BGIOSGA012465
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA012465 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA012465, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_11240 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA012465-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA012465-PA |
| Length |
6701 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:12045116..12051816 |
| Sequence Coding Region |
12045116..12045239,12045287..12045367,12045769..12045985,12046108..12046218,12046683..12047186 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:12045116..12051816 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:12045116..12051816 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCCTCCTCCGCGGCGTCAAGGCTGTCCCACATCGTCGCCGCCGCCGGTGGTGCGGCCGGGGAGTCCAGCGAGCCGCCGGCGGCGGCGGCTGCAGCGTCCGGTCTTGCCCAAGAGGACGATGTGAGTGGAATCGCGGGGAGGCTGTGGGTTGAGCGGATTTTGAGTGGTTTTGATGGAGACGAGATTGGAGCACTAGTCTTTGACCTTTCATCAGCGATGATGGGCTACCGCCTTCCTCCAAAAGAAATACAAGACATCGTTGATGCACCACCGCTACCCGTGCTATCATTCTCGCCAAGCAAGGACAAGATTTTATTCCTGAAGCGCCGAGCACTGCCACCATTGTCGGATCTCGCAAAGCCTGAAGAGAAACTTGCTGGTGTGAGAATTGATGGCTATTCTAATACTAGAAGCAGAATGTCTTTCTACACTGGAATAGGTATCCATAAGCTGATGGATGATGGGACTTTGGGTCCAGAGAAAGTGGTCCATGGATATCCTGAAGGCGCAAGGATTAATTTTGTCACCTGCTTTGTATGGGTTAACAATTCTACTTTGCTTGTCTGCACTATCCCTCTGTCACGTGGAGCTCCACCGCAGAAGCCCTCAGTTCCATCTGGTCCGAAAATTCAGTCCAATGAGACATCAAATGTGGTCCAAGTGAGAACTTTCCAGGATCTTTTGAAAGATGAATATGATGCCGATCTGTTTGATTATTATGCGACCTCGCAGCTTGTATTGGCCTCTTTTGATGGAACAGTAAAGCCAATTGGCCCTCCTGCTGTATATACATCTATTGACCCATCACCAGATGACAAATACTTAATGATTTCTTCTATTCACCGTCCATATTCCTATATTGTACCTTGTGGAAGGTTTCCGAAGAAAGTTGAATTATGGACTGTAGATGGAGAATTCATTAGGGAACTTTGTGATTTGCCCCTTGCTGAGGACATTCCAATAGCAACAAGCAGTGTCCGCAAGGGAAAGCGTTCAATCTACTGGAGGCCAGATAAACCTGCGATGCTGTACTGGGTGGAGACACAGGATGGTGGAGATGCAAAAGTAGAGGTGTCACCTCGTGACATAGTTTACATGGAAAATGCTGAGCCTATAAATGGTGAACAACCAGAGATTCTGCATAAACTTGACCTCCGATATGCAGGGACCTCTTGGTGTGATGAATCTCTTGCATTAGTGTATGAATCTTGGTACAAAACACGGAAAACAAGAACATGGGTTATCTCCCCAGATAAAAAAGATGTTAGTCCACGCATCTTATTCGATAGATCTTCTGAAGATGTATATTCTGATCCTGGCTCACCAATGCTACGAAGAACTGCCATGGGGACATATGTTATTGCAAAAGTTAAGAAGCAAGATGAAAATACCTACATCTTGCTGAATGGGATGGGTGCCACACCAGAAGGGAATGTTCCGTTCCTTGATTTGTTTGATATAAATACTGGAAGTAAAGAGAGGATATGGCAAAGTGACAAGGAAAAGTACTATGAAACTGTTGTTGCACTTATGTCGGACAAAACTGATGGGGAACTGCCACTTGAGAAGTTAAAGATACTTACATCAAAAGAATCAAAAACAGAAAACACACAGTATTACCTGCAAATTTGGCCAGAAAAGAAGCAAGTTCAGATCACAGATTTTCCCCATCCATATCCTCAGCTTGCTTCATTGTATAAGGAGATGATAAGATACCAACGGAAGGATGGGGTTCAACTAACAGCTACATTGTACCTGCCCCCAGGCTATGATCCTTCACAGGATGGACCTTTGCCATGTTTAGTTTGGTCCTACCCTGGTGAGTTTAAAAGCAAGGATGCTGCTGGACAAGTGCGTGGCTCACCTAATGAGTTTCCAGGGATTGGTGCTACATCCCCACTGCTTTGGTTGGCTAGAGGGTTTGCTATTTTATCAGGTCCAACCATCCCGATTATTGGAGAAGGCGATGAAGAGGCCAATGACAGGTACGTGGAGCAGCTAGTAACTAGTGCTGAGGCTGCAGTTGAGGAAGTTGTTAGGAGAGGGGTGGCTCACCCTGATAAAATTGCTGTTGGTGGTCATTCATATGGTGCATTCATGACTGCAAACCTTTTAGCTCATGCTCCTCACCTTTTCTGCTGTGGGATTGCTCGTTCTGGAGCTTACAACAGGACACTGACACCATTTGGGTTTCAGAATGAGGACAGAACTCTATGGGAGGCGACTAACACCTATGTCGAGATGAGCCCTTTCATGTCGGCCAACAAGATCAAGAAACCAATTTTGCTTATTCATGGAGAGCAGGACAACAACTCTGGAACACTTACGATGCAGTCAGACCGATTCTTCAATGCCTTGAAAGGCCATGGCGCACTATCTCGTTTGGTGATACTCCCTTTTGAAAGCCATGGGTATTCTGCGAGGGAGAGCATCATGCATGTTCTGTGGGAGACTGATAGATGGCTGCAGAAGTACTGCTTAAGCGGTAGTAGTAAAACCGATTCAGATTCAGTAGCTGACACCGAAAACAAGACAGTGTCCGCTAGTGGTGGTGGAGCACCATGTGAAGGTCCTGAGGCCGAGGGGTTCTCATCAATGCAAAGATCGCTTCTGTGGATAGCTATTGAAGATGGGAAAATGAGTTTTCACGATATAAGTTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSSSAASRLSHIVAAAGGAAGESSEPPAAAAAASGLAQEDDVSGIAGRLWVERILSGFDGDEIGALVFDLSSAMMGYRLPPKEIQDIVDAPPLPVLSFSPSKDKILFLKRRALPPLSDLAKPEEKLAGVRIDGYSNTRSRMSFYTGIGIHKLMDDGTLGPEKVVHGYPEGARINFVTCFVWVNNSTLLVCTIPLSRGAPPQKPSVPSGPKIQSNETSNVVQVRTFQDLLKDEYDADLFDYYATSQLVLASFDGTVKPIGPPAVYTSIDPSPDDKYLMISSIHRPYSYIVPCGRFPKKVELWTVDGEFIRELCDLPLAEDIPIATSSVRKGKRSIYWRPDKPAMLYWVETQDGGDAKVEVSPRDIVYMENAEPINGEQPEILHKLDLRYAGTSWCDESLALVYESWYKTRKTRTWVISPDKKDVSPRILFDRSSEDVYSDPGSPMLRRTAMGTYVIAKVKKQDENTYILLNGMGATPEGNVPFLDLFDINTGSKERIWQSDKEKYYETVVALMSDKTDGELPLEKLKILTSKESKTENTQYYLQIWPEKKQVQITDFPHPYPQLASLYKEMIRYQRKDGVQLTATLYLPPGYDPSQDGPLPCLVWSYPGEFKSKDAAGQVRGSPNEFPGIGATSPLLWLARGFAILSGPTIPIIGEGDEEANDRYVEQLVTSAEAAVEEVVRRGVAHPDKIAVGGHSYGAFMTANLLAHAPHLFCCGIARSGAYNRTLTPFGFQNEDRTLWEATNTYVEMSPFMSANKIKKPILLIHGEQDNNSGTLTMQSDRFFNALKGHGALSRLVILPFESHGYSARESIMHVLWETDRWLQKYCLSGSSKTDSDSVADTENKTVSASGGGAPCEGPEAEGFSSMQRSLLWIAIEDGKMSFHDIS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..124#172..252#654..870#993..1103#1568..2071#3117..3245#3585..3881#3973..4431#4602..4667#4775..4835#5080..5229#5310..5447#6176..6456#6656..6701#ATGTCCTCCTCCGCGGCGTCAAGGCTGTCCCACATCGTCGCCGCCGCCGGTGGTGCGGCCGGGGAGTCCAGCGAGCCGCCGGCGGCGGCGGCTGCAGCGTCCGGTCTTGCCCAAGAGGACGATGGTTCGTGCTGACTTCGTTGATTGCGTGATCTTTTTTTGCTTTTGTAGTGAGTGGAATCGCGGGGAGGCTGTGGGTTGAGCGGATTTTGAGTGGTTTTGATGGAGACGAGATTGGAGCACTAGTCTTTGGTTAGGGGATCGGTTCGTGAAGAGATCGTGGATTTTTTTAGTGGTGATTTTGAGTGCTTCAAATTTGTTTAGGTTTTGTTCGTGGTATGAGTTTAACGCTAGATAGATTGGTGAAGGCCATAGCGCTTAGCTTCTCATGTTTCAAAAAGATCAAAAGAAGTTGATTGGCATCTTATTTTTTTAGGTTTGACAGACCTGTTAGAGCTGCATATAGGTTAGTTTGTCTTGCTTGGCTTGTTCAATGATAGATTGTCTTAGTTGACATAGTTAACGTATATGCCTGGTGAACATCTATTTTAATTTCTGTATGAGCAGATTCTGTCCTGGCTTTTTTGTCAACGAGAAAAGATAATGTAGACCAGTGGTACAGCCAACAATTGATGCATTTAATTGCTCTGCAGACCTTTCATCAGCGATGATGGGCTACCGCCTTCCTCCAAAAGAAATACAAGACATCGTTGATGCACCACCGCTACCCGTGCTATCATTCTCGCCAAGCAAGGACAAGATTTTATTCCTGAAGCGCCGAGCACTGCCACCATTGTCGGATCTCGCAAAGCCTGAAGAGAAACTTGCTGGTGTGAGAATTGATGGCTATTCTAATACTAGAAGCAGAATGTAAGTATAATAAATAATTTGGGTAAATTTTCATTGTCTAACTAATCGTTTTTATCTGTGACAAGTTTAGTACTATGTCCAAGACATGTTATGATTGGAAATCTGATATACATAATTTGTAGGTCTTTCTACACTGGAATAGGTATCCATAAGCTGATGGATGATGGGACTTTGGGTCCAGAGAAAGTGGTCCATGGATATCCTGAAGGCGCAAGGATTAATTTTGTCACCTGGTAATTTTCTGGACCTTCCATCAAGGAACTTCAAGGATTTTTTTTTCTGGTTCTTAATTGCCTTGCTTCCAGTTTTAGCTGTTTCAGAAATGATTTTTACTTGTATTATGGATTACTTTATTCCTAACTCTATGCACTGAACCATTTGACCTAGGTCACAAGACGGACGCCATTTATCATTCAGCGTTAGAGTTGATGAGGTAATTGGTTGGCTGCCTTTGAAAAATGGATGTGATTTGTTCAAATGATTAGATATAATGAACTCTAGTGTGGATTCAATTAGGAGGACAACACAAGCGGCAAGCTACGTTTGTGGATTGCAGATGTGGAATCTGGAGAAGCCAGACACTTTTTAAATCTCCTGAGATATACTCTAATGCTATTTTTGACAGGTGAAATTGAATATCAATTTCTGCTGTTTTCTCCTGTCCTACTTCTAAAGAACTTTTGTTTTGCTGTTGCAGCTTTGTATGGGTTAACAATTCTACTTTGCTTGTCTGCACTATCCCTCTGTCACGTGGAGCTCCACCGCAGAAGCCCTCAGTTCCATCTGGTCCGAAAATTCAGTCCAATGAGACATCAAATGTGGTCCAAGTGAGAACTTTCCAGGATCTTTTGAAAGATGAATATGATGCCGATCTGTTTGATTATTATGCGACCTCGCAGCTTGTATTGGCCTCTTTTGATGGAACAGTAAAGCCAATTGGCCCTCCTGCTGTATATACATCTATTGACCCATCACCAGATGACAAATACTTAATGATTTCTTCTATTCACCGTCCATATTCCTATATTGTACCTTGTGGAAGGTTTCCGAAGAAAGTTGAATTATGGACTGTAGATGGAGAATTCATTAGGGAACTTTGTGATTTGCCCCTTGCTGAGGACATTCCAATAGCAACAAGCAGTGTCCGCAAGGGAAAGCGTTCAATCTACTGGAGGCCAGATAAACCTGCGATGCTGTACTGGTATGTAGAACAGAATTTCAATCATCAGTTTTTTTAAGTGCAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTGACAGACAATATTTTCAGTTCAGGCTAGCTACTAATTTATGTATGCATGAAATCCACATCTGAAAACAAATTTAACACAGACCACACCATTAATTCACATCTGAAAAAATAACATTCATCAGACAATTTAATTCCCATATGCCAAAAAGTAGCTTTCATGTCTCAGACATCCTAAATTGTGTATTATGTGGTTGTTTCAAACTTAAACCGTTCTATTTGTGTTTGTACAAGTGATAGTAGCGTTCAATTGAATTAAGTAATAATAAGCGAAGGAGTAGATACATATCAAAATAGGAGCAGATCTGGAAGGAGGCCCATCCAATCTGATCAGACACTAGTTGCTTGGATTGTTCCTTAGAGTCTATCCTTTCATCAAGAGGATAGCAGGTTGAGAACTTAAGGTTACATGAGACAATAATGCAAACTTTTATCGCAGCTGTAAATTTTTTATTTGCCCTTTTGTTGGGACTATTATTTAGTATGTGGGTTTCGAAGCTTTGAATGTTACAACTTTTACTCTATTGGTTTTACTGAAAAATGTTATTTGATGTAAATAGACATGGTAATGTTCTATTTCACCTTGTTTGAAAAAAAAAAACTCTGAGAAAATAAAAAAGAATGTGTATTAGAATAAGAACAGTTCCCAAGCAAAATAAAAACAAATGCGTATCAGAATAAGAACAATTTCCAAGCAAAACCAGTGTATCTTTGCAGGTGCTAGAAGGGTAAAAACCTTGGAACTGAGGATGCATAGAGTGCATCAGCACCATTACCATAGCAATTTCTTTTAACTAGTAGAGATTGGTATTCCATCCTGATTGTTTCTATGCTACTAACATATTATTAGCATATAGAAAGAGTTCATTTTCCTACTTGGCTTAGCTACTCCTAATTCTATCTAAATGAATTGCCAGGCAAAAGTATCATATAATTAAGTGGTGCATGCAAAATAGTTTATATATTTTTGTTTTTGTCAGGGTGGAGACACAGGATGGTGGAGATGCAAAAGTAGAGGTGTCACCTCGTGACATAGTTTACATGGAAAATGCTGAGCCTATAAATGGTGAACAACCAGAGATTCTGCATAAACTTGACCTCCGATATGCGTATGTATTTTGAGCGATGTGTTAGCCTACTTTAGTAGGATCAGTAAATTATGTTCACTGCATTTGCATCATGGTTAAGCTTTCTGCATCTGGCATAGTTCAATACTACTGGTAGGAAACTTCCCATAAACAAGGACATTAATACAAAGCTTCCTACCAATAAACCATATATATAGTATAAGTCTCTTACATCAAAATTATCTATATTTGGTGCTCAGATATGATTAAATGACACTTCCTTTTAGAATGTTAGTTATGCTAATCCTTTGTGACGATTTATTTGCCTTCTTAACTAACTCTATCAGATAATTAATCTCCTGTTATATTCTGTTGATGCAGAGGGACCTCTTGGTGTGATGAATCTCTTGCATTAGTGTATGAATCTTGGTACAAAACACGGAAAACAAGAACATGGGTTATCTCCCCAGATAAAAAAGATGTTAGTCCACGCATCTTATTCGATAGATCTTCTGAAGATGTATATTCTGATCCTGGCTCACCAATGCTACGAAGAACTGCCATGGGGACATATGTTATTGCAAAAGTTAAGAAGCAAGATGAAAATACCTACATCTTGCTGAATGGGATGGGTGCCACACCAGAAGGGAATGTTCCGTTCCTTGATTTGTTTGATATGTATGTCTATATCCATCAATAGTTATATGCCTTATAAGTANATGTTTGAACATATGTGCCCGATCCTAGTTGACACCTTTGTTATTGCAAGAAATACTGGAAGTAAAGAGAGGATATGGCAAAGTGACAAGGAAAAGTACTATGAAACTGTTGTTGCACTTATGTCGGACAAAACTGATGGGGAACTGCCACTTGAGAAGTTAAAGATACTTACATCAAAAGAATCAAAAACAGAAAACACACAGTATTACCTGCAAATTTGGCCAGAAAAGAAGCAAGTTCAGATCACAGATTTTCCCCATCCATATCCTCAGCTTGCTTCATTGTATAAGGAGATGATAAGATACCAACGGAAGGATGGGGTTCAACTAACAGCTACATTGTACCTGCCCCCAGGCTATGATCCTTCACAGGATGGACCTTTGCCATGTTTAGTTTGGTCCTACCCTGGTGAGTTTAAAAGCAAGGATGCTGCTGGACAAGTGCGTGGCTCACCTAATGAGTTTCCAGGGATTGGTGCTACATCCCCACTGCTTTGGTTGGCTAGAGGGTATTATTTTTCGTTCTATTCAAGAATATGCATACCACATTTCCTACTGCTGTTTCTCAAGGACAACATCTTCTTCTCACCTTCAAATTGTTGATGCATTTATCACAAAATTATTATTTTTTGTTTCTGTTGCGTGTTGTCACTTAACAAGTCATCACTTCCGTTGCCAGGTTTGCTATTTTATCAGGTCCAACCATCCCGATTATTGGAGAAGGCGATGAAGAGGCCAATGACAGGTTTGTTTTTTATACTTAACTCCATTCTTTTGTGGTTAGAAACTTCCAATCTATGCTACAGTTGTACCATGGTATTTATTATTTTAGTATTGCAAACTACCTTGTAGGTACGTGGAGCAGCTAGTAACTAGTGCTGAGGCTGCAGTTGAGGAAGTTGTTAGGAGAGGGGTGAGC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