BGIOSGA009390
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA009390 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA009390, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0033P04.23 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA009390-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA009390-PA |
| Length |
9892 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:40759246..40769137 |
| Sequence Coding Region |
40769096..40769137,40767900..40768172,40766054..40766199,40765805..40765961,40765502..40765560 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:40759246..40769137 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:40759246..40769137 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCAAATAGAATTGTTTCTCCTTAGTTATTCAAGTATAAATGCTTCCAAGAGTCGTTTCGTTGTGGGATCTCATGTCTGGGTCGAGGACCCAGATGAGGCTTGGATGGATGGCCTGGTAGAGGAGATCAATGAAAATGATCTCGTAGTAAACTGCACTTCTGGCAAGAAGGTCACCATTAATGTGGGAAGTGCCTATCCTAAGGATACAGAATCTCCCCGAGGTGGTGTGGAGGATATGACAAGGCTAGCTTATTTGCATGAGCCAGGAGTACTCCAAAATCTAAAGTCCAGATATGCACTCAATGAAATATATACTTATACTGGGAATATTTTAATAGCTGTCAATCCATTTCAAAGGCTTCCTCACCTCTACAACAATCACATGATGGGAATTTACAAAGGAGCTGAATTTGGTGAGCTGGGTCCCCATCCATTTGCTATCGCAGATCGTTCGTATAGACTTATGATCAATAATCGTATCAGCCAAGCAATTTTAGTAAGTGGAGAGAGTGGAGCTGGCAAGACAGAAAGCACTAAAATGCTTATGCAGTATCTTGCATTTATGGGTGGCAAAGCTCAGGCTGAAGGGAGGTCAGTGCAGCAACAAATTCTGGAGTCCAACCCTGTTCTTGAGGCATTTGGCAATGCAAAAACAGTCAGGAACAACAATTCAAGTCGTTTTGGCAAATTTGTTGAGATTCAATTTGATGACAATGGGAAGATTTCAGGAGCTGCCATAAGGACTTATCTTCTAGAAAGGTCACGTGTTTGTCAAATATCTGACCCAGAAAGAAACTATCACTGCTTTTACATGCTATGTGCTGCACCTTCAGAGGATTGCAAGAAATATAAATTGGGAGAAGCCAAAACATTTCACTATCTTAATCAATCTAATTGTATTGAACTTGATGGGTTGGATGACTCCAAAGAATACACGGATACCAGAAGGGCTATGAGTATTGTGGGTATTAGTTCTGATGAACAGGATGCGATATTCAGAGTTGTAGCTGCTATTCTTCATTTGGGAAATGTGGAGTTTGCAGAAGGAAGCGAAGCAGATTCTTCTATGCCTAAGGATGAGAAATCCCAATTCCATCTTAGGACAGCAGCTGAACTTTTCATGTGTGATGAAAAGGGTCTCGAGGAATCATTGTGTAAGCGTGTTATGGCAACACGTGGGGAGAGTATCACAAAAAATTTAGATCCACGAGCTGCAGCTCTTAGTAGAGATGCATTATCTAGGATTGTTTATTCACGTTTGTTTGATTGGCTTGTAAATAAAATCAATAGTTCAATTGGTCAAGATCCCGATTCAAAGATTTTGATTGGTGTACTGGACATTTATGGTTTTGAAAGTTTCAAGACAAACAGCTTTGAGCAATTCTGTATCAATCTAACCAATGAGAAGCTTCAACAACATTTTAACCAGCATGTGTTTAAGATGGAACAAGAAGAATATACAAAAGAAGAAATTGATTGGAGTTACATCCAATTTGTAGATAACCAAGAAATTCTTGATCTCATTGAGAAGAAACCGGGAGGGATAATTGCTCTACTGGATGAGACATGCATGTTGCGGAATTCGACCCATGAAACATTTGCTGAGAAGCTATATCAAAAATTTAAAGACAACCCTCACTTCAGTAAACCAAAATTTTCACGATCTGATTTCACAATTCATCATTATGCTGGAAATGTCACTTATCAAACAGATCTTTTCCTAGATAAAAATATAGATTATGCTGTAAATGAACACCAAATCTTGCTAAATGCTTCAAAATGTTCTTTTGTTTCAAGTCTTTTTCCACCTTGTGAAGAATCAACAAAATCAACTAAATTTTCTTCAATAGGATCAAGTTTCAAGCAACAACTACAATCTTTGTTGGAAACTCTAAGTGCTATAGAACCACACTACATCCGTTGCATAAAACCCAATAATGTTCTCAAGCCAGCAATATTTGAGAACAGTAATGTTCTCCAGCAACTTCGATGTGGGGGAGTTTTAGAAGCAATAAGGATAAGTTGTTTAGGATACCCTACAAGGCGGACATTTTTTGAATTCATTAATCGCTTTGGTATTTTGCAACCCAAAGTTCTAGGTCGAAGTCATGATGAAGTAGCTGCTACTAAGATGCTTCTTGGGAAAGCCAATCTTACAGGCTATCAGCCACTGGTAACCCACCACCAGGTGTGTGAGTGGAAGGAGTTGAGGGTGGGGAAGGGCCAACAGTATTTCCTGTGCCTGTACTATTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MQIELFLLSYSSINASKSRFVVGSHVWVEDPDEAWMDGLVEEINENDLVVNCTSGKKVTINVGSAYPKDTESPRGGVEDMTRLAYLHEPGVLQNLKSRYALNEIYTYTGNILIAVNPFQRLPHLYNNHMMGIYKGAEFGELGPHPFAIADRSYRLMINNRISQAILVSGESGAGKTESTKMLMQYLAFMGGKAQAEGRSVQQQILESNPVLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKFVEIQFDDNGKISGAAIRTYLLERSRVCQISDPERNYHCFYMLCAAPSEDCKKYKLGEAKTFHYLNQSNCIELDGLDDSKEYTDTRRAMSIVGISSDEQDAIFRVVAAILHLGNVEFAEGSEADSSMPKDEKSQFHLRTAAELFMCDEKGLEESLCKRVMATRGESITKNLDPRAAALSRDALSRIVYSRLFDWLVNKINSSIGQDPDSKILIGVLDIYGFESFKTNSFEQFCINLTNEKLQQHFNQHVFKMEQEEYTKEEIDWSYIQFVDNQEILDLIEKKPGGIIALLDETCMLRNSTHETFAEKLYQKFKDNPHFSKPKFSRSDFTIHHYAGNVTYQTDLFLDKNIDYAVNEHQILLNASKCSFVSSLFPPCEESTKSTKFSSIGSSFKQQLQSLLETLSAIEPHYIRCIKPNNVLKPAIFENSNVLQQLRCGGVLEAIRISCLGYPTRRTFFEFINRFGILQPKVLGRSHDEVAATKMLLGKANLTGYQPLVTHHQVCEWKELRVGKGQQYFLCLYY</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..42#966..1238#2939..3084#3177..3333#3578..3636#3739..3898#4290..4439#4527..4663#4756..4902#5018..5119#6061..6118#6225..6326#7111..7148#7226..7352#8087..8254#8335..8466#8885..8994#9095..9155#9806..9892#ATGCAAATAGAATTGTTTCTCCTTAGTTATTCAAGTATAAATGTAAGTCAATCATATCTCTCTTTTTTATGGAGACAAGCCAATCAAATCTTAGGATGCATTTTCTAGCCGATACCTCCTCCGCCTCCTCCTCCTTCTCATTGTACTCTCTACACAAACACTACTAAAAAAAGGTAAACATCATGAACCAATCAAATTTCTCAATGTGCCGCCTCCTCTCCCTCCACCACTTACTCCTCCTGTTATCGTGTCATGAATCATTGCTAAAAAAAGTAAACTCCAGAAGCCCACTAGATCTCATAATGAAAGCCAATTAAGGCCCTCAATTTGCTCCAAGACGACACTACGATCAAGGGGGAAAATTCACTCAGATTTCAATTAGGATGCGAACTCAGTATTTACAATGCTCGGCAAATTGGCATCACATTGCATTGTCGGGCTGTGCTGATCCTCTCTATCCTAGTCTTTGATTGTTTCGTCACGCGTAATGGTACCCATTTCTTTCCTTCCTTTTCTCTTCCTTTTATATACATATCAAAACAAATTTATGAGAATGCATTACATCTTTATTTTTCCAGCCTAAACCCTCTTCATGTCTTCTATATGTTTGAAGATGTCCAAATGCAATTAATCAACATAATAGTTTGTGCACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGCATGGGCTCATGCTAGCATATATTATAGCGAATATATATGATATACTTTTTATTTTTATTTAGCACTCACTGAATTATCCTCAAATATATGCACAGAACATTGTGATGCCATTTTAACACTCCACCAATTTCACTTTTTTTAAGTAAATTGAATTAGTTGTAGTATCTAAGTAGACAAGTAGGACTGTGTACAAATACCTATGCCTTTGTGTGTGATCGTTACTCCTCTTTCTCTATATGAAATCGGCTCCAAATACTCCATCTAATATTTTTTTAAACTACATTACAGGCTTCCAAGAGTCGTTTCGTTGTGGGATCTCATGTCTGGGTCGAGGACCCAGATGAGGCTTGGATGGATGGCCTGGTAGAGGAGATCAATGAAAATGATCTCGTAGTAAACTGCACTTCTGGCAAGAAGGTCACCATTAATGTGGGAAGTGCCTATCCTAAGGATACAGAATCTCCCCGAGGTGGTGTGGAGGATATGACAAGGCTAGCTTATTTGCATGAGCCAGGAGTACTCCAAAATCTAAAGTCCAGATATGCACTCAATGAAATATATGTAAGTTGAGCTCCCAACATATCATCTTTAGCTTTATTATTATTGTATCCAATGAAAACACTTTCGCTTATTTTTATAACTTCTTCCATGAACATTGTTTGTCTCGACATTGCTTTAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGGACCTATACTAAGCTGGTGTTTGAATCTCCTGAAGATGAAGATGAAGATAAAGATTAAGTGTTTTACGCAAAACGAGGTGGTAATAACGTGTGATTAATTGAGTTTTAATTATTACAAACTTGGAATTGGATTAATCTGATATTTTAGAACAACTTTCATATAGAAAGTTTTCGCACGAAACACACCGTTTAGCAGTTTGAAAAGCGTGCCAGTTTACCCAACTTTTGTTGTAGGTTCGAACAGGGCCTTGATACAAATTCTACACTACCATATTTTGGTGTTAGCACCACTAAAATAATCAGCTCAATAGAAACTAACCCATATCAAATATTATCATTGACTTAATAAAAAAAAATCCAATAAGATAAAAAAAAACTTTACTTGAGTTATCTATTTATTTTGCCCTAATATATAAGTAGCTTTGTTTCGTATTATGAAGTGGTTATATATACTTTAGAAAAAAACTCTTTACCCTTGTGAGTGCTGGGATGTCCTTATAGAAAATTGTTTATGCATGTTGTGTGCTAATCATCTTGGATGTGCTTGTTTGGTTAGTTCTCCTTATGGTTCCATAATTCTTGATGTCTTGGACAGCTGCATGGTCTCCAAAACTTCTCTTTGATTATGATTTTCAATTATAATATATTTTATAAAAATAAGTAAATGTTTCATTGCACTAAAGTACTTTTAGGGACTAATCTATACATCGTGTTCTAGTGTCTCCAAATTAAATGTTTTAAAAAATTATTGATAGTTGAAGTACTAATTGTTTGACCTCAATCTTTGTCCAAAACGTCAAGAATTATTTGACCAGATGGAGTAGAAGCAGATTAGCCAAATTATGTTGGAATTCTCCCCCCCCCCCCCATTTTCATTCCTCCATCACCTGCCTCCCTTCCTTGGTGGCACTGTTGCCCACCGCCTCTCCATGGGCAGCCCATTATTCCTTTTCCTCTTGACACTGTCGATGATTGGTTCATCAATGTGCTGCATGGTTGAGCAATTTTTTTTCTCAGAATCTGCATTCCCAGCTCCCATTCCTCTCTCACAAATGCGACTGCGCCGACGGGGAGCACGTTGTGACGGCAGCGAACTAGAAATGCATGTGATGGCTTGCTTTTCCAAACTACCCCACCCTCATCGCCCAAGTGTTGTCATCATCTGCGGGCGGGAGGTCTCCAGATCTTCGAGTTCATGGCGGATTCAAATCAGAAATGGTAGATAAGGCAGGACAAAACCAACCATGCATCCATGCCCCCCCCCCCCCCCGGTCCCATGCCTCCACTGCCATCTCTGCCTCATCCATCCTGTACCCACGTCGAGGACCGATGCTGCCAATGCTCTGAGTGGAAGAAGAAGAAGAAGCTATTTTTTAGGTAGGGGGCTAATCTTGTCTAAACTCACACTGTTAGGCCCAACAATGACGAATTCGGTTTTTTTTTTGGAGTGGGGGGGGGGGGTCTGCTACTTGGTGTTTACCTATGCTTGCTACCAATATAATTTTCTCAAATGATATTCATTTTCTTGTAGCTTCCCTAATGCATTTAAGCTCTTCTTTCAGACTTATACTGGGAATATTTTAATAGCTGTCAATCCATTTCAAAGGCTTCCTCACCTCTACAACAATCACATGATGGGAATTTACAAAGGAGCTGAATTTGGTGAGCTGGGTCCCCATCCATTTGCTATCGCAGATCGTTCGTATAGGTGGGTTTTCCTCCTCTCTCACATTATGGTGCCTTATTATATGTCACATATATATGGATCATACTCAAGTGCCCCTCTTGTTTCCTGTCTAGACTTATGATCAATAATCGTATCAGCCAAGCAATTTTAGTAAGTGGAGAGAGTGGAGCTGGCAAGACAGAAAGCACTAAAATGCTTATGCAGTATCTTGCATTTATGGGTGGCAAAGCTCAGGCTGAAGGGAGGTCAGTGCAGCAACAAATTCTGGAGGTACGTTTCGTGCCACTCCACTTTTTTTGGTGTGGGTGGGGAGGTGGGGGTGCTGACAGTAGAAACACCATACAAAAGTCATCCCTTAATTAATTTCATTTTAACATTCACTCTCATTAGTGGTTAGACACTTCACATTAGTAACATTTATATGCCTACCATCAAAGATATTCTCCTTTCAGGGCTAAGAAACAGTAGTGTACCATTCATATATGTTTCTAACATATCTATTTGGGTGACACAGTCCAACCCTGTTCTTGAGGCATTTGGCAATGCAAAAACAGTCAGGAACAACAATTCAAGGTAAACACAACAAAATACAACAAAGGTGGTTATTAATTTATCTTTGAACCTTTCAATATCTCTCTCTAACAATTTGGTTTTCACATGTTCGTGGTTTTGCAGTCGTTTTGGCAAATTTGTTGAGATTCAATTTGATGACAATGGGAAGATTTCAGGAGCTGCCATAAGGACTTATCTTCTAGAAAGGTCACGTGTTTGTCAAATATCTGACCCAGAAAGAAACTATCACTGCTTTTACATGCTATGTGCTGCACCTTCAGAGGTAAAAGCCTCGTCAATACAATCTTTTATTCCTAAATTTTTGTTGCACCCACAATTTTGGAACTACCAGATTTTATAGTTAGATTTTTGCTGTGGGTTTGTAATGAAAACATGTCATGTGGGTCCTATTTCTCATGGTAAATATAAAAAGAAGCTTGTGAGCATCTCAAAGGTTTGAAACGTATAGTGGCTAACTACTACGAGGTAAAATATGTACACTATTTCTTCCCTGAATAAAAATTTCACCTTCAAATTTTCATCTTCTAATTCTATCAAGCTTACAAAATGGCTAATTTTGGTTTTACCTTGCACAATTTGATCATTGTTTTGTTTTTAGTCCTTTTGACTTATAACTTGTTTACCTATAGCTTTGATATGTGAATGTTGATCAGGATTGCAAGAAATATAAATTGGGAGAAGCCAAAACATTTCACTATCTTAATCAATCTAATTGTATTGAACTTGATGGGTTGGATGACTCCAAAGAATACACGGATACCAGAAGGGCTATGAGTATTGTGGGTATTAGTTCTGATGAACAGGTATGACCAAGGTTTTACCAGCAATCAATTTAGTACATCGGGAGTAGAGGGGCAACATTACATTCAACATATATTTCCATGTCTTAGGATGCGATATTCAGAGTTGTAGCTGCTATTCTTCATTTGGGAAATGTGGAGTTTGCAGAAGGAAGCGAAGCAGATTCTTCTATGCCTAAGGATGAGAAATCCCAATTCCATCTTAGGACAGCAGCTGAACTTTTCATGTATTTATTTCTTCACTGTTTTAGTTTAGAGGTTTACCCAAAATTTCCTACTTCCATCCCTTACTTGGACATGGATTGGCTACATTTTACAGGTGTGATGAAAAGGGTCTCGAGGAATCA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