BGIOSGA007925

From RiceWiki
Revision as of 18:48, 20 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

BGIOSGA007925

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA007925, complete gene.

LocusTag

OsI_06655

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA007925-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA007925-PA

Length

7844

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:10192656..10200499

Sequence Coding Region

10192656..10193316,10194769..10195034,10195203..10195322,10198877..10198948,10200226..10200275
,10200354..10200435,10200485..10200499

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:10192656..10200499 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:10192656..10200499 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCTGATAAGGATGTGGCGGTGATTGCCGGTAAGGAGGAGGTGGGTGATGAAGCGACGGCAGCGGCGGCGTTGATTGCCGACAAGGAGGAGGTGGGTGATGAAGCGACGGCGTCGGCGACCGTGAATGGCCCTGACAAGGGTACCCGTCGTAAGGTGCGGGTGATGGTGTCCGTAGTGCACGAGGTGAAGGCGGCGGCGGCGAGGGGCATCCTCCGGTGCCACAAGGCAAGATCCGGCTCTCGCAGCAGACCATCGATGCGATCCTCGCCACGAAGACGATGCATTATTCTACAAATACCCCTGGAATACTACCGGATCAAGAAAGATTATGAGATGCTCCGTCTCATGCACAGCTGCATGAGGACGCATGACGAGTTTCAGAAACGCATCGTCAAGCGTAAGGCGTGGATCCGTAGTGAGCTGGAGAAGAAAGGGTACATTGATATCGACGAGAGTAACGCAGCAACCTTCACTCCTATACATTGGAGGGAGGAGCTTGTGACAGAGGATGAGGAGAGTGACAATGATGGGGATGATGAGGACGATTTCAGCGAGGGCGAGGAGGAGTCTGAGGAAGATGACGATGACAATGGAGACAACGAGGAGGAGGTGTCCAACGACGATACTACGAGGAGGACGACCTTGAAGACGATGACAACTGCATCCCCTGCTTCTACGGCCTTTCAAAGTCCTTTGAGGACAAGGCCTTTGGCACCTTGCCGATCACGATGTTGTTCAACAGGTCAATCAGGCGTTGCACCTCCTGTGTTTAACTATATAGTTGATGCAAGGAAAGGGAAGAAGAGTGCAAGCCAGATTGAGAATATCCACCAATTACGTCTGCTGTATGATAGATGCCTGCAGTGGCAGGTTGTAAATGCTCGTTCAGAAGATACACTAACCTTCCAAAAGAGTAGCATAGAGAGTATTGTTTACAGTGTGTGGAAAAGTATCGTGCAGCTGCGGGATTCTGTTACAGTAAGAAGAATTGATGTTCAAGTCCTGCAGCAAGAGCTCAAACTGTACTACATTTTAAAAGAGCAGTACTCCCTTATTGATTCCTTCCTCGCTTATGAACAAAAAGGACTCAGAGCTGATACATTGAGTGCGGCAAAGAGGATGGAGGATAATATGATGTACCCAATCAAGGACCAAGAAACCATGCTGGCAGTACCAATGGACATGAACAGGCAGCAGGATACAGTTTGCTCCAAGGAAATTTTGCAGCACCAAAACAGTACTATACTGGACAGATTGATCTAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MADKDVAVIAGKEEVGDEATAAAALIADKEEVGDEATASATVNGPDKGTRRKVRVMVSVVHEVKAAAARGILRCHKARSGSRSRPSMRSSPRRRCIILQIPLEYYRIKKDYEMLRLMHSCMRTHDEFQKRIVKRKAWIRSELEKKGYIDIDESNAATFTPIHWREELVTEDEESDNDGDDEDDFSEGEEESEEDDDDNGDNEEEVSNDDTTRRTTLKTMTTASPASTAFQSPLRTRPLAPCRSRCCSTGQSGVAPPVFNYIVDARKGKKSASQIENIHQLRLLYDRCLQWQVVNARSEDTLTFQKSSIESIVYSVWKSIVQLRDSVTVRRIDVQVLQQELKLYYILKEQYSLIDSFLAYEQKGLRADTLSAAKRMEDNMMYPIKDQETMLAVPMDMNRQQDTVCSKEILQHQNSTILDRLI</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..661#2114..2379#2548..2667#6222..6293#7571..7620#7699..7780#7830..7844#ATGGCTGATAAGGATGTGGCGGTGATTGCCGGTAAGGAGGAGGTGGGTGATGAAGCGACGGCAGCGGCGGCGTTGATTGCCGACAAGGAGGAGGTGGGTGATGAAGCGACGGCGTCGGCGACCGTGAATGGCCCTGACAAGGGTACCCGTCGTAAGGTGCGGGTGATGGTGTCCGTAGTGCACGAGGTGAAGGCGGCGGCGGCGAGGGGCATCCTCCGGTGCCACAAGGCAAGATCCGGCTCTCGCAGCAGACCATCGATGCGATCCTCGCCACGAAGACGATGCATTATTCTACAAATACCCCTGGAATACTACCGGATCAAGAAAGATTATGAGATGCTCCGTCTCATGCACAGCTGCATGAGGACGCATGACGAGTTTCAGAAACGCATCGTCAAGCGTAAGGCGTGGATCCGTAGTGAGCTGGAGAAGAAAGGGTACATTGATATCGACGAGAGTAACGCAGCAACCTTCACTCCTATACATTGGAGGGAGGAGCTTGTGACAGAGGATGAGGAGAGTGACAATGATGGGGATGATGAGGACGATTTCAGCGAGGGCGAGGAGGAGTCTGAGGAAGATGACGATGACAATGGAGACAACGAGGAGGAGGTGTCCAACGACGATACTACGAGGAGGACGACCTTGAAGACGATGACAAGTCCTCTTCTGATGATGATGAGGCACCAAATGAAAGTAGTACTACTTATTAGTATTATTAGTTAGTACTCCATATAATAGTCACTAAGCATGTGTTTGGCTTGGAGATGTGGTGGGATAGATTAGATGATCCATTCTTTTTTTTTTATGGGTTGGACCTAGTTTCTGTTTGGTTGGAGGGATGGAATGAACCATGTATTTTTTTTTGTTTGGTTTGAGGGTATGATGGGTTAGAATGGTTCTATCCTTTGTTTGGATGGACGGTTAAAGATGTGAGGTTACCTCTCACATGAAATTATTTCTTGGATATAACTACAACATTAACACATTCACATCACTATCTCTACTACTAAAAAAGACCATAATGGTGGTCGTGATTCCTACAACTTTTATTTCTGATACATCTAATTTGTCTATTCTTTGCCTACTGTTTAGTAATAGTGTATCCAATAAAATTTTTGTCTTAGTGAAAAATTCATATAACAGAAAAAGAAGGTCCTCAACTCTTCCATAATATCCCTATCTTGCTTAATATCTGAGTCATGCAGAGATCAATTATATTTGTTCATTGCTCATGTTGACTTCAACTCACGCAAGGAATCACTTCTATATACATGATGCTCTGTTGACTAGGACTGACTGACAGTAGAGATTACAGTTTCAGAAACCTAGCAATCGAACTAATATTGAATTCTATAGATTTTGGTTTTTAGGAGTTGGGACTTTCAAGTTGATGGTTGTGAGCAGCGGTTTTCATTTGATAATTCAAACCTCTTTCAAATCTATTGAAACCTCCTTAGTACTACCTATGCCTTTTACTATTGAACCCCTCCGCCAGCCAATAGATGATATTGAAATAGATGGTGTTGCATCCCCAATGTATTGAATTTTCCATTTTTCAACTTCCAAACCCACATGTTTTCACCGGACGAATTCTTCTTTTGCTTTTTTCTGTTCCCAGATTGATGCTTTAAGGATACAGCTCCAGTTATTCAGATTTTGTGAACTCACATGCTATAATCTCTAGGTGAAAACCTAAACTCTTGATTGCTATACCTAACTCTGAAATCAGACAACACATACTATCTTACACATGTCAGTTGTTCACGGTTATTTAATTTAAGGTTACTTACATGTTCTCCTATGGTCTTTAGTATTGTCGCAGAACTTTTCTCTTAATAGACATGCATATATAAAATATAGGCATACATAGGGATGCAACATCATCTATTTCAACACTGAAAGTTTCTGAAAAATATAAGATAGGCAAGTCTGAAAATTTACTGTCACAACATGGGAATAATAGGGAGATCTACGGCTCTCAATTGCCTCTGTTCTATACCTCTATATGATTCATTTCTCAGTTAGTTTTATATATCACCACCAAACCTCTATATGATTCATTTCTCAGTTAGTTTTATCAACCACCACCAAATTTATATACACTTGTCAGCTGCATCCCCTGCTTCTACGGCCTTTCAAAGTCCTTTGAGGACAAGGCCTTTGGCACCTTGCCGATCACGATGTTGTTCAACAGGTCAATCAGGCGTTGCACCTCCTGTGTTTAACTATATAGTTGATGCAAGGAAAGGGAAGAAGAGTGCAAGCCAGATTGAGAATATCCACCAATTACGTCTGCTGTATGATAGATGCCTGCAGTGGCAGGTTGTAAATGCTCGTTCAGAAGATACACTAACCTTCCAAAAGAGTAGCATAGAGGTATGCTATATTGGTTTTGCTCCTGTCTGTTCTCTAATTGCTTTGCTCAAGTTTGTGCCTGATGAAGCCATTGTTTCTTAGTGGGTGCATTCTCTTTATTATTATTATTTTTCATTGGGCAAGCAATGTTCAACTAATATAGTATCTCTCTCCTCCCATGTAAAACAGAGTATTGTTTACAGTGTGTGGAAAAGTATCGTGCAGCTGCGGGATTCTGTTACAGTAAGAAGAATTGATGTTCAAGTCCTGCAGCAAGAGCTCAAACTGTACTACATTTTAAAAGAGCAGGTACTTGGTTGAAATTTTCCTCTAAATATACTTCCTTTAAATTTGATTCGAAGTCATTCAGAATCTGAAAATTTCTTTTAAAAAAAACAATCTGAAAAAAATGTGGTTTTTAAATATGGGGCTGAAAAGAACACAAAAAGTTGGTGATTGGGTAATACCATCCCTCTAGAAAATCTTCTAATTTGGTTGACATTTATTCAAATTCAGGGAAGTACTGTAAATTTTAATCTTTCAGTAATTTTTGTGGTAATTATGCCCCCTGATTCTTTTTTTTTTGAAATTTATTGAATTCATTGAAAGTTTTCAAATTTTGATTAAAGTACGGATATTTGACGATTTGGGGTGTTTAGACCATTTCAATTTTTTTAATATCTAAAAAAATCCTTGGTGGGTTACTTCTCGCCATATGTGATTCAGATTGTTTATATTCAACATTGGCCGGAACTAGAAGGAGAGAACGGTAGTACTTTGATTGGGGCTATTGAAGCTTTACAAGCATACACAAATCTGTGAGATGACATTTTATATAGTATAGTCTCACCATCAATTTCTTTTGTAGTGGATCTGAACATGTCAATGAAGGATATTTATAATGACTTGTTTGTTTTCTGCATTTTAGTTTCAACTTGTGGTTCCAGCTGAAGCAATTGGAGATTTATTAAATCTAAGGCTACATGCTAGGCTGCTATGAGGTAATCTGAGGAATTCAAATTTATATATTTATATACCTGGCAGTACAATATCATGTTCATACTGCTTTGTTCTGGAAAAATATCTGACAGTTTAGCACCTCTAAGAGATGACATTTGTAATGTATTATTACTCCTGCATTTCCTTTTTCCTCAAGTCAGGAGTACTCACATGAGTTCTCCCCGTGCTAACGCTATGATTAAATTTGACAATACATTTCAAAAATCAAAATGCATCCGAGTTCAGGAGGATTCACATGAGTTCTGAATTTCTGTTGTAGTCACTGAATTTGTGTTCAACCCTTGAGAATTGTCAAACATGTTAGGATCAAGTATATATATCAGCCATTAGGAAATGTGAATTTCTATTTTTTTGCTACCAGCAGCTCCATGTGAATTCAGGTGCATGTAGATGATTTTATTTAAGTTTTAAAACCTACTCATGCAAGTTTTGTCCATATTTAGTCAATATTAACTCGATCTCGGAGTTCACGGTCGCTCCCTCCTCAGCATCCAGAGTTCAATGGCGACGGTTTCTGCTGCTTCTGGTGGTGGTGGCGCTGCTCATGGTGGCTTCTGCTGGTGGCGATGGCGGCTGTGCCGGCCCCGTTCTTCGCCGTGGACCCGGGTTATCTCCCACACATCTTCCTTATGACAGCCATGGCCTCACACGACGCGCAGAAACTGCCTCCGCCTCTCAGTATAGGTAGCCTCACGTTCTCCTTTAGAGTTGCACCACGAGCTAACACTATTATTGACCGTACACCAGTTCAATAGCATCATATGCAGGTCTTGACTGCATGCACAGCCGTTGCATCGCCAATAAGTACTCCCTCCGTCCCAAAAAAAAAAACCTAACCTAGGATAGAATGTGGCCTATCCTAAGATAGGATCTGACCTATCCTAAGATATGATACGATGTGACCTATCTTAGGACAACGAATCTAGACATTCTATCCTAGGTTGGGTTTTTTTGGAACGGAGGGAGTAGTGGTGTATTGGCTCGTGATGAAGGCGGTGTTATAAAATGGTATTCTTTCCTCATCTGCTCCTCCATTGTGACGAATCCTTCTCTGCTCCCCTCCTCTGCTACTCTACTCTGCTGCTTCCTTCCGATTCTCTAATTTGTCCTTACTCCTGATGTTGTTCATCGATTTCGATTGTTGTAGCTTGAGGTTTTGAGGATGATGAAAGGTATAGTGCTTCTTCCATGTCAGTAGGGATAGCAGATTGTGTTGTTTATGATTTTGTTTTTAGTCTGATTTAATGTAATTAGAGAATGCATTTTAGGATTTTCAATTCAAAACCAGCATGTGTTCCTTCTTCTTGATTCAAAAGGTTTTCAGTGAGGAAAAAAAACCAAGATATCTTTATGTTGCTATTTAGAAAAAGCCAATAATTTACGATCTCCGTTCTGGTTTATGTTTTGTTAGTTAAACCCTGGCATCATTAGCCCGGAGAAATACACGAGGTGCTTCAGTCTGAATGTTTTGGTTCAAGATACATATTTCTTAATGAGATTTTGTTCGGTACTTTTAAATTACAGAATTGTCCATTTTGTGTTGTAGTTCATCATCTTTAGAATATGGACTGATGGCCATTGTCAAAGCCTCAAGTGGTAAGGAAGGACCAGTGGTATTAACCTTGAGAATTACGAAAATAAATGTATGCACCACTGGTAGATCACTTCAGAACCAATGATATTAACCTGGAGTATTAAGAGAATTAATGCCTGCACCACTGGTATATTTATTTATGTCATGCATGTTCCACTGTTGACGGCAACTATTGAATAAATATGGTCAAATATCTCATGAACCCGCCTTTTTTTTCAGAATCCTTTTTTGTGAAAAGTTGAAACCAGCTCATTATGGTAGTGCCCGAGTTGTGAAGTTACTGGTGAAAACATTCAAACTGCATTTGGTTGCTGCATTTAGCATGTCATCGGTATTTTCTTTTGAATCTCTCTCGTTGATTTGGTTTCATTTCATTTAGGTAGATATTGTGCTAAATTTATTCCAAATCAAAATTATCCCTTCCCCATCAGGATTGTCATGCTATCTGCTCTCTCCAAGGTGAGTATTGGAAACCTTCTCTTGTGGCAATTTCATTCAGCTGATGAGTTATCCTTTGATCGTGGCCATTATAAATGAAATATAAACTGAATTGCACTATCTGTATAATATAACTTCTACAATTGGATTATGTTTTTTCTGAATTTGGCATAAAATGTATATGAATTTCATATACTTGGACAACCATGTGTTTCTTTTTTTTTTTTTTGGGGGGGGGGCATGTTTCTGAAATTTACCACCTAGGAAAAAAATTATGACATATGGTATACTAAGATTTTCCATAAAAATACTTATGTATTTGCCAGCCTTCTAGCACATGAGTTTGGATGCTTGTTATTGCCTGACATAATGATAGCTTGCAATATTAAATCGGAATACAAACAGTGAGTATAAAAACAAGCAGACTTTTGTATAAATGGAACCATTTGTGTTATTAGAGTGAGGTTTACATTTGGTCAATATTATATTCCCGTTTATGCTCATGAAATTCATCTTATTGCTGTTCACTGCAGCACAATCCAACTATATCGATGCAGGTCAATATCCACAAGGTCCTTACATGCAAGTAACATGCGCTCACATCCCTGCAAGTTTATTCTGTTCATTTATAGTCAAATTATGTAATAATCGAGTCCATATGCCTATGAGAAATATAGTTTCCTTACTGAAATTGATGACTGAGTGTACAGAACATGACTCACATTTTGGGATTTGAACATATATTTCCTATATTAAGAAATTGTGCATTCTTACTTAGGGATTTGATCTGTTGGTTTGTTTAACATTGCAGTACTCCCTTATTGATTCCTTCCTCGCTTATGAACAAAAAGGACTCAGAGCTGATACATTGAGTGCGGCAAAGGTGAGTCATGTGCGGCAAATTTGGTTGTCTATGTGTCTATTCATTTTCTAAGTAAGCTGTAAGTACTGCCAGCATTACTTTGTAGTCATGCTACACATCATCTGCACTATTGACCTCCTTATGCTCATGCGACGGATATTTTTTCAGATCAATGCAGTACAATCCTACTTTTGATTAGTGATAAATAGAAGTTTGGTTGTTGAACTGATCAATACAAGATCCTTATTTGTAAGTATCATCTTTTGCACCTAATATCTGCTTACAATGAGCTATGAGATAACAAAAGGAGTTTATGAAATTGAGGTGCTCTTAATTTATTGCAAGGTCAGTTTATCCTTTGTCAAATTTATACATGTTGAGTTTTGTGTATTTTTACTTTGTTTGATTGGATCCTATAATGCTATACTGAATTTTGGTAGTTGCTGCTTTCCTTCCTAATAATCCATCAAAATAAATTTCTGAATTTTAAATCAGTGGAGACCTGAAAAACTGTGGTCAAAAGCATTTCTGAACAATGTGTCATGATTATCTAGAATATGGTGGTCAGAAGCACTTGTATTATATATACCATGCATTATTTAAAATTGGTTCCTCTAGGTGCTTGTTCAGGTGTTTGCATATTGTTTTATAATGCCAACTGAACCTATCTGAAATCGATTCCTCTAGGTGCTTGTATGCCCGTGCGTTCATTGCACTATTGTGCAGTTTGCTACCAAATCAATCTCAGATTTTTCTAGCAAGCCCGGTTCATTAATTTGTCTATGGTCAAGTGTAGCTTTAATTTGTCAGATATGGTGACCTTTAATTTGGATTTATTTATGATATTTCCTCAACAACCTCTATAAAGTTTATCTACTTTCTTTTTATCTATGTGAAAAGTTAAACAGATGGTTCCTTAATTTGCAGTGAATTTGGTTCCCCATCTCTGGTCCTACGGTCCAGAGATTGACATTTCTCTGTTTTATGAGGAATTCAGAAAATGTTTTTGCTAAATGCATACCAGAACAGTACGACCATATAAAGGGGGAGCTGTGGTCGGCCTGGTGAGTGTGGACCTCACGGCTAGGTGCTATCGCTATCTACAATTGCACATACGTGTATTATCCAGAATTTTTTCTTCTCCAAAACCAACACAATGCCCTTAAATGTTAGTTCTCCAGATCCAACAAAATTGTGCTGCTCTTGTATAGCTGGATTTGGGACTTCATTTGATTTGGGGTTGATATGTGGTTATGTTTCTTAGATTTGAGTGGGAATTTTTGTTTTGGTTCAATCAGAGGATGGAGGATAATATGATGTACCCAATCAAGGACCAAGAAACCATGCTGTGAGTTGGCCAATCTCTGTTCTCCTGCAATTACATTTCCCTTTTTGCAGTAGATCTTGCTTCCAATTGATTTTGCAGGGCAGTACCAATGGACATGAACAGGCAGCAGGATACAGTTTGCTCCAAGGAAATTTTGCAGCACCAAAACAGTACTATACTGGTTAGCATCTCTTGTTTATTTGCATTATGATATTTTTTTTATCCTGTAGGACAGATTGATCTAG</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA007925