BGIOSGA013333
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA013333 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA013333, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_13027 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA013333-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA013333-PA |
| Length |
8805 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:31048973..31057777 |
| Sequence Coding Region |
31048973..31049018,31049124..31049246,31050369..31050533,31052538..31052677,31052985..31053095 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:31048973..31057777 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:31048973..31057777 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTGCTCAGCAAGTCCGACGTCCTCTCCTGGATCACCGACCGCACGAAGCGGCGGCGGCGGCTCGAGGGAGAGCGCGTTCCTGGAGGCCGTGGCGGAGGGGAACGTCCGCCGCCTGAAGAGTGAGTGCTCCTCCCTCCTCGTCTCACCGCCCTCCGACGCCGCGGCGGAAATGGTGAATAGAATGGATGAGAAGGACAGGGCAAAGCTTACTGATATGCATATAGATGGCATTGGGTTAATGCAAGTGGCAGCAAACCTGGGAAAAATTGAGGTCATCAGGTACTTTGTGGAGGAGCTTGGCTTTGACGTCAATGCTGGTTGCCTCTGTGGTGGGCATGAAGAAGTAGCACATCTCTTGTTATCTAGTGGATCCAGGGTTGATATAGCTGTTGCTCACGGGACACCACTACATATTGCTGTTTCCTTTGGGAAGACTGGGGTTGTCAAGATTTTATTGGATCACCATTCAGATCCAAACAACACTTCAGGAGTTTGGGGTACCCCTATACTTACGGCTCTTCATTCTACTAAACATGGATTGGATGAATCTGATTCTTTGGGATGTGTAAAGCTGCTTGTCAAGGCTGGTGCTGATGTGAACTATGCTTGTCCAAACACTCCCTTGGTGGTGGCCACGACAGAGGGTTTAACTGATTGTATGAAGTACTTGCTTCAGGTTCACGCAGATCCTAACATCCCAGATAAACAGAGCGGACGCACACCAATAGAAATCGCTGCAAGCTTACGAAGAAGAAATCATGTGGAGATTCTATTTCCTTTCACTTCCCCTGTTAGAGCAGTAACAAATTGGACAGTTGAAGGAATTATTACTCACGGGAAATCAAGATTCTCAATGCCCAAGATTAAGGATGAGCCATGTAGCAAGGTCAATGACAGAAAGATTGAACTAAAATCACTGGGAGGAAAAGCAGTTAAGAGAAAGGACTACCTTGGTGCATCAAGGATATACTCTGAGGCACTTGAGCTAGATTATTTTGATGCAACCTTGTATTCAAACAGAAGCCTTTGCTATCTACGAATTGGAGAAGTGCAAAAGGCTTTTCTTGACACAGAAATGTGTATAAAACTGCGACCTGAGTGGGTGAAAGGCCACTACCGGGAAGGAGCTGCTTTGATGTTGCTAAAGGAGCACAAGAAAGCATTCGAGGTGTTCTTGAATGCACTGAAACTGGATCCTACGAATGCCGACATTGAGAAAGTGTTGTGGGAAGCATTGGAGGCGATGAAAAAGGATGATGCTGCTGAAGAGAAAACCTTAAAGTCGGTAGATTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MCSASPTSSPGSPTARSGGGGSRESAFLEAVAEGNVRRLKSECSSLLVSPPSDAAAEMVNRMDEKDRAKLTDMHIDGIGLMQVAANLGKIEVIRYFVEELGFDVNAGCLCGGHEEVAHLLLSSGSRVDIAVAHGTPLHIAVSFGKTGVVKILLDHHSDPNNTSGVWGTPILTALHSTKHGLDESDSLGCVKLLVKAGADVNYACPNTPLVVATTEGLTDCMKYLLQVHADPNIPDKQSGRTPIEIAASLRRRNHVEILFPFTSPVRAVTNWTVEGIITHGKSRFSMPKIKDEPCSKVNDRKIELKSLGGKAVKRKDYLGASRIYSEALELDYFDATLYSNRSLCYLRIGEVQKAFLDTEMCIKLRPEWVKGHYREGAALMLLKEHKKAFEVFLNALKLDPTNADIEKVLWEALEAMKKDDAAEEKTLKSVD</