Os07g0486000
| Gene Name |
Os07g0486000 |
|---|---|
| Description |
Similar to MSH4 |
| Version |
NM_001188272.1 GI:297725674 GeneID:9266513 |
| Length |
9703 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os07g0486000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:18530719..18540421 |
| Sequence Coding Region |
18530783..18530863,18532057..18532260,18532348..18532383,18532481..18532593,18533183..18533228 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008400:18530719..18540421 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008400:18530719..18540421 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggagggcgacgccgccggagccggtggcggcgaccggtcgagcatcgtgatcggcctcatcgagaaccgagccaaggaggttggtgttgctgcttttgatttgagatcagcctcactgcatctttctcagtatattgagaccagttgctcatatcacaatacgaagacacttctgcatttctatgatcctatggttgcaatagtgcccccaaacaaaacagcagcagacggtatggttggagtttcagagctggttggtaaacatttgccaacaaataaaaagataacaatggcacgtggctgctttgatgacacaaagggtgctgttatggtaaaaaatctttcagctagagacccatctgcactcggtttagatacttattgcaagcaatactatctttgtcttgctgctgcctctgcaacaattaagtggattgaatcagaaagaggtgtaattatcactaatcactcattatcagttacattcaatgggtcatttgaccacatgaacattgactcaactagtgtacaaacattggaaattattgaccctcttcatactgaactgtggggaactagcaacaaaaagaaaagtctctttcagatgttgaagactacaaagactacaggagggactagactactgagagccaacttgttgcaaccgttaaaagacattcaaacaatcaatactcgtctggattgcttggtaaggagattaatcttttttgttattctcaattcttaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEGDAAGAGGGDRSSIVIGLIENRAKEVGVAAFDLRSASLHLSQ YIETSCSYHNTKTLLHFYDPMVAIVPPNKTAADGMVGVSELVGKHLPTNKKITMARGC FDDTKGAVMVKNLSARDPSALGLDTYCKQYYLCLAAASATIKWIESERGVIITNHSLS VTFNGSFDHMNIDSTSVQTLEIIDPLHTELWGTSNKKKSLFQMLKTTKTTGGTRLLRA NLLQPLKDIQTINTRLDCLVRRLIFFVILNS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>65..145#1339..1542#1630..1665#1763..1875#2465..2510#2760..2806#2946..3053#3269..3383#gcaagcctcactctcctcctccccgcttcggattccaccgtcgcggagctcggcgcgggcggagatggagggcgacgccgccggagccggtggcggcgaccggtcgagcatcgtgatcggcctcatcgagaaccgagccaaggaggtgacgcctctcactgactaaccccccccccccccgccctcccatccctccccctacacccccgcacgcatttttgcttgtcggattgctcgcctagctagcttcctcctcttctcctccaaggcccccgagggtttccgtttcgcgttctactcggtcttcgctgcgccgcggatcggcttcgatcgtgtcgtcggcctgcgtgcgtgttgtgttcgcgctcccgcgggggtggtggtcgatcggatgctgctcgggtggattacttgctctagctggtcagattggtggtggtggtgggggggggggttcgtgttatatggcgttctgagcggcttgatttgagggtttggtggttttaggatttgaggctccagctccatttccggggcgattagagcataccctgtcctcgatagtgctgctctagcggttcgaatcgagttggtgtgatgtgtacagtaaattgttggagaggtgggcacaattactgcagtgacctgctgttgcaattttttcctccactgatttggccggcactttcttacaagttgggaatccggataaccaacggtcaaaggataaagccatttccataacagcaccatgcgccatgcgggaaagcatttttatctacgatatattagttgttctccaggcttgttttgaaggagttgcaagtttcattgtaaacaggaaaattcattggatcatggtgcattggcgcagaagagagaaatttgatcaaagtgttgtagtagatcaactcataaacttattatggatgaattttttttagataatgtattatggatgaacagattgtgaaaatgatttctccattgtacacacttgttttgtggtttactaatgaacaagatcttctgagacgctgacctctctgtacatctttatttttcttgttctaagtcaagtgtatctttagttttggaagcatctcaacatttttgccaacgtaagaattctttgtagtgtcagttttggaaaaaaaaaatcgtgatatgaacacgtgtagattgtctgtgcacgtcagttgataacttgatatgcacaccatccaattcaactcaaattgaaaacatacaaacaaaaatcatggagttaattatttctcaatttctttattatgaaccaaaagatcacgaagatttatcaaactagtatttttgcaggttggtgttgctgcttttgatttgagatcagcctcactgcatctttctcagtatattgagaccagttgctcatatcacaatacgaagacacttctgcatttctatgatcctatggttgcaatagtgcccccaaacaaaacagcagcagacggtatggttggagtttcagagctggttggtaaacatttgccaacaaataaaaaggtgatggctgacatatgcaaatttgttctatgttttctcataatatgaacccactttcgtttattctaaacagagttcaccttttagataacaatggcacgtggctgctttgatgacacaaaggtataatgatttgtattcctttctgaccatttatttgcttaattgttgggtgattaactgctgcttaacatcatgcatgttcttgttttcttttaagggtgctgttatggtaaaaaatctttcagctagagacccatctgcactcggtttagatacttattgcaagcaatactatctttgtcttgctgctgcctctgcaacaattaagtggtacgcgtgctatctttgtctcgatacattgctgggctacattttccctgtttaggattaagttaataacttctgttatgtatctcccatgaacatagttgtgtattgcttcaatatggacataacgacttgacaaagctgtgtcataatttctattttttcaaagtgtaattggagcatatgaacttactatgtactacaacagtgcaactctcaaagcaagtacttactaaattattttacaatttgtctgttacttctcatgtcatttcataggagttatgcctaagcacctcatttgatgatactacttactatttatacaatgccccagaatatttgttgttacttagtacattgaaatggaaactgagataggattttcaagttggatacttggattctataaagcttatcttggatcatcaaaacatatttctcatattgttttttttggtcatagataactatttttttcctcgtattggacggaaatgaggataaaaccgaaatatagcagatgattagatctcatgttgatagtgttgataagtatcacaatgacaatttactttgtttcttcttgcaggattgaatcagaaagaggtgtaattatcactaatcactcattatcagtaagttttttagagttttgtttcatataaatcatcgttgtttagcctttttttcacctgtaaggccattcttacgatattatgtatcaaaagtctccattttgtgactactcttctatgggctatgctgatctgaaaaaaatctatacattatggggtcccatacattatctctaaaaacgttttctctaaaaatgttagctgatgtttccgtatttttctcttatatatgtatgtataacttttcaggttacattcaatgggtcatttgaccacatgaacattgactcaactaggtactcttttggttaaattgagcagtattatctgtcacttgataaatcatcttcaccaaaggagcagaaacaatataagttaaaattttctgctacacgatctgaattgccttcattgttccatatatgcacctagcagtgtacaaacattggaaattattgaccctcttcatactgaactgtggggaactagcaacaaaaagaaaagtctctttcagatgttgaagactacaaagactacaggagggtatggctttcccattctccaaactaatcttttttacatatatttacactgcaacattcaatatctcctcatttttgcaatttgaacaatcttttctgagataaaaagtttcatgtcaacttctattgatggtacaaaatagtttaactttatgtagtctatgtattgaaatatcaagcacactgcaacaattctcttcaaacttgcttgttcaggactagactactgagagccaacttgttgcaaccgttaaaagacattcaaacaatcaatactcgtctggattgcttggtaaggagattaatcttttttgttattctcaattcttaaattggaatgtctgtttgatcaaattggtcatacggtaatcctgacatttgaaacttccaaagttgcacatattaagttctggatcttctagtaggctaggttctggatcttctgtgggaatgaactaacttcatggagtatgaaccctgctttatgcatgtggaaatcttagtgcatatagtcttaaatcgttactcgaagggtttaccacaatcatgtttgtaccatttatagttcatttcctgttggagcactttgcaatataatggagaattttactgcaaccatgattgtacaccacaggccatatgtgaaagtatttccatgagaaggggaagcaatagttcttgtaatattgatatgcaacgctcctttgcaagaatgaaagtcaactggaatctgggatataacaagtattcagttactaatattatcatcgaaaatgatcagtaatatatccaataaatgcatgtttattaattttatatcttaaattttaggatgagctaatgagtaatgaggaattattctttggcttgacacaaggtcttcgtaagtttccaaaagaatcaggtgaacttatgtcctttttctctgtagaaaattctatatcctcttctggctgtgcaacactacagataataggtaaaatggttgctggtgttacaacttccataattttattatgcctcagataaagttctttgccacttctgcttcaaacccaaaaaggatactgatgaagtgctaaagcctgccaatggtagaaagagccaagggctgatttctgacattattgttctaaaaacagctctggatgccataccattcctctccaaggtagtgttatagatgtgtttgtcctagtattcaatttagcaatttattcattctgatttttcattttgttttgtttttgaagatgcatgttattttgttcatttaagggtaaatgtcttttattctagaaacatacccatctaccttttcacgcatgtgatgtgtagctcatcacaggttctaaggggtgcaaaaagtttccttcttcgcaacatttatcagactatatgtgaaaacccaaagtatgcaagcatgagaaagaggtactgttttctgacctttttcctcccatttcaaaggagaagttgaatgaagactgaaaacagcatgctaacttcaggcttagtcttcccatcctgcttttgtttgtacatttgtttttagtttttagtaatattgccagtatattagcattatgtgactgtaaatatgttcgtccacatttattaaataacaagtatatccatctacattctaaaagtaaccattcacctttgatttggttgcatgttttcttttatgatcctagaattggggatgtcattgatgaagatgttgttcattcaagggctccttttgtaacctgcactcaacaatgttttgctattaaggctggaattgatggactgcttgatgttgctcgtagatctttctgtgataccagcgaaggtgtctatcgttttcatgtttgttttctaattttacctaacacagctgattgacataatgcatttttcagccatacataaccttgccaacaagtacagggaggattttaagcttccaaatttgaagataccatataacaacagactaggattttattttattgtaccccagaaggacattactgaaaggctccctaataaatttatccaggtatgtggatatatcccttttaagaaccagcctcttagctaaaccataagatgctaaccaaatatttgtgaatgtgtaatcaattaggtagttagacatgggaagaatgtccactgctcaagcttggagcttgcttcggtaagtttgcatccagtgaattatcatccttgggcatttttagtaattcaacacttactgccacactgcaaatttaaccatgtaattattttctctgggatgctattttcaagtggaataagtgttagtcaatagttattcatttatgttcttttgttttccctcaaagaaagtttatcatcttgtttaagcatcacggagcaaactattcttttgccaaaagcattgggacagtgttatatttttcttctttataagtgtatggtataatttcatcatagctacacgtgaaataagcttttattttatcgattaggatatgacattgaaaaaatataatatgctattggagagtttatttcttcatacggtcacttattaccatgtgctttctacccaaatttgcagctaaatgccaggaataagtctgctgctgctgagtgcttcttgcgcacggaactttgtttggaaggttgccatggccactaaacattgagtattcaacatttttccattggagttttgttactttatttgttgatattgatataggttaagctctggtccagttatcagatacctgttattataattttctagtgataaactagagagttaacatgcaatacatgcatgcataatgtatctgttgcattgggatatcaaattctatatttgttgggcatcctccatataggtagcagctattgtagaacagaacatcatcattcttcttaacttagaatagggatctcctcattttgctttgtttatgaactttttagccatccatttctttgctttcctggcttattttggctgaattggtgggactttgagggtatcatacacttgactaattcaactcacgaacttaaagggaattgaagcttgtggatagtgtaacttgtttctgtgcagcattttacatttcaactagtattattcaagtgtctaaagaaatatttaacttgcataaatctgttctgttgtttcagggcttattaatgagatcagagaagacattggtatattaacgttgcttgccgaagtattatgcctgttggacatgcttgtaaattcttttgcgtttacaatatctactaagcccgttgatcgttacacgagacctgaattcactggtgggcaattcaattcaacactagtaactgatcttgttaaggattttttttagtgatgttgtggagtcctgatctgacagttgcttccaattaagcagatgatggtccgatggcaattaatgctggaaggcatcctattcttgagagcttgcataatgattttgttgtaagttcttcatttgttatttattcctcagtatttacttcatttgtatgtctttttcatcataaatttgttgattgaaatagcaatgatcataatactgtttatatcatgcagcctaacaatctctttctgtctgaagcatctaatatggttcttgtcatggggccaaacatgtgcgttccataaacattgtatccaaatgtctatagcaggctaattatatatggaaattcatctgctctctgcattatctgctgttgcaggagtgggaagagcacatatcttcaacagatttgtctaatagtcattcttgcacaaattggctgttatgttccagctcaatttgcatcactaagagtggttgatcgcgtattcacacggattggcactggggacaatgttgaaaataactcaagcacagtatgcaaattcatctcttctatatggtttatacttatgttatcttgttatttgacttacagaattcttctaaaagcacgtgaaacaataaaatgattagataaagcattcaactgttactgttgatagtcctcaagtaatatttatcccctgagtaccattctttaggcttgtttcctcccagattaattcctatttattatcttaaatctcctgatgcacattatctctattgtgctcaaacctatcaaatttaagatgttttcttgtccatatgaagtataaatggtcatttgcattgtcctgttccagtagttggtgtttttggattccttggtggatttccttaatatagcattagatatggagggtcttaactcctaagatcggtacctgtttgtcatatttatggatgactctacatgaagaagcgcgttgaagtagtggattaaccatcttatctaggatcgcgagagcccatactataccatttcttggtaatatctggatggctgatctggacttttgaattgtttgtatactgtcatttataaccttccttcaagttgtattggccttggacacttgacaaagcaattcacatataatatttcttcgatcaaatcaaatatttcatcaatagttggtcgagcttttcctttgtgagaggcatcttgtagatatttgctttcttaatgaaatgaagcacagttctcctgcgtttttgagaaggaaataaaaacatcaatgctgtatcttttatggagtattagtaattagtctgaagccaattgatgtatagtttatttcaatgctgctaatcagcttaatttctctttgcagttcatgacagaaatgaaagagacagctttcattatgcagaatgtttcttcgaagtactatgggtctaccatgctgcaatagattggattgctgtttctcttgtttccttgtaatgaccatgtgcacatttgcacacattacaggagcctgattgttgtggatgagcttggaagagctacgtcttcctctgatgggttggcaattgcatggagctgctgtgaatatctattatctaccaaagcgtaagaactattaacctcttaagtaccacatttgatccttttcatgcagcataatttgacttatcacagtcctaacttggtggggtctgtatgaaataacttatgtgccttttaattgagtgcttctgaaaaagagatgatgatttgtgtacgttgtcatacttaaattcttagcagacaatgaaatagataagggcagaagagataaactaccatttttctacatgcatgcttactatttttgaacaagaagaggaagctaatatgcattgtaagactggagggagtatcaatattcacagcagatgttttcttgtcaatagttttgaaactgcatgcttttctaaatgtgttgtctaggcttctgttattcagttacctcatccaacatttttgtagcctatttattcaaccatatccatatgttctcatcttgaatcaaatatttgatcgtgataatggttagtacaagaacatttactacttgtcttgtgctcaccttaggccgtgctaccatcaagtttcagatatcatatttatcacagaacctactacttccgtcccaaaatatagcaacttttggctatgtatcttgacacgcttttgtccagatacatagctagaagttgttatattttgggttagatattagcagtaagttcagcatagtgcctgggggtgcttgacatgctgaatgcagctggtcatgtttggttaatcttgccaaccacaatatggtctattagttacagatataaccttttaagacaagatatcatccttgttgagcaaatcctactatcttagaagcatcactgtcgggtcttttcacccaatgcagctacacggtgtttgccacgcacatggagagcttgtcagaacttgcaaccatctatccaaacgtgaagatcctccattttgaagtcgacctgagaaacgaccgcctcgatttcaaggtataacctgaatcgttgacagtcacatgacttttttttttcatgtctcttaacatcatggatcatacaatccctctgcatcagttccggttgaaggatggtgtccggaaagtaccacactatggtcttttgctggcaaaggtggctggtctcccttcttcagtgatcgacactgcagcaagcatcacttcacggatcacagaacaggtaaacctctcagtactgattagagctgatgttgataacacagtgtgtgtgactgcttagattacattatgcaactcaaattgtatgcccattttcttctacttgggtccttttcttttttgactgcacagccttgctcgttcctgctgctggatttgatttcttctactcgagcgcattgatcaagtcaagtttacctgttttgatcccggcctgcaggaaatggtgaggaaggacgacaactgcgagcagtaccggtcgctccagatggcgtaccaggtcacgcaacggctcatctgcttgaagcaatccaaccaaggcgatgactacatccgggaagcgttgcagaatctcaaggacggctatgctgcaggccgcttgacatgagaagaaaaatatatgtaaaaaggagtttttgtttctctctcctacagctggcagcatgtatggattatggtcgtatggatgtagccatgtagggcacccc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |