BGIOSGA005985
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA005985 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA005985, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_08179 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA005985-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA005985-PA |
| Length |
12931 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:27097858..27110788 |
| Sequence Coding Region |
27110415..27110788,27109606..27110014,27109438..27109509,27109278..27109340,27108870..27109028 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:27097858..27110788 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:27097858..27110788 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGACGCGCTCGTCTCGGCGGCGCTGGAGGAGGTGTGCGCCCGCCTCTCGCCCGGCCTCCCGGTCACCGACCTCTGGCCGGCGCTCCGCGGCGCGCTCGAGGCGGCCGGCCTCGCTCCCGGCCTCGATGCCAAGCGCGTCCTCTGGGCCCGCCTCATCGCGCTCCCCATCATCAGCCTCGTTGTGGGAGAGGGGGACGGGGCGCCCGTCGACCCGGTGGAGAAGGACGTGGAGGAGGCCGAGCGGCGGGGGGTGCGGTTGGTCGCTAGCGCCGCGCTCAGGGACAACTTCCTCGGGATGTATGACCGCAGGTTCGCGAAATCGGAGTTGAGCGCCGTCCAGAAGGGGGCGCTTGAACGGGTCGGAGCAAGCAGGACTTCTGGTGTAACGCAAAATGATCTATGCAAAACTTTCCGTATGAAAGGAAACAACTTCCACTTTATTGTAAAGAGCCTTCAGTCGCAGAAGTTAATCGTTAGGCAGTCAACTATTATAAAGGTTAAAGATCATGGAGCTGATGCCGAAGATGCTTCCCAGAATAAACAAATCATCAATACTAACTCATTGTATCTCTCGCGATATGCCAAAAACCTGAATATGAATTCACAACAGAGAATTGAGATCATAAAGCCTGAACTACTGGGCAGCAATGAAGAGAGCAATGGAGATGTTTTGCAAGAAGATGGGGCTTTTGGTGTAAATGACAAAAATGATATATCTATTCATGATTATCTTCCAGCAATGAAAGCCATATGCGATAAACTAGAAGAAGCTAGTGGAAAGACTCTTGTTGTTTCGGATATAAAAGTAGATCTCAATTACAGGATGACATATGGGCACAGAGCATGGAGAAATGTACTGCATAGGCTAAGAGACGCACAACTTATTGAAGAATTTGATGCCAAAGTTGATGATAAGAAATTCGATCCAAATGAATTTCAGCCAAAAAGTACAACCTCAAACTACAAACTTGGCAAGAAAGGCCAGGCAACTGATCAAGTCATGGAGCTTCCATTAGAGAACTGTATATACGATATGATCAACGCTCAAGGGCCAAAAGGAATAACCCTTGTTGAGCTTGGCAAACGTCTTGGGCACAACAATTCAAAAAGGCTTCATAAGCGAGTGTCATCCATGCTTAAAAAATACAATTTGACTTGGGAAGCTGAAGTTCAAGACAAGACATCACAATACCGAGTTTGGACTTCAAAAAACTTTTCACACTACAAAGCTGGTGCTGCTCTGCATAATTTGGAGGCACTCCCAGATGACCACGAGAAGTGTTCTGATTTGTGGTCATTAGTTCCATCTAAAGGATCAGAATCTCCAATCTCACGGGTTGATTTATTTGTTGATAATAACAAGCTTTTGTTGGAAGAAGAATGCCACAATAAACCAGCAGGACATCCCCTCCAGAGTAACCATGAAGCTTGCGTTGGGGTTTCTCAAATTGTTGAACAAGAGAAACTTGCTTTGGGTCAGAGGAAGAGGCGTCGCTGCCCTCCATTGACTTCTGATGATCGACGGCATAGGAGGATTCTTCACATGCTAAAGAAAAAGAAATTTGTACTAAAGGTGGAGTTACATAAATGGTTAGAGGGACTTGAAAAAGAAAATGGAAAAATAATGGATAGGAAGACATTGACTCGCACTTTAAATAAACTTCAGGAAGAGGGCAGCTGTAAATGCATCAAAGTTAGTGTCCCTCTGGTTACAGACTACACCCGCAGTCGTCTCATTGATGTAATACTGCATTCTTCTGTTGGAGACTTGTCACCGGAACTTGTGGATCAAATTAGGAATAGACAAAGGAATTTTGATACAGAAACTCGTTCAGGTGCAGCAGCTAAATTGAAGCAAAATCAACACACGACTGCTATACTTGGATTGAGGATTCCGCGCAGAGTTAAAGATAACAAACCATTAATATTAGAAGCTATGCATGCCAATGGATTCATTGGTGCAAAGATGATTCGAGCTAAGCTGTTCCATAAATTTCTGTGGGTATATGTTAGTGGTTTGCCAAATTGGTGTGACCCATTTGATAATGACAAAGAAGGGCATCATGACAAGAACCTTAGTCAATCGTCTGTGTTGTTTTCTATGGTGGGAGCTACAAAAAAAATGCCTCTTGAACTCTTTCTGCAAGTTGTGGGATCAGCAAAGAAGATTGATCACATGATTACTAAGTGTAGGCTTGGAAAAACGCTTTCAGAAATTCCTACCGAGGAATACAACCAACTCATGGATACTCATGCCAAAGGCCGACTCTCACGCTTGGTAAATATTCTAGATAAGCTCAAGCTTGTCCAACTTGCAAAGGAACTTGTAGATGATTCTGGTGCGCCATCAGATGCTTTGCCTACACATTCAATAGAGCTGAGGCCTTACATTGAAGAGCCTACACCAAGAATTCTTCCATCATCCCATGTTAATGTGAACCATCGGCCAAAAATTCGGCATGATTTTGTTCTTTCAAGGCAGGAGTTTGTTGATGCTTACTGGGAAACGTTAGAGTACTGTTATTTAACAGCTGGCTTGGCTGAGCCATCAAGTGCCTTTCCTGGCTGTTCTGTACCAGAGGTTTCTCATCCTCGTTCATGGAGTTCACTTAGAGTAATGACTACTGAACAAAGACTGGAGTTACAACAGCGCATTATGAATGCCAGTGAGAATGGAAAACTTCCTTTTAGAGATTGTCGTATAATTGCCAGGGAGTTGAATCTCTCTGTACAGCAGGTGCTCTGTGTATCGTCCTCTCAGAATAGACAGCTTCATGGACAGCCCACCGTCCCTGCTGCAAGAAAACGGCGAAAAGTTAATTCAGGATCAACCTCTAAAAAAAGGAAAAGGTCTGCTGATGAGATTACCCTGAAATTTATCAAACGGAATGTTGAAACCATTGAATCCACTGAACCGAGACCAGCACAGTCTATCCCACATGAGGAGGTGGATGAAGATACGATAAGCAGTCCAAGGATCAGTCGATCTACCATCTTAAGAGGAAGCTGCATGAGAGAGAAACGATTTGTGTGGACATACGATTCTGACAGAAAATTGCTGATGATATACACTAGATCCCGTGCAACACTTGGAGCAGGATCTCATCGCGTAGATTGGAACTCTCTTTCTGATCTTCCAGCTCCACCAGCTGCATGCCGTAGAAGGATAGCATACTTGAGGAAAAAAACAAACATAAGACCAGCTGTGAGCCGAGTCTGTGACCTTTTAGGGATACGATACGCTAGGTACCTTGAAAAGGAAAAGAGATGGAAATTGAGAGGATTACCTTCCGAAATCTCAAATTCTAGTCATGACAACTGTGTGGATCCAGATTCTGAGCAATTCTTTTGGGATAATTTCGAGGATCCAGAGATAAAGAGTGCACTTGATGAAGTCCTTGAATTCATTCGAGTAGAAAAAATGGAGCAGACCAAGAGAGTTGGGTCTAAGAATGAAAGGAACAATGATGATAATGATGCCACCAAGGAAGTTCCAAATGGGCAGAAACAGCCAGTTTTAGGTGCACGTGCAACCTGTGCAAGCACTGCAATTCAAGAAAGTGGACTCCGTGAACATGCAAAATCCTATAGGCTGTCAAATGCAATCCATGCAAGTAAAAACATGGACATTCCCTTCAGATCTCATGAAAAGGCCATTAACCATAATAAAGATGATATTGCTAAAAGAGATGTATGCAGATCATTGGCAGTTGCAAATGCATTAGAGCTTCTGAAGCTGGCTTTTCTCAGCACCTCATCAGGACCAGAAGTGCAAGCTTCGTTAGCAGCAACCCTCCAGCTTTATTCAGAGACTGAAATTTTTACTGCCTTTTCCTTTCTCAGAGAGAAAAATTTCATGGTAACTGGAGATGGAACAAAGCCATACACTCTTTCTGGGAAATTCTTTTTTAATGCTTCGAATTCACCCTTCCCATTTGGTTCAGGGAAAAAAGCTTCTGAATTTTCTCAATGGGTAGGGCAGCAAAAGAATACCATGGATGATGGAGTTTGTTTGTATCCAGATCTACAATGTGGGGAAATTGTCCAGCTCTTTTCTCTTGTTTTGTCTGGAGAGTCGTTCATTTCACCCTCATTGCCAAGTGAAGGAGTTGGTGAGGCTGATGAGCCTAATAGCTCTAGTTTGTTTGTTGATGATAACAGTGAATTGGATGAGAGTAGTCACAAACGCAAGGCTGATATGGTTAAACTTAAAAGCAGTAAGACTAAGAAACACAAACCTTTGCCCAAGATAGAAAGCGACTTTTGCTATCGCCGAGAGAAAGGTTTCCCTGGTCTTCAAGTGGCTTTGAATCAAGAGAGAATTAAAACAAGTAATCTTACACAAGAGTTACATGATAAAGAATGCCTTATTTTTACTTCAGCCTGGGAAATGGGGAGCAAGGATGTTGATTCACAGGTAGAAAGCCACAATATGTCATCATTGTATCTAAACAACTCCAGTTCATGTCGGCGTTTACTGTCAGAATCTCATTTGGAGAACTCTTACAGTGGGTGGCCTTGGGATGCTATAAAAACATATGCTGAACAGTCACCATCATTATGTTGTAACAAAAATGAACCAGACATATTGTCTTCTGACCTGTTCAGAAATGCATTTTGTGTTGTTCATAAAGCTGGCGAACAAGGAGTTAATTTGAGAGAGATGTCACAGGCACTGGATCCTCTAGGCATCCAGTTTGTCGATCTGATTGTTCATACTCTCAAGAGATTTCAGCTGGTCATTAAGGTCAATGCATATGATGGTGTGCAGATTGTTGACTCTATACATAAGTCAAAATATCATATAACTACACTTGCAGATTCAAGTCATTGCAGTTGTTTGCGAGCTTCTGCTTTTGAGATGGCCGAGACTGGAGATACAGAAAATCTACTGAGAGAGAAGCATGCAATGTCTAGTGATGTGCAAGGGAGTGTAAAAATGCTTGGTGACGGGCACACTGTGACGGTTCTTAATGTCCAAAGCAAGTC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|
