Os07g0497400

From RiceWiki
Revision as of 08:37, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os07g0497400| Description = Transglutaminase-like domain containing protein| Version = NM_001066242.1 GI:115472216 GeneID:4343301| Length = 1041...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os07g0497400

Description

Transglutaminase-like domain containing protein

Version

NM_001066242.1 GI:115472216 GeneID:4343301

Length

10412 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os07g0497400, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 7

Location

Chromosome 7:19303178..19313589

Sequence Coding Region

19303310..19303465,19303626..19303802,19305947..19306048,19306149..19306235,19306927..19307009
,19307714..19307827,19308918..19308972,19309074..19309160,19309870..19309925
,19310012..19310071,19310179..19310266,19310371..19310594,19310933..19310987

Expression

GEO Profiles:Os07g0497400

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008400:19303178..19313589 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008400:19303178..19313589 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggtggcccgccggttcgtcgtgcggcaggggggcggcggcggcggaggcggcgaggcggaggagcacgaggtggagtacgacacggagcacggcctcgacatcctccgcctccagatcttctccctcacctccgtcccgcccgagctccagaagatcgtggtggaggcggacgggtccgtggtggacgacgggaccgacctggaggccatctccgagggcctccgcctcgtggccatcaccggggaggaggaggaggctgaggctgcggctgcggcggaggcggcaagggcgcaagagaagtcggatgaggagctcgcgcggatgattcaggcggaagaagaggcacttcttctacaacagtacagcatacgcaatgatggaggggaggaattcagagaaagagttgagccatacatgcaccaggttctgatgtacgaggatccaatgcgtcaagaggcagcacggaagactgttccaatggatgaacttcaggagaaggcactggtttcactagctaaggaagggaacttcagtccttcaaaagatgaagaggatcatgcctttctcttgcaattgcttttctggtttaagcaatcattcagatgggtcaatgcaccaccctgcgacagctgtggccgtgaaacattcaatgttggaatgggcaccgcacttccctcagaaattaaatttggtgccaatcgcgtcgagatctataggtgcaactattgttctagtaccacccgttttccaagatataatgatccatataagcttctagaaactaggaaaggacgctgtggagaatgggccaattgctttacattctactgtcgaagttttggatatgaagctcgtctgattctggatttcactgatcatgtgtggacagagtgtttttcaaacttgtatgggaggtggatgcatctagatccatgtgaaggagtctatgataatcccctattgtatgagaaagggtggaacaagaaactagattatgtaattgctatttcaaaagatggagtacgtgatgtaacaaaacgctacaccagaaagtggcatgaggttctttccaggcgaataattacctcggaagataccgtttcagctatcttgtcatcgataacagggaaatatcgcagtggattgtcaattgatggactcacagccttagaaaatcgtgacaagaaagagtccgaggaacttagtaaagctgcttatcttgaagttgacaccagcatatctttacctggaaggcaaagtggttctgtggagtggagaaaagcaagtcagaaatgcagtacatacatccttagcattaccagtggcaatggatgtggttga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MVARRFVVRQGGGGGGGGEAEEHEVEYDTEHGLDILRLQIFSLT SVPPELQKIVVEADGSVVDDGTDLEAISEGLRLVAITGEEEEAEAAAAAEAARAQEKS DEELARMIQAEEEALLLQQYSIRNDGGEEFRERVEPYMHQVLMYEDPMRQEAARKTVP MDELQEKALVSLAKEGNFSPSKDEEDHAFLLQLLFWFKQSFRWVNAPPCDSCGRETFN