BGIOSGA006624
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA006624 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA006624, complete gene. |
| LocusTag |
P0543C11.29 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA006624-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA006624-PA |
| Length |
5223 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:12743323..12748545 |
| Sequence Coding Region |
12748214..12748545,12746012..12746351,12745707..12745925,12745554..12745613,12744850..12745005 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:12743323..12748545 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:12743323..12748545 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCACCGACGACGGCGGCGGCGGCGGCGAGCAGCAACGGCGGCGGCGAGAGCGACGGCAGCAGCAAGGAGTGGAGGCTGACGGCGCCGACGAGGGGCGGCGCGATGGCGGCGGCGGGGGACAAGATGAGCATCCGGGCGGTGCGGTACAAGATCAGCGCCAGCGTCGACGACCGCGGCCCGCGCCCCGTCCTGCCGCTCGCCCACGGCGACCCCTCCGTGTTCCCCGAGTTCCGCACCGCCGCCGAGGCCGAGGACGCCGTCGCCGACGCGCTCCGCTCCGGCGACTTCAACTGCTACCCCGCCGGCGTCGGCCTCCCCGCCGCGCGACGTGCTGTGGCAGATCATTTGTCACGCGACCTCCCATACAAGCTATCTTCTGATGACATCTTCCTAACCGCTGGAGGAACTCAGGCCATCGAGGTCGTAATCTCAATCCTTGCCCAACCTGGCACAAACATATTGCTTCCTAGACCAGGCTACCCAAACTATGAAGCTCGAGCCGCGTTCAACAACCTTGAAGTTCGTCACTTTGATCTTATTCCTGAGAAGGGCTGGGAGATTGACCTTAACTCCCTAGAATCTATTGCGGACAAGAACACTACTGCGATAGTCATCATAAATCCCAATAATCCATGCGGGAATGTGTACACTTACGAGCATTTATCCAAGGTGGCAGAGGTAGCAAGGAAGCTTGGGATATTGGTAATTACTGATGAGGTGTATGGTAATTTGGTTTTTGGGAGTTCCCCATTTGTCCCAATGGGTTGCTTTGGGCACATCGTACCAATATTAACCATAGGATCGCTATCAAAGAGGTGGATAGTGCCGGGATGGCGACTTGGTTGGGTAGCAATATGTGACCCCAAGAAGACTCTACAAGAAACCAAGATTGCAACATTAATTACTAATTTCCTTAATGTTTCAACTGATCCAGCAACTTTCATTCAGGGAGCTCTACCGAATATTCTTAAGAATACCAAGGAAGAATTCTTTAAGAGGATAATTGATTTGCTTACGGAAACATCAGATATTTGCTATAGAGGAATAAAGGATATTAAATGCATCACTTGTCCTCACAAGCCCGAAGGATCCATGTTTGTGATGGTGAAATTGAACCTATATCTTTTGGAGGGAATCCATGATGATGTTGATTTTTGTTGCCAACTTGCGAAAGAAGAGTCGGTGATTCTTTGCCCAGGGAGTGTGCTGGGAATGAAGAATTGGGTTCGCATTACTTTTGCTATTGATTCATCTTCTCTCCTGGATGGTCTTGAGAGGATCAAATCCTTCTGCCAAAGGCACAAGAAGAAAAACCCTTTAAATTATATCTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAPTTAAAAASSNGGGESDGSSKEWRLTAPTRGGAMAAAGDKMSIRAVRYKISASVDDRGPRPVLPLAHGDPSVFPEFRTAAEAEDAVADALRSGDFNCYPAGVGLPAARRAVADHLSRDLPYKLSSDDIFLTAGGTQAIEVVISILAQPGTNILLPRPGYPNYEARAAFNNLEVRHFDLIPEKGWEIDLNSLESIADKNTTAIVIINPNNPCGNVYTYEHLSKVAEVARKLGILVITDEVYGNLVFGSSPFVPMGCFGHIVPILTIGSLSKRWIVPGWRLGWVAICDPKKTLQETKIATLITNFLNVSTDPATFIQGALPNILKNTKEEFFKRIIDLLTETSDICYRGIKDIKCITCPHKPEGSMFVMVKLNLYLLEGIHDDVDFCCQLAKEESVILCPGSVLGMKNWVRITFAIDSSSLLDGLERIKSFCQRHKKKNPLNYI