BGIOSGA005617

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA005617

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA005617, complete gene.

LocusTag

P0431B06.5

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA005617-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA005617-PA

Length

10914

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:33535320..33546233

Sequence Coding Region

33546111..33546233,33544256..33544294,33544003..33544091,33543786..33543876,33543551..33543640
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,33541600..33541738,33541456..33541503,33540990..33541045,33540452..33540560
,33540141..33540281,33539883..33540062,33539680..33539763,33539506..33539592
,33538809..33538853,33537524..33537602,33537018..33537087,33536453..33536540
,33536109..33536198,33535792..33535908,33535629..33535691,33535320..33535451

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:33535320..33546233 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:33535320..33546233 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGAGGATCTGGGCATCGAGGCGAAGGAGGCGGCCGTGCGCGAGGTGGCGAAGCTGCTCCCGCTCCCGGAGCTCCTCTCCTCCATTGCCTCCATCAAATCCGACTACCTCGCGCGGCAGCAGACAAATGATGCACAGCTCAGTACAATGGTAGCAGAGCAGGTTGAGCAAGCCCATGCTGGCATCAATGCTCTTGCACTATCTCAGGAAACAATAAACAAACTACGCGAGAACTTCATAGATATAGACAAGTTGTGCCAGGAGTGTCAAACATTAATTGAGAACCACGACAAGATTAAGCTTCTTAGCAACGCAAGAAATAACCTGAACACAACTTTAAAGGATGTGGGAGGTATGATGTCTATTTCTGTTGAAGCAGCTGCAGCACGCGACTCGCTAAGTGATGATAAAGAGTTAATTCGCACTTATGAGAGATTAACAGCTCTTGATGGAAAGAGACGTTTTGCTTTAGCTGCTGCTGCATCTCACAAGGAAGAAGTTGGTCGATTGAGAGAGTACTTTGAAGATGTGGATCGTTCATGGGAAACATTTGAGAAAGCATTGTGGGGCCATGTCACTAACTTTTTCAGACTTTCAAAAGATAGCCCTCAGACGTTAGTTCGAGCAATAAGGGTTGTTGAAATGCAAGAGATCCTAGATCAACAAGTTGCAGAAGAAGCAGCTGAGGCTGAGGGTGCAGGTGCTATGGCGACAATAGCAAACCAGCGTAGAACTGCAAACAGGAAAGGTGGAGGAGCAACATCTACCCCAAGAAGCACTCAAGATAAATCAAAGGTCCAGGGAAAGGGCTACAAGGACAAATGCTATGAGTATATCAGGAAGGCTGTTGAGGCTCGCTTCGACAAACTGCTCACCGAGCTTGTTTTCTCAGAAGATTTGATGGAAGCTTTGGAGGAAGCTAAGGCAATTGGAGATGAGCTTGGTGATATCTATGACTATGTTGCACCATGTTTTCCTCCTAGATATGAAATTTTCCAGCTCATGGTAAACCTGTATACTGAAAGGTTCATCCAGATGCTAAGACTTCTCAGTGATAGAGCAAATGATATTCCAAATATAAATATTCTTAAGGTAACAGGTTGGGTTGTGAAATACCAAGAAAATCTTATCGGTCTTGGTGTGGACGAGTCTCTTGCCCAAGTTTGTTCAGAAAGTGGTGCATTGGATCCCCTCATGAATATGTATGTGGAACGTATGCAAGCAACAACTAAGAAATGGTACAGTAACATTTTGGAGGCTGACAAAACACAACCACCAAAAAGTACAGAGGATGGGAAACTATATACACCTGCAGCTGTGGATTTGTTCAGAATATTGACTGAGCAAGTGCAGATTGTTACAGAAAATAGCACAGATGTCATGCTGTATCGTATTGCTCTTGCAGTTATACAGGTCATGCTTGATTTTCAAGCAGCTGAGAGGCAAAGACTTGAGGAACCAGCTTCTGATGTTGGTTTGGAATCTCTATGTGCATTGATTAACAACAACCTGCGTTGCTACGAACTTTCATCAGAGCTAAGTAGCAGTACATTGGAAGCGCTTCCACAAAACTATGCTGAGCAGGTTAATTTTGAAGATACCTGCAAAGGATTTCTTGAGGTTGCCAAGGAGGCAGTCCTTCAAACTGTCAGCGTTATTTTTGAAGACCCAGGTGTACAGGATCTACTAGTGAAAGTTTACCAAAAAGATTGGATGGAAGGAATGGTTACAGAATATCTTGTCGCAACATTTGCTGATTATTTTGGGGATGTCAAACAATATATTGAAGAAAGATCATTTCGAAGATTTGTGGAGGCTTGCCTGGAGCAAACAATTGTGGTATACGTTGATCATCTCCTTACTCAGAAAGGCCATATAAAAGAAGAAACAATCGAAAGGATGAGGCTTGATGAAGAAGTGCTTATGGATTTTTTCAGAGAACACATTAATGTGACAAAAGTTGAAACCAGAGTGCGGATTCTGGCTGATCTAAGGGAGCTTGCTTCAGCTGAGAGTCTGGATAGTTTTACTCTCATTTATACAAATATTCTGGAACATCAACCAGATTGCCCGCCTGAGGTTGTTGAGAAGCTTGTGGGAATGAGGGAAGGCATTCCAAGGAAGGAAGCCAAAGAGGTTGTACAAGAGTGCAAGGAAATATACGAGAACTCTCTTGTAGACGGGAACCCTCAAAAGTCTGGTTTTGTGTTTGGCAAATTGAAGTGCCTAACAGCACGGAAAGGCATATGGAGCAAGCTTGGACAGTAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MEDLGIEAKEAAVREVAKLLPLPELLSSIASIKSDYLARQQTNDAQLSTMVAEQVEQAHAGINALALSQETINKLRENFIDIDKLCQECQTLIENHDKIKLLSNARNNLNTTLKDVGGMMSISVEAAAARDSLSDDKELIRTYERLTALDGKRRFALAAAASHKEEVGRLREYFEDVDRSWETFEKALWGHVTNFFRLSKDSPQTLVRAIRVVEMQEILDQQVAEEAAEAEGAGAMATIANQRRTANRKGGGATSTPRSTQDKSKVQGKGYKDKCYEYIRKAVEARFDKLLTELVFSEDLMEALEEAKAIGDELGDIYDYVAPCFPPRYEIFQLMVNLYTERFIQMLRLLSDRANDIPNINILKVTGWVVKYQENLIGLGVDESLAQVCSESGALDPLMNMYVERMQATTKKWYSNILEADKTQPPKSTEDGKLYTPAAVDLFRILTEQVQIVTENSTDVMLYRIALAVIQVMLDFQAAERQRLEEPASDVGLESLCALINNNLRCYELSSELSSSTLEALPQNYAEQVNFEDTCKGFLEVAKEAVLQTVSVIFEDPGVQDLLVKVYQKDWMEGMVTEYLVATFADYFGDVKQYIEERSFRRFVEACLEQTIVVYVDHLLTQKGHIKEETIERMRLDEEVLMDFFREHINVTKVETRVRILADLRELASAESLDSFTLIYTNILEHQPDCPPEVVEKLVGMREGIPRKEAKEVVQECKEIYENSLVDGNPQKSGFVFGKLKCLTARKGIWSKLGQ</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..123#1940..1978#2143..2231#2358..2448#2594..2683#2818..2897#3238..3330#3491..3517#3838..3945#4496..4634#4731..4778#5189..5244#5674..5782#5953..6093#6172..6351#6471..6554#6642..6728#7381..7425#8632..8710#9147..9216#9694..9781#10036..10125#10326..10442#10543..10605#10783..10914#ATGGAGGATCTGGGCATCGAGGCGAAGGAGGCGGCCGTGCGCGAGGTGGCGAAGCTGCTCCCGCTCCCGGAGCTCCTCTCCTCCATTGCCTCCATCAAATCCGACTACCTCGCGCGGCAGCAGGTGATGTGATCCCTCCCTCGAAACCCGATTCGCGCCAAACGTAGCGGAATTTCTGAAGTGTTTGGTTGATAGATTCGGCGAACTCTGATAGTCATCTCCATTCTCCTTCTGAGTGACCTGTCGCATTGAACTGATTTGTTTTTCGCTCTGAGCTCTGATGCGTCGCTTGTGATGTGGCTGCCATTTAGTGGTGTGGGTCGCGGCAGGATCCTATCTCTCAGCTTCTAGCACTTAGATTAACCAGCATCAGGTAGTTATTTGTTTGTTACGGTGAAATGCTTGAAAATTAGGCTGGTTCAAATTCGTTGCTGATCAGTGCAATCACAAATTGTAGTACTGTGCCTGTGAAGTGGTGAGGTGTGCGGAAATCCTGATCCGGTACCCGTGATATAGTTGTCCCTGAGACTTCCGTCGAATTCTAATAAAATTTTCCATGGTTTCTGAAAATACTTTGCTACCCTCAGAATTTTCTGGTGGCTAAGTTGCAGATGCAAAGTGCTAAAAAATTGTGTTGCTCGGTGAACCCTGATGGATTATATGCAGCATCTATGCAGATTAGCTATTCCTGGTCTAATGTTCATATCAGCAGTTACTGTGCAAGCAAATTCGTTACTATTCATATGGTTTGAAAATTAAACTTTAGTATACAGATAAGGATAGTAGAGAGAAGAACCAGGGAAAAAAAAACAAGGAGATGGCATGGTTTAGACCTTTTCTATTATTTCCTTTTACTTACGTTTTTCAGTGGGCCCACTTGCTACTTTTATCCTAAGGCATACCTATAATTGTGGTGCCATATTTTTCATCAAAAAACAGTCAAATTGTTTTTACAGTCACATACAACAAAAAAATACAAATGTAAGTAGGAAGTAATTATAGTGTAACTAAGATGTAATTGATATGTAAGTAGTATGTAATTACGGTGTAATAGATATAGTGGCTACTGGTGATCCTCTTCGTTTCTCATCATGATAATGATGAATAATGAATACTGATCAATCGGTCATATCAACATGCATGTTTGGTAGACTGGCAGAAATGTTAGAAGGCTCAGGAGGCACGAGCAAGTTTCGAGAAAGGAAGCCAAGAAAAGAAGTAAAACGCATGCGTGAATGCTCAGCAAACACAAATCTCTATGCCATCCTAAAGCTGAAAATTCAACTGTGTTTTGTGAAAAAATTTGTCACCATAATTATAGCAAATCAGAATGAATATTCAAGGGAAGAGATTTCAATCCTTGCGTTTACAATAAAATTGATTGCTGGACTTCTTCCAAAGCTAAATGACATTTGACCATCTAATGCGTGCATCTATCCTCAAACATCCTGCTGATCACAACAAGGCTTAGTTTCTCCTTATTGATTACTCCACTCTTGCGTGTAGCTTTGTACAGTGTACTCCAGGATTTGTTTTAAGCCTTTTTGGTCCTATGTCGACTGTTTGTCTCAATGCTATTGTTCCTCACATTCTTGATGGTTGTTATCTCTTACCAAAGGGTTTCAAAACATACTAATTAAGCAAAGGTTTGTGTTAGACTTGATTGGGCATTTCTTAAAAAGGTTTGGGCAGAGTTGTCTCAGTTCTCAGATATGGCTGGGATGTTCGGCAAGCTTAAATGTAGACATGCAAGTAAATTATAAAACATGGCTAAGTGTATGTGCGTATGTGCTCACACCCATTTTGTAATGCATATATTGGCATATGCATATTATCTTCAGTGAGATATTATGAGCATGTTTACCATTTTGTAAAGCATATATTGGCATATGCATATTATATACCTCTGGATTTCTAACTGTCTTCTATAAATTCTCAGACAAATGATGCACAGCTCAGTACAATGGTAGCAGAGCAGGTATTCCTTGACATCTACTATGAACTGCCAAACTTATTAGTTTTAATGCTATTGTTAATGCTTTGCTCGAGTTACGGTTTCTGCTACTATCATTTGCATTCCCCCCTCAATGTTTGTCTGTTGGATTATAGTTTTTCTGTATGTGCATATTTTATCACTTATAGGTTGAGCAAGCCCATGCTGGCATCAATGCTCTTGCACTATCTCAGGAAACAATAAACAAACTACGCGAGAACTTCATAGATATAGACAAGTAAGCTAAAATATTTTTATCTCTACATTTTCTTATGCTCTTGCATGATTGATATGCTAGATCACTTCCTTGAGGTTATATGTTTCTCCTCATTTCTCAGTCCTGTTTATCATAAATGTCTGGCAGGTTGTGCCAGGAGTGTCAAACATTAATTGAGAACCACGACAAGATTAAGCTTCTTAGCAACGCAAGAAATAACCTGAACACAACTTTAAAGGTGTGCTGACCTTACTTTAGCAATAACAACTGTATTAAGGTTGTACTTGCTTGTTTTTTACTAACGTTCTTATCAATACATTAAGCTAACCAAGTTATCGAGCACGAAAATTTCATCTGACATGTTGATTGTCAATGCCTATTAGGATGTGGGAGGTATGATGTCTATTTCTGTTGAAGCAGCTGCAGCACGCGACTCGCTAAGTGATGATAAAGAGTTAATTCGCACTTATGAGGTTCTATTTTTCCCTCTTTGGATCACTGATCAATACCATGATTGATATTATAGCTCTTTTTTTAAATCAGGAATTGATCATAGTTATATCCTACTTGCCTGACTTTGCTGTTTGATCTTATTTGTTGAAATTAGAGATTAACAGCTCTTGATGGAAAGAGACGTTTTGCTTTAGCTGCTGCTGCATCTCACAAGGAAGAAGTTGGTCGATTGAGGTGGTGTTTCTCCCCTGAAACTAGCTAATATTAATGATTATTCAATGCATACCTGCCTCCTCCCCCCCCCCCCCCACGCCCCCACCCTTTAACGTCCCCATTGTCTTTCTCGTTAGAATAATGTAAAGCATTCTGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCTTAAGGAAGAAATGCAGAAATGATCTTCTCTACATATTACAGTATGATAGCAAATACGTTAGGGTTAACAAGGGATTTTAATCTTTCTTCTAGTTNGTAGTGCAATGAAGTATATATCTATAATTNGCTTGATTATTGTCTTCTCCACAGAGAGTACTTTGAAGATGTGGATCGTTCATGGGAAACATTTGAGAAAGCATTGTGGGGCCATGTCACTAACTTTTTCAGACTTTCAAAAGATAGGTACTGCCTTTTATTACGATTCACTTTGTCTTTGCTATTTAACATGGTAAATGAATGAATTGTCTTATNGTTTTTATATGAATTGCACTGCCTTTCTATTTAACGCATATCTGCTACAAATGCTCCTGTATTAAACTCACTATCTTTTTTCTTTGTGCAGCCCTCAGACGTTAGTTCGAGCAATAAGGTATGCATGAACTATTTAATATCTACTTTGATCATTTTGTACAGTCAATTGTGAAAGCTGAATGTTTGGACCAGCTCATAGTTTGATACTTGTTGCCCATCAAATTCTTCTGTGGAGCAATTATTCCCCCTGGCTTCCTCCCTTTCAGTTCACTTGTTGAATGAAAGACTATTTATTGATTTATTAGGGAAATAATACATAAATACAAGCTGATCATTTGAGATTTAGAAAATTGGCTTGATTCTTTTTTCTTATTTAGTTTCTAGGTAATGGGCACTTATATATCTTGCACATAATTCTTAAATTCATTCTTATGTTAGGGTTGTTGAAATGCAAGAGATCCTAGATCAACAAGTTGCAGAAGAAGCAGCTGAGGCTGAGGGTGCAGGTGCTATGGCGACAATAGCAAACCAGCGTAGAACTGCAAAGTATGCTTCTTCCTTTCTTTGCTTCACACATGTTTCTGTACTTCCAGTAGGTGCTAGGTAGTATGATATATTGATATTATATCTTTCATGTTTCAGAGGATCAAAGAAATAATGTATCCTAGGATACAAAATTTGTCATGTCCCTTTACTTTCATGCTGATATAACTGTACTGAAGATATGAGTACTAACGCACTTCTTGTCCATATCAGCATCTGTGCATCTGCGCACCTGTAAAGGTGGCATTAAAGTTTTTACATCATGCTTTTCATATATAATATCTTTAATACCGGAGACTGGCTACCAGATCAACAAATTCAAGCTATTGTACGGGACTATGGGTGTAACTAACTTGGTTGTCTGCTATGGTCTGCATGAATTGCTTTACTATTGTCATGATGACTTGTATAACTGTTGTTTTATTCAAATTATCTCTAAATATCTATTATCAACCAACAACCAATGTGAGAACCACTCAAATAGTAATTATTAAACCATTTTATTTATTATACTGACTGCTCATAGTTCTGACTCATCCTTGCCCAACTGTAGCAGGAAAGGTGGAGGAGCAACATCTACCCCAAGAAGCACTCAAGATAAATCAAAGGTCCAGGGAAAGGGCTACAAGGACAAATGCTATGAGTATATCAGGAAGGCTGTTGAGGCTCGCTTCGACAAACTGCTCACCGAGGTAGTGCTTAAATATATCCTGGACTTAAGATTTTATTGTGTGGTCATCACAGTCCATGCAGTTAGCAGCAAGT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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA005617