Os07g0178900
| Gene Name |
Os07g0178900 |
|---|---|
| Description |
TIP49, C-terminal domain containing protein |
| Version |
NM_001065566.2 GI:297606818 GeneID:4342553 |
| Length |
5037 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os07g0178900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:4183152..4188188 |
| Sequence Coding Region |
4186047..4186262,4186426..4186542 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008400:4183152..4188188 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggtaggatcagaagtgtattcctcagaggtcaagaaaactgaggtgctaatggagaatttccgtagagctataggtttgcgtataaaagaaaataaagaggtctacgaaggagaggttactgaactttccccagaagaggctgagagtacaacaggtggatatggaaaaagcattagccatgtaatcataggtctgaagactgtaaaagggactaagcaactgaagctagatcctacaatttatgatgctttaataaaggaaaaggtatcctgctcctcgccctcctatcttgtgctggatattttagaatacactaagtgcattttttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MVGSEVYSSEVKKTEVLMENFRRAIGLRIKENKEVYEGEVTELS PEEAESTTGGYGKSISHVIIGLKTVKGTKQLKLDPTIYDALIKEKVSCSSPSYLVLDI LEYTKCIF</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1927..2142#1647..1763#ctcgctcgcagtcgcagctcaccagccgccgcccaggtcgccgccgcgccgccgctcgctcgtagctccgcacgtgcgtcgctgcgccaccggccggccaccgtcgttgcggtgggggagagggagggaggcggagagacaggaagcggcggcggcggcggcggcggcgatgaggatcgaggaggtgcagtcgacgacgaagaagcagaggatcgcgacgcacacccacataaagggcctcggcctcgacgtgcgtccccgcgcttctcctgctcctccgctctctcccccaccttgctgctgctgctgctgctgctgcagtggggaaaggtttttctcctagggttttagagaaaattttctcatggcttggcttggtttggtggtctcgagcaggcgaatggggcggcgatagggttggcggcggggttcgtggggcagggggcggcgagggaggctgccgggctggtggtcgacatgattcgccagaagaagatggccgggcgcgcgctgcttctcgccggcccgcccgccaccggcaagacggctctcgctctcggcatctcccaggagctcggtagtaaggttggttggtgcctccactccctcattctcctctcgaacaccctttgagcactgctctagatgatttgtacactctgctgtaaataaatttggaggttagattttaggcttcataatgaacaagccatgttattagcaacatatgctcaccgtaagcttgtacaaagtgttttgccttttggggatttttgctcttccgctcgtcaagaggtcgatgcgatggccctcagcgtggtgaaatggtggccgcacaaggttgtgaataccttggttttaagcctcatttcaacaacatattatacatgtgtgtgttcaagcctcacttctacatagaggggttatgtttcctgcctttcataccatagacttagtttaagaggtcttacttctatttcatagttctctttactgaagattgaatggagttaaagcatgtggccaataaaaactgatgaatcgtgtttaagtgcaataagggcaccgtggacaattgttcataataagccatttctttgtaagtttgaatcctttttgttcattagctagtgtaaacaagtaattctacatttataagggctcatctagctccagaaaggcattcatattgagcttctggtatttgagaacctatgccttattattttttagttcaactgttgggaggatggttggattaaatttcagattcacctaactaaattgctattctaaagaaatggtcgacttagcatgtttttttctatgtttttggctttcaacatttcttttaggcttggattctgttgcttgctggttcaatatatttgtttcccttccttgaaaataattctgctaatggtggatcactggaatttgatgtcaatttattagatacctgtacatttttttactttatacctcacaatctatatgagaaattctttgtgttaactataagatttttcgttcaatgtcttacatctgcttcatttttggtaaaacttccaatgtttcattcatgttgatggagaatatcttatgtgttatcttattattttactatacaggtccctttctgtcctatggtaggatcagaagtgtattcctcagaggtcaagaaaactgaggtgctaatggagaatttccgtagagctataggtttgcgtataaaagaaaataaagaggtctacgaaggagaggtaagcacaccatatatgctaatttttaagtttgcactaagatattgttcttgaatttgtgcattatttcattttctcttgatattagcacatttataactgatatgatattctcactgtctgtttctaaaataatatatatttgtgcttcattgccttttaggttactgaactttccccagaagaggctgagagtacaacaggtggatatggaaaaagcattagccatgtaatcataggtctgaagactgtaaaagggactaagcaactgaagctagatcctacaatttatgatgctttaataaaggaaaaggtatcctgctcctcgccctcctatcttgtgctggatattttagaatacactaagtgcattttttgaaattttagtaatagttggatgattgttcatttcttattcagaagaatgtcttgttgtgaatatttaatctataaagtaaactttggagaatgttaattgtaaaaaaaaaattgcatgattggaaattcataacttgtcatcgtgaagctgattagatgccttgatactgagattcacttctgttacttccattttttgcactagttgtttcattacatcagtgatacatgggatgcaggtgtcagtgggtgatgttatatacattgaagctaatagtggtgcggtcaaaagagttggtagatgtgatgcttttgctacagaatacgatcttgaagctgaggagtatgttccaatccccaaaggggaggtccataagaagaaggaaatagtgcaggtaatttggtgaattttagcctaaaagatttttgcacaggcaagtcttttttgcattgtactatctatgaatttatgttggtgataattaaagaaatgaatggatcgtgttttacaaatttgaagtatagtgtcaaatattcatgccttgaagattgaaagtagagctgtcagctatgggacattttgttaccatcacaccttgtctgaatagatatggattaccagattagaaccaactctttcaggcctgtaggtgatattgaactaaccgccctaccaaagccaaaaggattggtcttaatcccttttctatccacatttgtaaatacacctcccttgataaatggtttatacagttcacaaatcaaacactactaaataataaattcatgaccatcagtctacattattataacccttggagttcattatgtttgattaattaggtcccactggaagatttgtcctttttatcttctattttatccctcaactgttatattcctgtctaccggcataaaaaaatgggttcccttatacagcattagtgtgttatatacaggctctctgtttatgattctcaagttatatggatgttagttaaagagctgaaacttcagttatcaattttgtacaggatgttacgcttcatgaccttgatgctgcaaatgctcaaccacaaggaggccaagatattttgtcccttatgggacagatgatgaagccacggaaaactgaaatcactgagaagctacgacaagaaatcaataaggtattcaaatttcccatgtagcagcactgctgcttttaaaagtggaccacatttaataaacatgtcaggattggcatatgatctttaacatctatactgtatgttgctaggtggttaacagatatattgatgaaggaattgctgagcttgtacctggtgttctgttcattgacgaggtatcttattatttcatccttacgaattatgattggaaattttctcagtggctcattttggagtcagaaggtataaatacaaatgagggtgtgtttgtctgttgtcaaacatacagtgggttgtccttgtggggcagtgccatactgccatgctatttctctactatatggtataaatcttgatgtggtttgatttagttacttgtgaggaactttaatcgcaggtccacatgttagacattgaatgcttctcttatcttaatcgtgctttggagagcccattatcaccaattgtgatacttgctacgaacagaggaatatgtaacgtaaggtaaacagtttgatttaccagtcgaagcactctgcgctacattataataccagactaatcatgtgtttgtcagtttgtttattaccatatgctccttaaagtttacaaagtcttgttatgcttgtgtccagaggaactgatatgacaagtccacatggtataccagttgatcttctagacagattggtgattattcgaacagaaacatatggtcccactgagatgatccaggtttgattttggatcttatatcacttaggctttcctgtttagaaatgtgtttgatctttgctcattgtcctctacagatacttgctattagagcgcaggtggaagagattgacattgatgaagaaagtctcgcatttttaggagagattggacaacagacatctttgaggtacgattcttggttgttacaccgacaggtttgagaaagagagttaagatggaaattatgcagtagggagttatgttaagtggactgatcttatttcccactttcggtgttctataagcattttaaattttgtagttttagttttataaccaccaagctcatcttactgaggcagctagcgaagatgaacgattgtaacacatgttgaatctcatgtaggcatgctattcagttgctatcacccgccagtgtagttgcaaaggctaatgggagagagaagatcagcaaggtatgtgttgaaattccagcaggatattgtaacgtcctcttgttgtcttttttgccgtatgggctatggctggctgctacattcacttgttagcctgatattgttcttgcaagttttatgtatgctgaacccatgaccttgtttttaatcaggccgatcttgaggaagtcagtgctctgtatttggacgctaaatcatcggctcgtctccttcaggagcagcaaggaagatacattacttaaatttctcttgcagtatgacgataaactcgagaatttgtccctattcatgctgtacacaggtgcgaagactctttcaggagcacacttgattgatttttgcagaaatgtagaaactgaacaatgtacccctgcactgtaggcagcctctagagaatagcagcattttcgaagtattgcttgttcaaactactgtttgctgagtagatctcctatgga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