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..46#152..274#1397..1561#3566..3705#4013..4123#4389..4514#4909..5061#7153..7266#7972..8142#8230..8309#8739..8805#ATGTGCTCAGCAAGTCCGACGTCCTCTCCTGGATCACCGACCGCACGTCAGTCGGTCTATAGTTCGCATCGCCTGCTTTTAATTTGGTTAGTCTCTAATGGCGTTGTTGTTGTTGCTGATTCGGTTCTTCGTCTCCTCCTCCTCCCTCCAGGAAGCGGCGGCGGCGGCTCGAGGGAGAGCGCGTTCCTGGAGGCCGTGGCGGAGGGGAACGTCCGCCGCCTGAAGAGTGAGTGCTCCTCCCTCCTCGTCTCACCGCCCTCCGACGCCGCGGCGGGTTTGATTTCTTCTCGTCGGGATTCGAGGAGGTTGCTCGTCGGCCTGCTAGCTTGTCCGTGTGCGTGCGAGCGAGTCTCTTGTTGCTTGCATTCGTGGCTGTTTCGATCGGTCTGTCTACGTTTTTTTTTCCTTCCGCGCATGTCACTTCCAGGGGCGGAGCCAGTATTTTGAGGCACCGGGGTCACACTAGCTAGTCTAAGGCTCTAAGCTAACGTCATGTTTAATTAGGCTCTAATTCTAAGATCATTTTTTTAATCTACAAACCTTTAGAGCCAAAAGATTTTGGAACTAAATTAATTGTGGATTGAGATAATTTCGGTGAGATATCATTATCTTAGACTAAACATAAAGTGTTAAATCACTTTAGTTAGCTATTTAGACATAAAACTCCCAAGTTTGGCAATAATTTATGAGCTAAAACTATATAATAATTGACAAACTACGCCTAATTATTTTGGGCACAAAAACAGGTCCCCAGAGTTGTTTATTAACTAAAAGGCCTAATGCGTAGTGTAGTTGATTAACAGAATTACTAGCCTAATTGCATGTATAAACACACCACATAGAAATAGCTAATTTGTTAAGTGATGAAATATGCTAATGGGCTAGCTGTGCGGTGGTGGTGGGCTGACGACACCATAACAAAGATGTTGGAAGATGCGATCAGCAGTTCTGAGCGTTTAGTCTATGAGCTAGCTGTTGCAGTTGAGCGGGCCGGGGTCAACAAGCATCAGCTTATGGGGTCACTTCTCACATACTAAGGAACACACTGGTTGGTCCGATATCATCAGTGTCATCTGACCCCGGTGATATAACGTAGTTCTGCCCCTGGTCACTTCCCAGGTTGCGCCAAGCCGCTAATTAATGAATTAAGATCCTGCGGTAATCTGCTTATTGTATTGCTTGCATCAAGGTTGGATTTCGCTATGCTTTACAAGCTGGAAGTGCTTCACACCTTCAGCTTGGGATGTTTTCATGCTCTACAATTGTGCTTGGCGAGCTATGGTTTTGTGATTTGATGTTACTTTCCAATTATGACCCAGACATGGTAGTTTAGAATTGAATTTTTGTTGCACAATCTTTCACCATATCATGATTATCATTTTCTTCCATGAAACAGAAATGGTGAATAGAATGGATGAGAAGGACAGGGCAAAGCTTACTGATATGCATATAGATGGCATTGGGTTAATGCAAGTGGCAGCAAACCTGGGAAAAATTGAGGTCATCAGGTACTTTGTGGAGGAGCTTGGCTTTGACGTCAATGCTGGTTGCCTCTGTGGTGGTGCGCGCATTTCTTCCAGTGATTAATTGCATTTATTTTTTTTGGATTGTTTTATTAGTTTATTCAAGAAATTATGTCAAGCAAGCTGTTGCGTGACACAATATTTAGTTCATACAATGCTACTTCCTCCGTTTCACAATGTAAGTCATTATAGCATTTCCCATATTCATATTAATGTTAATGAATCTAGATGGATATATATGTCTAGATTCGTGAACATCAATATGAATGTGGGAAATGTTAAAATGACTTACATTGTGAAATGGAGAGAGTACATTCTTTTATGTTTGATTGTGACATGTTATAAATAGTAGCAGCATAAGAAAGTTGGGCTGCTTTAGTTAGCAATCTGCTGTGATTGATAAAAAAAATGTATTTCGGATTTGAGGTCATTTCTGAACTTGTACGCTACTTTCTGGATTTCATTCCATATATAGCATAAGGTACCTTACAGGATTGATATATAGCATCCCATAATTCAGTGAGAAGCAAGCTGGGACATATAGCCTTTCCTAAAATGCAAACCAATGCATGCATGCACTCCGTGCAATGTGCCATTTTGTGGCCATCCTATGGTGAGATGGTCTTTTAGAAGGGACTATCTACACGCCATTTGACAAATTTTTTATTCAAAATCACCTGGATTTTTAAACCTCTCGATTATCAACTCCTAGCTTACATTAGAGCAATACAAAGAAGAAACTCATTAACAAGATTTAAAAGAATAAGTAGTTTCATTATAAAATACAATATGATTATATTTTGTTTGAAAAATTAGAATACAAAAAGTTACATAGAAATCTAAAAAGTTAAAGCGTATTAAAAGTAGTGTAAGAGTATTATATTTACATTGTAACTTAAGACTATGGTTTCTCTTTGTCAACATTGCCTTCATCTCTCTCCCCTGTTAAAGTTGAGTTGTCATCCAATCATATTATTGGGTAGTGGAAAAAGTAAAGGCTGCATGCAAAACATTTGCCACCTATGCCCTGCACCTGGGGAACGAGTGAACAAGAAAACTTGGTTGTGTCTGCTGCCTGGGGATGATGAGGCAAAAAAAAGGGACATATCTCGAGGTATATCGAACTTTTAAAAAATGACTAATTTTATGCTAAAATTCTGTCGAAGGATTTATAGCAAACCTGATTTCAGAAATTGTATTATTTACCATGCTACTAGGATTTCAGCTTGACCACTAAAATCTTTTGGATGAGAGCCAAGTTGTTGGTAACCTCACAAGGTACTTGTCTTCATTGTTGTTGTCAGGTGCTACAGCTTTGGGTTGTGCCGCATTGTTTGGAGAAGTTGATACTGTGAGATATCTTCTTGACTGTGGGGCTGATCCTAATAAGATAGATGAGACAGGTCATGTTGCTCTTCATTGTGCTGTGAAAAATGGTCTTTCTCTTCATGCCTACTACTCGGTTTTCTTTTCTCATTTCGTGACTACGGATGTCTTGCTGAACATGAACTGATGGATTTACCGCAAAATTTAACCATCAAATGAAGAACCATTTTGGGTTTAATTATGAAAAAAAAAATTTAGTAATCCATTTTTGTGACTGCTCTCTCGGGGTAGTTTCTACACATTGGATTATAACACTCTCCTATATTCTTTTTTGCTTGACTAGTTTGTTTGCTGTACTCTCCTATACTCTCATACATTGGATTAACACTCTCCTATTATTTGAAGTAAACCTGTCTAAAATATTATCCTCATTATTCTTTGCAAAGTTCTGTTAGCTATAACTTTTTACTGTTTATTCAACTCTTCCCCACAAACGATCATTTTCCTGTTGTCCTGTGTAGTACTATAAAAACAAGCAGTTAAGTATTTAGCTAAGCACCTCACCAAGAGGCCTACAACTCCTGTCATTTTTAGCTTTGGCAAGAAGTTAGTTGGATCTTTTTAGCACATATCCTACTTTTACCTAATTATGTAGTGTGCTAATAATGCTTGTTCTTTGTTATGACAGTACCATGTTGGTTGTTCATTTTATTTAGGGCATGAAGAAGTAGCACATCTCTTGTTATCTAGTGGATCCAGGGTTGATATAGCTGTTGCTCACGGGACACCACTACATATTGCTGTTTCCTTTGGGAAGACTGGGGTTGTCAAGATTTTATTGGATCACCATTCAGATGTAATAACTATATTTCACGTTTTTTTCATTTGCATTATTCTTGTTGCTCGATACAATCTGAATGATTTTTGTGCTTGTGTTCATTCAGTATTTCATGCCTTCATAGTTTATTACTGGCTCTTAACATATTTTGTGCTGATAAATCAAATAAATCATTCATATATTGTTTTAGTCGCGTAAGATGAATTTGCAGAAATATATATATGGCTGTTAAAGCTTGTTCTATTTTTGCATTCTGCAGTAATGTTCCTGCTGAGTTATCTCACTTGTGTAGGGAATGATTTTATTTTCTATATTAAATTTGTAGCCAAACAACACTTCAGGAGTTTGGGGTACCCCTATACTTACGGCTCTTCATTCTACTAAACATGGATTGGATGAATCTGATTCTTTGGGATGTGTAAAGCTGCTTGTCAAGGTCTGGTATCTGCTTCACCTTTGTTTCTTTATTAGTCGGGAATCTATTAGTTACTATTATTATCAATAGTGCTTGTATTCATCTCTTAAGGACTGTAGGCCTGAATATATGCATGTACATGTAGGAAAATAAGGAAATTCCTCAGGGAAAATACGGAACATAGTATATGTTTATCTAACAACCATATGGATTTCTGTACGAAGCATCTCTATATTGCGCATATTAATTGCACAGGCTGGTCCTGATGTGAATTATGCTAGTCCAGGCTGGTGCTGATGTGAACTATGCTTGTCCAAACACTCCCTTGGTGGTGGCCACGACAGAGGGTTTAACTGATTGTATGAAGTACTTGCTTCAGGTTCACGCAGATCCTAACATCCCAGATAAACAGGTGTGTGCCTTTTATTCCCTGTTATTCTCTTTAAAGTTGCTGTCTTCTCAGTGCATGATATAATATAATTGATTTTGAGTACTAAATCATTCTATCAGCTATTCAATTTTTTTTCTATCAGCTATTCACATGCATACGCTTGTTCATCAATATGTGCACAAGTGCACACCATGTATGATTCAACCTGAATAACCTGTTCTTATCCAGTTAACCTTTTATTATTGCCTTTCAAATTTAAGTCAATTAATACTTCAAGCAAGTTAACGTGTCTCTTCATGAGAGTATTCAGGTGGAAACCACCTCCACAAGGTTCTTATTTTATAATCATGCTCGCGATTGTAATTTATTTTTGTAAGTT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