BGIOSGA008642
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA008642 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA008642, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_08112 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA008642-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA008642-PA |
| Length |
6105 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:26452665..26458769 |
| Sequence Coding Region |
26452665..26452711,26453501..26453696,26453850..26454234,26455699..26456852,26457045..26457310 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:26452665..26458769 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:26452665..26458769 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCCAAACCCAATGGCAAAGAGAAAACGGGTGACATGGGATTGTCGATGGCTCCTCCAAAGATTTCCAAGGATAGATTTGATGCTGCTATCAGAGCCATGGCTGATATTGGTATCCTAAAGGAAACTGCTGCGCCCGTGTTGAATAATCTACTAAACTTATTCGATTACAACTGGGTGCATATAGAAGCTGATAATTATCTGGCTCTTGCTGATGCTATATTTTGTGATTCAGATCCCAAAGAAGGACAGAAAAGGCAAGCTAATGAGACAAATCTTGATGCAGACCAATCTAACAAGAAGCTTAAGACAAAAAAGCGTTCTCAAAATCCTACATCCAAGATGCATGGCAATGACAATAGAGAGTTTGTTGAAGCTCCACCACAGCAGGGACGAGGCACACTGTCTGCCCGAACTGTTAATGGGAAGAAAGTCACCAGGGCCCACTTGGAGTTGCCTTCTTCACAATTACTGATCAAGGAACCACATACATGCCCTAGCATTGCAAAGAATACAACAATTGTTGAAAATAATTCTGCTGTATTATGCCATGGTCAAGACCTTCAAACTTTTGAGGTCCCAGTAGCAACTACTTGTCCGCAAGTTGTAGCCCCCAGTACTCGCAAAGCTCTTTACTTCATTTCTAATCAAGTCTTTTGGATTTTCTATTTTTCACGTTATGAAGATGCACGTAGGACTTCTGGTGCTCACCATGATCAGAAGCATGAAGGTGTATCTGGTGCGCATGAAAGGAACAGGGCTGTTGCGTGTAGCAACCAGGAAATTGTAAGCAGCAAGGATTCTCCATCCAACATTGAGGTAGTTTTGTCAAATTATGGAGCTGGGAAACTATCATTCACATACAACTCTTCCCTGGCAAACCGTTCTGATTTTCATCTGCCTGACATTAAATTAATTTGCAAGAAAATGGAGGCTAGATGCCTTAGGAAATACAAGAGCCTAGAACCCAATTTCTCTTTTAAGAATCTTATTAAAGATACTTGCCAGTGTATTGTTGAATCTAGTGGACCTAGACATGAAGGCATCATACAAACTGTTCCTGCCCTGGACATTCTGTCCAAACCTTCAGTGCCGCAAATATTGCAGTCAAATCAAGCTAATTCCTCTTTTATGCCACCTAATAATGTCATGAGCCTTGGTGGTACTTCTTCCTCTTGCGCTGTTGCTGGAGTTAGCCAGAATTCTAGCAATATGCCGGTTGTTCCGCATCAACTACATATTGGTGCCAACAGACCACCTCATGATGTCAATGATATCACAAAAGGTGAAGAACGTTTAAGGATTCCAATTATTAATGAATATGGCAATGGGATTCTTCCTCCTCCATTTCACTACATACCACACAATATCACACTCCAAGAAGCCTATGTAAACATCTCCCTTGCTAGAATCGGAGATGACAATTGCTGTTCTGATTGTTTCAGAGATTGTCTGGCACAATCACTTCCTTGTGCGTGTGCTGCAGAAACAGGAGGAGAGTTTGCTTATACAACAGATGGCCTTCTTAAGGGAGCATTTCTAGATAGCTGTATCTCAATGATTCGAGAACCACTTAAACATCCCCATTTCTACTGCAAGATTTGCCCAAACGAACGAATGAAGATAGAAGTAAATTCTGATTCATCAAACACAGAAATGAATCCTGGTCCTTGTAAAGGACACCTTACAAGGAAATTCATCAAGGAGTGCTGGAGAAAATGCGGCTGCACTAGAAATTGTGGAAACCGTGTGGTGCAGCGAGGCATCACACGCCATTTACAGGTGTTCTTAACCCCTGAAAAAAAAGGATGGGGATTGCGCAGTACTGAGAAACTTCCTCGAGGTGCTTTTGTTTGTGAGTATGTTGGTGAAATATTAACGAACATTGAGTTGTATGACCGTACAATTCAAAAGACTGGTAAAGCAAAGCACACATACCCATTGTTACTTGATGCCGACTGGGGTACTGAAGGTGTTCTTAAGGATGAGGAAGCCCTTTGTCTAGATGCCACGTTTTATGGTAACGTCGCAAGATTTATAAACCACAGGTGCTTTGATGCTAATATTATAGGAATACCTGTTGAGATCGAGACGCCCGACCACCATTATTACCACCTGGCGTTCTTCACAACAAGGATAATAGAGCCTTTTGAGGAACTCACATGGGACTATGGGATTGATTTTGATGATGTCGACCATCCTGTGAAGGCATTCAAATGTCATTGCGGAAGTGAGTTTTGCCGAGACAAAACGCGCAGATCTAAATCGAGGGCGCGGGTTTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAKPNGKEKTGDMGLSMAPPKISKDRFDAAIRAMADIGILKETAAPVLNNLLNLFDYNWVHIEADNYLALADAIFCDSDPKEGQKRQANETNLDADQSNKKLKTKKRSQNPTSKMHGNDNREFVEAPPQQGRGTLSARTVNGKKVTRAHLELPSSQLLIKEPHTCPSIAKNTTIVENNSAVLCHGQDLQTFEVPVATTCPQVVAPSTRKALYFISNQVFWIFYFSRYEDARRTSGAHHDQKHEGVSGAHERNRAVACSNQEIVSSKDSPSNIEVVLSNYGAGKLSFTYNSSLANRSDFHLPDIKLICKKMEARCLRKYKSLEPNFSFKNLIKDTCQCIVESSGPRHEGIIQTVPALDILSKPSVPQILQSNQANSSFMPPNNVMSLGGTSSSCAVAGVSQNSSNMPVVPHQLHIGANRPPHDVNDITKGEERLRIPIINEYGNGILPPPFHYIPHNITLQEAYVNISLARIGDDNCCSDCFRDCLAQSLPCACAAETGGEFAYTTDGLLKGAFLDSCISMIREPLKHPHFYCKICPNERMKIEVNSDSSNTEMNPGPCKGHLTRKFIKECWRKCGCTRNCGNRVVQRGITRHLQVFLTPEKKGWGLRSTEKLPRGAFVCEYVGEILTNIELYDRTIQKTGKAKHTYPLLLDADWGTEGVLKDEEALCLDATFYGNVARFINHRCFDANIIGIPVEIETPDHHYYHLAFFTTRIIEPFEELTWDYGIDFDDVDHPVKAFKCHCGSEFCRDKTRRSKSRARV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..47#837..1032#1186..1570#3035..4188#4381..4646#5325..5391#5482..5532#5793..5883#6080..6105#ATGGCCAAACCCAATGGCAAAGAGAAAACGGGTGACATGGGATTGTCGTAAGAGTTATTCTTTTACTCAGCATTTTTTAATACAATTGTTTTTATGGGCATCCGATGATATTATCCGATTCCAAACTCTATCTCACTCAGCAAAAAAAAAATAATTCGCGAATATATGACATGTTTTGCACACTCAGAATTCTTATACTAAACCATAGACACATCTTACAGAACATTACTGCCTCATGTAACACTGAACAAGGTATACATTTCTGAATGCTGCTCAAGTTGTCTAACTTTGCATGCACATGGAGAGATAATAATGCAGATTGGATGTCAACTGCTCAAGTAGTATGAATTACTCATTTTCTGTTTTTCCTGTTGTTGCACTGCTGTGTCATGAAAACTAGTCACTTCCCCTGGCATATATAACCATTCTGGTTATAGTGCTATTTGTTAAGTTTATTCCTCAAAATATTTAATTTGTTCCTATAATCAAGTAGATGGTATGTGGCAATTATCCGGTGAGTAATCTATTTCAAATGCTGACTGAAAGAATAATATTAACATGCACAATAGATTGAAAATTCAGAAATAAGCGCAGCCCTTCTCCAAGGATAAATAAGTTAGCTTGTACCTGGAGTACTCTTGTGGTTGGTCCTGTAGCCTATCTTGTGTGCTTAGTCCACAACTTCTCGTAATGTATCACAATCTTAACTTCATTGTACATTCGTAAGATGTTTGTGATACCATGCTTAGTATGTGTATATGGTTTTTCTTATCACTTGCTTTCTCAAAGGATATCACGTGTTAATGTGCCATGCTGATTTGTTCCACTGCAAGCAGGATGGCTCCTCCAAAGATTTCCAAGGATAGATTTGATGCTGCTATCAGAGCCATGGCTGATATTGGTATCCTAAAGGAAACTGCTGCGCCCGTGTTGAATAATCTACTAAACTTATTCGATTACAACTGGGTGCATATAGAAGCTGATAATTATCTGGCTCTTGCTGATGCTATATTTTGTGATTCAGATCCCAAAGTATAATCTTTTTGCTTTGTTCTGGCATATTATTAAATATTTGGTTCTTTAAGTCAGTAGTGTAGTTTTATTCTTTATTATGTGAGCACCATATATCTTATTATTTCATTAATCTGCCATTTTGATTTGATTCAAGTTTTGGTGATGTACCAGGAAGGACAGAAAAGGCAAGCTAATGAGACAAATCTTGATGCAGACCAATCTAACAAGAAGCTTAAGACAAAAAAGCGTTCTCAAAATCCTACATCCAAGATGCATGGCAATGACAATAGAGAGTTTGTTGAAGCTCCACCACAGCAGGGACGAGGCACACTGTCTGCCCGAACTGTTAATGGGAAGAAAGTCACCAGGGCCCACTTGGAGTTGCCTTCTTCACAATTACTGATCAAGGAACCACATACATGCCCTAGCATTGCAAAGAATACAACAATTGTTGAAAATAATTCTGCTGTATTATGCCATGGTCAAGACCTTCAAACTTTTGAGGTCCCAGTAGCAACTACTTGTCCGCAAGTTGTAGCCCCCAGTACTCGCAAAGGTAATATCTTTGTAGGCGACATAGTGTTAATAATTTATATGAAAATGCTAACCTTTTAATGCTTTGTTGATGGATTCCCACAAATTAATCTAGTTTTATTGTATAAACTAAAACATACAGGTCGCCCCAGCCTATTAATGTTGTCTACCTGAGTGTGCTAATCTAAATATTCTTCTCTCCACTCTATCCGTTCCAAAACATCTTTTGGGCGTGGTGCAGTAACAACATTTTGAAATTTGACAAATGTATCTAAATCAGCTGCATAAAAGCAATATTAGTGTATCCATCATCAATTTACTTTCATAATGCTGTTAATTCATAGACCATCCAAAATTAATGACTACTTATTGTTGGGAATTCATGGAGTAAGTTTAATTGTTGGGTTGTATTGTTGTCAACTTCAGTGCTATTTTATCAATTTGTTAACATTATGTTAATATAGTCTTGGTCTGTTAATCAGCTTCCTACCTACACATCACTGTAGCGGTTTTTTTTTTTTTTAAAAAAAGATGAATTACTTATGGTTTAGAGTTGAAAGGAATACTTTATATAAATTCCAGTTAATGGGGTGTTGAGGCTTTGAGAGCAAGCGTGTATTGTAAAGCATTTTGCTAGACATGAGTGCATTATTATTTAAAGAGAATTTTTTACTACTACTTTCACAATAAGAATCATGATCCTCAAACTTGGATTTGAAAAAGACCCGTTATTTAAGTAATATTTCTGTGGGATTTTGTGAGTCACTCCTTTTGAACTAGGGTTGTCAATATATCCAAAAGTAAAACTCATATTGATATTCAGATGGCCTCCTTCGGCCTTCCCGGCGAAAAAAACTAATATTGATATAATGTTGTTGCCAATATATTGCGATCAGAGAAGTTGTGAAAATCTTGCATTGTGACTATTAACTTAAAGACCATTTATATTTGGCCAGAGATTATTTCGAATTGTGTTGTCAATTTTGGTCAAAGAGTGGACGTATACCTCTATAATGTTATATATATAGAGAGAGAGTAAGTTCACATAGTTATCTGAAATTGTTGCTTAGAAGTGTGATTTTTATAGTTTTGTGAAAGGTAGTGTTGTTTTTGTGGAATTTATTCACATATCGTATACACTTTTTGCAAAAAGAAAAAAAAACATGTGGCTGTTTTTTGGATATATAGAATTTTATGTGTGGATGTCTGAGGGATTATGATCTTATGTCTGTTATTTTGGGGGATGGGGCAGGGAGGTCTAGAGCTCTGGATGTTGATATCTCCTGGCAAAGAATTGGTCTAGCATTTGATCTCTAATAACTGTACAAATGTCAGTCCTTTAAATCCCTGTTCTACTCTGTTGCGAGCATGCTTGTCTAGTGATTCTGAACAATATTGGAGTATTCTAGAGATGTCCTTTGCTTCCTGCAGAAAGTGTCATTGTTGTTGCTGTCATGTTAATATTCTTTTTTTGGCTTGTTGCTAGCTCTTTACTTCATTTCTAATCAAGTCTTTTGGATTTTCTATTTTTCACGTTATGAAGATGCACGTAGGACTTCTGGTGCTCACCATGATCAGAAGCATGAAGGTGTATCTGGTGCGCATGAAAGGAACAGGGCTGTTGCGTGTAGCAACCAGGAAATTGTAAGCAGCAAGGATTCTCCATCCAACATTGAGGTAGTTTTGTCAAATTATGGAGCTGGGAAACTATCATTCACATACAACTCTTCCCTGGCAAACCGTTCTGATTTTCATCTGCCTGACATTAAATTAATTTGCAAGAAAATGGAGGCTAGATGCCTTAGGAAATACAAGAGCCTAGAACCCAATTTCTCTTTTAAGAATCTTATTAAAGATACTTGCCAGTGTATTGTTGAATCTAGTGGACCTAGACATGAAGGCATCATACAAACTGTTCCTGCCCTGGACATTCTGTCCAAACCTTCAGTGCCGCAAATATTGCAGTCAAATCAAGCTAATTCCTCTTTTATGCCACCTAATAATGTCATGAGCCTTGGTGGTACTTCTTCCTCTTGCGCTGTTGCTGGAGTTAGCCAGAATTCTAGCAATATGCCGGTTGTTCCGCATCAACTACATATTGGTGCCAACAGACCACCTCATGATGTCAATGATATCACAAAAGGTGAAGAACGTTTAAGGATTCCAATTATTAATGAATATGGCAATGGGATTCTTCCTCCTCCATTTCACTACATACCACACAATATCACACTCCAAGAAGCCTATGTAAACATCTCCCTTGCTAGAATCGGAGATGACAATTGCTGTTCTGATTGTTTCAGAGATTGTCTGGCACAATCACTTCCTTGTGCGTGTGCTGCAGAAACAGGAGGAGAGTTTGCTTATACAACAGATGGCCTTCTTAAGGGAGCATTTCTAGATAGCTGTATCTCAATGATTCGAGAACCACTTAAACATCCCCATTTCTACTGCAAGATTTGCCCAAACGAACGAATGAAGATAGAAGTAAATTCTGATTCATCAAACACAGAAATGAATCCTGGTCCTTGTAAAGGACACCTTACAAGGAAATTCATCAAGGAGTGCTGGAGAAAATGCGGCTGCACTAGAAATTGTGGAAACCGTGTGGTGCAGCGAGGCATCACACGCCATTTACAGGTAAGTAATAATATCAAAGTTTTTGCTAGCTTGACGATAATCTGTCAACTGCCAAATATTGTTGAAATTATGATGTTAGCTGCAGCAGTTTGTTGTGATAGTGCATCATGTGTATGATCATGTGCTTGTCACAGTAAACATCTCATTGCTTACGTGTTTTAATAATTTTTCTTGTTCTTTCTAAAATTTCAGGTGTTCTTAACCCCTGAAAAAAAAGGATGGGGATTGCGCAGTACTGAGAAACTTCCTCGAGGTGCTTTTGTTTGTGAGTATGTTGGTGAAATATTAACGAACATTGAGTTGTATGACCGTACAATTCAAAAGACTGGTAAAGCAAAGCACACATACCCATTGTTACTTGATGCCGACTGGGGTACTGAAGGTGTTCTTAAGGATGAGGAAGCCCTTTGTCTAGATGCCACGTTTTATGGTAACGTCGCAAGATTTATAAACCACAGGTATCCATTTATTATTTATAATAATGGATTCTTTTTTTACCAGAACATCTAATGATTGTTATGGAGTCCTCTGTAATACATGAAGCTGTTGCTTCTATGGGATGGGTAAAAAAAGGGATGAGCTGGTTCTTGTCGCTTTCTGGTTTTCCCGGTGAGAACCTGGTGATGTACATTTTCTGACTGTTCTGCGATTTAGTGAGTTCTCCATGATATGTGTGCTTCAAGTTGAAAGTGTAGGAAATTTCATTGAAAATTGACAATTGGTGTGACTGGTAAATGGCTACCAGTGGGGTCCCAACTAAAACCTCATGGACCATAGCGATTAACCCTGGTTCTGTGAACTAACTTAATATGTGCTTTTCAGTTGTCATTATATGATATTTCTCGTTAGAAAACTGTGAACAACATCGTAGATTTGTGATTGTTTGGCTGCTCCTATATTATTGCCTGATGTCGTAGATTAGTGATTGTTTGGCTGCAACCTATATTATTGCCTGATGTCAGCACTTAATCAAGATAGTTAAGTCAATGTTACTCTTATTTGAAGCTAGCTAACAGAACAAAGTCTTATCCAAATTTTAAATATATAAGTATTTCTTAAAAAAATGTTGCTTCTGTGCTCTGCTGAATCTAACACTTCTTCCTTCTTGACCTGGCATATCATTGTACGGTTTTCAGGTGCTTTGATGCTAATATTATAGGAATACCTGTTGAGATCGAGACGCCCGACCACCATTATTACCACGTATTTTTTCAACTTTAGCTTGTAACTGATATATATTAGTCCAAGTTAAACCATATTGAGCTTATTCTGTGTCTTCCATTTTTTGGTTAGCTGGCGTTCTTCACAACAAGGATAATAGAGCCTTTTGAGGAACTCACATGGGTAGGTTGTACTCCACAATTTAAATTTAAGCTCCATTTCATGTGGACTATAACCATTTTCAGACATTCTAGTTGAATTTGCTTTCATCTTATGTTTTGGGCTTTTTGACCTTTTGGTGGCCACCTTGTGACTTGATACTCATTAGTGCTTTTCCCATAGATAGTATCCCCCCATTGTTTGGTTGAATCATGTAGCATATGGAGCACTACCTGTTGTAAGTCATTTTTCGAAGTTTGCCATGATCTTGTGTTTACCTGCAGGACTATGGGATTGATTTTGATGATGTCGACCATCCTGTGAAGGCATTCAAATGTCATTGCGGAAGTGAGTTTTGCCGAGACAAAACGCGCAGTAAGTTCCTGATGGCATCTATATGTGCATTTAGGAAGTTGAGGTTCTCCCCTAAAATATGGCTTTATTAATGCTGATTCTGTGAGGCATTTACCTTGTGTCTCCATATGTATAGATGAGTGGTTCTATGCTGCTGCACTCGTCTGGTTCATCAATGAAATTGCATTAGCTGACAAAAGTTTATATACTGCCACAGGATCTAAATCGAGGGCGCGGGTTTAA</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
