BGIOSGA006961
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA006961 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA006961, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_06215 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA006961-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA006961-PA |
| Length |
5741 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:6101852..6107592 |
| Sequence Coding Region |
6107542..6107592,6107388..6107450),complement(6107203..6107244,6106511..6106576),complement(6106356..6106421 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:6101852..6107592 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:6101852..6107592 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGTTCTTCAGGGGCCTGACCGCGGTGTCGAGGCTTCGATCCCGCGTGGCACAGGAGGCCACCACGCTTGGTGGTGTGCGATGGCTGCAGATGCAGAGCGCATCTGATCTTGATCTCAAGTCCCAGCTGCAGGAATTGATTCCTGAACAACAGGACCGCTTAAAGAAACTTAAATCGGAGCATGGAAAGGTCCAACTTGGAAATATAACAGTCGATATGGTCCTTGGTGGGATGAGAGGGATGACTGGAATGCTTTGGGAAACATCATTGCTTGACCCGGATGAGGGTATTCGTTTTAGGGGTCTCTCGATTCCAGAGTGCCAGAAAGTGCTGCCGACAGCAGTTAAAGATGGGGAGCCTTTGCCTGAGGGTCTACTTTGGCTTCTTTTGACCGGAAAGGTGCCAACCAAAGAGCAAGTTGATGCTCTATCAAAGGAATTGGCTAGTCGTTCGAGTGTTCCAGGTCATGTGTATAAGGCAATCGATGCTCTCCCTGTAACTGCTCATCCGATGACCCAGTTTACCACAGGAGTGATGGCACTTCAGGTGGAGAGTGAGTTTCAAAAAGCCTATGACAAAGGAATGTCAAAATCAAAGTTCTGGGAGCCTACCTATGAAGATTGCTTAAATTTGATAGCTCGCCTTCCAGCAGTGGCTTCATATGTTTACCGGAGGATATTCAAGGGAGGGAAAACTATAGCAGCTGATAATGCACTGGATTATGCAGCAAATTTTTCACACATGCTTGGGTTTGATGATCCCAAAATGCTTGAGTTGATGCGACTATATATAACAATCCACACTGATCATGAAGGTGGAAACGTCAGTGCTCATACTGGACATCTGGAAAATCCTGGTGTATCAGTATGGCCTTTTAATGCATTAGGAAAGGTTGGAAGTGCTCTGTCAGACCCTTATCTTTCTTTTGCAGCTGCACTGAATGGTTTAGCTGGACCGTTGCACGGCCTGGCTAATCAGGAAGTGTTGTTGTGGATCAAATCTGTAATAGGTGAGACTGGTAGTGACGTTACAACTGATCAACTCAGAGAGTATGTGTGGAAGACACTAAAAAGTGGAAAGGTTGTTCCTGGCTTTGGTCATGGAGTTCTACGTAAGACCGATCCACGGTATACATGTCAGAGGGAGTTTGCTTTGAAGTACTTGCCTGAGGATCCACTTTTCCAACTGGTCTCCAAGTTGTATGAAGTTGTGCCTCCTATCCTCACTGAGCTTGGCAAGGTCAAAAACCCATGGCCTAATGTTGATGCTCACAGCGGAGTTCTACTGAACCACTTTGGATTATCTGAAGCTCGGTATTACACTGTTCTTTTCGGAGTTTCAAGGAGCATTGGAATAGGATCTCAGCTCATTTGGGACCGTGCTCTTGGCCTGCCGCTCGAAAGACCGAAGAGTGTCACCATGGAGTGGCTGGAGAACCACTGCAAGAAGGTTGCTGCTTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAFFRGLTAVSRLRSRVAQEATTLGGVRWLQMQSASDLDLKSQLQELIPEQQDRLKKLKSEHGKVQLGNITVDMVLGGMRGMTGMLWETSLLDPDEGIRFRGLSIPECQKVLPTAVKDGEPLPEGLLWLLLTGKVPTKEQVDALSKELASRSSVPGHVYKAIDALPVTAHPMTQFTTGVMALQVESEFQKAYDKGMSKSKFWEPTYEDCLNLIARLPAVASYVYRRIFKGGKTIAADNALDYAANFSHMLGFDDPKMLELMRLYITIHTDHEGGNVSAHTGHLENPGVSVWPFNALGKVGSALSDPYLSFAAALNGLAGPLHGLANQEVLLWIKSVIGETGSDVTTDQLREYVWKTLKSGKVVPGFGHGVLRKTDPRYTCQREFALKYLPEDPLFQLVSKLYEVVPPILTELGKVKNPWPNVDAHSGVLLNHFGLSEARYYTVLFGVSRSIGIGSQLIWDRALGLPLERPKSVTMEWLENHCKKVAA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..51#143..205#349..390#1017..1082#1172..1237#1729..1842#1952..2015#2687..2769#2984..3033#3119..3196#3296..3424#3512..3554#3992..4036#4305..4391#4573..4674#4935..5042#5122..5172#5279..5352#5474..5525#5646..5741#ATGGCGTTCTTCAGGGGCCTGACCGCGGTGTCGAGGCTTCGATCCCGCGTGGTGAGCCATCCAACATCTTGCATGCCTATTTTCTGGCGATGCGTTTGCATTTATGTGCGCTGAAAAATTGTTCGTTGCTTTGTGTTGTCAGGCACAGGAGGCCACCACGCTTGGTGGTGTGCGATGGCTGCAGATGCAGAGCGCATCTGATCTTGTAAGTCAATTAGTTTTTGTTCGTTCGTGCTAAATGTGTGGTTGAAACTACCAGTTACTATGTGCCATCTGTGGCTAGGCTCGAAAGTGGGGAATGTGCTCTGAAAAAAGATGTTTGATTGTGTTTCTAAATATTATATGCAGGATCTCAAGTCCCAGCTGCAGGAATTGATTCCTGAACAACAGGTTTGTTACTTTCTAGCACGTCTAATAACTCACACAAAGTTGGAAAGTATATGGCATCCAGTTCTTTATCTACCCTTTTTGCTTTACTGCTTTAGCCTGTAGTGATATCATCTTCTTGCTTCATGCGATATTGTGTGAGGTCATGCTTGCAACTTCCAAATGTTGTGGATTATCTCTTTTTTGTAAAAGCTGTGCTGGCGCATGGAAGCAAATGCTGCATGAACATTGCATTACACCATTGTTTCAGCACCTTCAGAAACCGCTCATCACAAAATGTGTATATTTTGAGCAGCCACTAGCTTTGTGTTTTCTGCACTATTGAAAATGCATTACAAGATTGGCATATCAGGTTATTGTTTTCTTCACAAGTTTAGTTTTGCACCAAGAAGTAATCACAATATTCAGAATCTGTATCAGAGAAGACCATAATTGCAGCTAGTTGCATGCTCCTATCATTATGAGGAAGTCATCATGGTTGATATAAAATAACTTCACCATTTCAATGTTTACCTAAAATCCATATATGAGTTGCATGCCCTGTGCTTTGTCTCAACCATCCAAGAGTGCCAAATTCCTGTCAAATACCAGGAAAGAAAAGCTCAACTCACTTTACCATTCTGTTACAGGACCGCTTAAAGAAACTTAAATCGGAGCATGGAAAGGTCCAACTTGGAAATATAACAGTCGATATGGTATGCTTTTGGTATTGATTATTTATGGATTGTTTCTCAAGGGTGTCCTTTATTGATTGGTCTAAAATCTTAAATGGTGTTTATCCAAGGTCCTTGGTGGGATGAGAGGGATGACTGGAATGCTTTGGGAAACATCATTGCTTGACCCGGATGAGGTATGCTTGTAAACTATGGTGCTACGATACCATAATGGCATAATATAGAAGCAAATTTGGATATTTTGTCTATGTATATCTTGAAATTGGAATGTGCAAAAGTTGGAAAATAAAATAAATGAATGATGAATCACCATATTTTCATGATCTCCAAGCAAGTGTACTAACAGTTGAGCATGATCCGTTCAGTGCACAGTAGGAATGACACAATGATTGCTCATATTTGTCAATCTGAATCAAGTTCTGTAATCAACTTTAGCACATTGATTTAAAAGAGGTACAGGGACTAAATAGTCTAGATTTCTATAGTCATTATGTAGGAATGTGCTTCATTACAAGAGTTTGATGCTTTTATGATTTATTTTTTAGGATGGCGGCTTTTCTGCAGATTTTAAGTTAGATTTTTAGCTTAGTTTGACTTTGTGAAATTTAAACGTGCATCACTCTATATCTTGCTGTTGGATGTAAGTCTGTACCTCTTTCCTATCCAGGGTATTCGTTTTAGGGGTCTCTCGATTCCAGAGTGCCAGAAAGTGCTGCCGACAGCAGTTAAAGATGGGGAGCCTTTGCCTGAGGGTCTACTTTGGCTTCTTTTGACCGGAAAGGTTTGGCTTCTTTTGTTTAACTGTTTTTCTTGTAAACTTGGTTTTCCTGTTCTTATTTTTGTCGGCATTTAGCTGCTAGTGTGGACTGATAGGTATTTGTTTGTTTCAGGTGCCAACCAAAGAGCAAGTTGATGCTCTATCAAAGGAATTGGCTAGTCGTTCGAGTGTTCCAGGTCTGCAATTGTCTCTTCTGGTTTATTGCATTATTGTTTGCTCAATTAGTAAAAAAACCTAGATGAGTTTTATGTCATTATCTTATTTCCCTTTTCTTAGAAGATAAAAAATATAGTCACGGATACATACAGAGATTATGGAGTTTTTGTTCCTACGAAGCTTTTTTCTGCAAGTACCATAAACACACCAAGTTTCTTGTATAATGTTCCCCCAGATGGTTCTTTAGTTAGTCAATTTGAAAATAAATTGAAGCTACTGCATTATGAATTTCTGATAGTAATCTGAGCTTTTAAGGTTAAACTCTTCAATTGCCTGAAAATATGAAATGTTGTTAACTTAAGCCTATATTCTTAAGTATATTTGATTTATTATTATTATTTTTTTGCTGGGCAAGTGTAGTTGAAATTTGAAAGGCAACTGTAGAAAGTTTTTTTTTGGGACTGTTCCATGATGTTCTCTATTGACTTCAGTTTTCTTAATCCTGCCTTTGATAATGATATAGCTCATTTAAGTATTCATCTGTGATAAGTTGATTTGAGTTTTTGTATACTCAATCATTGGAAAAATATGTCTCAGGGCTGCATTACAAATTTGTGCTTCTGTAAACATACGGCATGTTACCCACTTGCCTACTTGGCACTTATTCGATTGACTTATGATACGGATGCAGGTCATGTGTATAAGGCAATCGATGCTCTCCCTGTAACTGCTCATCCGATGACCCAGTTTACCACAGGAGTGATGGCACTTCAGGTAAACCTTGTAGCATATATCACTCATCTGAAATAAATACATATTCTGTTGCCACTTATTTGAAGGTATATTTATTTTGGAGATGGTGCATGTAAAAAAGACAATCATTTAAAAAAAATCCATTGATAAAACCCTCTTATTTTGCTGTTTGTAATTCTTTCTAGGTCTCCACACTTAATTAATTTGCCTTTTCTATTTTAATTCTTATTTGCAGGTGGAGAGTGAGTTTCAAAAAGCCTATGACAAAGGAATGTCAAAATCAAAGTATGCTTGGGATTTATACTGCCTCCAAAATTGCATTAGTTGTTGAATGGATTTTCCATGTACTGACCTGGTGCTATTTTAATAGGTTCTGGGAGCCTACCTATGAAGATTGCTTAAATTTGATAGCTCGCCTTCCAGCAGTGGCTTCATATGTTTACCGGAGGTAGCTTTTTATCAATTCATTCACCATCTTTACTTACCAGGCAATCTGTAAAAATTTTCAACTGCAATAGCAATAATGCCGTTTTCTGGTTCTCTGAAGGATATTCAAGGGAGGGAAAACTATAGCAGCTGATAATGCACTGGATTATGCAGCAAATTTTTCACACATGCTTGGGTTTGATGATCCCAAAATGCTTGAGTTGATGCGACTATATATAACAATCCACACGTAATTCATTCCATCCTTGTTTTAGTTTCTATTTATTTCTAAAAGACTTGGTTTGATTTCTTTTTCCTTTCACCTGTGTTCTTCCAGTGATCATGAAGGTGGAAACGTCAGTGCTCATACTGGACATCTGGTAATTTTTGTATTTCTGGTTTCAATGCAGTTTTTTTCTTGTTAGCATTGCCACTATTGTTGTAAACCTGCCAATGGATCATTTCTGGCTGCTACATCATCCTTGTGCCTTTTTACATATGTTACACTTTTGGCATGCACTATTGCACTGGATGCCACTTTAAGCCTTTGATTTGCTTTGCTGTTATTACTATGTATCGGAGATATATTAATAAGCACTGATAAACCAAACTAGCCATTTTAAGGAATATGAACTAGGAACAAAACTAAAACTTAAACTGCTTTTAGCTGAGTTCTTCATTACTTTAACTGTTATCTTGAAGGATCATCTGCTTAGTACTCATGGAGTCATTAGTCTTACATTTTATTGTCTAATAGCATCAAAGCTATGACTGAAAATATGTATCTATTTCTGCTAGATAGCTATTGTATGTCTAGGAAAATCCTGGTGTATCAGTATGGCCTTTTAATGCATTAGGAAAGGTAATATAATTGGTTGCGCTGTGATCCTTGATCCAGTTAGCTGAATCTCTATCTTCAAGGTAGAAGTGGTAATGATAGTACAAGGTAGCCTCTTAATTTGCCGCAGAAAACCTTGCAATCCGTTATCTTTAGGATTTATCACTTATGATCTATGACTTATTTTCTTTTGTTGGCAATTGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATGACTCATCTATGGGCACTGACCTCTTCATTCCGTGCTCATGATATTCAATTACAGGTTGGAAGTGCTCTGTCAGACCCTTATCTTTCTTTTGCAGCTGCACTGAATGGTTTAGCTGGACCGTTGCACGGCCTGGCTAATCAGGTATGCTCAGTTTGTTGTACTGGATCTTCTCTGCCACATCCTGCTAAACAAGGATTCACTGCATTGCATACTCAAAATATGTCGCAGATTATCTTTGGAAGAAGGAACTAATGTCCTTCCATTTTTAAATTGATATTTTAGTGTGTGTGTGTGAACTAACCATAGTTCACATCCAATGCAGGAAGTGTTGTTGTGGATCAAATCTGTAATAGGTGAGACTGGTAGTGACGTTACAACTGATCAACTCAGAGAGTATGTGTGGAAGACACTAAAAAGTGGAAAGGTAGCTTATCTCCGTGTTATATTTCTATTTGATGAGGAAGTGCATATCATCATGTTTTAACTGAAATGAAAACTCAACTTTCTGAGAGTTCATTGCTAAGC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|
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