BGIOSGA006344

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA006344

Description

Putative uncharacterized proteinStarch branching

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA006344, complete gene.

LocusTag

P0475F05.16

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA006344-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA006344-PA

Length

10957

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:20764778..20775734

Sequence Coding Region

20775584..20775734,20775302..20775429,20774691..20774902,20773867..20773965,20773737..20773779
,20773477..20773536,20772725..20772805,20772524..20772640,20772251..20772334
,20771638..20771759,20771197..20771316,20770017..20770146,20769809..20769919
,20769540..20769668,20768086..20768189,20767456..20767600,20766854..20767001
,20766612..20766712,20766300..20766377,20765643..20765798,20764941..20765015
,20764778..20764861

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:20764778..20775734 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:20764778..20775734 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGGCGCCGGCGTCTGCGGTTCCCGGGAGCGCGGCGGGGCTACGGGCGGGGGCCGTGCGGTTCCCCGTGCCAGCCGGGGCCCGGAGCTGGCGTGCGGCGGCGGAGCTCCCGACGTCGCGGTCGCTGCTCTCCGGCCGGAGATTCCCCGGTGCCGTTCGCGTGGGGGGTTCCGGGGGGCGCGTGGCCGTGCGCGCGGCGGGCGCGTCAGGGGAGGTGATGATCCCCGAGGGCGAGAGCGACGGGATGCCGGTTTCAGCAGGTTCAGACGATCTGCAGGTGCCAGCCTTAGATGATGAATTAAGCACGGAGGTTGGAGCTGAAGTTGAGATTGAGTCATCTGGAGCAAGTGACGTTGAAGGCGTGAAGAGAGTGGTTGAAGAATTAGCTGCTGAGCAGAAACCACGAGTTGTCCCACCAACAGGAGATGGGCAAAAAATATTCCAGATGGACTCTATGCTTAATGGCTATAAGTACCATCTTGAATATCGATATAGCCTATATAGGAGACTGCGTTCAGACATTGATCAGTATGAAGGAGGACTGGAAACATTTTCTCGCGGTTATGAGAAGTTTGGATTTAATCGCAGTGCTGAAGGTGTCACTTATCGAGAATGGGCTCCCGGGGCACATTCTGCAGCATTAGTAGGTGACTTCAACAATTGGAATCCAAATGCAGACCGCATGAGCAAAAATGAGTTTGGTGTTTGGGAGATTTTTCTGCCTAACAATGCTGATGGCTCATCTCCTATTCCACATGGCTCACGTGTAAAGGTGCGAATGGAAACTCCATCTGGTATAAAGGATTCAATTCCTGCCTGGATCAAGTACTCTGTGCAGGCCGCAGGAGAAATCCCATACAATGGAATATATTATGATCCTCCTGAAGAGGAGAAGTACATATTCAAGCATCCTCAACCTAAAAGACCAAAGTCATTGCGGATATACGAAACTCATGTTGGAATGAGTAGCACGGAGCCAAAGATCAACACGTATGCAAACTTTAGGGATGAGGTGCTTCCAAGAATCAAAAAGCTTGGATACAATGCAGTGCAAATAATGGCAATTCAAGAGCATGCATATTATGGAAGCTTTGGGTACCATGTCACCAATTTCTTTGCACCAAGTAGTCGTTTCGGGACCCCAGAAGATTTAAAGTCATTGATTGATAAAGCTCATGAGCTTGGTTTAGTTGTGCTCATGGATGTTGTTCACAGCCATGCGTCAAATAATACACTAGATGGGTTGAACGGTTTTGATGGTACAGATACGCATTACTTTCATAGTGGTTCACGCGGCCATCATTGGATGTGGGATTCTCGCCTGTTCAACTATGGGAATTGGGAAGTTCTAAGATTTCTACTATCCAATGCAAGATGGTGGCTCGAGGAGTATAAGTTTGATGGTTTCAGATTTGACGGTGTAACCTCAATGATGTACACTCATCATGGATTACAAGTAGCATTTACGGGGAACTACAGTGAATACTTTGGATTTGCCACTGATGCTGATGCAGTAGTTTACTTGATGCTGGTAAATGATTTAATTCATGGACTTTATCCTGAGGCCATAACCATCGGTGAAGATGTCAGTGGAATGCCTACATTTGCCCTTCCTGTTCAAGATGGTGGGGTTGGTTTTGATTATCGCCTTCATATGGCTGTTCCTGACAAATGGATTGAACTCCTCAAGCAAAGTGATGAATCTTGGAAGATGGGTGATATTGTGCACACACTGACTAACAGAAGGTGGTCAGAGAAGTGTGTTACTTATGCTGAAAGTCATGATCAAGCACTAGTTGGTGACAAAACTATTGCATTCTGGTTGATGGACAAGGATATGTATGATTTTATGGCTCTGGACAGACCGGCAACACCTAGCATTGATCGTGGAATAGCATTGCATAAAATGATTAGACTTATCACAATGGGGTTAGGAGGAGAAGGCTATCTTAACTTTATGGGAAATGAGTTCGGACATCCTGAATGGATTGATTTTCCAAGAGCTCCACAAGTACTTCCAAATGGTAAATTCATCCCAGGGAATAACAACAGTTATGATAAATGCCGTCGAAGATTTGACCTGGGTGATGCGGACTATCTTAGGTATCGTGGCATGCTAGAGTTTGACCGCGCGATGCAGTCTCTCGAGGAAAAATATGGGTTCATGACATCAGACCACCAGTACATATCTCGAAAGCATGAAGAGGATAAGATGATTATATTTGAGAAGGGAGATCTGGTATTTGTGTTCAACTTCCATTGGAGTAACAGCTATTTTGACTACCGTGTTGGTTGTTTAAAGCCAGGGAAATATAAGGTGGTCTTGGACTCAGATGCTGGACTCTTTGGTGGATTTGGCAGGATCCATCACACTGCAGAGCACTTCACTGCCGATTGTTCACATGACAACAGGCCCTACTCGTTCTCAGTTTATTCTCCTAGCAGAACCTGCGTTGTCTATGCTCCAGCGGAATGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAAPASAVPGSAAGLRAGAVRFPVPAGARSWRAAAELPTSRSLLSGRRFPGAVRVGGSGGRVAVRAAGASGEVMIPEGESDGMPVSAGSDDLQVPALDDELSTEVGAEVEIESSGASDVEGVKRVVEELAAEQKPRVVPPTGDGQKIFQMDSMLNGYKYHLEYRYSLYRRLRSDIDQYEGGLETFSRGYEKFGFNRSAEGVTYREWAPGAHSAALVGDFNNWNPNADRMSKNEFGVWEIFLPNNADGSSPIPHGSRVKVRMETPSGIKDSIPAWIKYSVQAAGEIPYNGIYYDPPEEEKYIFKHPQPKRPKSLRIYETHVGMSSTEPKINTYANFRDEVLPRIKKLGYNAVQIMAIQEHAYYGSFGYHVTNFFAPSSRFGTPEDLKSLIDKAHELGLVVLMDVVHSHASNNTLDGLNGFDGTDTHYFHSGSRGHHWMWDSRLFNYGNWEVLRFLLSNARWWLEEYKFDGFRFDGVTSMMYTHHGLQVAFTGNYSEYFGFATDADAVVYLMLVNDLIHGLYPEAITIGEDVSGMPTFALPVQDGGVGFDYRLHMAVPDKWIELLKQSDESWKMGDIVHTLTNRRWSEKCVTYAESHDQALVGDKTIAFWLMDKDMYDFMALDRPATPSIDRGIALHKMIRLITMGLGGEGYLNFMGNEFGHPEWIDFPRAPQVLPNGKFIPGNNNSYDKCRRRFDLGDADYLRYRGMLEFDRAMQSLEEKYGFMTSDHQYISRKHEEDKMIIFEKGDLVFVFNFHWSNSYFDYRVGCLKPGKYKVVLDSDAGLFGGFGRIHHTAEHFTADCSHDNRPYSFSVYSPSRTCVVYAPAE</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..151#306..433#833..1044#1770..1868#1956..1998#2199..2258#2930..3010#3095..3211#3401..3484#3976..4097#4419..4538#5589..5718#5816..5926#6067..6195#7546..7649#8135..8279#8734..8881#9023..9123#9358..9435#9937..10092#10720..10794#10874..10957#ATGGCGGCGCCGGCGTCTGCGGTTCCCGGGAGCGCGGCGGGGCTACGGGCGGGGGCCGTGCGGTTCCCCGTGCCAGCCGGGGCCCGGAGCTGGCGTGCGGCGGCGGAGCTCCCGACGTCGCGGTCGCTGCTCTCCGGCCGGAGATTCCCCGGTAATGATCCCGCGCCACCTTGTTGTTCTCGTCCGCCGCGACGCGCCACGCGTGCGCCTCGGCTCGACCAGGTGGCGTGCCGTGTCGCATCGCGCCGCGGGTGCGGTAAATCGTCGTGATCTTCATTTTGGTTTTGCCTGCGTCTCGTGTCCAGGTGCCGTTCGCGTGGGGGGTTCCGGGGGGCGCGTGGCCGTGCGCGCGGCGGGCGCGTCAGGGGAGGTGATGATCCCCGAGGGCGAGAGCGACGGGATGCCGGTTTCAGCAGGTTCAGACGATCTGCAGGTGCGTGATCATGATTCATCCTGCCTTGACAATACTATTGCTACATATCTAACAGCATTTTGCATGTCATGTTTGAAAATGGAGACATGTTCTTGTGCAGTGCTACCTTACGAGATCATATACATTTCACGCAGTCCACGTCTTGAGACGTGTTGATTTCTGTTTGTGACGGGATTATGATATATTCAGTGATTCAGTCCTTTTTTATGTACTTAGTCCATACTAGTTGTCTGCGTGCATAATGATAATATGATCTAGGTCTAGAGCACCCTATATGAGGCCTCAAAGGGCACACCATATGCGTAGGATTGATCTAGAGTCTTGCTTGTTGTCGCTCATTCCGTTCAGTTGTCATTATGTTTTACTTCTGAACATTTTATCTCTTGTACATTGTTGTAGGTGCCAGCCTTAGATGATGAATTAAGCACGGAGGTTGGAGCTGAAGTTGAGATTGAGTCATCTGGAGCAAGTGACGTTGAAGGCGTGAAGAGAGTGGTTGAAGAATTAGCTGCTGAGCAGAAACCACGAGTTGTCCCACCAACAGGAGATGGGCAAAAAATATTCCAGATGGACTCTATGCTTAATGGCTATAAGTACCATCTTGAATATCGGTATGGCTTTCCGCCCTTCTTTATAGATCACATAGTTTCATTAGGTTATGTTTTTATTATTCTCCATCTGTTCAGTCTTTCACAAGATGTATGCAAATAACTACTTACGTGTCACAGCTGATGAGACTCTTGAAGTTTTATCTTTAGTCCTGCATATATACTCTGATCTGTTCTCAAATGGAAGTTGTTTTAGAAATCATTCAGTCATGCTTTAAAATTTAACAAGAGTCCTAAACTACTAATGTGCGAAAAAAAAATAGATTTACCATTATAAGAATTTTTAAGTCAACATATAGTTAGAAAAAAAAGTTAATGGTCAAATGAGTATATTGGACATACATAGTAAATAGTACTAATAATACATAGATAGTACTCTTCACAGTGGTTCTGGGTTGGGGCGGTACTGCAAACCAAACAAAAGAGTGATAGGATGGCGTCAGAACTAAGAAATGCAATATTAATTTTGCAAATATTTAATCTGAAAGTTATCTATGATGTAAAATACATAATGGGTTTTAGACCTTGCTGACGTCTGTCAACTGGACAACAACTTTATTTCCTTTCTTTTATATCATTGTTATACTCCCTCTGTCCTAGAAAAAACAACTTTCGTACGTGAACTTGGAAAGTTGATTTATTTTATGATGGAGGGAGCATAGATGAAGTCAATATGCCCATGCTAACTCTACTAGAAACCTGATTATGCTTTAATTGATTGAATACAGATATAGCCTATATAGGAGACTGCGTTCAGACATTGATCAGTATGAAGGAGGACTGGAAACATTTTCTCGCGGTTATGAGAAGTTTGGATTTAATCGCAGGTATAGTTTCTTTTACATTGTAACCGCACATCACTTCTCTGGGTGTAACAAAATAACTCAGTGATATTCATCCTTCTTCCCATGTAGTGCTGAAGGTGTCACTTATCGAGAATGGGCTCCCGGGGCACATGTATGTTCTTTTGATAGTCTCACCATTTACCTAAAATGCTACATTATTAGTTCCATATTTCTAGTACATGTAGATATAATTACCATGCCATATATTCTGAGATATTCCAGATTGTATGGAATTTATAATTCTCAGATGAACAACTTGTCAATGTACTTGACTAGACGTTGTTAAGAACTAATTTTTGCTTCCAATTGCAGTCTGCAGCATTAGTAGGTGACTTCAACAATTGGAATCCAAATGCAGACCGCATGAGCAAAGTAAGCCCACAGGCTCACAAATATGCCCTTCCTTTCTTCAAAAATATTTTGTTTACATTTCTTTAACTAATTTATTTGGTTATAGCATTGGTTTCATCTATACTCTAGAGTTGAGCTAGTGATATATCATGCGAACGCATGTATAGCGCAGTGGTAAACCTGACTCGAACCTGGATTTTCGCACAAAAAAAATTAAATCCCTCCTTGCAAATGCTGGCAGAAGCGTGCTCCCCATGTGAGGTTGAGCAATCCCGGTTGTGCGATGCGTTCAGGGGTGGGGTTCTCAACTTAGCTTCATGCTGCGGGCCATCTTAACCCGCCGATTGAGTTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCATGCACACTCTTATATGTTATTGGCTGTTGCCATGAGTTAACTGTTAGTTATCGGTTTTGATGCTACTGTAGTGGTAGTACATTAATGTTGTGTATGTTACATGTACATTCTTTAGTACCTAGATGTATTTTGCAGTTTTTGTGGACTTGATAGGAGAAGATGAGTAGCTTGAGGTTGTAACTAATAATGCATGGACCTAGTGTTGTAATTCCATATGATTGGTAAGTTGGTAGTTACCGATGCTCATATCTAATGCAACTGTTTCCAGAATGAGTTTGGTGTTTGGGAGATTTTTCTGCCTAACAATGCTGATGGCTCATCTCCTATTCCACATGGCTCACGTGTAAAGGTAATTCCTTATCCTGCTTGGCCAGTGTTTTAGCTCTGGGCCTGTGAGCATCTCCCTGTATCAAGCATGCCTTTTGTCATCTAGGTGCGAATGGAAACTCCATCTGGTATAAAGGATTCAATTCCTGCCTGGATCAAGTACTCTGTGCAGGCCGCAGGAGAAATCCCATACAATGGAATATATTATGATCCTCCTGAAGAGGTACCTCCCCCCCCCCCCAACACGTGCACACGCCATTTGAATATGTTCTTGTTCCTTGAAAAAAGTGCTTCATTTGTACTTGTGAATACTTCTGTAATGTCCTTGGACTCTTGGAAATTTCTCTTTTTGTTGGCATCTTTAGATTGTTCTTTTTATCTAGTTATTAAAATGTTTTATATGACTATGCAGGAGAAGTACATATTCAAGCATCCTCAACCTAAAAGACCAAAGTCATTGCGGATATACGAAACTCATGTTGGAATGAGTAGCACGGTAATGCATCTTTTCTTTTAATTACTAGCCATATACAGTTCAAGTTAACTTACATTCTAGAATTATATTAAAGTACTGTTAGCCTTAATTTTTATAACTGTCTACTTCTAAGCAGTGATAAGTTGTTACAAGTTTCCTCTGTAATAATATATAATATATTAATACAATCAGCACATTTTTTGCACATTCGTCAACAATTAGCCGTTTATATAACCTTTGCTGGATGGTTGATTCAAATATGATGTTTTGAAACAAATTACTGATATTTGCACTGATATAATTTTTGATTTATGTTTTCTGCTAACATAGGGTATATTTAATTAATCTAATGTTTGTATTTCTTACAAACGGGTACGGTTATTATTACATAATAAAAAATAGCGAATAACACCATGCCTACCATTTGTATACATTTTTTTTTGGGCGTCTGTTGGTAATTTATGATTTTCCTGTACTATGCTGGCTGGTATTAATTTTAATATTGCAATCAGGAGCCAAAGATCAACACGTATGCAAACTTTAGGGATGAGGTGCTTCCAAGAATCAAAAAGCTTGGATACAATGCAGTGCAAATAATGGCAATTCAAGAGCATGCATATTATGGAAGCTTTGGGTGATCAAATTACATATTGCTGGATTTATTTCTTGTCTTTGCAGTTTACATATATATGCTTTTAGACTTTATCTTTCATCTTCCTTGTTCCCTTTGTATAATGTGATAAACTGCTTCATCTTATCATCTTTAACTTCCTTTTATACTCATGAAACAATGCTGTTACTGACCCCTTTTGTTTCCCCTTTTGTTTTGGTACAATTGAACTGTAACAAATGACATTCGCCACCTTTTGAATGAATGGCTATTGAGATAATTTTCAATTGTCAATTAAGACTTTTATTATGGGTGAGCAATGCAGATTTTTTACTTTTGTTTCAGGTACCATGTCACCAATTTCTTTGCACCAAGTAGTCGTTTCGGGACCCCAGAAGATTTAAAGTCATTGATTGATAAAGCTCATGAGCTTGGTTTAGTTGTGCTCATGGATGTTGTTCACAGGTAATTAATTACTCCCTCTGCTCATTTTTATAAGGCATATTTTAATTTTAGAAAGTATTTATGACTGAAATTTGACAATTAATTTCTCATAAAATATATTTATCATAGCTATAAAACCAATATAATGTGAAAATACTTTGAGGTATGAATCTAGTGGTATATGTTTTATACTCTAAATATACTTGTATATCAACTAATTATTGGTCAA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External Link(s)

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