VGMGTALPSEIKFGANRVEIYRCNYCSSTTRFPRYNDPYKLLETRKGRCGEWANCFTF YCRSFGYEARLILDFTDHVWTECFSNLYGRWMHLDPCEGVYDNPLLYEKGWNKKLDYV IAISKDGVRDVTKRYTRKWHEVLSRRIITSEDTVSAILSSITGKYRSGLSIDGLTALE NRDKKESEELSKAAYLEVDTSISLPGRQSGSVEWRKASQKCSTYILSITSGNGCG</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>133..288#449..625#2770..2871#2972..3058#3750..3832#4537..4650#5741..5795#5897..5983#6693..6748#6835..6894#7002..7089#7194..7417#7756..7810#acacgcgattcctcccctccaagtctccaactaacagagaggggtggtggtggactcattcgcgcgaccaagtatccgctagtacgcgccgcggagtggaggagacggagagagcccgcgcgcgcgcgcgcgatggtggcccgccggttcgtcgtgcggcaggggggcggcggcggcggaggcggcgaggcggaggagcacgaggtggagtacgacacggagcacggcctcgacatcctccgcctccagatcttctccctcacctccgtcccgcccgagctccagaaggttcgcgactgactgacttagtttcccccccgccgcgccgcgccctgcacgggacagcctccaccgaccaccgtccccgcgggtgttccggttggttggctggcctctgctctgatcgatttcggcgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcagatcgtggtggaggcggacgggtccgtggtggacgacgggaccgacctggaggccatctccgagggcctccgcctcgtggccatcaccggggaggaggaggaggctgaggctgcggctgcggcggaggcggcaagggcgcaagagaagtcggatgaggagctcgcgcggatgattcaggtgcgccgaagttaaattgatgtcccctctagctgatggctctgtgtctgtgcgaatcggaacttgcgtagacgtgtggtagttggtccgggacagcgtggaaattaattttaagttggatggatttacgatgttgtagtgtgtgactgtagctgtcacttgattttgtttggtttgataagtttatggttggaaattggaggaagtgggtgttaaatcaagctgcattttgatcagaacgggttgccgtttggctgcattgtggccggaatgatacggctatgtcggtatttataactgcttagtgtgatttggacatcatgattctatttggtttcggtttgcctgaggttcagattgcggcctcaaccactttgctttgatctgagcaccgagtgcactgctttgcattgctcatcatctggtgtgatgcaatgctgtggcgtgtgcagatcgtggtggaggcggatggatcaagggtggacggtggaaccgacatggagtccatctgtgagggtctccgcgttgtggccatcagtgagggggatggggaggacatcgctgcggcagaggcagccagggtgcaggagaagtctgacgaggagtttgcaaggatgcttcaggtgtgacatgattaattgaaataactgagagctgagctttgtgcatttggaatcgagtagatagcttagacatccttttattttgcttggttaagttggacatactatgtgatgatgttggatttgctagtgactgttggggttacttacttttgttgggctagtagggtatttagcttgaaattgatcacaattagggcttcgctgttgcttgggtttcacagttattaatggtattcagagtcgcttcacatgatttatacatcaaagttccctttggttccagtttagttcatcagctgaggtttgaagcaggtgtgaaatatctgaattcaattaaggtgcctgaataacttgcgttctataggttcttcaatggaacctttgagctttgttatttgattgagaagtgagttgaatgatctacatgccaatttcgtgaagcattccacattacagtttggatagcttatgctgttaccactggttggacattgtcttggtttgaatgggaactttttatgagcaggggttagttcagttcaggtgcagtctaacttcattttgttcgatttttaggcctttccttagtttgaggtggctcatgtttcatgggtttgatttggtttatttggtatcaaattggaacaaatgtaaactgagctgcaatacagcatacaatgcagtttcttgtccagatattttagttggtggatagctgaataccacattgaactcattttacctgtcattgagtggatactatgtgttatctgaattttagcttgcaatagaatggagtttagttttcttggttccagtctttgcttcaatgttctgggaggcaggcaaatgttgtgtaaaagaacccgtcaatatagtttggttctcatctgatttggtggatctttatgacttttctcagttggctgatcagattgatttcagttcttcagctagacatgtatactatgcaacatattctgtgtctgaatctaggactcaagctcattgtagatcatattcatttattttgatggccttgttagctgaggtgagagtacatgaattatctaattagatggaactggtcatcatcaagtcatgcaactgcatgagtcggctagacggctacttccactattttttttctatatgcattttgtgagtagactacacatgaactgtttattcagtctgttcatgctttgtttgcaattgcaatatacatgaggggtatttgaataggcttcttattgtttagtggagtaactggagctgactgaaaattcatatctgtatagtattttacttagtaaaaatgtcataggtgttgctcagaattgcctcatctcgcacccatggattataagtatggactaaacagtgcccacaaagcataacctagcatgacaatgaaatgaagtaatcgttagtttaaatattctatccagggaaaaagtagggactccaaattatcattctcatcagaactatgcttatttccttaacaaatcttaggcggaagaagaggcacttcttctacaacagtacagcatacgcaatgatggaggggaggaattcagagaaagagttgagccatacatgcaccaggttctgatggtatggtcttagaatgtatttcatatacaaagctatatttgtgatgattgcatttatatttaatatataatccttgtttgttgacaccttttgaatgcagtacgaggatccaatgcgtcaagaggcagcacggaagactgttccaatggatgaacttcaggagaaggcactggtttcactagctaaggtttccgttctctatttaaatttccagctctgtttgtttcttctttttcctctccatcatcttactcccttcgttccaaaatgtagctatttctagagttcaaatatgctcctacaccatcatggtgggattgcaccatggtgagtgtgtggagtgatcctgaactgttgctttcctttcttttacagtggtaagcctgaatgtaatcaaacaacttctgtcattttgataatgaaatgggggagcaatgcctctctttctcaaaacaagtttctagagttcaaatttgtcccaaaatgttgatattctccacctaccccccatcacaatcatctcccatttattttttcacctactttctcttctcaacaaatcacaaccttccaccattcaatttcacctacttatataattcccatgaaaacctctagaaatgcttacattttgggatggagggagtaatattcaacatggttgtgttgtcttgcatttattgataatgcttcttttgattcttgtcaacatggctctccaaggaaagatgctgtactttatgatttctcttatcattctaccaccatggctgtgtcttttttctaatgatatggattttggggaaaaattgctatattgcattttgcatttgaagagatgcgtgatcaatatgttcttataaaagattctgtagtaggaagggaacttcagtccttcaaaagatgaagaggatcatgcctttctcttgcaattgcttttctggtttaagcaatcattcaggtcattgaaacacttctgtgccttatttctcagtttttattttctgcatgtcatgtgtgtgcgcgcgctaccatctagtacctatatttctgttacatcagtactctacctaaccatttatattataaccaaagtactgttttcagttaagatacttcttttgtgcgtatgttttaattggcatatttttcaccatttatgtaatagtggtatagtgaggttgttcacagactactgatggacatgaaataccaatgatcttgaagatatgtcaaaccgtataaactaagtacaaacacatttgttctattcggactggaaaagaccactttgatatatatatagtcttgaatctagtttctgaaaattagctctatttgaaacattggagtcaaacaaagcagagcatgaatgataaatgacttgtgtgaatgtgtgatatttgcatgtctttgctttatggtacatagaaaaatgagagtaatgtttctttttctttttcaagttcattgatttggaacaaaggtgtcaattctagtgataactttgagctcaaattatgggattgcctgtgatttactggtggtttacattttgggttgatatactttcatgatgcttacagaacactgtacttttcatagaaagacctacgatggaactcatatgtgctcatcttgtgatgatgatgcttttgtttgcagatgggtcaatgcaccaccctgcgacagctgtggccgtgaaacattcaatgttggaatgggcaccgcacttccctcagaaattaaatttggtgccaatcgcgtcgagatctataggtagcagtctctagatgtcaatcaattgttcttacatcttcatcttttacatcaattctaaatagaagaatcatttgtacctgaagcttagttgcatgtactccctctatccaaaatacaaggtgtccatattttgaggaaaaatcaacatttgtaatttttgactaatagttaagctaactatatatatgtttggtgtcacacatgtgatatcattagatttgtatttgaaagtaccttcatcgttaatttcgtagttgttgataatatattatgaatgatcaaagtaaaatgtggagaccgtgtaaaagctaatacggcttatatttagtgatggagggagcactattttatttttgaactcccacatacatgatgttaaggtgtcaataaggtttgtttccatatgcttcaaatgcaacagttgtcaactatcattctaatctgttctttaccctgcaactgtacctccagcttaaggcaaatctaaggtgcacttctttgtgacatctctgtctgagcagcaaatgctgtcactatcatggtctaggcaggattttttttgtgtgtttgtcaacaagatcaggataatacagtgatgataggttttagttagaaagtcatgactctgaagatttttttagggaatgtgcaaagatttgcacacttttcatgaagtaaggaaagtaaacaaagtcataaattctatggtgttacctgaaaaagatcccactgagcattggaatttgaatgattcatggtattgtgtcgtatcatggtattttgtagtactggttagacaggttagtcctagcagcattgtgtataactgctgaatcgggctatgctcatttcctagctgttacatctatgttatgccagttagagataggtgaaatacaacaccagggtcataatattctaaggtatccctctgttctaagttgtctcaccaataagttgatgacactggaacagagaccaaatgcacttcttaatcttttacccgtcagggctcagcccttatgcctgatgctttatgatcattttcattttcttatttgcatatactgagtatgtctatgtttaggtgcaactattgttctagtaccacccgttttccaagatataatgatccatataaggtatgaataagtcctgttattgtgtgagataaggtgttatttttcaaccaaactgaaattgatggtcaaattgtctgttccaatatttattgctttggaagcttctagaaactaggaaaggacgctgtggagaatgggccaattgctttacattctactgtcgaagttttggatatgaagctcgtctggttagttccataatattcataaatttgttttatccacaatgatatacaatttgcttataattgtaagcggctctccattcgtccacttgtcagtatacttttggttttcctgtctgaccgtctgttactttcacccttaacatcttggaagtctctttccttgcctgttaccttcacccttaatgcccaatttagtggtcaaacccaaaactgataaagaattatgcattatctgcattgtctgattatcgaatttcattgggcgcaaatatgaattaggtttttcccatgcaaaacttgtttctgtgatacttgaattcacaattggatcctataaaaatatgtggatgcgattgtttaactattgcacaattatctgtatgttcgatgtcagctgaattatgcagaaatttgattcatatgcagattgttattcacatgattcataccaaaacatcttaaaacagttataccaaacaaggttaccatgatccactctaatagcaaacagagccttagtatgcctaaatttatgttgccactaattactgatgactggtctttgctcttgtgtaatgcaatataacactccttttctatttcaatgttcacaaacagttccatttggaagaagaacgagtgcactaaagtttattctagcattgtcaatatactgtaactttgcttacctgagtaatttaatttatagattctggatttcactgatcatgtgtggacagagtgtttttcaaacttgtatgggaggttagtgaatatacccactgcttctaatttggtattctgtcacgcctattcctactgacaatctgacagagttctggaatgtttaggtggatgcatctagatccatgtgaaggagtctatgataatcccctattgtatgagaaagggtaaaatatgttcttagccaactggtttatgcatactgccttgtcgtaaagtgcatagtttatctaatttatctggatttagtgatacaactctgtggactttccaggtggaacaagaaactagattatgtaattgctatttcaaaagatggagtacgtgatgtaacaaaacgctacaccagaaagtggcatgaggtagaaaattttggcttggttaagacctgtgttgaggctgggtaggataggtgtgtttagaatgttttgatttttatttcatgcatactgcttgtcaattgcaggttctttccaggcgaataattacctcggaagataccgtttcagctatcttgtcatcgataacagggaaatatcgcagtggattgtcaattgatggactcacagccttagaaaatcgtgacaagaaagagtccgaggaacttagtaaagctgcttatcttgaagttgacaccagcatatctttacctggaaggcaaagtggttctgtggagtggagaaaagcaaggttagaactgagccaagttgaatcactcgcatgctcatcttgccctgctcgaaaatgtgtggatgctcatgtttcaaaaatatatgatgctctttctgctcttctttcacatttttgtgatggagacatccctaaagaaagagttattgaagtttttgactcgctgaagtgcttgatgcaaaatcttaaagatgcaaagtttaaaagcaggagagctacattggacaaaaaaacacaactggtttttgaggagatttttccttctgtcgaaagattgctttgtgctatgtccttgaaagcagagttgggtactgatggaaaatgctctgtgacaacagtcagaaatgcagtacatacatccttagcattaccagtggcaatggatgtggttgatgagatactgagtaattacaagagtaatgcggtttgcacaaaaggtcaccaattcccaagaggcaatagactctgttcaggttctgtccttgcaagtggtgaacaactcccaattggaattgtatgagctgcaacctgtgcattctcttatgttcattcatcatcattagactacaatattgattttcaaattgtttcaggcaacggcggcatttgatggcattcgctcatccaaatgggaagagcctgatggagccaaaggtgatccggttgtagtattactaatatgatcttttaatcatttctttattatttctcatctgtactagtgactctacgcttattgattaattctaacatataccttgagtatgctaaatttatataaatttaaactgtactgtttcaagtacaaaaactatctcggaattttaagctttgaaatgattagtttgtgccatgtcgatatcccaactttgatgaaaatgatggtgcccatgctttatcatatagtttaatccttttatttggctgttggtgtaataattgtgaataaatgtcattgatattactttcatctcatttcttctccagatgaatctatctacctttgatttgctagattggaactaaaatttttgagtttatgatgatccagttagaattgcagggtttgttctataattgctgcagaatttcattttctatatgagtagttcatatgcttctggtcctgtctgattgccaatatgcacattgaaatttaagctgttcaccaatttttggcgtgggttagaatttcgtgctctctaggtcatgaagtctttcatgagcgctcccctgtaaacatctgtcgttgagtggagcttttctcctttttctgtcttaatacaagtaatagagttctcctgagtattctctaaaggaaaaaaaaaggtattagtgtccagtcagtattttcatgctgtttaaaagaacatgtgtttcaaatagttataaacataaattttcactgttcccattatattatctaacatagtcatttttcaggatgttggataatttacaagatgcttgatggccaaacttgcgagttggattcatatgatttgatgtcagctaatgatgttccagagagggatccaatggactggtatagcaactttgtttccttacatacctttttacacacataacaccgttgataagcaaccattacagtgccaaaatcctagtaacatgaagtatgcaacaagatatgtcaatttaagagaattatgggcgacaaaatataatattaaaataaatctggattacaagctaaattgttgttatttggcaattgaactttgttttggtgggtagtcggctctagtgggacctgcaaatgtcttggttaccattgtttgttgcaatacaaaatgttagattagctgttgggcttttgcaatgccggtgttttgacatggcgctacttttttaggctagaccattatcttttgatccactcaagcagacatacttatcgcaggacccagctcttataccagcaactgtagagaacctgtacaaatgtttggccttctcttatgctcctccaggaaaagtttggaaatctttctgttttgacatatttccttgcactctatagtttttgtttttaatactgtaaaatggtgttaatcgtttttttgtggggaaaaatggtgttaattgttaacagaattttgagaagttctaaggaataaagtgctacgacttatgattagttctaagattttaaaaggcataaagctgttaaaacttacgagacacaagtttttggcaaacatcaattgaagttgatgatagatatggcactagctttgctttctttgaatcttctttaaagcgatgatattccatgagccacaagcaattgtgtcacagggttcttgaagggagcactgatggaggctccacctggaatacaatagacgcccggagttctgtaattttcgacagtcgtttctataggaaaacatttactgtggacaagagatataaagcaaatgcttttcggtatgttcaatatctatctgctggtagtgattgctgaattttctcccttttggctaacaatgttttatatgcgtttgacaggtttcggtttctgcgagtgagagaatctaatggcaatccaaggtttcagataggttcaattgacctctacgggaaaagcacatgagctttcttgaaagtgtgttacctcgaatagaaagccttttaaaccttctcgaagctaaactatacgtggctgtgaccatggctattatttgcaaccaacgcagttgcattatttattggaagattgtaaaatgtgaaattcaactatggaaggagtgattatcccttcaattcttgagaagactctttatatgcccccattgccttaagtctctagttgtttcctacaactcaagagtactgcagaataaggaagcacagaggagctatctaagtgttgtgtgatatatagacatgtatatgtcagtttgtaccagtatctaattgtttaattaaaagccttaccaaatgttcatttggtagtgtttttgagagt</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os07g0497400, RefSeq:Os07g0497400