BGIOSGA006957

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA006957

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA006957, complete gene.

LocusTag

OJ1225_F07.5-1

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA006957-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA006957-PA

Length

8295

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:6160982..6169276

Sequence Coding Region

6168767..6169276,6167561..6167701),complement(6166473..6166862,6165704..6165808),complement(6165015..6165155
,6163625..6163828),complement(6163190..6163282,6162596..6162707),complement(6160982..6161025

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:6160982..6169276 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:6160982..6169276 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCCGACGACCCCCTCGACCCGCCGCCGGAGCCGCAGCCGCAGACGCCGCCGGCGGTAGCAGCCGCGTCCCCGTCCCCGTCCCCCCCGCCGCTCCTTCTCCGCCCCCGCCGCGAGGCCTTCGAGCACGGCCTCCTCCCCATCCCCAAGCTCATCTTCCCCGAGGGCACGCTCGCGCACACCCTCGCCCAGGTCAAGGACAAGCTCGCCTCCGCCGCGGATGGAGGAGGCCGCGTGGCCGCGGCGGCGCTCGCGGAGGCGCTGCAGATCCCGCACGAGCAGGCCGCGCTCGCGCTCGCCACGCTCGCCGCGGTGCTCCCCGCGGACGACCCCGCGCTGGACTCCGGCGGCGGGGGCGGGGCCGACCTCCGCGACGTGCTGCTCTTCCTCTACATCCAGTCGTACAAGCGCCTCGTGCCCCGCGCGCACAAGGACTCGCCCGCCGTCACCGACGTCTGGCCCTCCACCTCCGCCTTCGACGGCTACCTCTCCGCGCTCTCCCCGATCCAGCTTGTACGCAGTAATAGCCGTCGATTCATGCCTTCTCAAGCTGATGAGGAAATTCACCAGCTATCTTATCTGCAAAAGCATATGGCCAATATTCTTACTCTGTTGGCCGATTCTGTTGAGGGCGAAGGTGACGATTCTCTGGTATTGACCATGGAGACATTTGAACACCTTGGATTTCTACTGAAGTTCTCAGAAGGAACACCCTTAAGCCAGGCAGCCACTTTTTTTGCAAATTCTGATCCTGACATGCCTGCTGCCCCTGTACCTGCTGCCCAGGTTCATGATTGGATCTCACAGAATATATCTGCTTCACTGGAATTCTCTACCGAGAAGTCCATATCAAAGGAAGTTAGCCAGCAGGTTACTTCCGATATAGACGTCACAATGGCTGATGCCAATGCTAGTAATGCAAGGAACAGCACACCGACTGGTACAAATCCTGCATACTACAGAAACACAACATTTGTGGAAGGCTTCTCCAAAACTTCTGTTGTCAAGCACGCGTCTGATGTCAAAGGACATTCAGTGAAGGTTTTAAATTGCCATGAGTCTGTTATCTACATATTGGCACCATTGAAGTACGCAACTGTGTATGGATGTTCTGATGCTACTGTTGTTCTTGGTGCTATTGGTAAGGTTGTTAAGGTGGAGCATTGTGAAAGAGTTCATATTATTGCAGCTGCTAAACGGATTTGTATTGCTAACTGTCGTGAGTGCATATTCTACCTGGGAGTAAATCACCAACCTCTTATTGTGGGGGACAACCATAAATTACAAGTTGCTCCATTTAATACCTACTACCCACAATTGGGTGAACATCTGGCAAAAGTTGGTGTGGATCCTGCAATCAATAAATGGGACCAGCCTTTTGTGTTGGGAGTTGTTGATCCACACGATTCATTATCCCATCCCGCGGGGGTTTCTGATGTTCAGGCTGAATCTGCAGCTCGTCTAGATCCTGATCTATTCACAAACTTTATGATTCCTAGTTGGTTTGGGACTGAAGTGCAAGAACCTACAAAATGCTGTCCTTTTCCATTGCCTGAAATTTATTGTGCATCCCAGAGCAAAAAGCTTGCTGCACTGGAAGATATTAGGAGGACTATTCGGGAGCTGCAAATTGATGACAATAGGAAGAAGGAATTGACAAATGCCCTCCATGCACAGTTCAAAGATTGGTTATATGCTTCAGGCAACATCCGCCAGCTCTACTGCCTGCAAGGCGACTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MADDPLDPPPEPQPQTPPAVAAASPSPSPPPLLLRPRREAFEHGLLPIPKLIFPEGTLAHTLAQVKDKLASAADGGGRVAAAALAEALQIPHEQAALALATLAAVLPADDPALDSGGGGGADLRDVLLFLYIQSYKRLVPRAHKDSPAVTDVWPSTSAFDGYLSALSPIQLVRSNSRRFMPSQADEEIHQLSYLQKHMANILTLLADSVEGEGDDSLVLTMETFEHLGFLLKFSEGTPLSQAATFFANSDPDMPAAPVPAAQVHDWISQNISASLEFSTEKSISKEVSQQVTSDIDVTMADANASNARNSTPTGTNPAYYRNTTFVEGFSKTSVVKHASDVKGHSVKVLNCHESVIYILAPLKYATVYGCSDATVVLGAIGKVVKVEHCERVHIIAAAKRICIANCRECIFYLGVNHQPLIVGDNHKLQVAPFNTYYPQLGEHLAKVGVDPAINKWDQPFVLGVVDPHDSLSHPAGVSDVQAESAARLDPDLFTNFMIPSWFGTEVQEPTKCCPFPLPEIYCASQSKKLAALEDIRRTIRELQIDDNRKKELTNALHAQFKDWLYASGNIRQLYCLQGD</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..510#1576..1716#2415..2804#3469..3573#4122..4262#5449..5652#5995..6087#6570..6681#8252..8295#ATGGCCGACGACCCCCTCGACCCGCCGCCGGAGCCGCAGCCGCAGACGCCGCCGGCGGTAGCAGCCGCGTCCCCGTCCCCGTCCCCCCCGCCGCTCCTTCTCCGCCCCCGCCGCGAGGCCTTCGAGCACGGCCTCCTCCCCATCCCCAAGCTCATCTTCCCCGAGGGCACGCTCGCGCACACCCTCGCCCAGGTCAAGGACAAGCTCGCCTCCGCCGCGGATGGAGGAGGCCGCGTGGCCGCGGCGGCGCTCGCGGAGGCGCTGCAGATCCCGCACGAGCAGGCCGCGCTCGCGCTCGCCACGCTCGCCGCGGTGCTCCCCGCGGACGACCCCGCGCTGGACTCCGGCGGCGGGGGCGGGGCCGACCTCCGCGACGTGCTGCTCTTCCTCTACATCCAGTCGTACAAGCGCCTCGTGCCCCGCGCGCACAAGGACTCGCCCGCCGTCACCGACGTCTGGCCCTCCACCTCCGCCTTCGACGGCTACCTCTCCGCGCTCTCCCCGATCCAGGTCAGGGATCAAGGCCTCCCCCCCGTTGCTTTATAATTAGAATTTGGGTGCTCCCATGATTCCTCTGCAGCAGAGAACACCTTGGATGTGTGATTACTTAGCCTTAATCATGTGCCCAATTGAGCTTAGAACATCGCCGTCGATTTAAACAAGGCGGCTGTTGTGCCACCTTATATCCTTCATGTTGCAGCTGATGCTGCCGTTTATCTGCTGTCACAACAAAAATTGATATGTGATGTAACTCACTCGAGCTATAAGAAATGCGCCACAGTAAAAAGTCGTGCAGCTCTAGATATATAGTGCAAAGGAAGATCCTAGCTGCTGATACTTATTGGATGCTATGGATGGTACCGTATGCTGGGGTCACTTCTTGACTTCAATTTAAGGTTATCTTTTTTATTGGTGGCCGTCAGAAATGAATGGTTGGTTGCATCAAATTACGTATGATGGTTGGACTGGTATGCTAACAGTAAACTCAGAAGCACACAGACTTTGCCATAATTCAGCGACCAGTCATTGTTGTGACCATTTTGTTATAGATTCAGTCAATTGTATGTTTGCTTAATTCTTTCGATTTGATCTGGAACCATGCAAACCTGGTAATTTCACTATAGGCACAATATTTTACTTCCACTCTTTTAGCTCAAATTTCAAAATTTGGAGACTATGGTGCATTCAAATATGACTTACAAAATTCCCAGCTGCTAAACCTCTGTTTCGTCTATCAGCAATATTTTTAAACTGAAATCCTATGCCCTGTGCCTTTTCTGGTTTGGGTGGTAACAGTGGCTACAGAGGGTTAGTATTCATGCCTTTTTGTATAAAGTTTTTGTAAAATCAAGATTTCTCCTACTTATTCAATTTCTCGTATTTAAAGCTTTTACGCTACCAACCTCAGTTACATGTTAAAATTGTTCTAGGTGTTACATTTAGGGTCAATCCCAATTTCCCTTCCCCAAACCAACAGATCAAGCAAAAGACATAAAAACACCTTCTGTTCCTTTTGCTAATATGAGTCGTATGGTACCTCCTTCACTTACTCTTTATATTTATATTATTTCGCAGCTTGTACGCAGTAATAGCCGTCGATTCATGCCTTCTCAAGCTGATGAGGAAATTCACCAGCTATCTTATCTGCAAAAGCATATGGCCAATATTCTTACTCTGTTGGCCGATTCTGTTGAGGGCGAAGGTGACGATTCTCTGGTACGCAGCCTTTTCTTTCTTTTAAGTTTGCCGAGCTTGTTGCTATTTGTGATATCCACTTGATTACTCTTCTGTTTGACAATTTGTATTTTGTTTTCTTAGTAGAGTGAAGCTTTATGTGGGAAAAGAGTGACAGAATAATGCATAGCATGTTCTGATAATGGAGTTTATTTGTTTTTCTATATCTCAAAACACTAGAATCGACCCGTAAAAGTACATCTCCGTGTTGGATGCCTGGAACTCCAGGGCCGTGATCCTGTAAAATTATATGCAAACCTACCTCTCAGACAAGTATACCTCTAAATATATTGTGATGTATGAGTATGCTTTTGGTCAATTAGGTGTTAACTTCACTCAGAAGGTGCCCTGCAAAAAAAGAAAAAAAACGAAGACCACCCATCAGTAGATGTTTTGAGATAGCAGATTCTTTTTTAAAAACTAATATATAGACAAGCAAATATAAAGGTAGCATATATTTGACCCAGTTAGATATATCTGGCCCAAGTAAGAACTCATCTTTTTGTTAAATTTAGGATACATGTCACATTGTCACCTTACATTTGAGGGCATTTTCTGAAGGCAATTGCCTTTGTGCGTCCTATTTAGGTTTTTATTCCTTAGGATTCTTTGTGGTTGGGCTTTGGTAGACCATTACACTTCAGAATGTAAAATAACTGTATTTCACAATTTTTGTGCAGGTATTGACCATGGAGACATTTGAACACCTTGGATTTCTACTGAAGTTCTCAGAAGGAACACCCTTAAGCCAGGCAGCCACTTTTTTTGCAAATTCTGATCCTGACATGCCTGCTGCCCCTGTACCTGCTGCCCAGGTTCATGATTGGATCTCACAGAATATATCTGCTTCACTGGAATTCTCTACCGAGAAGTCCATATCAAAGGAAGTTAGCCAGCAGGTTACTTCCGATATAGACGTCACAATGGCTGATGCCAATGCTAGTAATGCAAGGAACAGCACACCGACTGGTACAAATCCTGCATACTACAGAAACACAACATTTGTGGAAGGCTTCTCCAAAACTTCTGTTGTCAAGCACGCGTCTGATGTCAAAGGACATTCAGTGAAGGTATGGATCATAGCTGCTTACCATAAACTATTTTTGGATGCTGAAAAGACTACAAAGATATGTCACTTTTCACATTTCTACATGTTTGCATTGTCCACTAAATCCCCCCCCCCCCCGGGGGGGGGGGGTGTAATGTTGATAAAAAGAACCATTTATGCGAATCTAGGTTTAAAACAGTTTCAAGTGTTTTCATATGCTTACATATCTTGAATGTAATAATTTATTCTAGTGCTACTCTTAGTACAATAAAGAATATGTTTTAATCTCTGGATTTCCAGTGGAGTATTAGTTTGAAAGGGAAAAACATTGTTAGCCACATCTGGGTGATTAAGGAGATGATGGCTTAAACTGGCATTATTTGGGCCAGGATATGTAAAATGTTAAAACCGAAGCGAAAAATTTAGATAGCTATATTTTGGGACGCGGGGAAATAGGCTGCTAAGTAGAATTGGGATGAGAAAACAAATATGACAACTGTTCTCATGATGAAGATTTTTTGCAGACTCCAGCTTCTAGCTGTTTGTGTCAGTATTATGTTTTACTCTATTTCAAGAAATTCCCACTTCTGTGTTGTATTGTGACGTAGCTGCTTTGTGTATTTAATTTTGTGATCATGGAGGTGGGACTCCACATTTTTGGTTTTCTTAACAAACAGCTTTTGTAGGTTTTAAATTGCCATGAGTCTGTTATCTACATATTGGCACCATTGAAGTACGCAACTGTGTATGGATGTTCTGATGCTACTGTTGTTCTTGGTGCTATTGGTAAGGTATGGATGCCAATCGGTATATCTTTACACCCTCCTTTCCCATTGTTGCAGAATATTGATTAATATATTCCTCATATTTTTCTAAGCAATTTAAAGAGAAAAACCCTTGTATACACATCAGTTGCCACCAGACTATTTTAGCTGCACCGGATCTGTTTGAGACTTCAATTGTGTATGCCTTGGTATCACCTGAATGGTACATGAGTGCTGAGTATTTTGTCCAAATAGAAGAGGAGGTGATGATAATAATAACAATAGACAGTGAAAGCTGTCACACATTGTTGTGTGAACCAAAAACTGACATGCTAGTTGCTACTCTTTTACAGTCTTTTCCTGGAAGATTCCTATCAAATAGATTTAATCATGCATTGAGTTGGACTGTTAAACATAATATAAGATAGGCTGTACATTAACAAAGAATAAAGGGCCCCAAGTGGAAAATAAGAAACACTTTTTTATTGTCACTTCAAATTTGCTGTTATTACCTCTGTTCTGCTAAAGTGCTAAGTACATTTGACAATTATACTTTATATGTTTTGTGTTGTCAGGTTGTTAAGGTGGAGCATTGTGAAAGAGTTCATATTATTGCAGCTGCTAAACGGATTTGTATTGCTAACTGTCGTGAGTGCATATTCTACCTGGGAGTAAATCACCAACCTCTTATTGTGGGGGACAACCATAAATTACAAGTGAGTGTCCCTTTTAATAGTGTAATTGAAGGTACACACTTGTTGCTATGAAAAGTTACTGCCAAGTGATTAATCAAACTTTATTATATAGATGATTGTACACCCTCAATAATATATTCATATCTACATGACTATCTATATGTTTACCGATTGTTAAAATAATTTATTTGTGGAGATCATAATAAAGTCAATGCTATACACCCTAACAAATCAAGAAGAGATAACTCTCAAAGAATTATTTGTTTAATGATCTTAACTATAAGGTTCACCTTCACACTTTAGAGCAAGTTTAATAGTAGAGCTAACTACTAGCCATAAGCCCATTTAAAAATAATATTAGAGGTAACATGTATAGTATATTAGCTATAAGGTTGCCTCAAATTTTCTTCCCTATCTTTCTCTCACTTATGCAATTAATGCATTTACCTTGGAGCATGTGTAAAGCTAGCTCTTGCATAAAAGCTAGCACCCATCATTTTTCTTGTTCTTTCTCCTCCACATAGCCTTATAGTTGGCTTAGAGTCCACTATGGAGCAAGTTTAGTTAGTAGGCTATAACTCAACTGTAAGCTTATGTGGAGGAGAGATAACAAGAAAAATGAGTGTTATGCAAGAGATAGCTATACACAT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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA006957