BGIOSGA010215
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA010215 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA010215, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBB0049I21.9 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA010215-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA010215-PA |
| Length |
10376 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:27607216..27617591 |
| Sequence Coding Region |
27617567..27617591,27616152..27616301,27612744..27612866,27611623..27612654,27611260..27611531 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:27607216..27617591 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:27607216..27617591 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCTTGCATTTGCAAATGCACTGAATGCTTAGTTGTCTGGGACAACAAGCTCAATTTCCACCTCGCTGATATCATTTTCACCTACACCGCCCCTGTTGTCATCCACGACCACACTGCATCTCCCTTTTGTCCATCCAGGAAGGTCGCCCTCACAGCGATCAACCTGGGGAAAGATGGAGTTACTCAATATCAAAGTATACAAAAACCTATTGTTCGTGAGGTCATTCCAGATACTGACTACGTTGAATTTGATAGCTCATTATTCGAGCCTACAAATGAAGATATAGTTGACAACGGTCGTACTGAGGATGCACAAGGTGTTGACAATGATTTCGATGAAGCCAGTCAAGTTTTGGAGGATGATGGATACGAGTCATATCGTGTTGACGTTAGTGGCGTTAATGGGACTGGTATTGATGATCCACACGATCGTGTGTACCATAAACTGCCGAAGACACACCATGTCTTAAAAAAAGTGCCAGATTGCAAACACTGTCACGCGATAAGGTTTCAATTTGAGTCTCCTGGGTTCTGTTGTAGGGAGGGAAAGATAAATGTTAAGATTCCAACAGTGCCTGCCGAGTTAATACGCTTGTTTACCAGTCAGGTGCATAATGATGCAAAGTATTTCAGAAAGCACATACGGTACTTCAATTCTCATTTCTCATTCACGAGCCTTGGAGTGACCCTTGACCAACGAGTCAGCACTGCGGCGGGTACTGGTATATATACATTTCGTGTACACGGTGCGTTGTACCATCGCCTGGACAATTTGGTTCCAGGTTCTCAAGGGCCTCGCCATATGCAGCTTTACTTTTATGATACAGAAGATGCTGATGCACTGGCTCATAGGGTTCGGAGGTCTCCTGACCTTGATATCAACCTTGTCCGAGTCATTTTAGGTATTTTGGCCAAGAACCCATACGTACAGACCTTCAACAGAGTCGGATCCATCCCTAATTTAGATAACTACATGATTGAGCTCAACACCAATGTAACACCTGACCAACGAAGATATAATGCCCCCACGGCCTCGCAGGTTGCTGCTATTTGGTTAGAGGGGGATGATCCAGTGAGAACCTTTGATAGACATGTCTTGGTACATGCCAAAGGTGATAAGCCCAGTTATATCAAAGCATACCATGGTTGTTATGATCCTTTGGCATATCCTTTATTTAACCCTAATGGGGAGACTGGGTGGAACCTGAAAATGCCATACGAGGATCCCAACCAGATTCCGTGTGATGTGGAAATGGATGAAACATGCGAGGCGCCGACTTTTGTTAATGTACGTACCAACGAAGAAAGCACTTTTGATGATCTTCCGGAGAACGAGGTTGTTGACAATTATCTAGACAATGAAGATGATAATGACGATAGTACCAAATCTGGCAAAGGGAAAAAGGACAAGTTTGTCACAGCGAGGGAGTACTATTGCTTCAGGTTACAGGTTAGAAGGGGACTTCTAAACATCATCTTGTTCGGAGGACGACTTTTCCAACAATGGGCTGTTGACATGTACATCAAAATCGAGTCTATGAGACTCGATTGGTACTCAAAACCTGAGAACCAAAAAAAGATTCGGGCTGAGCTGTACCAGGGCGTGGTTGACGTGCTTTCTTCTGGAGAGACAAGTGGTTCGGCGGTTGGTAAGAGGGTTGTGTTACCTCGCTCGTTTCCTGGAGGTGATCGCGACATGCAACGAAGGTTTCTCAATGCGATGGCTCTTGTCCAGCGTTTTGGGAGGCCAGATTACTTCATCACAATGACATGCAACCCATATTGGGATGAGATAACGGAAAATCTCGAACCTGGCCAGTTACCGCAAGATCGACCAGACCTTGTCGCAAGAGTTTTCAGGGCTAAGCTGCGAGACATGCTGGATCTATTTGTGAAGAAAAAATATTTTGGAGAGGTTCAGGCTTATGCGCACGTCACTGAGTTTCAGAAAAGAGGACTACCACATGAACACATCCTGTTGATCATAAAGTCAGGCAGTAAATTGACAACCCCAGATGAGTACGATAAAGTGATTTGCGCGGAGATACCAGACAAGGCCAAATACCCTGAGCTACATCGTCTTGTCATCAAGCATATGCTGCACGGACCATGCGGCGCATTGAACAAGAATTGTGCTTGTATGGTGGATGGAGAGTGTCGCTTTGACTTTCCTCGACAGTTCAACCAGGCAACCCAACAAGGGAAGGACTCATACCCTTTGTACAGGAGGCGAGATGACGGATGGCGTGTCAAGATTAGAGGTGCTGAGTTAGACAACAGGTGGGTGGTCCCATATAATCCAGGACTGCTTATGCGGTATAACTGTCACATCAATGTTGAAGCTTGCGCAAGCATCAAATCTGTGAAGTACCTATATAAGTATGTGTATAAAGGACACGACTGTGCATCTTTCTCGGTTGATCCATCTGGGGAAATAAATGAGATACAACAGTACAGAAATGCCAGATATGTGACACCACCAGAGGCTATATATAGGATGCTTGGTTTCCCACTGTTCGGTATCTATCCGGCTGTTTTGCAGCTCCAACTTCATCTTCCTAACATGCAGTATGTCATGTATGATGAGAATGTTAATCTCGAGGATGTTGTCAATCGTCCGTCTTCTTCTAGGACAACTCTTACGGAGTATTTCAAAATGAATCAAGTAGACCCAGAAGCAAGGAAATTGCTATACAAGGAGTTCCCCGAACACTACCGTTGGATAACTGGACAGAATGTGTGGCAGAAAAGGAAAACGAAGAGAGGTCAGGTTGGACGAGTCGTGTACGCTCACCCTGGAGAGGGGGAGAGATACTACTTGAGAGTTCTTCTCAACCATGTACGAGGTGCTACCTCGTTTGAAGATTTGAGGACAGTGTCAGGTACAATGTACTCTACTTTTAGAGAGGCATGCGAGAAGAGAGGACTTGTGGAGACGGACAAGTCACATGACGATTGTTTGAATGAGGCATCCACTTTCCAAATGCCATCTGCTCTGCGTCGGTTATTTGCAACCATACTGGTATTTTGCGAAGTCACCGATATCCGTGCGTTATGGGACAATCACAAGACTGCAATGTCTGAAGATTACAGCCGAGGGAACACTAACACTGCAACAGTAGAGCAGATGGTCCTACGAGACATACGTGATTTGCTTCATTCCATGGGGAAGGATATCACGGAGTATGGTCTTCCCGAGATCATTGATATAGTTTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MACICKCTECLVVWDNKLNFHLADIIFTYTAPVVIHDHTASPFCPSRKVALTAINLGKDGVTQYQSIQKPIVREVIPDTDYVEFDSSLFEPTNEDIVDNGRTEDAQGVDNDFDEASQVLEDDGYESYRVDVSGVNGTGIDDPHDRVYHKLPKTHHVLKKVPDCKHCHAIRFQFESPGFCCREGKINVKIPTVPAELIRLFTSQVHNDAKYFRKHIRYFNSHFSFTSLGVTLDQRVSTAAGTGIYTFRVHGALYHRLDNLVPGSQGPRHMQLYFYDTEDADALAHRVRRSPDLDINLVRVILGILAKNPYVQTFNRVGSIPNLDNYMIELNTNVTPDQRRYNAPTASQVAAIWLEGDDPVRTFDRHVLVHAKGDKPSYIKAYHGCYDPLAYPLFNPNGETGWNLKMPYEDPNQIPCDVEMDETCEAPTFVNVRTNEESTFDDLPENEVVDNYLDNEDDNDDSTKSGKGKKDKFVTAREYYCFRLQVRRGLLNIILFGGRLFQQWAVDMYIKIESMRLDWYSKPENQKKIRAELYQGVVDVLSSGETSGSAVGKRVVLPRSFPGGDRDMQRRFLNAMALVQRFGRPDYFITMTCNPYWDEITENLEPGQLPQDRPDLVARVFRAKLRDMLDLFVKKKYFGEVQAYAHVTEFQKRGLPHEHILLIIKSGSKLTTPDEYDKVICAEIPDKAKYPELHRLVIKHMLHGPCGALNKNCACMVDGECRFDFPRQFNQATQQGKDSYPLYRRRDDGWRVKIRGAELDNRWVVPYNPGLLMRYNCHINVEACASIKSVKYLYKYVYKGHDCASFSVDPSGEINEIQQYRNARYVTPPEAIYRMLGFPLFGIYPAVLQLQLHLPNMQYVMYDENVNLEDVVNRPSSSRTTLTEYFKMNQVDPEARKLLYKEFPEHYRWITGQNVWQKRKTKRGQVGRVVYAHPGEGERYYLRVLLNHVRGATSFEDLRTVSGTMYSTFREACEKRGLVETDKSHDDCLNEASTFQMPSALRRLFATILVFCEVTDIRALWDNHKTAMSEDYSRGNTNTATVEQMVLRDIRDLLHSMGKDITEYGLPEIIDIV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..25#1291..1440#4726..4848#4938..5969#6061..6332#6430..8041#10372..10376#ATGGCTTGCATTTGCAAATGCACTGGTATATTATATACTCTATACATTTAAGTTAAACTCATCTTTTTCTGCCATCAGAAGAGAAGCTGCCTTGTCCCAATTCCTTGCATTTGATCCCACCAATTTTGTGATAGATTGTGGATTTCCATCACACATGTTTCATCGTTATTTTTTTTCCTGACGACATGTTTTTCTATTAAGAGAATAATAATTGTACGAACTGCTTTTCATGAAAAATTTACCAACATCATTTTCTCATGGAAAATTCTAGCATTTCTGTATCAACTAATCATGGAAATATCGATGTCTGACTGGGACAGCATCTATTTGACATTGGAGGTAGTACTGATTACAAAAATGCATACAACTAAATTGAATAAGGTACCAGACAGTTGCAAGCCCCTTCTGTTCTTGAGGCTGTTTGGAATCAACTTTCATATAAGTTATATCTGTTGTGATCTCTTCTCCGTACAATTAATTCCTTTTCAAAAGTTCCCCCTTGCTGCAGGGAGGCCAAAGCTTTTTTCGTTATTGATATAATAATATAGTTAAGTCTTTTGCATGTCCCTGAAAAAAAGGTAAAAAGATACAGATGAAGCATATGCAAAGAACCTTAGTAGAACTATATGTATTTACATGTGTGCACCTTGGTATATTGAGAGAAGTAGAGCCTGCAGCATCCATAAAATACCTTGCTTTTTTTAAATTTTATTTTATTTGTACTTGCATATATTGTTTTTAGTTGTGATAACAGAGATATATAATTTTCACTTAAGACGATATTGTAGTGTGGTTTTATTATGCTTTCTATTTGGATATTCGATAGGGGGGACGTTTTCGGTTCAGATATCGAATTTGCGAATTTGGCCATAGCTAGCTGTCATATATGACAAAATTAGTACACCTATTGACAGGACAAAGCTAGCTACATGCATGTGTGCATTTTGCTTGGAATCATGTAAGATCACCATCCAATTCGCAACATTGAGCCATTTTCTTTCTTTGTGTTTCGCTGAATGTGTGGTGTCAAATTTCCATGCCTAGGAGGTGCTCGATTAAATGCGGCATAAACAATCTTCCATTCAATTCATCAAACAATTTTGTCCTCAATGTGTGGTTTTGTACTCTTTATCTGTGTACTAGGTAGTAATTTTCAGATTGTAGTTGCAGATCAGGTATATTGTCAGTTGAAATTAGATTCTGAGGGGTATAGATGCTTTCTGTGCATGAATGAACTTAAAAGGCTACTAATCTGCGTGCTGTCTATCTTTTTCTTTTTGCTTGGTACAGAATGCTTAGTTGTCTGGGACAACAAGCTCAATTTCCACCTCGCTGATATCATTTTCACCTACACCGCCCCTGTTGTCATCCACGACCACACTGCATCTCCCTTTTGTCCATCCAGGAAGGTCGCCCTCACAGCGATCAACCTGGGGAAAGGTAAATTTCCCATTGAAACAGGTCCACCCTTTTGTTAATATTTAAAACATTCCTTTATATTCCTCCATGTATAAAATCCTCTGAAGGGAAGCGTTTTCTCTGTGATTTTTGAGGGAAGGAATGTTTCCTACTCGACATTTTCAGAAAGAAAATGTATTTGTAGTACCATTCCTTGGTTTTTTCGATTTGCATGATTTCTTGTATAGCTGCTCATCGTCTTGAAACCTACAGTAACCCTTGGATGCTGTTGTAGTAACTACTGAGAATGGACTGAAATCCACTGACTAAAATCAGGTCTGAAATTTTATATTGCACTGGGCATACTTGTTAGGCTAAAATCATGTCTGAAATTTTTACACCCACTAATTCATGTAATAATCTAAGGTTTAAAAAAGGTAATTTCCGAATAATGTAGAAAGCAAATATGGGTAATCTTCCAAGCTGCACGTGAGCAGAGAGATTTGCCTGAACCACAAATGGTCGAATACGATTTGCTACGGGATGTGCACTCTCTTCAAATTAGTCTTGAGTGCAAGAGCATATTTTCTCTGTATCTACAGCTAGATGTGCACCGTTGTATGCTCTGGTTGCACCAACTGGAGTTGTTTTTGATTCATTTTCAGTTTGCTTTCAAATGTAAATAAAGCCTAAACCCATATTTTATTAGCTTTGTTTCTTAGCTATATGGATTCTATTCGCTTTACCAGGATGTTTCTTTATGCAGTGAAGTGCCGTTTTTCTCATTCAGCTTGAATGCAAAAAAAAATGAAGCTTGATTAGTTGTCTCAAACACTGGTTAACTGACGCTAATGCCCACACTTTTGCATGTTTAAACATGTCTCTATCGCTGGTTAATTAACGGATGAAAGCTTCTGGATATTTGGACTGACCATTTTTTTCCAAAAGCAAATATTATCTTGGCCAATTTGTTTCTTACGCACAAAAAAGGACTTTGAGATAGCTTAAAACATCTCATTGCTATAATGCTGCAACTTCAGTAAGTATAATAACAATCATTGGTGTTATTTAGAAAGACAAATCCAGCTGATGGGTACACAACGTGATTTTATAGGAAGAATTCATATCCGATTTATTTATCGAATACTATATACCAGATGGATTGCATTGGTTTTTTTTTTTCAATTTTATTTCGGTGGTGAAACTTGCGCGGCAACCTAACAAAAAGGGATTGATGTGTAGTTTAATTCTTTACTTTTCCTTTCTTGGTATGACTTTAATTCATGCATCTTTTGTAATTGTTTAATTTAGATCATATAAAATAATACTGTAGCGTTAGCACATGCATGCTATTAATATATAGGTGAACAGCAGCACACAAACCTTCTACTGTTATCAAAATGATTTCTATGCAGGACCTATATATGCTATTAATATATAGGTGATCCATGCAAATTAAGTACAGCAGCACAGGTATATGTAGACAAATTAAGTACAAAATTGAACATCCCCATCTCTGAATGGAACAAAAGGCAGCACAAATTAGTGGTCGGATCAATAGCAAAACCAGTATCTCTGAGATGCAATATTTAGTTATTTCTCAAATTTCTCAATGCTGATTCCAATATGCAGCAACAGAATTAATTATTGCTAATCTAATGTGCAGGAAGAACTCTGGCTTGACGTCAACTGCCACAACTTCACTGCTGTGGAACAAGCTGTCCATTGTCCTTGGTATTCAGTCAACCCTATCACCCAACAACAAACATATATATTAAATTAAAATTTGTTGGATAACCTAAAGCATACAACACTCACATCGGTTGGATAACCTGTGAGGAAACAAATTATTATGTGAATGCATGAGACTATATAGTTACTTACCTAGCTAAGGGTGAACTGTGTGGGGCTGTGGGCAAATTCAGTACATAACCTGCTCGTGGCAAATTGAGGACTAAAATTTTGATTTTGATTTAGATTTCCAAACCTTTTCTCATTTTATTTTCATGCCAGATCAAAGAAGTCATATGACATTTAAAAGTGTATTGGAGGATCATACGTTATGAACGGTTGTGGATTGGCACGTAAAGTTGTTGTACTTTCTATACTTGTATTGAGTGGATATGATTCTCATACTTACAAATCACATGTTATACTCGACTCAGCTTTATTAAAAATTTATCGATTAGGTATGGAACCAAAAGGATCAGCTAATGGAGATCGTGTTCCCTTCAGAGATTTGACTAATGTTTCTTCAGGTGTTGTCGCTATACTTTGTACTTTGTGTCCTGATCTTTATATACTCCTCTGACATATATGAACTTTTAGTATTGTCTGTTTGTTTTTCTATTTTGAAAAAGCACCTACATCAGCTCAAAATACACCTTGTAATGACGCCCAACGTAAGAGAGAAGAAACTAACGCGAAACAACGCGAATATCGTGCGAAGAAGAAGGCTGAGGCAAACAAAGTTATTAGTCCTCTCATATTTACATCACAAACACCACTATCACAAACCGAATTGTTGGCTAAAGAGAAGAAAGATGAAAGGAATAGAAAGCAGTGTGAATGGCGCGCTAGGAGTGCACTGAAGAAGGCCGAGGAGATCTCTAAAATAGATATGGTAACTCCTGACACTGTCATGCAAAGTTTGACAGAGACTGAATTGTTATCCAGACAAAAGAAAGAATTATTGGCTAGGAAGCAACGTGAATGGCGTGCAAAGAGAAAGGTGGACTCACAATCGGTTGAAGATAGTGCGAACAGTGAAATTCTTCAGGTGTCTACCTTTTGTCATGCGCAATTGACTGAGAGTCAGGAGGACCAACATTCTGAAATGTTGAGCACCCAATCTAAGAGAGAACAGAGAAACAAATATATGCGTGAATATCGGGCACGGAAAAAGGCTAAATTGAGCAATACTAACGGAGGGGGTACTGCACGAAGCACTCCTACTATTGGTAAAGTTTAGTGCCTTTGGTTAATTTCAGTTTTCTTTATCAATTATTCTTATGTATATTGTTTTGTTACATAGGTGCGTCCTCTGTCATTACTGAAGGGTCGATGCATGGAATGATGCATTCTACCATTCTAGAAAATCAGAGCGGTGCTAACAAGGAAAATCTTGATCCAGACAATACCGATGATTGGCTACATAGAAATGATAGCTATATACCTCGATTCAGTGCAAGGAAAACATCGAGCCTTCAACAGGGGGGAGAAAGCTCAGTCCTAAGTGAGACCATTCATATAATTTTATGCATTGCACTCTATTTTGATTTCAATCGCAAAAACACACATTTTAATAAGTTGTTCCCTTCTAATCAGATGGAGTTACTCAATATCAAAGTATACAAAAACCTATTGTTCGTGAGGTCATTCCAGATACTGACTACGTTGAATTTGATAGCTCATTATTCGAGCCTACAAATGAAGATATAGTTGACAACGGTGAGTTCTCATATATCATTCAGCAGTTAATGCATCCTATCTAATATTAAAATATATTGTCTCA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