BGIOSGA007040

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA007040

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA007040, complete gene.

LocusTag

OsI_06067

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA007040-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA007040-PA

Length

6818

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:4875660..4882477

Sequence Coding Region

4882342..4882477,4881362..4881491),complement(4881213..4881281,4880950..4881015),complement(4880795..4880866
,4880646..4880717),complement(4880402..4880473,4880260..4880325),complement(4879601..4879666
,4879040..4879446),complement(4878895..4878951,4878755..4878792),complement(4878410..4878496
,4878058..4878326),complement(4877814..4877952,4876447..4876586),complement(4876168..4876324
,4875660..4875746

Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:4875660..4882477 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGCGGATGGCAGCGGGAGGGAGGTGCTGCTTCCGGAGAGGGGCTCCCGCGGCGGTGCTCGTGCTGCCGCTGCTGCTGCTGATCGCCGCGGCGGCATTGCCCCGGCGGGCGCTCGCGGCCACCGTCGCCGCCGATGTTGCTGCTATAAATGGACTGTATGTTGCACTTGGATCACCGGCTCTTCCTAAATGGACTGCGAATGGTGGTGACCCCTGTGGTGATGGTTGGCAGGGCGTTGTATGTATTGGCTCAAATATAGATTCAATAATTTTCAATGCTGCAAATTTGGAAGGACAGTTAGGCAGCCTGGGGAACTTCACTTCAATAACCACTATAAATCTTAGCAACAACAATATTGGTGGAACTATACCAGAAGATCTACCTGTTACACTGCAGCATTTTTTTATGTCTGATAACCAGCTCACTGGAAGCATTCCGACGTCACTATCAATGCTTCAGAGTTTAACAGACATGTCTCTAAATGATAATCATCTCGACGGGAAACTGCCAGATGCTTTTGGTTCCCTTACTGGCCTTGTAAATTTTGATATTTCATCCAATAACTTCAGTGGTTCATTACCACCTTCTCTGGGAAGCCTGTCATCATTGACTACATTGCACATGCAAGACAACCAACTATCCGGAACCCTTGATGTCTTGCAGGATCTCCCCCTCAAAGATTTAAATATAGAGAATAATTTGTTTTCTGGACCGGTTCCTCCAAAGTTGCTGAATGTGCCAAACTTCAAAAAGGATGGGAACCCATTTAATACCAGCATAGCTCCTTCTGCATCACCCTCTTCAACACCTACAGGCTCTACACCAACACAAACACCATCGTCACCTTCATCTTCTGGAACTCCTTCGCCATCTAGTTCGCCCTCTAATTCTTCTGGTGGATCTACTGCTCGAGACAGCAGCTCTCCATCATCTAGGAAACATAAGTCTTCAACCCTCAGGATTGTTGGATATGTTCTTCTAGCTATTGTCCTGTTTATAGTTACAGTGCTGCTGGTAATATTTTGCCTGTCCAAGTACCAAGAGAGACAGTCAAGACGTGATTATACAACAAGTCAGGTGGGGAGGGTTCATCAGAGGGTTGAAGAGCCGAAAGTTAAGCAAGCTTCAGTGCAGTCAAGGAATGATGCCAAAAAAGGATCAACAGAGGTTCCTGAACGGAGGCAGGTTCGTGAAATAAATTTGGCGGTACCAGCTGCTCTCGAGAAGCCTCCTGAAAAGAGAAAAGAACATCAATATACAAATAGTTTTGAAGAGGGAAATTTGATAAGAGAGAGTAGGTTGGGAAAAGTATATCTGGCAGAACTTCCTGAAGGCAGGTTCTTGGAAGTTATGAAGATTGATAACGCCAATGATAGAATACCGGTAGATGAATTTCTAGAACTGGTTGCAAGTGTATCAGATATTAGGCATCCCAACATCCTCGAGCTTGTTGGATACTGTGCAGAATATGGTCAGAGGTTACTTGTTTATAATCATTTCAGTAGAAAAACACTGCATGATGTACTACATGAAGGGGAGGAATTGGATGGTGCACTATCATGGAATGCTCGCCTCCAAGTTGCTCTTGGTGCAGCAAAGGCCTTAGACTATCTACATGAGAGCTGTGAACCTCCAGTAGTGCACCAGAATTTTGAGCCAGCCAATGTGCTCCTTGGTAATGGATTCTCAGTACGTGTCGCTGAATGTGGACTGGCAGAATTGACGCTGTCAGGTTCTGTTACACAGTTGTCAGGTCGCATGAGGGCACTGCTGAATTATGAAGCTCCTGAAATCCATGAAGCTGGGACTTTTACCTACCGAAGTGATGTTTACAGTTTTGGCGTGGTAATGCTAGAACTTCTCACTGGCCGTAAACCATATGACAGTTCTCGTCCTCGTGCTGAACAACATCTTGTTAGATGGGCTGATTCTCAATTTCATGACATTGAGTCCATATCAAAGATGGTTGATCCTTCTATTCAAGGAGAGTGTTCTGAGAAAGTACTGTCACGTTTTGCAGACATCATCAGCCGTTGTATTCGGCCGGAACCAGAATTCAGACCATCAATGTCAGAGATTGTCCAAGACCTAGCTAGGATTATAAGTGTTACCAGTGAGGAATCAGAGTAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MRMAAGGRCCFRRGAPAAVLVLPLLLLIAAAALPRRALAATVAADVAAINGLYVALGSPALPKWTANGGDPCGDGWQGVVCIGSNIDSIIFNAANLEGQLGSLGNFTSITTINLSNNNIGGTIPEDLPVTLQHFFMSDNQLTGSIPTSLSMLQSLTDMSLNDNHLDGKLPDAFGSLTGLVNFDISSNNFSGSLPPSLGSLSSLTTLHMQDNQLSGTLDVLQDLPLKDLNIENNLFSGPVPPKLLNVPNFKKDGNPFNTSIAPSASPSSTPTGSTPTQTPSSPSSSGTPSPSSSPSNSSGGSTARDSSSPSSRKHKSSTLRIVGYVLLAIVLFIVTVLLVIFCLSKYQERQSRRDYTTSQVGRVHQRVEEPKVKQASVQSRNDAKKGSTEVPERRQVREINLAVPAALEKPPEKRKEHQYTNSFEEGNLIRESRLGKVYLAELPEGRFLEVMKIDNANDRIPVDEFLELVASVSDIRHPNILELVGYCAEYGQRLLVYNHFSRKTLHDVLHEGEELDGALSWNARLQVALGAAKALDYLHESCEPPVVHQNFEPANVLLGNGFSVRVAECGLAELTLSGSVTQLSGRMRALLNYEAPEIHEAGTFTYRSDVYSFGVVMLELLTGRKPYDSSRPRAEQHLVRWADSQFHDIESISKMVDPSIQGECSEKVLSRFADIISRCIRPEPEFRPSMSEIVQDLARIISVTSEESE</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..136#987..1116#1197..1265#1463..1528#1612..1683#1761..1832#2005..2076#2153..2218#2812..2877#3032..3438#3527..3583#3686..3723#3982..4068#4152..4420#4526..4664#5892..6031#6154..6310#6732..6818#ATGCGGATGGCAGCGGGAGGGAGGTGCTGCTTCCGGAGAGGGGCTCCCGCGGCGGTGCTCGTGCTGCCGCTGCTGCTGCTGATCGCCGCGGCGGCATTGCCCCGGCGGGCGCTCGCGGCCACCGTCGCCGCCGATGGTAAGTGCTCCGCGCTCGCGCTTCGTGCTTGGATGCTTTGCTCGTACGTGTTGCACTAGCTTTTGGTTGGTGGCCGTTGGTCGTTGCACTGTTTGCGGAGGCGATGATTCGAGCTAAGTACTGTTCGGGGTGAACATGGGATTTGTCGGTGGAAGCGAGGTCAAGGTGGGGATTGATTTCGATGCAGTGCTGTACTGTGCACTAGAGATTGGGCGGGTGGTGAGAAACGTGTGGGGGGTTTAGGTTGGGTCGATCGATTCAATTTGATTGTGCGGATTGGCAGGGGATATCTTGCGGTACTTCTTCTTCTGGACTTGATGCGGCGGTTGAATTTTCGTGTGCTTTTGCTTGTGGAAGCAAATGAAGTGGTTAAATGCTGCAATCGAGCTGCTATTTTCGGTCTGAAGGGATGTTTTAGGATTGTTATGTGAACTGTTCTCTTTGGATTAGTAATCGTCATTATTGACGACAATGGTTGATGGATAAAGTGATGGATGATTTAGTTAGGCTAGTTGTGGTAGAATGAGAAATGGTCTTATTATTACTCTCGCTTACATGAATCTTTAATTAAAAAGTTCCTTTCAAACTGTTTGCATAAAAAGGGGTCTTAGTTGTAAAAAGTCGGCTGAAGGTGATATGATGACTAATTTCCACTCTCACCCTTGGTTTTTGGTGAAATGCTGGGTTCTGTTTTACCTGAATTAACTGGCCCATTTGCACACTCTGCACTCTACTTACTATGTAGGTTCATTTCATTAAGTACCTTAAAATGGTGTTGATTTGGTGTGAATCCATGTCAGGGATAATTATGTTTGTTACTAATGACTGTTTTTGCTTGATTTATGGGCAGTTGCTGCTATAAATGGACTGTATGTTGCACTTGGATCACCGGCTCTTCCTAAATGGACTGCGAATGGTGGTGACCCCTGTGGTGATGGTTGGCAGGGCGTTGTATGTATTGGCTCAAATATAGATTCAATGTACGTCCATTGTACATTTGCATTTCCTTTATCTGGTCGAGTGTTTATATTTTGTGCTTTTATCAACTCATTGTTTGTAGAATTTTCAATGCTGCAAATTTGGAAGGACAGTTAGGCAGCCTGGGGAACTTCACTTCAATAACCACTATGTAAGAGTATTACTGTTAATTTTATTCTCTTTGCCCATGATTGATCCTTGATCGTCATGTCATCTAATTATACATGCATAGTAATTAATAGATCAATAGGAAATTCAAAGTCTGTACTTATATATTGGCAGAAGTTATGTTGTTTTCGTATGTATCCTGGTCAGGTTTTGTGACTATTTACTTTTCTTTCATTGTAGAAATCTTAGCAACAACAATATTGGTGGAACTATACCAGAAGATCTACCTGTTACACTGCAGCATTTGTATGTGCTATTCTTCCTCTTCTGGAATTTTTTTAGCTCTTGTGATTGAGTGATGAGATGCCTTATGTTCCTTGCTGGTGCAGTTTTATGTCTGATAACCAGCTCACTGGAAGCATTCCGACGTCACTATCAATGCTTCAGAGTTTAACAGACATGTATGACTATTGTCCTATTTCTGTTCCTAAGCAGAGAGGTTGCTGTACTATTTTTTTTCTGATCTGTCTTTTTGTAGGTCTCTAAATGATAATCATCTCGACGGGAAACTGCCAGATGCTTTTGGTTCCCTTACTGGCCTTGTAAATTTGTAAGATACCTCATTTTCCTCTCCTTTTCATTTTGCTTATTCTTACTCTTCATGTGCACTTGCTCATGCACCTGAGAGTATATCATATCTTCATTTTCCCCAAGACCCGAGAGGGTTGGCAGGCAAGGGGTGAACTGTTAACTCGTTCATAACATCTAGCATTTGACCACAGTGATATTTCATCCAATAACTTCAGTGGTTCATTACCACCTTCTCTGGGAAGCCTGTCATCATTGACTACATTGTAAGTCTACAAGTATTTTCTTATATAGTTTTTTCCCTATCATTTTTACTTATTTTCATGCCTTGTTATTTTACAGGCACATGCAAGACAACCAACTATCCGGAACCCTTGATGTCTTGCAGGATCTCCCCCTCAAAGATTTGTATTCCCACACTCTCTATTCTGTCATCATATTACTGATTCACTTTTATTAGTACACCATTATGTATAAATTGGACAATCAGCAATTGTATTCTCAGTTATGTGTTGATTTATAAAATTGATCTGCTTAACAGACATTTTCTTCTGGTCTACTTTAGAGATGTCATAGTATAAATTATGATTATCCTGCACTTTGTCATTATTTTGAAGTAACATGCAACAATATGTTAGCAGACACAAAGTTCTCTATTATTCAACAGTCACATTGAATTTGATAAGGTTGTAGAAACTTGACATCCTTTCACAAAGTACATGGCAGTCATACATTTGTTTGCAGAAGTATAATGTACCATGTAGTCATGACCAGAACCGGGACTTTTAGGTTTTAACAAAGCTGTACTAGTTAGAAAAAAGAACAGGTGATGTAAGTGATTTAGCTTTTATCTTATCATAGACATTCACAAGTCAAACAGTAATTTAAATCCAATTTGTTATGTATGTCTAATCCAGATCATCCTTTTTCTTAGAATGCTGTTATGCATACAAATATGAAATATCTACACTTGTTTCTGATAATATATTTACCTGAAACAGAAATATAGAGAATAATTTGTTTTCTGGACCGGTTCCTCCAAAGTTGCTGAATGTGCCAAACTTCAAGTGAGAATCCTTTTTCTTACATATTTCAAATTTATTGATGCAATTCACATAGTACTTGGTATTCCTACATAAAAATTCTCTCTACTATATACTTTTGCCATATGTAATTATATGTAAGGTAACTTATTGAGTAATTCATTGTTTTTGTCTACAGAAAGGATGGGAACCCATTTAATACCAGCATAGCTCCTTCTGCATCACCCTCTTCAACACCTACAGGCTCTACACCAACACAAACACCATCGTCACCTTCATCTTCTGGAACTCCTTCGCCATCTAGTTCGCCCTCTAATTCTTCTGGTGGATCTACTGCTCGAGACAGCAGCTCTCCATCATCTAGGAAACATAAGTCTTCAACCCTCAGGATTGTTGGATATGTTCTTCTAGCTATTGTCCTGTTTATAGTTACAGTGCTGCTGGTAATATTTTGCCTGTCCAAGTACCAAGAGAGACAGTCAAGACGTGATTATACAACAAGTCAGGTGGGGAGGGTTCATCAGAGGGTTGAAGAGCCGAAAGTTAAGCAAGCTTCAGTGCAGTCAAGGAATGATGCCAAAAAAGGTCAACAATTAATTTATATATTCTGTAATATATTTCTGATTATATTTTATTTGTTTTATATCACAGCATATTGATGTTCTATTAACAGGATCAACAGAGGTTCCTGAACGGAGGCAGGTTCGTGAAATAAATTTGGCGGTACCAGGTATAGATGCTTGTAAATCTGATCTATCAGGTCTTTTAGTACTGTAATACTATTCACATTTTTAAGTTCAGATGTATAAAATAACTATTCAATTGCTGGCAGCTGCTCTCGAGAAGCCTCCTGAAAAGAGAAAAGAACATGTAATTAACTTGCAGCGATCAGAAACAGAAATTTTTGCTTCTACACCTCCGCCGCCGCCGCCTCCACCACCACCACCTCCTCCTCCTCCTCCGACACCACCACCGCCACCGCCGCGGCCGCCGCCGCCGCCGCCACCACCACCACCTGTTGAAAAAGTGATTGTAAATCCCATTGTTAAGCCAGAGAAAAGAGTTAGTACTCCACCTAGGACAGGTCCCTCGACATCTGCAACATCCTTTTCTGTTGCATCACTTCAGCAATATACAAATAGTTTTGAAGAGGGAAATTTGATAAGAGAGAGTAGGTTGGGAAAAGTATATCTGGCAGAACTTCCTGAAGGCAGGGTATGTTTACAAAATACTGCTTCATTTAAATGGAATTTTATGATTATTGAAATGCTATACTAATCTTCCTTTATCCTATGCAGTTCTTGGAAGTTATGAAGATTGATAACGCCAATGATAGAATACCGGTAGATGAATTTCTAGAACTGGTTGCAAGTGTATCAGATATTAGGCATCCCAACATCCTCGAGCTTGTTGGATACTGTGCAGAATATGGTCAGAGGTTACTTGTTTATAATCATTTCAGTAGAAAAACACTGCATGATGTACTACATGAAGGGGAGGAATTGGATGGTGCACTATCATGGAATGCTCGCCTCCAAGTTGCTCTTGGTGCAGCAAAGGCCTTAGAGTAAGTTACCAAGCTGTATCGCGGTTCAATATAATTACCATGAACTTGTGCTTATTTAATTTAGTTTTTCATGGGGTAGCTTTTGTACTTATATTCTTCTTTCAGCTATCTACATGAGAGCTGTGAACCTCCAGTAGTGCACCAGAATTTTGAGCCAGCCAATGTGCTCCTTGGTAATGGATTCTCAGTACGTGTCGCTGAATGTGGACTGGCAGAATTGACGCTGTCAGGTTCTGTTACACAGGTAACATCTAGTGTTGTACACCAACCTTGTGGTTGTGATACTTCGGCTTTTCCGTCGCAAGCAGTTCTGATACATTTCCTAAAATTCCTGAAGTCCAATTAAGAAGAGTAAATTTCAGAAAACTACATA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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA007040