BGIOSGA013124
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA013124 |
|---|---|
| Description |
Calcium-transporting ATPase 2, plasma membrane-type |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA013124, complete gene. |
| LocusTag |
OS03G0616300 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA013124-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA013124-PA |
| Length |
11657 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:26994410..27006066 |
| Sequence Coding Region |
26994410..26994488,26994755..26994927,26995034..26995207,26995475..26995598,26995685..26995785 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:26994410..27006066 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:26994410..27006066 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGGGACGCCACCCGATGGCGGAGGAGATAGGCCGTGGGAGTCGTACCACACCGCCTACACCAACGCCAAAGCTGGAATGGAGGGAGTTGACAAAGAGAAGGTGCAGAAGGTAATCTACGAAATGAGCAAGGGTTCAAAATATTTTGAAAATGAACAGAGGAAAGAGGCAATTACCAAACAAAAAATCGACCATCTGCGTGCACAATGTGCAAAGCTGACTGACAATGACATATCACATTTTCAGAAGGTCGCCGAACATAAAATTTTGGAGCTGGAAGCTTCACGGGATCTTTCAAAGATATGGCTTCACACCGACATGGATGCCTTTTATGCTACTGTCGAGATATTGGAAAATCCATCCTTGAAGGGAAAACCATTGGCAGTGGGTAGCATGTCTATGATAGCTACTGCCAGTTATGAGGCACGGAAGTTTGGAGTTCGTGCAGCAATGCCTGGTTTTATTGGCTGTAAATTATGTCCTGAGTTGGTTTTTGTCCGTCCAAATTTTGAGAGATACACTTATTATAGTGAATTGACAAGAAAAGTTTTCCAAAGGTACGATCCCAACTTTGTTGCAACAAGCCTAGATGAAGCATATCTCAATATTACAAAAGTCTGCTTCGATAGAGGCATTACTGGTGAGGAGGTTGCTACAGAACTTAGGGGTGCCATTCACCAGGAAACCGGTCTAACTTGTAGTGCTGGGGTAGCTCCAAACCGCATGATTGCTAAGGTTTGCTCTGATATCAACAAGCCTAATGGACAGTTCATTTTGCCGAATGACCAAGAAGCTGTGACAACATTTGTATCAACACTACCTATAAGAAAGATAGGTGGTATAGGCAAAGTAACAGAACAAATGTTACGTCAGGTTCTTGGTATCAGTACATGCCAGGAGATGCTGCAAAAGGCTTCTTTCTTATGTGCTCTTTTTTCTGAATCCTCAGCTGATTTCTTTATTTCGGTTGGTCTTGGACTAGGCGGTACTGAAACTCCTGAGCAAAGACTAAGGAAAAGTATAAGTTGCGAGCGAACTTTCAGGGCAACAGATGATTGTTCTATGCTTTTCGAGAAATTAGATAGTCTCGCAGACAATTTGGCCGATGATATGCAAAAAGAATGCCTGAAGGGAAGGACACTAACACTCAAACTAAAGACTGCCGCTTTTGAGGTCAGGACAAGAGCAGTAACCACACAAAACTATATCAACTCCAAGGAAGACATCCTGATCTACGCTAGGAAATTGCTTAAGGCTGAACTGCCTCTTTCTTTGAGATTGATGGGGTTGCGGATGTCCCAACTTCGCGATGAGAAGGATGATTCATCTACCCAAACCCAAAAGACACTAGATAGATTTTTCCGCACGCCTGACAACTCAAATGTCATTGGAGCAAACAGTCCAAGCATCGGTAATACCACAGGAGGGGATAACTATTGCACTAATGTGATGACCAAGGTCGATTATTTAGAGCATGATTCCATGGATGATCAGGCATTGTTTTTGCATGAAAAGAACTTATTTGTTCCAGAAGGAAGGAGCTCAGACAATTATAATAATGATGCTGCATCAAGCAATCCACTTATGTGTGATGGTGTTGGTGGAAAAGAATTGGATGATGACTCCTCCAGTTCGAAGGGTACACATACTGTAAAGTTTGATGGCCAGCTCACCAGCTCTAACGCAACTACTTCATCGAGTAAACCTGATCAGCTTTTCTGGATAAATGGCTACATTTGTTCCATTTGTGGATTTGAACTACCTCCAGGTTTTGAGGAGGAGAGACAAGAACATTCAGATTACCACTTGGCTGAAATGCTTCAGCAGGAAGAGGCAGTGGACAGCACAGGCCCCCTCTCGAAAGAGAGGTTAGCTGAAAGGCCATGCTCTAGCACACCCACACCAAAGAAGAAGCTCAAGTCTTCAAAAGAAGGAAAACACATACCTATTGATGCTTTCTTTCACAAGGAGAAGTTACAGGTTGCTGCACTGCCATCCAAAGCTACACTCGAGTTTGAACATGGTGTCTCACTTCGAAGTGCATATATTGTTCCTGAAGATGTTCAAGCTGCAGGGTTCCAGATTGATGCTGATGAACTAGCATCTATTGTTGAAAGTCGCGACACTAAAAAGTTGACTGTGCATGGCCAATTAAATGGGATCGCAGACAAATTAGGAACATCATTAACCAATGGTATAGTTACAGACAAGGACCTCTTGAATCAAAGGCAGGACATATATGGAGTAAATAAGTTTGCTGAGACCGAGATTCGCAGCTTTTGGGAGTTTGTATGGGAAGCACTGGAAGACACAACCCTTATAATTCTTAGTGCGTGTGCTATTTTCTCTTTGGTTGTTGGCATAACCACAGAAGGATGGCCACAAGGAGCCCATGATGGCGTTGGCATTGTTGCAAGTATCCTCCTTGTTGTTTCTGTTACCGGAACAAGTAACTATCAGCAGTCCTTGCAATTCAGGGACCTTGACAAGGAGAAAAGGAAAATTCTTGTTCAAGTCACAAGGAATGGCTTGAGACAAAGAGTACTGATAGATGACCTTCTTCCTGGTGATGCTGTCCATCTTGCTGTTGGAGATCAGGTTCCTGCAGATGGCCTCTTTATTTCTGGGTTTTCTGTGTTGGTCGATGAGTCTAGTCTAACTGGGGAGAGTGAACCTGTTTTTGTAAACGAAGATAACCCTTATCTTTTATCAGGGACGAAAGTGCTTGATGGGTCCTGCAAAATGCTGGTTACAGCAGTTGGGATGAGAACACAATGGGGCAAATTAATGGCTGTTCTTACTGATGGTGGGGATGATGAAACTCCACTTCAAACCAGACTTAATGGAGTTGCGAATACTATTGGGAAAATTGGTCTATTTTTTGCTGTATTGACTTTCATTGTCCTCTCACAAGGGATAATTGGCCAGAAATACCTTGACGGGCTTCTTTTGAGTTGGTCCGGAGATGATGTGCTAGAGATATTGGATCATTTTGCTGTTGCAGTTACAATTGTTGTTGTTGCTGTACCTGAGGGATTGCCATTGGCAGTCACTTTGAGCCTTGCATTTGCAATGAAGAAAATGATGAATGACAAGGCACTTGTTCGACAGTTGGCTGCCTGTGAAACCATGGGCTCTGCCACAGTCATTTGCAGTGACAAGACAGGAACACTGACAACAAACCGCATGACTGTTGTAAAAGCCTGCATCTGTGGGAATACCATACAAGTTAACAATCCACAGACTCCAAACATGTCTTCCAATTTCCCAGAAGTTGCTGTAGAAACTCTTCTGGAGTCCATATTTAACAACACCAGTGGCGAAGTGGTGACTAACCAAGATGGGAAGTATCAAATACTAGGCACCCCTACTGAGACAGCTTTGTTGGAGTTTGCACTGTTGCTAGACGGAGACTGCAAAGAAAAGCAACTGGGAAGTAAGATTGTTAAAGTGGAACCTTTTAATTCAACCAAAAAGAGGATGAGTACCATTCTTGAGCTTCCTGGTGGAGGATATCGTGCACATTGTAAAGGTGCTTCAGAAATAGTATTGGCTGCATGTGATAAGTTTATTGATGAAAGAGGTTGTATTGTCCCCCTTGATGATAAAACTTCCAGTAAGCTCAATGATATAATCAAAGCCTTTTCTAGTGAAGCGCTCAGAACACTTTGCCTTGCTTATAGGGAAATGGAAGAAGGGTTTTCTACTCAAGAGCAAATACCGTTACAAGGATACACTTGCATCGGCATTGTTGGTATTAAAGATCCTGTTCGTCCAGGTGTCAGGAAGTCTGTGGCAACTTGCCGGTCAGCTGGCATTTCAGTGAGAATGATTACAGGAGACAATATTGATACAGCAAAAGCAATTGCTCGGGAATGTGGCATACTTACCAAGGATGGCATTGCAATTGAGGGTGCTGAGTTTAGAGAGAAAAGTGCTGAAGAACTCCATGATTTGATTCCAAAAATGCAGGTACTAGCCCGTTCTTCCCCACTTGATAAGCATACACTTGTGAAGCACTTGCGCACCGCATTCAATGAAGTTGTTGCTGTGACTGGTGATGGCACTAATGATGCACCTGCGCTGCGTGAGGCAGATATTGGACTTGCCATGGGCATTGCAGGGACTGAGGTGGCAAAAGAGAGTGCTGATGTTGTAATTCTGGATGACAACTTCTCCACGATTGTTACTGTTGCCAAATGGGGACGCTCTGTTTATGTGAACATCCAAAAATTTGTGCAGTTCCAGCTTACTGTTAATGTTGTTGCATTACTAGTTAACTTCACTTCTGCATGTTTCACAGGGGATGCTCCACTTACAGCTGTACAACTTCTTTGGGTCAACATGATCATGGATACCCTAGGGGCGCTTGCACTAGCCACCGAACCACCTAACAATAACTTGATGAAGAAAGCACCGGTAGGAAGGAAAGGGAAGTTCATCACAAATGTGATGTGGAGGAACATTGTGGGGCAGTCGTTATACCAATTCGCTGTCATGTGGTATCTACAAACTCAAGGGAAACACTTGTTTGGGCTGGAAGGCTACCATGCTGATATTGTACTAAATACAATCATATTCAACACTTTTGTCTTCTGCCAGGTGTTCAATGAAATAAGCTCAAGAGAGATGGAGGACATCAACGTTCTGAGGGGCATGGCAGGGAACTCCATTTTCCTTGGTGTCCTCACCGGCACCATCTTCTTCCAGTTCATCCTAGTCCAGTTCCTGGGCGATTTCGCTAACACCACACCTCTGACCCAGCAACAGTGGCTCATCAGCATACTCTTCGGCTTCCTTGGGATGCCCATTGCTGCTGCCATCAAGTTGATTGCTGTAGAACCTCATGAAAAAGCCGATACACGTAGAACGCCGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAGTPPDGGGDRPWESYHTAYTNAKAGMEGVDKEKVQKVIYEMSKGSKYFENEQRKEAITKQKIDHLRAQCAKLTDNDISHFQKVAEHKILELEASRDLSKIWLHTDMDAFYATVEILENPSLKGKPLAVGSMSMIATASYEARKFGVRAAMPGFIGCKLCPELVFVRPNFERYTYYSELTRKVFQRYDPNFVATSLDEAYLNITKVCFDRGITGEEVATELRGAIHQETGLTCSAGVAPNRMIAKVCSDINKPNGQFILPNDQEAVTTFVSTLPIRKIGGIGKVTEQMLRQVLGISTCQEMLQKASFLCALFSESSADFFISVGLGLGGTETPEQRLRKSISCERTFRATDDCSMLFEKLDSLADNLADDMQKECLKGRTLTLKLKTAAFEVRTRAVTTQNYINSKEDILIYARKLLKAELPLSLRLMGLRMSQLRDEKDDSSTQTQKTLDRFFRTPDNSNVIGANSPSIGNTTGGDNYCTNVMTKVDYLEHDSMDDQALFLHEKNLFVPEGRSSDNYNNDAASSNPLMCDGVGGKELDDDSSSSKGTHTVKFDGQLTSSNATTSSSKPDQLFWINGYICSICGFELPPGFEEERQEHSDYHLAEMLQQEEAVDSTGPLSKERLAERPCSSTPTPKKKLKSSKEGKHIPIDAFFHKEKLQVAALPSKATLEFEHGVSLRSAYIVPEDVQAAGFQIDADELASIVESRDTKKLTVHGQLNGIADKLGTSLTNGIVTDKDLLNQRQDIYGVNKFAETEIRSFWEFVWEALEDTTLIILSACAIFSLVVGITTEGWPQGAHDGVGIVASILLVVSVTGTSNYQQSLQFRDLDKEKRKILVQVTRNGLRQRVLIDDLLPGDAVHLAVGDQVPADGLFISGFSVLVDESSLTGESEPVFVNEDNPYLLSGTKVLDGSCKMLVTAVGMRTQWGKLMAVLTDGGDDETPLQTRLNGVANTIGKIGLFFAVLTFIVLSQGIIGQKYLDGLLLSWSGDDVLEILDHFAVAVTIVVVAVPEGLPLAVTLSLAFAMKKMMNDKALVRQLAACETMGSATVICSDKTGTLTTNRMTVVKACICGNTIQVNNPQTPNMSSNFPEVAVETLLESIFNNTSGEVVTNQDGKYQILGTPTETALLEFALLLDGDCKEKQLGSKIVKVEPFNSTKKRMSTILELPGGGYRAHCKGASEIVLAACDKFIDERGCIVPLDDKTSSKLNDIIKAFSSEALRTLCLAYREMEEGFSTQEQIPLQGYTCIGIVGIKDPVRPGVRKSVATCRSAGISVRMITGDNIDTAKAIARECGILTKDGIAIEGAEFREKSAEELHDLIPKMQVLARSSPLDKHTLVKHLRTAFNEVVAVTGDGTNDAPALREADIGLAMGIAGTEVAKESADVVILDDNFSTIVTVAKWGRSVYVNIQKFVQFQLTVNVVALLVNFTSACFTGDAPLTAVQLLWVNMIMDTLGALALATEPPNNNLMKKAPVGRKGKFITNVMWRNIVGQSLYQFAVMWYLQTQGKHLFGLEGYHADIVLNTIIFNTFVFCQVFNEISSREMEDINVLRGMAGNSIFLGVLTGTIFFQFILVQFLGDFANTTPLTQQQWLISILFGFLGMPIAAAIKLIAVEPHEKADTRRTP</aaseq> |
| Gene Sequence |
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