BGIOSGA007840
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA007840 |
|---|---|
| Description |
Citrate synthase |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA007840, complete gene. |
| LocusTag |
OS02G0232400 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA007840-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA007840-PA |
| Length |
6059 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:8424151..8430209 |
| Sequence Coding Region |
8424151..8424363,8425040..8425220,8425297..8425382,8425488..8425592,8425762..8425824 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:8424151..8430209 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:8424151..8430209 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGATCGCGCCCGCCTCGCCGTGCTCTCCGCCCACCTCGCCTCCCCCGCCGCCGCCTGCGGGGAGGCGGACGCGGCGGGGCCGCTGGAGAGGTCGGCGGCGTCTGCGGGGGCGCGAGGCGGCGCGCTGGCGGTGGTGGATGGGAGGACGGGGAAGAGGTACGAGGTCAAGGTGTCGGACGAGGGGACCGTGCGCGCCACCGACTTCAAGAAGATTACCACTGGAAAGGACGACAAGGGTCTTAAGATCTATGATCCTGGTTATCTCAACACAGCCCCAGTTCGCTCATCCATCTGCTACATTGATGGGGATGAGGGAATTCTTCGTTACAGGGGATACCCAATTGAAGAGTTGGCTGAAAGCAGCTCATTTGTTGAGGTGGCCTACCTCCTGATGTACGGAAGTTTGCCTACCCAGAGCCAATTGGCTGGATGGGAATTTGCGATTTCTCAGCACTCTGCTGTTCCCCAGGGACTCTTGGATATCATACAAGCAATGCCTCATGACGCTCATCCCATGGGTGTCCTTGCCAGTGCAATGAGCACGCTTTCTGTCTTCCATCCGGATGCAAACCCTGCTCTTAGAGGTCAAGATCTTTACAAGTCGAAGCAGGTTAGGGATAAGCAGATTGTGCGAGTACTTGGGAAGGCACCAACAATTGCAGCTGCAGCGTACTTGAGATTAGCTGGAAGACCTCCTATCCTTCCTACAAATAGTCTCTCTTATTCAGAGAACTTCTTGTATATGCTAGACTCTTTGGGTGACAAAGAATACAAGCCAAATCCTAGACTTGCTAGGGTTCTAGATATCCTTTTTATTCTCCATGCTGAACATGAAATGAACTGCTCTACAGCTGCTGCTAGGCACCTTGCTTCAAGTGGTGTTGATGTCTTCACTGCTCTTTCTGGTGCTGTTGGAGCTCTATATGGTCCACTGCATGGTGGTGCAAATGAGGCGGTACTTAAAATGTTAAATGAGATTGGAAGTGTGGAGAATATTCCAGATTTCATCGAGGGAGTGAAAAACAGGAAGAGAAAGATGTCAGGTTTTGGGCACCGTGTTTACAAGAATTATGATCCCCGTGCTAAAGTCATCCGAAAGCTAGCAGAGGAGGTCTTCTCTATTGTTGGACGGGATCCTCTTATCGAGGTTGCTGTTGCGTTGGAGAAGGCAGCATTGTCAGATGATTATTTTGTCAAGAGGAAGCTGTATCCAAATGTGGATTTTTACTCTGGCTTAATATATAGGGCAATGGGATTCCCTACAGAGTTCTTCCCTGTTCTGTTTGCAATTCCTCGCATGGCTGGTTGGTTAGCACATTGGAAAGAGTCACTTGATGATCCAGACACTAAGATTATGAGGCCTCAGCAGGTATACACTGGTGTTTGGCTGAGGCATTACACACCTGTCAGAGAACGAGTCCCAGCAAGCCAGGGCGAACAGCTTGGTCAGATTGCTACCTCTAACGCAACAAGGCGTCGGCGTGCAGGTTCTGCCCTGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDRARLAVLSAHLASPAAACGEADAAGPLERSAASAGARGGALAVVDGRTGKRYEVKVSDEGTVRATDFKKITTGKDDKGLKIYDPGYLNTAPVRSSICYIDGDEGILRYRGYPIEELAESSSFVEVAYLLMYGSLPTQSQLAGWEFAISQHSAVPQGLLDIIQAMPHDAHPMGVLASAMSTLSVFHPDANPALRGQDLYKSKQVRDKQIVRVLGKAPTIAAAAYLRLAGRPPILPTNSLSYSENFLYMLDSLGDKEYKPNPRLARVLDILFILHAEHEMNCSTAAARHLASSGVDVFTALSGAVGALYGPLHGGANEAVLKMLNEIGSVENIPDFIEGVKNRKRKMSGFGHRVYKNYDPRAKVIRKLAEEVFSIVGRDPLIEVAVALEKAALSDDYFVKRKLYPNVDFYSGLIYRAMGFPTEFFPVLFAIPRMAGWLAHWKESLDDPDTKIMRPQQVYTGVWLRHYTPVRERVPASQGEQLGQIATSNATRRRRAGSAL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..213#890..1070#1147..1232#1338..1442#1612..1674#1957..2066#2197..2316#2386..2461#2808..2881#3028..3148#5114..5211#5290..5413#5928..6059#ATGGATCGCGCCCGCCTCGCCGTGCTCTCCGCCCACCTCGCCTCCCCCGCCGCCGCCTGCGGGGAGGCGGACGCGGCGGGGCCGCTGGAGAGGTCGGCGGCGTCTGCGGGGGCGCGAGGCGGCGCGCTGGCGGTGGTGGATGGGAGGACGGGGAAGAGGTACGAGGTCAAGGTGTCGGACGAGGGGACCGTGCGCGCCACCGACTTCAAGAAGGTAGGAGCGCTACGCTTACTGCTGGCTTCTTCGTTGCCGTGATCCGCGCCGTGATCCGCGCCGGGTTATGTGGGGGTGTTGCGGGATTTCGGGATGCGGGTTTTGGTTGGTGGATCAAGCTGGATTTCTGTGGAATCGGCTTGGATTAGGGGATTGCGATCTTGGTTGTGCTCAATTTTCGTCTGCTGCTAGTGATTGGGTGACAAAACCGATGTGTAAATTTCGCCCAATCGCCACCCCCCTTTGGACAAATCTTCTCCCTGGAGATGTCAGAAAGTCGAAACTAGCATGATTATTGAGTTTAGTTCCTCATTATAGTGTCTGTATGGATGTAGGTGTGGCGATTTCTAATTGTTATCCTGGTTGACTTCGATGAGGTCGCAGCTTACCCGTTTGTTCACAATGAAGTTATCCTAAATCTTCTAGTGCTTGCATGTGACTTCATAGTTGTAGTAAATTGTTCTGCTTGATTGGCAGGTACTTCTTGCGAACAAACTAGAATGCAACTACCGAATTATTAGATAACTATGCAAATGTTACTTCACTACCTTTTGGTTTAGGACTAAAATTTCAAGAGAATGTGTGGACAGCTCAAGCTCTGTGCATATTATGATGCCTTTGCTATATGAGATCATCCCAGAGTTAAATAGGATTTTTTTTGGGTTAATTGTTGCAGATTACCACTGGAAAGGACGACAAGGGTCTTAAGATCTATGATCCTGGTTATCTCAACACAGCCCCAGTTCGCTCATCCATCTGCTACATTGATGGGGATGAGGGAATTCTTCGTTACAGGGGATACCCAATTGAAGAGTTGGCTGAAAGCAGCTCATTTGTTGAGGTGGCCTACCTCCTGAGTAAGTGTTCTGCACCTTTATTTCCTCTTTAATGCAAATGTAGTTTTTGTTGTTGAAAACATGTTTGCTCTTGCAGTGTACGGAAGTTTGCCTACCCAGAGCCAATTGGCTGGATGGGAATTTGCGATTTCTCAGCACTCTGCTGTTCCCCAGGGACTCTTGGTATGTTTTGCCATCTTATTGTGTATCATTGCAGTATATATGGACAGCTTTTCTGTTTAATTTGTACTAATAACTAATAGGTTGGTGTTCTTTTAATGTTGACAGGATATCATACAAGCAATGCCTCATGACGCTCATCCCATGGGTGTCCTTGCCAGTGCAATGAGCACGCTTTCTGTCTTCCATCCGGATGCAAACCCTGCTCTTAGAGTAAGCACTCTCTAAATGCACTAATTGAGCTAGTTGTTTCTTCACATGATTTTACTTAACATGATAGAATCAGCCAAAAATTGGATTTTTTAATATCTGAATTATGTATGCACCATCTGTTATGTGTAATAGTTTGCTGTTGTTAATGACATATATTGTACTCGTGTAGGGTCAAGATCTTTACAAGTCGAAGCAGGTTAGGGATAAGCAGATTGTGCGAGTACTTGGGAAGGTATGACTTAAGAAATCCGATTATTCTTGTACTAGTGAAGTTAATCGAGGATAATTTCCCAGTTAAATGATACACCCTCTTTCTTGAATTAGTGAAGTGATAAAATAGCCAGAGATATTCTATGGAAGGTCATGATGCATATCACAATGATGTTTCTCTTTTAGATTTATATAATGTTATTTTTCCGGAAACAAGCACTGCCGGGCAAAGCCCAGCAGTTAGCTTTATATATGTTTGGTTTTACTAATAATTGATGCAATATTAACTTGATTTTCTGTATAGGCACCAACAATTGCAGCTGCAGCGTACTTGAGATTAGCTGGAAGACCTCCTATCCTTCCTACAAATAGTCTCTCTTATTCAGAGAACTTCTTGTATATGCTAGACTCTTTGTAAGTCACATCACTTTGGAATTATTTGTATTCTGTTCTCTCATGTGCTCTTTCATTTTTCTTTTGTTAGAAATCAATAAGCAATTCAATTTTGTGATTGACTTCATTTTCCTTTTCGACTGTGATGCAGGGGTGACAAAGAATACAAGCCAAATCCTAGACTTGCTAGGGTTCTAGATATCCTTTTTATTCTCCATGCTGAACATGAAATGAACTGCTCTACAGCTGCTGCTAGGCACCTTGCTTCAAGGTAGATAATGCCATTCATTCTAAGAATTGGGAGTCTGATCTTGCCTGATTATTTATCCTGTGTTTACAGTGGTGTTGATGTCTTCACTGCTCTTTCTGGTGCTGTTGGAGCTCTATATGGTCCACTGCATGGTGGTGCAAATGAGGTAAACAATGCTGAGCAATGAGCAGTTGTCACTTTTGTTTCTTGCATTGGACTGCTAATAGTTTATATACACATTCATCATCAGAATCTAAGGATCAAGCTCACAAGTAACAAAGACATACAGTCTATGTACTCTATAAATTTGTTCTGTTAACAATGTAAATAAGTCACCTCCTTGATAGAGAGGTTTTTATTTTCTTGGATTTTTTTTATATAATTGAAAATTTAGTTCTAAAACCTTTGTTTCGCTTTAACCTTGACTCTACATCTGTTATTTTTAGAAGTAATTAAGGCATTACTCAATTATTATGATGCAGAAGCACTAATGCCATTTTCTAACATGCCAGGCGGTACTTAAAATGTTAAATGAGATTGGAAGTGTGGAGAATATTCCAGATTTCATCGAGGGAGTGAAAAACAGGTAATATATAACTCCTGTCCTGATTTATATTTTCTGATCTGAAATGTAATCATGGAGGTCTTTTTTAGTTTAATAAAGTTTAAGCTTTTACCTTTTTAAATCTATATGTTTGGACTTGTTTTTATGAGATCTGTTTTGTTCTTTAGGAAGAGAAAGATGTCAGGTTTTGGGCACCGTGTTTACAAGAATTATGATCCCCGTGCTAAAGTCATCCGAAAGCTAGCAGAGGAGGTCTTCTCTATTGTTGGACGGGATCCTCTTATCGAGGTTAGTTATGCTGAATTTCTTTATTCAAGAAGTCCAGTTTATGATGACTGTATGTATGTAACCTTCATTCAGTTAGTGAAATATTTGGTTAATGTTTCACATTGCAATCAACACCCAAGAAACAGATTTTGTCAGGCACTATAGGATGCTAAATGACATGTACTTGGGAACATGAAGCATTCATTTCTAAACAGTAGGTCTACATTTTATTTGCAATGAATGAATATGGACTTTGCACAACACATTGAGATGGATGGAATACTTCTGATTAGTTTCTTTCTTGATCTGATCAATGTTGAATAAACACAAACAGATTTATTAGTCTTTTACTGTTCGCAATCCTTTTCCTGTAACTAGAATATAAGCGCGTCTGTTGACACGCTCGTTATTTTGTACCTGTGCATATTATATAAAGTGCATTTAGATTGAACAACTATTTTATAAATAATAAATTCAATTCCCTTAAAATCTCATAAAAATATAGGAAATAATATACGCTTGTGTGAAAAAAGTAATTACATTCATCAAACAGGATAAAATATACACTTCGATTTTTCTTAAAACACATGTTTTTTAAAATATACGCTTCATTTTTTTTCTTAAAAACACATTTTTTTTAGAATATGAGTTTCATAAATTAAAATGTTTCTTGTTTATATGCACTCTTAAATCATTGTTGTTTCTATTTTTTCTACCATGTAGCAAATTGATAGTAATGACGGCGATGGTGGTGGTTCTGTCACCACCTTACCAACTGACATGTGGGGACCATAGGTCCATGGGAGGAAATGGACACAACATATACTTTTAACCTTGTTTAAACAAAACAGTGGACATGATTTAGACCATAATGTTTTTTATAACATGTCTAATTGACTTATTAAGCATGAAAAATAAATAAATAAATAATATCTTTAAAGACTCCTATATCTATATTGTTTGTGGTTCTAAAACCAATGCTACAAAATAATCACTACAAAAAATAACTTAAAATTTAAATTTTGTTATTTCTTATAATTAATAGGCAGATGATGTTGGGTAAAAAGTTGAAAAATATTTTTATAATTGCTAAGAAAATCCGTTACAACGCACAGGCCCTTGGCTAGATATTTAAAAATCTCCTTGAACGAAACTGGCTACGCTAATAATCGTTCAGAATGATTAATTTAAACCTAAATTCATGGTTCTGTATTAAAAAATAACAACTAGCCTTTTTAGATGCCATTAATCGTCATGCTTCACATATTTCAAAGAGCAATCATTTTTATTCAGGAGTCTGTAAAATTAAAAAGACAATCAAGATATTTATTGACAGATGTATTATTTTTAACCATTCAGAAAAAACTTTTTTAATGCTATTCTTGTCCTTCAGAATTTTGTATATCAATCATATGCCGATACATATGAAACATTGATTGTTGCTTTCAGTCAGTTTCTTCATCCACATGTACTTTGCAGATTTACTACTGTTATCGCAGAAAGCCTTTGATATTTAATACTGCAAAGCTCAAATAAACATGAGGTTAACAAGCTATATTGGCAAAACATTAAGCACCTGTTCCGTGTAGTAATTGTGTTCTACTTGCCCAAGTGCTACAATCAATATCATATTTTGGTTGCTGGCTTTGATCATTTGATCCATCGTATTAGAGGAATCCCAAGAACTATTAGGATTATATTCTATCCTTTCCACAATACTTGAAATTTGATTGATTAATCTGGAAAGTTATTTGGCAAAAATATCAAGCAGGCTATAACTAGCACTCTTCGAGGATTGATGGTGTCACATTTTTGTTAACTACCCTGTGTTATCTTCCAAACCTTTTCCTAATGGAACAAAAAACTACAATAATTATTTTCTGTTCGTGAAGTAGGATTCTGAACAACATGGTTATCTGTGTGCAACTGCAATAACACTTTGATAAATCCAATACACCTTTGTGATGGTTTCTGATGCCATGTCAGGTTGCTGTTGCGTTGGAGAAGGCAGCATTGTCAGATGATTATTTTGTCAAGAGGAAGCTGTATCCAAATGTGGATTTTTACTCTGGCTTAATATATAGGTACATCAGTGGGAAAGCTGTTTTTCTCTTTTCTCTCCTTTTGTCATTGAGTAGCTAATTGTGATTGTGTTGATTCAGGGCAATGGGATTCCCTACAGAGTTCTTCCCTGTTCTGTTTGCAATTCCTCGCATGGCTGGTTGGTTAGCACATTGGAAAGAGTCACTTGATGATCCAGACACTAAGATTATGAGGCCTCAGCAGGTCAGTGATAGGCAAACAAATTTGCCATGTACTATTATGTTCCCTTAGTATGAACTCCAGGTCAATCATGAATTATGATTACTCCTTTTTGAGCAACTTAACATTTAGATTTTCTTGTCAATCAATATTGAGCCAGATTGGAGCCATTGTTATTCTGCACAGTGACTGCGGTGATGGGAAATAAATAGTTATATGCTCTTTTCCTTTTGAATATCATTTGGTTTGGCTAGCTCTTCTCTGGGCTGCAAACAAGGAGCGTAGGATTTTCTTATGACCACGGCATAGTTATATCTTTCACTAACAAAGTCCAGCAGTATTCTTGATATATTGACTCCTTTTATACATTCATCACTTGATACTGTGCTCTCTATCTAGACCTTTTTGGGTGTATTCTGAATGCTGGCCAATTAATTCCTATGTATTATATATTTGATTCATGCGATACATAATTACAGATATGGTGTTAATCAGTTAGTTGACTAGATATCTTGATGATGGCTTCTTCTTTCTTCAGGTATACACTGGTGTTTGGCTGAGGCATTACACACCTGTCAGAGAACGAGTCCCAGCAAGCCAGGGCGAACAGCTTGGTCAGATTGCTACCTCTAACGCAACAAGGCGTCGGCGTGCAGGTTCTGCCCTGTAA</dnaseqindica> |
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