| Protein Sequence |
<aaseq>MDALVSAALEEVCARLSPGLPVTDLWPALRGALEAAGLAPGLDAKRVLWARLIALPIISLVVGEGDGAPVDPVEKDVEEAERRGVRLVASAALRDNFLGMYDRRFAKSELSAVQKGALERVGASRTSGVTQNDLCKTFRMKGNNFHFIVKSLQSQKLIVRQSTIIKVKDHGADAEDASQNKQIINTNSLYLSRYAKNLNMNSQQRIEIIKPELLGSNEESNGDVLQEDGAFGVNDKNDISIHDYLPAMKAICDKLEEASGKTLVVSDIKVDLNYRMTYGHRAWRNVLHRLRDAQLIEEFDAKVDDKKFDPNEFQPKSTTSNYKLGKKGQATDQVMELPLENCIYDMINAQGPKGITLVELGKRLGHNNSKRLHKRVSSMLKKYNLTWEAEVQDKTSQYRVWTSKNFSHYKAGAALHNLEALPDDHEKCSDLWSLVPSKGSESPISRVDLFVDNNKLLLEEECHNKPAGHPLQSNHEACVGVSQIVEQEKLALGQRKRRRCPPLTSDDRRHRRILHMLKKKKFVLKVELHKWLEGLEKENGKIMDRKTLTRTLNKLQEEGSCKCIKVSVPLVTDYTRSRLIDVILHSSVGDLSPELVDQIRNRQRNFDTETRSGAAAKLKQNQHTTAILGLRIPRRVKDNKPLILEAMHANGFIGAKMIRAKLFHKFLWVYVSGLPNWCDPFDNDKEGHHDKNLSQSSVLFSMVGATKKMPLELFLQVVGSAKKIDHMITKCRLGKTLSEIPTEEYNQLMDTHAKGRLSRLVNILDKLKLVQLAKELVDDSGAPSDALPTHSIELRPYIEEPTPRILPSSHVNVNHRPKIRHDFVLSRQEFVDAYWETLEYCYLTAGLAEPSSAFPGCSVPEVSHPRSWSSLRVMTTEQRLELQQRIMNASENGKLPFRDCRIIARELNLSVQQVLCVSSSQNRQLHGQPTVPAARKRRKVNSGSTSKKRKRSADEITLKFIKRNVETIESTEPRPAQSIPHEEVDEDTISSPRISRSTILRGSCMREKRFVWTYDSDRKLLMIYTRSRATLGAGSHRVDWNSLSDLPAPPAACRRRIAYLRKKTNIRPAVSRVCDLLGIRYARYLEKEKRWKLRGLPSEISNSSHDNCVDPDSEQFFWDNFEDPEIKSALDEVLEFIRVEKMEQTKRVGSKNERNNDDNDATKEVPNGQKQPVLGARATCASTAIQESGLREHAKSYRLSNAIHASKNMDIPFRSHEKAINHNKDDIAKRDVCRSLAVANALELLKLAFLSTSSGPEVQASLAATLQLYSETEIFTAFSFLREKNFMVTGDGTKPYTLSGKFFFNASNSPFPFGSGKKASEFSQWVGQQKNTMDDGVCLYPDLQCGEIVQLFSLVLSGESFISPSLPSEGVGEADEPNSSSLFVDDNSELDESSHKRKADMVKLKSSKTKKHKPLPKIESDFCYRREKGFPGLQVALNQERIKTSNLTQELHDKECLIFTSAWEMGSKDVDSQVESHNMSSLYLNNSSSCRRLLSESHLENSYSGWPWDAIKTYAEQSPSLCCNKNEPDILSSDLFRNAFCVVHKAGEQGVNLREMSQALDPLGIQFVDLIVHTLKRFQLVIKVNAYDGVQIVDSIHKSKYHITTLADSSHCSCLRASAFEMAETGDTENLLREKHAMSSDVQGSVKMLGDGHTVTVLNVQSKSSSPQIRYQSPVGQKRSFTPAQDNRGSDCCHACERHIYHPILPWINGDGSMNNTVYEGLSRRIIGYTMQYPGVVEEDIIHRMDVLNPQTCRTLLEKLMFDKHLYARVFDERAPSAPTLLQSILKQDRCKEPSKCNKRYFANPMSTFLL</aaseq> |
| Gene Sequence |
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