BGIOSGA012286

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA012286

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA012286, complete gene.

LocusTag

OsI_10868

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA012286-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA012286-PA

Length

9231

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:9292443..9301673

Sequence Coding Region

9292443..9292445,9292786..9293014,9293435..9293538,9293678..9293740,9294001..9294101
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,9299645..9299870,9300012..9300089,9300495..9300638,9300947..9301126
,9301453..9301512,9301602..9301673

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:9292443..9301673 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:9292443..9301673 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGCTTCATCAGCAATGCGAGGATAGAAATGTTCTGCGCTATGTATACTATTATCTGGCTCGCATATTGTCAGATAATGGTGCCCAAGGTTTAAGCGCTGCTGGTGGCATACCTACCCCAAATTGGGATGCTCTTGCAGACATTGATGCTGTTGGTGGAGTGACACGAGCAGATGTTGTACCAAGAATAGTTGATCAGCTCTCAGCTGAATCAACCAGCGATGATGTTGAGTTTCATGCTAGGAGACTTGCTGCTCTGAAGGCCCTTACCTCCTCCACAAGCAATTCTGAGATGTTGGAAAAACTCTATGAAATTGTGTTTGGCATTTTGGAGAAGGTGGCTGATACTAAACAGAAACGAAAGAAAGGTATATTTACTAAGCAAGGTGGTGATAAGGAGTCTATTATACGGAGTAATTTGCAGTATGCTTCTCTAAGTGCCCTGAGAAGGCTTCCACTTGATCCTGGTAATCCGGCATTTCTGCACCGAGCTGTCCAAGGGGTTGAATTTTCTGACCCAGTTGCAGTAAGACATGCGTTGTCAATAGCCTCTGAAATTGCCGTGAGAGATCCGTACTCTGTCGCAATGGCACTGGGCAAGAACGCACAGCCTGGTGGAGCTCTTCAGGATATCCTTCATTTGCATGATGTTCTTGCCAGAGTTTACCTTGCAAAGCTGTGCCATTCAATTTCTAGGGCACGTGTATTGGATGAGAGACCTGACATAAAGTCCCAGTACAGTTCTCTCCTTTACCAACTTCTTCTGGACCCAAGTGACAGGGTCTGTTTTGAGGCCATACTCTGTGTGTTGGGAAAAGTTGACAACACAGAAAGCACGGAGGAGAGAGCTGGTGGATGGATTAGGTTAACAAGAGAAATTCTTAAATTGCCTGAGGCCCCTTCTGTAGCATCAAAGGGTATTCTGTCAAAATCTGAAAAATCTTCTAAAGCAAGGCGTCCTCAGCCCCTCATTAAACTTGTAATGAGAAGACTGGAGAGCTCTTTTCGTAGCTTCTCTCGTCCTGTTCTTCATGCTGCTGCAAGAGTAGTCCAGGAAATGGGGAAGAGTAGGGCCGCTGCTTATTCTTTAGGCGCTTATGACGAGGCTGCCAATCTTCAATCTTATTCTGATAATGTCGAGTCTCTTGATTCTGATCTTAATGAGAACTCACAACCTGAAGCTACTCGAAAGGCTAACCCACTATCAAATGGACATGGTGGAATGGACACAATAGCAGGCTTATTAGCATCACTGATGGAAGTAGTGCGGACAACTGTAGCATGCGAGTGTGTATATGTTCGAGCAATGGTCATCAAAGCTTTGATATGGATGCAAAATCCTCATGAGTCTTTTGAAGAATTAAAATCTATTATTGCATGTGAGCTGGCTGATCCGGCCTGGCCTTCTTCTCTCCTGAATGATGTCCTATTAACTCTACATGCTAGGTTCAAGGCAACTCCTGATATGGCCGTGACTCTGCTTGAGATTGCTAGAATTTTTGCTACCAAAGTTCCTGGCAAGATCGATGCTGATGTACTACAACTCCTGTGGAAGACATGCCTTGTTGGAGCAGGACCAGATGGAAAACATACAGCTTTGGAAGCTGTGACAATAGTCCTTGATCTACCACCACCTCAGCCTGGTTCAATGTCTGGATTTGCATCTGTCGATATGGTATCTGCCTCCGATCCAAAATCAGCTATGGCACTGCAAAGATTAGTTCAAGCTGCGGTTTGGTTTCTAGGTGAAAATGCAAATTATGCTGCTTCTGAATATGCCTGGGAGTCTGCAACACCTCCTGGTACTGCACTAATGATGCTTGATGCTGATAAAATGGTTGCTGCAGCTAGCTCTCGCAATCCTACGCTTGCTAGTGCTTTGACACGTCTGCAAAGGTGTGCATTCAGCGGTAGCTGGGAGATCCGTATTGCTGCTGTCCAAGCCCTAACCACCATTGCAATAAGGTCTGGTGAACCTTACAGACTGCAGATATATGAGTTTCTTCATGCTTTAGCTCTAGGGGGTGTACAATCAAACTTTTCAGAATTGCAGCTAAGTAATGGGGAAAACCAAGGTGCTAGTGGTACTGGTCTTGGATCATTGATAAGCCCAATGCTCAAGGTCCTGGATGAAATGTATAGAGCTCAAGATGATCTCGCTAGGGATATCCGTCAGCATGATAATAGTAAGCAAGAATGGAATGATGATGAACTTAAGAAACTTTATGAGACCCACGAGAGGCTTCTTGATTTCGTCTCTTTGTTCTGTTTTGTTCCAAGGGCCAAGTACTTGCCTTTAGGTCCTACCAGTGCGAAACTCATTGACATCTACCGCAACCGGCATAACATTAGTACTTCTGCTGGTCTAAGTGATCCTGCTGTTGCTACTGGCATATCTGATCTCATGTATGAGCCCAAAGATGTGCCCAAAGAGGCCACTCTTATACAGACTGGAATTGACCCTGATCTGGCTATGGCCTGGGCAGCAGGTTTGGAAGATGATGTTTGGGAAAACAACGCACCAGCTGTGGATAAAGTAAAGGATTTCCTTGCTGGTGCTGGAACTGATGCTCCTGATGTGGATGATGAGGAATACATGAATTCTAGGCCATCAGATGATGATGGAAGATCATCTGGGGGATCCTCTCCTGAGTCAACTGGTTCTGTAGAAACATCCATATCGTCCCATTTTGGTGGCATGAACTATCCGTCGTTGTTCAGTTCAAAACCATCAGGATATGGGGCTTCACAACAAACGATACGTGAAGAACCACCATCATATTCAACATCAGTTCTACAGAAACGTGAGTCATTCGAAAACCCCCTTGCTGGGCGTGGTGGTCGGAGTTTTGGATCCCATGAGGACGAAGACAGGAGTTCAGGGAACCCTCAATCTGGGAAAGCACTGTATGACTTCACAGCAGGTGGCGATGATGAGTTGAGTTTAACTGCTGGAGAAGATGTGGAAATCGAATATGAGGTCGATGGTTGGTACTATGTAAAGAAGAAGAGACCCGGAAGGGATGGAAAGACAGCAGGTCTGGTCCCTGTTCTGTATGTGAATTCGTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MLHQQCEDRNVLRYVYYYLARILSDNGAQGLSAAGGIPTPNWDALADIDAVGGVTRADVVPRIVDQLSAESTSDDVEFHARRLAALKALTSSTSNSEMLEKLYEIVFGILEKVADTKQKRKKGIFTKQGGDKESIIRSNLQYASLSALRRLPLDPGNPAFLHRAVQGVEFSDPVAVRHALSIASEIAVRDPYSVAMALGKNAQPGGALQDILHLHDVLARVYLAKLCHSISRARVLDERPDIKSQYSSLLYQLLLDPSDRVCFEAILCVLGKVDNTESTEERAGGWIRLTREILKLPEAPSVASKGILSKSEKSSKARRPQPLIKLVMRRLESSFRSFSRPVLHAAARVVQEMGKSRAAAYSLGAYDEAANLQSYSDNVESLDSDLNENSQPEATRKANPLSNGHGGMDTIAGLLASLMEVVRTTVACECVYVRAMVIKALIWMQNPHESFEELKSIIACELADPAWPSSLLNDVLLTLHARFKATPDMAVTLLEIARIFATKVPGKIDADVLQLLWKTCLVGAGPDGKHTALEAVTIVLDLPPPQPGSMSGFASVDMVSASDPKSAMALQRLVQAAVWFLGENANYAASEYAWESATPPGTALMMLDADKMVAAASSRNPTLASALTRLQRCAFSGSWEIRIAAVQALTTIAIRSGEPYRLQIYEFLHALALGGVQSNFSELQLSNGENQGASGTGLGSLISPMLKVLDEMYRAQDDLARDIRQHDNSKQEWNDDELKKLYETHERLLDFVSLFCFVPRAKYLPLGPTSAKLIDIYRNRHNISTSAGLSDPAVATGISDLMYEPKDVPKEATLIQTGIDPDLAMAWAAGLEDDVWENNAPAVDKVKDFLAGAGTDAPDVDDEEYMNSRPSDDDGRSSGGSSPESTGSVETSISSHFGGMNYPSLFSSKPSGYGASQQTIREEPPSYSTSVLQKRESFENPLAGRGGRSFGSHEDEDRSSGNPQSGKALYDFTAGGDDELSLTAGEDVEIEYEVDGWYYVKKKRPGRDGKTAGLVPVLYVNS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..3#344..572#993..1096#1236..1298#1559..1659#2673..2767#3007..3027#3664..3759#3865..3985#4092..4247#4356..4546#4884..5155#5530..5631#5809..5985#6074..6262#6344..6585#6660..6806#7203..7428#7570..7647#8053..8196#8505..8684#9011..9070#9160..9231#ATGGTAAGTATGCCTTCCTCTACTGTTTTAGCTCTTTTTATGGCTTCATCTTTCACGTAGACAGCGTAATTACTTGGTAAAAGCAGTAACTAGGGTAATTCTCAGAAAATTCGACTATGTTAGCACCACAATGCATTGTCACTATGGTTTGAGTCTCTGAGGAGATCAATGACAACCTTTTCATGTTTAAAACAGAGGAAAAAAAGTACGAGTACTTAAATATGTGTTGCAACTTGGAACTGAAACTGCACACATCGCATAATTCACTGTTAGATTAACCTAACGAGATCTTGTTTACTTCAGTTAACTTTTCTCTTAATCGAATCTGGTTCTGTATTTACAGCTTCATCAGCAATGCGAGGATAGAAATGTTCTGCGCTATGTATACTATTATCTGGCTCGCATATTGTCAGATAATGGTGCCCAAGGTTTAAGCGCTGCTGGTGGCATACCTACCCCAAATTGGGATGCTCTTGCAGACATTGATGCTGTTGGTGGAGTGACACGAGCAGATGTTGTACCAAGAATAGTTGATCAGCTCTCAGCTGAATCAACCAGCGATGATGTTGAGTGTATGCTTTTATACTGTGCTCTCAATATACGTTGAAGCTATATTATGCAAAACTTGTATTCCAAACCAACCTCTTGTCACTGTTTTACATTTTTTTCTCATTGGTACTGCTCCCCTTTTGCACTGATCACACCTCATGATTAGTTCTACCATATTCTAAGCATGCTATCTCATTTTGGTGAAATAAGTATTATGTTATTTTCTTCTGTTTTGCATCTTAGTGAGAATTATATTTCTAGTAAACATCTAATTCTGCATAAATGATACCATATGACCAAATAAGAATGATCACAATATTATTATGCATGGCTGAGCTAAAACAAGATGCTCTTTAATTTCTTGAACCAAGCATGCTTAATTCTTATTAAGTTGCATTGGGTGGTTCTTCATAGTGCTAAACTATGGATTCTGGTCTTTGAAGTTCATGCTAGGAGACTTGCTGCTCTGAAGGCCCTTACCTCCTCCACAAGCAATTCTGAGATGTTGGAAAAACTCTATGAAATTGTGTTTGGCATTTTGGAGAAGGTTGATAATTGATATGCTTTTCATATTCAGATTAGTTCCTCAAAGTTTTATTGCCCTAAGTTCCTTTTTGGTATCCCTTGTTTTTGGCTATAAAATTGACGCTTTTCTTCTGTCCATGATGTATTCTGAATCCTTTCAGGTGGCTGATACTAAACAGAAACGAAAGAAAGGTATATTTACTAAGCAAGGTGGTGATAAGGAGGTACTAAACAGAACGAAAGTACTATTTATTGTATATGCACTTAATCCTTTTCTTAGAGGTTTCTTATCTCATACCTTGCTGATAATGGGAGTTAAGAATACACTTATTGGAACATTGTAGTTAACCTGGTAGTTTTTTCTTGACTAGATAACAAAGTAGGTGACACCACTTCCTGTTTATTTTGAGCTGGACTTAAAATTCCTCACTAGTATCAGTACAAGCTGTCTGATGATGCCTTTCTAATTTGCATTTCTTTGCAGTCTATTATACGGAGTAATTTGCAGTATGCTTCTCTAAGTGCCCTGAGAAGGCTTCCACTTGATCCTGGTAATCCGGCATTTCTGCACCGAGCTGTCCAAGGGTGAGTGTGACCTTTTTTCCTCTGGAAACTTAAGTTTAGGTTTATTTTCCATGTCTGTTTAGTTTACCAGTTATCTACTACCTCCATTTCATATTATATGATGTTTTGGATTTGTCCTAAGTCAAATTTCTTAGATTTCGACCAACTTTATAGAAAAAAAAAATCAACATCTGGAACACCAAATTAGTTCATCATATCCACCATTAAATATATTTTAAAGTACATTTGCTTTGTGTTGAAAATGTTGCTATGTTTTTCTATAGACTTGGTCAAACTTAAAGAAGTTTGACTTAAGGCAAACCCAAAACGACTTATAATGTGGAACAGGTCGAATAGGTTATTGCTTCTTTTGAGGATAAATGGGGGCATGAGTATTGTTTTGTGGTATCTTTTATTTGATTATACAATAATAGTTTTTCTTATTGGGAGCCTAGTCTAAACTAAAAGATTAGATCATTGTGATGACATTGCTAATAGTACGGCGAAGGAGGATTCTTCAGGGTGTGCTTAATGGAGAATGAATATTCGACATCTGTTGGTTTGTTAATATAACCTATCTTGAGAGATCTAGAAAGGATGCTATTCTCGTGTCTACCTTAAACTGCAATACCGCATTAGTGTTTTTTAGACGGATATAAGATTGTGAGAGCCGATGCTCTCTTTAGGCCTTAATATGGATGGATATCCAGTGTTCAAGCAGGTAAGTGTAAAGACGGAGTTATCAAATGGTAAACTTCATCGAAAAGAATTTCTCCCTACAAAGATTACAAACAACTCCTTAAGCTACATATTTGTATTGAAGTATTCTTTAAGCAAATTGATCATTTCATTGTGTTGTCTGAACATAATTATCAAATGGACACCTAAGTTTTTGTCTATCTATTTTTATGACCACTTGATTCTGCTTCTGCAACAAAATTACAGAGGGGTATAGCCTAATCAAAAAGTATCATCAAGGAACCTGCTGTTGCATAATTATCATTTTATTCTCATCAGACCTGGTACAATTGCAGGGTTGAATTTTCTGACCCAGTTGCAGTAAGACATGCGTTGTCAATAGCCTCTGAAATTGCCGTGAGAGATCCGTACTCTGTCGCAATGGCACTGGGTCAGTTTACTCACTGATTGTTGTTCATCTTATTTATTGTTCTTGCAAGCAGACAAAACATGGGCCATTAACTCGTGGTGTAGAACATACTTGATCTTTTATGTGCAAGGAATTGTATAGAATTTCGACTATAAATTTTTTAAAAACTGTCAGCTGTGATATATTTAGTCAATATGCAGTAAATTTGGCTCATGCCATTTCGTAGATTCTCATTCTCATGTTTGTTTTTTGTTTTGCAGGCAAGAACGCACAGCCTGGTGGTAATGTTTTTTCCCCTTTCTTCTGTGTTTCATTTGAACTTAACTTGATTATGCATCTGATTTGTGTTTTAGAGTTCTAGTTGAACCGACCGAGTTTGTAGAATTAGGATTTCTAATGATATGGGCTGTATTCTGCGAAGAATCACGTGTTAAATCGCATTCATATATTGTTGTTTGATTTATATTTACTTGTTGATGCACTGGCATGAAATGTAAAATATAAGCAATAATCTGGGGAAAAGGCAGTACCTTTCTGTCAGTTGCTAATGTAATACGTGCTCAATGACAACAAGAAATGCCGTACATGTATTCTTTGATCACCATATTTAGTTCAATGGTATTTGAGACCTGGGTGACTTAATAGCGCAACCTTTTGTTTATTGAGTATTTTAGTGTATGATATATGGATTTTGAGAGGCATGAATCAACTAATGGTACGGTAATTGCATATAAATAGCTTCGGACACCATCTGATTGTTGTGACTGATCTTGCTGTTGATTGTTTTGAATTCCACAAAAAAGGAATTTACCTGCTTGTATATCTGATTGCTTACAAGGTGTTTCTTTTTTCTCTTTGAGTTTGTTCTACTTTGATGTACTCATTTCCTATTATTACGCTGTGTCAAATTTAACCAGGAGCTCTTCAGGATATCCTTCATTTGCATGATGTTCTTGCCAGAGTTTACCTTGCAAAGCTGTGCCATTCAATTTCTAGGGCACGTGTATTGGATGGTGAGTGTAATTTGTTTTTGTGCCTGTCTTAAATCAAGATGAACATGTCATGATTCCAGAGTGAATGCATTTAATCGTGGTTCTGGTCAAATTTGATTTACGCAGAGAGACCTGACATAAAGTCCCAGTACAGTTCTCTCCTTTACCAACTTCTTCTGGACCCAAGTGACAGGGTCTGTTTTGAGGCCATACTCTGTGTGTTGGGAAAAGTTGACAACACAGAAAGGTACTGATGAGGTTTCACCAATTTAAATTTCTATATAACTTTGTTTCTTCACTTCAGTTCGACTTGTACGTCTGTGTTTTTCCATATAAATTACTATATCTTGCAGCACGGAGGAGAGAGCTGGTGGATGGATTAGGTTAACAAGAGAAATTCTTAAATTGCCTGAGGCCCCTTCTGTAGCATCAAAGGGTATTCTGTCAAAATCTGAAAAATCTTCTAAAGCAAGGCGTCCTCAGCCCCTCATTAAACTTGTAATGAGAAGGTTTGTATCTTCATTCAAATGTTCAAATAGTCGGTCTCTCTATTTTGATTTCCCTGTATGTTTTCTCTTGTTCATGGATACCTATTGTTCATTTTTCTCTTCTGTCAGACTGGAGAGCTCTTTTCGTAGCTTCTCTCGTCCTGTTCTTCATGCTGCTGCAAGAGTAGTCCAGGAAATGGGGAAGAGTAGGGCCGCTGCTTATTCTTTAGGCGCTTATGACGAGGCTGCCAATCTTCAATCTTATTCTGATAATGTCGAGTCTCTTGATTCTGATCTTAATGAGAACTCACAACCTGAAGGTACCATGATATTATTGTAGTTTTAATTATTCAATTATAAATCAGCGTGAATCATATGCAACGTAAATTTTAATTTTATTTAAAGTAATGGAAGATGGTTCCTTCAAAGCATTCCTTATTGGGTTGGCTGGAAAACTAGGAAATTAGCAGCCTATAGATGTAAATACATCTCTTTTAGAATTAGGCTGGGGAATGC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