BGIOSGA008198

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA008198

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA008198, complete gene.

LocusTag

P0487H05.39

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA008198-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA008198-PA

Length

12890

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:17382469..17395358

Sequence Coding Region

17382469..17382558,17384052..17384187,17384266..17384353,17385634..17385786,17386750..17386912
,17387009..17387193,17387267..17387440,17388158..17388303,17388472..17388595
,17388711..17388891,17390011..17390170,17390258..17390299,17390379..17390497
,17390577..17390775,17391545..17391676,17392538..17392641,17392744..17392923
,17394103..17394242,17394328..17394467,17394603..17394763,17395000..17395123
,17395207..17395358

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:17382469..17395358 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:17382469..17395358 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGATCTGCAGAGCCTCGCCGTCGTGCTGCGCGCGGCGCTCAGCCACGTCCCCGAGGAGCGGAAGGCCGCCGAGGAGAGCCTCAACCAGTTTCAATACGCACCACAACATCTGGTTAGGTTGTTACAGATTATTGTCGATGGGAGCTGTGATATGGCTGTACGACAGGTTGCAAGTATTCATTTCAAGAACTTTGTTGCAAAGAACTGGTCTCCAAATGATCCTGAGGAATCTCAAAAGATTTCAGAAAGTGACAAATTGATGGTCCGCGAGAATATACTGGGTTTTATTGTTCAAGTACCCCCTTTACTAAGAGCACAGCTTGGTGAAAGTATCAAAACTATAATACATTCAGACTATCCTGAGCAGTGGCCAGGTCTCCTTCATTGGGTTACACACAATCTGGAATCAGAAAATCAAATTTTTGGAGCTTTATATGTGCTAAGGGTTCTTTCCAGGAAATATGAGTTCAAATCTGAGGACGAGAGGATCCCTTTATATCACATTGTTGAGGAGACCTTTCCTCGCTTGCTAAGTATCTTTAGCAAACTTGTTCAGATTGTCAACCCTCCAATTGAAGTAGCTGACCTGATCAAGCTAATATGCAAAATATTCTGGTCTTCAATTTATTTGGAGATTCCGAAGCAGCTCTTTGACCCAAATGTCTTCAATGCATGGATGAGTTTGTTTATAAACTTGTTGGAAAGACCAGTTCCAGTGGAAGGCCAACCATTGGATCCTGATGTGAGGAAATCTTGGGGCTGGTGGAAAGTTAAGAAATGGACAATTCATATATTGAATCGTCTATACACCCGATTTGGTGATATGAAACTACAGAAACCAGAGAGTAAAGCTTTTGCACAAATGTTTCAAAAGAACTATGCTGGAAGAATTTTGGGCTGCCACTTGCAGATTCTGAATGCAGTTCGAACTGGTGACTATTTGCCAGACAGGGTTATCAATCTTGTTCTTCAATACCTAACCAACAGTGTTACAAAGAACAGTATGTATCAGTTGATGCAGCCTCAAATCGACATCATTCTGTTCGAGATAATTTTTCCGCTCATGTGTTTCAATGACAATGATCAAAAGTTATGGGATGAAGATCCTCATGAATATGTTCGGAAGGGATATGATATCATTGAAGATTTGTACAGTCCTCGAACAGCTGCTATGGATTTTGTGAGTGAATTGGTAAGAAAACGAGGAAAAAGCAATCTCCAAAAGTTTATCCATTTCATTGTGGATATTTTTAGGAGATATGATGAGGCATCTATTGAAATCAAGCCATATCGCCAAAAAGATGGAGCACTTCTTGCTATTGGGACATTATGTGATAAGCTGAAGCAAACAGATCCATATAAAGCTGAGTTGGAGCGTATGCTGGTCCAGCATGTCTTCCCTGAGTTTAATAGTCATGTTGGACACCTGCGTGCCAAGGCTGCATGGGTTGCTGGACAGTATGCACATATCAGTTTTTCAGACCAGGACAATTTTCGGAAAGCTATGCATTGTATAGTTTCTGGAATGCGTGATCCAGATCTCCCTGTTCGGGTCGATTCAGTGTTTGCACTTCGTTCTTTTGTTGAAGCATGCAAAGATCTCAACGAGATACGACCTATACTCCCTCAACTCCTTGATGAATTTTTTAAACTGATGAATGAAGTTGAGAATGAGGATCTTGTTTTCACTCTTGAAACCATCGTTGATAAATTTGGTGAAGAGATGGCACCATATGCACTGGGGTTGTGCCAGAATTTGGCTGCTGCCTTCTGGAGATGCATGGCTAGTCAAGAAGCTGATGATGAAGCTGATGATTCTGGTGCTTTGGCAGCTGTTGGTTGTTTACGAGCCATAAGCACAATCCTTGAGTCTGTTAGCAGTCTCCCACACCTTTTTATTCAAATTGAGCCAACTCTGTTGCCAATAATGCGCAGGATGTTGACTTCTGATGGTCAAGATGTTTATGAGGAAGTTCTAGAAATTGTCTCATATATGACTTTTTTCTCACCATCAATTTCGTTGGACATGTGGAGCCTGTGGCCGTTGATGATGGAGGCTCTAAATGATTGGGCAATAGACTTCTTTGAGAATATTCTTGTTCCATTGGACAACTATGTTTCCCGGGGATCGGACCATTTTCTTGCCTGCAAAAACCCAGATTATCAGCAAAGCTTGTGGAGTGCACTATCATCTATTATGATGGATCAAAACATGGAAGATTCAGATATTGAGCCTGCTCCCAAGCTCATTGAGGTGGTTTTTCAAAACTGCAAAGGCAATGTGGATCAATGGGTTGAGCCTTACCTCAGTCTTACAATTGATCGATTGCGTCGAGCACACAAACCATATTTGAAATGTCTCCTTGTTCAAGTGATTGCTAATGCGTTCTACTACAACCCTTCTTTGACACTTGCAACCCTACATAAACTTGGGGCTGTGACTGAAATTTTTAACATTTGGTTTGGTATGTTAGAACAAGTCAAAAAGAGTGGTGTACGAGCCAATTTTAAGAGAGAGCATGATAAGAAAGTTTGTTGCTTGGGGTTGACCTCACTTATTAGCCTTCCAGCAGATCATATTCCAGGAGAAGCCCTGAATCGTATTTTCAAAGCAACACTTGATCTGCTTGTTGCCTACAAAGAGCAAGTGGCAGAATCTAAGAAACAAGATGATGCTGATGGTGATGATATGGATGGTTTTGATGCTGATGAAGATGAAGATGATGATGAGGTTGAATCTGATAAGGAGATGGGACTTGATGAAGAAGATGCTGATGAAGTAAACAGTCTTCATCTTCAGAAATTAGCTGCTGAGGCCAGAGGCTTCCAGCCAGCTGATGAGTATGATGAATCTGATGACGATTTCAGTGATGATGAGGAGCTGCAATCACCAATAGATGAGGTTGACCCGTTCATTTTGTTTGTTGAAACTGTCCAAGGCTTGCAAGCATCTGATCCTATCAGGTTCCAGAGCCTCATGCAAACTCTTGATTTTCGTTACCAGGCCCTTGCTAGTGGCATAGCTCAACATGCTGAGGAAAGAAGAGTTGAGATTGAGAAAGAGAAGTTGGAGAAAGCAAATGCACAATGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MDLQSLAVVLRAALSHVPEERKAAEESLNQFQYAPQHLVRLLQIIVDGSCDMAVRQVASIHFKNFVAKNWSPNDPEESQKISESDKLMVRENILGFIVQVPPLLRAQLGESIKTIIHSDYPEQWPGLLHWVTHNLESENQIFGALYVLRVLSRKYEFKSEDERIPLYHIVEETFPRLLSIFSKLVQIVNPPIEVADLIKLICKIFWSSIYLEIPKQLFDPNVFNAWMSLFINLLERPVPVEGQPLDPDVRKSWGWWKVKKWTIHILNRLYTRFGDMKLQKPESKAFAQMFQKNYAGRILGCHLQILNAVRTGDYLPDRVINLVLQYLTNSVTKNSMYQLMQPQIDIILFEIIFPLMCFNDNDQKLWDEDPHEYVRKGYDIIEDLYSPRTAAMDFVSELVRKRGKSNLQKFIHFIVDIFRRYDEASIEIKPYRQKDGALLAIGTLCDKLKQTDPYKAELERMLVQHVFPEFNSHVGHLRAKAAWVAGQYAHISFSDQDNFRKAMHCIVSGMRDPDLPVRVDSVFALRSFVEACKDLNEIRPILPQLLDEFFKLMNEVENEDLVFTLETIVDKFGEEMAPYALGLCQNLAAAFWRCMASQEADDEADDSGALAAVGCLRAISTILESVSSLPHLFIQIEPTLLPIMRRMLTSDGQDVYEEVLEIVSYMTFFSPSISLDMWSLWPLMMEALNDWAIDFFENILVPLDNYVSRGSDHFLACKNPDYQQSLWSALSSIMMDQNMEDSDIEPAPKLIEVVFQNCKGNVDQWVEPYLSLTIDRLRRAHKPYLKCLLVQVIANAFYYNPSLTLATLHKLGAVTEIFNIWFGMLEQVKKSGVRANFKREHDKKVCCLGLTSLISLPADHIPGEALNRIFKATLDLLVAYKEQVAESKKQDDADGDDMDGFDADEDEDDDEVESDKEMGLDEEDADEVNSLHLQKLAAEARGFQPADEYDESDDDFSDDEELQSPIDEVDPFILFVETVQGLQASDPIRFQSLMQTLDFRYQALASGIAQHAEERRVEIEKEKLEKANAQ</aaseq>

Gene Sequence

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