Os09g0459800

From RiceWiki
Revision as of 07:28, 21 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os09g0459800| Description = Similar to ARP protein| Version = NM_001069918.1 GI:115479578 GeneID:4347279| Length = 11844 bp| Definition = Oryza...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os09g0459800

Description

Similar to ARP protein

Version

NM_001069918.1 GI:115479578 GeneID:4347279

Length

11844 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os09g0459800, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:18030721..18042564

Sequence Coding Region

18031026..18031080,18032038..18032211,18033057..18033238,18033674..18033779,18034070..18034146
,18034847..18034934,18035682..18035871,18036715..18036841,18036946..18037026
,18037177..18037278,18037404..18037499,18037641..18037715,18038108..18038227
,18038681..18038809,18039124..18039201,18039692..18039778,18041927..18042013
,18042100..18042150

Expression

GEO Profiles:Os09g0459800

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008402:18030721..18042564 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008402:18030721..18042564 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggagctgaagcccgggatgtcggccctcgtcacgggcggcggctccggcatcgggaaagcactttgcattgctcttgcacagaagggtctatttgtgacagttgttgatttctctgaagaaaatggaagagaagccgcttcattagttcaaaatgaaaataaaaagtttcatggagatcttaaagttccaagtgctatgtttattaaatgtgatgttactaatgcaggtgatctttctgctgcctttggaaaacatgtggacacatatggtggactagatatttgcatcaattgtgctggaattgccatcaagacactagtttatgatgatagatctgatggaactagcacatggaggcatgctgtaaatgtgaaccttgttgctgttattgatggtactcgcattgcaagtcaaattatgcgatctgggaagaagcctggtgtcataataaatattggttcagccgcaggcctttatcctatgaactttgatcccatatatagtggaacaaaagctggcgttgttatgtttacaagatcacttgctccattgaaacgccatggtatacgtgtcaatgtactctgccctgagtttgttcaaactaatatggcagagcaactaagtcgtcgaataatagatgtaactggtggatatataaagatggaagacattgttaatggtacatttgaacttataaaagatgaaagcaaggctggtgcttgcctttggataactaaacgaagagggatggagtactggccaacaccagaggaacaaagaaagtatatgctcaatcttcccaagtcaaaaaggatgttaacacaaaataccttttcgactgtccaaactcctgagttctatgagaagatagttgttcacacacttagccataattttcgcgatgctacaagacttgaacgtgtgcgcttgagattgccggttgaaccacacaatgctctggtcaaaataatatacgctggtgtaaatgctagtgatgttaacttcagtgctgggcgttatttcagtggtggtgctaaagaaactgctgcacgccttccgttggatgccggttttgaggctgtgggcatcgttgcatctgttggagattcagtgaaccatattaaagttggcagtcctgtagcccttatgatttttggggcctattctgaatttactcaggttccagccaagcatcttcttccggtgccaagaccagatccagaggtcgttgctatgctaacatcaggattgactgcttcaattgcccttgagaaggcaggccaaatggcatcagggcaagttgttctagttacagctgctgctggtggaacaggacaatttgctgtgcagctcgcaaaactagcaggcaacaaggttgttgccacatgtggtggcaaatgtaaagctgcacttctgtcttccttaggagttgatagagttatcaactaccaaaatgaaaagatcaaagatgttctgaaaaaagagtttccaagaggagcagatatcatatatgaatcggttggtggggaaatgtttgacttatgcttgaatgcacttgcagtccatggacgccttattgtaattggtatgatctcccagtatcaaggagagcatggatggaagccacggaactacactggactatgtgataagattcttgctaaaagtcaaactgtggctggttttttcctaatccagtatgctcacttgtggcaagatcatcttgacaaactttttgacctgtatgcctctggaaagctaaaggtttcccttgacccgaagaaattcgtgggtgtagcttctgcgcctgatgcggtagaatatcttcattctggcaagagtgttggcaaggttgttgtgtgcattgatccgtcatacagtcagacccttgctaagctatag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MELKPGMSALVTGGGSGIGKALCIALAQKGLFVTVVDFSEENGR EAASLVQNENKKFHGDLKVPSAMFIKCDVTNAGDLSAAFGKHVDTYGGLDICINCAGI AIKTLVYDDRSDGTSTWRHAVNVNLVAVIDGTRIASQIMRSGKKPGVIINIGSAAGLY PMNFDPIYSGTKAGVVMFTRSLAPLKRHGIRVNVLCPEFVQTNMAEQLSRRIIDVTGG YIKMEDIVNGTFELIKDESKAGACLWITKRRGMEYWPTPEEQRKYMLNLPKSKRMLTQ NTFSTVQTPEFYEKIVVHTLSHNFRDATRLERVRLRLPVEPHNALVKIIYAGVNASDV NFSAGRYFSGGAKETAARLPLDAGFEAVGIVASVGDSVNHIKVGSPVALMIFGAYSEF TQVPAKHLLPVPRPDPEVVAMLTSGLTASIALEKAGQMASGQVVLVTAAAGGTGQFAV QLAKLAGNKVVATCGGKCKAALLSSLGVDRVINYQNEKIKDVLKKEFPRGADIIYESV GGEMFDLCLNALAVHGRLIVIGMISQYQGEHGWKPRNYTGLCDKILAKSQTVAGFFLI QYAHLWQDHLDKLFDLYASGKLKVSLDPKKFVGVASAPDAVEYLHSGKSVGKVVVCID PSYSQTLAKL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>306..360#1318..1491#2337..2518#2954..3059#3350..3426#4127..4214#4962..5151#5995..6121#6226..6306#6457..6558#6684..6779#6921..6995#7388..7507#7961..8089#8404..8481#8972..9058#11207..11293#11380..11430#aacgcaaaactaatcacctgtgtatgtaaaccgttgagtcatccccttcgcgtgcgtcacgttccaaatcaaacggagatcgggagaagagaccgaacagtctgaactctgaagctggtcaacaatgaggacgagataaacaagcttcctgcctactccgaccttccatcctcgcgttctccgtcgcttcgcctctctccccggctcccccaaaccccaaaccccagctcccgtctccgtctgcttccccggccgcccgagctcccccgtacggccgcaccccacccatccaccccgccgccgggatggagctgaagcccgggatgtcggccctcgtcacgggcggcggctccggcatcggtgaggatcgatcgcctcttccctgtctctctctctctctctctctttctgcgcgtccacggttcacgaaagcccctggtcctggggtctggacgcgccttgctgtttgtacgtattgctgttggatgggattgggtgatgcttagtttgtccatggctcgcgcgctggtcggtctgattttgtgccccaatcatcagttcatgagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgcgtgcgtgtgttttctaaattctaatggtgcgagaaatgggggaggagcggctagttatgcggggtggtacttgggatcggaggtgaacaggtgatgatggtccattgatccctgtgatgggtgcctttctggaaagcgctgtatgatggttgtagcattattagcaaacggaggttgagggcttgtacttgtaatgcttatggttcaatggttgtgttaggcagggtgaaagtgaactttgagcgacacaccgacgcaataacttgttgtgtatgattgttatgccccgtacataatactacggaggaattagtctagtagctagcagagtacctcacatttcccctttctcttttcgttgtccctgaaactgaaaggatagcgggcacccggtatgctcctgctggcaactgtcagcatgtcacttgtattgttgtactctgatttggtaccttgtatatgctgtcatttgtatgatgaatataaatgaatccctgctgtttgttcagtatcagtgtcaaatttgagcaaataaatgtgttggggaaatgcaacaactagtatttaagtccgcactcatgaagtttgctactaggatatatttgctgacaacaagtatcttctcacattcatgatttaattggttttctgcagagtagatgaacacttccagcatattcttataatgcattgactgaatattcttttaaaattttccagggaaagcactttgcattgctcttgcacagaagggtctatttgtgacagttgttgatttctctgaagaaaatggaagagaagccgcttcattagttcaaaatgaaaataaaaagtttcatggagatcttaaagttccaagtgctatgtttattaaatgtgatgttactaatgcaggtaagagtcttgataaggacaattaatttgtttgtgtacctcgttttcgagatcacacttgtagctgttttcctggtgctaaatgctttgataacaatcaacacacatgtcagaactaaagtaatttaaaaacttggcagatatcaaaagactggcgaagtgtgataattctttagaagccaattgtaacatagtgttttttacataacatataattctttgacttctaagtactactacgtactagctaaaatctgttctgaaacgctaatttaaaaggcatccctgcagtgtttcagaagtatgataactatgatttaacacctaatgattaacatggtattgcttccttttggttttaaaaagtactccctccatcgcataatataaggcgcccacgcatttcaagattccaccttcaaaacattttgaccaatatttagtataacatgaattgaattttacttgctaaaaattatatcattggattgacatttgaatttactttcatatggttatagttttgttactacaaaccttataatatatgagaaattataaaacaaagattagttttggagaccgtgtcaagtttgacaatgccttatattatgggatagagggagtaacatatttctattagctatgccttatttgtaccatttttctgtgtgagagagcaccaaatcctttgtctcgttggactggaactcaggatttcttgttgtaattgtattgttttgatttattttatcattggatttccaattgcatgtagtatagtttcaactgttaacttaaatcacaatcatgaaaaaaatgtgcatttattttatcatatgtaggtgatctttctgctgcctttggaaaacatgtggacacatatggtggactagatatttgcatcaattgtgctggaattgccatcaagacactagtttatgatgatagatctgatggaactagcacatggaggcatgctgtaaatgtgaaccttgttgctgttattgatggtactcgcattgcagtaagtctatcaggaactggttgaatataattcacttaaacagttactgctagaccaagtgattgatgcctgtctactatgtttggatgtattaacatatgattaggaatggcacatatggtttttgtatctgttgatccatttgtggaatacagaagggggttattgttttttctttctttatttattttcatctattattatcagaggaagttaagtggtaatagattttcacaatgtaacctgtccatagagtttctttgagagaatgaactagagtagcattttggatcaatgacaattgacaaatcatgccaattattgatatttggattcttcgttgtgcatttcttctcaacaactaatatgtttaggatgctattttttttagttcatgcaagcaccatatatacttacagttatttttttcaccagagtcaaattatgcgatctgggaagaagcctggtgtcataataaatattggttcagccgcaggcctttatcctatgaactttgatcccatatatagtggaacaaaaggtgcatatacaatcacatatataattcttattttttgggcagaagattgctgttgcaatgaaagtccaacttggattataatttgatcatttatttgtgaaaaataatatgcatgctaactgtttatctagatggttcaagattctttgcaattacaacttgtacatgatccacatgttgataaagatatatggccaactgtattttccaatattaactccacattcattttatattatcaaatatgtttttcacgctatgccactgtgatcgcaaatattgtatttcagctggcgttgttatgtttacaagatcacttgctccattgaaacgccatggtatacgtgtcaatgtactctgccctgaggtatgaatatattacataactagaggcaaatatgaaatatttatttatttttgtcatttctgactcatagtattccagcatatgtattctgtccaaaacttgtgaatttgctgatatgtttggtagtatatcagaatattaacttgatgatggtacaacagacagcacacccagctgtgctctctgttacataagttcttattacatagaaatattactagaatgatcacataaagctttccatagggccaactctactatttcttagaaaaagaaagacgaaaagtgattggtcactacttggattctcaaggaccaggagcagatatccttatgaccatccgtgcacccattaaaattgcaagccttatataactctcatttttagttgtggtagagttgtatgaacatgtagtattgtagttgagctcacaggtaaaattaactaagtgggcaaaagttgatgataattgcatatgagaaaaaccgtggatatctggaaagagttgatatctgcaacttgataatttccagattgcagaatctccaagtcataaattcacatggcttcaaatttatcctaaacaaactgttctatgattctatcattgtctcattatcaaacgctggatgctgtgaaggcaatgatgctccatgatcattatcaaacatgatctattttatggtttgttatgtgcagtttgttcaaactaatatggcagagcaactaagtcgtcgaataatagatgtaactggtggatatataaagatggaagacattgttaatggtatgtttctcttacctttttgagcagtaggtacgtctgtatgtgtgttctccacttttaaccttgtgaccataatttgtgtgtcacagtttatacaggcatgttcaacattctgatgaataattctattgcttttgttgagatggaatgctttacttgttgaatcaaatgtagacatctgcgcacatttagctatgtaaaagatatgtgattccattattttgatttgagcaaagacataaagtttgaggtctataaacttccatgagtatttaactttagtctcggagcttgagagctattcaactaggtccttcaacttataaaatcaagtgatatcatcactactttgttcgcatacccattgataaccatatgagcaactgaatgtataaatttccgcaatgaaaggagatcacaaatatgcgatagactttactggcatgcaaatatctaaaacctgatatcctggtctgtaaaatggacatagcttttcttgggatggatccatgtgcctatgccaaatgtccctgtcaggttggtattgtgtttgacgggactcgactagttgacctccttataccactgaatgtgtttagggacctaagttctcaatcctagggggtcaggtaatacacctatgcaattttagttatctactgtggtattttaacccctattgatgcatacctcttgtttaccctctcttttggtttgctgaaaagaacccatttttatttggattaggtacatttgaacttataaaagatgaaagcaaggctggtgcttgcctttggataactaaacgaagagggatggagtactggccaacaccagaggaacaaagaaagtatatgctcaatcttcccaagtcaaaaaggatgttaacacaaaataccttttcgactgtccaaactcctgagttctatgagaagatgtaagtagtcctggtatgctattattattattatttctgaacacctgaattctcaagtaaataacttgccccccaatgtttatttttttggtgtgcgttaagagtccttccctacaatggttgaaacctgagttaatacctcagagctaatgtttttcataacaatgcaacatttgctagttgaaaaaaaaataaaatatgtgcctgcaaacacatttaccatctggtcatgattgtgtcctcgtaccttctaccttgatgtcagctagtacagatgtgatcagcataggtcatgattgtgtgaagcatgagctcaccaagcgtattggtgttgatgcttcttacacacgctttcatcatacaatttgtgaacttcggtgggcatgcatttagtacttgtattactgtaattttcccatattttaagtactgtaaagttgtctcttgcatatctagaccctttggtgcatttccaacacatgctcaattcatttcaatctagaagacaaagtttcattttgttatgtagaagtgcaactattgataacccagcaaaaataataatgattttaccatatggatttctctgtgaaatgtttgtttcttagagatgattaggagtgccattttgtggaatccgtgttcgtgttatctatcatctataatggactaatggttcaaatataaatatggtgaacaataatattgcctaccagtttttatgtttcacaccttggaaaggtcctccgatacctatggtagtttttatgccagcaatttttttacaagaatattcaaaatggaatttatttattaatgatctgtttcttgattatcatgcagagttgttcacacacttagccataattttcgcgatgctacaagacttgaacgtgtgcgcttgagattgccggttgaaccacacaatgctctggtcaaaataatatacgctggtgtaaatgctagtgatgtaagtccttggattcgtattttccaaatgttttcctcttgatttctcgttgatcagcgttcgcgaagatttctcgttgatcaacctttcatggcgcttttcaggttaacttcagtgctgggcgttatttcagtggtggtgctaaagaaactgctgcacgccttccgttggatgccggttttgaggtgatggatgtcctcgtacttctgtgttaaactttttaaaggatgctcaatgttggttaatgtttttaagatatacaactacctcctctgccttttattttcccataatattccttagccttttctcatgagaaattctaatttatgcaggctgtgggcatcgttgcatctgttggagattcagtgaaccatattaaagttggcagtcctgtagcccttatgatttttggggcctattctgaatttactcaggtattacattctatgcatctgtgttacacactaaattaccaatgaccttcaccactccttcaatggatcatttccagcatccatctatcagttcaccttttgactttacatctttatgattaaaggttccagccaagcatcttcttccggtgccaagaccagatccagaggtcgttgctatgctaacatcaggattgactgcttcaattgcccttgagaaggttagtatacagttcttttgtttctttgctacataacatgtggctttgacctcatacttggtgaaccaacgtttaagtttggtgtggtctacatgaatataacttcattatctgatttgcgttgatttctgctgcctttaggcaggccaaatggcatcagggcaagttgttctagttacagctgctgctggtggaacaggacaatttgctgtgcaggtcagttgatgttgacactattactatgcctttactcttgatttagtgcaatgctcaactctgcacctccgtctatagtttatctgggaggtgttattatgtctcgaatttcattttggaatttccacaagataactgtttcatctaagttaggacatgcatatataatgttcttttttcatagttattaacacttgggaccatgaatttggctccttccctgtaccttttgctgcagtatatatgatgtttctaggacacatagtgacacagacaatgttatcatctttgattttatatttctgtctgcatgttattctgttttctgtcggctgttattaaccctgaatcatatcactgtatgctgactattttatttattgcttcactagctcgcaaaactagcaggcaacaaggttgttgccacatgtggtggcaaatgtaaagctgcacttctgtcttccttaggagttgatagagttatcaactaccaaaatgaaaagatcaaagatgtaagcttgctcaaacttcacttttaatatctctacacttagaattgatttttttcatactgaatactttgtgttttatgtttctaagcttggtagcatctttctttagggtgtattgacataaaggatgaaccaaatatgttgtctagtccaaagtcttaacttatttttctgttgtgtttgtggacttctacatgcttctgttgaatcttgcagaatgctataatcctcttgttcaacatttcatgtgctactgataatgcctaatgtttgttgtgaatacttgaattacatttatttgtgatgtatatgtagacaatctttatactactgtagtatttctgaaactatcactctcaaccttctagtggctgtaagctatttacattgactgtataagttcgttttagtgagggtttagcaattagtgatcttttgaatatctgattccaggttctgaaaaaagagtttccaagaggagcagatatcatatatgaatcggttggtggggaaatgtttgacttatgcttgaatgcacttgcagtccatggacgccttattgtaattggtatgatctcccaggtatggttgacagctgaaactcattttttaatttatcatatgttgtgaatatgggaatttagtaaccactgcgcatgaatgaactatccaagtgagctttatgggaattttgttctgtacttcgcctgaaaagaaaaacatttgtaataggaaacttggaggtgtagctaggaaatatcattgaactgtagttgttctgatgacacctattggaactagtgcttattaccctgtttagcttgtagttattttaaaatgccatggcttttaccaattcataacgaacaatcaacaatctttgtttttcttttcagtatcaaggagagcatggatggaagccacggaactacactggactatgtgataagattcttgctaaaagtcaaactgtggtatgtgtgatgtaggcattagaccaacctgaacccttttcgttggcatgaagagcacttatttaatatccatttaataatttgatcagtaaacaatgattcatcataccgagaatgttgatctgatgatctctaaacttggaccggctagagttttcaaatactttgactgctatttgtatatcgatgaatttgtaaatacttaaaagtatataatattaataaagtatgttgcatggcaatgtaataatacagcaatcattcatcgtaaccaaataatccagggccctgcatgagacatgggaaaattttcaaattcctgtctaattctcatgttccaacaggacctagaaattactagtggctaaaatttgaatgataagttgatgatgtcaagcaaatgaattgtatgagccagtgattgtgatgtactaatacgattcttctggaatgtcctaacactaacgagttctttccttgtcaacttcaggctggttttttcctaatccagtatgctcacttgtggcaagatcatcttgacaaactttttgacctgtatgcctctggaaagctaaaggtatgcctcgagcctccaatgtaaatttctgtttggccctatgcatgactagggtcaaaacgaagctacatcagtaggacctttatttgggtgatgaggcagaaatctaacgaagatacacaaataacaaaagccttaaattattctaccatttcttgtttctcttcatactgttctggcatccacaatcttatgaaaatgtaggtattaggcaataaagtattcccatgacctggtaataagcattgtggaagtggatagtaataacaaatactaataagtagtaagcttatgacccagttgtaagaataaaaaaaaataaaaatctctttctttcttctttctctctctctcttttcaacacaaggatgtgcttctactgcatgctgagttggacaaaaacaactgaaaaagcaatacagtacttttttctcatggcatgggacccactttacaaaggcctactaccttaacctgctacttttattgcctaactaggcaagatacattggtgttgccatatgtacaaaacattgcactattgtattgcttttaaataatgccaaagcacgtagtcccggcctcccaggtgaccagtcttatcactgtctcagacatctaatgcttttcaaatttctattttagattttctcaaaaactttactggagtctttgttttcgcttttcaaattggaactaaacgtttgaagtactacttgaagtaaagttttgggactccagtatcctatctagttgggaaccacttggaactagaactagcctcaaagttcttttatgcaggataatcacacacatttaatttggtattatttctattcttcattttattttccatatgataaattctacttttggccttgaactattcttcatgcccccttttttttcacttgaattcaaaaccatttgtcttcacacccaattttcaaaatcggataaataacaccttagcagtggttttcgttaggacaggctcatcattatgcatgttttagtgacttaggtgccacttaattgggtacacatcaacgtatcttaaatcatataagttcaggtcagcaggaacaactaccatgtcaaccacaaccaccatggaatagtgctcggttttgttagttgaggatgaaaaataacccctttttcattcaaggtgaaaattaggctccaacaagagttgagggccaaaaatagattttgccctagctatataatatctgtatttaccttattctgcaaactaaatatttgagtctgttctactcttttttattttcagtattctcagcttctcatttagctttttggatagatcactctcgcctaataatccgcttatgatgtctgccctcgctttgtgtaagatggttaacgagaggattatagtcagactcgactggatttataatctggttcaaactcctgctaacgagtaaggcggtactatcactactgctgcttgctcgcttactctgatctctttcttcgttctctgctccttctctctccctattgggccatcagtgagcaatcagcagccctgggcttctgatctttgaggagtagctcttcttcctttgattttatcagtaatagggcccctttgaatcacaggaatgaaaaacggaggaataagaaaagcataggattctgatagaaatacaagtgtaaaacagaggattgcaaaacacaggaaaaacataggaatggccatttgattgagccgcaggaaaaacacaagaatttaaagatagataaagactcaaaagattcttaacatgaggtagttcctccaaaacttgcatgggaataggcattccgtaggaatttcatggtattacataggattcattcctttgattcaaagggctatgtaagaaaaatacctatagaaatgaaatcttttaaaattcctataaatcaaagggggccttgttattatgtgtgttacgttttcctaaccagcattggcacgcaacttcctaaagtaatagccagcattggcacgcaacttcctaaagtaatagccagcattggcacgcaacttcctaaagtaatagcgaatatgtataatatatatatgctttttatttgcaaatttagctttgcatgacacgatgcatacaacaggtttcccttgacccgaagaaattcgtgggtgtagcttctgcgcctgatgcggtagaatatcttcattctggcaagagtgttggcaaggtaccatcgcttatatgatgaaatatgattctgttcttatcttctcaaatgtgacttaatagatttttcttctggaacctttccaggttgttgtgtgcattgatccgtcatacagtcagacccttgctaagctatagtctgtggacatgagatacatcatatttcatcgtctagtcacgaggaagaacagtgcaaaaaagacaattacacaggctatcggcataccgtacaaccttgggcttcttgctccgttttgttgtctgtgtgcgtagctgaaacattcccatatttaccccagccgggagaaaccgaataactgcatatgttgtatagctcagttgtctgagtttgtgggaatagctcaattgaatgttatatataagatcgttccatgctcattgtcaaacttatcttggaaaacaatgctgtgtagaactagaatattttcttctgtggcagggagccctttgtgtatccgtggggatcatctaactatctaagcacacataaggatgtgcttgcaagttgcaatccaggcctgaaaattcttg</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os09g0459800, RefSeq:Os09g0459800