BGIOSGA010715

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA010715

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA010715, complete gene.

LocusTag

OsI_11617

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA010715-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA010715-PA

Length

12241

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:15145226..15157466

Sequence Coding Region

15157389..15157466,15154390..15154460,15154229..15154307,15153949..15154093,15153737..15153856
,15153554..15153631,15153360..15153415,15153197..15153266,15152659..15152746
,15151919..15152162,15151451..15151678,15150241..15150567,15149996..15150045
,15149240..15149300,15149088..15149171,15148068..15148181,15147825..15147994
,15147422..15147488,15146873..15147061,15146604..15146791,15146273..15146408
,15145226..15145366

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:15145226..15157466 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:15145226..15157466 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGTCGTCCGCGCCGGCGGCGGGCGGGGCGTTCGACCGGTACCAGCGGGCGGGCGCGCCGGCGGCCAGCGGGAACACGAGTACCTTGCCCCAGAGAGGTGGTGAAGTGAATGTTACTCTGGGAGGAATTGACTTGAATAATTCTGGGAGTGTGGTAGTCAGAGAAGACAAGAAGTTATTGACTGTCCTTTTCCCAGATGGCCGTGATGGTCGTGCATTCACCCTTAAGGCAGAAACTTCTGAAGATTTATTTGAGTGGAAAACAGCATTAGAAGAGGCTCTTGCGCAGGCTCCAAATGCAGCTCTTGTGATGGGACATAATGGGATCTTTCGTAATGAAACGACTGACACATATGATGGAGCTATCCCAAATTGGAGAGAGAAGAGGCCGATCAAGTCGTTAGTTGTTGGCAGGCCAATTCTTCTCGCACTTGAGGATATTGATGGAAGCCCTTCTTTTCTAGAAAAAGCTCTGCGTTTTCTTGAGAAATATGGGATAAAGGTGGAAGGAATTCTACGCCAGGCTGCAGATGTAGAGGAGGTTGACAGGAGATTGCAGGAATACGAGCAAGGAAGGACGGAGTTTGCACCGGATGAAGATTCTCACATTGTTGGTGATTGTGTAAAGCATGTTCTCCGAGAGCTACCATCCTCTCCAGTTCCTGCTTCCTGCTGTACAGCATTATTGGAAGCTTTTCGGCTGGAGACTAAGGATGCTCGGATAAATGCTATGCGCTCAGCTATAGTTGAGACATTTCCAGAGCCTAATCGGCGGTTACTGCAGAGAATTTTGAAAATGATGTATACTATCGCTTCTCATACTTCCGAGAACCGAATGACAGCATCAGCAGTTGCTGCCTGTATGGCTCCTCTGTTGTTGCGTCCACTTCTTGCTGGTGAATGTGAAATGGATGAGGTATTTGATATGGATGGCGATGATTCTACACAGCTTCTTGCTGCTGCAAATGCCGCTAACAGTGCTCAAGGCATTGTCACAACTCTCTTAGAGGAATACGAGAGTATATTTGATGGTGAACACAACCTTAGATGCTCCCTGTCGCCAGAGTCTCAAATTGAAGATAGCGGTAGCGAGGCATCAACAGATGATGTAAATTTGGATGTCAAGGGTAATGGATTTCATGATGCTGAAAATGATGTAGATCAGGAAATGGATGATGAGAATGGCGCAGAACGTATACTTAGTGGAAAACTGAGTGAGAGCAGTGGATACGCTGGCAGTGACCTCTATGACTACAAGGTTGTTCATGCTGATGATTCAGATGCTGAACGTTCTGAAGATGCTAAGGCAGCGGAAGTAAAGATTGAGTTAAGCAAAGGTCCAAAAAGTCATTCAACTGAAAACGGTTCAGCATATATGGAAACATTGCTGAGTGAAAAGAATCCTTCTAACCCAATATCTAGCCATGAGACTCCACTGTCTATGGGAGAAATACTTTCTTCTTTGGATCCTGGAATATCTTTAGCTAATCACAGTGGTGAATATTCTGTAGAAAGCAGACAGCCAGCCAAAATCAATGGATCTCACCCACATGTGAAACGCAGTAACTTCTGGGGGAGGAATAATGCAAGAAAGAGTCAACACTCTGAATCAGTCGACTCATCTGGTGAAGAAGAGCTTGCTATTCAAAGGCTCGAAATAGCAAAGAATGATCTGCAGAACAGAATTGCCAAAGAGGCTAGGGGTAATGCAATTCTACAGGCAAGTTTGGAAAGAAGGAAACAAGCACTGCATGAACGTCGTTTGGCCCTGGAACAGGATGTGTCTAGGTTGCAAGAGCAACTACAGGCAGAGAGAGATCTTAGAGCTGCATTGGAGGTTGGATTGAGCATGTCTTCCAGTCAGTTTTCTAGTTCACGTGCTATGGACACGAAGACGAGAGCTGAACTTGAGGAGATTGCTCTTGCTGAAGCTGATGTTGCAAGGTTAAAGCAGAAGGTTGCAGAGCTTCATCTCCAACTCAACCAACAGCGCCAACACCAGTATGGCCCTATGGTAGATTCAAATGATCGTTACCACCGTATTCCTGGCCATTTTTCGCAGCAGAACTTTGTTCAGCCAGGATTCGACATGAACCTTGCCTTCTGCAACCAAGAGAAGCAGAGAAATGAGGAGAGCTCGGTGGACTCATCACAGTGGAGAAATATCAAGCAGCATGTGCTACCTTATGGTTCTTCAAGGCCACTCACCCGCAAGCTCTCTTTGGACGCATCTTCAAGCGATTCAAGAGGCATGGAGGCATCGACGAGCATGCCAACAGATAACACTGCTATGGCTATCAATGCCCCAAAGTTTACTGAGGGTGTTGATTATGGGAGGCAACCAATGGTGGCCTCCTCCACTTTGGTAGAACTGACAACTAGGCTAGACTTCTTCAAAGAGCGGAGGTCGCAACTGATGGAACAACTCCACAGTCTCGATTTAGGACATGGATCCGCTTCTCAGGGTTTTCCATACAACAAACCGCCCTCTCCTTGGGACAGTCCAAGGTGGGGTGCCATTCAAAACAAAAATTTCCAGCGCTATAACAGTATATATTTGTATTTTTGTGTGGCTACTCAAAAGGAAGGAATAGAGTTACGCGTTTGTACGGTTGTTTGGTTTATAACACTTGGTTTGATGAAGGTGGAACAGCACATCAAGCGCAAGCTCATGAGCCAGGGCATCGATCCGCAGACGCATCAGCCGGTTAGCGCCGGGACCAGCGTTGCCGCGGCAAGCGAGCTGACCACGACGGCCAGCACTGTCGGCTTCCCATCCCTGTAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MSSAPAAGGAFDRYQRAGAPAASGNTSTLPQRGGEVNVTLGGIDLNNSGSVVVREDKKLLTVLFPDGRDGRAFTLKAETSEDLFEWKTALEEALAQAPNAALVMGHNGIFRNETTDTYDGAIPNWREKRPIKSLVVGRPILLALEDIDGSPSFLEKALRFLEKYGIKVEGILRQAADVEEVDRRLQEYEQGRTEFAPDEDSHIVGDCVKHVLRELPSSPVPASCCTALLEAFRLETKDARINAMRSAIVETFPEPNRRLLQRILKMMYTIASHTSENRMTASAVAACMAPLLLRPLLAGECEMDEVFDMDGDDSTQLLAAANAANSAQGIVTTLLEEYESIFDGEHNLRCSLSPESQIEDSGSEASTDDVNLDVKGNGFHDAENDVDQEMDDENGAERILSGKLSESSGYAGSDLYDYKVVHADDSDAERSEDAKAAEVKIELSKGPKSHSTENGSAYMETLLSEKNPSNPISSHETPLSMGEILSSLDPGISLANHSGEYSVESRQPAKINGSHPHVKRSNFWGRNNARKSQHSESVDSSGEEELAIQRLEIAKNDLQNRIAKEARGNAILQASLERRKQALHERRLALEQDVSRLQEQLQAERDLRAALEVGLSMSSSQFSSSRAMDTKTRAELEEIALAEADVARLKQKVAELHLQLNQQRQHQYGPMVDSNDRYHRIPGHFSQQNFVQPGFDMNLAFCNQEKQRNEESSVDSSQWRNIKQHVLPYGSSRPLTRKLSLDASSSDSRGMEASTSMPTDNTAMAINAPKFTEGVDYGRQPMVASSTLVELTTRLDFFKERRSQLMEQLHSLDLGHGSASQGFPYNKPPSPWDSPRWGAIQNKNFQRYNSIYLYFCVATQKEGIELRVCTVVWFITLGLMKVEQHIKRKLMSQGIDPQTHQPVSAGTSVAAASELTTTASTVGFPSL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..78#3007..3077#3160..3238#3374..3518#3611..3730#3836..3913#4052..4107#4201..4270#4721..4808#5305..5548#5789..6016#6900..7226#7422..7471#8167..8227#8296..8379#9286..9399#9473..9642#9979..10045#10406..10594#10676..10863#11059..11194#12101..12241#ATGTCGTCCGCGCCGGCGGCGGGCGGGGCGTTCGACCGGTACCAGCGGGCGGGCGCGCCGGCGGCCAGCGGGAACACGGTGCGTTCACGTCGCGTCGCCTCTCCTCTCCGTGTGGACTGGGCTTAGCTAGGAGTAGCTAGCTAGCTTCCTTGCGTGCGTCATGCGCGGGTGGTGGCTTGGGGGATTTTGGGGTGGGTTTTGGTATCTGATGCTTACGGGCATCTCGGTTTCGTGTTCCCGCGGCTCTATAATTTGGACCTCATGGGGGGTTCAGCGGCCGCCGCAAGCTTCTGCTCTAGACTGGCATTGCTGGCAAGGAGATGCTGCGTAGCTGCTATTAATAGGAAGGTTTCGACTTCAGTCGGGTTGCATCAGATGAGCTGCCCTTTTTTGGGGGGCTCCCACGAGCTTCGATTTCCTTCATACCGATGGTCATACTGGCGGGGTGCTGGCAATGCAGCTTAGGATAATCACCGGAACATGCAATGGATAAGGAAATGTAACTACATTTGTGGAGGTTTTGATGCTTGCCGAATGTCGATGGGGGCATCGTGAAGCTTGCCTGGTTTTGACCTGAGATTGGCTCTGATTACGGCTGAATGGTGTGTCAGATGTTGCGTGGGGTTTGACGTGATGGTGACACGTGTGAATTGGGGCCGAGTGGAGAGAGAATTTGAGGGCGGGAGATTTGTGGCATGGTAACCGTGAAGGATAATTTGGAGCAAAAATGATAAGAGCAGGGTGGAGCGGTGCACAGGTAAGAAAGGAAGAAATAATATCTGGTTGGAAGATGATCAGCTGTCAGCACAAGGAGGGAGTAGAATTTAGGAAGCTCACACATGCAGATACATCTATTATTTCGTGAAACTAGATTTGGGGAATTCTAAATGGTTTGATGTCTAGCATATGCATTTCATGAATGTGCTTAAGCTTTCTGCGTGGCTTCCCATTACATTAGTAAATTGTAAATAAACATGCATGTAAACTCAGATCAGATGACATGGTAAATTGATCGACTTCAGTAGTTCAGTTCCCCAAGCCCTAACTCTTGATAAAGCAAGATAGAAATAGACATCTTAGCATCAATCTACATTCTACTTGCTGCGCTCACCTCGTCTATATTTAGAAGATCAAATTCCAATACTACTATGACATTACCATCAACACTAATTTTGTTATCATGCCATCACAGGATGCAACTTTTAGTAATGAAAACCTAATCATATTCACTTTGTTAGGTCCATGCACAGTGATTTTCTCCAGAAAATTAATTTGGGAATTCTTGGAACTGTTTTTATTCATCATGTTGAGCATAAAGCAGTATGCTTTTAGTTAGCACTAGAGTTGAACACACAAGAGTTAATTAACAACGTGGTCATGTATCGGATATACATATACAATTCCTTTCCATTTTATCTACTATGAATTTTGAATGTTTGTCTATATACATATTACGTACTTGCTAGGTATTGCAATCTCTTAGTATATTTAATATTATTGTCCTGTTCACATTTCTGATGTCAACTAGTGTGCTAACCAGGTTTTCAAGAGTGGACCTCTCTTCATTTCATCAAAGGGTACATTCTTGCTCTCTACCTCTGTCACATGTATCATAAGTTGTTTCAGGCCGTTTATGTGATGTAAACATGTAAAGTTAGTCCAAATATTCCCATTTTCTCTTGTGTCTCTGTTTGAATTCTTCAAAGAATTGAGGCACTCACATATTTTTGGTGATGAACGCCGACACCATGATTATATAGAGGATGCCATAATATTCTTCTTTTTTGTGATATTAATTATTTCTTGGTTTCTTGGATTATAAGCGAAGGGGGAGGAACATATGTTCTGTAATTTCCAACATAGGTTAATCAGGTTGAAGTATCTTGCTAGCAATCATGTACGCACAAAGGAACTATACGAATCCAGGAATTATCTAGAGAATAACTTTTCTCAAAGTTAGATATGCTTGTATCATGCCTTTGTCACCAACTTACGTGGGAAAGATAAACCTGTTGCCATGGGGAAGGCTCCAAAATCCAAACCAAATGATAGTTTGGATTGCCTTATGCCTCAGAAATTCAATTAGAGTGCCAAATATGACTCCTGCCAGCTGAATCATGATTTTCCTGAGCAGATTGATTCCTACGAATTGTAATTTAGTTAATCTACCAAAATCACCCTTTCATATTTGAATTAAATCATGTGTTGTGAGTCAGTATCACATTGTCTATTTTTGGTATGTCTTCTACAACTTTCTAATATGATATCATATTCTTCTACAGTAAAGAAAACTCTTTTTATATATAATTTTCAGGAATCGGGTGGAAATCATGGAAAAAACGGTGGTTCATCCTCACACGAACATCATTGGTTTTCTTCAAGAGTGATCCTGTTAGTATTTCTATCATTATATGTTTCCTCTGCTTGAGAAGTCAATAATTAGCCTGGTGTACCTTTGCATAACTTGTTTCTCAGAGCCCTGAATTTAGTTGATGTTATAGATGAAGTATAGCATATGAACTTTTTCCGGCAAAAGCACAACCACCACAGAATGTGATTATTTGGCTTTAAGTGCCATCACTCTTATTTGTTGAAACTGCTATAAATTGTTCTGCTTGTAAGACAAGTCCTACTAGGGAAAAAAAAGTTCATTGCCACCTTGCCATGCACAGATAATTTGATAGTTAATAGTATATAGTTTCAATTTTCGATCCATTTTTCGCATGTGTGCAATACTTTGAAATGCATGAGTTTTCAACATCTAGTGCTCATAACAAATCAATTACACAACATGCTTTGGTTATATAAGCTCTCCTGTCTTAAGTTTTGAACAACTTGTTTTCTCCCAATTGATGTGCATTTCCTTTTCTATTTTCGATAGGGAGTTGAGTTAAATTATTTAATGAGTCCTTTCTCTCTCTCTCCCACCCACCCACTAGTGCAGTTATAACTTGTGTAACAACAACCATTTCCTAATTCTTGATAAACCTTTTGTTGACATTGTAGAGTACCTTGCCCCAGAGAGGTGGTGAAGTGAATGTTACTCTGGGAGGAATTGACTTGAATAATTCTGGGAGGTATTTACCTCATTCTTGAGATTTTCTTTTCCCTTTTAGGATGTACAGATAATACTGTATTAAAAGCTCTTATCATTTGCAGTGTGGTAGTCAGAGAAGACAAGAAGTTATTGACTGTCCTTTTCCCAGATGGCCGTGATGGTCGTGCATTCACCCTTAAGGTAAGATGGTTTTTCCTTTCCTATTTAATAATTGGATCATCTCAACACAGATGAGAGATTGAATGATCAGACATATGTTCATGCTCCTTACTCCTTATTAGTATTTTCTGAATGTTGTATATTTGCTTAATACAGGCAGAAACTTCTGAAGATTTATTTGAGTGGAAAACAGCATTAGAAGAGGCTCTTGCGCAGGCTCCAAATGCAGCTCTTGTGATGGGACATAATGGGATCTTTCGTAATGAAACGACTGACACATATGATGGAGCTATCCCAAATTGTTGGTCTACTTATGCTATTTCATTTTTTTTTCTTCTCCTACTCATTACAACCTTGTTTGTTGTTAACTCATGCCTTTCCAATTATTTGCAGGGAGAGAGAAGAGGCCGATCAAGTCGTTAGTTGTTGGCAGGCCAATTCTTCTCGCACTTGAGGATATTGATGGAAGCCCTTCTTTTCTAGAAAAAGCTCTGCGTTTTCTTGAGAAATATGGTGGGTGCACAAATAATTTTTAACTAGCACCATCTTTAGAACCTGGAGTACTGCTAGTTTAGCATCTGTACAATGTACAATAGTTATGTTAATCTTTTCTTGTAGGGATAAAGGTGGAAGGAATTCTACGCCAGGCTGCAGATGTAGAGGAGGTTGACAGGAGATTGCAGGAATACGAGCAAGGTTGAACCATTTCTTAGTTTATTCTATGACTAGTATTGTTAATTTGATGGTATTGGTAGCTCTGTTTTGTTTTTGTCTTTGCTTATTGATTAATTTGCATATGGTTCCATTATTGTGCCTGTTTATATCCCCTACCAGGAAGGACGGAGTTTGCACCGGATGAAGATTCTCACATTGTTGGTGATTGTGTAAAGGTAACTCTGTCACGGTACCTCTTCTTTTTTGTGCTGGGAGCTTGAATAATCCGTTCTATCACTAACTGTATGTTCATGTAAACATCTCTGCAGCATGTTCTCCGAGAGCTACCATCCTCTCCAGTTCCTGCTTCCTGCTGTACAGCATTATTGGAAGCTTTTCGTAAGTGTTCTATTCAGTTTAAACTAAGTGATATTGCTCTAGTATATTCCGTCGCTGTTGAGTATTGACATATGCATAGGATACTAGGAAACACACCTAGGTTCCTGTTGTGTATCACTTACAATTTAATTCCATCTCAGTCTATTCCAGGAAGTCTGTAGATAACTGTGGAAATGGGGATAATTATCTTTTTGAATTATGTAGTTATTTTGCTCAAAAGTGCCTGGCATTGGCATGTCCCCTTGTATGGCCGATGATTATATTTCTATATAGTTTCATAGTATGCTCCTCTATTCCCGTGTATTCTTTGCCTCTGAATTTTAGTTGATCTAGGCAAGCATCTAAGATGCTAGTTGATGTACATTTATCGCTAAGATCTTACATGCTTTCTCATTTCCTTTGCTGTCTTTTTATTTGACTAACTGTCTATATTCTGCTTTACTTTCCTAGGGCTGGAGACTAAGGATGCT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