BGIOSGA012163

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA012163

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA012163, complete gene.

LocusTag

OsI_10600

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA012163-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA012163-PA

Length

6871

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:7133556..7140426

Sequence Coding Region

7133556..7133598,7134689..7134786,7134919..7134969,7135044..7135157,7135242..7135442
,7135518..7135619,7136716..7136823,7136902..7137132,7137216..7137466
,7137579..7137750,7137812..7137868,7138026..7138181,7138278..7138328
,7138524..7138664,7138741..7138935,7139005..7139136,7139239..7139412
,7139867..7140106,7140232..7140426

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:7133556..7140426 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:7133556..7140426 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGCAGCCGTACATGAAGAAGGATGACGACGACGAGGACGTTGAGTACTCGCCATTTTATGGGATTGAGAAGGGAGCCGTTCTGCAGGAGGCAAGGGCTTTCCATGATCCGCAGCTTGATGCCAGGAAGTGCTCGCAAGTCATCACTAAGCTATTGTATTTACTCAACCAAGGGGAGACATTCACAAAGATTGAGGCCACAGAAGTTTTCTTTGCAGTAACAAAGCTGTTCCAGTCCAAGGATGCTGGTCTTAGGCGGCTGGTGTATTTAATGATCAAAGAGCTTTCACCATCATCAGATGAGGTTATCATAGTCACAAGCTCATTAATGAAAGATATGAACAGCAAGACGGATATGTACCGTGCCAATGCTATCAGAGTTCTTTGTAGAATAATTGATGGCACCCTCCTTACTCAAATTGAGAGATATTTGAAACAAGCTATAGTTGATAAGAATCCTGTGGTTGCTAGTGCTGCTCTTGTTAGTGGCATCCATCTGCTTCAGGCAAATCCAGAAATCGTGAAAAGATGGAGCAACGAAGTGCAGGAAGCTGTTCAATCAAGATTTGCACTTGTGCAATTTCATGGCCTAGCTCTTCTTCACCAGATCAGACAGAATGATCGTTTAGCTATTAGCAAGATGGTTTCTGGCTTGACTAGGGGGTCTGTCCGCTCACCTCTTGCACAATGTCTTCTGATTCGTTACACGAGCCAGGTAATACGCGAGTCAAGCATGAACACACAAACCAGTGATCGCCCATTTTTTGATTATCTGGAATCATGTTTGAGACATAAATCAGAAATGGTGATTCTAGAGGCTGCACGGAAAATAGCAGAGATGGATGTGACAAGTCGTGAATTAGCACCAGCGATTACTGTGTTACAGTTATTTTTGAGTTCATCCAAACCTGTCCTTCGATTTGCTGCTGTCCGGACACTCAACAAGGTTGCTATGACACGCCCTTTGGCAGTGACAAACTGCAATGTGGACTTGGAAAGTCTGATGTCGGACCAGAATAGGAGTATAGCAACCCTGGCAATCACTACACTTCTTAAAACAGGCAATGAATCTAGCGTAGACCGCCTCATGAAACAAATTACCAATTTCATGTCAGACATAGCAGATGAATTCAAGATAGTTGTTGTTGAAGCTATACGATCTCTATGCCTTAAGTTTCCCCTGAAGTATCGTTCAATGATGAACTTCTTGAGTAACAGTTTGAGAGAAGAAGGGGGCTTTGAGTACAAAAAGGCCATCGTTGATTCCATAGTAACTCTTATCAGTGAGATACCAGATGCTAAAGAAATTGGTCTTTTGTATCTCTGTGAGTTCATTGAAGACTGTGAGTTCACCTATCTTTCCAGTCAGCTGCCTATGAATTATCAGGTAGTATTACTTGATATAGTGAAAAATGCTGATGCAATGATATTGCATCTTTTGGGAAATGAAGGACCAAGGACATCAGATCCAAGCAGATATATACGCTACATCTACAACCGTGTGATACTGGAAAATGCCACTGTCCGTGCTAGTGCTGTCAGTACATTGGCAAAGTTTGGTGCCTTAGTTGATGCCTTGAAGCCTAGGATCTTTGTTCTTTTGCGTCGTTGCCTGTTTGACACCGATGATGAGGTTCGTGACCGTGCTACACTTTATCTCCAAACTCTTGATGGTGAAGTTGCTGTTGGTAGCACTGAGAAGGATGTTAAGGAGTTCCTATTTGGATCATTTGATGTGCCACTTGCCAACTTGGAAGCAAGTCTTAAAACCTATGAACCCTCTGAGGAGCCTTTTGATATTTCTTTGGTGTCGAGAGAAGTCAAATCACAACCACTTCAAGAGAAAAAGGCCCCAGGAAAGAAGCCACCTGCTGGTGCTCCTGCTCCTGCACCTGTTCCAGCTGTTGATGCTTATCAGAAGATTCTCTCGTCCATTCCTGAGTTCTCCGGGTTTGGAAGGCTCTTCAAGTCCTCAGAACCTGTGGAGCTGACAGAGGCGGAGACTGAATATGCGATTAATGTGGTTAAGCACATATACAGTAGCCATGTTGTGTTGCAGTACAACTGTACAAACACTATACCCGAACAACTGCTAGAAAATGTGACTGTTTATGTTGATGCCACTGATGCTGAGGAATTTTCAGAAGTTTGTTCAAAGCCACTTAGAAGTTTGCCTTATGATTCACCTGGGCAAATTTTTGTTGCTTTTGAAAAGCCAGAACATGTTCCTGCTACTGGGAAATTTTCAAATGTGCTGAAGTTTATTGTTAAAGAGGTTGACACATCTACAGGGGAAGTTGATGAGGATGGTGTGGAGGATGAATACCAGATCGAAGACCTGGAAATTGTTTCGGCTGATTACATGCTGAGGGTTGCAGTCTCCAACTTCAGGAATGCCTGGGAAAATATGGACCCAGAAAGTGAGCGTGTCGATGAGTATGGACTTGGTGTTAGAGAGAGCTTGGCTGAGGCTGTGAGTGCTGTCATTAGTATCCTTGGTATGCAGCCTTGTGAGGGCACTGAGGTTGTACCAAAGAATGCAAGATCGCACACTTGCCTGCTGTCTGGTGTGTTCATCGGCGACGCCAAGGTTCTTGTCAGGCTATCGTTTGGACTGAGCGGGCCCAAGGAAGTGGCGATGAAGCTTGCCGTCAGGTCAGATGATCCCGAAGTCAGTGACAAGATCCACGAGATTGTTGCCAGCGGCTAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAQPYMKKDDDDEDVEYSPFYGIEKGAVLQEARAFHDPQLDARKCSQVITKLLYLLNQGETFTKIEATEVFFAVTKLFQSKDAGLRRLVYLMIKELSPSSDEVIIVTSSLMKDMNSKTDMYRANAIRVLCRIIDGTLLTQIERYLKQAIVDKNPVVASAALVSGIHLLQANPEIVKRWSNEVQEAVQSRFALVQFHGLALLHQIRQNDRLAISKMVSGLTRGSVRSPLAQCLLIRYTSQVIRESSMNTQTSDRPFFDYLESCLRHKSEMVILEAARKIAEMDVTSRELAPAITVLQLFLSSSKPVLRFAAVRTLNKVAMTRPLAVTNCNVDLESLMSDQNRSIATLAITTLLKTGNESSVDRLMKQITNFMSDIADEFKIVVVEAIRSLCLKFPLKYRSMMNFLSNSLREEGGFEYKKAIVDSIVTLISEIPDAKEIGLLYLCEFIEDCEFTYLSSQLPMNYQVVLLDIVKNADAMILHLLGNEGPRTSDPSRYIRYIYNRVILENATVRASAVSTLAKFGALVDALKPRIFVLLRRCLFDTDDEVRDRATLYLQTLDGEVAVGSTEKDVKEFLFGSFDVPLANLEASLKTYEPSEEPFDISLVSREVKSQPLQEKKAPGKKPPAGAPAPAPVPAVDAYQKILSSIPEFSGFGRLFKSSEPVELTEAETEYAINVVKHIYSSHVVLQYNCTNTIPEQLLENVTVYVDATDAEEFSEVCSKPLRSLPYDSPGQIFVAFEKPEHVPATGKFSNVLKFIVKEVDTSTGEVDEDGVEDEYQIEDLEIVSADYMLRVAVSNFRNAWENMDPESERVDEYGLGVRESLAEAVSAVISILGMQPCEGTEVVPKNARSHTCLLSGVFIGDAKVLVRLSFGLSGPKEVAMKLAVRSDDPEVSDKIHEIVASG</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..43#1134..1231#1364..1414#1489..1602#1687..1887#1963..2064#3161..3268#3347..3577#3661..3911#4024..4195#4257..4313#4471..4626#4723..4773#4969..5109#5186..5380#5450..5581#5684..5857#6312..6551#6677..6871#ATGGCGCAGCCGTACATGAAGAAGGATGACGACGACGAGGACGGTTAGTCCCCTCTCCCCCCTCCTAATTCTCCTCCTGTTGGCTTTCTCCCGGCCGCGCTGCGATCTGGGAGCCGCTGGCCCAGCGGCGGAGATGCCGGATCTGGCGGGATCTCGCGGTGGATCTCGACCTCGTGTGCATGTCCGCCCCCGAGAGTTTGTGGTGGTGGTTGTGCGAGCTTCCTGTTTGAATGTTTGATGCTCTCCGCTGGTCAGAGTGGCCTTCTGTTTTGCGACTTGGCGTGCTTTGGCCCTGAGAATTTGGAGTGGGAGAGCTTGGGTTTACCTGGATCTGGAGTGCGCTCGATCACTCCTCTGAGGCATCACAGGCGTTCGGTTCCGACGCACTTCGTTTTTTTTTTATGTTCATCCTCTAATTATCAGTCGGCTAGGCCCATTGGTGATCCAATAGTGAGATGAGATTCAGTTGCGCCCGTGTGCTGGAACCATTTCGTTTCACTTTCCATTGGAGATTCGCACGTCTAATTTGCATATAGGAGTAGATCCGTTCCTTAGGCTGTGTTTAGTTCCATTGGCAAAAAAATTTGCCGGGTCACATCGGATATATGGACACACATTTGAAGTATTAAACGTAGACTAATAACAAACCAAATTACATAATCCGCATGTAAACTGCGAGACGAATTTATTAAGCCTAATTAGTCCATCATTAGCAAATGTTTACTGTAGCACCACATTGTCAGATCATGGCGCAATTAGGCTTGAAAAATTCGTCTCGCAATTTACACGCAAACTGTGTAATTAGTTTTTTTTATCAATATTTAATACTCCGTACATGTGTTCAAACGTTCGATGTGACGGGGCAAAAAAATTTGCCGGTGGATCTAAACACCCCCTTAGTCTATATGGGTGTTCGGCCAATTTGTATGATCCAAATATGGTAAGGTTTTTGGTGCTCAATGCAAGCTGGTTACATGCGGTGTTTACCTTAACGTCAGAGCATTTCATTTTGATATTGCAGTTTGATCTTTTATAGAGAGTGTCCTATCTCTTGTTTTTAGATTGAATTCAGTCAGTGTAGTAAAATGCTTTCAAGTTATTACCTGTTTATTAACCCATGGATGCTTTTACAGTTGAGTACTCGCCATTTTATGGGATTGAGAAGGGAGCCGTTCTGCAGGAGGCAAGGGCTTTCCATGATCCGCAGCTTGATGCCAGGAAGTGCTCGCAAGTAAGTGTTTCTTGCATGACCTCTCTCATTTTCATATCAGTTCTGAGTATTGTGTTCAGATGTATGTTTCACCCTCTTGTTATTCATTATTATGGCTTTGCTCTTTGTTTGATGTGTCTTGGAATTTCTCAGGTCATCACTAAGCTATTGTATTTACTCAACCAAGGGGAGACATTCACAAAGGTAGGATACTACATCTCGTGCAACCAAACTTGCCTTATGCCCTCAATGCCCTGATGGATTTGCTTCTGATGTAGATTGAGGCCACAGAAGTTTTCTTTGCAGTAACAAAGCTGTTCCAGTCCAAGGATGCTGGTCTTAGGCGGCTGGTGTATTTAATGATCAAAGAGCTTTCACCATCATCAGATGAGGTCAAAGGAAACTGTTTTTAGATCCATGAATTATAACTTGTTTCTTGTATTGTCATTCTAAATTGTTTGAATTTTACACAACAGGTTATCATAGTCACAAGCTCATTAATGAAAGATATGAACAGCAAGACGGATATGTACCGTGCCAATGCTATCAGAGTTCTTTGTAGAATAATTGATGGCACCCTCCTTACTCAAATTGAGAGATATTTGAAACAAGCTATAGTTGATAAGAATCCTGTGGTTGCTAGTGCTGCTCTTGTTAGTGGCATCCATCTGCTTCAGGTACACTTCTATAGTTCTATACGAAAAAAAACATAATTCTTTTCGGAAGTCAAAAACTGTACTTATTATATGCAGGCAAATCCAGAAATCGTGAAAAGATGGAGCAACGAAGTGCAGGAAGCTGTTCAATCAAGATTTGCACTTGTGCAATTTCATGGCCTAGCTCTTCTTCACCAGGTTTGTATTTTGTTTCATCGATCAATGCCCAACTAAACTTAGACTAATAGCAAAGCAAAGACAGGTATTGAACATGAAGGTGAGATAGATTATAATGCCTATGTTATGGTATATCTTGTTGATCCGGTGAATGGAACTTCTGAGTTGTACCTGGGCATTACCAAAGAAGCCGGCAGCAGTTCTGTGCCTAATAATATAGGTTGCACGTTGTGTTTTACTAGCTTTTGACGAAAAAATGAAAAGCATGACAAACTCTGATTAATCCTGGCCCTTTGAAGAACACTTTGGCTGCATGATCTCATTTGAGGGAGATAGATTTTAACCACTTAATGGGATTCCATCCTACTTTTTAATGCCCTTGGGTTGTGTCATGGCACATTTTGAGATCTGTGCATGGATTTTTCGTAGCTATATATTTTTTGTGCATGGATCTCAAAGACATTCGGATGATCGGTGGTGGTACAGGGGAGCATCTGTGTTAAAAGTATTTTTCATCATTTGACTAAATGATGGAACTGTGGAATATCAATATTTTACTTAATATATTGTAGCTTTTCATAGTTTACTCTTTAAATTTTCTAGGAGGACATCTTTCTTTATTGAAAGTTAGAATATCTACCTGAATCATTTTGTGTGCCCTGTTTCACTTGATAGCTTATGGATTCAGTTCAGGAGGCCATTGTCAGGCCACAGGTCATATGCTTTGCAGTTTACTGTTTTGGAATAGTCCATGGTTAGTTTATCAGTGCCGACGATGAACTTATACACCAGATGTCAATGTCTTGATATCTCAGAATGAAACTATTTAGGTCAAACACTTTTACCAAAGTAAAGCTTTTCTGAACTAAGGTATGACTAACCAATTTTCAGTTGCTTCAGTCCATTTTGCACTAGTTTTAGTTATATGCTATGCTGGGTTAACATCTTCAAATATCACTGACCTCCACTTTACTTAATCTTAAAATAACTGTAATTATGTAGAAATTGATTTATTTTTGTGCATTTGGTATGCAAAAGGAATAGTATGGTATAAGGTGTCCTAGCCTGAGACACATGATGAGTTGATGCTCTGTTAATTTTGTCTCCCAACTTTCAGATCAGACAGAATGATCGTTTAGCTATTAGCAAGATGGTTTCTGGCTTGACTAGGGGGTCTGTCCGCTCACCTCTTGCACAATGTCTTCTGATTCGTTACACGAGCCAGGTAAGCTACATATACCTCTACTGAAGCTTAAAACCTAGCAAAAGTAAATTGCTGAACATTGGAAGGGTGATTTACCAGGTAATACGCGAGTCAAGCATGAACACACAAACCAGTGATCGCCCATTTTTTGATTATCTGGAATCATGTTTGAGACATAAATCAGAAATGGTGATTCTAGAGGCTGCACGGAAAATAGCAGAGATGGATGTGACAAGTCGTGAATTAGCACCAGCGATTACTGTGTTACAGTTATTTTTGAGTTCATCCAAACCTGTCCTTCGATTTGCTGCTGTCCGGACACTCAACAAGGTTATCCCTGCATGATGTTTAATCTTTGACATTTAAATTTTCTCAGCTTATGTCTATATCTTGATTTGCCTGTTATCTCGCAGGTTGCTATGACACGCCCTTTGGCAGTGACAAACTGCAATGTGGACTTGGAAAGTCTGATGTCGGACCAGAATAGGAGTATAGCAACCCTGGCAATCACTACACTTCTTAAAACAGGCAATGAATCTAGCGTAGACCGCCTCATGAAACAAATTACCAATTTCATGTCAGACATAGCAGATGAATTCAAGATAGTTGTTGTTGAAGCTATACGATCTCTATGCCTTAAGTTTCCCCTGAAGTATCGTTCAATGTATGTAAATCTTAATTCGGTGTTGATGACATTTACATTCTTTTAGTGCCGTATGCTTTGACTATCAGTTGCATTTGGTGTCCAATGCTCTTCATTTTTTTTTCTTCTATAGGATGAACTTCTTGAGTAACAGTTTGAGAGAAGAAGGGGGCTTTGAGTACAAAAAGGCCATCGTTGATTCCATAGTAACTCTTATCAGTGAGATACCAGATGCTAAAGAAATTGGTCTTTTGTATCTCTGTGAGTTCATTGAAGACTGTGAGTTCACCTATCTTTCCAGTCAGGTAATTACATTAGCTATTTGCTGTTGATTAAGTAACAACTGGTTAACTTCCATCCTTCCAGCTGCCTATGAATTATCAGGTAGTATTACTTGATATAGTGAAAAATGCTGATGCAATGGTAAAAAAAGAACGGGGACATAACAAACTGACGACCTTTCTATAGATAAAAAGAACTGTTGAGAATGTTCATAATCAATCTTTTCCAATTGGTAGTTCCTTGCCTAGCTCTTGTTTTTCAACATTTGAACAGAGAATCAATCCTCTCTATTTGTTAGATATTGCATCTTTTGGGAAATGAAGGACCAAGGACATCAGATCCAAGCAGATATATACGCTACATCTACAACCGTGTGATACTGGAAAATGCCACTGTCCGTGCTAGTGCTGTCAGTACATTGGCAAAGTTTGGTGCCTTAGTTGATGCCTTGAAGGTAGGATAAATCATATATCATGTGCTCTAATTTATATAGACCACTTTTGTGTATTCTTAGCTCATTTGAGATCTTGCTTTTCTTTTTCTTTTTCAGCCTAGGATCTTTGTTCTTTTGCGTCGTTGCCTGTTTGACACCGATGATGAGGTAAATAGC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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA012163