BGIOSGA010939

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA010939

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA010939, complete gene.

LocusTag

OS03G0292900

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA010939-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA010939-PA

Length

9951

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:11137477..11147427

Sequence Coding Region

11147287..11147427,11147076..11147185,11146165..11146237,11146009..11146070,11145770..11145911
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,11142956..11143116,11142654..11142753,11142462..11142536,11142244..11142378
,11140903..11140998,11140176..11140358,11139989..11140093,11139375..11139533
,11138965..11139009,11138640..11138855,11138016..11138122,11137889..11137945
,11137730..11137808,11137477..11137641

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:11137477..11147427 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:11137477..11147427 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCTCTCTCCGCCGGGGACGTGCAGTTCATCTACTCCGTCCTCGCCAACTCGCTCAGCGCCGACGCGGCCACGCGGCAGCCGGCGGAGGCCTTGCTCGCGCAGTGCGAAGCGCGCCAGGGGTTCTGCTCCTGCCTCCTCGCGATCATCACGTCGAGAGGGGAGGAATCCGACGACGATGTGCGGCTGCTCGCCGCCGTACACCTTAAGAACTGCGTCACCCGCTGCTGGCGGAACAGCGTCGATTCCCCTGCCATAGATAATGAAGAAAAGGTCTACATTCGAAAAAGTCTTCTGCTAAATATGCGAGAAGAAAATGGGAAGATTGCACTTCAATTGGCTGCACTGATAGCCAGGATTGTATACTTTGATTATCCAAAGGAATGGTCAGATGTCTTCTCTGTGTTGGCACAGCAACTTCAGACATCTGATGTATTCACTTCATATCAAGTGTCTACAGTCCTATTCCGATCTTTGAAGAAACTATCAAAAAAACGTCTTGCTTTCGATCAGAGGAACTACTCTGAGATCACTGTCTACTTGTTTGATTATATCTGGAACCTCTGGAAGAGCAATGCACAGATTGTATTACAAAATTTTTCAGTGCTTTCTCAGCATAATTCCAGTTTGGACCAATCAAATGATCTACTGTTAATATATGAAAGATGGTTAGTCTGTTTGAAGATCATTCGCGAATTGATTTGCTCAGGTTATGCAAGTGATTCAACAACCATGCAGGAAGTCTGTCAAATCAAGGAAGTCTGTCCGGTACTTCTGGGTGCTATTCAATCTATTCTTCCATATTATCCCTTCTTCAAAGAAAGGCAAGCTAAGCCGTGGAGCCATGCAAAAAGAGCATGCATTAAGCTGATGAAAGTTCTTATTATATTACAAGACAAGTATCCTTATTCATTTGCTCATGAAACTGTGCTTCCAGCAGCAGTTGACTTCTGTTTGACTATGATCACAAATCCTGAACAGGCAGATACATCTTTTGAGGAATTTCTTGTCCAGTGCATGGTTTTGGTGAAATTAGTATTGGAGTGTCAGGAATACAAGCCAGGTCAAATAGGCTTTGAAGCAGTTGGAAGTTCAGAACATGCAATTTTTGATCAAAGGAAGAACAACCTTTCAGCTACTGCCAGCAGCATGGTGATGTCTGTTCTTCCTGCTGACCGTATTATGTTGCTATGCGATATATTAATAAGGAGGCACTTCATTTATACAGCAACAGATATGATTGAATGGCATTCCAATCCTGAATCCTTTCATCACGAGCAGAATCTGCTACAATGTACAGAGAAACGCCGACCATGTGCTGAAGCACTTTTCATTATTTTGTTTGACAACTACGGAGTGCAACTTGCTCCTTTTGTTGCCTCCATCATCCATGATGTCAAAGCTGTTTCGCCTCCACTTGAAATAGAAATTACTGCTGGAATGCTTTTAAAGGAGGCTGCTTATACAGCTGCTGGCCATGTTTTTGATGAACTCTCAAAGTACCTTAGTTTCGATGAATGGTTCTGTGGATATCTATCTATTGATCTTTCAAATGGCAACCCCAATATGTGCATCATTCGTCGAAGAATTGCATTGTTACTTGGACAATGTGCTTTTGAGATAAAGGGCGTTATTCAGAAAGAGGTCTGTGATGTTTTGGTTGGACTTCTTGGGGATCAGGACATGGCCGTTAGGCTGGCAGCATGCTCTTCCCTATGTTACGCTTTCCGAGTTTTTGGTATTTGGGAAGTAGATTTGCTTGAGTGTATTCCTACATGTTGGGTAATGTGTTTCAAGTTGATAGGAGCTGTTCAAGAATTTGATTCAAAGGTGCAAGTCCTGAGTTTTATTCTGGTTCTCCTTAATTATGTTGGGGACGACAGGATCATTCCATTTGTGAGCGAGCTATCACAATTTTTTCTAAAGACCTGGGAGGAATCATCTGGTGAATGTTTACTACAGATAGAACTTCTAGATGCAATTCGAACTTTTATTTCTTCTCTTGGGTATAACTCTCCACTTTGTTATGGCATGGTTCTTCCTATACTCCAATATGGCATGGATGTTCATAGTCCTAACGCTCTTAATCTTCTTGAGGACACTGTTTTGTTGTTGGAAGCAACTCTTTCTAATGCCCCTTCCATTGTGCCTCAACTGCTGGACTGCTTCCCTTATCTTGTGGGCATCATGAATGGGAGCTTCAATCATTTGGAGATCATGATCAAAATAATAGAGCACTACATAGTTTTTGCTGGATCAGATCTCTTGCAAAGCCATGCCACAAGTTTAGAAAGCATCCTTGATACTATTGTGGGCAATGCTGATGATAAGGGCCTTCTCACAACACTTCCTATCATTGATCTTCTTGTTCTGATGTTTCCTCAGGAAGTTCCACCTCTGATATCAAGTGCTCTTCAGAAACTTGTTTTCATATCATTGAGTGGCGGTGATGAGCATTATCCTTCTAGGACTGCTGTTTGTGTCACTTCTGCAGCAATTCTTGCTAGGCTTCTTCTGCTGAATAGAGACTTTTTAGCTCAACTATTATCAGAGCCAGCACTTATAGCAAGGTTCCAACAAGCAGGGATAAACCAGAATCTACTTCTTCTTTTGGTTGATTGGTGGATTAACAAGGTAGATGACGCAAGCTCTATAGAGAAAAAGGTATATGCAATGGCTCTTTCTGTAATTTTGACTGCAAATATACCTGGAGTTATCGAGAAACTTGGTGATATTCTGAGATTATGTACAAGTGTTATTATTGGAGGACATGGGAGGACTACCAGTGATGATTCTAGTGACGATACAATCTCTTCATTGCCTCTTAGTGATGATCCAGAGTATTCCAATACGAGTAAGGAATTCAAGAAGGCGCAAATAAGGGAGCTGGATCCCATTAGAAAAGCATCGCTTGTCGACATGCTAAGAGAGAATTTGAAAGAATGTGCAGCTCTGCATGGTGATGCAGTCTTCAATGCAGCTATCAGCAGGATCGATCCTTTAGTAATTGCGCAGTTGTGGCAGGCCCTGGAGATTGAATAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