Os07g0166100

From RiceWiki
Revision as of 08:23, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os07g0166100| Description = Membrane attack complex component/perforin/complement C9 family protein| Version = NM_001065505.1 GI:115470742 GeneID...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os07g0166100

Description

Membrane attack complex component/perforin/complement C9 family protein

Version

NM_001065505.1 GI:115470742 GeneID:4342485

Length

7932 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os07g0166100, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 7

Location

Chromosome 7:3593343..3601274

Sequence Coding Region

3593555..3594253,3594684..3594850,3595620..3595806,3595880..3595948,3596551..3596752
,3597124..3597362,3598374..3598637

Expression

GEO Profiles:Os07g0166100

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008400:3593343..3601274 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008400:3593343..3601274 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggcatacagagcaatgctgcaaagtgctgcggagtctgctatacagtccattggtcttggttacgacattgctcatgatatacgtctcaagtattgcaagcagcgcagttcgcctgacccgttgctcattgagcttgaccatgacgaggttcaggatattgtgctccctggtggactgacagttgcaggcgtgtccaagtcgattaagtgtgacaaaggggagcggacgcggttccggtccgatgtcctgtcatttcagcagatgtcggagcaattcaaccaggaattatctttgtctgggaaaattccatctggtttattcaatactatgtttgaatttactggctgctggcagaaagatgctgctaataccaagtcacttgcctttgatggttggtgtatcacactgtacactgttgcactctcaaaggcacagattgtactccgggatcatgttaagcaggctgttccatcaacatgggaacctgctgcattagcaaggtttattagaaagtttggtactcatgtagttgttggtataaaaatgggaggcaaggatataatttatttaaaacaacagcattcatcaactttgcaagctgttgatgttcaaaaacgattgaaggagatgtcagaccgaagatttcttgatgcaaacgggcaatctgacttcagtttcaaggattcctatggaaaggataagattgacacaagagagcatcggctgagatttgtggactccagtccattgaattcttactcttcaaaggaggatttggtgatgatgcctaagcggagaggtggaagggataaagatatcctttctcacagcgagtggctgaatactgttcaggcagaacctgatgttatctcaatgtccttcatacctattacttcactgttgaatggagttcctggctgtggatttttaaaccatgcaattaatctgtaccttcgatataagcctcaaattgaagagctgcaccaatttttggagttccagcttccaaggcagtgggctcctgtttacagtgacctccctcttggtcctcagaggaaaagacaaagcactgtatctttaccagttaatttaattggtccaaagctttatgtttgtaccaacatggttgatgtgggcaaaagacctgttacaggaatccggctgtttcttgaaggaaaaaggagcaacaaactagctatccatctccagcatctctgctctcttcctcagattcttcagcttgaagatgatccttacaatgaccaaactccagaagcatatgaccgcaagtactacgaaccaattggctcatggaagcgtttctcccatgtctgcactgcaccagttgaatcagatgactcctccattgtcacgggggcacaattagaagtggttagccatggcttcaagaaaatactgttccttcgcctccatttctccaaggtctgcaacgccacttccgtcaggaaccctgagtgggaaggatctccaaacctggctcagaaatcgggcctcatctcaacactcatcagcacacatttctccacagcagctcaaaagcccgcgcctcgccctgctgatgtgaacatcaactcggcagtgtaccctggtggaccccctgttccagtgcagaccccaaaacttctcaagtttgtggatccaacagagatgatgcgtggaccgcaggatctgccaggttattgggtggtctcaggtgcgaagctgcagctcgagaggggcaagatctcgctgcgggtgaagtactcgctcttgacagcaatgttgcctgacgacgatgagtttgcgttcgatgaagagttttag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAYRAMLQSAAESAIQSIGLGYDIAHDIRLKYCKQRSSPDPLLI