Os07g0486100
| Gene Name |
Os07g0486100 |
|---|---|
| Description |
RFT1 family protein |
| Version |
NM_001066196.1 GI:115472124 GeneID:4343254 |
| Length |
6624 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os07g0486100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:18541333..18547956 |
| Sequence Coding Region |
18541707..18541776,18541869..18542041,18542122..18542174,18542258..18542413,18542747..18542884 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008400:18541333..18547956 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008400:18541333..18547956 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>aacaaacaaattgtcaggttgtcagccatgatggactgcgataaacagttgttgcacatgtgcatgttgtttacaggacagactttcaggaaactgatgctccaagaaggcgaaaagtttgttcttgtttggtttgatactccatataaccaggctgcctatggtcttgtggataaattagggagtctggttgttagaatagttttcctgccattcgaggagagttcttatgctacatttgcacagttggcatcaggacaaaatccccagaatatatccaatttggaaggttctttgctcggagctcttaagcttattatgctgataggcttggtggtcatctcatttggtccaagttattcatatacccttcttagactactttatggggcaagatacagtgatggagatgctacagttattcttcgttactattgtttctacgtcatatgcttagcaatgaatggcacatctgaagctttccttcatgctgttgcaaatgaagacaagcttaagcagtcaaatgatatgttgctcctgttctcggcaatttacattgtgctaaatgttgtcctgattaaatctgctggtgcagttgggttgattgctgcaaattccatcaatatgctgctgcgaatcacatattcagcggcattcattaaagactatttcaagggctcattctctttccgccactgcttgccggcaggctggggtgtgttgctcatttctggcctgaccacagctttctctgaaaggatgtttctgaatagaaacaggttcaagcagacccttcccattcacatggcgataggcataatgtgcctgggtttctcatcactcgagatataccgtggtgaaaagcagttcttgacgagtataatcagatcattgaagagccgcgacaaacttgcatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>NKQIVRLSAMMDCDKQLLHMCMLFTGQTFRKLMLQEGEKFVLVW FDTPYNQAAYGLVDKLGSLVVRIVFLPFEESSYATFAQLASGQNPQNISNLEGSLLGA LKLIMLIGLVVISFGPSYSYTLLRLLYGARYSDGDATVILRYYCFYVICLAMNGTSEA FLHAVANEDKLKQSNDMLLLFSAIYIVLNVVLIKSAGAVGLIAANSINMLLRITYSAA FIKDYFKGSFSFRHCLPAGWGVLLISGLTTAFSERMFLNRNRFKQTLPIHMAIGIMCL GFSSLEIYRGEKQFLTSIIRSLKSRDKLA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6181..6250#5916..6088#5783..5835#5544..5699#5073..5210#4812..4883#4244..4318#3975..4155#agagaggtctccttggccctcccaactcccaagttccccactccgccgcagcttctgtgccggccggacccccgttgtgccccgatttccgcggccgtcccgcccccgagcggcgctgccatctcgcattgccgccgccgccgccggtatggccacgggtgctgaggccgccgcggcgttatctcctccgggcgccgccggtgccgccgtcatgggagtcttcaagtacaacttcggtgcgtgcactctctccctctcccttctccgatccaagtctgaggttgatttcggggggtgggggatctaagtgcggcctcgttgttgcagcggcgcagttcctatccagggtcacccccttcctctacaacagctggttcgtgcgccagctcagcgccgacgactgcgcggtgcgggatcccctcccctcttcttgctcgctcgctcgctcgcttgattttatttctgtgcccagatgaagaactgaattgtgcgtttactcaccgtagtaaagcaaatgtggcgattttgttggaacccaagttgttgatttttgtagcaagctattgcatgattttattgtagggggttttaatagtgtgatttgggtttattttgaagttttacttggttgaactaaaagagaactgctctgggaatctagtccaccagcaaccgactgtgagaatccagtagatatgaacaaatcaacgttttgataatgctgtgtttcttatgtgcttcactttgttcaaatatctaatagaagcttaaactcctttatatgtcatctatctggcaggcatacgcgttacagcttcctctcttcatcaactgcgtcctatttttaagccgggaggggtttcggcgtgcatgcttgcgtaatgattctgacaggtattacaataactttatatggactttctgaagcaatttaggagctataagccatatttataatttctgaagaaataactaagcagtaagtctttttgtttagactagtcatagcatggatttatttattttaagcgagaaaatcaatctttaaaatgaccaacgtgctatagaactatagatactggaaagtgataaaaccccggtcacaatttcttgacctaacgcaccatatactctggctatagcttgttagttttaaaaagaaccatgtgaaaaatttgtgctctagtttcacttgtgcatacagaatagtaaattcaaagagaaatgaaccctttataatttggtagagtaattcaagaaagagaagaaataaagaaaagaaagaaatgtacctttattaggcacagttgatttctcataaagagttaattgtaggaagaaaggtaaaaggaagaacgattgcaattgatgccacaattgccttataaaccaaggtagacaaatttgaatttattagatgaacaactatgtgtttcatggacacacgatccatgatttgataaagcccaacacttatggggaatggtcatatgatttccatactctcataacagcacttctttattgttactgtgtgctattaacattcactttaaactttcatggtaggactagcccacaacctcacattgtccatagaggctaccttctgtgtagtggtgagggttagttccatgttggaacatgagtagtactatcatgttatacttgagggtcttaatgtttactgctgagggttttaatgcaacaactgtgagctaacctgtttgagtgaaatgaggacgaaatcccatgtgagttgctctctgtccgcaggcttatcttgcatgcgggctgtgcacttgtgaatttgagccctagtgtgctaaaacttaattatttctttataatcaaccaaaatcacattcttattttgcatacttgtgaaaatctattttcatatacatattctagataaaccttagaactgtacttgtggtagaattacacaatttcattcatttcttacaagtcctaacgtgtcatctcagcatactgttcaaacggtgagcaaataattgctttctattagtagtttgtatgcactattaattttttttctcaattttcaaccacttgaacatgttgaaacatgctctgggattgtaaaggtctttctagcaattgcattggaatatactctttaaatgatgatggttaaaatatttatattacagtggcaatgcgataagtgatgaagagatactaaaggtagcttggatgattgtcccatttggcatcttagtttcctttatcagcagcttatttgtgttgagggtaaagaaattgcggttatccgatacctatgctaaagctacattaattatcggtaagctttgtattaaccaagtttctgtacaagctttgtgtatttgtcctgaatatggtgactgatatttcatttagtataaattcgtcagagtgaatgagtcagttgattgaggataagctctttggaatgaatgaatcagttgattaagttagaatattccacatattaactcgttagtggtgctgaaatattatatcttccatgcaattgttgaacacctggctcttgatcaataaaatggagatgagcattcatgcaagcatacagttatttgtagcatttcaagatggtccttttagacatttatctatttgtttttctatttggatatgatctataaaagcacggctatgaatggctttgtctttcctgtttgtatgatatcactccacatgttttgccttatttttttcatattgtgtgacttctgtccactttcctcacgttgagagctaatgtatttagttgattcaatatgacagcatttgcttgcgtactggagctactggcagaacctctgtatattctctcccagaggaagaaatactatcaaataagagtgtatactgaacctgtggctactctgctgcgttgtttaacaacttttatcttcataacaaaaggacattctaaaatggtaacagcagaggtttttactctattgacgttctattcaacttattatgcactttctgtctcagtttgttatcactgataaaataaaatgcttaagttcacattgtttttgttgtttacacctgatactggtatagccatctatttggttatggttacattgtgaaagctagcaaatcaaaaagttccattgccaatttcatattgtgttcttttggtccatgcaccaaagaaaataacttggtgtgagatttctctcttagctacatttgttcagggttaacaggatgtgggttagagaggattaacttaatcaggttgtgacattttaactttattaattaggattaagttaacccacaaaaaaagtgaatatgataacatagaacaactaaacctctttagagttctatttttccaaatataagtgtataatctggctaaccatctaatctagccaaacaaagtcttagactgaccattctaattgccaaatcgaacaattaagctatatgtattttagacttatagtgttacttaatctagttattttcaactttaagcagatcaccttatgtttttttggttggttatgcctccattgtaaattccatgttaagttcgtctttgacaataataggactttacaaaacaaaaatatgaattctgctgagtgatatgtccaagtaatcttttctttctttacttttcaattaattggtgttcatctcatgtcattcttttcttattcaattgttgatcaacacaacacaaaaacaataatttatttcttgcaggaaaagttggttgtatttgctttgtcacaggttgtctatgcagcttgcattttctttggatattggacctattttcttatatttacaaataccaaaatttccgatctccttccattcaggttccttctatgtctgcctttgcattgtgttgtatcattaggttttgtttgatccatcacatgtttatgtttgtttccacttgatgttaaaacaaacaaattgtcaggttgtcagccatgatggactgcgataaacagttgttgcacatgtgcatgttgtttacaggacagactttcaggaaactgatgctccaagaaggcgaaaagtttgttcttgtttggtttgatactccatataaccaggctgcctatggtcttgtggataaattaggtaagtatgccgaccgctgtttgtttcagatcctttttatcttctaatgttgccgggtatgtgcaattcatgttttgtttatttgcagggagtctggttgttagaatagttttcctgccattcgaggagagttcttatgctacatttgcacagttggcatcaggttcttctgcatttacttcatttagatatgagaatcacattccttatccctttggtgtctgaacttgaaagtttctctgtgaagttttgtctaacatctctttgattggttattcaatgaaaattaacctatgttggctgggcaggcattgcaccaaacatggcagttcatccttttttttttttttaaaaaaaagagtttatttttttatactcctttcagaaattgtaactttggtatgtttcttgattatttgatccttacaatttagacttgatcattttccatatttcttactgcctgaaaatatatcttttggtattattgttgtttcatattgcagctttaagatacgataacttttccttgaaatgttgatttgaccaacaccagaattcatagcaatattgtttatttcaaaacaatatgttccacgcatatgtttagatgtatatttctgtaaaagctctaataatgggccttttatccacaggacaaaatccccagaatatatccaatttggaaggttctttgctcggagctcttaagcttattatgctgataggtttgttatccaatgttgaatgctatattgattgcatttgcgtgtgttatttactgtgtcctcttagggagtaagaagcaagcaattgcagtacatgtagtgtacagtaaacatgtttagtagctaccaactttattctctacgttctcattcgaatacagtcatccttaaagtgtcctaactttgcaggcttggtggtcatctcatttggtccaagttattcatatacccttcttagactactttatggggcaagatacagtgatggagatgctacagttattcttcgttactattgtttctacgtcatatgcttagcaatgaatggtttgtacttactacttctatttaccagttatatcatagtagagcaatgtttttgtacagtattactgtcttcatgcttaaattatgtattaaaaaaaatctgaaatgatgaactgtagttgacctttttgaattgagttagtgtaccaacaagtagcattgcttcttgtgttgatcaatagttagctatacttgatgatgtgttctatatttaaaaattgcacatattagcctttatacaaccatgtaattgggcatgagtaacacattcaattgattcctcatgaggatgcaatattgagttgcactgattatgttaatgtgtactttcaggcacatctgaagctttccttcatgctgttgcaaatgaagacaagcttaagcagtcaaatgatatgttgctcctgttctcggcaatttacattgtgctaaatgttgtcctgattaaatctgctggtgcagttgggttgattgctgcaaattccatcagtatcctttggttaatcactaccatcttatttcctttaaagtatcttttaagaactttctttgtgccttgactgtttgtaaagatatgctgctgcgaatcacatattcagcggcattcattaaagactatttcaaggtaagaggttcggttgatgtttcacatagtttgttttagtttctgttctaacaaaaatacctgatgactttattttacagggctcattctctttccgccactgcttgccggcaggctggggtgtgttgctcatttctggcctgaccacagctttctctgaaaggatgtttctgaatagaaacaggttcaagcagacccttcccattcacatggcgataggcataatgtgcctgggtttctcatcactcgagatgtaagaacaccatttcataaaaaaaaaatgtctcgctctttttatatgctataatataataatcaccttggcattcgtttctcattcaacagataccgtggtgaaaagcagttcttgacgagtataatcagatcattgaagagccgcgacaaacttgcatgagtctaacaacattcagggttttgcgagtgtttttagcattcgcctgataaccgcattttcagaaagaaaacatatacgatgccgtaaatataattgtacattgcatgggttgacgacagaagataattatgccaagcggctggaggacttcactgaacatggatcaaactggtcgcgttctctactggagtcgggttaatggtgtgtgcagcagaacaactgttcactaaacggcaacagaaagcatagatcagtggcttatataggcaatttattatcttattctgtagtaactgctgactacaccaaaatctaagggtgttaagagaaaaattgattatattttgttacagctaaaatatactccctctgtc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
