BGIOSGA008798

From RiceWiki
Revision as of 18:53, 20 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

BGIOSGA008798

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA008798, complete gene.

LocusTag

P0135D07.18

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA008798-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA008798-PA

Length

7304

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:29361788..29369091

Sequence Coding Region

29361788..29362089,29365756..29365811,29366293..29366513,29366589..29366985,29367543..29367628
,29368143..29368206,29368309..29368421,29368951..29369091

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:29361788..29369091 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:29361788..29369091 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGGGCTGGAGATGGAGGGGATGGCGGCGGCGATCGGCGTGTCGGTGCCCGTGCTCCGCTTCCTGCTCTGCTTCGCGGCCACCATCCCGACGGGCCTCATGTGGCGGGCGGTGCCCGGCGCCGCGGGGCGGCACCTCTACGCGGGGCTCACCGGCGCCGCGCTCTCCTACCTCTCGTTCGGGGCCACATCCAACCTCCTCTTCGTCGTGCCCATGGCGTTCGGGTACCTCGCCATGCTCCTCTGCCGCCGGCTCGCGGGGCTCGTCACCTTCCTCGGCGCCTTCGGCTTCCTCATCGCATGTCACATGTACTACATGAGTGGAGATGCATGGAAGGAGGGTGGCATTGATGCAACAGGTGCTTTAATGGTTTTAACATTGAAAATCATTTCATGTGCAATAAACTACAGTGACGGTATGTTGAAGGAAGAGGGTTTGCGTGATGCCCAGAAAAAGTATCGTTTGGCTAAACTTCCTTCTTTGATCGAATATTTTGGCTACTGCCTCTGCTGTGGCAGCCATTTTGCTGGGCCAGTATATGAGATGAAAGATTATCTTGAATATACTGAACGGAAAGGATTATGGGCCAGCCCAACTCCTTCACCACTATTGCCTACTTTGCGTGCTCTAGTTCAAGCTGGCGCATGTATGGGGTTATATTTGTATCTATCACCTCAATTTCCACTTTCACGGTTTAGTGAGCCCTTATATTATGAGTGGGGTTTCTGGCACCGGCTCTTCTATCAGTACATGTCAGGCTTTACTGCTCGTTGGAAATACTACTTTATATGGTCACTTTCAGAAGCTGCAATCATTATATCTGGTCTGGGTTTTAGCGGCTGGTCTGATTCATCTCCCCCGAAAGCCAAATGGGATCGTGCAAAAAATGTTGATGTTTTAGGTGTCGAATTAGCTACAAGTGCAGTTCAGTTGCCGCTTATGTGGAACATTCAAGTGAGCACATGGCTGCGATACTATGTTTATGAGAGGTTAGTTCAGAAAGGAAAGAAACCTGGTTTCCTCCAGTTGCTGGGTACACAGACAGTCAGTGCTGTCTGGCATGGTCTTTATCCCGGATATATCATATTCTTTGTTCAATCAGCATTGATGATAAATGGTTCAAAAGTCATATACAGATGGCAACAAGCAGTCAGCAATCCAGTCTTCCACGCTATCCTGGTTTTTGTAAATTTTTCATACACCTTGATGGTCCTTAACTACTCATGCATTGGGTTCCAGGTACTGAGCTTCAAGGAAACCCTAGCATCCTACCAGAGCGTATATTATATCGGCACAATTGTTCCCATTGTAGTTGTCTTGCTGGGTTATGTTATCAAGCCAGCCAGGCCAGTGAAGCCAAAGGCTCGGAAGGCAGAATGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MGLEMEGMAAAIGVSVPVLRFLLCFAATIPTGLMWRAVPGAAGRHLYAGLTGAALSYLSFGATSNLLFVVPMAFGYLAMLLCRRLAGLVTFLGAFGFLIACHMYYMSGDAWKEGGIDATGALMVLTLKIISCAINYSDGMLKEEGLRDAQKKYRLAKLPSLIEYFGYCLCCGSHFAGPVYEMKDYLEYTERKGLWASPTPSPLLPTLRALVQAGACMGLYLYLSPQFPLSRFSEPLYYEWGFWHRLFYQYMSGFTARWKYYFIWSLSEAAIIISGLGFSGWSDSSPPKAKWDRAKNVDVLGVELATSAVQLPLMWNIQVSTWLRYYVYERLVQKGKKPGFLQLLGTQTVSAVWHGLYPGYIIFFVQSALMINGSKVIYRWQQAVSNPVFHAILVFVNFSYTLMVLNYSCIGFQVLSFKETLASYQSVYYIGTIVPIVVVLLGYVIKPARPVKPKARKAE</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..302#3969..4024#4506..4726#4802..5198#5756..5841#6356..6419#6522..6634#7164..7304#ATGGGGCTGGAGATGGAGGGGATGGCGGCGGCGATCGGCGTGTCGGTGCCCGTGCTCCGCTTCCTGCTCTGCTTCGCGGCCACCATCCCGACGGGCCTCATGTGGCGGGCGGTGCCCGGCGCCGCGGGGCGGCACCTCTACGCGGGGCTCACCGGCGCCGCGCTCTCCTACCTCTCGTTCGGGGCCACATCCAACCTCCTCTTCGTCGTGCCCATGGCGTTCGGGTACCTCGCCATGCTCCTCTGCCGCCGGCTCGCGGGGCTCGTCACCTTCCTCGGCGCCTTCGGCTTCCTCATCGCATGGTGATGAAACTCTCCCCCCCTTCCATCCGCTTGTCTCCAGGGTTTGCATACTGCTATTGGGTGATTAGGATCGAAGAAGCCGTAGCTGCATGCCTAATTTGGGGTTGACACACGAGTAGGACGAGTAGAAAGAGAAGGCTAGGGCAGTTTATTTACAAACCAGAGGAATTTTTGAACGGAGGGGTATGTGGTGATGTGGCGGTGCCAGATTTCATATTCGAGCCGACTCAAACGATTTTGACTTTTTATTACTGGTACTCATGTGGTCCTACGTAACATAAGATTTTTACCGTGGGAACAAGGTCTTCTATTGAACTCCGCGTCGATTCGCTTGTATGCCTGCAAACTTCGAATTGGTGATCCTGTGAAGTTTGGAATGAATAGGTTAATCATTTGCTTTTCTAGTCCTGTTAACTGCAAAAATATAGGAGTGATGGACTTGTTGCAATAAAAGCTCATTACTACTGCTTGGATTGCATAGTCCACTTATATTTTTATCCGTAGTTTGGTGGCAACCCTTTGTGATGTTTTATTGAAATAACATAGTAATGCATGCTAATGTGAAAAACACATGGTCAAATATGAAATTTTGGTTACTGAACGTAAATGCAAGGTAGAGATACTCTAGGCTGAGATTACTATATCGGAACATTCTGAAGCTCCATATGCAGCCCAAAACAGATTTTATAGACCTGCTGTTTTTATGCCATCTTTCTCTGGTTTCTGCCGTATCTGGCTTCAGAACAGTTCAGGAAAGGCCCTTGCATTTACAGTTTATTTTGCAGAAATCTCATTTTATTTTCTTGGAGTATTAGTTCCCTGTGTTCAATTGCATGAGGATTGCCACTCTCCAATAGCGGCAATTGATGATTTTCCACTCATGTCTATGACACATGGGACAAGGCCCACATGCAGTAGTCTATATGTGGAAAGTCGTCAAATGGCCTATGGAGAACGATAAATCGTCAGTTTTCCTGATAGGCGTTATGTCCATTAAGTGCTGATGTAAATATTTCCTGGAATTCACTAATTCATGTACATGCTTATTCATCCATTTGTTACTCGCTTAATATTTGCACCTACGCACTGATGAACAGAAGAAAAGGGATAGCTTTTCATCTATACTAGTTTGGGGGTTTTTTCGTCGTCTTACCCTTCTTAGTGATCCACCGCAGTTTATATTTATGTGTATGAGGTGGAGGTTGGTAAGATAAAATTAGGATATCGGCCTGCTATCAATTCTTAAATAGCAGATCGTTAGTCTCCCAAGGATTTCTGCATTACACTAAAATATGGTTCAAGAATCGAAATCAGCAATCACGCAAGAGATCTTTTACTGGTGTTGCATCTAGTGTCCTACGATGTTCAAGCTAGGGTTATTGTGAATCTGCAAGGAATATTGATTTTGTTTTACTTGGTGTCATGAGAGATGGGATTCTGCAGGGTGAAGCAACAAGATAAATCACTGCAAAACAGAAAAGTGATGTGCAAAATAGTTGACAATGACAGCTGACAGGAGTGGTTCCCAAATATCCCCAAGCGTTAAGATGATAATGGTGCTGTTTGATTCACCTTAAATTATTTTGTTCAGTTGATTGTAACTGAGTATGTCAACTAAAAGAAATGAAGGGATTTAGTTTATTCTTGAAGGAAACAATCAAACTTGGAACTGGTGATGTTTTATTTGCTGAATGGCCTATTGATAGATTGGCAATCTGAGTATCTAAACCCACTCCAGTGACTATGCAGATATAGGTGTTTTCCTATTACAATCTCATTAGTATTAGTGTTTCCTATATCTCTAAAGAAATTCATCCTAAACTGCTGCAAGTATCTAGTAGGGTCTGCCGATTTGGAATTTCAAAATGAGATTGTGTCATTCCCTGCATAAGCAGTGTGAATCAGAAGCAATGATGTTATTCTAATTTCACGTAGAGAGTAATCATGTCTTCTGCTCCCTTTATCTCGTAGAGAGTGCCTGTCGATTTGGATTTGGAAATCCTAAGTTTACTATTCTAATTTCACTCCCATTTATGTTCATGCCTTCTGCTCCCTTTCTCTGGTCCGCTGATTCGAAATTTCAAAATGAGGTCAGGCACCCTAGATAAGCAGTGTGAATCAGAAGCAATGATGCTATTGTAATGTCACTCCCATTTATGTCAGGCTTCTCCCTTTATCTCATAGAGAGTACCTGCCAATTTGGAAATCCTAACGTTTACTAAGTTACCTTTTTATAAATGTGCTCCAATATTAATGGGCTGAGTTCTGTAGTAAGTTTTGCATTATTCTCAAATCCTGTTTTCTTGCCAAAAGATAAAACAATATGGCAGGCTGTGATGCCATGTTGCAACTAGTACCTAAGATGATGCCCGCTTTCCATTCTTATGCCATTGCATGCGTCAAACTAAGCATCTAACAGAGATTACCAAGAACCTGATTGAGACCTTAATTGGAAAAAAAACTGTTATTTTCCTTCATTCAACATTCTGATCAGCAGTCTCTGTCATCAAGATAAGGGAGAAATATCAAACATTCCACAATCAGATTGGATGCTGTAAACTGAAGTATGCTTATTTCGAATTCTTAATACATAACTGATTTCTATTTCTAGAAACCATAATTTCTCTGTTGGCGGGATCCTGATACCGTGTCCTCTGTCCGCACTCCGCACCCTAGTTTCTTGACTTCTTTCTGGTACAGTGGTACTAATGCCATTTTTTTGGTGGAACATGGAGCACTATGATGGAAAGAAACTACTGTCAGAATTGGGCAAAAACAAAATCTAGCTAACATATTAGATGACATATCCACGCAATATCAAGAAGATCAGCCACCAACAGGCGATCATCATAGTCCTAAATATTGTCGTGTTTCCACTTTACGCCAACTTTGAAGTTAGCTAACTCATCATCTGAACATATATGTATTTTTATATTAACTATTGTCCTGGCGTTGTTTACTCACATAAAAGGATAAACTATAATATATTGTCGTCTAGCACTTTATTTTTCTAGTGTGCTGTTTGCTATTATTTCCTTTATCTTCCGTAAAAAGGTATTCCCTTGTGCATATGCAAATTTTGAAAAGCAAACTGTTAGGGAACAAAAATGTCTTTTGGATCTGGATGGGGCTTCTTTTACAGACTGGTTTAAACTTAATCCAATTTATTATTAAAAGTGTGTTGTGGACTGGAATGTGGCTGGTTGGACACCTGAAGTGTGTGTTTGTAACAAGTGATTTTACAGTCCACTTGAGTAGGTACTGATAGGTACCCCATTTTATAGTGTAAAATTTGGTACCTCTTGATATCTCCAGTACTAGAAGGTATGAAAATTTGCACTAAAAAATTTAGTGCCTCTTGCCTCTTGGTACCTCTCAAGGGCTGTCAAATTTCTCATGTAACAAATCTTTTTACCTTTAACTCAATATAAAATTTGGTGGGCTATCCTTTGCCAGCTCCTTGTCTTTTCAAGTGCTATGGACCCATTCTAAGTAGCAGGTCAAACTGAGTCCACACCATTAAGACTAGGGAAACATTTGATTGTTAGGAATTATAGTTGCGGTATTAATGTATTCAAATTTAGTCATGATTTTTGTCTTGGAGATGCATGGAAGGAATAATAAGCAAATGCAGAGATCCTAACAGGTTTTCATCCTCTTATACAGTCACATGTACTACATGAGTGGAGATGCATGGAAGGAGGGTGGCATTGATGCAACAGGTATAATATAGTGCTCTATTGTTTCTCATACATATTTCATATAGTTAAACTATATTCATTGGTTAATTTTCTACATCATTTCGTTCTTTTTCTTCGGGGAAGTTTTTAGACCATATCTGATTTACATATTTGAAATAAGCATAGAAAATAAGACATGTATTGTTTTCAGATCCCTAGTATTACCTTATGGAATTTTACTCATCTGTTTTTGCTGCCCTGCTTCCTTGTAATTAAACACTGTTCCACGAGGATACGGTTCCTCTTTTCTAGTAAGAACTAGACCTTCCTTTTGAGGGTTTAGCTATAAAGGCAACAAATTTCATAATAACTTAACTTTTGAGGCTACATTTTGTCCATTCAGGTTAAAACATCAAACTTTAGGTTTTCTGGAGAAGGTTTTATTTGTGTCACCCCTAAGAAAAACATTGTGCTCTGTTTCAAGTGTCTTTCTGGAATTGATTTTTTTCTTTTTGCAATGCAGGTGCTTTAATGGTTTTAACATTGAAAATCATTTCATGTGCAATAAACTACAGTGACGGTATGTTGAAGGAAGAGGGTTTGCGTGATGCCCAGAAAAAGTATCGTTTGGCTAAACTTCCTTCTTTGATCGAATATTTTGGCTACTGCCTCTGCTGTGGCAGCCATTTTGCTGGGCCAGTATATGAGATGAAAGATTATCTTGAATATACTGAACGGAAAGGAGTAAGTGGCTTTTGTCTGCTTTGTGTGGATGATGTTATGTTTTGTTTATTACTGATATTTTCTTGTCTAAAACAGTTATGGGCCAGCCCAACTCCTTCACCACTATTGCCTACTTTGCGTGCTCTAGTTCAAGCTGGCGCATGTATGGGGTTATATTTGTATCTATCACCTCAATTTCCACTTTCACGGTTTAGTGAGCCCTTATATTATGAGTGGGGTTTCTGGCACCGGCTCTTCTATCAGTACATGTCAGGCTTTACTGCTCGTTGGAAATACTACTTTATATGGTCACTTTCAGAAGCTGCAATCATTATATCTGGTCTGGGTTTTAGCGGCTGGTCTGATTCATCTCCCCCGAAAGCCAAATGGGATCGTGCAAAAAATGTTGATGTTTTAGGTGTCGAATTAGCTACAAGTGCAGTTCAGTTGCCGCTTATGTGGAACATTCAAGTGAGCACATGGCTGCGATACTGTAAGTTCTGCATCCTGATGAAATCCATCATATCGTCAATATTTTTTTTAACTTTCTTTGTTGGATGATAGAATGTATTTTTATTGAGTTTACTATGTCGGTATGGAAAGTGCTGTTGTGCTTTCCCAAAATGGATAGCACGATTTTAAAGCTTACTGAAGATCTGATCGGCAATGACCTATTATGATCCATAATTCCACATCACTTCTACATTATGTGCAATTCAGTTTGCAGAAGAGCATAGAAACAATACTCTATTAATATGTAGTCTTGTTATAAGTTAATTTACAGTTTAAGTGGGAGAAGTCTAAACTTCTAATTTATGTGTTTGACCCTTGAAATTAACTAGTTGAGTAAGGAAAGTCCATCCACTTGAATTTTATTTTGTGTAAAATCTGGGTATGCACTAAACAGTTTGCCTTCTTTTAAACTGGATACCATTCGTTCAAGATTACTAATAAATATGAATTTTGAAAGCCTGAGCCGATGATATTCAATTTGAATACTATTAGTTCCATAACACTGATTCAACTATTTCAATTCCACTGTTATTTCAGATGTTTATGAGAGGTTAGTTCAGAAAGGAAAGAAACCTGGTTTCCTCCAGTTGCTGGGTACACAGACAGTCAGTGCTGTCTGGCATGTAAGTTTTATTTTTCATGAAGATTATATTTTGACTTTACTTTTTTGTACTTATCATCTATAGAATAGCGCCCTGAACATAATTCCATCAATACTTGCTATATGAAATTAGAATGCTGTATATTTAGAGCTTCTATTGTCCTAGTGCCCTAGTACCCATCTTTCCAAGTAGAGGCAACACAAGTAAATTGTAAAATGTCCTTTTCACTTCTGACATATTCTGATACTGTATTAAAAACTTGTTTTCTGACACTTTTCTCATACCAAGGATTAGGTAGTGCTTAATATTTTTCTAACTTCATCTCACATGAATATGTTGAGGCCTGGTTTAGTTCCCAACTTTTTCTTCAAACTTCCAACTTTTCCATCACATCAAAACTTTCCTACACACACAAACTTCCAACTTTTCCGTCACATTGTTCCGATTCCGTCACATTGTTCTGATTTCAATCAAACTTCCAATTTTGGCGTGAACTAAACACACCCTGAGTGATCTGATTGTTTCTGTTTTACAGGGTCTTTATCCCGGATATATCATATTCTTTGTTCAATCAGCATTGATGATAAATGGTTCAAAAGGTAGCTCTCCCTCTCTAATTTCAGCCGCTCTAATTTCCTGAGATGTACTCTATTAGTTAGAATTATGAAGTTGTAGTTGATCTGACATTTTCCTCAATGCAGTCATATACAGATGGCAACAAGCAGTCAGCAATCCAGTCTTCCACGCTATCCTGGTTTTTGTAAATTTTTCATACACCTTGATGGTCCTTAACTACTCATGCATTGGGTTCCAGGTGAGATTGAGCTTCTGAATCTTGTTTTACTTTATAGCAACTGAAAAAAAAAAGACTTGTCAGAGTGTTTGTTGAAATGAATCCTGAATGAAAATGTTGCATTTGCATACACACACAAGAAAAAAAGGTAGATACCATTGTTTTGATCCGTGCCTTTCATGACTAGTATATACATGTGGTTTTTGTAGTAACATTTTTAGTTTTTACTTTATCACCATCTTAAGAAAAGAGCATTGAAGCCTGAATGGTTCTTTAACTAAGTTTAAACAATCGTGCTACTTTAGTGATTTTAGTACCATGAAGTTATGAGGTTATGTAAGAGGGCAGCTTAAACTCACCAAGCACACCCGAAGAAAATACACTACTGTAGTTGCTGTCCTATTTTATTAATAAGAAAATACCGTGGGTTGAGTTTTGTGTCTCTTGACAGTAGTTCTAGTATTACCCTGTAATGTGAAAAGATGCCTTTCCTCTATTGTTTTGTGTATAGTTTGTATTTACCATGCTGTATACTCTTCGTTTCCTCCAGGTACTGAGCTTCAAGGAAACCCTAGCATCCTACCAGAGCGTATATTATATCGGCACAATTGTTCCCATTGTAGTTGTCTTGCTGGGTTATGTTATCAAGCCAGCCAGGCCAGTGAAGCCAAAGGCTCGGAAGGCAGAATGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA008798