BGIOSGA009957
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA009957 |
|---|---|
| Description |
RING-HC protein 1 |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA009957, complete gene. |
| LocusTag |
OS03G0706900 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA009957-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA009957-PA |
| Length |
6675 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:32595059..32601733 |
| Sequence Coding Region |
32601600..32601733,32600953..32601043,32600785..32600869,32600602..32600686,32598909..32598978 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:32595059..32601733 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:32595059..32601733 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCAGCGGCGGCGGGCGCAGACGTGGGCGGGGGTGGGGAAGACGGCGCAGGCGGCGGCGGCGCACGCGGCGCTCTTCTGCTTCACGCTCCTCCTCGCGCTCAAGGTCGACGGCCGCACAGCCTACTCCTGGTGGATTATATTCATCCCTCTATGGCTATTTCATGGCATTATTGCCCGTGGAAGGTTTTCAATGCCAGCCCCTTCGCTTCCTCATGGCCGTCATTGGGCTCCTTGCCATTCAATTGTTGCAGCGCCGTTGCTTATTGCGTTTGAGCTGCTGCTTTGCATATATCTCGAAAGTTTGAGAGTTAAAAGTAAGCCGACTGTTGATTTGAAGATTGTATTCCTTCCTCTTCTGGCCTTTGAAGTGATTATTCTTGTTGACAATTTCAGAATGTGTAGAGCTTTAATGCCAGGAGATGAAGAAAGTATGAGCGATGAAGCTATTTGGGAGACACTTCCTCGAGCTGGTTTTGAAAGCCAGGCAGTTTTCTACTATTTGGAAATGGCTGGTGATGTTGGTGCTTTGGGATGGTGGGATTTGTTTATAAATTATGGAATCGCGGAGTGTTTTGCATTTCTTGTTTGTACTAGATGGTTTAATCCCATGATTCATAAATCTCCTAATCCTGGGGAGGCTAGCTCATCATCAGCGGCAATTAGATACCGTGATTGGGAGAGTGGTCTTCTCCTCCCATCACTAGAAGATCATGAACAAGAGAGGCTCTGTGGTCTTCCTGACATAGGCGGTCACGTAATGAAAATACCACTGGTGATTTTCCAAGTTTTGCTTTGTATGCGCTTGGAGGGTACGCCTCCTAGTGCTCAGTATATTCCGATATTTGCACTGTTCTCCCCACTATTTATTTTACAAGGCGCTGGTGTCCTTTTCTCTCTAGCAAGATTGTTGGAGAAGGTTGTTCTACTATTACGAAATGGACCAGTTAGTCCTAATTACCTTACAATCTCATCAAAAGTCCGTGATTGCTTTGCTTTTCTTCATCGTGGTTCAAGGCTTCTTGGTTGGTGGTCTATTGATGAAGGCAGCAAAGAAGAGCAAGCCCGGTTATTCTATACTGAATCTACTGGGTACAACACATTTTGTGGCTATCCACCTGAGGTAGTCAGGAAAATGCCTAAGAGGGATCTTGCAGAAGAGGTATGGAGGCTCCAAGCAGCTTTGGGAGAGCAATCAGAAATTACCAAATGTACCAAGCAGGAATTTGAAAGGCTTCAAAATGAGAAGGTTCTTTGTAGGATTTGCTACGAGGGGGAGATATGCATGGTCTTACTTCCTTGCCGGCACAGAACATTATGCAAGACTTGTTCTGATAAGTGCAAGAAATGTCCAATCTGCCGTGTGCCCATTGAAGAACGCATGCCCGTATATGATGTTTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MQRRRAQTWAGVGKTAQAAAAHAALFCFTLLLALKVDGRTAYSWWIIFIPLWLFHGIIARGRFSMPAPSLPHGRHWAPCHSIVAAPLLIAFELLLCIYLESLRVKSKPTVDLKIVFLPLLAFEVIILVDNFRMCRALMPGDEESMSDEAIWETLPRAGFESQAVFYYLEMAGDVGALGWWDLFINYGIAECFAFLVCTRWFNPMIHKSPNPGEASSSSAAIRYRDWESGLLLPSLEDHEQERLCGLPDIGGHVMKIPLVIFQVLLCMRLEGTPPSAQYIPIFALFSPLFILQGAGVLFSLARLLEKVVLLLRNGPVSPNYLTISSKVRDCFAFLHRGSRLLGWWSIDEGSKEEQARLFYTESTGYNTFCGYPPEVVRKMPKRDLAEEVWRLQAALGEQSEITKCTKQEFERLQNEKVLCRICYEGEICMVLLPCRHRTLCKTCSDKCKKCPICRVPIEERMPVYDV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..134#691..781#865..949#1048..1132#2756..2825#3660..3708#4566..4611#4691..4940#5219..5424#5504..5578#5734..5803#5905..5985#6430..6509#6597..6675#ATGCAGCGGCGGCGGGCGCAGACGTGGGCGGGGGTGGGGAAGACGGCGCAGGCGGCGGCGGCGCACGCGGCGCTCTTCTGCTTCACGCTCCTCCTCGCGCTCAAGGTCGACGGCCGCACAGCCTACTCCTGGTGGTAACGCTCCCTGCTCTAAACCCTAGCTAGCACCCTCCCCCGTCCTCCGCCGCCACGGGCCTCCGCTTCGATCTGGCTTAGTGGTTCCCGCGAGATTGCGAGTTGGGGGTGGAATTAGTGGCTGGCGTAGTGGTTTTTTTGGGGGGGTTTCCATCGGATGCAGATGCAGGCTGAGGGGGGAATCGGACTAGTCCTTTGCGTGCGGTTGAGAGTCGTCGCCTGCTTGTGGTGGTCTGGTGAACTAATTTTCTCCACCAGAACGATTCAGCTCTTTCGTGTCCTTGTGTTTGGACATTGATGAGTTGATGTAGGCATTTTGCTCACGCAGAGGGTGTGCTTCGGTTAGTCTTTAGCTGATGCTGGGCCACAGTTCCTGGTTCTACTGAAGGCTGCACTTTGAGAGCTCGTTCTTATTTGGTTATGTATTTGTTTGAGTAACCCAGCGCTCTTGTTCCTATAATGATGGTAGCAGATTCAGAAGACATTGTTGACTGCTTTGTCTGTAGCAGTGAAGGTATTAATACCGAATGCTAATTCTGCTATTTCCATCATGCAGGATTATATTCATCCCTCTATGGCTATTTCATGGCATTATTGCCCGTGGAAGGTTTTCAATGCCAGCCCCTTCGCTTCCTCATGGCCGTCATGTAAGAATTGGTATCAATTTCTCTAGTTAGTATGCACGTGCTTACCCCACATTTTGATCTGATGGGTTTCTATTTGTATGTAGTGGGCTCCTTGCCATTCAATTGTTGCAGCGCCGTTGCTTATTGCGTTTGAGCTGCTGCTTTGCATATATCTCGAAAGTTTGAGAGGTAGGTTCTTAGGTTATCTAGATGAGAGAAGCTTTGGCGACCATAAACGAATTTCCTGGAGGCTCTTATACCCCTTCTCTCTGTTTGTTCTTCCGCAGTTAAAAGTAAGCCGACTGTTGATTTGAAGATTGTATTCCTTCCTCTTCTGGCCTTTGAAGTGATTATTCTTGTTGACAATTTCAGGTAATGAATCTGAACAATTATTTTGCATGCCTTTAATACTGTATCAGTAAATGCACAAACGCACTACCAATTGGCACGATTGTATGTGCCTTACTGTTTTATCTGCTTATGTATTCTGCAAGTCTTAAGTGCTGAATGTAACTAGTTTTTTTTTCCAAGATTGTTTTTCTGACTAAGCAGCTAGCACTTATAAACTGTGCCATGAACTCGTAATATGTCCTAACCTATTTTTGGTTACGTCTGGGATTGTAGTAAGACGACCTGACCTATTGTCAAATATGGTATGCACCTTCAAGAGCAGCTAACGCGTTTTAGATTATAAATTTCTTGCAACCAAAAGAATTCAATTATCTGGTGTTCTGTTGTTCTCAATGGCCGGTTCTTGGTGTCTGTCTTTTTCTCCGCTGGAAAGAATACTGAAATTACTCAACTGCCTCTTTGTTTATTTTTGCACACTGCTTAGGCTGTGTTCGCCAGTCCACGTTCCCAACCGGAACAGTACGCGCGGAAAATGGAGCGGTCCATTAGCGCGTAATTAATTAAGTATTAGCTATTTTTTTTTCAAAAATAGATTAATTTGATTTTTTAAGCAACTTTTGTATAGAAACTTTTTGCAAAAAACACACCGTTTAACAGTTTGAAAAGTGTGCGCGTGGAAAACGAGGGAGAGGGGTTGGAAAAAGGGGTGCCGAACACAGCCTTAGTCAGGTTCAATGATATCTTTCTGTTGGTTGCAAAATAAATTAATCATGATCATTATACTCATATGGTTTCTGTTGGTTGCAAAATAAATTAATAATTATCATTATACTTGACGACTTGGTATGTAGAGGGTAGCACTAAGTGCTTGTTTATCATTGCTTATTTGATAGCAGGTTGAATTATCTCAATTACAAATATACTCAAGTCTACTGTTGATATTATTCTTAGTTTTGTTATTCCGTACAACATTTTTTTTGCTACATAATAATAAATGGTGGCATTCTATCCAAAAGTTACAAATGGTGTTTTTAAAAGGTAAATTTCGCAATACTGAACTACCATTTGCAAAACTATCGCAAAAGACACATGTTTATTCACAATTTTGGAGAACTACACTTTTTAGTTGCAAAATGTGCAGCAAAACTGCACTCCTATCAGAGAAACAGGTCTGATAGGTTGGGCCCTCTCATCAGTCATCAGTATTTCATCCGGGTTGTTTCTGTTTCTGATGCATGTGTTGGTTAAAAAGAAACAGCCTACACATGCAACACTGACTAGTGGACCTAGCCTGTCAGGCTCATTGGCATTTTCAGTAATTTAGTTTTGTGAAACTTTTCACAACCAAAGGTATTCTTCCGAAATCGTCGCAAAAGTGTGTTTGCGATTGTTTTAGCGATGGCTTTTGTCTGGTTTAATGAAATTGAATCATTGTTAAATTTTAGCTTGTCACACAATCAGTACTGTTGTTGGTATGCAACGCATAAATTGGATGCAATTCATAAAGATATGTGCTGACCAAATCATGAACCTTAATTTGGCCAAAAATATCTAGAGATATTAGTTGTTAATACAATAGTAGCGCTAAAGTTAATTTGGATGTTAACCTTTATTTTTTTTCCTTGCATTGGTTTGACTATTCAGAATGTGTAGAGCTTTAATGCCAGGAGATGAAGAAAGTATGAGCGATGAAGCTATTTGGGAGACACTTCCTGTGAGTATAAGTACTAGTAACTAGTGGTTCTTTTTAAGAAATTATCTCCATTAGCTTCAATTTGAGCTTAACTTTTATTTACTATAAGTAACCATACTTCTACCAAATCATCTTCCATTTTGTTATAAAAATATATTAGAAACTTTTAAATACGATGATAACTAAATTAGAGAGCTGAATATCATGCAACAAAATGCATTATTTTTCAGTCCATTTTTAGTGGAATACTGGATTGGAATAATTTTATTGATAAGAATAAATCAGCTGCAAGGATGAAAGTAGAATCTCATGAACTTGTCAATTGACGATGCTGTATTTTCACATTATGGAGCCTATATGTTGGACTTGTACCAGCTTAATATGGGTTGATGAGTTTATTAAGTTTAACAAAGCAAAACATATACAGTGAACAAATATTCTCTACATAATGAAGTAAACTTCTGTTCAAAGTATTAAGAGAATCATGCCTTGATCAGGGCTTGTGTTAATACAATTATGGTTTGATCATTTCATTCTATCTGATACTCTATTTGTCACAGCAGAATGTACCGATTTACATTGTAATATATCACACCGATGTAAAGTCTATGACTGAATAACATTGTGTGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCCTCTATAGTTGGTAGGATATGGGTTTCTCAAAAGTCGCTTCATGGTTTACTAGAGTGGTTGTCACAATGACATTCTTCTAAGAGTGATTAGGTAGTTGCAAATGAGACAATAGTTACTAAAACAAGATTAGATTGTCAATTAACCATAAAATCTGGAAACATTACATTCAGCGAGCTGGTTTTGAAAGCCAGGCAGTTTTCTACTATTTGGAAATGGCTGGTGATTTCACCTGAACTGGCCGGGTTTCTATTTTTGGCAGTTTAAAGCATAAATTCGTGCAAGTTAAAACTATCTTTAGTATAAGCAATACAATGTTGGATAGAGAGCAAAAAGATATTCCTAGGGTTCCCGTGATGTGAAGACCCACCAGCTGCTTTCCCATTCACATGCATATATGCAACATTTTTCCATGGTTTCTCACTCTAAAGAGTGTAATCTTCCAATTCCCAACACAAAATCGAAGTCAGCTTCTCCACACTGAATCAAACTCCTTAATGCATTTCATGTGGTCGATTTTCTTTGACGATACTTTCAATTTGGTGATCTATTACAGTTCTTTTTTTTTTTGGTATACGCAAAAGACTTGTGTAGCATTAAGGAGTTTGAATGTTACATCCCCTGCCTAGCTCCATATAGCTGGGCAACTACCTAATGAGTAGTACAAGATTAATTCTCGTGATACAATTGTGCGACCTATGTGCCAGAGCGATGTTAGACCACAGATTGAGCCATCTTTGCTCCTGCAACGATCCAGAGTCTTGCCTCTGCGGTGATTGCTGCAATCACTGCATCCAGTTCCTACTTTCCCAATTGAAAATCTGGTCCTTCAAGATTACCCAAGCGACCAGGATCCATCAAAGTTCTGAGTTGTTCCAGTTACTAGGGGCTGCTTTGTCTGCCTCCTCCATGAGCTTTTAAGTGCTACTTTTTAAATCAAATCATTTATTAGTTCGATGTGATAAGAACAACATGTTCAGCAAACTATCTTAGATTGTACAATATTCAGGTTTTTATTTCTCTTCGGCCTAATTTTCCTCTACTCTGAAATGTTTTGTGATATTATTATTGCATGACAGGTGATGTTGGTGCTTTGGGATGGTGGGATTTGTTTATAAATTATGGGTGAGACTAGTCTCAATAGCAATTTTCTTTATTAACGAGATCTGTTATAATATAATCCAGCACCTTCTTTTTTGTACAGAATCGCGGAGTGTTTTGCATTTCTTGTTTGTACTAGATGGTTTAATCCCATGATTCATAAATCTCCTAATCCTGGGGAGGCTAGCTCATCATCAGCGGCAATTAGATACCGTGATTGGGAGAGTGGTCTTCTCCTCCCATCACTAGAAGA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