Os07g0445400

From RiceWiki
Revision as of 08:33, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os07g0445400| Description = Disease resistance protein family protein| Version = NM_001188248.1 GI:297725626 GeneID:9270276| Length = 8205 bp| ...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os07g0445400

Description

Disease resistance protein family protein

Version

NM_001188248.1 GI:297725626 GeneID:9270276

Length

8205 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os07g0445400, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 7

Location

Chromosome 7:15852601..15860805

Sequence Coding Region

15852601..15854189,15854366..15854463,15855661..15855972,15856174..15856486,15857762..15859760
,15860770..15860805

Expression

GEO Profiles:Os07g0445400

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008400:15852601..15860805 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008400:15852601..15860805 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggctgaaggttttattagcttgacacaaggaacagaaatcgatcgagttgctgaaaactatttttatgagcttgtcaacagaggaatgatacaacctgtagatgttgactataatgatgaggtgatatcttgtacggttcaccacatggtacttgacgttattacgaacaaatccatggaagagaattttgtgacagtaattgattgttctgaaactagtataggatttcctcataaggttcgacgactgtccctgcggtttagcagtacaaaatatgcaacaaatttagcaaatatcacactggcacaagttcgatcttggtactttgttggacttactaattttgtgccttctattatggagtttaagcttcttagagtagtgatccttcaactctggggttgccatgatggtcagtcaagtttcaatctgactaatattggcagactatttcaactgagatatatgaaaatttcatgcaacataagtgtagacctgccattgaagatgcaagggctacaatatttggaaacattggagataaatgcaagaataagtgctattccatctgacattgttcatttgccacgtttgtttcatctacatcttccatgtattactgatttgtctaatgggattggcagcatgagatctctgcgttctctgggatactttgacctttgtaataactctgaagacaacataagaaaccttggtgagctgactaatctgcaagatcttcgacttacttgttcgactgtaccatttgaccgcttggagaggaacatggaagttgtcagctctttcctatggagacttggcaatctgaaatctttatctctggttcctagtcacagtgcttcaagcaagtgcatttcctgcgatggtttgagaattgtgtccactcctcccagacttctccagaaacttgagttattgatgcctattggtgtgttctctaggcttcccaagtggattggacaacttgacaaattgtgtgttttaaaaattgttgtcagagaagtactgagatatgatatcgacaatctcataggattgccttccctctcaattctgtcactgaatgttcggacagtcccttcaagcaagattatctttcataaaacggcatttccagctctcaagtacctcaagttcaagtgtagactactttgcttaagctttgaggaaggagcaatgcccaatctgaaaaggctcaagctaggtttcaatgcacatggagcagaggaatactgcagtacgagtgtcggtattgagttccttttgagcctaacagaaatcaatggagtaattggcgtctttggtgctagtaaatctgacagaatagctgcagagcgcgtgttgatcaatgtttcaaaagtacatccaggttgtcctagcatcaatatccatcaggtagattgcatttttgacggtaatgaagcaatgagtagcaaggctgaagaaaaggcatacatgtctctacaggaaacacaatgtcagatcttggagaaagttttaactgatcaacatggcattctggaacttaacacacagaaaaataaggaaggaagagttgtcagacgggcttctcccttgtgcattctggcaggaacttctttttcacgtttcccagatacgtctggtccgctagctgcttcccctccacagttgccatatatagagcatgaaagagataagggaaggaagagggaaagagagatggctagtgtaagtgtttcaactggggtgatgaactctcttctggagaagctcaactccctcccatgtgaggaaaattataatctcaaaggtgtgcggaatgagttggtgttgcttaagagtcagctcagtgagctgaatattctccttgaggtattagcagaaatggatgaacctgctccactagcagagaagtggatgagccaagtgaaggagctgacgtatgatgttgaggattacattgatgacttgagttgccaaggtcattattatgctggccttgtgggtattgagggaccaaagaacaagctcatcaaactgttaatgaatgttcatgcagagcaagggttgaaagtgctatctattgtgggatttgggggtttaggcaagacagctcttgccaatgaggtgtaccatgaacttggagaacagtttgagtatcgagtttttgtatcagtgacccaaagacctcagattgcagtactactacgcaacatgctctcacagcttggagaacagaagtctgctgaatccaacgatgtgcaatacctcattagcaaactcagggaacatctaaataacaaaaggtacttcatcatacttgatgatttatgggatgagtcagtgtggaatattcttagttgtgcttttccaacaaattctcatggtagtagagtaataacaacgacacgaattgagaccgtgggcagagcatgttgtgcttatcaggctgatttcatatataagatgcaatgtctgaatgctaaagattcagaaacattattttttagtagaatatttggatccaaagatcaatgtcctgaaaatttggaagaaggcttagttgagattgtaaggaagtgtgatggggtgccacttgcaattgtcactgtagctcaacatttagcttctcggcaaactacatttaaggaacaattggagtctctgcgaagttctctgtgcaccatactcggaacatgttccacatttcaaggaatacggcatacattaaaccttagctacataaatcttccgaattatctgaagacatgcttactatatctgggtatatatccaacgggttacactatcagaaaagatgatttggttaagcaatgggtagctgaaggttttgcgagcagcatgcatgggcaagatgctgagcatgttgcaaagggttatttcaacgagcttgtcaataggagtgtggttcaacctgtagatacagattacaatgatgaggtgttgtctttcagagttcatagttcgatgcttgaatttatcaggtataaatctgcagaagagaattttcttacagtagtcgatcagttaggagcaacaagaggacgcccagacaaaatccgacggctctgccttcatgttaatgaatcaagtgctttcagaataccagcaagctttgatttgtcacaagttcgatctcttctgttttttggagcttcggttatggatgtttccgagtacaggtttcttcgagtattaattttacaatcttttgacagtggccttctgcaggaaattgacctcacaggaattcaagcattgttccaactaagatacttgaaggtttcagcatacattacactcttacctagacgaattgggatgttgcagtatttgcagacactgtgcatagaagggtctagactactttatatgccacctgatattgtctgtttgccaaatttgtcgcatctgattgttccatcgcagacaagcttgcctgatgggatttgcaacctgaaatccttacgtactctgaagtgtttcgatttggatatgaactcatcaaagaatataaagggcattggagagctgactagtcttatagaacttgattatttctttgatggaaggaaactcaaaacagaaaaacaggatgctctttgttgttcccttggaaagcttgcttatggtaagctaaaatatctatacatttctgctcctggttctggttacaatgcttctaggttgagtaatgtatctccatcgccccaacatcttgagaaactagttctttctggctgctggtttttacatgttcccaagtggattaaagaactccgtgaactttacagcttggtactctcagttgaggacttggacatgagtgatgtccgtgcactaggaggaatgcccaccctagtccacctttttctggaaacccgaaggggtcctatggaaaactccatcaccattactgacaagtcattccccgctctgaagcattttgaattcagttgtagagcaccatgtctgatcttccaggctggtgcaatgccccaggttgaaaggcttagtttaaattttgctgctgacggatggaataaatgcaattctgaagccattggcattgagcgcttgactgaattgaaagaaatctgtgtacaagttttgggaagtggtgccaacagattaaatacagagtctcgtatcctcgcagaagtttattactacttcgaacaattccatgctcatggtaaaaatgtgcgttactcttacaataatgatgtggaccactcttactttaatgatgacggcgatgatgattacaatggagactctgatacatggagagtcaggaggctgaaaattcttccataa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAEGFISLTQGTEIDRVAENYFYELVNRGMIQPVDVDYNDEVIS