BGIOSGA012546

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA012546

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA012546, complete gene.

LocusTag

OsI_11399

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA012546-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA012546-PA

Length

13261

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:13379135..13392395

Sequence Coding Region

13379135..13379224,13380011..13380173,13380260..13380378,13380969..13381081,13381177..13381232
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,13382585..13382752,13382836..13383027,13383113..13383156,13383759..13383828
,13383948..13384109,13384671..13384778,13384872..13384909,13385120..13385264
,13385799..13385925,13386036..13386229,13386528..13386658,13387012..13387087
,13387216..13387326,13387463..13387645,13388262..13388405,13388944..13388967
,13389553..13389726,13389806..13390153,13390230..13390559,13390774..13390959
,13391050..13391605,13391862..13392022,13392141..13392395

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:13379135..13392395 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:13379135..13392395 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGATTCCGCGGCGGCGGCGGGGGAGGGGCAGCGGTTCAAGCGCATTCCGCGGCAGTCGTTGGCGGGGAACCTGGAGCTGGATCCACTGCTTAATGAAAATTTAGATCAATGGCCACATCTAAATGAGCTGGTTCAGTGCTATAAGGCTGATTTTGTGAAAGACGACTGCAAATATGGACGATATGAAAGTGTTGCACCACCATCTTTTCAGAATCAAATTTTTGAGGGACCTGATACTGACTTAGAAACAGAATTGCAGCTTAGCAATGATAGGCAATCCAAGCCTGATGAAGTTACTGAAGATGATATGCCAAGCACATCAGGGAGACAATTATATGAGACTGAAGTGCCCGCTTCATCCTCAAAAAAACACTGCAGTCTATCACCTTTACCAGCATATGAACCGGCATTTGATTGGGAAAATGAGAGATCTTTGATATTCGGCCAACGGGTGCCAGAAAGTGTCCCTGCAATAAACAGCAGTGGATTGAAGATAACTGTCAAGGTGTTATCTTTGTCATTTCAAGCTGGATTAGTTGAGCCTTTTAGTGGTACAATCTGCTTGTACAACAGAGACAGAAGAGAAAAATTGTCAGAAGATTTCTATTTTCATATACTCCCAACAGAAATGCAAGATGCTCAGATTTCTCTAGACCGCCGAGGTGTTTTTTCATTGGATGCCCCTTCACCATCAGTGTGCCTTCTGATTCAGCTAGAGAAGGCTGCCACTGAGGAAGGGGGAGTAACACCCTCTGTTTATTCTCGTAAAGAACCTGTTCACTTGACTGATAAAGAGAAGCAAAAATTGCAAGTCTGGTCTCAAATCATGCCATATAGAGAGTCGTTCGCATGGGCTATGATTCCACTGTTTGAGAACAACCAGGCTGGTGGTGCTGCCTCTCCCAGTAGCCCTCTAGCACCAAGTATGTCAGGCTCAAGTTCTCAAGATAGTATAGTGGAGCCTATTTCCAAGCTCACTTTGGATGGAAAGCTCAATCATTATTCAAGTGGAAGCTCAGTTATTGTAGAGATATCAAATTTGAACAAAGTGAAGGAAAGCTACATAGAGGACTCCCTCCAAGACCCCAAAAGAAAAGTACACAAACCAGTGAAAGGTGTACTGAGGTTAGAGGTGGAAAAACTTCATAATGGCCACAACGACATGGATAACATTTCTGAGGGCGGTAGCATGGCCAATGATTTGAATGATGCTGGTGAACTCAATAATGGTAGATACAACCGGAGTAGCTTTGATGGGATCCATGGTTCTTTGAATTCTAGTGCCGTGGCCCAGAAAGATGCACATCAGAATGGTCAAGCTTCCAATACAGAGAGTGGTGAAAATTTTCAAGCTTTTGACTTTCGGATGATGACCCGAAGTGAGCCATTTTCACAACTCTTCCATTGTCTCTATGTGTACCCACTGACTATTAGCTTGGGCCGTAAAAGAAATCTATTTGTAAGAGTGGAATTGAGAAAGGATGATTCTGACATCCGCAAGCCTCCATTAGAGGCTGTTCATCCAAGGGATCGGAACACAACACTACAGAAGTGGGCGCATACTCAGATTGCTGTTGGAACGAGAATGGCTTGCTACCATGATGAAGTTAAAATCAGTCTGCCTGCTCTCTTGACACCCCAACATCATCTTCTGTTCACATTTTACCATGTAGATCTCCAAATGAAACCTGAAGCCCCCAAACCAGTTGTCGTGGGATATGCTGTTCTTCCACTGTCGACACACATTCAGTTACTTTCAGACGTATCTTTGCCAATTTTAAGAGAACTTGTTCCACATTACCTGCAGGAAAGTGGAAAGGAAAGAATGGACTATCTGGAGGATGGCAAAACTGTTTTTAGGTTGCGATTAAGACTTTGTTCTTCATTATTCCCAGTTAATGAAAGAATAAGAGACTTTTTTGTCGAGTATGATCGCCATACACTTCATACAAGTCCACCTTGGGGTTCTGAGCTTCTTGAGGCCATAAACAGTTTAAAGAACGTTGAATCTACTGCACTGTTGCAATTTCTCCAACCCATACTTAATATGCTACTTCATCTTATCGGTGATGGTGGTGAAACCCTTCAGGTTGCCGCATTTCGAGCTATGGTCAATATCCTAACCCGGGTCCAGCAGGAATCATCTGATGGGGCTGAGAGAAATCGGTTTCTTGTTAATTATGTTGATTATGCTTTTGATGACTTTGGTGATCGGCAAGCACCTGTATACCCTGGTCTGTCTACTGTTTGGGGAAGCCTGGCTCGGAGTAAGGCTAAAGGTTATAGAGTTGGGCCAGTCTATGATGATGTGCTGGCAATGGCTTGGTTTTTTCTGGAGCTTATTGTAAAATCGATGGGATTGGAACAAAGTCGTCTATTTTACCATAATCTTCCACTAGGTGAAGATGTCCCACCGCTACAGTTGAAAGATGGTGTCTTCCGATGTATCATGCAGCTGTTTGATTGCCTTCTAACTGAGGTTCATGAGCGCTGTAAAAAGGGTTTAAGCTTGGCGAAGCGCTTGAACAGCACACTTGCTTTCTTTTGTTATGATCTTCTATCAATTATTGAGCCACGCCAAGTTTTTGAGCTGGTTTCATTGTATATGGACAAGTTTGCAGGAGTTTGCCAGTCAATTCTCCATGATTGCAAATTGACATTCCTTCAGATAATATGTGACCATGATCTTTTTGTTGAGATGCCTGGTCGTGACCCCTCTGATAGAAATTATCTCTCGTCAGTACTTATTCAAGAGATTTTTCTCACCCTTGACCATGATGATCTATCTCAGCGAGCGAAAGCAGCCCGTATTTTGGTTGTTCTAATATGCAAGCATGAATTTGATGCACGATATCAAAAAAGTGAAGACAAGCTGTATATTGCTCAGCTGTATTTTCCTCTTATAGGACAGATTCTAGATGAGATGCCTGTATTCTATAATCTAAATGCTGTTGAAAAGCGTGAGGTGCTGGTAGTCATTTTGCAAATCATAAGGAACTTGGACGACATGACTCTGATCAAAGCATGGCAACAGAGCATTGCTAGAACCAGATTGTTCTTCAAGCTACTTGAAGAATGCATTACCCATTTTGAGCACAACAAAACAGGAGACAGCTTGTTACTAGGCTCAAGTTCACGGAGCCCTGATGCTGAGCGCCCTGCATCTCCAAAGTACTCCGATCGATTATCCCCATCAGTTAATGCATATTTGTCTGAGGCATCACGCCATGAAATAAGGAAGAATATTTCAGATGGTAACATGCCTCAGGGAACACCAGAAAATGGATACATGTGGAACAGGGTTAGTCCTCAACTGAGCTCTCCTAACCAGCCCTATTCATTGAGAGAAGCACTTGCTCAAGCGCAGTCTTCAAGGATTGGATCAACCGCGAGGGCACTGAGAGAATCTCTACATCCAGTGCTGAGACAAAAGTTGGAACTGTGGGAAGAAAATCTCAGTACTGCTGTGAGCCTGGAAGTGTTGGGAATAATTGATAAGTTTTCAGTCGCTGCAGCTTCTCGTAGCATCACTACTGATTACGCAAAGCTAGATTGTGTAACATCTGTATTAATGGGTCTTTTATCAAGGAGCCAGCCCTTAGCTTTTTGGAAAGCTTTCCTTCCTGTGGTGTATAATATATTTAACCTCCATGGCGCAACACTGATGGCAAGGGAGAATGATCGCTTCTTGAAGCAAATTGCTTTTCATCTTTTGCGCCTTGCTGTTTTCCGGAATGATTCTATTAGAAAAAGGGCTGTTGTCGGGTTGCAGATTCTTGTTAGGAACTCGTTTAATTATTTTAAGAACACCACAAGGTTGAGGGTGATGTTGACAATCACTTTGTCAGAACTTATGTCTGATGTGCAAGTAACTCAGATGAAATCTGATGGCTCTCTTGAGGAAAGTGGTGAAACTCGGCGCCTTAGGAAATCACTAGAGGAAATGGCTGATGTACGAAGTAAGGATCTCTTGAAAGATTGTGGCCTCCCTGTTAATGCACTGGAGGCAGCGCCTGAAGGTTCGACTGATAATAGGTGGTCTTGGGTAGAAGTTAAACATCTATCCAAATGTCTAGTCCAGGCCCTTGATGCTGGTCTTGAACATGCCCTCTTGGGCTCTGAAATGACTCTGGACAGGTACGCGGCTGCTGAGGGTTTCTATAAGCTAGCAATGGCCTACGCGCCTGTGCCAGATCTTCATATAATGTGGTTACTGCATCTATGTGATGCACATCAGGAGATGCAATCATGGGCTGAAGCTGCACAATGTGCAGTTGCTGTAGCTGGTGTTATCATGCAGGCACTTGTTGGAAGGAATGATGCGGTGTGGAGCAAGGAGCATGTTGCTTCCCTATGTAAGATTTGCCCTATTGTGAACACTGATGTTAGCTCAGAAGCATCTGCAGCAGAAGTTGAGGGATATGGTGCATCCAAGCTTACTGTGGATTCAGCTGTCAAGTATCTTCAGCTGGCAAACAAACTTTTTGCACAAGCCGAACTCTATCACTTTTGTGCTAGTATTCAGGAACTCATCATTCCTGTGTATAAAAGCAGAAGGGCATATGGGCAGCTGGCTAAGTGTCATACATCACTCAAGGATATCTATGAGTCAATTCTTGAACAGGAGGCTAGTCCTATACCATTCATTGATGCTACCTACTACCGGGTAGGGTTTTATGGGGAGCGGTTTGGCAAACTCAACAAAAAGGAGTATGTGTTCAGAGAGCCAAGAGATGTTCGTCTTGGTGACATAATGGAGAAGCTTAGTCATATCTATGAGGCTAAAATGGATGGCAATCACACCTTACACATCATTCCGGATTCGAGACAAGTCAACGCTGATGAGTTGCAACCTGAATCTCTAGAGTTTTCTCCTGTTGAGAATGCGATTGGAATGATCGAGACAAGGACAGCTGCCTTGCGAAATGAACTAGAAGAACCACGCAGTTCGGAAGGTGACCAACTCCCAAGACTCCAAAGCCTGCAGAG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Protein Sequence

