BGIOSGA006452

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA006452

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA006452, complete gene.

LocusTag

OSJNBA0048K16.5

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA006452-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA006452-PA

Length

12621

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:18305628..18318248

Sequence Coding Region

18318026..18318248,18316721..18316869,18316525..18316623,18316360..18316410,18313966..18314082
,18313808..18313864,18313303..18313422,18311244..18311306,18311055..18311133
,18310668..18310777,18310534..18310587,18310397..18310464,18310188..18310290
,18309823..18310025,18309611..18309707,18308370..18308441,18308198..18308274
,18307992..18308108,18307824..18307908,18307571..18307738,18307133..18307243
,18306966..18307052,18306755..18306882,18306536..18306618,18306310..18306415
,18306055..18306207,18305856..18305976,18305628..18305741

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:18305628..18318248 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:18305628..18318248 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGCTCTCGTTGCAGCAGCAGGGCGGCGGCGACCCGCGGCCGCAGCAGCCGGCGGCGGCGCCGGCGCTGCTCGGGGGCGCGGACTGGCTAGGGTTCGGCCGCGCCGCCGCCGAGCTCGACGAGTCCGTGGCCTCGTCGCCGGCCTCGTTCCTGCTGCCGCCCGCGCCGCCGGTCGACGCCAGGGCCCAGGCCCAGCCCGAGCCCAAGCCCAAGCAGCTCGGGGCTGTTGATGTAGAACGGCATTTGGCACTTGCACATCAAAATTACCGGTCTGGAAAGTATAAAGAGGCATTAGAGCATGGTAACATCGTTTATGAGAAGAATCCACGGCGGACAGATAACCTGCTTCTTCTTGGAGCTATTTACTATCAGATACGTAATTATGATATGTGTATTGCAAAGAATGAGGAGGCTCTTGCTATTGATCCAAACTTTGCAGAGTGCTATGGTAACATGGCCAATGCATGGAAGGAGAAGGGTGATGTTGATCTTGCAATCCGTTACTATCTAACCGCCATTCAGCTGCGACCAAACTTTTGCGATGCTTGGTCAAATCTTGCTAGTGCATATACAAGGAAGGGAAGATTAAATGAGGCAGCTCAATGCTGTAGACAAGCACTTGCAATCAACCCTCGATTGGTTGATGCGCACAGCAATCTTGGTAATCTGATGAAGGCCCAAGGTTTTATTCAGGAGGCATACAATTGTTACATTGAAGCACTACGCATAGATCCACAATTTGCGATCGCATGGTCGAATCTTGCTGGCCTGTTCATGGAGGCAGGGGATCTGGATAAAGCTTTACTATATTATAAGGAAGCTGTTAAACTTAAGCCATCTTTTGCTGATGCATATCTTAACCAAGGGAATGTTTATAAGACCATGGGAATGTCTCAAGAAGCCATTATATCATATCAGCGTGCAGTGCAGGCACGTCCTGACTATGCAATGGCTTACGGTAATCTTGCTACCATTTACTATGAGCAAGGCCAGCTTGATATAGCAATTCGTTGTTACAATCAAGCTATAATCTGCGATCCACAGTTTGTTGAAGCATACAATAACATGGGCAATGCCCTTAAAGATGCTGGAAGAGTGGAAGAAGCAATTAACTGCTACAGATCATGCCTTGCGCTGCAAGCAAACCATCCACAAGCTCTTACTAACCTAGGAAATATTTATATGGAGTGGAACCTGATAAGTGCGGCTGCTTCATTTTACAAAGCAGCAATATCTGTGACATCTGGGTTATCTTCTCCTCTGAACAACTTGGCTGTGATATACAAGCAACAGGGAAACTATGCTGATGCTATCACATGTTATACTGAAGTACTTCGGGTAGATCCTACTGCAGCTGATGCACTAGTTAATAGAGGGAACACATTCAAGGAGATCGGTAGAGTCAATGAAGCAATTCAGGACTACATTCAGGCTGCAACAATCAGGCCAACCATGGCAGAAGCCCATGCCAACTTAGCCTCAGCTTATAAAGACAGTGGACATGTTGAAACGGCTATAGTTAGCTATAAACAGGCTCTTCGTTTGCGTCCTGATTTTCCTGAAGCAACCTGCAACCTTTTGCATACTTTACAGTGTGTGTGTGATTGGGAAAACAGGAATGCCATGTTTCGCGATGTTGAAGAAATTATCAGAAAGCAAATAAAGATGTCAGTACTTCCAAGCGTGCAACCTTTCCATGCCATCGCATATCCTATTGATCCCATGCTTGCACTAGAGATAAGCTGTAAATATGCTGCTCATTGTTCCTTGATTGCCTCTCGTTTTGGATTGCCGTCCTTTGTGCATCCCCCTCCTGTTCCTGTCAAAGCAGAGGGTAAACACTGTCGACTAAGGGTTGGATATGTTAGCAGCGATTTTGGGAATCATCCCCTCTCCCATCTCATGGGTTCAGTATTTGGAATGCATGACCGTGACAATGTTGAGGTCTTCTGCTATGCGCTGAGTCAAAATGATGGTACTGAATGGAGGCAGCGTATTCAGTCTGAGGCTGAGCATTTTGTGGATGTGTCTGCCATGACCTCTGATATGATTGTCAGAATCATTAATCAAGACAAAATACAAATATTAATAAACCTTAATGGTTACACAAAGGGTGCCAGGAATGAAATTTTTGCACTGCAACCAGCCCCCATCCAGGTTTCGTACATGGGGTTTCCAGGCACAACTGGGGCTGCATATATAGACTACCTAGTTACAGATGAGTTTGTTTCGCCAACTTGCTATTCACACATATATTCTGAGAAACTCGTCCATCTGCCTCATTGTTATTTTGTCAATGACTACAAGCAGAAAAATCGTGATTGTCTTGATCCTGTATGCCCACATAAAAGATCAGATTATGGGTTACCCGAGGATAAGTTCATCTTTGCATGCTTTAATCAGCTTTATAAGATGGATCCAGAAATATTTGATACATGGTGCAATATTCTCAAACGTGTTCCGAACAGTGCATTATGGCTTTTAAGGTTCCCAGCAGCAGGTGAAACTAGAGTAAGAGCACATGCTGCTGCGAGAGGAGTCAGACCCGACCAGATCATCTTCACTGATGTTGCTATGAAAAATGAGCATATTAGACGCAGCTCATTGGCAGACCTTTTCCTGGACACCCCTCTTTGCAATGCGCACACAACTGGGACAGACATATTGTGGGCTGGTTTACCAATGATAACCCTTCCACTGGAGAAAATGGCAACCAGAGTAGCTGGTTCCCTCTGCCTAGCCACCGGGCTAGGGGAAGAGATGATTGTCAGCAGGCAAGTTATGAAAGAGTATGAAGATAGGGCAGTAGACCTTGCACTAAATCCGGCTAAACTTCAAGCTCTGACTAATAAGTTGAAGGAAGTCCGTATGACTTGCCCATTATTTGATACAGCTAGATGGGTACGCAACCTTGAACGTGCGTACTACAAGATGTGGAACCTGTACTGCTCCGGTCGCCACCGAGAGCCGTTCAAGGTGATAGAAGATGACAATGAATTTCCATACGACCGCTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MLSLQQQGGGDPRPQQPAAAPALLGGADWLGFGRAAAELDESVASSPASFLLPPAPPVDARAQAQPEPKPKQLGAVDVERHLALAHQNYRSGKYKEALEHGNIVYEKNPRRTDNLLLLGAIYYQIRNYDMCIAKNEEALAIDPNFAECYGNMANAWKEKGDVDLAIRYYLTAIQLRPNFCDAWSNLASAYTRKGRLNEAAQCCRQALAINPRLVDAHSNLGNLMKAQGFIQEAYNCYIEALRIDPQFAIAWSNLAGLFMEAGDLDKALLYYKEAVKLKPSFADAYLNQGNVYKTMGMSQEAIISYQRAVQARPDYAMAYGNLATIYYEQGQLDIAIRCYNQAIICDPQFVEAYNNMGNALKDAGRVEEAINCYRSCLALQANHPQALTNLGNIYMEWNLISAAASFYKAAISVTSGLSSPLNNLAVIYKQQGNYADAITCYTEVLRVDPTAADALVNRGNTFKEIGRVNEAIQDYIQAATIRPTMAEAHANLASAYKDSGHVETAIVSYKQALRLRPDFPEATCNLLHTLQCVCDWENRNAMFRDVEEIIRKQIKMSVLPSVQPFHAIAYPIDPMLALEISCKYAAHCSLIASRFGLPSFVHPPPVPVKAEGKHCRLRVGYVSSDFGNHPLSHLMGSVFGMHDRDNVEVFCYALSQNDGTEWRQRIQSEAEHFVDVSAMTSDMIVRIINQDKIQILINLNGYTKGARNEIFALQPAPIQVSYMGFPGTTGAAYIDYLVTDEFVSPTCYSHIYSEKLVHLPHCYFVNDYKQKNRDCLDPVCPHKRSDYGLPEDKFIFACFNQLYKMDPEIFDTWCNILKRVPNSALWLLRFPAAGETRVRAHAAARGVRPDQIIFTDVAMKNEHIRRSSLADLFLDTPLCNAHTTGTDILWAGLPMITLPLEKMATRVAGSLCLATGLGEEMIVSRQVMKEYEDRAVDLALNPAKLQALTNKLKEVRMTCPLFDTARWVRNLERAYYKMWNLYCSGRHREPFKVIEDDNEFPYDR</aaseq>

Gene Sequence

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