CTVHHMVLDVITNKSMEENFVTVIDCSETSIGFPHKVRRLSLRFSSTKYATNLANITL AQVRSWYFVGLTNFVPSIMEFKLLRVVILQLWGCHDGQSSFNLTNIGRLFQLRYMKIS CNISVDLPLKMQGLQYLETLEINARISAIPSDIVHLPRLFHLHLPCITDLSNGIGSMR SLRSLGYFDLCNNSEDNIRNLGELTNLQDLRLTCSTVPFDRLERNMEVVSSFLWRLGN LKSLSLVPSHSASSKCISCDGLRIVSTPPRLLQKLELLMPIGVFSRLPKWIGQLDKLC VLKIVVREVLRYDIDNLIGLPSLSILSLNVRTVPSSKIIFHKTAFPALKYLKFKCRLL CLSFEEGAMPNLKRLKLGFNAHGAEEYCSTSVGIEFLLSLTEINGVIGVFGASKSDRI AAERVLINVSKVHPGCPSINIHQVDCIFDGNEAMSSKAEEKAYMSLQETQCQILEKVL TDQHGILELNTQKNKEGRVVRRASPLCILAGTSFSRFPDTSGPLAASPPQLPYIEHER DKGRKREREMASVSVSTGVMNSLLEKLNSLPCEENYNLKGVRNELVLLKSQLSELNIL LEVLAEMDEPAPLAEKWMSQVKELTYDVEDYIDDLSCQGHYYAGLVGIEGPKNKLIKL LMNVHAEQGLKVLSIVGFGGLGKTALANEVYHELGEQFEYRVFVSVTQRPQIAVLLRN MLSQLGEQKSAESNDVQYLISKLREHLNNKRYFIILDDLWDESVWNILSCAFPTNSHG SRVITTTRIETVGRACCAYQADFIYKMQCLNAKDSETLFFSRIFGSKDQCPENLEEGL VEIVRKCDGVPLAIVTVAQHLASRQTTFKEQLESLRSSLCTILGTCSTFQGIRHTLNL SYINLPNYLKTCLLYLGIYPTGYTIRKDDLVKQWVAEGFASSMHGQDAEHVAKGYFNE LVNRSVVQPVDTDYNDEVLSFRVHSSMLEFIRYKSAEENFLTVVDQLGATRGRPDKIR RLCLHVNESSAFRIPASFDLSQVRSLLFFGASVMDVSEYRFLRVLILQSFDSGLLQEI DLTGIQALFQLRYLKVSAYITLLPRRIGMLQYLQTLCIEGSRLLYMPPDIVCLPNLSH LIVPSQTSLPDGICNLKSLRTLKCFDLDMNSSKNIKGIGELTSLIELDYFFDGRKLKT EKQDALCCSLGKLAYGKLKYLYISAPGSGYNASRLSNVSPSPQHLEKLVLSGCWFLHV PKWIKELRELYSLVLSVEDLDMSDVRALGGMPTLVHLFLETRRGPMENSITITDKSFP ALKHFEFSCRAPCLIFQAGAMPQVERLSLNFAADGWNKCNSEAIGIERLTELKEICVQ VLGSGANRLNTESRILAEVYYYFEQFHAHGKNVRYSYNNDVDHSYFNDDGDDDYNGDS DTWRVRRLKILP</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..1589#1766..1863#3061..3372#3574..3886#5162..7160#8170..8205#atggctgaaggttttattagcttgacacaaggaacagaaatcgatcgagttgctgaaaactatttttatgagcttgtcaacagaggaatgatacaacctgtagatgttgactataatgatgaggtgatatcttgtacggttcaccacatggtacttgacgttattacgaacaaatccatggaagagaattttgtgacagtaattgattgttctgaaactagtataggatttcctcataaggttcgacgactgtccctgcggtttagcagtacaaaatatgcaacaaatttagcaaatatcacactggcacaagttcgatcttggtactttgttggacttactaattttgtgccttctattatggagtttaagcttcttagagtagtgatccttcaactctggggttgccatgatggtcagtcaagtttcaatctgactaatattggcagactatttcaactgagatatatgaaaatttcatgcaacataagtgtagacctgccattgaagatgcaagggctacaatatttggaaacattggagataaatgcaagaataagtgctattccatctgacattgttcatttgccacgtttgtttcatctacatcttccatgtattactgatttgtctaatgggattggcagcatgagatctctgcgttctctgggatactttgacctttgtaataactctgaagacaacataagaaaccttggtgagctgactaatctgcaagatcttcgacttacttgttcgactgtaccatttgaccgcttggagaggaacatggaagttgtcagctctttcctatggagacttggcaatctgaaatctttatctctggttcctagtcacagtgcttcaagcaagtgcatttcctgcgatggtttgagaattgtgtccactcctcccagacttctccagaaacttgagttattgatgcctattggtgtgttctctaggcttcccaagtggattggacaacttgacaaattgtgtgttttaaaaattgttgtcagagaagtactgagatatgatatcgacaatctcataggattgccttccctctcaattctgtcactgaatgttcggacagtcccttcaagcaagattatctttcataaaacggcatttccagctctcaagtacctcaagttcaagtgtagactactttgcttaagctttgaggaaggagcaatgcccaatctgaaaaggctcaagctaggtttcaatgcacatggagcagaggaatactgcagtacgagtgtcggtattgagttccttttgagcctaacagaaatcaatggagtaattggcgtctttggtgctagtaaatctgacagaatagctgcagagcgcgtgttgatcaatgtttcaaaagtacatccaggttgtcctagcatcaatatccatcaggtagattgcatttttgacggtaatgaagcaatgagtagcaaggctgaagaaaaggcatacatgtctctacaggaaacacaatgtcagatcttggagaaagttttaactgatcaacatggcattctggaacttaacacacagaaaaataaggaaggaagagttgtcagacggtacgaattatatcatcttctctaagttcttctttcccctttatttcagtgttagctttaattatctggcatgtcagcatttccatgttatgtgttactatgctctagctagcttttggttcttgtctgatattatatatgtatatatatttaacaaactatgaatgtgttgtcagggcttctcccttgtgcattctggcaggaacttctttttcacgtttcccagatacgtctggtccgctagctgcttcccctccacagttgccatatataggtaattgaataaagctctcctaaagctgaatacaaaaaaaaaatcataggaaagctccaagactatctaatattctacctgcaattcaattggtatctaggaagtacagttgcatactcattcaaaatcctggcttcattacaaattctgaatattacaaaataattagcattgtgacttgtgagcacaacaaaatcttacataatttgtgagtagtcaacatacacataccggacacatttttttcaagttgtgatactcatgtttttttttttgttgacatactcatttttttttcaattttagatggttcatcttggtatggataaacaaagaaagtatttaagtcttacaaagatagggcacttctttttatggatatacatcaaagtaaataagcaatcaatatcccattctaatgattcttgtggttctggggaatccagctacaggagaacctgcaactctctgccgactctttgatcttaaacttaagaatgccatgttaagaactagtgccctatgtggacgatcgatgaagttgatagtagaagtaaaacaaaggggtgatgactggtcactgactaagtgtatatggactttttctaatttttttaagcactaaaatagtggagattgaaaattacgtttattgacattgtaggcattccttgtttatatacaccgtcacttccctttagaagaagacaatccaatgcaatggaacagattgtgtccaaactgaatttgattagtgagtgtgttgtctcttggggatattttggaaggcatgaattgcataaatatgtgtacatatatatgaactttacttgtggcataatgctctatcttctaaaatgtaatttttatattaaaatcctaatatcaggtgtaggtgtgctattcatgcagtcacccactttgtagcgcttatacagctataatctttgtatttggccttgcagacctttgttgatggatgttgtatggttctctcaatatgtttttgagtttcacaacaaccaagaaccaactcatgtatatatggaaaattgtaatatatatttttttgggtattgtgatatcatttatttgaaattcattacaatgcatggctgctcagctgtacattcatatcacaaagtacagcaactgcctgtggcaaaactcacacgcactgttacaccatttttgcagagcatgaaagagataagggaaggaagagggaaagagagatggctagtgtaagtgtttcaactggggtgatgaactctcttctggagaagctcaactccctcccatgtgaggaaaattataatctcaaaggtgtgcggaatgagttggtgttgcttaagagtcagctcagtgagctgaatattctccttgaggtattagcagaaatggatgaacctgctccactagcagagaagtggatgagccaagtgaaggagctgacgtatgatgttgaggattacattgatgacttgagttgccaaggtcattattatggtaaggttttgttcgctagatggattgctcaatacatcagtatgttaatcgaacactctcatgccaatcagcggatccaacaattgacgattgccatcgtggatgcaattcatcagcataagaggtataaacttgattgcagcttggcgtctccctctttgtgccttgatactcgactacctgtactttttgtggattcagctggccttgtgggtattgagggaccaaagaacaagctcatcaaactgttaatgaatgttcatgcagagcaagggttgaaagtgctatctattgtgggatttgggggtttaggcaagacagctcttgccaatgaggtgtaccatgaacttggagaacagtttgagtatcgagtttttgtatcagtgacccaaagacctcagattgcagtactactacgcaacatgctctcacagcttggagaacagaagtctgctgaatccaacgatgtgcaatacctcattagcaaactcagggaacatctaaataacaaaaggtacatattatcaattatgctcagtgtcataactgtattttttcatttgattaagcatgctgctcggcctatgtctcacaagcctgctggcactgtatgatctaaaatcctaacttacatgtctggaaattcaccactcaagaaaatttgcactagtaatggtaatttataataatttccatctcatgagattttggagtatcttagtgatggccttttggtcaagattctttggcagtctggttaaattagatcttgtgtaattgttatttgttaggagagtccttaatatcttgatgcttattgcaattgttgcagaaagcaagaaaaaaaccaatgttcctagtccagctagcatctcgtgtataattgtcagaagagtcctttatatactgatgcttatcgtaatgttggagaaagtgacaaacaaaccaaagttcctagtctgtctccctgacaacttgtcctagcgatatggctattgacacagtgtcatggcatcacttggttcgtaaacatttcaatcaggactaagcctgtgttcgcatgcaccttttcccatcccctctccttcgttttccgcgcgcacgcttttcaaactactaaacggtgtgttttttgcaaaaagtttctatacgaaagttgcttaaaaaaatcaaattaatccatttttgaaaaaaaaaattagctaatacttaattaatcacgtgttaatggaccgctccgttttccgtgcacatgatcccccatccgaactcagcctaagggccattatctaaccatgttggattaatctgattccagacctatcctggctgatgcttccatgcaataacacatagttgaatgggatggtctgtattgtgaccagaggaagtagaggagacaagttattattagattgattttacttggaactgttgagagtctttttttctttttttgaccaaactgttgggagcctttatatggggcttattgtaatattgtgtcccaggacaccttgatcaaattttagaagcctgagtatacaccaataatgggcatgcctgaatccaaatctattcaaggtgtcctaggacacaaataatgggcatccgttatatttttttttataaatatttacttacatttcatgactccctgaatcctactttttaataacttgctgaactggacacctgaatctgtgtcagattctaacttatgtgtcatcggaacattgtttcttattaatatctctataactagtgtgctatatattttttcttgtaggtacttcatcatacttgatgatttatgggatgagtcagtgtggaatattcttagttgtgcttttccaacaaattctcatggtagtagagtaataacaacgacacgaattgagaccgtgggcagagcatgttgtgcttatcaggctgatttcatatataagatgcaatgtctgaatgctaaagattcagaaacattattttttagtagaatatttggatccaaagatcaatgtcctgaaaatttggaagaaggcttagttgagattgtaaggaagtgtgatggggtgccacttgcaattgtcactgtagctcaacatttagcttctcggcaaactacatttaaggaacaattggagtctctgcgaagttctctgtgcaccatactcggaacatgttccacatttcaaggaatacggcatacattaaaccttagctacataaatcttccgaattatctgaagacatgcttactatatctgggtatatatccaacgggttacactatcagaaaagatgatttggttaagcaatgggtagctgaaggttttgcgagcagcatgcatgggcaagatgctgagcatgttgcaaagggttatttcaacgagcttgtcaataggagtgtggttcaacctgtagatacagattacaatgatgaggtgttgtctttcagagttcatagttcgatgcttgaatttatcaggtataaatctgcagaagagaattttcttacagtagtcgatcagttaggagcaacaagaggacgcccagacaaaatccgacggctctgccttcatgttaatgaatcaagtgctttcagaataccagcaagctttgatttgtcacaagttcgatctcttctgttttttggagcttcggttatggatgtttccgagtacaggtttcttcgagtattaattttacaatcttttgacagtggccttctgcaggaaattgacctcacaggaattcaagcattgttccaactaagatacttgaaggtttcagcatacattacactcttacctagacgaattgggatgttgcagtatttgcagacactgtgcatagaagggtctagactactttatatgccacctgatattgtctgtttgccaaatttgtcgcatctgattgttccatcgcagacaagcttgcctgatgggatttgcaacctgaaatccttacgtactctgaagtgtttcgatttggatatgaactcatcaaagaatataaagggcattggagagctgactagtcttatagaacttgattatttctttgatggaaggaaactcaaaacagaaaaacaggatgctctttgttgttcccttggaaagcttgcttatggtaagctaaaatatctatacatttctgctcctggttctggttacaatgcttctaggttgagtaatgtatctccatcgccccaacatcttgagaaactagttctttctggctgctggtttttacatgttcccaagtggattaaagaactccgtgaactttacagcttggtactctcagttgaggacttggacatgagtgatgtccgtgcactaggaggaatgcccaccctagtccacctttttctggaaacccgaaggggtcctatggaaaactccatcaccattactgacaagtcattccccgctctgaagcattttgaattcagttgtagagcaccatgtctgatcttccaggctggtgcaatgccccaggttgaaaggcttagtttaaattttgctgctgacggatggaataaatgcaattctgaagccattggcattgagcgcttgactgaattgaaagaaatctgtgtacaagttttgggaagtggtgccaacagattaaatacagagtctcgtatcctcgcagaagtttattactacttcgaacaattccatgctcatggtaaaaatgtgcgttactcttacaataatgatgtggaccactcttactttaatgatgacggcgatgatgattacaatggagactctgatgtgagttcagtgataagcggatgaatgacaatagcctggtacgaaatattcctccaacaataatcgaatctctgcattcaccttattatttgtttattcttattttcaatatctttagtatgttctcttcccttcactgaaactgatcattctatcgaaaatcacttgtattttacgtggaacaggtggttttgccaataggatttctgcctgcagtgggctggccattatcgtcggggactttttcacccactttgcatagtgggtttctcgttggtttcatgtttaatgtacttttgtttacgtggtttgcttatttcatctcatgggaagttactccccttgttaagacttgtaaactcaaacattatatttgtgcgcatccaaaatgcagaggccaggatgtaataatattacttatcttaaaataatgtgggctagggcatgtttttaataccatcttcgcatttagtgttttgccgaactttggtacttacataagaaatcttgttaaattttagtaaggtttattttagctacagtctgaacaacccctttattttggactaaatatctaagaatgtggccatctatctttaccgattattaaccaacctgttaaccaatttcttgacacaggattgctatttatctttgattcttgtttctgctcttgcatgagcagatatattaaatatgctcaatctgagctttgatgtgtggaaatgctagcgagcaagatattggattttagctatcctgtttcgggtgttgaattttgataattcttaatacaatatttcctgtttcgggtgttcctatttcatgatataattatgaagtctttatggaatatatattttgttttgagatcttatagctgttcacacaagtaacgagcggaattaccgaaaaagaaaaggaacacatttgctgttttatgcaagcaacaacgtgagtgattgtaaatttgtacttgtctgctttgtatgccctcttaattttgcagacatggagagtcaggaggctgaaaattcttccataa</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os07g0445400, RefSeq:Os07g0445400