BGIOSGA012829

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA012829

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA012829, complete gene.

LocusTag

OsI_11967

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA012829-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA012829-PA

Length

18149

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:18307542..18325690

Sequence Coding Region

18307542..18307732,18307821..18307950,18308070..18308194,18308301..18308393,18308888..18308954
,18309113..18309203,18309294..18309346,18309520..18309584,18310647..18310752
,18313372..18313482,18313929..18313988,18314349..18314378,18314610..18314660
,18314729..18314827,18315161..18315220,18315285..18315374,18315762..18315863
,18315946..18316056,18316704..18316820,18316905..18316985,18317656..18317760
,18317841..18317921,18318003..18318089,18318550..18318627,18318701..18318840
,18318957..18319056,18319590..18319708,18319906..18320041,18320125..18320255
,18321269..18321316,18321392..18321447,18322523..18322593,18324289..18324373
,18324454..18324557,18325221..18325349,18325640..18325690

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:18307542..18325690 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:18307542..18325690 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGTTTTGTTGCATCTCTACCGTCCCCCTTTTCCCCCTTTTTTTTTGGCTTCTCTCTTTCCGGTACGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCACCGCCGCCCTCCCACTCCCACTCCCACTCCCACTTCCACCCCATCCAATCCGCCGCCGTCACGACCGTCGCCGCTGCAGTCGACGACGACATGGAACGCACTGAGGAGGAGGAGGCGCCCGCCGCCAAGGACCCCAACGCGTCGCTGCCGTCGCCGACGTACAGGTCGCTCGCCGCGCCCGTCACCAAGCCCGTCGACAAGTTCGCGCTCCTTCCTGCCTTCCTCAAGGTTAGAGGCCTCGTTAAGGAGCACATCGACTCCTTCAACTACTTCATCACCAAGGGAATTAGGAACATTGTCAAGGCAAACAATCGCATCGAAGCGCGCAACAACCCCTCTATTTTTCTTAGGCAGTACAATAGTGTAAGGGTTGGTGTGCCCTCCGTACAAGTACAATACATCGCCGAAAAAATCACGCCACACTTTTGCCGCCTTACCGATCGCACATACTCTGCTCCTGTGTTGGCTGATATTGAATACACAGTTGGAAAGCAGTATGAGCTGAAAAGGAAGCCTAATTTCATCATTGGGTACTTGCCAATTATGCTTAGAAGTCATGCATGCGTTCTGAATGGAAAGGATGAAGCTGAATTAGCAAGATATGGTGAGTGCCCTCTTGATCCTGGTGGTTACTTCATTGTTAAGGGAACCGAGAAGGTCATTCTTATACAAGAACAGCTATCAAAGAATCGTATTATTATCGACACCGATAGTAAAGGAAGGGTGATTGCATCTGTTACGAGCAGCACACATGAAATAAAAAGCAAAACTGTGATTTTTATGGAGAAGGAGAAAATTTATCTACAGTTGAATCAATTCACTAAGCCGATACCTATAATTGTGGTTATGAAAGCGATGGGGATGGAAAGTGACCAAGAGGTTGCACAAATGGTCGGAAGAGATCCAAGATATGGAGATCTCCTATATCCATCTATTCAGGAATGTGCCTTTGAGAGAATCTATACACTGAAGCAAGCTCTGCAGTACATGGATGACAAGGTGATGTATCCTGGTGCAGGAAATCAGAAGGAAGGTCGTTCAAAATCAATCCTCCGTGATGTTTTTGTTGCACATGTTCCGGTTGAAAGCGGGAATTTCCGACCAAAGTGCATATACACAGCTGTTATGTTAAGGCGCATGATGGATGCAATCTTGAATGCCGACACTTTTGATGATAAGGATTATGTAGGAAATAAGAGGCTAGAGCTGTCTGGTCAACTAATATCCCTGCTTTTTGAGGATTTGTTCAAAACGATGAACTCCAATGCTGTGGAGCTTATGAACAAAACAAGTGAAAAGATCCATTCTAGCCCATTGGATTTAAGCCTGCATATAAAGGAAAATATCATAACCCATGGTTTGGAGAGGGCTATTTCCACAGGAAATTGGGATATTAAACGATTTAGGATGCATAGAAAAGGTGTATCACAGGTTCTTTCAAGATTATCCTACATGGCATCTTTAGGCTATATGACAAGGATAACACCACAATTTGAGAAGACCCGGAAAACAAGTGGACCTCGTGCTTTGCAGCCTAGTCAGTGTTATAGTCTAGGTGTGGAAGATTTATCACTTCTGTCTGGAGAAGAAATCCATGCATCGGGTTCGTTTTTGGTCATGTTCAATGGGTTAATACTGGGGAAACACAGACAACCTCAGAGATTTGCTAATGCTATGAGAAAATTGCGTCGTTCGGGTATAATTGGAGAGTTCGTAAGCATTTTTGTAAACGAGAAGCAGCATTGCATTCACATTGCCTCTGATGGCGGTCGTGTCTGTCGCCCACTTATAATTGCTGATAAGGGGATACCAAGAGTCAAAGAGCATCATATGAAACAATTGAGAGATGGTATTCGTTCGTTTGATGATTTTCTGCGTGATGGGTTGATCGAATATCTTGACGTTAATGAAGAAAACAATGCATTGATTGCCCTGTATGAGCATGAGGATCAAGATGATGTTCAAAGAAGCAGTATCACACATATTGAAATAGAGCCCTTGACCATTTTAGGGTTATTCCGAGCAGATTCTCTACTCTATTTACTAGTGTATGCACAGCGTCCCCTTCTTACAACAAAAACTATTGAGTTGGTTGGATATGATAAGCTTGGGGCTGGACAGAATGCGACTGTTGCTGTCATGAGTTATAGTGGATACGATATTGAAGATGCAATTGTAATGAACAAATCATCCCTTGACCGAGGTTTTGGTCGTTGCATTGCAATGAAAAAGTACACTGTGACAAAGGAGAAGTATGAAGGTGGTTATTCAGACAGGATCGTTAAGCCCCAGAGGGATAAAGATGGTGCTCTGTTAAAACAGAACATGCGGGCATTGGATGAAGACGGATTTGCTGCACCAGGTCTAATAATACGCAATCATGATATCTATGTGAACAAGCAAACTCCCAGAAATACCAAGAGAGATTCTGGTGCTCATTTAACAGACAGGGACTATAAGGACTCGCCTGCTGTCTACAAAGGTGTTGATGGCGAGACCACTGTTGTAGATCGTGTAATGCTTTGTTCAGATACAGATGAGAAATTAATCATCAAATGTATTATCCGTCACACTAGGCGTCCAGAGGTTGGTGACAAATTCAGTAGCAGACATGGACAGAAAGGTGTTTGTGGTACCATTGTTCAGCAGGAAGACTTCCCCTTCTCTGAGAGAGGAATATGCCCTGATTTGATTATGAATCCCCATGGATTTCCAAGTGCATTTGGGGAACCAAGTGGTAATGCTGATAAGGTTGAAGATATAAGCCGTACTCTGGTAAAGCATGGCTTCAGCTATAATGGAAAAGATCTCTTGTACTCAGGAATTTTAGGCCATCCTTGTCAGGCATATGTATTCATGGGGCCAATCTACTACCAGAAGTTGAAGCACATGGTTCTTGATAAGATGCATGCTCGAGCTAGTGGACCACGAGTATTGCTGACCCGGCAACCTACTGAAGGGCGAAGTCGTGATGGAGGCCTACGTCTTGGTGAGATGGAGCGTGACTGTTTAATCGCATACGGTGCTAGCATGCTAATCTTTGAACGTCTACTAATATCTAGTGATCCATATCAAGTACAGGTTTGCAGAAAATGTGGCTTGTTAGGCTATTACAATCATAAACTGAAGGCTTCCTACTGTTCCATGTGCAAAAATGGAGAAAATATGGCCAAGATGAGGATGCCGTATGCTTGCAAGCTTTTATTCCAGGAGCTGCAAGCAATGAACGTTGTTCCACGATTGAAGTTAACCGAAGGATAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MFCCISTVPLFPLFFWLLSFRYAPPPPPPPPPPPSHSHSHSHFHPIQSAAVTTVAAAVDDDMERTEEEEAPAAKDPNASLPSPTYRSLAAPVTKPVDKFALLPAFLKVRGLVKEHIDSFNYFITKGIRNIVKANNRIEARNNPSIFLRQYNSVRVGVPSVQVQYIAEKITPHFCRLTDRTYSAPVLADIEYTVGKQYELKRKPNFIIGYLPIMLRSHACVLNGKDEAELARYGECPLDPGGYFIVKGTEKVILIQEQLSKNRIIIDTDSKGRVIASVTSSTHEIKSKTVIFMEKEKIYLQLNQFTKPIPIIVVMKAMGMESDQEVAQMVGRDPRYGDLLYPSIQECAFERIYTLKQALQYMDDKVMYPGAGNQKEGRSKSILRDVFVAHVPVESGNFRPKCIYTAVMLRRMMDAILNADTFDDKDYVGNKRLELSGQLISLLFEDLFKTMNSNAVELMNKTSEKIHSSPLDLSLHIKENIITHGLERAISTGNWDIKRFRMHRKGVSQVLSRLSYMASLGYMTRITPQFEKTRKTSGPRALQPSQCYSLGVEDLSLLSGEEIHASGSFLVMFNGLILGKHRQPQRFANAMRKLRRSGIIGEFVSIFVNEKQHCIHIASDGGRVCRPLIIADKGIPRVKEHHMKQLRDGIRSFDDFLRDGLIEYLDVNEENNALIALYEHEDQDDVQRSSITHIEIEPLTILGLFRADSLLYLLVYAQRPLLTTKTIELVGYDKLGAGQNATVAVMSYSGYDIEDAIVMNKSSLDRGFGRCIAMKKYTVTKEKYEGGYSDRIVKPQRDKDGALLKQNMRALDEDGFAAPGLIIRNHDIYVNKQTPRNTKRDSGAHLTDRDYKDSPAVYKGVDGETTVVDRVMLCSDTDEKLIIKCIIRHTRRPEVGDKFSSRHGQKGVCGTIVQQEDFPFSERGICPDLIMNPHGFPSAFGEPSGNADKVEDISRTLVKHGFSYNGKDLLYSGILGHPCQAYVFMGPIYYQKLKHMVLDKMHARASGPRVLLTRQPTEGRSRDGGLRLGEMERDCLIAYGASMLIFERLLISSDPYQVQVCRKCGLLGYYNHKLKASYCSMCKNGENMAKMRMPYACKLLFQELQAMNVVPRLKLTEG</aaseq>

Gene Sequence

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