BGIOSGA012197

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA012197

Description

Transmembrane 9 superfamily protein member 1

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA012197, complete gene.

LocusTag

OS03G0236966

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA012197-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA012197-PA

Length

17892

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:7723272..7741163

Sequence Coding Region

7723272..7723637,7724505..7724639,7724726..7724799,7725153..7725192,7725371..7725416
,7725593..7725672,7725780..7725955,7726043..7726168,7726547..7726621
,7727326..7727451,7728006..7728075,7728453..7728535,7729405..7729518
,7730073..7730172,7730814..7730849,7732277..7732455,7735164..7735204
,7735289..7735874,7736232..7736627,7737162..7737371,7738993..7739226
,7740304..7740547,7740674..7740862,7740939..7741163

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:7723272..7741163 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:7723272..7741163 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGTGGGATACAAAATTCGGTTTCCCTCCAGCAGCGCCGCCCACCACCGCCGCCGCAGCGCAGAAAAATCCCAAGCGGAGGAGAGAGGCGGAGGCGGAGGCGGAGGGGGAGGTGGCGGCGGAGATGAGGGAGGAGGCGGTGGAGCGGCTGCGCGGGGTGGTGCGGGACAGCGTCGGGAAGCACCTGTACGCGTCCGCCATCTTCCTCGCCGACAAGGTGGCCGCGGCCACGGGGGACCCCGCCGACGTCTACATGCTCGCGCAGGCGCTCTTCCTGGGCCGCCACTTCCGCCGCGCGCTCCACATCCTCAACTCCTCCAAGCTCCTCCGCGACCTCCGCTTCCGCTTCCTCGCAGCCAAGTGCCTCGAGGAGTTGAAAGAATGGCATCAGTGTTTGATCATACTTGGAGATGCAAAAATAGATGAGCATGGAAACGTTGTTGATCAGGATGATGGCAGTGACATTTACTTTGATAAGGATGCTGAAGACCATGAGATCAATATCAAAGCGGCAATATGTTTTTTACGTGGCAAGGCATACGAAGCACTGGACAACTGTGACCTTGCTCGACAATGGTACAAAGCTGCAGTGAAGGCTGATCCTTTGTGCTATGAGGCCCTTGAATGCCTTGTTGATAACTACATGTTGACATGCGAGGAAGAATCTGAGCTGTTGTCCTCTCTAAAATTTGGAAAAGAAGATGGGTGGCTCTCAGCATTCTACTCTTGTTTGATAAGGAAGCATGAAAAAGAATATATAGTGGAAGCAAAGTTCAAGGAATTTGAACGAGAATCTTGTAGTATTTCATCTTTGAGTTCAGGACTGACACTGAAAAATAATATTGACGTGTTGGCTTGCAAAGCTGAATACTATCATCAGAGTGGAGAGTACCAAAAATGTTTCGAACTCACATCTGCGTTACTTGAAAGGGACCCTTTTCATTTGAAATGCACTTTAGTTCATTTGGCAGCTGCAATGGAGCTTGGCCATTCAAATGACCTTTATATTTTGGCCTGCAATCTAGTGAAGGACTATCCTCAGAAAGCTCTTTCCTGGTTTGCTGTTGGGTGTTATTACTACTGTATTAAGAAGTATGATCAAGCACGCAGATACTTTGGCAAAGCTACAGGGTTAGATGGGACATTTCCTCCTGCTTGGATTGGTACTGGTATTGCTTATGCTGCACAGGAGGAGGGTGATCAGGCAATGGCTGCATTTCGGACAGCAGCTCTGCTATTTCCTGGATGTCATCTGCCAACTTTATACATGGGCATGCAATATTTGCGAATGCACAATTTCAAACTTGCAGAGCAGTTCTTCACGCAAGCAAAATCTATCTGCCCATCTGATCCGCTTATATATAACGAGATGGGGGTTGTAGCTTATAATATGAAAGAGTATCAAAAAGCAGTTCAGTGGTTTGAGCTAACACTGGAGCATACTTCATCCTCCTTGAATGAAATGTGGGAACCAACATTGGTGAATCTTGGGCATGCATTGCGGAAACTCAAGAAATATCAAAAGGCAATATCATATTATGAAAAGGCACTCACCTTTCAAACCAAAAGTTTGAGCGCGTTTGCTGGTCTTGCTTATACTTACCACCTTATGGATAAATTTGAGGCTGCGATAACTTACTACCACAAGATACATGAGTACAAAACTGTAGTGATTCCAAAGTTTGTGCAAAATTTCCATCACGCAGAAAATCACGCCGGGGATACAATCATTCATGGAGTAAACATTAAGAATTCTTCAGCAATCATCTGGAAAGAGGCATGGCCCCTCCAAATAAGTAAAGCATTAAGCCGATGCCTTCGGAAAAGTGAGACGTATCGGTACTTTGACCTGCCTTTCTGCTCTCCAGAGAAAGTGAAGGAGAAGAGCGAGGCACTCGGTGAGGTCCTCAATGGGGACCGGTTGGTTGATGCACCTTACAAGCTTGATTTCCGTGTGGATTATGACTCCAAGCCGGTTTGCTCGAAGAAGCTCACCAAGGAGGAGGTGGCCAAGTTTCGGAATGCGGTAGCAAAGGACTACTACTTCCAGATGTACTACGATGACCTCCCACTGTGGGGATTCATTGGTAAGGTGGAGAAGGGAGGCAAGACAGATCCGAAAGAGTGGAAGTATTACCTGTACAGGCACATCATCTTTGACATCCTCTACAACAATGACCGGGTTATTGAGATCAATGTGCACACTGACCAGAGTGCACTAGTTGACCTGACTGAGGACAAGGAAGCTGATGTTCAATTCCTTTACTCAGTCAAGTGGAAGGAGACACCCACACCATTTGAGAAGAGGATGGAGAAGTATTCCAGTTCCTCCAACCTCCCACACCATTTGGAGGTCCATTGGTTCTCTATCATAAACTCTTGTGTTACAGTCCTCCTTTTGACTGGATTCTTGGCGACCATCCTCATGCGAGTACTGAAGAACGATTTTGTCAATGCAACAGCAGCTTTGCCCTTCGGCACTATCTGTGTCATTGTGCTCATCTGGACCTTGGTTACATTTCCCCTTCTAGTTTTGGGAGGCATTGCTGGTAAAAACAGCAAGACTGAATTCCAAGCTCCCTGCCGTACCACCAAATATCCTAGGGAGATTCCTCCACTTCCGTGGTACCGGCAAACAATCCCGCAGATGGCTATGGCTGGGTTTTTACCTTTCAGTGCCATCTATATTGAGCTCTACTACATCTTTGCTAGTGTTTGGGGCCACAGGATTTACACAATTTACAGCATTCTCTTCATAGTCTTCATCATCCTCCTTATTGTTACTGCCTTCATTACTGTTGCACTGACGTACTTTCAGCTTGCTGCTGAAGACCATGAATGGTGGTGGAGGTCATTCCTATGTGGAGGATCAACTGGATTTTTTGTCTATGGGTATTGTCTGTACTACTATTATGCACGATCAGATATGTCTGGATTTATGCAGACATCATTCTTCTTCGGCTACATGGCTTGCATCTGCTATGCTTTCTTCCTGATGCTGGGCATGATCGGTTTCCGTGCCGCATTGTTCTTTGTCCGTCACATATACAAATCCATCAAGGGCCGAGGCCGGAGCCCATCCGGCGCGCCCGTGCTCAAGGCCATCGAGGCCGGGTACCGCCACTTCGACACCGCGGTGCACTACGAGACCGAGGCGCCCATCGGCGAGGCCGCCGCCGAGGCCGTGCGGTCCGGCGCCATCGCCTCCCGCGCCGACCTCTTCATCACGTCCAAGCTCTGGTGCAGCGACGCGCACCGCGACAGGGTGCTCCCCGCGCTCAGGCAGACGCTACGGAACCTTCAGATGGAGTACGTGGACTTGTACCTGGTGCACTGGCCTGTGTCCATGAAGCCGGGCCGGTACAAGGCCCCCTTCACCGCCGACGACTTCGTGCCGTTCGACATGCGGGCCGTCTGGGAGGCCATGGAGGAGTGCCACCGCCTGGGCCTCGCCAAGGCCATCGGCGTCTGCAACTTCTCCTGCAAAAAGCTCGACACCCTGCTCTCCTTCGCCACCATCCCTCCCGCCGTCAACCAGGTTGAGGTGAACCCGGTGTGGCAGCAGAGGAAGCTGAGGGAGCTGTGCAGGGAGAAGGGCGTCCAGATCTGCGCCTACTCGCCGCTGGGCGCCAGCGGCACGCACTGGGGCAGCGACTCCGTCATGGCCTCCGCCGTGCTCCGCGACATCGCCCAATCCAAGGGCAAGACCGTAGCCCAGGCACGTCACGTGTGCCTGAGGTGGGTGTACGAGCAAGGGGACTGTCTGATCGTGAAGAGCTTCGACGAGGCGCGGATGCGGGAGAACCTGGACATCGTCGGATGGGAGCTGACGGAGGAGGAGAGGCAGAGGATCGCCGGCATCCCGCAGCGGAAGATCAACCGTGCCCTCCGCTTCGTCTCCGACCACGGGCCCTACAAGTCGCTCGACGACCTCTGGGACGGCGAGATATGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MWDTKFGFPPAAPPTTAAAAQKNPKRRREAEAEAEGEVAAEMREEAVERLRGVVRDSVGKHLYASAIFLADKVAAATGDPADVYMLAQALFLGRHFRRALHILNSSKLLRDLRFRFLAAKCLEELKEWHQCLIILGDAKIDEHGNVVDQDDGSDIYFDKDAEDHEINIKAAICFLRGKAYEALDNCDLARQWYKAAVKADPLCYEALECLVDNYMLTCEEESELLSSLKFGKEDGWLSAFYSCLIRKHEKEYIVEAKFKEFERESCSISSLSSGLTLKNNIDVLACKAEYYHQSGEYQKCFELTSALLERDPFHLKCTLVHLAAAMELGHSNDLYILACNLVKDYPQKALSWFAVGCYYYCIKKYDQARRYFGKATGLDGTFPPAWIGTGIAYAAQEEGDQAMAAFRTAALLFPGCHLPTLYMGMQYLRMHNFKLAEQFFTQAKSICPSDPLIYNEMGVVAYNMKEYQKAVQWFELTLEHTSSSLNEMWEPTLVNLGHALRKLKKYQKAISYYEKALTFQTKSLSAFAGLAYTYHLMDKFEAAITYYHKIHEYKTVVIPKFVQNFHHAENHAGDTIIHGVNIKNSSAIIWKEAWPLQISKALSRCLRKSETYRYFDLPFCSPEKVKEKSEALGEVLNGDRLVDAPYKLDFRVDYDSKPVCSKKLTKEEVAKFRNAVAKDYYFQMYYDDLPLWGFIGKVEKGGKTDPKEWKYYLYRHIIFDILYNNDRVIEINVHTDQSALVDLTEDKEADVQFLYSVKWKETPTPFEKRMEKYSSSSNLPHHLEVHWFSIINSCVTVLLLTGFLATILMRVLKNDFVNATAALPFGTICVIVLIWTLVTFPLLVLGGIAGKNSKTEFQAPCRTTKYPREIPPLPWYRQTIPQMAMAGFLPFSAIYIELYYIFASVWGHRIYTIYSILFIVFIILLIVTAFITVALTYFQLAAEDHEWWWRSFLCGGSTGFFVYGYCLYYYYARSDMSGFMQTSFFFGYMACICYAFFLMLGMIGFRAALFFVRHIYKSIKGRGRSPSGAPVLKAIEAGYRHFDTAVHYETEAPIGEAAAEAVRSGAIASRADLFITSKLWCSDAHRDRVLPALRQTLRNLQMEYVDLYLVHWPVSMKPGRYKAPFTADDFVPFDMRAVWEAMEECHRLGLAKAIGVCNFSCKKLDTLLSFATIPPAVNQVEVNPVWQQRKLRELCREKGVQICAYSPLGASGTHWGSDSVMASAVLRDIAQSKGKTVAQARHVCLRWVYEQGDCLIVKSFDEARMRENLDIVGWELTEEERQRIAGIPQRKINRALRFVSDHGPYKSLDDLWDGEI</aaseq>

Gene Sequence

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