BGIOSGA006116
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA006116 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA006116, complete gene. |
| LocusTag |
OS12G0125500 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA006116-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA006116-PA |
| Length |
3560 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:24961207..24964766 |
| Sequence Coding Region |
24964464..24964766,24962626..24963167,24962376..24962462,24962159..24962215,24961820..24962058 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:24961207..24964766 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:24961207..24964766 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGAGAGGACGACGGAGGATGATGAGAGGCCGACGGTTCCTCTGCTGGAGCCTAAGCCGGCGATCAACGGCGGCGGCGGAGGCAGCAACGAGGAGGAAGAAGAGGTTGGGTCGCTGGGGCGGCGCTTGGTGGAGGAGAACAAGAAGCTGTGGGTGGTGGCGGGTCCTTCCATCTGCGCGCGCGCCACCTCCTTCGGCGTCACCATCGTCAGCCAGGCCTTCATCGGACACATCGGCGCCACCGAGCTCGCCGCGTATGCCCTCGTCTCCACCGTCCTCATGCGCTTGAGCGTCGGCATCCTGATAGGCATGGCAAGCGCATTGGAAACATTGTGTGGGCAATCATATGGTGCCAAGCAATACCACATGTTAGGCATCTATCTACAACGCTCATGGATAGTTCTCTTCTGTTGTGCAGTAATCCTTCTCCCAATCTACCTCTTCACCACTCCGCTCCTAATTGCCCTTGGTCAGGATCCCGATATCTCTGTTGTGGCTGGCACCATCTCACTATGGTACATTCCCATCATGTTCTCCTATGTCTGGGGATTAACAATCCAAATGTATCTACAATCACAGAGCAAGAACATGATCGTTACCTACCTCTCCTTGCTCAACTTTGGACTCAATCTCTTCCTATCATGGCTCATGGTGGTCAAGTTTCACCTTGGCCTTGCTGGGGTGATGGGCTCCATGGTCATTGCCTGTTGGATCCCTATATTTGGTCAGCTCGCATATGTCTTCTTTGGTGGTTGTCCTCAAACATGGACAGGGTTCTCGTCCTCTGCCTTTACTGATCTTGGTGCTATTATCAAGCTTTCGATATCATCCGGAGTGATGCTTTGTGTAGAATTATGGTACAACACCATATTGGTGCTCCTCACTGGTTATATGAAGAATGCAGAGGTTGCTCTTGATGCTCTTTCTATATGCCTTAATATCAATGGTTGGGAGATGATGATTGCTATTGGATTTTTGGCTGCAACTGGAGTGCGGGTGGCAAATGAACTTGGAGCTGGGAGTGCAAGAAGGGCTAAGTTTGCCATTTTCAATGTGGTCACCACTTCTTTCTTGATAGGATTTGTGTTTTTTGTGCTCTTCCTTTTCTTTCGTGGAAGCCTTGCATACATATTTACTGAAAGTCAGGAGGTAGTAGATGCAGTCGCTGATCTTGCTCCCCTTCTAGCTTTCTCCATTTTATTGAATAGTGTTCAACCGGTGCTCTCAGGTGTCGCTATTGGCTCTGGTTGGCAAAGTGTAGTTGCCTATGTTAATGTTGCATCGTACTACTTGATCGGTATCCCTATTGGGGCAATACTAGGCTATGCTCTAGGATTTGAAGTAAAGGGCATTTGGATTGGAATGCTTGTTGGAACACTAGTGCAGACTCTTGTGCTTTTATTCATCACACTTAGGACTAATTGGGAAAAACAGGTAGAGATTGCTCTCGAGAGACTAAATAGATGGTACACGGATGATAATGGAAGATCACAAAATTCGAGAGGAAATCCATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MERTTEDDERPTVPLLEPKPAINGGGGGSNEEEEEVGSLGRRLVEENKKLWVVAGPSICARATSFGVTIVSQAFIGHIGATELAAYALVSTVLMRLSVGILIGMASALETLCGQSYGAKQYHMLGIYLQRSWIVLFCCAVILLPIYLFTTPLLIALGQDPDISVVAGTISLWYIPIMFSYVWGLTIQMYLQSQSKNMIVTYLSLLNFGLNLFLSWLMVVKFHLGLAGVMGSMVIACWIPIFGQLAYVFFGGCPQTWTGFSSSAFTDLGAIIKLSISSGVMLCVELWYNTILVLLTGYMKNAEVALDALSICLNINGWEMMIAIGFLAATGVRVANELGAGSARRAKFAIFNVVTTSFLIGFVFFVLFLFFRGSLAYIFTESQEVVDAVADLAPLLAFSILLNSVQPVLSGVAIGSGWQSVVAYVNVASYYLIGIPIGAILGYALGFEVKGIWIGMLVGTLVQTLVLLFITLRTNWEKQVEIALERLNRWYTDDNGRSQNSRGNP</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..303#1600..2141#2305..2391#2552..2608#2709..2947#3034..3152#3238..3324#3480..3560#ATGGAGAGGACGACGGAGGATGATGAGAGGCCGACGGTTCCTCTGCTGGAGCCTAAGCCGGCGATCAACGGCGGCGGCGGAGGCAGCAACGAGGAGGAAGAAGAGGTTGGGTCGCTGGGGCGGCGCTTGGTGGAGGAGAACAAGAAGCTGTGGGTGGTGGCGGGTCCTTCCATCTGCGCGCGCGCCACCTCCTTCGGCGTCACCATCGTCAGCCAGGCCTTCATCGGACACATCGGCGCCACCGAGCTCGCCGCGTATGCCCTCGTCTCCACCGTCCTCATGCGCTTGAGCGTCGGCATCCTGGTATGCCTGATGACCACTGATTAATTATTCTTTGCTTATATACTACACCCTCGGTTTCAAATTATAGGACACTCTTTTTTTAAAAAAAATTAAACTCGGTAACTTTTTACTAATAATCATATTAACTAAGTATTATGGCATGCTATATCACTAGATTTATATTTTAAAATACTTTAATATGATGCTAATTTCATATTTGTTGAGAATATGGAATAGAATAAAATAATGGTCAAAGTATAGTACTTAGTTTAATTACAGAGGGAGTACTTAATTTAATTACAGGTTTGTTTTCATTAGTACGTGTAACAGTTCAACTCGATTTTTTTCACATGATTGGTCTTTCTGCAACTAGCAACATTTAAAGACAAAATTTGATACATGATATTCACAAATTATGGTAGTATTTACTAATACGCACCATCAAAACATGGCTTTGTACGAGTACACCTTGAAAGGTGATAATTTATTAGAGAATATCATAGCTGTTAAAATACACACTTGTGAGAGGGCTATTTTGGTCTTTTTCAAATATGCTAAAAATGATCAAATAATAATATGATATTTTCTAGCAAATTAACACGTTCTTTTAGGTGTCCTTAGGTCAAGCCACGTTTTAGGAGTATCCCTAACAAAATCACTCTTATAGTAAATTTTGCCAATTTTAAAAACTAACTTTAATAATGTTGGAGTCATGACTTAATTCTATCCATCGAGACTAATAGCGTCACTAACTTTTTTTCTTTAATTTAATTTGCACATCGATTAATTCGTATAAATCATGTATGTTTGATTTGCCTTTATAAGAGTTAGGCTCGATATAAAAAAGACATAAAACGTATCGAATAAAACGTATTGAAGGAAGAAAATTATATGAGATCTTTGCCTCCTCACATTTTTTCCTTCTTGAGAAGGGGATCATCAAATTATTCAACTTTCAAAACACTAATTAATATTTGAAGCAGGCTCTTCATCTAATCATCCACCCCTTAATCATGGCATTTTCTTCATGCAATAATTATATAGTGTACTCTTTCTTTATTCTTCTTGGATCTTCCGTATGCTATCTTCTTCGTGCTACCTCTGTTAGCTAGCACTGCAACAATAACAAACTCTTAATGGTACAAAATATACAAATAAAATGTAAACATACCTTACTTTAAGTTATATAAAAATATTTATCTTTTACTAACAATTAATTTTTGTTACAAATCATCTTGTACAAAATGCATACATAAACAATTAACTATTTACAATTACTTGATAGTTAACCATACATATACATTGTTGTAACTGCAGATAGGCATGGCAAGCGCATTGGAAACATTGTGTGGGCAATCATATGGTGCCAAGCAATACCACATGTTAGGCATCTATCTACAACGCTCATGGATAGTTCTCTTCTGTTGTGCAGTAATCCTTCTCCCAATCTACCTCTTCACCACTCCGCTCCTAATTGCCCTTGGTCAGGATCCCGATATCTCTGTTGTGGCTGGCACCATCTCACTATGGTACATTCCCATCATGTTCTCCTATGTCTGGGGATTAACAATCCAAATGTATCTACAATCACAGAGCAAGAACATGATCGTTACCTACCTCTCCTTGCTCAACTTTGGACTCAATCTCTTCCTATCATGGCTCATGGTGGTCAAGTTTCACCTTGGCCTTGCTGGGGTGATGGGCTCCATGGTCATTGCCTGTTGGATCCCTATATTTGGTCAGCTCGCATATGTCTTCTTTGGTGGTTGTCCTCAAACATGGACAGGGTTCTCGTCCTCTGCCTTTACTGATCTTGGTGCTATTATCAAGCTTTCGATATCATCCGGAGTGATGCTTTGGTAAGTAACAGTTCTGTTTATGTACACATATGAAATTTTGTATAATTTTGATGATACCAAACAAAAGGCAATATGTTATATCTAACCTAGTGTTAACCAAGTTCTTTCCTACAGCTAATTTGGTAGCTCATTGATTCATTCTTGTTGTTCCTTTGCCTTTCAGTGTAGAATTATGGTACAACACCATATTGGTGCTCCTCACTGGTTATATGAAGAATGCAGAGGTTGCTCTTGATGCTCTTTCTATATGGTAATATGTTAATATATATACTATTGTTGCATACTAGTTTAGAAAATAATAGCCAAATCATGTTGTATCATGTACATCAATTTATTGTTTTGTGTTGATCCTTTAGTACTTGGAGAAATTGCTTGTTGAGCACAGTTGTTTTCACTTACAAAATTTGTAGCCTTAATATCAATGGTTGGGAGATGATGATTGCTATTGGATTTTTGGCTGCAACTGGGTAACTTCATGATCTTACTTGTTACTCATTAAGTGGTTCATCTGACTATTCCATTATGTCCTATAAATTTGACTTATACTTAATACATATACATTTTTAGAGTGCGGGTGGCAAATGAACTTGGAGCTGGGAGTGCAAGAAGGGCTAAGTTTGCCATTTTCAATGTGGTCACCACTTCTTTCTTGATAGGATTTGTGTTTTTTGTGCTCTTCCTTTTCTTTCGTGGAAGCCTTGCATACATATTTACTGAAAGTCAGGAGGTAGTAGATGCAGTCGCTGATCTTGCTCCCCTTCTAGCTTTCTCCATTTTATTGAATAGTGTTCAACCGGTGCTCTCAGGTATGATTATTTTATTTGACGGACGAATATATCAAAATAATTTAAACTTTCACTTTGAAATTACAACGTTTTCTAACTATCTATAGGTGTCGCTATTGGCTCTGGTTGGCAAAGTGTAGTTGCCTATGTTAATGTTGCATCGTACTACTTGATCGGTATCCCTATTGGGGCAATACTAGGCTATGCTCTAGGATTTGAAGTAAAGGTAAGGTCCTGGTTGCTATTGTAAATTTCATTAGGAAATCTTGGGTCTAAGTTGCGTTTCTCACTTTTATTAATTGGTTCTATAGGGCATTTGGATTGGAATGCTTGTTGGAACACTAGTGCAGACTCTTGTGCTTTTATTCATCACACTTAGGACTAATTGGGAAAAACAGGTTGGCTTTGTTATCTTTTTTGCTCATATTTTTTGTTATCTTGTATTTAATTATATCTTTTTCACATAATATAAGGGTCTATCTAGAAAAACATGTGGGACATTGAAAGAGCACACTTTTTTTATATTTTAATGGTGTGCTCCATTGTTTTTTAGGTAGAGATTGCTCTCGAGAGACTAAATAGATGGTACACGGATGATAATGGAAGATCACAAAATTCGAGAGGAAATCCATGA</dnaseqindica> |
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