BGIOSGA009580

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA009580

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA009580, complete gene.

LocusTag

OS03G0812000

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA009580-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA009580-PA

Length

13084

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:38365203..38378286

Sequence Coding Region

38378204..38378286,38377037..38377106,38376794..38376859,38376213..38376318,38374755..38374900
,38374577..38374663,38373741..38373811,38373539..38373647,38373374..38373436
,38373056..38373121,38372815..38372903,38371623..38371671,38370950..38371036
,38370785..38370878,38369554..38369624,38369377..38369466,38368899..38368982
,38368580..38368705,38368327..38368484,38367808..38367889,38367563..38367727
,38367371..38367472,38367059..38367180,38366332..38366452,38366013..38366067
,38365817..38365916,38365203..38365359

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:38365203..38378286 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:38365203..38378286 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCCTACGCCATGTCGGTGCTGCTCGGCCGCGCGCTCCCCGACGTCCGAGATGGGCTCAAGCCAGTGCACCGCAGGATACTTTATGCTATGCATGAGATGGGTCTTGCATCCCGTAGACCATTCAGAAAATGTGCAAGGGTTGTCGGTGAGGTACTAGGTAAGTTCCATCCACATGGAGATTCGGCCGTATATGAAACCTTAGTACGGATGGCTCAGGACTTCTCAATGAGGTATCCACTTGTTCAAGGTCATGGAAATTTTGGTTCCATAGATGCTGATCCTCCTGCCGCAATGCGATATACAGAGTGCCGCTTGGATGTAGGTTGCTTCTTTTTCTTGGACATTGATGCCATTTTTATCATTGGACAGGTTGACTTCGTCCCAAACTTTGATAATTCACAGAAAGAGCCTTCTCTGTTGCCAGCTCGTGTTCCATCTCTATTGTTGAACGGTTCTTCTGGAATTGCAGTTGGAATGGCAACAAATATTCCTCCTCATAATCTGGGTGAGCTTGTTGATGTGCTCTCTGTTATGATTGAAAACCCTGAAGCTACTCTCCAAGAACTACTAGAATGCATGCCTGGACCTGACTTTCCTACAGGAGGGACAATCGTGGGAAATCAAGGTATTTTGGAGGCCTATAAAACTGGGCGTGGTCGAGTTGTTATGAGAGGCAAAACTGACATCGAAACAATTGATGTGAAAAGCAAACGCTCTGCCATTATAATTAAAGAGGTTCCATACCAAACGAATAAATCCACTCTTGTTGAAAGGATAGCTGAGCTTGTTGAAGAAAAGGTATTAGAAGGCATCAGTGATATTCGGGACGAAAGTGATCGCTCTGGAATGCGTGTAGTAATAGAGCTGAAAAGAGGTGCAGATCCTGCCATAGTTCTGAACAACTTGTACCGTCATACAGCTCTGCAATCTAGTTTTAGCTGCAACATGGTAGCTATCCTTGATGGGCAGCCAAAATTGATGGGACTGAAGGAAATTCTTCAGGCATTCATTGACTTCAGATGTTCTGTTATTGAAAGGCGTGCAAGATTTAAGCTTTCACAAGCTCTGGAAAGGAAACATATCGTTGAGGGCATTGTTATTGGTCTTGACAATTTGGATTCTGTTATCCAAATAATAAGAGGAACATCCAATCATGCAATGGCAAGAGAATCTTTAATCAAGGAATTTGGTCTGTCTGACAAGCAAGCAGAAGCCCTATTGGATATCACACTAAGGAAACTTACTTCCCTTGAGCGGAAAAAATTTGTTGACGAAGCTAAATCTTTGTCAGAGGAGATCTCCAAGTTAAATGAGCTCCTGTCTAACAAGAAGCTTATTTTTCAGGGGTTGGTTGATGGTTTAGATTATTTGAGAGCTGAAATTAATGTGGTTATTCGAGAGCTGAAGTTAATGTGGTCTTTATTTAAGCTTATTTTACAAGAGGCAACTGACTTAAAGAACAAATTTGCTACCCCACGACGTTCTTTCATAGAAGATTCAGCAAGCACTGAAGTTGATGATCTTGATATTATTCCTAATGAGGAAATGCTTTTGATTCTTAGTGAGAAGGGCTACGTTAAGCGTATGAAGCCTAATACCTTCAATCTACAAAACCGGGGAACGATCGGAAAATCTGTTGGAAAGATGCGAATGAACGACAATACATCCGATTTCATTGTCTGCCAAACACATGATCATGTCCTTTACTTCAGTGACAAGGGAATAGTATACTCAGCACGTGCTTATAAGATACCTGAATGCACAAGAGCTGCGACTGGAACTCCACTGGTACAGCTGCTTTCTTTGTCCGATGGGGAGAGAATAACCTCCATCGTTCCTGTAAATGAATTTGGTGAAGATCAGTATCTTGTGATGCTGACCGTTAACGGTTATATCAAGAAAGTTCCTCTTAATGCTTTCTCAGCAATCAGGACTTCTGGGATCATTTCAATTCAACTGGCTCCTGGTGATGAGCTGAAGTGGGTTCGTCGTTGTGGGGATGATGACCTTGTTGCTTTGGCTTCACAAAATGGGATGGTTATAGTTAATACATGCAACAAGCTTCGCGCCCTTGGAAGGAAAACAAGGGGCGTCCTGGCAATGAAGCTAAAGGAAGGTGACAAGATGGCATCCATGGATATAATTCCAGCAACGTCGCATAACATGCCTGAAACTTACAGCAGAGTCAGAGATTTGAGTCCGCCATGGCTGCTTTTCATAGCTGATAATGGTATTGGGAAGCGTGTGCCCCTAAATGCATTCCGGCAAGGAAATTTCAACAGAGTGGGCTTGCAAGGCTACAAGCTTCCACCAGACTGTAGCTTAGCTGCTGTATTTGTTGTTGGATTTTCACTTACTGATGACGGTGAAAGTGACGAACAGGTGGTTTTAGTTAGCCAGAGTGGTACTGTAAACAGAATCAAAGTCAAAGATATATCCATCCGGTCTCGTTCCGCAAGGGGAGTCATTCTGATGAGGCTGGAACATGCTGGGAAGATCCAGTCAGCCTCACTAATATCAGCAGCAGAAGAGGAGGAAGAACAGGACCCGGAGTCAGCCTCACTAATATCAGAAGCAGAAGAGCCGGAAAAACAAGACCCGGAGGTCTCAGCTTAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAYAMSVLLGRALPDVRDGLKPVHRRILYAMHEMGLASRRPFRKCARVVGEVLGKFHPHGDSAVYETLVRMAQDFSMRYPLVQGHGNFGSIDADPPAAMRYTECRLDVGCFFFLDIDAIFIIGQVDFVPNFDNSQKEPSLLPARVPSLLLNGSSGIAVGMATNIPPHNLGELVDVLSVMIENPEATLQELLECMPGPDFPTGGTIVGNQGILEAYKTGRGRVVMRGKTDIETIDVKSKRSAIIIKEVPYQTNKSTLVERIAELVEEKVLEGISDIRDESDRSGMRVVIELKRGADPAIVLNNLYRHTALQSSFSCNMVAILDGQPKLMGLKEILQAFIDFRCSVIERRARFKLSQALERKHIVEGIVIGLDNLDSVIQIIRGTSNHAMARESLIKEFGLSDKQAEALLDITLRKLTSLERKKFVDEAKSLSEEISKLNELLSNKKLIFQGLVDGLDYLRAEINVVIRELKLMWSLFKLILQEATDLKNKFATPRRSFIEDSASTEVDDLDIIPNEEMLLILSEKGYVKRMKPNTFNLQNRGTIGKSVGKMRMNDNTSDFIVCQTHDHVLYFSDKGIVYSARAYKIPECTRAATGTPLVQLLSLSDGERITSIVPVNEFGEDQYLVMLTVNGYIKKVPLNAFSAIRTSGIISIQLAPGDELKWVRRCGDDDLVALASQNGMVIVNTCNKLRALGRKTRGVLAMKLKEGDKMASMDIIPATSHNMPETYSRVRDLSPPWLLFIADNGIGKRVPLNAFRQGNFNRVGLQGYKLPPDCSLAAVFVVGFSLTDDGESDEQVVLVSQSGTVNRIKVKDISIRSRSARGVILMRLEHAGKIQSASLISAAEEEEEQDPESASLISEAEEPEKQDPEVSA</aaseq>

Gene Sequence

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