Os07g0218200

From RiceWiki
Revision as of 08:27, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os07g0218200| Description = Terpenoid cylases/protein prenyltransferase alpha-alpha toroid domain containing protein| Version = NM_001188173.1 GI...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os07g0218200

Description

Terpenoid cylases/protein prenyltransferase alpha-alpha toroid domain containing protein

Version

NM_001188173.1 GI:297725476 GeneID:9270657

Length

6030 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os07g0218200, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 7

Location

Chromosome 7:6548171..6554200

Sequence Coding Region

6548171..6548479,6550023..6550175,6550569..6550704,6550832..6551050,6551152..6551530
,6551794..6552055,6554132..6554200

Expression

GEO Profiles:Os07g0218200

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008400:6548171..6554200 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008400:6548171..6554200 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggcgccggctttccaccctgcgatattcggtgacttcttcatcaacaacgtccaaccatcacccaaagagtcagatgaatggatggaagagagagtagatcagttggttgaggaggtaggtagaatgcttgaggtttgcaaggatgatgtggtaaagcaaatgaacctggtggatgtgctccaacgtttgggaatagatcatcattttgaggagcagatcgacaccattctaaaaaatattcatagagctgagttcaatagctctgacctttacgaggttgcccttcggtttcgcttacttaggaaacaagggtattgggtctcgccagatgaattcaacaaattcaaagctgaagatgggagctttagtagtgatgacataactaatgatccgaagggcttgttaagtttatacaacgcagctcaccttctaactcacaacgagaaagcacttgaagaagctatattgtttgcaaggcatcacctacaattattgagaggcaacctcgcgtacccattggatgaacaagtaacacgtgcccttgagataccgttaccaaggaccatgaagagagtagaggtgctaaattatatcttcgagtatagcgctgaagagaaaatgttcaatccctctattttggagctagccgtgcttgatttcaatattctacaaaaagttcaccaaaatgaactcaaggaaatttgtcagtggtgggagaatctttcaagtgacattagactcgactacgtccgtgaacgtgtggttgagtgctatttttgtgcatacgctgcctactatgaaaaagagcacgcacgggcccgtatgatattcgccaagaggtgtatgctattttcactgctcgatgatacatacgatgtgcgtgcaactttagaggaggctcgcaagtttaacgatgctctgcaaagatgggacaagagtgacgtttcacttctaccagaggacctgaagagattttttctgagcataataagtaactttagggagtttgaggatgaattggaaccacatgagaaatatcgtaattcttacaacattaaagcgaccggaggtgcaatagagttacctgttagtttaattgttggcatgggtgatatagcaactaaggaggtgttggattgggccttggctaaccctgatgctggtagggcctttgcagaggtggcacgattcatggatgacttagctgcatcacacagtgggagggacaagatggatgtggcgagcactgtggagtgttacatgaacgagcacggggtgacgagagaggtcgccgaggcgaagatcgctggaatggctgaggacgggtggaaaagcatgaaccagatacgcttcaagcaccgcgcgttcctcccgttcgtgcagcggatcgccaacctgtgcatgtccgccaccctcctataccatggcaagaagaatggcttcagcaatagcctggagctaaaggatatgttcgagagccattttgttaacccaatcccgcttaatcatatagattacgattaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAPAFHPAIFGDFFINNVQPSPKESDEWMEERVDQLVEEVGRML EVCKDDVVKQMNLVDVLQRLGIDHHFEEQIDTILKNIHRAEFNSSDLYEVALRFRLLR KQGYWVSPDEFNKFKAEDGSFSSDDITNDPKGLLSLYNAAHLLTHNEKALEEAILFAR HHLQLLRGNLAYPLDEQVTRALEIPLPRTMKRVEVLNYIFEYSAEEKMFNPSILELAV LDFNILQKVHQNELKEICQWWENLSSDIRLDYVRERVVECYFCAYAAYYEKEHARARM IFAKRCMLFSLLDDTYDVRATLEEARKFNDALQRWDKSDVSLLPEDLKRFFLSIISNF REFEDELEPHEKYRNSYNIKATGGAIELPVSLIVGMGDIATKEVLDWALANPDAGRAF AEVARFMDDLAASHSGRDKMDVASTVECYMNEHGVTREVAEAKIAGMAEDGWKSMNQI RFKHRAFLPFVQRIANLCMSATLLYHGKKNGFSNSLELKDMFESHFVNPIPLNHIDYD </aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>5722..6030#4026..4178#3497..3632#3151..3369#2671..3049#2146..2407#1..69#atggcgccggctttccaccctgcgatattcggtgacttcttcatcaacaacgtccaaccatcacccaaagtatgtactgcaatatatgtacatgttcatgtacgtccgtgcatgcatgcattcgtactgttagctagctaggtaaaccatttttaccacgtacgggtggtaacctataaccataccctacgaacgtacaggcattcagtcaccgtacccacgcgtgatttaaaagttttttcttcaaactttcaactttttcataacatcgaacatttctacatacacaaactttcaattttttcactatatcgctccaatttctttaaacttttaattttagcgtgaaactaaacacagccaaaaataagcgatttatatataggcacagattccatatcgggaatctgctctctttatcacgtactactagtatgttacgtcctaccgtatatagttggatataactaccgacaaccacgatgtgattgtatgctattattttgacttaacctttcaaaaaattatgctccatatttggcactacagatggcatctaatgaaaagacataaacttatcccgttgacctctacaattttgatggagagcacgtctccatctgaggtggtttcaaaaaactctaaaatttatttcgttctaatagcttgtaacaaatattagggaatatgaaaatgtcaaatggaaaaaagcgctatcaactaaaaaaattttagatctcactgagagcaataaatttcgtataaaatttatgtgcatctaacttcatttgtgtaaaagtttttttctcttgaattatgttttttttaaaaaaaaattcttgaaggaggttcattaagagaaccatctgcagtaattcattagtacctatgtggttacttaagcaatccgtatgtgaaaattcatttatgattaattgaggtaaactattatctatgatccttacaatattttatttaacatgctatggtccatatttcgatagcatgtttctttcaatacaattgttctcctgtatcaagttccctatagagtttgcatgctatatacaagttaacataagtaattgaccacagtaaagcaaattttgtcagaaaatatagatcacccaatattaaaagaaatgttgcaatgatcttgcataactttggttcaacttaatcggacataaaatgcattttatatgaaatttgaaagcttcgacttccatatgattcgccaataaaaaattatatctgagagactgtactgaatatttggccaactaaacgatctcaagtggaaaaaacttgcaactacaaagatgcaggtgttgtcaagatctaattttgatagaacaggtatctatctgagttctaaagaaaatttcgacccctaaacaatctcacatgaaaaaaatttcaactacaaaatttatatctcatctagtgctacaattttcatataaaatttgtttttatccaacttcgtatgaaagacttatgatttttttctttaaatactattcctcccattttaaagggtggtttatagagctttttatagatagtaccacctataaaaattaccccacttttatcagcattttcatagacggttcactataggctaaacacccatgaaaattggtttatttgcatatgcagttttcttaagacactgcttgtcaaaatatgatttcacagacggtctaattaccggagactgcatcggtcatcttcatcataggtggttacaaattttagccacctctgaaaatggaaagtctagaagcaggaaaagttgttttttaagccgcgtatacaaagtgaaggattcttaacatcgcacagttaccgtaagattgttgcggttaccacatgcccttatcagtatttaaaacctcactgaatttcactcttaccaaacggtttttccggtaaaaccacatggtcgctgcagtaatcttgatactgccggctagcagtaacccccaccaaaatggtaggggaaatactcttcatacaactgttgtaaaattaaatattgttttaagattgtttcaaaatgatactttttacaaaataatttgttatgtgtttataaaagtaactacctgcctatatgtccttccatgtatcttgcaggagtcagatgaatggatggaagagagagtagatcagttggttgaggaggtaggtagaatgcttgaggtttgcaaggatgatgtggtaaagcaaatgaacctggtggatgtgctccaacgtttgggaatagatcatcattttgaggagcagatcgacaccattctaaaaaatattcatagagctgagttcaatagctctgacctttacgaggttgcccttcggtttcgcttacttaggaaacaagggtattgggtctcgccaggtacatatactgcaacagtgaattaaataccaataacacacttagactaaatgatgtatttggagtgtgggattatttttactccttcattggaaaatttcagtgaaattattctgttccacacgaatcttgaatttccattctttttgttatatcataatttcaatgacttgtgagaactgagaagtctactaagcagaatatgtacaacattagttattctaaattatttgattgatctttatggtctgtactgaacacagatgaattcaacaaattcaaagctgaagatgggagctttagtagtgatgacataactaatgatccgaagggcttgttaagtttatacaacgcagctcaccttctaactcacaacgagaaagcacttgaagaagctatattgtttgcaaggcatcacctacaattattgagaggcaacctcgcgtacccattggatgaacaagtaacacgtgcccttgagataccgttaccaaggaccatgaagagagtagaggtgctaaattatatcttcgagtatagcgctgaagagaaaatgttcaatccctctattttggagctagccgtgcttgatttcaatattctacaaaaagttcaccaaaatgaactcaaggaaatttgtcagtaagttttctagtctgcgccgctgttctccccacatgattttattactaatcattgtagcgagaaaatagaattaatatattatattatatatattataggtggtgggagaatctttcaagtgacattagactcgactacgtccgtgaacgtgtggttgagtgctatttttgtgcatacgctgcctactatgaaaaagagcacgcacgggcccgtatgatattcgccaagaggtgtatgctattttcactgctcgatgatacatacgatgtgcgtgcaactttagaggaggctcgcaagtttaacgatgctctgcaaaggtttggtctacttcaattcttttcttgcctttcgtttcgataagtaataattaataaagcagcacacgcacacgcacacatacgcagacacgtatattaattgtgtgtgctatataattatatgcagatgggacaagagtgacgtttcacttctaccagaggacctgaagagattttttctgagcataataagtaactttagggagtttgaggatgaattggaaccacatgagaaatatcgtaattcttacaacattaaagcggtaaaacgccagtctctagctccttatcaaagtacttatggccacgtactgttttcttggaatataattttagtgtatatctcacaatccaacaccataaaataaatttgccactacttaacaagtagtggaataatatatatgttaactaattaataatttagtggaccaataaacttgttaaaacctgggatgacaatcatgcattttacctacctgaaggtagaaaacactaattgtcttcttcgatcactagtttgtgcttatccccttttttttttttttggctacatgcagtttcaaatactatcgagcaatttcctccaagaagcagaatggtttcatcaaaactatattccatgctttactgatcatgtgactgtttccctccagaccggaggtgcaatagagttacctgttagtttaattgttggcatgggtgatatagcaactaaggaggtgttggattgggccttggctaaccctgatgctggtagggcctttgcagaggtggcacgattcatggatgacttagctgcatcacacgtatgtatgactaattaatattcatatgcatgtgtgctagctacccactaaatctggacacgtgtcacattccgaaatgttgttattttgagacggagaaagtaatgccatttaacgctactttttgaaaatacaaactatacaaaagtaggtcatttaattaatatcacgatcttgatttcgcttgtatcgatcatgtgcctgagcataaacaaataatactccctccgtatctaattatgcgtcacttttaaatttattcgatcaaaattttgaaacttcgagtctcaaacataaaattcgtgcagataattctttttctttataagcacatttacattattataatttagtgtcttgacccatattataatttagttagacatttaattatcgttatagtctaatagaaaattagtggtgaaaaattgcaccataggaaccaaataaagtcaataatattatatatttgaataccgagaatatattatatggctagccgacacctcaataaaagggaaaatattttacgaacaatgttccgagcatgttgtttattaagaacttagtgtacactggacgtgctcatgtccttaatatacattattttttgcgattacactagaggtgcaaacgactggcatagtactacacatgcacataacacacgaatgcacacaaacacatgcttaaaataacaaaggtcaatagcaaagtggtgggccactgtacaacctttggtatttctagttatgtgcaccccactttattaccggtttaaaatcccctttatttttattctcgatctttagtactggttgatgcatactaaatgaaaataatctgtcggatgtgggattcaaactcaagacttctctcacctcagtcctcatttgtgttaccatctcacctactatacataactaactttgatatagatgctttcttctttaactaacatgtactaaaaccgtaaaaacattctaggttggtgttaccatccggtatctttagtacgggtttggtttctccatctttaacttcggttggattggtaacaccaatcgaaagtagaaacgtttttgagacttcgacttttagaacaggtactgcaaaatatttttagtaccgattctaaatctaactgacatatttgtgttttgggtacaatgataaaaaatcggttttctaatagtgctcgaaagatgtagcagtattacttttatcaccaaaaagtaattaatttatcctgcgtgtaatgaggacaaaatgtatatgctacatgcaattaatgaaaatttagatggctacttggattctgattaataatttaatttatttattcatatatgttttggatatccgaagatgacatataggaccctcttcaaaaaaaaaagaatcagaaaaataaataaatattaaatacttttggatggagtattaattaattggcatatatatatatatatatatatatatatgtatatgtatatgtataaatactaactataaatatatgtattaattggcatgcatgcagagtgggagggacaagatggatgtggcgagcactgtggagtgttacatgaacgagcacggggtgacgagagaggtcgccgaggcgaagatcgctggaatggctgaggacgggtggaaaagcatgaaccagatacgcttcaagcaccgcgcgttcctcccgttcgtgcagcggatcgccaacctgtgcatgtccgccaccctcctataccatggcaagaagaatggcttcagcaatagcctggagctaaaggatatgttcgagagccattttgttaacccaatcccgcttaatcatatagattacgattaa</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os07g0218200, RefSeq:Os07g0218200