BGIOSGA012882
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA012882 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA012882, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBB0056B16.25 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA012882-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA012882-PA |
| Length |
9752 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:19543495..19553246 |
| Sequence Coding Region |
19543495..19543645,19550620..19550669,19550752..19550889,19550968..19551265,19551348..19551580 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:19543495..19553246 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:19543495..19553246 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCCGTCCCGGATGATGCAGGCGTTCGCGCAGGAGGCTTCCGACTTCGACCGGCAGATGGGCTGCATGGCCGGCATGTTCCAGATCTTCGACCGCCGCCGCCTCCTCACCGCGCGTCAACGCGGCGGAGCCCGAGGCACGGCGCCACCAGCTATGGCAGTGCAAGCTGGAACCCCAGCTACTCCTATAAGCCCCCAAGTGATTAGTGGTGCATTTGTTCAGCAATATTACCACATTCTACATGAGACACCAGATCAGGTCTATAAGTTCTATCAAGATGCAAGTATTGTTGGTCGGCCTGATTCTAATGGAGTCATGAAATATGTATCAACAACTGCTGATATCAACAAAATAATCTTGTCTATGGACTTCAGCAACTACTTAACAGAGATAGAGACTGCAGATGCACAGTTATCTCACCAGGATGGTGTGCTCATTGTTGTTACTGGATCTTTGACATCTGAAGGCATATGCCGTAGATTTACACAGTCATTCTTCCTTGCACCACAAGAATCTGGTGGCTATGTTGTTCTCAATGATATTTTTAGATTTATAGTGGAAAGGCCACCAGTTGCAATAAGTCAAGTTAGTCAAGAAAATGAGAACAATCAGAACACTGCCACTCTTCCTGAAACTGATCCTAATCCAGCGGGAGATGGTATGATCTCAGAGCCTGTGGCAGTGGAAAATAATGTTGCGGAGGGGGAAGTGACAAATTCCACGGTTGATGGCACTAGTATTGAAAATAATGCTACTGCTGCTGTCGAACCACCTGTACAAATGACGAAAGAGGAGCCCAGGAAGATCTCTGTTGCTGCTCCTCCCCCTCCAGCTCAGAAGGATGTAACGAAGAAGTCCTATGCGTCGATTGTGAAGGTTATGAAGGAGGTGTCACTAACCCCAGTTGTCAAACCTAAGCCAGCTCCAAAACATGTGGTTAAGACTGTTGAAGCTTCGGAGAAACCTTCTGTTAAAAGTTCTCAAACTGTTGAAATCACTCCGAATGATAACAACGATGCTGAAAATAACACTTCTAATGATGAGCAAGGTTACTCAGTTTTTGTGAAGAGTTTGCCTCACAATGTGACAGTCCAGACGGTTGAGGAAGAGTTCAAGAAATTTGGCGCTATCAAGCCAGGTGGCATCCAAGTTAGGAACAACAAGATTGACCGGTTCTGCTTTGGTTTTATTGAGTTTGAGTCCCAGCAATCTATGCAGGCAGCAATTGAGGCATCTCCGATTCATATGGGTGGGAAAGAAGTATTTGTTGAGGAGAAAAGAACCACTACCCGAGTTGTGAATGGTGTTGTCATCACGCGTGGTGATAATGGGAATGCTGGTGGAGGCGGACGTTACCAATCTGGAAGGGGAGGCTACCGCGGTGATAATTTCAGGGGACGGGGTGGTGGCTATGCGAACAGCGGAAACTACCGTGGAGGTGATAACTTCAGCAGGAGGAACGACTTGAGAAATCGCAACGAGTTTTCAGGTCGTGGTCGAGGGCCACCGCCTGGGAATGGCTATCAGAACAACGGATTCCATCCAGCAAGGCCGTTCCAGAACGGAAATGGGAGGTTCACCCGAGTCAACGGCCCTAGGCAAACACCGGTTGCGGCATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPSRMMQAFAQEASDFDRQMGCMAGMFQIFDRRRLLTARQRGGARGTAPPAMAVQAGTPATPISPQVISGAFVQQYYHILHETPDQVYKFYQDASIVGRPDSNGVMKYVSTTADINKIILSMDFSNYLTEIETADAQLSHQDGVLIVVTGSLTSEGICRRFTQSFFLAPQESGGYVVLNDIFRFIVERPPVAISQVSQENENNQNTATLPETDPNPAGDGMISEPVAVENNVAEGEVTNSTVDGTSIENNATAAVEPPVQMTKEEPRKISVAAPPPPAQKDVTKKSYASIVKVMKEVSLTPVVKPKPAPKHVVKTVEASEKPSVKSSQTVEITPNDNNDAENNTSNDEQGYSVFVKSLPHNVTVQTVEEEFKKFGAIKPGGIQVRNNKIDRFCFGFIEFESQQSMQAAIEASPIHMGGKEVFVEEKRTTTRVVNGVVITRGDNGNAGGGGRYQSGRGGYRGDNFRGRGGGYANSGNYRGGDNFSRRNDLRNRNEFSGRGRGPPPGNGYQNNGFHPARPFQNGNGRFTRVNGPRQTPVAA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..151#7126..7175#7258..7395#7474..7771#7854..8086#8229..8400#8484..8605#8673..8738#8946..9009#9427..9752#ATGCCGTCCCGGATGATGCAGGCGTTCGCGCAGGAGGCTTCCGACTTCGACCGGCAGATGGGCTGCATGGCCGGCATGTTCCAGATCTTCGACCGCCGCCGCCTCCTCACCGCGCGTCAACGCGGCGGAGCCCGAGGCACGGCGCCACCAGGTAGTGGTACCATACCAATTCTTCTTCTCTGTACTCTTCTGCGGCGTGTGCTCTTCGTGTAGCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTGCTGCCAAAGTTTATCACAAAGACAAAACTGAATACTAACTGTCCTGTGGAGATATGAACAGTGTTACTGGCAGTAGATGCTAAACTAGAACAGGGATTAAAAAATTGTTTCGTTTAGAAAGTACTGCTGCTGCCAAGTAAGAACAGGGGAAATTTATAGGGAGGTACATGGTCATGGACAAGAAACTGACACAAGTTCAGAAGCTGCAGGAATGTAGATGTAGCACATATGAGTTGTAGTAATGGGCAATTGCACAGTGAATAATCAGTCAAGTAAAAATGAAATGGTAGTAAAGTGAAGTGCTTTTTCTATTCAGATATTTGGTATTCTTTGGCTGAAACAAATCAATAGATTTCAGTGATATGTTCTTGATCAAATCCAACTTTTAAAATTCAGATATCTTTATGATATTGATCTTTTCCTTCCCTCGATCAAATTAGATATTTATAATTTAACTGCGGTAACTTTCTTTTGGTTTATACCCAAATACAGTTCATATTAATAACTGTTTCCTGAATACTTTCTTTAGGCCATGTTTTGCCAAACAGCAACAGCAATGTCTCGATTCAAAACCCAGTTGCTTCAAACAACACTCTGGTAATTTTCCTACTGTACTGTGCATGACAATATATATCCCAAGTATGCGTTCATCTGCCTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCTTAGCTAACCCTTTCCTCAAGAGGTTGCACTAAGCACTCCTTCTACTAAGGGTATCTCTTCCCTTTCGGAGGTGAGATCCGACCTTCACAAACTTCTCCCGGCCAACCACAAGTAGATCAGTGGCTCGGGAGTGACACCTAGCCGCCTAGGAGTCCTCAACCTCCAAGAGTAACAAATGAAGCAAAGAACTCCCGGAGATGATGCAAGTGCTCACAAATCTTTACAAAGTCAACAACAAGCACTCACACAAACTCGAATCCACAACTCTCACACACACACCAAATCCAAATCAAACACGGGTGAGAGGGGAAACAAGAAAGCAAGGTTCAAAAGTGCTAGAGAGAGAGCAAGCCAAGGGCACAAATGATTGGAATGGAACCAGCCGCGCTCACAAGTGAGGGGAGGGGGCTATTTATAGCCACAGCCCAAATTCTGCCCGTTATGCACAATAATTGAGATTTTCGGATATTACGAAAGATTTTCGGACAAGTCCAAAAATTCCAGCTCAGCACCAATAGCAAAGTCAACGAAAGATTTTTCAGACATTCCAAAAATTTTTCGGATAAGTCCGAAAATTTCCAGCACCAAAACATCGTTCTTGATGTTTTCGGAAAAGTCCGAAAATCACTTTCGGACAAGTCCGAAAATACACAGAAGCGATTTTTGCCTTCGCTGAAGTTTTTCGGAAACTCCGAAAATCAATTTTGGAAAAGTCCGAAAATAAACAGAACAGTCATTTTCGGAAAGTCCGAAAATGTCTTTCGGACATATCCGAAAATTTCCAGAAGCGAAAATTGGTTCCTGTGCATTTTCGGAAAGTCCCGAAAATGACTTTCGGAAAACTCCGAAAATTTCCAGAACACACCAAACTGAGGAGAAACACTTTTTAAAAATGATTTTGAGCACTTTGATCACTCCTCATATGTCAAGAGATCATCCCTCTTAATAGTGCGGCATTCCTATTGACTCAAACGAAAGAAAAAAGGTACAATATACCATTTGCTCATTTGCCGCATCACACACATCAACATATTCGGCGCGATATGCATTACGCTAACTCATTGAGGACATAACAACCTTCACATTTGCTTAAATAAAAATGTTAGTCCTCTCTAATCGCATTGTAATTAATCACCAAAAACATTAAGGGCCTAGATGCACTTTCAGCTACGTAGGCGCCATGTCAGCTAAAATTGTCGCCCAAACCGCTATAGGACCTATATTGCACCGGTTTCGATAGTTGAGGAACCCGTTGTATCTGTTTTTTCGATGGAAGGATAAAAATCGGATTCGTTAACAAGTTAAGGGACCTTAGATGAACTTATTCCTCAAATAAAAACCAATGGAAATAAAGCGTGAGGAGTGAGAAGATGAGTTATTTCCCTTAGAAAAGGCCAAATGGGCTTGATGGGAAATAATCATTGGCTTTCATGAAGTCTTATTTTTGAGAGACAATTGATAGAAATCCCAAGCTGCTCATAAATTCAATCTTCTTAAAAGTTTCTGTTACCTAGGTCAAGTTATTTACTTGTGTAAATGATGTATTATCAGCATCACAAACAGACCACACAAATCTATTTCTCCAATTCTTTTTTTTTTAAAAAAAAAACCTCTAATAGAATTTAAGGGATAAAAGTATTCTCCCCGGCAACCTAATTTAACTTTTAAAAGAGGTGGACATAAAAGAAACTTCCAAATAAATCCATTCTCTTTTCGCACTCCAGTGTATGGCCCCTTCTTCTCCTGACGTGCACGACCTTAATGGTTGGGAGCTGAAATCTCGCTCTTCACAAGTAGGGATAAATATTTTCGGAAGTTTGTTTAGGGCTAATGTTGAAGACTATTTTTTTTTTCTTAAACAAAAACCTAAAAATTTAATGATTTGGAGTAGTATAGCTGATCTCACGAGTATATTTCCAAAACTTAGGGGCCTGTTTGGATGCCCACCTCACTTTGCCACAATTTTGTGTCAAAGGTGTGGCAAAATGTAAATTGTGGCTCCAAAATTGATGACCACACTTGTGGCAAACTTTGATTAAGAAAAAGGTCTATAACTAGTGGGATCAAAAGAGAAGAAAGTGCGACATGCTAAAATTGTAGAAACAAACCAAACCTAGCTATATTTGATCAAATTAACCTACCTCAAGTGTAGCAACATGTGGCACCAACCAAACAGGCCTTAAATCCCAGTCGGACGTACGTGAAAATCAACCGCCCGCCCCACCTCATGGCACGATTGAGGAGATCAACCACCGGATCGGTGGCCCCACTGTCTTAGCTAAACCACAGCCCCACGCATTAGTGGGTGAGAGATGATTACCGCCTTTGGGTAAAGGAAAGCCAGTCATAGTATTAAACCCTGAGTGCCATATTAGCTCATTCACAGTGCGTCCTACTCATTTGAGGAGCTTTGGAGTGCCACGTAGGTTTAGGTTACAGATCTAAAATCTTGATTCTTCATATCTTTCACAATGCACCTATGTGGCATTCAGCCCCAACATGCCAACTAGGAGATCCTTTCCATGTCTGTATCTGTCATGCCCCAAGTATGCTCCTCATGCAAAGCAAGAGAGAATGGGCCAGACGAGCCCCCAGTCAAAGCCACTCGCATTGTAAGAATAGTTTCTTATACGTTCTTCAGCTTATGTGGCACATAGCTTTTTCATGAGTCTCCTCATACATGGTAGCAACACTGCTCTTTCCCTGCAAAGTGGCTTTAGAAGTGGCTTCAATTTTATAGCTTATCCCCTATTATTTTTGTAGTTCTCATTTTATTTTTCAATTTATGTGGAGGTCCAAAATTTACACCGAACACCCTAAAATCTAGAAAAAAATTATAATACCCCCCTCTCCTTTCTCCCTTATCCTTTCCCTACTTCGGCCTCCTCCTTCAGCTACCCTGCCGCATCCCTCTCTCCTTACCACCCACTATCGGCACCCCTCTCCCCCTTCACCACTTTCCCTCCCCCCAACCGTTGCCCGTTGGTGTGGCTCTCCCTCCACCTTCCTCGTCGGGGCGCCGTCGGAAATTGAGCGACAGAATGGCGGATCGAAGCGACAACGAGCTCGGCACCGCGTGCATGCGTGGATGGCAAGGAGCTCGAGACGGATCTAGCAACGTTGGCGTGTCCGTCTCGTCGGCGTGACCGGGCAGAGAGGCGGCCAAAGCAGCGACTGTGCCGCCGAGCGGATTGACGGCGGGGCTTGCTGGATCCAGCCTCAGGCGGCAGTGGCGGCTTGCTGGATCTCCCCTCTCTCCCATGGGATGAGCTCGATGATGACACGGAGGCTAGGAAAAACGACAACATGCTCACTCACTCATGCACGCGGGAGCGGGAGGGCGAGGGCGAGCGCGGTAGGACGATGAAATGAGGTCACGACCTCCACAACACACCGCTCGCCCCTGGATTAGACCGAGGAACGAGTGACCAAAGTTGGACGCTTGGACTTCAGCTCGGTTTGGCAGAAGCTAAAGGCTGTGTTTAGATTCAAATTTTTTTCTTCAAACTTCCAACTTTTCCGTCACGTCAAATGTTTGGACACATGTATGGAGCATTAAATATGGACGGAAAAAAACCAATTGCACCGTTTGCATGTAAAATCGCAAGACGAATCTTTTGCCTAATTACGCCATGATTTGACAATATGATGCTACAGTAAACATTTACTAATGATGGATTAATTAGGCTTAATAAATTCATCTCGCAGTTTACAGACGGAATCTATAATTTGTTTTGGGGGTTTTAACTATTTTCCACTCTTCCGGAGTGCCACTATCCATATGCCACTCTTCTAGATTTTTTTACACAAACACTACAAGAGAGAGATTTTCTCCCTAATTAGTGTGCCATGTCAGCAGGGAAACTTGAAATGACCTTTTTGCTAGCA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