTTTTTCAATGTATTCTCATGACTACCAATGCAAGAATAAAATATCTTGGTCATTGGATCTTATGGAGCCTCATGGAATAACCAATGATCGTTTCATTTTTTCCACAATAGCCCCTAACTTGGTGCAATATCAGGAACTGGACTTGAGTGGTCTTGGTGTGACCAGTGTACCACCTGCAGCTTGGGAGACAAATGATGTGATGAAACTAGATCTTTCTAAGAATTCAATAGAAGATCTGCCAAACGAGTTGTCATTATGCTCGTCACTTCAAGTGAGTTTCTGAATTACAGATATAATATTGATGTTGTTATACTTCAATTGATCAATTCCATTGTATGTGTGAGATAAAAGTGTTTCGATATAACTCCTTACTCTTTTTAATCTACCATTTTTTTCAGTCTTTGATTTTGTCTAACAACAAAATTAAAAGGTGGCCTGGCACCGTATTCTCCTCCCTTGCCAGCCTTTCTTTGTTAAAGCTAGACAACAATCCTTTGGCAGAGGTAATGTCATGGTCTTCATATCTTTTCTTTTGCAAATTTCTTGGTATTGGATCATGATTCCCTGATGGGTTAATCTCTGGAAGTTAATCAATGTTGATTATTGAAATTGAAGAAGTTGATGGTTTAGCTGTTACAACACTTAGAAGAATTGAACTACAGGGTGCAGAGGCAACATGGATAAAGACTTGACATAATTATAAGCCATCTAGCCTATTATGTTTAGACACAAGTCATTTTACATTTTTTTAGGGATTGTCACATTGTTTCTTTCTTAGCTTTAATACCATGTTTACAGTTAATGTTTTCTCATGTGCCAAGACATCTTAGACAAGATTTTTTTTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGGAGGGGGGTGGGTGTGT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