<aaseq>MDSAAAAGEGQRFKRIPRQSLAGNLELDPLLNENLDQWPHLNELVQCYKADFVKDDCKYGRYESVAPPSFQNQIFEGPDTDLETELQLSNDRQSKPDEVTEDDMPSTSGRQLYETEVPASSSKKHCSLSPLPAYEPAFDWENERSLIFGQRVPESVPAINSSGLKITVKVLSLSFQAGLVEPFSGTICLYNRDRREKLSEDFYFHILPTEMQDAQISLDRRGVFSLDAPSPSVCLLIQLEKAATEEGGVTPSVYSRKEPVHLTDKEKQKLQVWSQIMPYRESFAWAMIPLFENNQAGGAASPSSPLAPSMSGSSSQDSIVEPISKLTLDGKLNHYSSGSSVIVEISNLNKVKESYIEDSLQDPKRKVHKPVKGVLRLEVEKLHNGHNDMDNISEGGSMANDLNDAGELNNGRYNRSSFDGIHGSLNSSAVAQKDAHQNGQASNTESGENFQAFDFRMMTRSEPFSQLFHCLYVYPLTISLGRKRNLFVRVELRKDDSDIRKPPLEAVHPRDRNTTLQKWAHTQIAVGTRMACYHDEVKISLPALLTPQHHLLFTFYHVDLQMKPEAPKPVVVGYAVLPLSTHIQLLSDVSLPILRELVPHYLQESGKERMDYLEDGKTVFRLRLRLCSSLFPVNERIRDFFVEYDRHTLHTSPPWGSELLEAINSLKNVESTALLQFLQPILNMLLHLIGDGGETLQVAAFRAMVNILTRVQQESSDGAERNRFLVNYVDYAFDDFGDRQAPVYPGLSTVWGSLARSKAKGYRVGPVYDDVLAMAWFFLELIVKSMGLEQSRLFYHNLPLGEDVPPLQLKDGVFRCIMQLFDCLLTEVHERCKKGLSLAKRLNSTLAFFCYDLLSIIEPRQVFELVSLYMDKFAGVCQSILHDCKLTFLQIICDHDLFVEMPGRDPSDRNYLSSVLIQEIFLTLDHDDLSQRAKAARILVVLICKHEFDARYQKSEDKLYIAQLYFPLIGQILDEMPVFYNLNAVEKREVLVVILQIIRNLDDMTLIKAWQQSIARTRLFFKLLEECITHFEHNKTGDSLLLGSSSRSPDAERPASPKYSDRLSPSVNAYLSEASRHEIRKNISDGNMPQGTPENGYMWNRVSPQLSSPNQPYSLREALAQAQSSRIGSTARALRESLHPVLRQKLELWEENLSTAVSLEVLGIIDKFSVAAASRSITTDYAKLDCVTSVLMGLLSRSQPLAFWKAFLPVVYNIFNLHGATLMARENDRFLKQIAFHLLRLAVFRNDSIRKRAVVGLQILVRNSFNYFKNTTRLRVMLTITLSELMSDVQVTQMKSDGSLEESGETRRLRKSLEEMADVRSKDLLKDCGLPVNALEAAPEGSTDNRWSWVEVKHLSKCLVQALDAGLEHALLGSEMTLDRYAAAEGFYKLAMAYAPVPDLHIMWLLHLCDAHQEMQSWAEAAQCAVAVAGVIMQALVGRNDAVWSKEHVASLCKICPIVNTDVSSEASAAEVEGYGASKLTVDSAVKYLQLANKLFAQAELYHFCASIQELIIPVYKSRRAYGQLAKCHTSLKDIYESILEQEASPIPFIDATYYRVGFYGERFGKLNKKEYVFREPRDVRLGDIMEKLSHIYEAKMDGNHTLHIIPDSRQVNADELQPESLEFSPVENAIGMIETRTAALRNELEEPRSSEGDQLPRLQSLQRILQGSVAVQVNSGVLSVCTAFLSGEPATRLRSQELQQLIAALLEFMAVCKRAIRVHFRLIGEEDQEFHTQLVNGFQSLTAELSHYIPAILSEL</aaseq>

Gene Sequence

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