MALSAGDVQFIYSVLANSLSADAATRQPAEALLAQCEARQGFCSCLLAIITSRGEESDDDVRLLAAVHLKNCVTRCWRNSVDSPAIDNEEKVYIRKSLLLNMREENGKIALQLAALIARIVYFDYPKEWSDVFSVLAQQLQTSDVFTSYQVSTVLFRSLKKLSKKRLAFDQRNYSEITVYLFDYIWNLWKSNAQIVLQNFSVLSQHNSSLDQSNDLLLIYERWLVCLKIIRELICSGYASDSTTMQEVCQIKEVCPVLLGAIQSILPYYPFFKERQAKPWSHAKRACIKLMKVLIILQDKYPYSFAHETVLPAAVDFCLTMITNPEQADTSFEEFLVQCMVLVKLVLECQEYKPGQIGFEAVGSSEHAIFDQRKNNLSATASSMVMSVLPADRIMLLCDILIRRHFIYTATDMIEWHSNPESFHHEQNLLQCTEKRRPCAEALFIILFDNYGVQLAPFVASIIHDVKAVSPPLEIEITAGMLLKEAAYTAAGHVFDELSKYLSFDEWFCGYLSIDLSNGNPNMCIIRRRIALLLGQCAFEIKGVIQKEVCDVLVGLLGDQDMAVRLAACSSLCYAFRVFGIWEVDLLECIPTCWVMCFKLIGAVQEFDSKVQVLSFILVLLNYVGDDRIIPFVSELSQFFLKTWEESSGECLLQIELLDAIRTFISSLGYNSPLCYGMVLPILQYGMDVHSPNALNLLEDTVLLLEATLSNAPSIVPQLLDCFPYLVGIMNGSFNHLEIMIKIIEHYIVFAGSDLLQSHATSLESILDTIVGNADDKGLLTTLPIIDLLVLMFPQEVPPLISSALQKLVFISLSGGDEHYPSRTAVCVTSAAILARLLLLNRDFLAQLLSEPALIARFQQAGINQNLLLLLVDWWINKVDDASSIEKKVYAMALSVILTANIPGVIEKLGDILRLCTSVIIGGHGRTTSDDSSDDTISSLPLSDDPEYSNTSKEFKKAQIRELDPIRKASLVDMLRENLKECAALHGDAVFNAAISRIDPLVIAQLWQALEIE</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..141#243..352#1191..1263#1358..1419#1517..1658#2066..2275#2368..2434#3043..3448#4086..4233#4312..4472#4675..4774#4892..4966#5050..5184#6430..6525#7070..7252#7335..7439#7895..8053#8419..8463#8573..8788#9306..9412#9483..9539#9620..9698#9787..9951#ATGGCTCTCTCCGCCGGGGACGTGCAGTTCATCTACTCCGTCCTCGCCAACTCGCTCAGCGCCGACGCGGCCACGCGGCAGCCGGCGGAGGCCTTGCTCGCGCAGTGCGAAGCGCGCCAGGGGTTCTGCTCCTGCCTCCTCGTGAGCCCTCCTCCCCTTTTCCCCTCCGCTTCGCTACTCCACCCCACGAGCCGCAGGCCCGCTGATTTCGGGCTAATTTAGGGGCGGTTTTGGCTTTGCAGGCGATCATCACGTCGAGAGGGGAGGAATCCGACGACGATGTGCGGCTGCTCGCCGCCGTACACCTTAAGAACTGCGTCACCCGCTGCTGGCGGAACAGCGTCGATTCCCCGTGAGTTCTCATCCTGTTCAACATTTAATTCTGTGTTGATGTGTTTAATTTGAACTAAGTGCGGTTTTAGTAGCGATCAATGGTAACTTGAAAGTGCAGCGACGTTTCTTACTTGGATGATCTCATTTGTGGCGTTTATTCAATAATGCAAGCACAGCAAATGCCTAAGTTGCTATATGCGGAAGGAAGTCTCAGCTGTACCATCACCTGTACGGCGTGTCTAGTGGTTTTGGATGATTTTTGTGCTACATAGGATTCTTCTATGTTTGGGCATTACTTGCTATTGCTGGTTTTGGTCCAACACTTTATGAGCTAAAAATAAGTGTTCCTGTTTATGTTTTCTTTGTTATTTTGTGCAATAAGATTCACGATGGTAGCAAGTCAGCAAAACACTTTGTAACTTGGTACGATAGATTTTTCTTGTCTCCAGTGAATTGTACACTAGATTAGTTTAGTGGGTCTTATGTGTGAGATTTTTATATTAGTAGAGTGGCATTAACTTCTGCGGGAGCCATCGGCAGAAATCTCTTGATTAATTCCTGGTGCTTAAATGTCCCTGGTGGAAATCTAATATCAACTACGTTGTTATGTCCAATAGGCTGTTACTGACTTTGGCCTCCATTTTTTTTGTTCTGAAACAGCAAGGGCTGGATTGGCCTACTTCTGTGCTTTTGTCTATAGACGGCACCCTGCATATTTCTCACTTCTGGGGCATACATATATTGTCTACTTTGATTTTCTATGATACTTTTCATACTGTTATAAGCCTTGTGTTCTCTCTGCCTTTGATAATTAATGTTTGATTTCTCGATGAATGAGTTTAAATTGTATTTTGCAGTGCCATAGATAATGAAGAAAAGGTCTACATTCGAAAAAGTCTTCTGCTAAATATGCGAGAAGAAAATGGGAAGGTGCACATTTGCAGGCAGTACATATTTAACACTGTTGAATAAACACAGGGAGATAATAATGGTAGTATTAACTTTGACAAATGATGTGGTGTAGATTGCACTTCAATTGGCTGCACTGATAGCCAGGATTGTATACTTTGATTATCCAAAGGAATGGTATGATATTTTTATCCCATTTCTTATCAATTGTCTTATGTTACTCCAACTACTGGACTCGTGACTCGAAATGTTTCTCATAATTTTGGTTATTTAGGTCAGATGTCTTCTCTGTGTTGGCACAGCAACTTCAGACATCTGATGTATTCACTTCATATCAAGTGTCTACAGTCCTATTCCGATCTTTGAAGAAACTATCAAAAAAACGTCTTGCTTTCGATCAGAGGAACTACTCTGAGGTATGTTCACTTTTCACAGGACATCTTCATGTTCAACTGCTCATCACTGCTAAGATATGAACTACTCTTTGATCACATTGATCTTCTATTTGATGCCTACTGGTTGTAGTTATCCTGTTGAAAAGGCACACATGAGCATTAGGTTCTTCCCTGTATATAGCTGACATTACTTTGTGATGACGACATGCCCAATACAGGACACTCACAGATTAATGTTGGCCTCGGCCAGTTTGTTTGATAAACACGTGACCTTTCACACTTAATTATAAGGCTTATATATTTTTTTTAAACAAATTGCAGATACATCTGCTCTATTTGAGCCTTTGTCTCATTATAAGCACACAGAGTACTTTAATTAGCAATTATGTATCTCATTCTGCCTTTGTGAAAACTATTATGTTATGCAGATCACTGTCTACTTGTTTGATTATATCTGGAACCTCTGGAAGAGCAATGCACAGATTGTATTACAAAATTTTTCAGTGCTTTCTCAGCATAATTCCAGTTTGGACCAATCAAATGATCTACTGTTAATATATGAAAGATGGTTAGTCTGTTTGAAGATCATTCGCGAATTGATTTGCTCAGGTTATGCAAGTGATTCAACAACCATGCAGGTACTAATAAAATATTTATGTTCACATATGCGCTTTTATCTTGAGCTCACAACCTGAGGCTAGAAGTCTAACCTAAATGTTTCAATATGTAGGAAGTCTGTCAAATCAAGGAAGTCTGTCCGGTACTTCTGGGTGCTATTCAATCTATTCTTCCATATTGTATGCTATATTTCTATTAATCACATGATATTTCTTATTTTTCATAATTTTCTTCCTATCTCAATATTATATATGATTCTTCTTCTGATTTTTCAGAAAACTAAACCATCTTGATTACTTGAACAATCTAGATATATTACCACAAAGTGTACTGTTTTTTCCTCTTACTCCCTCCGTCCCAACATATAACAACTTTACACTGGACGGAGGTTGTTATATGTTGGGACGGAGGTAGTACACAATATTTCTATCTAAGACCATGTTCATTCAGTATTTTTTCATTACACTGGAGCAACTATGCAATTCTTTTACTTGATATGTAAAATAAAAGCATGAGAGGCCCATGAATTTCACCTATGATTGTCATGTCCATTTCTGTGTGGATGTTCCAATGTTCAATACATGCTTATTGCTTTTGCATTATTCAATACAGTCTTATTTTTCAATACAGTCATATTTTTTGAAGAAATAAATACCCTTTTTGTTAGTATGATTTGGTTAAAAGCTTTGCGTTTCACTTCCCTCTTTGTGTTGATTTTTAAGATTCAGGTCTTTATCATCTAATTACATAGTTTCCACTAGTAAAATATCTACATTTGACATTACAGATCCCTTCTTCAAAGAAAGGCAAGCTAAGCCGTGGAGCCATGCAAAAAGAGCATGCATTAAGCTGATGAAAGTTCTTATTATATTACAAGACAAGTATCCTTATTCATTTGCTCATGAAACTGTGCTTCCAGCAGCAGTTGACTTCTGTTTGACTATGATCACAAATCCTGAACAGGCAGATACATCTTTTGAGGAATTTCTTGTCCAGTGCATGGTTTTGGTGAAATTAGTATTGGAGTGTCAGGAATACAAGCCAGGTCAAATAGGCTTTGAAGCAGTTGGAAGTTCAGAACATGCAATTTTTGATCAAAGGAAGAACAACCTTTCAGCTACTGCCAGCAGCATGGTGATGTCTGTTCTTCCTGCTGACCGTATTATGTTGCTATGCGATATATTAATAAGGAGGTATTATTCTGAATTGCTAGCAACCCATATGCCATATACAACTGCTCCACAGCCAACTGTTTCTGTTTGCATTCGTATAATTTCATTCGTAGTTAGCATCATGCTGCAGACCATCTATTGAAGTCTGTAAGATAGAACTTTTGGTTCTCTTTTAATTAGATTACACAAATTGTTCTGCTATCACTTTACTAGACAAGCAAATCATTGGGCTAATCAAGTAAAGCACCATCCATTATATAAACAACAATAAATGTTTTGAAGTACCATTCGCTGAAAAATATTTTATTATAGTTACACTAGGTAATTAGTAATTACACCTTCTTTTTAAAACTAATGATTATTGGTAAATAATTCCATAAATGTCTTAGAGTGGTTTACAGGAGCAACGTTCAGCAACTTATAAAGTATAGACGGACCTATCGAATGGCATGAGGAAATTATACACATTTTAATTGCTGTACAGGGAATGTGATGCCGTTATCCATGTGTGAGAGGAGTGTCAAATTAGTAAATTACATTGGATGTTGTTTGGGTTTGATATTTTACTATAATATTTTATACAATACCATAATGTGGTGTCATTCCCTTTGGCCTTCTCTTCTAGGACCCATTAACGCAAGTTTTAATTCAACTGCAGGCACTTCATTTATACAGCAACAGATATGATTGAATGGCATTCCAATCCTGAATCCTTTCATCACGAGCAGAATCTGCTACAATGTACAGAGAAACGCCGACCATGTGCTGAAGCACTTTTCATTATTTTGTTTGACAACTACGGAGTGGTATATGTGCATTTCATTGTTATTTCAAGTTTTATTATGCATGATGTACAATGCTTATGTTGTTTTACATTGCCTCAGCAACTTGCTCCTTTTGTTGCCTCCATCATCCATGATGTCAAAGCTGTTTCGCCTCCACTTGAAATAGAAATTACTGCTGGAATGCTTTTAAAGGAGGCTGCTTATACAGCTGCTGGCCATGTTTTTGATGAACTCTCAAAGTACCTTAGTTTCGATGAATGGTAAGTTTCTTGGTGTGTAATACCTTCTGTATTTACTCATGCTAGATAATATGCACTGGACTAGTAGATGAACAATATAGCCTAATTCAAATACATACAAAATGTTAATGAACCTAAGGATCCATGGGTATTCATCGGTTTCTGTGGCTTTCATGTTATGCGAAAGTTGCATCGCTACCTTTGCTCCTGCTCAATTATGCAGGTTCTGTGGATATCTATCTATTGATCTTTCAAATGGCAACCCCAATATGTGCATCATTCGTCGAA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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA010939