BGIOSGA006852

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA006852

Description

Serine/threonine protein phosphatase 2A 55 kDa

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA006852, complete gene.

LocusTag

OsI_006296

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA006852-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA006852-PA

Length

7175

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:7879747..7886921

Sequence Coding Region

7886774..7886921,7884922..7885025),complement(7884747..7884842,7883883..7884002),complement(7883308..7883514
,7883025..7883116),complement(7882641..7882759,7881712..7881835),complement(7881432..7881555
,7880807..7880875),complement(7880628..7880719,7880451..7880528),complement(7879994..7880061
,7879747..7879883

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGACCCCTTCTCCAAGTCCCCCGACGACGACGACCTCCGCCCCGAGGCGGAGGCGGCGAGGCGGCCGCAGCCGCAGCCGCAGCCGCGGGAGTGGCGGTTCGCGCAGGTCTTCGGGGAGCGCGCGGCGGGGGAGGACGTGCAGGAAGTTGACATCATCTCTGCAATTGAGTTTGACAAATCCGGTGACCATCTTGCCACTGGAGATAGAGGTGGTCGTGTAGTTTTATTTGAAAGGACTGACTCCAGGGATAGCGCCAGTCGGAGTGAACTTGAGAGACAAGATTACCCGATTGCCAGGCATCCTGAATTCCGTTACAAGACTGAATTTCAGAGTCATGAACCTGAGTTCGACTACCTAAAAAGTTTGGAAATAGAGGAGAAGATTAACAAGATCAAGTGGTGCCAAACAGCCAACAACGCCCTCTTTCTCTTATCTACAAATGATAAAACAATCAAGTATTGGAAGGTGCAAGAGAGGAAAGTAAAACGAATTTCAGTGATGAATTTGAATACCTCTCAAAGTTCAGGCAATGGCACAACTTCTAGTTCAAGCAGCAGTAGTTCTAGAGCGATTCTTCCAAATGGTGGATGCTCAGAGAAGTTATACAACTTCCCAAACAACGACCTATTATTTCCTCCTGGAGGATGCACATCATTGCGTCTGCCTGTGGTAGTCACTGGCCAAGATTTGAACCTTGTACCAAGATGCCGGCGTGTATATTCACATGCTCATGATTACCATATTAATTCCATTTCAAATAATAGTGACGGGGAGACATACATATCAGCAGATGATCTGCGAATAAATCTTTGGAACCTGGAAATTAGCAACCAAAGCTTTAATATTGTTGATGTGAAGCCTGCAAACATGGAGGACCTAACTGAGGTGATCACATGCGCGGAGTTCCACCCAACTCATTGTAATACATTAGCCTATAGTAGCTCGAAGGGCTCTATCAGGCTTATTGATCTGCGGCAATCAGCACTATGTGACAACCATGCTAAGTTATTTGAGGAGCATGAGGCACCTGGATCGAGATCCTTTTTTACAGAGATAATTGCATCGGTTTCAGATATAAAATTTGCAAGGGATGGAAGGCACATTCTTAGTCGTGATTATATGACTCTCAAGTTATGGGATATAAACATGGATTCAGGCCCAGTTGCAACTTTCCAAGTTCATGAATATTTAAGACCTAAGCTCTGTGATCTATATGAAAATGATTCAATATTTGACAAATTTGAATGTTGTCTGAGTGGGGATGGACTTCGTGTTGCAACTGGCTCTTACAGCAATTTATTTCGTGTTTTTGGTTGTACTCCTGGAAGTGCGGAGGCAACCACCTTGGAAGCAAGCAGAAATCCTATGAGGCGCCAGGTTGCTAATCCAACAAGGCCTGCACGGACCCTGACCTCATTGACCCGTGCCGTGAGGAGAGGTGGGGAAAATCCGGGAGTTGATGCTAATGGAAATTCTTACGATCTTTCAACAAAGTTGCTCCATCTTGCATGGCACCCAACTGAGAATTCCATCGCGTGTGCTGCTGCAAATAGCTTGTACATGTACTATGCATAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MDPFSKSPDDDDLRPEAEAARRPQPQPQPREWRFAQVFGERAAGEDVQEVDIISAIEFDKSGDHLATGDRGGRVVLFERTDSRDSASRSELERQDYPIARHPEFRYKTEFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIKWCQTANNALFLLSTNDKTIKYWKVQERKVKRISVMNLNTSQSSGNGTTSSSSSSSSRAILPNGGCSEKLYNFPNNDLLFPPGGCTSLRLPVVVTGQDLNLVPRCRRVYSHAHDYHINSISNNSDGETYISADDLRINLWNLEISNQSFNIVDVKPANMEDLTEVITCAEFHPTHCNTLAYSSSKGSIRLIDLRQSALCDNHAKLFEEHEAPGSRSFFTEIIASVSDIKFARDGRHILSRDYMTLKLWDINMDSGPVATFQVHEYLRPKLCDLYENDSIFDKFECCLSGDGLRVATGSYSNLFRVFGCTPGSAEATTLEASRNPMRRQVANPTRPARTLTSLTRAVRRGGENPGVDANGNSYDLSTKLLHLAWHPTENSIACAAANSLYMYYA</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..148#1897..2000#2080..2175#2920..3039#3408..3614#3806..3897#4163..4281#5087..5210#5367..5490#6047..6115#6203..6294#6394..6471#6861..6928#7039..7175#ATGGACCCCTTCTCCAAGTCCCCCGACGACGACGACCTCCGCCCCGAGGCGGAGGCGGCGAGGCGGCCGCAGCCGCAGCCGCAGCCGCGGGAGTGGCGGTTCGCGCAGGTCTTCGGGGAGCGCGCGGCGGGGGAGGACGTGCAGGAAGGTGAGAACGCGCCGACCCGCCCCCTTCCGCTGCTCGCCGCGTGCGTCGCGTGGCTCGTGAGATCTGCCTCGGTCCGGGGCGGGATGTGGGAGGGTTTCGACGCGGGGTGGCCGCGCATTCCTCCGTGTAGGGGGATTCGGATTCGAAGGGGGCGTGTGGCGGGGTGGCGAATCGAGGGGATTTCGCTGGTGATTTTGAGGTTGTTCGTTGCGTAGGGTGGAGCCGTTCGTGATCTATAGGACACGGGTTCACTGGTTAAATAAATAAATGGCTTTACCAAACTATATGCCAGGTGCGGGAATGGATCACTTCCCTGCGCTGTAGGCTTTGCTCGCTAAGACTTTGTAGCTGGTAGGTAGTTAGTGTTTGTAGGTGAACCGAGATGTTTTTGTTTGCCATTAGAGTGGGTTTGTAAGGATATGAGGAGGAAAGTGGGGGTTGGTGGATCTCCTGGACATAATGCCTCGTGCTTTACATCATGGCACTTTAGTGGGGAGTGTTGAAAGTCTGAATCTTTGTGCGATGATGTGTGGTGATTGTGTATTGCTCAAGTTTTTCTTATTCCTAGTGTCCTAGTATGATTTTGCTACAAATATATATTTATGAGCTTTGGCATGCGAAGTGGGATCACATAATTGAAAGTGATCCGCGGAGCTCCTGGGGGTAATGTTTGCGTTCTAAATGTTCTTTTAATGTGCTTATATGAGGGCTCATAAGCATGTTTCTTGTTTTCTTTCTCTACTTTCAATGTGCCATCTTCTGTTAGGCATGTGTGGATTATGTGATATATTGCTTCTTAGTTGATTTTCAATTTGTCCTGGTTCTGTGGTTAGATGTGTTGGTTTCATAACAGTTTCTCAATGAGTAGTGAGATAATTCTTATTATCTCTTCCCCTGTAACAGATTTACATATGAACTGCCTGTGTTTTGCATGCTTGTTTTTGGCCTTTGACTTGCTTACATTAGCAGCACATCTTTTTCTTGTTTCAACCATAGTGGTCCATGATTAGCTTTCCTTCAGGAATTCAGGATCTTCTACTTGTCTTCAGTTTGTAGTGTTATTCAATACACAAAATGCATTGGTACATAAGTATGATGGTGCAGTTTAGGGGAGGCAAAGTGTTACCTCTACTTATATGAATGCAGTAGCATAAAGCTGAAAATGCCTGCAAATTATATCCCTATTGGATCCAGTTCTTCTACCTGTCGCATATTTAACATGATTTCAGCACCTACTAATATTGTGCTACTCCCTCTGTCCACATTATAAGTTGTTTTGGCCTCTCCATCCCTCGTCTAGATTCACTAACATCCGTACGAATTTAGGCACATATATGAAGCACATGCATGGATCTATTCAAAACCCAAAATGTCTTATAATGTGAAACAGAGGAAGTAGCATCCTTTTTCTAAACAGAAAATGCACTCCACTGCTGCCAATCAATGATTGCACATAGTCGACAAAACTAAACAAGCAAGCTCAAATTTATCCAAACAGCAGTGATGTTTCTTATCTCTTTTTATCTTTTTTAGAGATTGCCATAGTCCTCACAAACCTTTTTAAATACTTTGTCCCAGTTTAATTAACATAAAATTGTCCGTTCTTCTCTTCAATTCAAATGTACTGATGTTTGTGGTTTTATTCATTTTGCCCGAAAGTTATGTCAAATGACTTGAGCATTGCTTTTTTCACAAGGTGGTTTTGATATCATGATATGCATCTTAATTACATGTGTTTCTTGTTTCAGTTGACATCATCTCTGCAATTGAGTTTGACAAATCCGGTGACCATCTTGCCACTGGAGATAGAGGTGGTCGTGTAGTTTTATTTGAAAGGACTGACTCCAGGGATGTAAGTACCACACACTATCTAAGTTATGTAGGTTTCTTGTTTAAATCTCTTGTTCTCATAGAAGTCAATTTATATGCAGAGCGCCAGTCGGAGTGAACTTGAGAGACAAGATTACCCGATTGCCAGGCATCCTGAATTCCGTTACAAGACTGAATTTCAGAGTCATGAACCTGAGGTATGTGAAACTTAAAATGGTTTTAATTATAGTGTCTCCCCTGGTCCATGAATCAGAGTGACATATATATCTGCCACAGTTGGACTGTATAATTTTGATAAGAATTTAAAAGTAACAAAAATATCTGATCTGAATATATGTTTTTGCCCATGTTAGATTTCTTGAAAACCTCGAGTCAAGTCAGGCACTTAAACTTGAGAGTTTATAATAAAATTTCAAGTTGGAGGAAATCACATTATATTTTGAAACATAAGCATAGGAAATTGTCAATTCTGACAGTACATACAATGGTAGGTAACAAACATACAATGGTAGGTAAAAAACATCCAGTTAGGTGTAACGTGGTAGTACCCTTCATCCATGAATATGTGCTGTTTGTAGATCCAACCTTATAAAAACAACATGATAGCGATCTTAATACATTATTGCTAAAAGTGTTTTCATGATGTTATAGCATTTTTAACTCATGCTAATATATTAATTAACAAGAAATTGATTGCCAAAGTTGTACAATGGAGACAGTATCAGAGTCTATAGCAACAGGATTGTCAAGCTTGTGCACCAATGACTGTATCAAGTCTGTAAGTGCACATAGGGGTATTAGTTATAGCAAAATTTTTCCTTTGCTTTGGTTGCAGGCTTCCAGGATTATCTTACCAAGCCATATGCACTGCATGTTAGATTGTTATTAACTATCCTGGAATTTCTCAATTTGTTTTTCTGATTTATATGTAATCCATGTAGTTCGACTACCTAAAAAGTTTGGAAATAGAGGAGAAGATTAACAAGATCAAGTGGTGCCAAACAGCCAACAACGCCCTCTTTCTCTTATCTACAAATGATAAAACAATCAAGTATTGGAAGGTACAGTTGTGTCACGAAGCTTCCATGTTCATTTCGTTTCTTATGGGTATGATCACTTGCCTACATCGGTACTAGAAGTTTGCATCCGATATTTTAGTTTGCATAATGTTTTTGCCCCATGAGGCCATGAGTTATATTTACAATAAACTTATTTCAGAGTTTCTCCTGGTATGGACAGGATATTTCTTCACAGGCTGGTTCTATCAAGGAACACATGCTTTTCGTTCTTTGATCTTTACAGATACAAATGAACCATACAATCGCTTCACAGTTTTAATTATTTGCATGCTATCTCTTTCTTTCTTTGTTTAGCTCTTATTACTTAAGCTATGTAGTATCAATACATTACAGTTTTACTATCTGTACAGGTGCAAGAGAGGAAAGTAAAACGAATTTCAGTGATGAATTTGAATACCTCTCAAAGTTCAGGCAATGGCACAACTTCTAGTTCAAGCAGCAGTAGTTCTAGAGCGATTCTTCCAAATGGTGGATGCTCAGAGAAGTTATACAACTTCCCAAACAACGACCTATTATTTCCTCCTGGAGGATGCACATCATTGCGTCTGCCTGTGGTAGTTGTACTTAACCCACTTTATTCATTATCTCATCTGTAATCGTGTTGTTCTGTACAGCACCAAATCTGGTGTTCACATGTAAAATAAGTCTCCTTTTGGCATGAATACTTATAGATAGATTTTCTTCTTATGGCAAACTGCACATATGATTACAATATATGAGTATTTATTTTCATTTACTATGTATGCAGGTCACTGGCCAAGATTTGAACCTTGTACCAAGATGCCGGCGTGTATATTCACATGCTCATGATTACCATATTAATTCCATTTCAAATAATAGGTTAGCTACCTTCCTGATATTATGGATATCTGATCAGGCTTGTAATTTTGTAATTTTGATTCTTGTTCTGTTGTTTTATTGGCTCCAAACTATTACACATTTATCTACTTTTTTCATCTGTTTATGCGTGTATCTGTGTTTCTTTACTGATTTGTGCCTTATTTCCTGTGTGAGTTCTCTGAACCTATAATACTACCTGCTTCTGTATATTTTCAAATCATGAGCATGAAGCTAATACCATGTTCTCATATTGTTTTACACCCAGTGACGGGGAGACATACATATCAGCAGATGATCTGCGAATAAATCTTTGGAACCTGGAAATTAGCAACCAAAGCTTTAATATTGTTGATGTGAAGCCTGCAAACATGGAGGACCTAACTGGTAAATTTTCCAGTGTGAGATAAGCTAGGCATGCTGTGGATTTGCCATTTGGCTTCCAGTTAGTTTTAAATGTTAAACACACGAATGCTATCTAATTGGTCACTCGGTCCAATAACAAGATGTTCCATATATTATTAGTGGAGTAAGACGCGTGGCAAAGTAACTGGAGTCCTTTTACCATGCAATTATTGGTATCCTACAACTACAAGTGTTAAATGTATGCAGGGTACTAGTTCTCTTGATATCCCTAATTACTAATTGCATTTCCCATGTGAATAACCTATTGTTGGAATGGCAACATGCATATCACTATGTATTAATTTGAAGTTTTCTCCCTATTTGGGTGGTCTGAAAATTGTCCATGCTCAACTATGGTTAAAGGTTAGATTGGGTGGGAAAGCAAATTCTTGAGGAATCATCTGTCTGCATCTATATGTTGGTATACTTGCTAGCGTCTCCTTGCGAATGTATACACTTTGTAGCTCAGTTTTGACAATCGATATCTGGCAGCTTTCATACAATACTGCAAAATAACGAATTAGAGTAGCCGTTTTT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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA006852