BGIOSGA012014

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA012014

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA012014, complete gene.

LocusTag

OJ1217B09.5

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA012014-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA012014-PA

Length

8993

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:5019116..5028108

Sequence Coding Region

5019116..5019409,5026311..5026852,5026971..5027057,5027135..5027191,5027311..5027549
,5027649..5027767,5027876..5027962,5028061..5028108

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:5019116..5028108 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:5019116..5028108 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGGTGACGGGCGAGGGGATGAGGAGGAGTGCAGGGTGGCGCTGCTGAATGGCGGCGGCGCGGCGAAGGAGGGCTGGCAGGTGGTGTCCGGCGGCGACGGCAAGCTGAGGAGGAGGGTGTGGGAGGAGTCGAGGAAGCTGTGGGTCATCGTGGCGCCGGCCATCTTCAGCCGCGTCGTCACCTACAGCATGAACGTCATCACGCAGGCGTTCGCCGGCCACCTCGGCGACCTCGAGCTCGCCGCCATCTCCATCGCCAACACCGTCGTCGTCGGCTTCAACTTCGGCCTCATGCTTGGCATGGCGAGCGCGCTGGAGACGCTGTGCGGGCAGGCGTTCGGCGCGAAGAAGTACCACATGATGGGGGTGTACATGCAGCGTTCGTGGATCGTGCTGCTGTCGTGCGCGCTGCTGCTGCTGCCCATGTACATCTACGCCGAGGACGTGCTGCTGCTGACGGGTCAGCCGCCGGAGCTGTCGGCGATGGCCGGCCGCGTCTCCGTCTGGTTCATCCCGCTGCACCTCTCCTTCGCCTTCCTCTTCCCGCTGCAGCGATTCCTGCAGTGCCAGATGAAGAACTTCGCCAGCGCCGCCGCGTCCGGCGTCGCGCTGTGCGTCCACGTCGCCATTAGCTGGCTCCTCGTCTCCCGCTTCCGGTTCGGCCTCGTCGGCATCGCGCTCACCCTCAACTTCTCGTGGTGGGCCACCGCCGCCATGCTCTTCGCCTACGTCGCCTGCGGCGGATGCCCGGAGACGTGGAACGGCCTCTCCCTCGAGGCGTTCGCGGGGCTGTGGGAGTTCGTCAAGCTGTCCGCCGCCTCAGGTGTCATGCTATGCTTGGAGAACTGGTACTACAGAATCCTCATCTTGCTGACCGGTAACCTCAAGAACGCGGCTATTGCGGTCGACGCGCTCTCCATCTGCATGACGATCAATGCATGGGAGCTGATGATTCCCCTGGCATTCTTCGCTGGAACCGGGGTGCGGGTGGCGAACGAGCTGGGCGCCGGCAACGGGAAGGGCGCGAGGTTCGCGACGATCGTGTCGTCGGTGACGTCGCTGGTGATCGGGCTCTTCTTCTGGGTGCTCATCGTGGGCCTCCACGACAAGTTCGCGCTCATCTTCACCTCCAGCGACGTCGTGCTCGACGCCGTCGACAACCTCTCCGTCCTCCTCGCCTTCACCATCCTCCTCAACAGCATCCAGCCCGTTCTCTCAGGTGTGGCTGTTGGGTCTGGGTGGCAATCCATGGTGGCCTACGTCAACATTGGCACCTACTACCTCATCGGCATCCCCATGGGCATTCTCCTCGGATGGCTCTTCAAACTTGGCGTCCTGGGAATTTGGGCGGGTATGATCGGCGGAACCGCAGTGCAGACGCTAATTCTGGCCATCATAACCATCCGCTGTGACTGGGACAAGGAGGCCATGATCGCAAGCACACGCATGGACAAGTGGTCGCAAGTCCGGTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MGDGRGDEEECRVALLNGGGAAKEGWQVVSGGDGKLRRRVWEESRKLWVIVAPAIFSRVVTYSMNVITQAFAGHLGDLELAAISIANTVVVGFNFGLMLGMASALETLCGQAFGAKKYHMMGVYMQRSWIVLLSCALLLLPMYIYAEDVLLLTGQPPELSAMAGRVSVWFIPLHLSFAFLFPLQRFLQCQMKNFASAAASGVALCVHVAISWLLVSRFRFGLVGIALTLNFSWWATAAMLFAYVACGGCPETWNGLSLEAFAGLWEFVKLSAASGVMLCLENWYYRILILLTGNLKNAAIAVDALSICMTINAWELMIPLAFFAGTGVRVANELGAGNGKGARFATIVSSVTSLVIGLFFWVLIVGLHDKFALIFTSSDVVLDAVDNLSVLLAFTILLNSIQPVLSGVAVGSGWQSMVAYVNIGTYYLIGIPMGILLGWLFKLGVLGIWAGMIGGTAVQTLILAIITIRCDWDKEAMIASTRMDKWSQVR</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..294#7196..7737#7856..7942#8020..8076#8196..8434#8534..8652#8761..8847#8946..8993#ATGGGTGACGGGCGAGGGGATGAGGAGGAGTGCAGGGTGGCGCTGCTGAATGGCGGCGGCGCGGCGAAGGAGGGCTGGCAGGTGGTGTCCGGCGGCGACGGCAAGCTGAGGAGGAGGGTGTGGGAGGAGTCGAGGAAGCTGTGGGTCATCGTGGCGCCGGCCATCTTCAGCCGCGTCGTCACCTACAGCATGAACGTCATCACGCAGGCGTTCGCCGGCCACCTCGGCGACCTCGAGCTCGCCGCCATCTCCATCGCCAACACCGTCGTCGTCGGCTTCAACTTCGGCCTCATGGTACGTAAATTACTACTACGCGTCCCACTCCATTAATTTACTCACTAGCTTGATCTTTCTAGCTCCGGGCCTCCGGCCGATTGAACACGTCCTTTTTTGCTGGTTAATTAATTCGTCGTGCTAGCTCGTACGTGCTATCTTTGGGTGCTATCTCCCCAATATGGTTGGCAACTTAGGATTGGTTTTAATTACCCCAGCAAGGAAAAAAAAACATAAACATTAAGCAGTAAATATTTCGAACAAAATGTGCTGTGAATTACTCCATTTCAAAATCAAACCGCTTCAAATTTAACTAGATTTATAGACAAATATAATAATATTTATATTACCAAATTAGTTTTATTAAATTTATAATTAAATATACTTTTTTAATAAACTTATCTTGGATTGAAAATATCACTATTTTTTCTATAAACTTGATAAAATTTAAAGTAGTTTGATTTTATAACCTTTAACGGATGGAGTAGACTGCAAGAGCAGCTAGCTAGCGCCAAGCATGCAAGAACGCTACGCTTCTGGAGTTCGATCACTGCAAAGCTGCCATGACCCATGATCGTAAAGTCCATTTATGCATGATGCTAGTGTGGACAGGTGTGACGTGTTAATTGGCATTCATATCGCAGCATTTGTGGGGTATCCTTTTGTTACACTTGCTCCTATCCATGCATGCGTGCCCAATGTTTTTTTTCCTTTTTTGAAAAAAATTGAAACGTAAATGTGGCTGGATTTGTTCAATTCAGCGGCCAAAATCCTCGTGCAACCCTGTACATATCGCAGACAGCCCACCTGAAGAGTTCAACTAGGAATTTGTGAAGACAAACCGAAGCGTGAGTAGTCAAGTGGATGTGTATTTCTTCGACTGCGATATGACTGTTTTTCCTCGCGTCAGAGTTACGACTTACGACATGAGAGCGGAATCTCTCTTGCCTTTTCGTGAATTCATGCGAAGTTGAAAGGCTGATCGTGAAATTTAAGGCCGCATTACTTCGTCTATGTTTATAAGCTAAAATTATTTAAATTTAACTTCAAAGCTAATTTTACTATTCTTAAAAAATACTAGAATCGTCGTAATTTCTAGTATAAAACTTGATAACTTAAGTACTAGATATCTCGAGTAATTAAAATTTTCAGTGTAAAATTTAGGTAACTTAAAATTCTTTCTCAATGACAATAAAACTTCTCTAATTTTGAAGTTTGATTTTATGTTTTTCATTATATTTTATTTTATATATTTTTAAATTAATAAAAACACATATATATATATATATATAAACATTTTATTGGCAAATTATTTTATTTACTATTCGAGGGATCATTTTACGGTACATGAGAAGCAACCATATATTTTTATTGTATAATTTATTGACTTTCAATACTTTCGATGTCAGAGGTACCAAAATTTTATTTTAAAAAACATTTCGGTACTTCTTGAGGCCAGTATAATTTCTGTTTGTTTTTATATAAAAAGATGCACGTGTCCGGAATATTTTTTTTAATTTCGTTTGTGAAAAATGGAAAATCATAAATGCAATAATCCAGAATGCAACGGCTGGCGCTTCTGTGCCCGCAAACACTTGGGTTTTTTCTGGTGTCCACGTTTTCTTATCATCAGTATACAGAGAAGGCGGTGTCAAAAAAAAAAAAAAAGTATACAGAGAAGGCACCGGAAGGAGCTGGGCCTCTTGAGTGAATTCTTCATTTCTTCTAGTACTTCTGAGAAGCTTCATCTCTTTTGTTCCTGAAACTTCGAATAAATTCCTCGCTTCCGCTGTTCCACCTGTCGATTTTATCAACCAACGCACACATACATGTGGCATCTATTCATCTCCAGCATATATTCCGACTTATTTGCCGTGCTTGCAATTTCTTTTCAGCAAAATTGATGTCACTTGTCACCTGCAACGTTAACCTTCTCCTTTTATCCCCCGAAAAAAAAAAAACTTCTCATGTTATCAAATAAACTAGCATGGTGGCCCGCACAATTTTCGGCTAGCATCATTATATTTTCTCTCATATAATAGCATATATGTTTTCTCATTATATTCAAATATATTAAAATGACAACATAATTTAAAATTTTGCAATAACTTTACAAAACTACTAATGTGTAATATTCATATTATATTTTATATACGTGCTATTTATTAATTATTTTTAATATTAAATTTTAGTTATTTGTAAATTATATATATTTCTATAGGGACTCTAGACTCGTCTTTTAATATTTTTTTTAATTCTGAATTTTCTGTAAATTGTATTTCTATATAGACTCTATGCTCTTCTTCCGATATATATATTTTTATTTCTGAGTTTTCATATTATATTTTATATATGTGTTAGTTATTAATTATTTTTAATATCAAATTTTAGTTATTTGTAAATTATATATATTCCTATATAGATTCTAGACTCGTCTTTTAATATTTTTTTTAATTCCGGATTTTCTGTAAATTGTATTTCTATATAGACTCTATGCTCTTCTTCCAATATTATTTATTTTTATTTCTGAATTTTTATTATTTCTAATTGTATTTCTATGTGGACTCTAAACTCATGTTTCAATATTCTTTAATTTTTTTTCATTTTGAATTTAAGTTACTTCTACATTGTATTCCTATATTGACCTTAAACTCTTCTTCCTATGTTTTTCTTAATTTTGAATTTTAGTTATTTGTAAATTGAATTTTTATACGGACTTTAAACTCTACTTTTAATTTTATTGTGTTTATTCTAAATTTTAGTTAGTTTTAAATTCCTATATGGACTCTATACTCTACTTCTAGTATTCCTTATTTTTAAATTCCGAATTTCTATTTTTTTTCTTAATTATATTTCTATATTGACTCTATACTCTACTTCTAATATTCCTTATTTTTAATTCCAAATTTCTATTATTTCCTAATTATATTTCTATATGGTCTTTATACTCTACTTCTAATATTCCTTCTTTTTAATTCTGAATTTTAGTTATTTCCTTATTGTACTTCTATATGGACTCTATACTCTACTTCTAATATTCCTTATTTTTAATTCCGAATTTTAGTTATTTCCTAGTTGTATTTCTGTATGGACTCTAGTATCCTCTTCTAATATTCCTTATTTTTTAATTCCGAATTTGAAAGGGTCAATTAGGCCTAGAGGGGGTGAATAGGCTAATTTAAAACTTAAGAAATGCGAAAGCAGTAATTTTCAGAGCTAGGCTGGGAATTTTCGGAACTTCCGAAATGATTTTCGGAACTTCCGAAAATGCACAGAGCAGCACACACAAAATGAAAACTCTAGATCTATAAGACTATAACAGGGAATACAAGGCACAATCAGCAACTAGACCAATAGCAACACAAGCAAGCAAAACAAGAGGAGAGGGATGAAGAAATATCACCAAGATGTAGCTCCCAAAGTTGTTGAGTTCAAATCCTTGAGGGGATTCTACTCTCCGTTGAGGAGCTCACTAAGAGCCGGGTCTTAGCTAACCCTTTCCTCAAGAGGTCGCACTAAGCACTCCTCCTTTCACTAAGAGGTATCTCTTCCCTTGCGGAGGTGAGATCCGGCCTTCACAAACTTTTCCCGGCCAACCACAAGTAGATCGGTAGCTCGGGAGTGACACCTAGCCGTCTAGGAGTCCTCAACCTCCAAGAGTAAAAGATGATGCAAAGAACTCCCGGAGATGATGCAAGTGCTCAGAAATCTTTACAAAGACCACAAGAAGCACCCACACAAGCTCGAATCCACACTCTCACACACACACCAAATCAAAATCAAACACGGGTGGAGAGATGAATCGAGGAAGCAAGTCTCAAATGAACTAGAGAGAGAGAGCAAGCCAAGGGCACAAATAATTGGAATGGAACCAGCAACCCTCACAAGTGAGGGGAGGTGGGTATTTATACCCACAGCACAAATCTGCCCGTTGGAGTGCAATAAAAGGGATTTTTGGAACTTCCGAAAATTCCAGATCTGAGGAAAATCGAAGTCAACGCAATTTTCGGAACTTCCAAAAAATATTTTCGGAACTTTCGAAAATTTCCAGAACGCTTCTGTGTATTTTCGGAACTTCCAAAAATTTCCAGAGAGCTCTCAAATGTTTCTGTGTATTTTCGGAACTTACGAAAATTATTTTCGGAACTTCCGAAAATTTCCAGAACGCCCAAACACGGTTCGGTGTATTTTCGGAACTTCCGAAAATTTCCAAAACGCTCCAATAGAGAAATGCTTCGAAGTAAAATTGATTTTGAGCACACGCATCACTCCTTATATGTCTATGCATCATCCCCCTTAATAGTACGGCTTTCCTACGACACAATGCGAGGAAAAAGATACAATATACCATTTGATCATTGCCACATTGCATCGCGATGTCGCATTCACAGGATATGCATTGTATTACAACACGTTGAGAACTTAACAACCTTCACATTTGCTTGAATAAAAATGTTAGTCCTCTCTAATCGCATTGTAATCAATCATCAAAATCATTAGGGGTCTAGATGCACTTTCAGAATTTCAACTATTTTTTTTCTTAATTGTATTTCTATTTAGACTCTGTACTCTACTTCTAATATTTCTTATTTTTAATTCCGAATTTATGTTATTTCCTAATTTTAATTC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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA012014