ELDHDEVQDIVLPGGLTVAGVSKSIKCDKGERTRFRSDVLSFQQMSEQFNQELSLSGK IPSGLFNTMFEFTGCWQKDAANTKSLAFDGWCITLYTVALSKAQIVLRDHVKQAVPST WEPAALARFIRKFGTHVVVGIKMGGKDIIYLKQQHSSTLQAVDVQKRLKEMSDRRFLD ANGQSDFSFKDSYGKDKIDTREHRLRFVDSSPLNSYSSKEDLVMMPKRRGGRDKDILS HSEWLNTVQAEPDVISMSFIPITSLLNGVPGCGFLNHAINLYLRYKPQIEELHQFLEF QLPRQWAPVYSDLPLGPQRKRQSTVSLPVNLIGPKLYVCTNMVDVGKRPVTGIRLFLE GKRSNKLAIHLQHLCSLPQILQLEDDPYNDQTPEAYDRKYYEPIGSWKRFSHVCTAPV ESDDSSIVTGAQLEVVSHGFKKILFLRLHFSKVCNATSVRNPEWEGSPNLAQKSGLIS TLISTHFSTAAQKPAPRPADVNINSAVYPGGPPVPVQTPKLLKFVDPTEMMRGPQDLP GYWVVSGAKLQLERGKISLRVKYSLLTAMLPDDDEFAFDEEF</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>7022..7720#6425..6591#5469..5655#5327..5395#4523..4724#3913..4151#2638..2901#gttccgcctccccaatccgtcccccgtctcctcgcccgccgccctcgactcccgtcttctcgcctcccgctggcatcctgctagcagaggtggcgccggcgttctcctgctcccgccgcattcgctcaccggtgagcatcctaatccatcccatccggcctcggcctcgagtttcgtctcctcgccgccgcttgcgccgatccccatcctgcgaggagaggtggcgcccggcgtcctcctgcttccaccgcatcgtcgctcgccggtgagcatccctccctacccacacctcatcagctattctgcgttatccctcaaaaaagtttcggggttcaaccgaaacagggttagatctgcctctgcccagttccacctactttcaacttgttaattttgatttttgtttttagcagatgtaatttggttactgaatctcatccaaacactcttagaatagttgcattagaacggaaaatgtaagctcacataatttgtactcatccaaactcatataaatttcttaagaagaatctataccacaaactactcatagtcacacaaaatagctttttattaaggtatattcttataagaagtttttattccacaaaattttctaaaagacatactgtaacacttgcaattaatctaattaaacattttttttctttattaggttataaattttctaaaagacattgtgccacttggcatgaatctaatttagcattctttctttatcaagttataaattgaaaccatcaaacttactttgtcttcccgtctctaaaacattgtgatatatctataatattttaatatttttgatattaaaataaatttagactaatcatatatatatatttaaattaggtaattaataaattcaaatcaactatacttttatataccaagtacaaatctaataacaatagaatgttagaaacaatgtgaattcaattttttttataaagtttaagtacgattcatatataaaattaaagaaaaatataaatttatatataagtgataacataataaaatgcaagttaaaattattaaaggaaaaatattattaataatcaatgttattgatgtatttctaaatattttcacgttatttttattaaatatcaatgagtaaaacggatgatttgccttatgacaaaataattattaaaattgtttttatccgttgcaatgtacggatatttcgctagtttatagcaaaacaaaaacacaccatatgcacaaacgcctttggccttttgagaattcgcaattccagccgatttgtaattttcaaaccaattgaataatactcctaaattgtttcagactagtacacgacatccgtataaaataatgccctacttgtcgttctttacttgtcattctcctttttcaaacccatggcctacatgtcatcctctacaaggcattctctacttgtcattctcctttttcaaacccatggcctacatgtcatcctctacaaggccaaagaaaagtgagcaactcatccttccttccccttcttctcatcttcagcgaggagcggagcaaatcctccgccgcctcgcgagctcccccaccgcctgacctatctccggtcgctggaatccgagatcggcctccttctcgaatccgcccccgcctgtacagtcgccgacggccgccccagctgatggttcgccaccgccccagctgatggttcgccttcactggaatccgagctgcttgaaggtgcacctttggccttttgagaattcgcaattccagccgatttgtaattttcaaaccaattgaataatactcctaaattgtttcagactagtacacgacatccgtataaaataatgccctacttgtcattctctacttgccattctcctttttcaaacccatggcctacatgtcatcctctacaaggccaaagaaaagtgagcaactcatccttccttccccttcttctcatcttcggcgaggagcggagcaaatcctccgccgcctcgtgagctcccccaccgcctgacctatctccggtcgctggaatccgagattggcctccttctcgaatccgcccccgcctgtgcagtcaccgacggccaccccagctgatggttcgccttcactggaatccgagctgcttgaaggtgctcccgttggtataccttcttgcttggttactgttttgagggtggctcttcattggtggttgctgtagaatgttcgtgctgcttagaaattggatatgaatttactgaattaccgatccgggtagttcggcttgatggcatattaggtttggtgttatgtttatgtagatccagctactgaaaatctagttgagtgactgcgtggtgggtgtagatcataccatctcccccaatccccttttaaagaagtgacagtattcgattccaaataagcaaagcaagtagttgtcttttcctgtcagttctaatcgattcatcgaggagaaaataatctttgattttgtgacgattccagcttcagaggattatagtgtctgcttcattcggaggttcatcgtcgccaaaaataaataaaatttggccgtgtcaactctacaattaggaaggtttcggatttctcaacgtggaatgataagaaatggcatacagagcaatgctgcaaagtgctgcggagtctgctatacagtccattggtcttggttacgacattgctcatgatatacgtctcaagtattgcaagcagcgcagttcgcctgacccgttgctcattgagcttgaccatgacgaggttcaggatattgtgctccctggtggactgacagttgcaggcgtgtccaagtcgattaagtgtgacaaaggggagcggacgcggttccggtccgatgtcctgtcatttcagcaggtacgtatcatatgcccaattcatatcttgtgtatactgcatattgccatgtttaagactgagaaatatatcgtaagatgctgtgtaaatgtatgctactatgatgtaacaataatcatgatgaatcccttgctatcttgatctaagaggttaatatgatagcattcatagttccaacttccatgatacctccaaagtaatataaccttttgcaattctataaattaatagaaaataggattattatttattgtaattaggagaatttctccagcaagaaaatagagtaggaacacaagttaattcagtatctcagaattacttgatatggatggtttcaacaatttgaattattagcaacatagactttaatctaccttgtattctaagtagatttggcataatttgaggcctgcagaagtgcagagatgcgagctccctacaaaatgataattccacacttgcagtgtccgtactagaggtttatagagacacacttccgttgtgacatctcaagttttgacagttaccagagcagagttatttttgctcaattgcatggctagacgtttagtcaaaactgtaggattctatccggtttgctggttgcgtgcattttttggcatgtggcactattcaacgccacctatctcaggccacagttatctgactcaggtgttgtggcacatgaatcaattagactctgcaatccaatgttttttctgttccaattcagtatgattctgtagtgatatctcatataactgcaatatatgtcacgcaagcaattcctatataccttgttcataactgttctatgtttgccaactgatgagctgtgaactgatgtaccattgctggctgaacattatgtctcaatgatacaagtctttgtccatgtcatgcttcttttcctcttcagctgtcatggaagccgctttaagtcgcagagtataattacatctataaaaggtaatatttgtgttcctgaagttgtgaagcattttgcagatgtcggagcaattcaaccaggaattatctttgtctgggaaaattccatctggtttattcaatactatgtttgaatttactggctgctggcagaaagatgctgctaataccaagtcacttgcctttgatggttggtgtatcacactgtacactgttgcactctcaaaggcacagattgtactccgggatcatgttaagcaggctgttccatcaacatgggaacctgctgcattagcaaggttagattcaatttgagtccacgctccatgtggtgatttaaattctgaatgaaaagttgaaaacttagtatttatatccttcagaaaaatcacattaggtttagtttttatgttctgaaattttcagaactgttctgagtgctcatttttcgttggtaggctggaagtgctcatgcctaataagttgctttgtaatgccatttttaggccttactaatttattgtgatcactgataaataacatcagtttgctttctacagttagtatttgacctattctaccaatgaatgaagactatgcacatcaaaacaagtgctgaactaaaattttgtttgatcttgtttgagaacaacgtactttactcttacaggtttattagaaagtttggtactcatgtagttgttggtataaaaatgggaggcaaggatataatttatttaaaacaacagcattcatcaactttgcaagctgttgatgttcaaaaacgattgaaggagatgtcagaccgaagatttcttgatgcaaacgggcaatctgacttcagtttcaaggattcctatggaaaggataaggtgattcctcagcgtctaaattttttctgccttcttttctcatggcatgatttttattcggcatcagtgatcagcattaactgctgtatttttttataagcatccttgtagccctctcaatagttaagagcatgttgtgtaaagatcctttttgttgaacacatctcattgtctcaccatatgtataattttcttctatagtggaaatgtggcttttcaccagttgaaattagtgttaccatttatttgatactattatcagaaacttatatcgttgattggcgccacattattttgagtttacaacttttaaagatttgaagtaagaaattggcatatgcatgtgctatgttctatgaggctgcatagccaaggagtatcttgggtttagcgatacagttataccatttcacaattattctcaatctcgatctctgtaagtctgtatatgtaggttaattggaatttaataatagatttactgttctctggcagactggcagtaccatttttgtacgaaatatgttggttttgcatcaattcctattccctttttttttctcttctaaaatttacaatcttagtttttctgtgctgttcagattgacacaagagagcatcggctgagatttgtggactccagtccattgaattcttactcttcaaaggaggtatagttcttttgtgttgatgcatttatctttgttcacattcatatcggtaagttgtggttgtgccactcaggatttggtgatgatgcctaagcggagaggtggaagggataaagatatcctttctcacagcgagtggctgaatactgttcaggcagaacctgatgttatctcaatgtccttcatacctattacttcactgttgaatggagttcctggctgtggatttttaaaccatgcaattaatctgtaccttcgatgtaagtcgagttttccactctacctctttgttagttaacatgaaactgcatctgcaattatgactaataataagagagcctggatcttcatcctcagtggtttacttttgctttgcacttctgttattggcataattgcagcttgcttattcatggtttataattgacggtagtgtctagagttaagaaaagacgattatggcacgctaatgtcaagtactgtctgtttttcaatatggcaggatttaatgttatctgtaggctgtttgaaatttgaacctggaccctatccacctcaaatggtcaaacatgtagaaagagggttgactggcttctctttcatatactaaaaatagtagtcgatgttgtttactaattctaataaaagaaggtgctgctggagaatagattatgtaatatttctatatttcatagctttgttcaccgactgtgcttcctatattttcttctgtggcgtgtgaaataatacccaatttagtatggtgtcacatcatcagctagtcagcttgcatttgcatggctctcttccccctgtggtagttctcatctttagtatggctgcaaagcaggtgttctctagtaatgagcttcagaggaaaaaaaatgtacttccaattgagttggatctttttaggttatgggtcactgtcgtatcatggcatacagacaatcattctagctaggaaaaagatggcattaggcctgaaacaacacaagcaactgtgtgacatgtgtaagttctgtgcagataagcctcaaattgaagagctgcaccaatttttggagttccagcttccaaggcagtgggctcctgtttacagtgacctccctcttggtcctcagaggaaaagacaaagcactgtatctttaccagttaatttaattggtccaaagctttatgtttgtaccaacatggtatgtatcttttttttgttatcataattgaaacctcccttgtttatatatttcttttgttttatccttgcatacttatatcataattattgtagtcttgtactcactataacactaagtcaggataggctagctctagaagcatttgataatgatgagttaatgatgatggtggtgatagtgttatttgacttttgcatatttagagtctgcattgataaccttgacatttttatctgtaaaaactgcaaaattgagttttcatgcaagtttgccaattgcactatatgaaaaatctactctaacaagcctgaaaaatgctgtaaccttttttactggatgtaatcttatcatttaagcagtattcgatgatggttttttccttttttttcttctatcactcgatttattttaaaacaaattggcacaggttgatgtgggcaaaagacctgttacaggaatccggctgtttcttgaaggaaaaaggagcaacaaactagctatccatctccagcatctctgctctcttcctcagattcttcagcttgaagatgatccttacaatgaccaaactccagaagcatatgaccgcaagtactacgaaccaattggctcatggaagcgtttctcccatgtctgcactgcaccagttgaatcagatgactcctccattgtcacgggggcacaattagaagtggttagccatggcttcaagaaaatactgttccttcgcctccatttctccaaggtctgcaacgccacttccgtcaggaaccctgagtgggaaggatctccaaacctggctcagaaatcgggcctcatctcaacactcatcagcacacatttctccacagcagctcaaaagcccgcgcctcgccctgctgatgtgaacatcaactcggcagtgtaccctggtggaccccctgttccagtgcagaccccaaaacttctcaagtttgtggatccaacagagatgatgcgtggaccgcaggatctgccaggttattgggtggtctcaggtgcgaagctgcagctcgagaggggcaagatctcgctgcgggtgaagtactcgctcttgacagcaatgttgcctgacgacgatgagtttgcgttcgatgaagagttttagaaccatgaaaccgagcgaagaaaagaaacccacctcattttgtttttatcatttatgtgcagctaacagcaggaactcgaatgctcaatctaggattttcgtagcatttgtaagtgaactagctggaagtctatgttgtatacagttgcgggtttgaaacatggaagcagaaatgaacggtctctggcttggatgacgcgagagtttgttgt</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os07g0166100, RefSeq:Os07g0166100