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..332#2195..2534#2621..2839#2933..2992#3541..3696#3969..4062#5090..5223#ATGGCACCGACGACGGCGGCGGCGGCGGCGAGCAGCAACGGCGGCGGCGAGAGCGACGGCAGCAGCAAGGAGTGGAGGCTGACGGCGCCGACGAGGGGCGGCGCGATGGCGGCGGCGGGGGACAAGATGAGCATCCGGGCGGTGCGGTACAAGATCAGCGCCAGCGTCGACGACCGCGGCCCGCGCCCCGTCCTGCCGCTCGCCCACGGCGACCCCTCCGTGTTCCCCGAGTTCCGCACCGCCGCCGAGGCCGAGGACGCCGTCGCCGACGCGCTCCGCTCCGGCGACTTCAACTGCTACCCCGCCGGCGTCGGCCTCCCCGCCGCGCGACGGTACCACCCACGCCATCCACTTCCGTTTTTTTTTTGTTTTCATTATTTTCCGGCGAGTTCAAATATTCGGTTTTGGTTTTATGTTTTTTTTCCGCTTCCGTTTCTTTGCCGATTAATTGTTCGCTACGTGTGCATGGTTCATGTTTGCCTTTTATGGCCTTTATTAAAATTAGTTTATTAAATTTTCTCAACTATTTGTTTGTTAACGAGAACTAGCAAGCTGAGCCGAGGCGAGCCATATATAGTGAGGCCAGTTTTCGTTCAAAATTGAATAGTTTAGTTTAAAAAATTTATCAACTAGAGTACTTTCGAATCGAGCCAGTGATAACACGTATTTACTAATAGTGCTTATTTTATTCATTAATGATAATTATAATACGAATTATACGAATAGTGTTTAGGGACTGGTTGGTTCATTTGCTTATTTTGTGTGCCAAACAGCATATATCACCAATTTAGCAAGCTATAGTTTTTCGACACTCGACAAAAAGCTCGCCACACTTATGGCCAAAATAAATCAGCTTGCAAATTGAGTCTATAAGCAAATCTAAAAACGCTACAATTGTAGTTATAAGCCAAACGTTTTGCCAGAAGAACCGGAGCTGCCTACTTTAGACGTGATAAAGTTTGGCAATAAACTAAAACAGTCCCCTAGTCTGCGTACCATTCTTTGTTTACTAACAAAAGCGTGCTACTTTACCCACCAGTTATATAATTTGTTCACTTTGATCCGATTCCTATTTTGCAACATGTACGGGTGATATATATTTCATATACACATCATCAGGCACCTATAATTAAGCTGCATGGGTCTTCTCTGTTGTAGTGAGCACACTTTGGTCATAATTTTAAGGACTGTAGCACTGAAAAATAGATTTATTTGAATTTTTTAAACAACTTGCACATATAATTTTTTTATGAAAATATATAATTTTACAGTTTAAAAAGTGTGCTAATGAAAAACGAGAAATTTAGAGTTCAGAGTTGAAAAAAAGAACCGGCAAAACAACAACCCCATATGCAACACGAGGTCAGTAGGGTCACAACTCACAACCTCCCTGTAATGTAATCCCGGGGAAGATTTGTTTCGATTCAAACCCATATAGAACCATGGATTTAATTGAATTTAAACTGGATGAAGAAAACAATTATTGAAGTAGTGTTATTACACATGTCACATGTGCGCGAATACTGTATTGGCGTCGATCTCGAGGCGTACTACTCCCCTGGTCGGCGAGAGCTAGTAGGGGAGGAGAACTGAAGTGGAACCAACGGCTGGCGATGGACGGGACGTACGGCCCGAGCGGCGCACGCGCCCGCGGCGGGGGAGCACGAGCCCCGCGTCGTCCACGCCCGCCCCCACCGCGTGCTGGCACGCCCCCCGGCTGCTGCGGCTCGTCCGACGTGGCGGCCGCACAGCCCGGATGGAGCCTTCATTGTGCATCTGTGCTAGCTGTAGGACTGAAGGCTGTAGCTGCTGGATTTCTGGGGGAAAAAACAAAAGAAAGAGGAGGAAAAGAAAGGAAGGAAAATGTGCTCTCTTTTGAATTGAGAACAATCGTGCCTTTTGTGGACTAGAAGCAGGGGAGAAGAATATATAGTCCAATAATTCGGTTTTTCTGGGTTGATGATGCATTTCTTCTTTAGAAAGGATTTTACATGCTGTTTTTTTTAATAATGGCATGTTGTTCATTATGTTTTTTTTTTCATGTATGATTATTAATTAAATGTTTTATTTGCGCCGAGGATGCAGTTCTTCCTGAAAGAGGCATTTACGTGATGTTGGTTCATGCTTGCTTATGTGATTGTTAATTATATCATAATATATCTTGATTAATCTTGTGCCTTTCTTTTGAATATAGTGCTGTGGCAGATCATTTGTCACGCGACCTCCCATACAAGCTATCTTCTGATGACATCTTCCTAACCGCTGGAGGAACTCAGGCCATCGAGGTCGTAATCTCAATCCTTGCCCAACCTGGCACAAACATATTGCTTCCTAGACCAGGCTACCCAAACTATGAAGCTCGAGCCGCGTTCAACAACCTTGAAGTTCGTCACTTTGATCTTATTCCTGAGAAGGGCTGGGAGATTGACCTTAACTCCCTAGAATCTATTGCGGACAAGAACACTACTGCGATAGTCATCATAAATCCCAATAATCCATGCGGGAATGTGTACACTTACGAGCATTTATCCAAGGTTCAGCTGGTTTATTTAAATTTGATAAAAGTTTAAATAATATTATGGGCAACTTATTAATGTGCATATGTATTATTGTTATTTAGGTGGCAGAGGTAGCAAGGAAGCTTGGGATATTGGTAATTACTGATGAGGTGTATGGTAATTTGGTTTTTGGGAGTTCCCCATTTGTCCCAATGGGTTGCTTTGGGCACATCGTACCAATATTAACCATAGGATCGCTATCAAAGAGGTGGATAGTGCCGGGATGGCGACTTGGTTGGGTAGCAATATGTGACCCCAAGAAGACTCTACAAGAAACCAAGGTAAAATATATATTTAATACTGTTTTGATACTTTTTTTGTGAATTGATATTTGAAATATATATTTTTCTAAGTGTATACTACTTTCTTTGTAGATTGCAACATTAATTACTAATTTCCTTAATGTTTCAACTGATCCAGCAACTTTCATTCAGGTTAGTGTTTTTTTCCTTAACAAGCCAATGTTTGGGTTATAATTTTGGTCATTTATCTGCTTTATGTAATGTTTGGTGGACTATGTGTTGTGGTCGCTCTTCGGAAATTGGATGGCTGTTCAAAATGCACAGTGTGGTGTCTAGCATTGTTTGTAGCTGAGAAAAACTACTGGTTTAAAATATACTATCGAATACTTACCAAATAAATAGTACTTATGAATCAGAGTTATAATCAAACATAAGTTCATCAAAGTAACAAAAAAAAGTTTAATTCAGTTTTTTATGTTCATTTCATCCTATTTCTGTTAAAACATAATAATATGTTTTAAAAATTAATTGAGAAGATGAGGTTTGTATTTTGTGTTCACTCTGAGGTGCGTAGTTATTTAAGTGATAATGTGAAGTTCAATGTTACGTTAAAGTAAGCATACAATTCTTATACTGAGATTATTTATTGGTATCTTGCTTTAAAAATATTATATTGGCCTCGTGTATTCATTTTATCTCAAATAATTGAATTGTGCATGTTTTGTTGTTGAATTTCTTAGGGAGCTCTACCGAATATTCTTAAGAATACCAAGGAAGAATTCTTTAAGAGGATAATTGATTTGCTTACGGAAACATCAGATATTTGCTATAGAGGAATAAAGGATATTAAATGCATCACTTGTCCTCACAAGCCCGAAGGATCCATGTTTGTGATGGTAAGATTTCCTCTTAAATCATTTTATCATTAGAGCTGTACTAGCATCAATTTATCACACTCAAAAAATAATTATGCTATATTTAATTTAGTTGGCACCTAAAACACTTAATTCAGAGTCATGAGAAATTTTTGGTGTATTGTGTTGAAGAATAATGCTATAATTAGGAAGTTGTAGTTTGCCATGTTAACATCAATTTTCTTTTGTTGCTACAACATACTTGTCACTTAAGCTTCACTTCCAGTAATCTTACATTGAAATCCTATAAACAGGTGAAATTGAACCTATATCTTTTGGAGGGAATCCATGATGATGTTGATTTTTGTTGCCAACTTGCGAAAGAAGAGTCGGTGATTCTTTGCCCAGGTACATCTAACATTTTTGTTAATAAATGGATATGTATGTGCCTATTTAATTAAAGAAAGTTATAAATTTAATATTATATTATTCAATTCACTTGTTATGTTCTTGTAATTCTCTAATGCTATACCATGACATATAAGTGATGCTACCTTATTTAGTTTCTCACAAATCTAATGATTACTTTTTGGCTAAACATTTATGCTTATTAATTAATTTTGTTATGAAACTTTGAAAATTATTCTATGATTTTGTTGCTTAAAAAAAGTTAATAGTTAATTACTTTTAGTTTTGCATCTCTAATCACTAATAGATAATAGTTTAGTTAGAATATTTAAATATATGTGGTTATGAGTTTTTTATTGATTGCATGTAAACTTTTTATATGTGATATATGAATATGACGACATTATTTTATTTCTATATATGAAAGAAAATTTAGCAAAGTGATGCAATGATATTCAGACAGGCACATTATATCCCTACCTGTTGTTTTTGTCTTATGGATGAACAAATGAAAGATCATCTGCTTTTTTTATAATATTTGAGAATACAAACGGATATTGACTATCTAAAAGATAAAAGTTGTTTTAAAATACAAGAAACTTATATGTAGAAAACATTTTGCAAAAACCGCACCATCCATGAGCTTGGAAAGTGTGCTTGTAAGAATCCATAATCTGTAAGAGGAAAAGAACAGGGCCAATCACATGTAAATAAAAATTGCGTATGCCTTAATTATATGAGAAAATATAATTCAATGTCCAACAATATTTGGGTACACGTACTTTGTCCTTTTAGTTTATGGATGTTGATTACTTTAAGTACTGAAGGAAAAACTAACAAAGAGATCTAAT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